4K5YA

Crystal structure of human corticotropin-releasing factor receptor 1 (crf1r) in complex with the antagonist cp-376395
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
411
structure length
407
Chain Sequence
HYHVAAIINYLGHCISLVALLVAFVLFLRARSIRCLRNIIHANLIAAFILRNATWFVVQLTMSPEVHQSNVGWCRLVTAAYNYFHVTNFFWMFGEGCYLHTAIVLTNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLSVAKSELDKAIGRNSNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRSALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVIATFRTGTWDAYDRLRAWMFICIGWGVPFPIIVAWAIGKLYYDNEKCWAGKRPGVYTDYIYQGPMALVLLINFIFLFNIVRILMTKLRASTTSETIQARKAVKATLVLLPLLGITYMLAFVNEVSRVVFIYFNAFLESFQGFFVSVFACFLNS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein, receptor
molecule keywords Corticotropin-releasing factor receptor 1, T4-Lysozyme chime
publication title Structure of class B GPCR corticotropin-releasing factor receptor 1.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 148
structure length 407
sequence length 411
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4k5yA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4k5yA01
125LA 1TN0A 3HANA 5B34A 239LA 1S8JA 1QT5A 3GUIA 4IAQA 2B70A 1AT9A 143LA 5JJJA 2RAZX 102LA 2KS9A 1ZYTA 1L48A 2OTYX 186LA 1C6NA 1D2WA 205LA 2O4WA 227LA 3G3VA 2L6XA 3DDLA 1R84A 4TL3A 4I7RA 3AYNA 1OVKA 3SBBC 2R4RA 3P0GA 1L74A 1PXRA 1L82A 1QS5A 3UONA 2R4SA 1L90A 2ZFEA 1C6FA 2BRDA 234LA 1C68A 4ARQB 1L73A 4I7KA 5A8EA 165LA 128LA 3PDSA 1CV6A 1L77A 4ZPUA 4W57A 3SB5A 3VHZA 1U19A 1E12A 2WJKA 1CU5A 146LA 1C66A 3HH5A 3NSBA 1JFPA 4G7RB 2B72A 2HPYA 3OE8A 4XTOA 5ITEA 3ZPQA 1L99A 3LZMA 1S53A 259LA 1L96A 4I7PA 1M0MA 181LA 2JAGA 4EKRA 1L40A 3C9MA 1C63A 4YXCA 1L56A 2Y01A 2F47A 5LWEA 1H68A 3DQBA 3EMLA 1P5CA 2LC9A 3SB6A 1QSQA 151LA 1H2SA 1KMEA 2RH1A 2YCZA 1L19A 233LA 161LA 1DYDA 1P6YA 1L45A 4PXFA 3S8GB 5B6VA 160LA 131LA 4GP5B 157LA 1L12A 3AM6A 1XJIA 2RBPA 236LA 3DNAA 4EIYA 5H2MA 144LA 1F50A 4IAPA 4I7OA 3C9LA 4GPOA 3CDQA 4MD2A 242LA 4W54A 1ZWNA 1IXFA 1P8HA 3HU9A 5B2NA 4K5YA 4I7NA 1QT4A 2HUKA 3OE0A 1L80A 1EPYA 4BEYA 3UTWA 1BRDA 3GUOA 1L98A 5G54A 1GU8A 1LGXA 1EHKB 2RBSA 