4JTTA

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with 066
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with 057
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 136
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2013-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4jttA00
2CLFA 4JDBA 1Q6LA 4ZVJA 2QAPA 3TK7A 2A5HA 1DL3A 3STEA 3EXSA 1VH7A 2RH9A 3ZWSA 4XTIA 4UTLA 3SGZA 3NR0A 5AHIA 5KITA 3CEPA 1W56A 1LRNA 1N8FA 4BWLA 3VCRA 1M7PA 3S1WA 5IM51 3PG8A 3S1UA 3VFLA 1JVNA 3GR7A 1KA9F 4FX7A 4IMCA 4JICA 5IBXC 1AK5A 5F2IA 4M6QA 3MP3A 2EAWA 1W3IA 2XFWA 3A24A 1FY6A 2ZZ5A 3PG9A 3STFA 1XDLA 1W5OA 3HGOA 4UMAA 1OYCA 3GAKA 3CT7A 4NXKA 3EX2A 3S1VA 1EWDA 4UTJA 3QJAA 2JBMA 2BX7A 4BI7A 1TO3A 5CG7A 3W1LA 4JTGA 4AF0A 1VR6A 4AWTA 6TIMA 1GTEA 3BLFA 2CLIA 5LSMA 3W9ZA 3MBFA 1JULA 3GK0A 1XM3A 2GQ9A 4YXGA 4O19A 5CSRA 1KV5A 4PFMA 3MO7A 4NQ1A 4GBUA 5EKYA 2QF7A 1SO5A 4Y96A 1CI1A 3TROA 1BWKA 3Q37A 4ZQPA 3U6WA 2YX0A 4X9SA 3W7EA 3I68A 2QCNA 2TMDA 3O6CA 1WX0A 4GXMA 3G24A 4JD4A 3R13A 1LCOA 2GJNA 2ZZ7A 1CX9A 4Q33A 2V82A 2E1DA 1TV7A 1SZFA 2NWRA 3NVTA 3HGJA 3INPA 1SPQA 4WY0B 4NJJA 3WK0A 1TV8A 1SFLA 3LRMA 1TJRA 5HNRA 4OQVA 4M7TA 1GTHA 1TPFA 5D2VA 1P1XA 1S5WA 1YPFA 1KM2A 3LHVA 4LWWA 4UC5A 3W7OA 3LTYA 2X1RA 3L0KA 1B3OA 2J88A 2PCQA 2E5DA 4LVDA 4Y9AA 2WSYA 4TMBA 4O52A 3W2JA 5J5DA 1MZHA 4ZQNA 1H5YA 3W87A 1NFBA 3M41A 1UASA 3TE9A 4AXKA 4IMDA 5DY2A 4JTSA 1XUZA 4C1KA 5KZMA 1WXJA 3RK8A 4FNSA 5EPDA 2C3ZA 5DELA 4CQ9A 5LGZA 2OCZA 4RXFA 5D04C 5AYYA 2AQWA 1JUBA 2Q8ZA 4U4MA 4IQLA 3M5YA 1TMHA 4XBSA 1G69A 2NV2A 1WBJA 2R94A 3W1AA 3C2RA 4M6PA 2F7FA 4JEQA 1SO6A 3CWOX 5FF3A 3L67A 2VEKA 4BFAA 1W1ZA 3AO0A 4O28A 1SSDA 5G2WA 4GE8A 3L66A 1BTMA 5L9FA 1OFRA 4WOZA 3G1XA 3P82A 4JTUA 3QYQA 4ICNA 3MYPA 4MY1A 3UWZA 1GYLA 5F2LA 3NQCA 3P81A 1VHCA 2ZBTA 1OX4A 3QMRA 3QZEA 4E0CA 1LM1A 4IWWA 4O4WA 3WK3A 2A7PA 3UYCA 3G0SA 4O18A 1IF2A 4JTJA 5FF7A 3PB0A 4ZQMA 4O54A 