4JYE | Genus

Total Genus 141

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	141
sequence length	347
structure length	346
Chain Sequence	MTGREILEKLERREFTREVLKEALSINDRGFNEALFKLADEIRRKYVGDEVHIRAIIEFSNVCRKNCLYCGLRRDNKNLKRYRMTPEEIVERARLAVQFGAKTIVLQSGEDPYMPDVISDIVKEIKKMGVAVTLSLGEWPREYYEKWKEAGADRYLLRHETANPVLHRKLRPDTSFENRLNCLLTLKELGYETGAGSMVGLPGQTIDDLVDDLLFLKEHDFDMVGIGPFIPHPDTPLANEKKGDFTLTLKMVALTRILLPDSNIPATTAMGTIVPGGREITLRCGANVIMPNWTPSPYRQLYQLYPGKICVFEKDTACIPCVMKMIELLGRKPGRDWGGRKRVFET

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Biotin synthetase, putative
publication title	X-ray snapshots of possible intermediates in the time course of synthesis and degradation of protein-bound Fe4S4 clusters. pubmed doi rcsb
source organism	Thermotoga maritima
total genus	141
structure length	346
sequence length	347
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-03-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04055	Radical_SAM	Radical SAM superfamily
A	PF06968	BATS	Biotin and Thiamin Synthesis associated domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4jyeA00

2FDSA 3NPUA 2C14A 3LCLA 4JTFA 3DENA 3E12A 4PTNA 4UFIA 5KZDA 3S1WA 3S9YA 4KFNA 2QR6A 1JCMP 4ZQMA 3ZWSA 2DZTA 3TAKA 2E5CA 1UUMA 3S5OA 3FYPA 3CWNA 1TQXA 2BZNA 1K8ZA 2LLEA 4N9EA 2GVGA 4HSOA 4KWWA 3W2LA 4RCXA 4M19A 1WAUA 2NUWA 3SFKA 2DORA 4IOTA 3USBA 1HFBA 4LVFA 5EPDA 2ALDA 1QPNA 2ZA3A 3W7OA 2YFNA 3RLVA 1FDYA 1GZGA 3BO9A 2E5DA 4ML9A 1FWSA 2Y85A 3QQ0A 3O6DA 4AB4A 1AW2A 3Q37A 5K4ZA 5F1VA 4JS3A 2VXNA 5D04C 2OCZA 3SIZA 1DL3A 1H61A 5DY3A 1UJPA 1ZCOA 3KRSA 2A2IA 2VEIA 2DJLA 1P1XA 1OHLA 4CCDA 5D33A 5HUOA 3NZRA 1LTDA 4O15A 3MUXA 3NQFA 4NNAA 3LCIA 4O12A 5AFDA 4RXGA 2WKJA 5DELA 3EWWA 3PAJA 5K9XA 2NLIA 3CTLA 4UR8A 2CLLA 3QMSA 1SR9A 4KFOA 3L0NA 1A53A 1YTEA 4K39A 1EUNA 2GQ8A 3NGJA 4IX2A 5HWMA 1QCWA 4MFEA 5BOOA 4RJEA 4UCGA 3V75A 1JUBA 4C1LA 3ELFA 3W84A 4UNKA 3TDFA 3I68A 