145LA 1LWGA 3T45A 2X72A 3HTGA 1L87A 4ARPA 3X3CA 4LDOA 3C7ZA 3HUAA 4XTLA 1JQUA 1G06A 4QI1A 1QTCA 257LA 1KY1A 4KNFA 3DN8A 3HT6A 4W56A 1OYUA 2OEAX 4I7TA 3CAPA 4MBSA 1D3FA 1L71A 1I6SA 2B75A 1P56A 3C8RA 1C6LA 1L68A 4ARLA 4MQSA 187LA 258LA 114LA 1P2RA 1L69A 6LZMA 1C3WA 4FA7B 2Z6BA 1DZEA 1C6QA 3D4SA 1L41A 1L43A 2Y02A 3AYMA 3RFMA 1L17A 138LA 1G1VA 1MGYA 1F4ZA 2J4YA 1L84A 3VGAA 4GP4B 235LA 1L47A 1OVHA 4I7MA 3GUNA 1D3NA 1AP9A 2LZMA 164LA 1JV7A 163LA 3PBLA 1X0K1 3HT7A 2LNLA 1XJUA 149LA 213LA 251LA 2OU8A 1GZMA 1L62A 152LA 3ODUA 1L97A 4Y9HA 1C6GA 1C6HA 1IW9A 171LA 1LYFA 183LA 119LA 1CX6A 4L35A 1KGBA 1L91A 5ITCA 112LA 1C65A 1P46A 254LA 2RBOA 2NTUA 1UAZA 1L09A 1KY0A 2B73A 1DYBA 1D9WA 1T97A 2QPEB 1QSBA 4X32A 176LA 2G87A 2YCYA 175LA 1CU3A 241LA 1L86A 3HH6A 5DHGA 1L79A 4UHRA 3FA0A 178LA 3QAKA 3A7KA 3VW7A 1S51A 1L65A 1G0JA 1T8GA 1WTHA 231LA 3BVDB 3NS0A 167LA 4WAVA 5AX0A 191LA 4ARJA 1L67A 1P36A 4DAJA 1T8FA 1QHJA 2F93A 2I35A 1L18A 3ABWA 4AMIA 1L93A 1G0GA 1CUQA 252LA 1F88A 4G7QB 2QB0B 2B7XA 4IB4A 4EJ4A 4EKSA 3CDRA 3C83A 1L63A 2VT4A 3GUPA 5G28A 109LA 2OU0X 180LA 2NTGA 3C8QA 2KSYA 2ZZLA 1C6KA 4NC3A 2PEDA 3QJUB 1E0PA 1L11A 4FBZA 5KKHA 1G0PA 224LA 5LZMA 1CV1A 1B6IA 3L64A 3DMVA 1QTBA 3HDFA 5H2JA 1L00A 1LYHA 3G3WA 3QJVB 1C6JA 5H2HA 1QUDA 1DYEA 4XT1A 174LA 1X0I1 2LCBA 1L22A 1M0LA 4W58A 3QJSB 1M0KA 3UTYA 2F32A 1FBBA 1C6MA 1Q5JA 4FAAB 103LA 1LI2A 1QUOA 1L07A 1P8UA 3QBKA 1PY6A 5AWZA 4A4MA 3SN6R 3HAPA 4W53A 3PXOA 2IGCA 115LA 1L13A 4W51A 228LA 3V2WA 4EKQA 3C82A 172LA 2NTHA 2RB2X 3HAOA 158LA 1CWQA 3PQRA 1SWYA 1PQKA 3KJ6A 3S3BB 4I7QA 4EXMA 3QBGA 1L04A 222LA 200LA 1TLAA 3GUKA 1L58A 1LWKA 1L57A 1L49A 148LE 1KW7A 3FADA 3SB9A 1LYDA 3VVKA 111LA 1L10A 210LA 212LA 1L34A 1SWZA 3HU8A 4DKLA 248LA 1L0KA 4E97A 4G72B 3ZEVA 4PK0A 1C67A 1XIOA 1QKPA 1L29A 226LA 209LA 1L39A 4IARA 5J7AA 195LA 2F2QA 3QJTB 2ZIYA 1LYGA 3SB8A 1XMEB 4JQ6A 3HAQA 3DN1A 2YCWA 197LA 1T6HA 3COCA 2O79A 4XT3A 3NY9A 3PWHA 221LA 1CTWA 223LA 1QUHA 1C6EA 2AT9A 4BUOA 1L30A 1C62A 3DN6A 1CV5A 253LA 2Q9DA 1L38A 260LA 162LA 4ARMB 123LA 5EN0A 2B74A 3DN0A 129LA 1QT3A 246LA 113LA 3OAXA 122LA 1P7SA 201LA 4PJZA 1PXSA 1G0MA 1L51A 1PQDA 