1DQXA 3QQ1A 2XN0A 3SY5A 2ZA3A 1EX5A 1KW1A 3W1MA 3QEZA 1DBTA 2QCDA 3U2OA 3WJSA 5AC8A 1IXNA 2VEIA 2VFGA 4UR8A 5KSWA 3WFAA 1A5SA 1ICSA 1OJXA 5T26A 5FEWA 2QCCA 1P4CA 1MXSA 1RQBA 3PBYA 4CNOA 3RLVA 5KMYA 5E93A 4ALDA 5F1VA 1KTBA 1WV2A 2V9DA 2VFHA 3P67A 2ZDRA 5K9CA 4RR4A 1ZAHA 3TMQA 1XUUA 1K8XA 1AL7A 3FJ6A 1B4KA 1GZGA 1I8JA 3P74A 4EWND 1H7XA 1OG0A 1H7PA 3G0XA 1GVOA 2ZRVA 1QPRA 1L6SA 1K7XA 1Y0EA 4S2CA 5AHEA 3E0IA 3A5VA 3UPBA 4WUIA 4N6FA 5LNRA 1S5TA 4WX2A 4YLWA 3G1DA 1ICPA 3O6YX 1K03A 2PE4A 1AW1A 3NM3A 4JY9A 1IIGA 3CTLA 4DBDA 1Q3NA 2AAMA 3A5FA 2QUVA 1TPUA 1I2RA 4IPJA 1JCLA 3W76A 3EKZA 4HSOA 3LCGA 5TIMA 1ME9A 1VCGA 4JX6A 1MEWA 1OYBA 3DH7A 3IIOA 2E77A 1OX6A 3EWXA 5K7JA 4K8HA 4AHQA 4RZ5A 3LHZA 4UTTC 4N9BA 4A21A 2X1SA 4KFOA 1QAPA 5G2HA 1NVMA 2CZ5A 5KZDA 1FDYA 1JRCA 1ZALA 3W2NA 4ZL1A 2BXVA 3F4WA 3HG2A 2C19A 5D02A 5LNWA 1H62A 1I4NA 4MY9A 3W2MA 3AJXA 4DO4A 1TPWA 2FLIA 3FOKA 1TSIA 4IMFA 3W7RA 2YCEA 4IXHA 3NZRA 2J9ZA 2EPHA 3SSJA 3FIGA 1QWGA 3W7IA 5HR7A 3QFEA 1SFJA 4FB7A 4AMAA 3CU2A 3M43A 3M6YA 1HO1A 3RU6A 4P2VA 2O7SA 1QFEA 2A6NA 3QPYA 4GC4A 4LTSA 1QMLA 5C2XA 3GDTA 4MFDA 3P80A 4NJHA 3GNNA 5FEZA 3R89A 4LNYA 1RZMA 4KWVA 1R2RA 4H3DA 1T0OA 4E2BA 3HG5A 2QCFA 3GR8A 4XZ9A 4FHAA 1LBLA 4UNKA 2ATMA 1D9EA 4Z08A 4HT3A 4P61A 4OGZA 1GT8A 1N55A 2WNNA 1T99A 2CZFA 4MZ8A 3C2VA 2ZRUA 3NQ8A 4K6AA 3RF9A 4LW7A 1WA3A 2ALDA 5CPNA 2BWGA 3VKJA 5DN1A 3M44A 1LLZA 5LNUA 5C55A 2QCMA 1W8SA 4MFEA 2H8ZA 3W7DA 1HG3A 1Q6QA 2E5CA 3GXTA 4BK9A 2V81A 3GDLA 3B03A 5ABTA 4RV8A 1TPVA 3A23A 5KINA 3DXIA 3G1SA 2ZRXA 3WK1A 2VELA 4FO4A 2RKXA 3SGUA 5LGXA 1H1ZA 4LS1A 3W07A 3BO9A 2BLEA 1J2WA 1YADA 4I7UA 3ZFHA 3ATZA 3TXVA 3UY8A 3ZS4A 4UTUA 3CC1A 3HBLA 3GZ3A 3DGRA 1VRDA 3Q94A 1VYRA 5D2YA 1QOQA 1TPEA 3NM1A 3LOTA 3LDVA 2GQAA 5CZTA 1XKYA 3C4UA 1LOLA 5AFDA 1DKWA 4RJEA 3W71A 3G8EA 1KFEA 3PUOA 3H54A 4MPQA 2QCEA 5K4XA 4MLJA 2V2CA 1IXPA 5D2WA 2Y63A 4DBEA 1OF8A 2YR1A 4DQWA 2KZHA 5G5IA 1VZWA 3W7NA 