4JTSA

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with 072
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with 057
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 136
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2013-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4jtsA00
3BO9A 3W7OA 3FKKA 1EWEA 1X1ZA 3L0NA 4GWEA 4UFMA 1XM3A 1SPQA 5D2XA 1GWJA 3LHYA 3L9CA 5G4WA 1TPUA 2WQPA 3CLMA 3GAYA 4PTNA 4O4WA 1QCWA 2Z0IA 5HINA 3DENA 1OFPA 3EXSA 4JTHA 2FIQA 2CLOA 5LNVA 1TPH1 2Y70A 3UXAA 4AHPA 2A7PA 4BWLA 4O12A 3L2IA 1M6JA 3MJYA 4K6AA 1FWWA 2ZZ6A 4JIPA 1WBHA 4YCOA 4H6KA 2QJIA 2CWNA 1QOQA 2X1TA 5H91A 3TXVA 1Y0EA 5BOOA 2NX9A 1OYCA 5MHBA 1U5JA 4UXDA 3NPWA 4PODA 4FO4A 4ADUA 3NAVA 2C0AA 4R34A 1J2WA 4GUHA 1KM0A 3U8GA 2ISSA 2V81A 5LKYA 1D3GA 1XFBA 4JY9A 1R2TA 4J9JA 3I6RA 1H51A 5EBUA 1JUKA 2WKJA 3PM6A 4P61A 3NDOA 4JNMA 4CQ9A 4DO6A 1UB3A 2RH9A 1R47A 3NQGA 4HPXA 5HUOA 3GXNA 1Z41A 5L9FA 3INPA 4XKYA 4GUIA 4LS2A 5DBUA 4MYAA 4MFEA 2JKPA 3O1NA 1OFBA 1EPXA 1SUXA 1MXSA 4XQ6A 2GQAA 1G67A 4KWVA 4UTTA 1BEUA 2J24A 3O63A 3GDTA 3BPWA 2A1YA 1JCNA 3EWXA 1M7PA 5BMXA 4UC5A 4AF0A 3DFPA 3TC7A 5C54A 1AMKA 2CLIA 4TR9A 4HN4A 4MLRA 1I2PA 1W5MA 3A22A 1KM2A 1QMLA 3LI0A 3HPSA 1QO2A 4GUJA 5A8GA 3TA6A 1I2RA 1G4SA 1QPRA 3ATYA 4NNCA 1F73A 1FDZA 1AL8A 2FB2A 4BF9A 1W56A 5K9CA 1Z44A 5TQLA 3HG5A 2Z6IA 4JEQA 4LUJA 3USBA 1D3HA 4XBKA 3MWAA 4O11A 4C1LA 1H60A 4DXVA 3OA3A 5D2YA 3WFAA 3LXAA 2ZRXA 5CZJA 1TB3A 1KBJA 2QCCA 4OGZA 4FHAA 4PH6A 4IMGA 4UFHA 1BWLA 4DF1A 2GVLA 3W1PA 3OVRA 3IGXA 4HNTA 3GK0A 3KAOA 4IWWA 3R8RA 3DFNA 1IXPA 3EX2A 1RQHA 1ZCOA 4N02A 4ZQOA 5D04C 3HG2A 2QCHA 2ZZ7A 3M9YA 7TIMA 3BV4A 3W85A 2H90A 5IBXC 4Z1DA 2TPSA 3GR8A 4I7WA 5FEWA 3N9SA 1D9EA 3HG4A 3LM7A 4OBTA 4AVFA 3P5YA 3SJ3A 5D03A 2OX1A 3SW6A 2DZWA 4N4QA 1SO4A 1NSJA 3FJ6A 1TV8A 4K8EA 1K3UA 3W2MA 5KZMA 3W87A 3N34A 3W1LA 3WJZA 3PSWA 1F5ZA 1QPNA 4RKAA 1LRQA 3KVJA 4IGHA 2Z2UA 4CNNA 