4K37A

Native ansmecpe with bound adomet
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
368
structure length
364
Chain Sequence
PLSLLIKPASSGCNLKCTYCFYHSLSVKSYGIMRDEVLESMVKRVLNEANGHCSFAFQGGEPTLAGLEFFEKLMELQRKHNYKNLKIYNSLQTNGTLIDESWAKFLSENKFLVGLSMDGPKEIHNLNRKDCCGLDTFSKVERAAELFKKYKVEFNILCVVTSNTARHVNKVYKYFKEKDFKFLQFINCLDPLYEEKGKYNYSLKPKDYTKFLKNLFDFWYEDFLNGNRVSIRYFDGLLETILLGKSSSCGMNGTCTCQFVVESDGSVYPCDFYVLDKWRLGNIQDMTMKELFETNKNHEFIKLSFKVHEECKKCKWFRLCKGGCRRCRDSKEDSALELNYYCQSYKEFFEYAFPRLINVANNIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Anaerobic sulfatase-maturating enzyme
publication title X-ray structure of an AdoMet radical activase reveals an anaerobic solution for formylglycine posttranslational modification.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 136
structure length 364
sequence length 368
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.98.-:
pdb deposition date 2013-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04055 Radical_SAM Radical SAM superfamily
A PF13186 SPASM Iron-sulfur cluster-binding domain
A PF13353 Fer4_12 4Fe-4S single cluster domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4k37A00
2YZRA 1TTJA 3L21A 1C8VA 4Z1CA 1LORA 1JRCA 4PFMA 1W5PA 4RX0A 1RPXA 2WJZA 4AVFA 3L5LA 3BV4A 3H54A 3EXTA 4I7UA 2YYTA 3DU0A 3DKLA 1F05A 1QR7A 2QCNA 3EKZA 1EWEA 4MVAA 3W7MA 3V75A 4R7JA 3GAYA 2A1YA 2ZZ6A 5D04C 1EIXA 1OFAA 5CSSA 5L6UA 3R12A 2GQ9A 1FDJA 3IIXA 4NVTA 2Y70A 3IGXA 5FF0A 3EWYA 5U4NA 2RKXA 3L9CA 1D3GA 2LLEA 1UJPA 1J5TA 1BWLA 4GE8A 2B7PA 1OFOA 3NL6A 1OFQA 2R91A 5BRBA 4K38A 1F7BA 4Z0SA 1W56A 4ORIA 1KBIA 1K3UA 1WXJA 2DJXA 3M5ZA 4O1DA 2DZSA 4HSNA 3LLFA 3CWNA 4A3UA 3PULA 4S2CA 3GXTA 2QCDB 2CLLA 3TJXA 2PRHA 3U2OA 3PF3A 2BTMA 4Y90A 5G2WA 5HULA 3DFNA 4IUOA 3DI0A 4ONVA 2WQPA 2F7FA 4O1BA 4Q4KA 3RFAA 1KM0A 4WOQA 4Y8FA 3N9RA 4MIMA 5I3KA 4LVFA 3DHFA 1KM6A 5D09A 1OFEA 2HS8A 4LC6A 3TCEA 1VHNA 3W1LA 4RCXA 1LBFA 3PSVA 1FQ0A 4O4WA 3R13A 1HO4A 2PURA 1VYRA 3HGSA 3O06A 5IBXA 5DBUA 2YSWA 1H5YA 1JQVA 3VFLA 1OX5A 3GZ3A 3NAVA 5MHBA 2ZCGA 1O4UA 3W85A 2QF7A 3W71A 2E6AA 3TR2A 4XWUA 3O6DA 1FXQA 3LV6A 1FCQA 