5A45A 1L94A 3EH5B 199LA 4BV0A 1KG9A 3HUKA 2Y00A 2B6TA 1PQJA 4HYXA 1L15A 5G2DA 4LZMA 1C6IA 1OWZA 215LA 3NY8A 2CUUA 1L64A 1GUEA 1L60A 1D3MA 2KSAA 2QARC 7LZMA 4JKVA 1T8AA 5B6YA 4LDLA 5FJGA 5B6WA 3HASA 1CU2A 3HH4A 1L0JA 3EH4B 4AMJA 1P64A 1HZXA 2Q9EA 4HYJA 1LGWA 214LA 1OV5A 1L52A 2RBQA 1S54A 1L72A 4JR8A 3CDTA 3VI0A 5H2NA 1LYIA 2ANXA 1XJTA 218LA 3S3CB 2RAYX 2EI4A 1L27A 1LW9A 1X0SA 1LPYA 3GUMA 211LA 107LA 1L53A 2B6YA 3DN3A 5DYSA 2I21A 3C8SA 261LA 1C8RA 5ETZA 3WQJA 4UG2A 1L92A 243LA 182LA 1DYAA 3CDVA 5C1MA 2RB0X 220LA 150LA 4BWBA 108LA 1QTZA 1KW5A 1L16A 1QT6A 2QPDB 5TGZA 1L14A 142LA 5BR2A 3HT8A 3OE9A 4LDEA 4GBRB 1C6AA 4HWLA 4ARQA 3X3BA 2O7AA 4X1HA 1BRXA 126LA 1G0QA 2RB1X 2Y03A 196LA 1CV0A 3CDOA 184LA 245LA 3MBVA 2OE7X 1LYEA 3GULA 2YDVA 3L2XA 2HUMA 3HTBA 192LA 1L25A 2B6XA 1L81A 5G53A 137LA 1CVKA 1LGUA 1QUGA 4YXAC 4DJHA 4OV0A 5H2IA 1L05A 3F8VA 1O0AA 3G3XA 3HWLA 1S52A 255LA 1L31A 1JTMA 3DMZA 2JAFA 3QJRB 4I7LA 4G7SB 5F8UA 1DYCA 3HTDA 1L54A 4G71B 2YDOA 2OE4X 229LA 4EKPA 4N6HA 1PQIA 3QJQB 4J4QA 1PQMA 1L89A 1L06A 3UTVA 240LA 230LA 198LA 1QM8A 1VJMA 5B0WA 4X31A 4YX7C 1L20A 3UG9A 1BM1A 1P2LA 4BEZA 2B6WA 5H2PA 3K2RA 1DYFA 1G0LA 4OO9A 1L26A 225LA 1L23A 1CV4A 4I7SA 4W59A 1L01A 3QBLA 3HUQA 3C7WA 1L85A 3SB7A 1QT8A 3RZEA 2RBRA 1JV6A 1L75A 1IW6A 140LA 1KNIA 1OWYA 1L0MA 1CX7A 1S8LA 4N4WA 4N4YB 1QKOA 3UZAA 147LA 3F9LA 1SX7A 3JR6A 2KSBA 2M3GA 3C7YA 1L02A 4XXJA 4QIDA 1SSWA 169LA 1C6CA 244LA 3HT9A 1L46A 3ZPRA 156LA 1FBKA 4I7JA 1C8SA 2ANVA 1KS3A 219LA 4GP8B 3SBAA 189LA 216LA 190LA 110LA 4EA3A 2OE9X 3V2YA 1BRRA 1XEPA 127LA 5B35A 1CUPA 4ARMA 3S8FB 1TN5A 206LA 1C60A 1D2YA 1K28A 2HULA 1L95A 1G1WA 120LA 1UCQA 1L42A 3EH3B 3HARA 4GYCA 5JJNA 1QS9A 249LA 3C81A 3UTXA 1LLHA 4FPDA 5H2OA 5H2LA 166LA 1NHBA 1L44A 2A4TA 2Y04A 4QRYA 1QTDA 2NTWA 1L24A 130LA 2F95A 1VGOA 232LA 168LA 4L6RA 3OE6A 141LA 1DYGA 1LI3A 247LA 4W52A 4MQTA 4PXKA 3S3DB 5H2KA 4EPIA 4W55A 188LA 5I14A 256LA 1L35A 4GRVA 1LN6A 3CODA 4KLYA 3HDEA 5AHZA 5B6XA 1L9HA 1C6TA 262LA 3HH3A 238LA 1KG8A 2Z73A 1L70A 118LA 1QTHA 1L50A 1OVJA 1PQOA 1LYJA 3DKEX 104LA 1LI6A 3QAPA 1P8IA 237LA 4G70B 155LA 217LA 3GUJA 1QTVA 1L61A 2OTZX 