3STEA 2YPIA 4DBDA 8TIMA 3L5AA 4DO4A 2P10A 3QSTA 3QMTA 1KFJA 3BGJA 3DI0A 3NQCA 2VFFA 1KFBA 1GVOA 3PB0A 1RV8A 4WJEA 3A23A 4O17A 4UTJA 4AXKA 4NX5A 5F2LA 3FFSA 2Q8LA 5F4SA 3PG8A 3QH2A 3G8RA 4IX0A 3EWYA 3LBMA 4IQLA 2B4GA 5EMUA 3M41A 1YDNA 4M6QA 1W54A 1S5WA 5AN7A 3RFAA 3O6CA 3UWZA 1VYSX 1WA3A 2LLEA 5FF2A 2O7SA 1IXOA 4A22A 4CQ8A 1X8FA 3W1NA 1WV2A 3G22A 4QQ3A 3IVSA 4DF2A 3GDKA 5IM51 1NEYA 4EF8A 4N9CA 3W7LA 1W1ZA 1KFCA 2OCZA 2ZYFA 1JCMP 2CLHA 5AC8A 1CX9A 5HULA 1VJIA 1FCQA 1VCVA 1M5WA 5AHMA 1OX6A 2DZXA 2VELA 4FNQA 3LCHA 3QPYA 2GVJA 3DU0A 3P5ZA 2H6RA 2QDHA 1CI1A 3TSMA 4K36A 2WNQA 2OMAA 4UMBA 2GQ9A 4Y96A 1TV5A 3UZ5A 3F03K 1R2SA 2Y61A 2A7RA 4S1FA 1GTHA 1VR6A 1YTDA 3FYPA 2ZRYA 1LOQA 4IJBA 5C55A 3EWWA 1JVNA 1IIHA 5H2ZA 2P0OA 4WQ6A 1Q45A 4IMEA 1XUZA 3OG3A 3QQ0A 3STCA 1ME7A 1SZNA 3DZ1A 3BGGA 1LDCA 5AHFA 2GQ8A 4UTWA 3O8AA 1XUUA 3NR0A 1KM4A 3O07A 1XL9A 2FTPA 3DH7A 4JTUA 5G1TA 4JTFA 1K02A 4MZYA 1SZFA 5K7JA 3W72A 5DCDA 3VKJA 1LZOA 3W76A 1FCVA 2RDWA 3IIXA 5FI8A 4NZJA 4UR7A 1O95A 1LLWA 3C8FA 4O1DA 3TROA 4LC6A 3KVLA 3E49A 3YPIA 1FWSA 1BKSA 4FF7A 3UY8A 2ZRWA 3UD6A 3MBDA 3BW3A 1SFJA 3DFSA 3GVGA 2ZZ3A 3TSBA 4JYFA 4PL2A 1UUOA 1LP6A 4BWLC 4O15A 4ZQCA 2DORA 1ZAJA 1RQBA 2QUVA 4NXKA 4PL1A 3UWVA 4BR1A 1FUYA 3LI1A 4EOUA 3CHVA 2C14A 3O16A 1WX0A 3HBLA 5FESA 4JD4A 2B7NA 3T78A 4JTGA 1V7YA 1SW0A 1KLYA 3CIWA 1QFEA 3G24A 3PUOA 3M5ZA 3JR2A 3EX3A 3LHUA 1LBFA 5IBXA 4FXRA 3PBYA 3PWAA 3P67A 3PVFA 2R91A 3CB8A 3BG9A 3EEGA 2RFGA 4Q4KA 4GFSA 1K8ZA 4WD0A 3LHZA 1W8SA 1JULA 1ME9A 2ZBTA 5DY3A 2Z6JA 5AHEA 3W7QA 5LNRA 4DF0A 2DZUA 4JYDA 2FLIA 5D37A 2DU2A 3BLEA 4UTTC 3BLIA 4M6PA 3S1VA 3KOFA 1F6PA 1YXDA 1XBZA 4R53A 4LV9A 4W9TA 1SSDA 1TTIA 3L65A 4AWTA 3NQ7A 1FWRA 1EP2A 3W75A 4JN6A 1VYPX 5AHNA 1K7XA 1FXQA 3SECA 4YL2A 2YZRA 4LOCA 1GOXA 2V30A 1GJPA 5CZTA 3N14A 2E1DA 2PC4A 3G18A 4OQVA 3W73A 5CPOA 3BLFA 2WPBA 4UCGA 2QEZA 1OABA 3L21A 5LHEA 1JCLA 3KXQA 3NQ6A 3P8JA 1BTMA 2YXGA 1NAL1 