1YXYA 2QUVA 1OFRA 1AK5A 1MEIA 4CCDA 3THQA 4ZVJA 3W2UA 5D33A 1KLZA 3NQMA 1GVSA 2A0NA 3FFSA 5G2IA 1Z44A 2E6FA 1NEYA 3W7EA 2VFGA 3CU2A 3DH7A 5D2VA 5BNKA 1D3HA 3HIJA 1I2QA 3W1RA 2DZXA 3P74A 1WOAA 4KWVA 3M16A 1KBJA 5KSWA 4MZ1A 3W7KA 2X30A 4DF1A 4LWWA 3DI1A 3GX9A 1EEPA 3DFTA 2VEPA 2R94A 5D02A 2ATSA 2R14A 3ZWSA 1SW7A 3NG3A 4IXXA 3EWZA 4GUFA 1I8JA 4HNTA 1O95A 3ZS4A 3DFOA 5KZDA 1HL2A 1LBMA 1QO2A 4RZ4A 5CPOA 3S5ZA 5AHLA 3HG4A 3QEZA 4UTJA 1T96A 4M5PA 3GDLA 3FOKA 3CEUA 2QAPA 3S1UA 4DO5A 2VC6A 1A5CA 4UC5A 5E1QA 4UTWA 2QCMA 3T55A 3TQ0A 3QW3A 4JYEA 2EF9A 1NAL1 3QMTA 1JR1A 3GDRA 3IIVA 1THFD 4QIUA 1M7OA 4RR4A 4CCCA 3H53A 2Y63A 2JGQA 3K30A 4JY9A 1W54A 1H50A 4MZ8A 5DBTA 1GG1A 3QZEA 3TAKA 1TJPA 3C52A 2ZZ3A 2H6RA 2NV1A 4LOCA 3PB0A 3CM4A 2ALDA 3LBCA 3LHTA 2J24A 4U4MA 1KLYA 3WJYA 1LOQA 1Z42A 1LLWA 4O10A 1LLZA 1L6YA 4K7VA 3UQNA 4AHOA 1P5BA 1TIMA 2NV2A 2QJIA 5AFDA 1HUVA 3MBFA 3W2NA 3LV5A 1K8ZA 1H63A 1VJIA 1XKYA 2GVJA 3A24A 4JDBA 2YW4A 5I3IA 5LHFA 1BKSA 4UFKA 1YDVA 2DU2A 3SIZA 4FIQA 4CLMA 2B7QA 2A5HA 1XL9A 4LS1A 3BK0A 4UTLA 1GTEA 3QW4B 4RXGA 5I3GA 3S5YA 3E49A 5EMUA 5C54A 1UASA 5LNVA 3P60A 1TJRA 3W74A 1OYCA 1JCXA 5KINA 1F6KA 1P4CA 3MHUA 4BWLA 5TIMA 3Q2DA 3HG2A 1LCOA 3NXFA 1PCKA 3W2KA 3NOEA 2V5LA 3W2JA 5AC6A 5AYZA 4KKXA 2TPSA 3A21A 3SI9A 3UNDA 4HNNA 4DF0A 3UY7A 2DP3A 1IXOA 5D2XA 4O52A 4XKYB 3MBDA 1UBSA 2C0AA 5CPMA 5HR7A 4Z1DA 3VE7A 2PCQA 3NVTA 3Q58A 3L67A 4LUJA 3R89A 1VLIA 3PWAA 3W22A 3B0VC 2NUWA 2TYSA 1DHPA 4FX8A 1JRBA 4TR9A 3RLVA 5I3JA 1OX6A 1SQ7A 4UCGA 2VEKA 1SZGA 1WA3A 1Q6RA 3QH2A 3WK3A 4UFLA 2W6RA 2JBMA 4TX9A 3W1PA 1TPC1 2J27A 2V81A 1SZNA 3TROA 2VFFA 3G1DA 4MPQA 1QPNA 1KFLA 1PE1A 1Q6OA 1W3TA 3GYEA 1O5KA 4FNPA 4JTKA 5CZTA 3MI2A 5AC8A 4AF0B 2QAFA 3LXCA 4IX2A 4DQWA 3HGRA 1GJPA 4WY0A 1XUUA 3G24A 2VOMA 2H8XA 2JK2A 4NXKA 4RJEA 3TV8A 5LNWA 3LGEA 3HOJA 4HKPA 3STFA 1I4NA 1TTPA 3G1VA 1NFBA 3GNDA 3BW4A 3TKFA 3UWWA 3IRDA 2CLIA 4JY8A 1KTBA 4RXFA 1WDWA 2FLIA 3OVRA 3S1XA 3DXIA 3BG5A 1IXNA 1FBAA 4LRSA 1WBJA 4W9TA 1IGSA 2NX1A 1TPVA 3LTSA 4FXSA 1OX4A 4UR8A 3FA5A 4LV4A 1FX6A 1TRDA 1X8FA 2H3DA 2ZRUA 3BLIA 1R2TA 3M5XA 2ZA2A 4IJBA 4ZQCA 1TPEA 1FWNA 3B03A 5LNSA 3B05A 