3SY5A 2CLHA 3G3DA 3I7RA 3IIVA 4M7SA 4CNOA 1KW1A 3W1UA 3LLFA 5G4EA 3GZ3A 4GUFA 4K7YA 5D37A 4S2CA 3PF3A 4OGZA 2VEMA 3PWAA 4O0KA 1ZALA 4DO4A 4QSHA 1EEPA 4UTUA 4ZVJA 3B05A 2WNNA 2VFHA 4O1CA 4JX5A 2Z6IA 1FWWA 3P60A 4WUIA 3W3OA 1UCWA 4MVAA 4XKYA 4I7VA 4LVBA 1K03A 1KA9F 2V2CA 2QCFA 1T96A 3D0CA 2E6DA 4RZ5A 2C16A 1GYNA 1OFEA 4MJZA 3NL3A 2JBMA 2JKEA 1VYPX 4IX0A 3TC6A 1ZJIA 1F6KA 5DCDA 5I3KA 4YCOA 2CWNA 1X6UA 4I7WA 3A9IA 4QITA 1FDZA 5EBUA 3N14A 1SO4A 1AW1A 3TH6A 3C52A 3W9ZA 3EWYA 3TAOA 4IXXA 4GUJA 5G2WA 3OEXA 1IXQA 3G1DA 5MHBA 1YDVA 4XZ9A 4MKNA 2H8ZA 1Z48A 2DZUA 1CW2A 1W31A 4PEKA 1G67A 1PCWA 4M7TA 3L68A 1KFKA 2ZZ4A 3EB2A 5I3HA 3W2NA 3P8JA 4FF7A 4LS0A 2YW4A 2B4GA 5LNUA 5EYWA 2B7OA 1JCNA 5TBOA 3UZ5A 1RV8A 4JR5A 3LV5A 2Z6JA 3B0VC 1EP1A 4O14A 3EX6A 3W76A 4LC8A 3N73A 3UPWA 3AO0A 3RF9A 4GUHA 5FEZA 1VS1A 5G5IA 3W87A 1UB3A 1KTBA 3HGJA 2Y70A 4Q32A 2CZFA 3CU2A 2KZHA 2Y88A 4Z1DA 2CZEA 1GTEA 4UC5A 2QJIA 3QSRA 2CLIA 2FLIA 2A7RA 4A22A 1H7WA 1OK6A 1X1ZA 3NNTA 3EWXA 1LBFA 4JEQA 3S5NA 3ZS4A 3BG5A 4WXZA 3C61A 3NZ1A 1ZAJA 5D32A 2V9DA 4DXVA 3S1UA 3LCGA 3S6DA 3I7SA 2Q3RA 3NYZA 1WYIA 1LLWA 4JTUA 1TO3A 2Y7GA 1Q6OA 2QCDA 3R2GA 1QO2A 4HKPA 1C8VA 4GFSA 4LVGA 3W1RA 1HL2A 2GVJA 3M5XA 3F4NA 2QCDB 2GVLA 2RDWA 4QISA 3N3MA 1HO4A 4JTTA 4MZ1A 2QF7A 3CM4A 4OV9A 3B03A 4LVAA 3MI3A 1SSDA 4WZHA 3KVJA 3C8FA 5CPLA 4R7JA 2Z2UA 4H3DA 2QUTA 2FFCA 2HSAA 2PRHA 4PA8A 4EF8A 2NXHA 3FFSA 3S8HA 1TTPA 2C19A 2ZZ3A 4UNLA 4NJHA 3NQ6A 3PUDA 4Z1AA 1T99A 1B4EA 1UBSA 4O17A 3UWWA 3BW4A 3TKFA 3BGJA 2IQTA 2WNQA 2C0AA 1HO1A 2QUVA 1LBMA 1W3NA 5AHLA 3W2UA 5DY2A 3BLIA 1P5BA 2W0UA 1SW0A 3CLMA 1TCDA 4ONVA 3CIWA 5CG7A 3M5VA 3MHFA 4Y8FA 2A6LA 4TMBA 3W71A 4RV8A 3MHUA 3W7JA 3CC1A 1FCBA 4AAJA 3EKLA 1TB3A 3NQ8A 3W1TA 4TIMA 2HMCA 2ZRXA 3C4UA 4WD0A 4CNPA 1WBJA 4JYFA 6TIMA 1SZGA 1PHQA 2YYTA 4FIQA 3PBVA 1GTHA 4DO6A 3QSTA 4KFPA 1OX4B 2Q8ZA 1FWTA 4FEZA 4LUIA 2PE4A 1KM4A 2QCNA 2C18A 1L6YA 3FKRA 5D2YA 4GC4A 2OX1A 3GLCA 