3QSRA 3FEMA 2RDUA 3RF9A 3NM1A 2H3BA 5EA9A 4PFMA 1ZNNA 4JX6A 3IIPA 3TW7A 4LVDA 2CLEA 4RZ5A 3KFTA 1EUNA 1H1ZA 3M44A 3G0XA 5D38A 3OBKA 4K38A 3ABQA 1GVFA 4PEKA 2Y89A 4O18A 4GXMA 3GLCA 3O06A 2TRSA 1ZALA 3UY7A 4CNOA 5CGQA 4TMCA 1TSIA 3M47A 2QUTA 2V82A 1KLZA 1OHLA 2Y7FA 2Y62A 3HGSA 1SFLA 3S1WA 1I2NA 3LCGA 3HGJA 4HNVA 3NQFA 4MJMA 3P8IA 2C3ZA 1I2QA 1FDJA 1TTJA 4O1AA 1S5TA 4UTHA 3EKLA 3HIJA 3S5OA 2ALDA 1QR7A 2CW6A 4MZ8A 2QCFA 3SFKA 4POCA 5AYXA 4LVAA 3I7SA 1NF7A 4JX4A 3E96A 2GOUA 5G5IA 4N9DA 3T7VA 3EWUA 4N6EA 1YXCA 4HNNA 2HS6A 3U2OA 3NL5A 4Y8FA 3L66A 3EB2A 2Q3OA 5D2WA 1FWNA 2A7NA 2RDTA 3S1UA 1W31A 1VPXA 1GVQA 5DLCA 3B0VC 2QCMA 3M5YA 3D0CA 3LCIA 1XDLA 1LRNA 1VC4A 2PURA 1B4EA 2Y85A 4HT3A 4ORMA 4AWUA 1QNVA 1WOBA 2YR1A 5FEXA 3PULA 2W0UA 3RLUA 5LNUA 2ATMA 1VH7A 3B06A 1VYRA 3UXDA 2NWRA 2NZLA 1YDOA 1OFOA 1WXJA 2Q3RA 4XKYB 2VEIA 3RNDA 3QFEA 2C1HA 2KZHA 4ADSA 5D2TA 3W70A 4O4VA 3GZ3A 2ZZ1A 3ZFHA 1O94A 2FPVA 4LS1A 4WXZA 5DXYA 2E68A 3G3DA 4AF0B 5DN1A 4QITA 3FYOA 3DBPA 3B8DA 3EXRA 5F2IA 2VXNA 2BLEA 3O6YX 5LNSA 4QNEA 1C9DA 3IIZA 4LTSA 2C16A 2DZTA 1EIXA 4FIQA 1UCWA 3T44A 3W2JA 4JTJA 1JRCA 2YGYA 3TX9A 3JS3A 1F05A 1XBYA 4RZ6A 2JKEA 3S8HA 4IPJA 2EKCA 3OVPA 3Q2DA 1H7OA 3FKRA 4GC4A 3VE9A 3NQ2A 5K4XA 2PCQA 4LVGA 4N6FA 5LGZA 2ISWA 1KM6A 1X7FA 3IGUA 2J9YA 2WO5A 3NGJA 2FB3A 4WZHA 2ATSA 4O0KA 3PY2A 2BSLA 3W1RA 1HUVA 4WOZA 3CPRA 3OIXA 1SW3A 3DXIA 3W7RA 3UWUA 2A21A 1GVRA 2WV8A 4UTWC 3OVQA 3Q37A 5AFDA 2ABBA 4LUIA 3NM3A 3BG5A 3FS2A 4OV4A 3N9RA 3A5VA 1KTCA 1KFKA 4NJHA 4MKNA 4UFKA 2V2DA 4OWGA 3HQ1A 1XBVA 4FXSA 4LY8A 3W83A 1TV7A 4QIUA 5CZSA 1L9WA 4JDYA 3HGOA 1PCWA 3MMTA 4MY8A 3RU6A 1XXXA 4NQ1A 1TPFA 3IRDA 4UTUA 4Q32A 3EWZA 1LROA 3F4NA 3P7YA 3THAA 1R2RA 2PRMA 4LRSA 1VS1A 1XCFA 1YADA 5LGXA 4MIMA 5HWMA 3TUUA 3HB9A 5F1UA 4ZL1A 3WK2A 1HFBA 4D2JA 4S2CA 1VCFA 4MZ1A 5TIMA 2V2HA 1VLWA 2E77A 4WX2A 1KA9F 4FEZA 1JUBA 3DFTA 1G6CA 2DJLA 3QJAA 4O19A 3PG9A 1JCYA 3THQA 4JTLA 