4K68 | Genus

Total Genus 124

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	124
sequence length	348
structure length	337
Chain Sequence	RTGIKDFYKDDFRIGTAVATATLTMKEKKPLLALIAREFNAITPENCMKWEPLKPQDKDWHWEAADKFVEFGEKHKMYIVGHNLVWHSQVPKEVFLNESGGTISKEALTAKMQDHIATLAGRYKGRIQAWDVVNEAVEDDGSWRKSPWYNIMGEDFIAKAFTMAHEVDPKAHLIYNDYNTESPIKRNFIVGMIKNFKKQGVPIHGVGMQEHLAIDGPSVDEIEKTLIALADAGVRAHITELDIDVLPSVFEYKPERDPYIQGLPKDMEEKLAKRYEDIFKIYLKHRDKIERVTLWGTADNETWLNDFPIKGRTNYPLLFDRNQKPKPAYFRLLDLKK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	GH10 xylanase
publication title	Development and biotechnological application of a novel endoxylanase family GH10 identified from sugarcane soil metagenome. pubmed doi rcsb
source organism	Soil metagenome
total genus	124
structure length	337
sequence length	348
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-04-15

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4k68A00

1IZJA 4U3AA 1BVZA 1OWQA 1V6WA 4WSJA 1C92A 2WZIA 2BS9A 1LWJA 4H04A 2D20A 4B3LA 5FCZA 2EPLX 3L4ZA 5C8BB 1CXFA 1OBAA 3ZO9A 2D24A 1CGWA 4EK7A 5A2AA 1WCGA 2X0YA 4PMOA 3WD1A 3WF2A 4D6CA 1XD1A 4JCLA 2ZUSA 1AMYA 2EPKX 3AMCA 1UWSA 3GH7A 5E6ZA 3OGVA 2DDXA 4P7OA 4NRSA 5HDRA 4PN2A 4GQQA 1OT1A 1US2A 3MS8A 2CPUA 2XSBA 2EJ1A 3CBWA 3CIVA 4HZ6A 4JFTA 3VDCA 4QFUA 1OD8A 5A3HA 2CETA 2XM1A 2ZX5A 1GONA 3NDZA 1JZ2A 1VAHA 3NSMA 2G3JA 4F9DA 3S6TA 3VX0A 5DT7A 3J7HA 1CWYA 1PEZA 5JBEA 2PF0A 4D6GA 4HA3A 5E9AA 1ODUA 2XG9A 4HOZA 2WANA 4FLOA 1WDSA 3VVGA 4BQ4A 1PX4A 3WF1A 1O7AA 4HA1A 1KXHA 2WWDA 4X0NA 1JFXA 3IK2A 1PAMA 3GH5A 1UD2A 2PBGA 4HPHA 3E1F1 1QNQA 1HP4A 2DSUA 2BHYA 5JBDA 1XCWA 1A3HA 4U33A 2WVSA 2GJXB 4MPKA 2BVYA 3NCOA 1V6VA 1ISYA 3A6OA 3WEOA 2ZUUA 2QPUA 2WCAA 1CECA 1BYCA 1HXJA 1R7AA 3AHVA 3K8LA 3WUFA 3TOPA 4DWSC 1JYVA 2CCRA 3ARXA 3PZUA 3MSGA 3DC0A 2TAAA 5BXSA 1KGXA 4AZGA 3FW6A 3TONA 1ZJAA 3GBEA 5ABGA 3WY1A 1QHPA 4AD2A 1AQHA 1OB0A 1V08A 3VD9A 2YBTA 2OSWA 2A3BA 3RPMA 4J7RA 1XRVA 2W4XA 3N11A 1XH2A 2VX6A 3W0KA 3IJ7A 4M1RA 3PTKA 3WUBA 1JFHA 1HJVA 5IFPA 2WHMA 4PBGA 5F7UA 1R86A 4BQ5A 1E55A 3GM8A 4PUDA 1CGTA 1ZJBA 2Y4SA 4AZCB 1HX0A 2D1ZA 5D9PA 3VIPA 1J0ZA 1NQ6A 3AHTA 3BAJA 1JIBA 2W5FA 1AQMA 