3LTPA 4O17A 1OFDA 2YXGA 5D37A 1KBJA 2JK2A 5IBXA 5HUPA 4NVTA 1SO3A 3S1XA 2Y7GA 3M0ZA 3NQ7A 3QRHA 2EHHA 1V7YA 3MBDA 4LVBA 2YSWA 4JR5A 2V8ZA 1O5XA 2DZPA 1JCJA 1R2SA 4DO5A 1P0KA 4OE7A 1PCWA 1VGAA 5FF0A 4O1BA 2V2HA 5HULA 3LCHA 4NZJA 1JCYA 5FF2A 2CLMA 3GX9A 4JTLA 3MJYA 1S3HA 3DZ1A 3NOEA 2A21A 3T55A 4QNWA 3G1YA 1BKSA 1GQNA 4LC8A 2VFDA 3LRLA 3TSBA 1GVFA 2V5LA 4ADUA 1H50A 1GVQA 4QITA 3MP5A 3P84A 4LOCA 5F1UA 3R8RA 2DZXA 4YL2A 2J6XA 3ATYA 3IIVA 4HNNA 3M47A 2ZFAA 3BARA 3DHFA 3DFQA 2WJZA 2E6FA 2FB3A 1ZFJA 3IV3A 2VEPA 2VKZG 3RNDA 4XWUA 3W2KA 4GUJA 3G8RA 1JUEA 3N2XA 3W2LA 5EY5A 4BF9A 2ABAA 2OT1A 1WDWA 3S5YA 1TYGA 3PB2A 2ZZ4A 2DJXA 3B05A 1G6CA 2X2GA 1FCBA 2P1FA 1ZAJA 3THAA 4UFIA 4JTKA 1OVDA 2DJLA 4CNPA 3UZ5A 1TQJA 5FF4A 4AWUA 2CLHA 1TTJA 1OHLA 3W7CA 4DPQA 1KFCA 2V5BA 3W1UA 4QSHA 4DEFA 5I3FA 3S6DA 1JQXA 1YXCA 3TQ0A 1TTIA 1KFLA 4WXYA 1TQXA 5D32A 5A8GA 4DELA 2WQPA 4ORIA 2A0NA 4WJEA 1Z44A 2E68A 4XTDA 3TX9A 5DXYA 1W5MA 3HG3A 4QNEA 3FYOA 2Q3RA 3NQ6A 1YTEA 4UXDA 3UQNA 5HINA 4R53A 3UY7A 3PS7A 4LUJA 3B06A 3WJWA 5G4WA 4GWEA 1KFJA 4WOQA 4NXSA 1JJKA 3ABSA 4OBTA 3TV8A 1L9WA 3N14A 4O50A 5CPLA 1SW7A 2B0MA 2NUWA 5I3JA 2RDUA 5L6UA 1V5XA 3M1ZA 3TUUA 1XBYA 3HJZA 4FXSA 4O10A 4PODA 1OK6A 3C52A 2FQIA 1K7EA 3NQEA 4JNMA 3NXFA 1YTDA 5CKSA 3N9RA 4FEZA 3LHWA 5F4XA 3L2IA 1W3TA 4AHOA 4HNUA 4LU0A 1ZENA 5G1TA 4M6VA 3ABRA 1SSGA 4N4PA 1L2UA 5U7SA 3V75A 1HL2A 4HSNA 4Z1DA 3R2GA 2ZRWA 3P5YA 5DCEA 2RHGA 1VCVA 1ZHAA 3WJYA 1YXYA 2NZLA 3PBWA 4AHPA 3UNDA 1ME7A 1TJPA 2VXNA 3W7JA 4A2SA 1ONRA 5AHFA 1UB3A 4AF0B 1EPXA 3ABQA 5E0KA 3LHUA 2TPSA 3BW2A 1W5PA 4D2JA 4HPJA 1SQ7A 2Y7DA 4IMEA 2HSAA 5EBUA 1C29A 3O63A 3ABOA 2ZZ6A 1G4PA 1EWEA 2FDSA 4UFJA 4O15A 3OHIA 1FCQA 2Y85A 1A5AA 4PEKA 3W7HA 5C54A 2C14A 1JCXA 4LC6A 3P8IA 5D05A 2I14A 1N7KA 2X16A 3M5ZA 5K3VA 3E9AA 2DORA 2UV8G 4BI5A 4E38A 1KFBA 3TMLA 4R7JA 4IX0A 3IVTA 2GVJA 5HJLA 3NDOA 4FNRA 4Y8FA 4JGDA 1K7FA 4NT0A 3NPUA 3KVMA 3IIPA 2E6YA 