1OFPA 4O0ZA 1QOQA 5C6MA 1TIMA 3ANYA 5CGQA 1F6PA 1VYRA 3NPXA 1JRCA 3EX2A 4FNQA 3LTSA 1DHPA 1TPC1 1W5PA 4RZ6A 3SJ3A 2E6YA 3LOTA 3EEGA 2PC4A 1UASA 2VELA 3L5LA 2GQAA 4ICNA 1JR1A 4ZQNA 1PE1A 3NQDA 3FJLA 3DI0A 1XC4A 3G1FA 3CPRA 3R8RA 3A21A 3L0KA 3W1MA 4OQVA 2ABBA 4XQ6A 3BVJA 4PL2A 4TX9A 2I1OA 4R34A 1KTNA 1AW5A 1TPB1 1OFAA 1X8FA 3E02A 4DPQA 1EA0A 1W1ZA 3TK7A 5D2XA 5FF2A 3VFLA 3DFQA 3TUUA 3PC0A 1SU5A 1KFLA 3W2KA 3W7NA 1VRDA 5FF7A 1J5TA 4UTJA 3U8GA 1D3HA 4PC8A 3SSJA 3PY2A 5E1QA 2DZSA 5J5DA 4N4QA 4R53A 3F1QA 4NX5A 3W7RA 1RR2A 3GNNA 2J88A 3T4CA 5I3IA 3QQ1A 4WOQA 3MP5A 3I65A 4Y9AA 5CZSA 5FF0A 5LGZA 2QDHA 1THFD 5FEPA 3W7HA 3QW3A 4K7VA 3STFA 3C2RA 1OG0A 3TC7A 3WJZA 4OV4A 3GR8A 3LXAA 1WV2A 3CIXA 1A5AA 5AHEA 4MY8A 3P7YA 4JICA 1ICSA 3W7DA 1JJKA 4FHAA 1H60A 3NOEA 1FDJA 4YWIA 1F2JA 1YTDA 3HGOA 2WSQA 4GNJA 2XN1A 5LNRA 3CEUA 2DU2A 1BKSA 3DH7A 3W7CA 3MHGA 3PG8A 3QEZA 4DF1A 1EX5A 3MWAA 4IMCA 1TV5A 4IWWA 3G0UA 3GXPA 1SZEA 3H55A 2VEPA 4LWWA 3FA5A 5LNWA 2J9XA 4AWTA 1DJQA 3QM3A 3SZ8A 1LP6A 5K3VA 3HPZA 3TJXA 3VNDA 5D38A 3HG3A 1OJXA 1PVNA 1T0OA 1MEHA 5KMYA 1JQVA 2YR1A 4XTIA 3IVUA 2NUXA 1WX0A 3EWBX 4JXCA 2JGQA 1G6CA 5FESA 2ZA2A 1PV8A 5D05A 1G7VA 4JY9A 5H2ZA 3M9YA 3W83A 2A5HA 4O19A 1I45A 5AC8A 2QCEA 3TW7A 4A2RA 3TIMA 2CLMA 3GDMA 5FI8A 3WK3A 1OFBA 4GJ1A 4IPJA 4WY0F 2OT1A 1H7NA 3GKFA 4MIMA 4O50A 3NPVA 5LNSA 1OFDA 3LERA 3WJSA 1EUAA 1YPFA 1C9DA 4TU1A 3NQVA 2E6AA 4JTLA 4OWGA 5I3GA 1QPOA 5LSMA 3R89A 1DV7A 3T55A 2B7PA 3DZ1A 4IUOA 3STCA 2Y61A 3QMRA 1TPVA 5KZEA 1L6WA 5CPOA 1ZENA 5KSWA 1QDSA 1N8FA 1F05A 3BK0A 3A23A 1N7KA 3P5YA 3P84A 2DZWA 2QKFA 5D03A 2V30A 4NU7A 3RU6A 3PVFA 2VFEA 3HOJA 3G24A 4ALDA 3N19B 3QFEA 1GJPA 4WQ6A 4NVTA 1LROA 3IIXA 1GVQA 1R2RA 5DBUA 4K37A 4UFKA 4WY0A 1O4UA 2GPTA 3STGA 3NA8A 3HB9A 1XFBA 3G1SA 3O15A 3UXAA 3IGUA 3W7EA 4WY0B 4LW7A 3MP4A 1TTQA 1ME8A 2FB3A 4UFJA 2JKPA 3TFCA 1OABA 2VKZG 1TPH1 4UTKA 2OT0A 3DU0A 3EX4A 5F4SA 4O1DA 1VLIA 2FB2A 2J27A 3M6YA 