3WH9A 1Q4NX 4CD8A 1CLXA 1US3A 2X2YA 4OIFA 5BROA 1GOKA 4W89A 1HJSA 4JKKA 4AYSA 2RGLA 3WMBA 2CBVA 2GK1B 1BYAA 2PWEA 1QI3A 2WLZA 2DQXA 3GZAA 2WNWA 5HOSA 2OWCA 2VZSA 1H49A 1P6WA 3WDHA 2ZUVA 3WSUA 1ZS2A 1JI2A 1KQYA 1I75A 3CHDA 1EQPA 4M24A 5DEZA 4HU0A 1KR1A 5GNXA 3SCRA 2WAGA 1TMQA 1FP9A 3VKKA 1SMAA 4UFHA 1TR1A 1HL9A 2VUYA 2J7EA 3WUEA 2ZXBA 3VUPA 4OOUA 3W82A 3WQ4A 4PYSA 3NIYA 1RP8A 1TG7A 1C90A 4UQAA 4EKJA 1HVQA 5EBAA 4J3UA 3GXIA 2W91A 1H2JA 2WW5A 4UZUA 3AISA 1L8NA 4W8AA 3PZ9A 1QOXA 1B3XA 1Q6EA 3DYMA 2J79A 5I5RA 1ISWA 1D2KA 4W7UA 1H0GA 1E5NA 2YL6A 3AMDA 4WK9A 2UY5A 2F8QA 2J62A 1WDQA 3WD2A 1V6XA 1W9XA 4E8CA 4WLCA 1PPIA 3ZSSA 1UUQA 3CZLA 2CBIA 5I23A 1DWGM 3RIKA 3WEMA 3EDJA 3BXWA 1GNXA 2VTFA 3TA9A 2WYSA 2VMFA 1TVNA 1QNRA 2EBNA 4MAVA 1N82A 1TFVA 3T2QA 1UKQA 4CD5A 3T09A 4U2YA 5TD4A 3VPLA 2OWXA 4QCEA 4MDPA 2EXOA 2J7GA 3SUUA 2WB5A 3FXYA 1B0IA 3ECQA 1HKMA 1ZBWA 2WZEA 2XM2A 4R5EA 4AMCA 4B9ZA 1UG6A 4KGLA 3WBEA 5ABFB 3MSDA 5I24A 1GPFA 1H4PA 1DWHM 2VX5A 4Z2KA 2Z1SA 1GQLA 1E73M 4PCTA 1PZ3A 1V6YA 3WKZA 5BYWA 2G41A 3CMGA 3VNZA 1B3YA 5BXRA 2WHLA 4LPCA 2QPSA 2E8ZA 2WVUA 3VD7A 5M3WA 2UY3A 4MJ4A 5A6BD 1KFWA 3ARWA 2DGAA 5CZKA 2ZX8A 1CXLA 3U7VA 1SMDA 1B3VA 8A3HA 2DT3A 4GI6A 1VENA 1OSEA 1WZLA 2WSKA 1E4LA 3UG3A 3L4XA 4AZ6A 3VGBA 2PBOA 3F5LA 3D3AA 4KWUA 4N42A 4BA0A 4HOWA 3N15A 2VX4A 1GOOA 4LYRA 3VIMA 3VU2A 2NW0A 1C7SA 3SUVA 1J9YA 3VMOA 3CZEA 2GJPA 4LYPA 2V3EA 1M03A 4H2CA 1U30A 1U33A 1LG2A 3ZT5A 2Y2WA 3GBDA 3AHYA 5JBFA 1E72M 3EMQA 1UD5A 3OB8A 1UZ4A 4X0VA 2DH2A 2J8GA 1G5AA 2J7BA 4HPGA 1MWOA 1QI2A 1UA7A 3WQ6A 4AY1A 4DM1A 2V3DA 1E5JA 2XFFA 4J27A 1E0XA 4GO9A 1E6QM 4KMQA 3WNNA 1LWHA 4A3HA 4D6JA 3K4DA 2X0HA 1DHKA 1QBAA 3AIWA 1TA3B 2A3HA 4AZ7A 4DWSB 3SCNA 1HJWA 3L4TA 1HF6A 4UZSA 2QLYA 4QP0A 2ZX9A 3LPFA 1VFFA 1X6LA 3OGSA 3T08A 3RJXA 3OLDA 2YA2A 4D71A 3SUTA 4OOZA 4JIEA 4UFLA 3K8KA 1KBBA 4OJYA 1E6PA 4DUWA 3JUGA 2BXZA 3CH9A 1HKJA 2J47A 3B9AA 3RM8A 2X05A 1HKIA 3L4VA 4CGTA 1E6ZA 2VL4A 1BQCA 3WUGA 4YHEA 1EHNA 4X9YA 4D1IA 4CU6A 2YDSA 1XC6A 3EDKA 4UFKA 3CZGA 1UD6A 2XVNA 3CPUA 4E2OA 2CNCA 3NSXA 1WO2A 2J75A 2VR4A 4DWSD 2YBUA 1H0IA 1NWTA 1GQIA 1UR4A 1PJ9A 2NSXA 3CUJA 2DSVA 3WN6A 2VRKA 5E0FA 4AEFA 1LG1A 3VIFA 