1JGJA 1R2NA 1L37A 1SSYA 3QBIA 5AHYA 3QDCA 1L55A 1C61A 1ZURA 2L78A 2WJLA 4XTNA 1C64A 1CU0A 2I20A 5AZDA 1P3NA 1CU6A 250LA 2B6ZA 1L36A 1SX2A 173LA 5G2CA 3FI5A 1L32A 1Q5IA 1L08A 3DN2A 5G36A 1L21A 2OU9A 2Z55A 1C6DA 4S0WA 2YCXA 1QT7A 4GBRA 5AX1A 3C80A 3VG9A 1C69A 4AQNA 3DMXA 1OV7A 1L83A 177LA 170LA 185LA 5B6ZA 1C6BA 4EPFA 3UZCA 1P37A 5BR5A 1L66A 3DN4A 2RBNA 1L33A 5A44A 5DHHA 1G0KA 1D3JA 139LA 1C6PA 4WW3A 1L76A 1L28A 3NYAA 3REYA 1JTNA 1G07A 159LA 1CV3A 3RUNA 1L03A 5JJEA 1L59A 1L88A 2I1XA 4MD1A 5G2AA 3HTFA 4BVNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5B34A 3HANA 1GBOA 3OJPA 5ILFA 1B7OA 1LZNA 4PJ2C 3QNGA 2O4WA 3G3VA 3ATOA 4IJ4A 3AYNA 2R4RA 1GF7A 1PXRA 1QS5A 2ZFEA 1XFPL 4ARQB 1HFYA 1CV6A 1I1ZA 1L77A 3SB5A 3VHZA 3TXEA 1E12A 1C66A 4NWEA 2D6BA 3ZPQA 1L99A 3AZ6A 1S53A 2JAGA 4DQ5A 4EKRA 2BPUA 3C9MA 1C63A 3EXDA 1RFPA 2NWDX 4G4HA 1P5CA 2LC9A 1UICA 1P6YA 3S8GB 1L45A 1UBZA 131LA 2ZIJA 1XEKA 4GP5B 157LA 3LYMA 1QQYA 1GAYA 236LA 153LA 144LA 1IWZA 4GPOA 1C7PA 5HNLA 3A91A 1P8HA 3HU9A 1GWDA 1GBXA 4I7NA 3OE0A 4BEYA 3UTWA 5G54A 1LGXA 2LHMA 2G4PA 4OWBA 3TMUA 1L87A 4E3UA 1YROA 3X3CA 1B7PA 1GDXA 4ZIXA 3DN8A 3HT6A 4W56A 3CAPA 4O34A 1D3FA 2B75A 1HHLA 3A34A 4MQSA 258LA 2EQLA 1RJCB 1L69A 1C3WA 1DZEA 5APEA 2BQHA 1LJ4A 3AYMA 2DKVA 1L17A 4DWXA 2D91A 1GBSA 4NSHA 138LA 1F4ZA 1OUGA 3VGAA 1OVHA 3GUNA 3A93A 5KXTA 3LZ2A 1JV7A 5AHZA 1WQPA 213LA 149LA 4GLAA 3WVXA 4Y9HA 1IW9A 5L3HA 119LA 3W6AA 1JPOA 2G4QA 3ZVQA 1P46A 1LSGA 4QEQA 5HNCA 4WLDA 1L09A 1IR9A 1KY0A 4LYMA 4OOTA 1QSBA 1JITA 2YCYA 2G87A 175LA 1CU3A 4WOAA 2MEAA 3QAKA 2BQIA 1WTHA 231LA 4XENA 3TMWA 167LA 3BVDB 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 2ANX A;  1XJT A;  218L A;  3S3C B;  2RAY X;  2EI4 A;  1L27 A;  1LW9 A;  1X0S A;  1LPY A;  3GUM A;  211L A;  107L A;  1L53 A;  2B6Y A;  3DN3 A;  5DYS A;  2I21 A;  3C8S A;  261L A;  1C8R A;  5ETZ A;  3WQJ A;  4UG2 A;  1L92 A;  243L A;  182L A;  1DYA A;  3CDV A;  5C1M A;  2RB0 X;  220L A;  150L A;  4BWB A;  108L A;  1QTZ A;  1KW5 A;  1L16 A;  1QT6 A;  2QPD B;  5TGZ A;  1L14 A;  142L A;  5BR2 A;  3HT8 A;  3OE9 A;  4LDE A;  4GBR B;  1C6A A;  4HWL A;  4ARQ A;  