3WFAA 4LT9A 5D03A 3STCA 3W2LA 3NQDA 1G4EA 4TU1A 3M47A 3W6YA 2C6QA 2Z2UA 2OT0A 4HT3A 3S1WA 1W3NA 2XN2A 3G0XA 4O28A 3T78A 4DBDA 3W7QA 4UTHA 4MKNA 4JX5A 3L66A 1JUEA 1LOSA 5LNUA 1K8YA 4HNVA 3OG3A 1BEUA 1WOBA 1G4TA 1W8SA 3TSDA 3TAOA 3I7QA 3UWYA 1F73A 4QQ3A 3UZJA 2EPHA 3W1MA 1JULA 2YDAA 1IIHA 3W7DA 2E77A 3GDTA 5FF2A 2Y7DA 1SFLA 5AHMA 2HSAA 1YDOA 5AOUA 2V5BA 1KFCA 3N34A 3KVKA 2GQ8A 2V30A 1OABA 2CWNA 3BG3A 4UTTA 1OFDA 1JUBA 4FIRA 2CU0A 3HGOA 1JCMP 2OX1A 3EWBX 4CCEA 4ADUA 4WJEA 2Z1BA 4J9JA 3PR2A 2WNQA 4IMGA 4Y96A 4BFAA 2WSRA 3IVTA 3ATYA 1IF2A 3F03K 4LV9A 5AC7A 1SZFA 2P10A 3P84A 5EA9A 2DORA 3STGA 3CTLA 2JKEA 4JNMA 5AN7A 5C55A 1K03A 1I2PA 1TPH1 3CHVA 3KVJA 4NJKA 4NNBA 3UWQA 4AWSA 3Q37A 4DEFA 1H1YA 2Z6IA 4P61A 4LY8A 3S6DA 2GJLA 4UFJA 1K7FA 3TE9A 1AW5A 4JICA 4S2BA 4UMCA 3JS3A 3QPZA 2B4GA 3TSMA 1U5JA 3NPWA 2J9XA 3KAOA 1LOLA 1B9BA 4LVBA 4YXGA 1UUMA 1W31A 4Y9AA 1ZNNA 4UTKA 3C6CA 1EWDA 3QJAA 3EEGA 1O94A 3BARA 2FB2A 4M6QA 2G96A 4RZ5A 3W84A 4UUIA 3HJZA 4IWWA 4Z1AA 3OIXA 1GVQA 2Y85A 1M6JA 1FCVA 1MSSA 3UY8A 4O16A 3VNDA 1NVMA 5F4SA 4R33A 2Q8ZA 4O1AA 5CPLA 3M5YA 4LVAA 5KTLA 4JR5A 4JTTA 3M41A 3R8RA 2E5BA 2ZRXA 1ICPA 3NPVA 2WO5A 4MFEA 3WJWA 2DZVA 2PRLA 5J5RA 1UCWA 2OJPA 3I6RA 3GR8A 2HTMA 3IIOA 1W3IA 3W73A 5BMXA 3TSBA 3RF9A 5LSMA 3LHVA 5D2WA 4N6EA 3GLCA 1G7VA 1JCJA 2Y6ZA 4MLJA 2C19A 1AMKA 4AEOA 5EYWA 4JTIA 4JX6A 2H3BA 1DL3A 1PS9A 1YLVA 4PCFA 1OVDA 2WPBA 2BSLA 4JIPA 1GVOA 1H61A 2V82A 3HQ1A 4TIMA 2QEZA 4YLWA 8TIMA 2P1FA 2ZRWA 4O50A 5K9DA 1S5TA 5CPNA 2ZZ5A 1ME9A 3O63A 5CKSA 1EX5A 3R5EA 3OVQA 4PH6A 1AL8A 3O6CA 1ZY9A 4O11A 3QFEA 3C8FA 1P1XA 4CNPA 3OHIA 3W75A 1TV7A 5H91A 4IMEA 3ANYA 1EA0A 3EXRA 5AB3A 1SR9A 1QCWA 3BLFA 3L0NA 1XM3A 3W7CA 1U83A 1HG3A 4A22A 4A29A 1X1ZA 4OBTA 5LGXA 4JXCA 4N02A 1GVFA 3OBKA 1MEHA 1IXPA 1R2SA 3G1XA 1PIIA 4XZ9A 4BI5A 3GK0A 3S5NA 4MY9A 2YW3A 5FF7A 4EVZA 2FDSA 2V0TA 4JTLA 3EWUA 4PC8A 1ONRA 2H90A 3P5YA 3TFXA 1L6SA 2A6LA 4D2JA 3OA3A 1QPOA 1AL7A 1SZEA 3UXAA 1GWJA 4O15A 3W2MA 2QJGA 2QKFA 1JCLA 1EUNA 5D32A 5HUOA 1ZENA 1XDMA 1FWSA 2A7NA 3F4NA 1OF8A 1JJKA 3G18A 1SUXA 1C9DA 1Q3NA 1PL9A 3CIXA 2F84A 2J88A 4WY0F 4DO4A 5DXYA 4NUWA 4DF2A 3QMRA 3O8AA 