2A2IA 4AWSA 4BI7A 1P1XA 4NNAA 3CWOX 5LSMA 4JY8A 3W7EA 4IMDA 4RLIA 5E0KA 2HSAA 4A21A 1H50A 1J5TA 2ABAA 4JDBA 1A5SA 2BXVA 3OHIA 1XC4A 3B05A 3LLFA 1JRBA 3CEUA 5FF7A 3ELFA 3C2VA 1MEHA 1KW1A 2YFNA 2E6YA 5FF4A 5AHLA 1YTKA 1K7EA 2Z1BA 4K8HA 4OE7A 2YFOA 3C2OA 4MPQA 4HNUA 4NUWA 1OYAA 4QISA 4DBEA 1GYNA 2VFEA 3EX6A 3W1XA 5I3IA 4PCFA 1X1OA 1KFEA 3W74A 4WY0A 1T96A 3NL2A 3M1ZA 5HUPA 4JGDA 2ZTJA 2DZPA 2P1FA 2ZTKA 3NL6A 4Y6GA 4O16A 1KM1A 3NPUA 1SO6A 3E12A 1ADOA 2V0TA 3HG3A 4FNPA 2WNZA 3EKZA 4RR4A 4O1BA 5BMWA 3DFQA 3HPZA 1ICQA 4O1CA 4OHQA 3QW3A 4ZQMA 3H53A 1L2UA 3MHUA 1Z48A 1DQXA 1W0MA 2F7FA 4IPIA 2B0MA 4WOQA 3IIOA 3W7PA 5D05A 3KVMA 4O57A 4B5NA 2V2CA 2QAPA 3C2EA 4IXXA 1AK5A 1EP3A 3W3OA 4TMBA 1TREA 3UYCA 3TV8A 3LRMA 3W7IA 3A24A 2EHHA 1A53A 5CPLA 1OG0A 1OYBA 3W88A 2CZFA 2X1RA 1OK6A 5F2MA 3GNNA 3SZ8A 1JJKA 2XN1A 4FX7A 3G1XA 3BARA 1MZHA 4HHPA 3ABSA 5LZLA 3MI6A 1W3TA 2YDAA 4XWUA 3BW2A 3NYZA 2RKXA 4IX2A 3QRHA 1GZGA 1G7UA 1KFLA 4Z1CA 3TQ0A 1IF2A 5GVJA 3G8EA 3V75A 2EF9A 3R5EA 4I9AA 1OFEA 1M7OA 5AC7A 4WUIA 3ATZA 5KSWA 3L0KA 3IV3A 2A4AA 2NWSA 4C1KA 3PB2A 3B0UX 3MI3A 1P5BA 3LTPA 1P4CA 3STFA 3NQ8A 5I3JA 1DQWA 2VFIA 3WJYA 3W7HA 1SO3A 1ZJIA 2G5WA 3MP3A 2X30A 4E38A 3LLDA 3STGA 1KV8A 3C6CA 1LLZA 4X22A 5I3KA 5E1QA 4AB4A 3W7GA 3RK8A 2QDGA 3KX6A 5HQEA 1H7XA 5HNRA 2UV8G 1WBJA 1IXNA 4NT0A 4HPJA 2NX1A 4NVTA 3TE9A 5K9DA 1FWTA 2YCEA 5EL1A 1RZMA 1FCBA 1KBIA 2NUYA 3LRLA 1HTIA 2H8ZA 3OEXA 3QYQA 5I3HA 3SGZA 5T26A 3NQAA 3CQ0A 1LBMA 3UNDA 1SSGA 3MO7A 4LWWA 3W2LA 6TIMA 4NNBA 1Q6LA 1YPFA 4ICNA 3HO8A 4UTKA 3QEZA 3DFOA 4CCDA 2R94A 2XN2A 3QC3A 4L4LA 3DAQA 3S5YA 5AYYA 2JK2A 3EWBX 1XKYA 3NVTA 3P84A 1GG1A 4P2VA 4JTKA 3R89A 1SQ7A 1B4KA 4Z0SA 1TIMA 4DEFA 3P82A 1TRIA 2YYUA 3N2XA 1LRTA 4ONVA 4UFLA 4DQWA 3W1QA 1ALDA 1JUEA 1YPIA 3LXBA 1VRDA 1PVNA 2BWGA 4Y9AA 3I68A 3PUEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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