3X3B A;  2O7A A;  4X1H A;  1BRX A;  126L A;  1G0Q A;  2RB1 X;  2Y03 A;  196L A;  1CV0 A;  3CDO A;  184L A;  245L A;  3MBV A;  2OE7 X;  1LYE A;  3GUL A;  2YDV A;  3L2X A;  2HUM A;  3HTB A;  192L A;  1L25 A;  2B6X A;  1L81 A;  5G53 A;  137L A;  1CVK A;  1LGU A;  1QUG A;  4YXA C;  4DJH A;  4OV0 A;  5H2I A;  1L05 A;  3F8V A;  1O0A A;  3G3X A;  3HWL A;  1S52 A;  255L A;  1L31 A;  1JTM A;  3DMZ A;  2JAF A;  3QJR B;  4I7L A;  4G7S B;  5F8U A;  1DYC A;  3HTD A;  1L54 A;  4G71 B;  2YDO A;  2OE4 X;  229L A;  4EKP A;  4N6H A;  1PQI A;  3QJQ B;  4J4Q A; 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 5H2O A;  5H2L A;  166L A;  1NHB A;  1L44 A;  2A4T A;  2Y04 A;  4QRY A;  1QTD A;  2NTW A;  1L24 A;  130L A;  2F95 A;  1VGO A;  232L A;  168L A;  4L6R A;  3OE6 A;  141L A;  1DYG A;  1LI3 A;  247L A;  4W52 A;  4MQT A;  4PXK A;  3S3D B;  5H2K A;  4EPI A;  4W55 A;  188L A;  5I14 A;  256L A;  1L35 A;  4GRV A;  1LN6 A;  3COD A;  4KLY A;  3HDE A;  5AHZ A;  5B6X A;  1L9H A;  1C6T A;  262L A;  3HH3 A;  238L A;  1KG8 A;  2Z73 A;  1L70 A;  118L A;  1QTH A;  1L50 A;  1OVJ A;  1PQO A;  1LYJ A;  3DKE X;  104L A;  1LI6 A;  3QAP A;  1P8I A;  237L A;  4G70 B;  155L A;  217L A;  3GUJ A;  1QTV A;  1L61 A;  2OTZ X;  1JGJ A;  1R2N A;  1L37 A;  1SSY A;  3QBI A;  5AHY A;  3QDC A;  1L55 A;  1C61 A;  1ZUR A;  2L78 A;  2WJL A;  4XTN A;  1C64 A;  1CU0 A;  2I20 A;  5AZD A;  1P3N A;  1CU6 A;  250L A;  2B6Z A;  1L36 A;  1SX2 A;  173L A;  5G2C A;  3FI5 A;  1L32 A;  1Q5I A;  1L08 A;  3DN2 A;  5G36 A;  1L21 A;  2OU9 A;  2Z55 A;  1C6D A;  4S0W A;  2YCX A;  1QT7 A;  4GBR A;  5AX1 A;  3C80 A;  3VG9 A;  1C69 A;  4AQN A;  3DMX A;  1OV7 A;  1L83 A;  177L A;  170L A;  185L A;  5B6Z A;  1C6B A;  4EPF A;  3UZC A;  1P37 A;  5BR5 A;  1L66 A;  3DN4 A;  2RBN A;  1L33 A;  5A44 A;  5DHH A;  1G0K A;  1D3J A;  139L A;  1C6P A;  4WW3 A;  1L76 A;  1L28 A;  3NYA A;  3REY A;  1JTN A;  1G07 A;  159L A;  1CV3 A;  3RUN A;  1L03 A;  5JJE A;  1L59 A;  1L88 A;  2I1X A;  4MD1 A;  5G2A A;  3HTF A;  4BVN A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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