3NQGA 2OT1A 1AW1A 5FEZA 3W07A 4WOZA 1P0NA 1I2NA 5KZEA 4NT0A 3PM6A 1MZHA 2B7NA 1FY6A 4NNAA 1KM5A 3N19B 3NPUA 3N14A 3D0CA 4M6PA 3GR7A 1VCFA 1W5NA 2QUTA 3CT7A 5G4EA 1LTDA 1VH7A 5D30A 1T0OA 4JTFA 1L9WA 1G4PA 2A85A 3TH6A 3EXSA 3RLUA 3PUOA 3TW7A 2WSYA 1VQTA 3NQ7A 3HG3A 2C18A 3W7NA 3UYCA 1QWGA 2CLHA 2ZZ2A 1TO3A 1QO5A 5K4ZA 2QCHA 3RU6A 4OQVA 3UZ5A 3KRUA 5G1YA 3G1AA 4WD0A 5FF3A 4JTHA 3DENA 3G1HA 2GOUA 5HMSA 3LHUA 4NX0A 3I7RA 3DKJA 1WYIA 4OE7A 3W1AA 2Y62A 4MUZA 3NQ6A 4WXZA 2X16A 1DQXA 3NM1A 1VCGA 3LRLA 3MI3A 1KM4A 4E2BA 5KITA 1PHQA 2A21A 4NZFA 2CZEA 1JCYA 1JVNA 4FNUA 4ZL1A 3P8IA 3IVSA 1JQXA 3DFQA 3P8JA 4N4PA 3QC3A 4BK9A 4NU7A 3NQ2A 1FXPA 1TB3A 1XUZA 4A2SA 2Z0IA 3NL3A 3G3DA 3KHJA 3QSTA 2C3ZA 3GKFA 2V8ZA 1K02A 2YX0A 2C13A 3PY2A 3M5VA 3H55A 2FIQA 3INPA 5AHEA 2VEIA 2V2CA 3UWVA 2HS6A 1W5MA 4K37A 2A7RA 3G0UA 2ZRYA 5LKYA 2WOQA 1GZGA 3W83A 3VKJA 3A22A 3GNNA 2EAWA 3C2RA 4O1CA 2JKAA 4GC4A 4ZQMA 2FB3A 3AJXA 4YCPA 4ZZ9A 4MOZA 3TNOA 1B4EA 1VR6A 2CW6A 4N2YA 4X9SA 4JS3A 1TPDA 2NXHA 3TXVA 1SU5A 3TC6A 5AYYA 1DJQA 4WX2A 4MZYA 2CFFA 1OFPA 3NM3A 5DN1A 3NEVA 5BMWA 4XQ6A 5DCDA 1BTMA 1XBYA 3UD6A 3PBWA 1TCDA 1ZAJA 2RH9A 2NXIA 3KVLA 1FCBA 4IPIA 4FO4A 3LI0A 1G6CA 3MO7A 5KZMA 1VS1A 4WXYA 4RLIA 2ISSA 1PV8A 1X7FA 1KM3A 4PEKA 1KW1A 3IEBA 2GVGA 2X1UA 4MYXA 4LW7A 4LU0A 1ICSA 1WV2A 2GPTA 4OT7A 4JTJA 3OEXA 3TQVA 4RK8A 1I45A 3SGZA 1LM1A 1QPQA 2DZPA 3NQ8A 4FB7A 3E12A 3CWOX 3WK1A 2RFGA 3M0ZA 3W1NA 1V5XA 3TMLA 1FUYA 3L65A 3CIWA 1RVGA 3VCRA 3LXAA 3DZ1A 3IGSA 4CQ9A 3TU9A 1AW2A 2XN1A 1J4EA 1VCVA 1AG1O 5AHFA 2BZNA 3U8GA 2AQWA 5AHIA 4A21A 1YXCA 3FEMA 2TSYA 3P81A 4NX5A 6ALDA 2J9ZA 2GVLA 1F76A 4QITA 2QCGA 5TQLA 3NR0A 2EKCA 3P67A 2QCDA 4GFSA 1ME7A 1I2RA 3CLMA 1GTHA 3LCGA 3BW2A 3LHYA 3HPXA 2RDTA 5GVJA 3NL2A 2FJKA 2I9EA 1YTDA 3KOFA 2ISWA 4N9DA 1RZMA 5D38A 3B4UA 5A5WA 3C2EA 5G5IA 3VI2A 4EF8A 5SWUA 4YL2A 4JN6A 3W7GA 1ZCOA 4DXVA 3O05A 3SR7A 3O07A 5D2YA 2WNNA 4FX6M 1PCWA 5U7SA 2VELA 3CEPA 4FNTA 4JGDA 1L2UA 3EB2A 5K3VA 1RQBA 5HJLA 3SZ8A 3W88A 1R46A 2Q8LA 4FNQA 2QCCA 3W86A 1VZWA 3PS7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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