1FXQA 1ALDA 3BW2A 1GT8A 3SW6A 3W73A 1AK5A 2CU0A 4IMEA 3DI1A 1B4KA 1UUOA 2QCCA 2Y89A 4H6KA 3C56A 3O8AA 3U6WA 2J9YA 1K7EA 3DBPA 4JDYA 1LBLA 3B04A 3GDKA 1W5OA 1T8XA 4UMAA 3LCHA 4MY1A 1PCKA 3G18A 4UFLA 1TPEA 2NUYA 1I2PA 5LKYA 5BMWA 3IVTA 1S5TA 2FTPA 1JCYA 4DBEA 4X22A 4BFAA 3LRKA 2HS8A 1KFCA 4O16A 3S1VA 1G69A 1OFRA 5GVJA 5EKYA 1XXXA 1K3UA 3UXDA 2Y7FA 3NM1A 1KM6A 3NR0A 3QC3A 1L6SA 3L0GA 4QQ3A 1BTMA 3UZJA 3QJAA 1QWGA 3FYOA 1TRIA 4QNWA 1B9BA 3A5FA 5D2TA 3IIPA 4PH6A 4L4MA 1O60A 1IXPA 2Y6ZA 5BW6A 2ZDRA 3O06A 1I2OA 2QCMA 1H62A 4N9CA 4LTSA 4N9BA 4Y6GA 4ZQOA 1XI3A 2F7FA 1PHWA 1X7FA 3LV6A 4LY8A 2A21A 2EHHA 1F74A 5ABTA 1YDNA 4FX8A 4BI6A 3R5EA 5HMSA 1AG1O 3PM6A 5TIMA 3FKKA 5IM51 4K8EA 4RK8A 1SO5A 4E2BA 3UNDA 3W23A 4FNSA 5KINA 2V0TA 5LHEA 1F7BA 3BV4A 1W5MA 3C2VA 2X16A 2E6FA 4MLJA 4WX2A 5H91A 4RKAA 5G4WA 2QCGA 3BW3A 1ME7A 2UV8G 1TQJA 3TA6A 5F2LA 4Z0SA 5T26A 2D73A 4MFDA 3K30A 1D3GA 4J9JA 4NJJA 3W1XA 4ADUA 2X1RA 1KBIA 1SZNA 1NF0A 3WFAA 2JKAA 1NSJA 4ZQCA 4IXHA 5HWJA 1DJNA 2H3BA 2C6QA 3L66A 3LCXA 1M6JA 4PFMA 1H1YA 4LS2A 3CT7A 4PODA 1LOQA 1OYAA 1YTKA 3HIJA 1W5NA 2ABAA 2W79A 1YDOA 1TSIA 3P62A 4A2SA 3UD6A 4FNPA 1XKYA 5CKSA 2OMAA 2VFFA 4AF0A 1MO0A 2X30A 1F5ZA 1SQ7A 3W86A 3LHUA 2FJKA 1W5QA 4NXSA 4X3ZA 3MJYA 4AF0B 5CSSA 4JYEA 5DXYA 4HNTA 2A6NA 2ZZ6A 4MZ8A 3TSDA 3VE9A 3WK2A 4FNUA 3DGRA 3G0SA 5F2IA 1Q3NA 4DELA 1VCGA 2HTMA 3R12A 2P10A 3DFOA 1VCVA 1LLZA 3GKAA 4O1AA 3TNOA 3GR7A 1E51A 3O1NA 1FCVA 3VE7A 1SUXA 1FXPA 1LOSA 4MLRA 1LCOA 1R47A 4HIBA 1QMLA 2ZRWA 1Q6QA 3NEVA 4K36A 1OX5A 1WBHA 1FCUA 3N9SA 4ZQRA 4O4VA 5CZ0A 2QEZA 4O53A 1L9WA 3NQCA 1GWJA 3RK8A 4IMDA 5G2IA 5KTLA 3LHVA 3IIZA 1OF6A 4IQLA 3C2FA 2V5LA 1MEWA 3UPBA 3E0IA 4YLWA 2QAPA 1K7FA 4UFHA 1IIGA 2QDGA 4NXKA 3PB0A 3TQ0A 3HG2A 1OYBA 2YW3A 4XWUA 1W3TA 1H51A 4AXKA 4U4MA 4MYAA 1CI1A 2ZBTA 4DF2A 1HG3A 3C3NA 5C54A 3KXQA 3WK1A 3UWQA 4JX6A 5I3JA 5AN7A 2V81A 3OIXA 2V82A 5L6UA 3L5AA 4MZYA 3ABSA 4DEFA 3SGUA 1F76A 3M16A 