1OFEA 2W0UA 1KTNA 1YYAA 2VFFA 2OT0A 3HF3A 1QCWA 4IGHA 1W37A 1VS1A 4OWGA 5C5YA 5F2MA 2ZCGA 3W7KA 5CZSA 1SR9A 2QAFA 3BW3A 3IVSA 3THQA 1TPC1 3EEGA 3CHVA 3PBUA 3TSMA 1FCUA 4GNJA 2GUUA 3MHGA 3M16A 2ZTKA 3EWUA 3S5NA 4KWWA 2Y62A 2OMAA 1KTCA 3FA5A 2CFFA 3MW7A 3N9SA 1VC4A 3ANYA 4GFSA 4NJIA 5G1YA 1FDZA 3O06A 3LCLA 1F74A 1JQVA 2Q8LA 3BG5A 3SIZA 1R2TA 4RCXA 3WK2A 3LERA 1KLZA 2QCGA 3L0NA 1VLIA 1W5QA 4GUGA 3QSTA 3VI2A 3C3NA 1KBIA 4LUIA 1QDSA 1ZNNA 3NQ2A 5CPOA 1DOSA 1KM3A 2R8WA 3NPWA 3MHFA 5K2ZA 3DU0A 2CU0A 1A5BA 1I2OA 3N19B 1XL9A 3LM7A 3GNDA 3TC6A 5LHFA 3LXCA 2EKCA 3EX4A 1NF0A 4FX8A 4GRSA 4I7WA 3DI0A 4DF1A 1F05A 3KRSA 1ME8A 1NAL1 1VLWA 4OT7A 1F76A 1OX4B 3PULA 3BGGA 3C2EA 4A29A 4ADSA 2OJPA 2NX1A 1EIXA 1M5WA 1DJQA 1Z48A 1XFBA 2NX9A 1H63A 5LKYA 5HWNA 1J4EA 4FF7A 3IIZA 3HQ1A 4GJ1A 3E02A 1FUYA 4MUZA 4FIRA 5K4ZA 4MYXA 3W84A 5KZEA 4H4IA 4NUWA 3STCA 2QCDB 1LROA 3H55A 3B0PA 1FXQA 3KRUA 4RZ6A 2H6RA 2CLOA 1UBSA 4RZ4A 4O16A 3EKLA 4MY8A 3W2UA 5D33A 1O5KA 1RQEA 3B4UA 1RQHA 2YYUA 1GOXA 3QH2A 2QJIA 3TFCA 3BGJA 2B7OA 2Z1BA 1XCFA 3TAOA 4OV9A 5AHNA 2WNZA 1FWWA 2D73A 4NX0A 2TRSA 3BK0A 3W6YA 1WQ5A 3NO5A 5BRBA 3LHYA 3S5ZA 4MZ1A 4XKYA 4GUIA 3TA6A 5HWMA 5CZJA 4IUOA 2YYTA 3NZ1A 1F73A 1HTIA 4WZHA 1I2NA 4PTNA 1KM5A 4K8EA 3NPXA 3DFTA 4NNCA 3NQVA 1G67A 1B4EA 1H51A 5DY3A 3T44A 3VNDA 1KM4A 3PUDA 1ADOA 3R5EA 1EP2A 3T78A 4JTFA 2B4GA 3TDFA 2HS8A 2O7QA 2WSQA 4UCGA 1S5VA 1LBFA 3DFPA 4QISA 4X22A 1YXDA 2DP3A 5BW6A 2A6LA 3HPXA 6ALDA 4HNVA 3I65A 3IGXA 3KXQA 3KVKA 2QJHA 1VHNA 2ZZ3A 5BMXA 4K36A 4TX9A 3C2FA 4EF8A 3TXZA 1VJIA 1QPOA 2C18A 1CW2A 1LOQA 4B5NA 2B7NA 1EEPA 3BG9A 5HQEA 4DO6A 3HO8A 1ZCOA 2QUTA 4K7VA 1C9DA 2X30A 2GOUA 2BTMA 3GDKA 3W23A 3U8GA 3HPZA 1RPXA 4N9CA 3HB9A 1O95A 3LCWA 3PSVA 3NL2A 3JR2A 2GVGA 1YDVA 1H61A 2ISWA 1I45A 4O12A 4QQ3A 2Y7FA 3CIXA 3B0UX 1OFPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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