3EXSA 3MYPA 5L9FA 2VC6A 2AAMA 3M1ZA 3MO7A 4UTMA 3W74A 3W88A 3W75A 2C13A 2YDAA 2TRSA 4W9TA 4FO4A 4GWEA 2ISSA 2EF9A 4FNTA 1YXDA 1O5XA 2Z1BA 2R94A 3NVTA 8TIMA 3O63A 2WV8A 3MI2A 1P4CA 4PCFA 2NXIA 2WNZA 1B3OA 3EXRA 2ZRZA 3PSVA 3GVGA 1ZHAA 4DF0A 2V2HA 2QJHA 1VPXA 1RQHA 4A3UA 1KM5A 4BI7A 3HO8A 1M7OA 4HSNA 3BG3A 1QR7A 1U5JA 4JTSA 3S0CA 3QMTA 2RFGA 4LVDA 2H6RA 4H4IA 3C6CA 5A5WA 3TX9A 3KHJA 4GXMA 3G1XA 2V8ZA 3TJLA 4JIPA 4O11A 1ICQA 4N02A 2NWSA 2RDTA 5D09A 3CHVA 5HULA 4JNMA 1SO6A 3TROA 1QFEA 1VJIA 3GB6A 4HHPA 5U7SA 3LI1A 3LBMA 1U83A 4AHPA 4MPQA 2FPYA 4Z0JA 3Q2DA 3DAQA 1OX4A 3GYEA 1XBVA 3NDOA 1G4PA 4GBUA 4ZZ9A 5HUPA 3CB8A 2HS6A 4UTWA 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4XBSA 1DORA 5AHNA 3TR2A 3UWUA 4JX4A 2R14A 5HINA 3TMQA 5FEXA 3P81A 3ZWTA 4K38A 4ORMA 5CPMA 3PBWA 3UWZA 5FEWA 1GVFA 3W85A 3HG5A 1N55A 4P61A 3P74A 3B0PA 1K02A 2P0OA 2XN2A 2BWGA 1JQXA 2VENA 4O1BA 3M5YA 5AB3A 3N9RA 5BMXA 3TCEA 1GEQA 1KV8A 1XDMA 3SECA 2QUUA 1LRQA 4FX6M 4IPIA 2DP3A 4UMCA 3M5ZA 2NV2A 3NG3A 3TQKA 1GVSA 2E1DA 3FEMA 4JTHA 4LS1A 2F84A 4UXDA 3C0JA 3HG4A 3TXVA 1NEYA 2ZZ2A 1OYCA 1ZNNA 4NZFA 2YX0A 1RZMA 4X2RA 4YL2A 3L67A 4AH7A 1TTJA 1A5BA 4OT7A 2R8WA 1VLWA 4JGDA 4M6QA 3I6RA 3P61A 1EP3A 2ZTJA 4YCPA 4TO8A 1EP2A 3QRHA 3VI2A 1FBAA 5SWUA 3DFSA 3IGSA 2E77A 1WA3A 1H7OA 4MOZA 2O7QA 3W1NA 1G4EA 2PRLA 3THAA 2DZVA 5HQEA 1MZHA 2Y7DA 1FY6A 3NPWA 4AHQA 5AHFA 2E5BA 3PB2A 4BR1A 5TQLA 3KVLA 1TV8A 1YLVA 3W72A 4FXSA 4UTTA 3G1AA 4UTTC 2YPIA 4O8RA 3T44A 2C3ZA 3UWVA 1XCFA 4NX0A 4RLIA 3HPXA 1GPWA 3W1QA 1W3IA 2Z0IA 1OF8A 1XUZA 1AL8A 2FIQA 1FCQA 1DBTA 5HR6A 5C55A 2A85A 1K8YA 2P1FA 5E0KA 1XBXA 3DHFA 1IGSA 3O05A 3NL6A 5F4XA 2ATSA 4ADSA 2TSYA 1H7PA 3W1LA 2PCQA 1NAL1 3QYQA 2A7NA 4NNBA 5CPNA 1TMHA 2I9EA 3MBDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4JYEA

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Chord Diagram

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