3WDJA 4ZE5A 3PZQA 5LA1A 1JXKA 3LMYA 3MV01 3U5UA 1UR0A 5ABFA 3WNMA 4P8XA 2FHCA 1VBUA 4CCCA 4FK9A 1MW2A 1FP8A 4PSRA 5D8WA 2UY2A 3VIHA 1CXIA 1A47A 1W1PA 1FFQA 4P7LA 1W2PA 3KL5A 3KL0A 4TTUA 2CHOA 2VI0A 3K4AA 1CGXA 3VGGA 1HL8A 1KXTA 1W1TA 2J78A 2J8FA 3WQWA 4H8VA 3EMZA 3BGAA 3VX1A 5E70A 2ZWYA 2YL5A 4TVUA 3TP4A 1BSIA 3FAXA 3SCVA 3W53A 1GVYA 2IXVA 2JF6A 1V3HA 2WVVB 4J3SA 2WZHA 3NDYA 1DWFM 1G01A 4UQ9A 2VQUA 3GXDA 2PI6A 1W2VA 2D23A 1IT0A 4XZBA 1VBRA 3FN9A 4M80A 2VVNA 1DEDA 4GI9A 4PMRA 1VEMA 5HXMA 4HZ8A 1E40A 1BVNP 1FH8A 3BAYA 3F5JA 4MDOA 3W26A 4M82A 1W32A 1MFUA 1C8QA 5A6SA 5HPCA 1UD4A 1RP9A 4A4AA 5LA0A 4M56A 4U31A 1NOUA 4GIAA 1TE1A 1MYRA 1E1FA 5CPQA 4AD0A 1DWIM 3GXFA 4JKMA 4WJXA 1GVIA 3OG2A 2XHYA 3CLWA 5AYIA 2BVTA 4ZEPA 1NWRA 1PZ2A 1XYFA 3AS1A 3L4UA 2WMJA 1QW9A 3ARZA 2JEPA 3DECA 2BY2A 4W8BA 4PTVA 2UWFA 1O6IA 1F4HA 4AEEA 4MB5A 1ISXA 1C93A 2ZUWA 1VIWA 1H09A 4H7VA 5A6KA 3M46A 5D8ZA 3HU7A 4ATLA 3WMCA 1JYXA 5A6LA 2UY4A 4V28A 1Q6CA 2DT1A 3VIIA 2J7DA 4Y7EA 1L0PA 3WDIA 3IANA 4D1JA 1M7XA 3AZSA 2J4GA 1PX3A 2CESA 2O9PA 1KXVA 3AHXA 3CHFA 3WFLA 3AYRA 1BHGA 2VVSA 4D6DA 1WZAA 1CGUA 1GJWA 3A47A 2HVMA 4UQCA 4UFMA 3EMCA 1KWKA 2ESCA 7A3HA 1KCKA 1Q6DA 2WMIB 4MTVA 2XVGA 3AS3A 4UQBA 3KL3A 1PIGA 4GZJA 5CLTA 5D9MA 4D6HA 1W91A 1SFSA 4J3TA 2YL8A 5AC4A 3KWXA 6A3HA 2YIHA 1U2YA 1CNVA 4W5ZA 2DIEA 5BWFA 4CU8A 1FHDA 4JZ5A 4AD3A 5IHRA 3GNRA 1E70M 4W86A 3RO8A 5A2CA 3EBVA 3W6LA 1V3LA 5A6MA 1JZ4A 4D6EA 1VEPA 1NH6A 4CU7A 1CXHA 2ZWZA 1YQ2A 4AZHA 5JUVA 3WNKA 3WNPA 5A8QA 4UQDA 3LPPA 4AD1A 2J7FA 1UZ1A 1IZKA 1CTNA 3EYPA 4V27A 1ZBVA 1JNEA 1M04A 3BSHA 4UR9A 2XJ7A 3MKKA 3PZTA 2E40A 4IPLA 2F61A 2WVVA 2WBGA 1WDPA 1NOWA 3QHOA 5E0CA 4JFSA 3I3EA 4AW7A 1DWAM 2BHUA 1XH1A 2XGBA 2PWHA 1LQ0A 3W24A 4DUXA 1CXKA 1XSIA 5I79A 1J11A 1QI5A 2OWWA 5FD0A 2ZIDA 4MB3A 1ZBCA 5A94A 4ZXOA 1ITXA 4AD5A 2QV4A 5CSYA 4HMEA 1OD0A 1PBGA 4K68A 3VDAA 3SCOA 3AXXA 1GOIA 3IAPA 2WWCA 3FHQA 3SUWA 4M29A 2CIPA 5IXEA 3VNYA 3AS0A 1V3JA 4UTFA 3UESA 4C7DA 1E6RA 4OBRA 1M53A 4FLRA 4J3WA 2HISA 4AC1X 2PWDA 1GW1A 2D0FA 3G6MA 4W7WA 4JFWA 4UFIA 5EFFA 1CXEA 3BAXA 5LA2A 1KR0A 2BY3A 3RILA 1UWUA 1BYBA 1LL4A 1OGBA 1R85A 2FHFA 4JL2A 1CIUA 3VD3A 1ISVA 3BAWA 1NP2A 3WDRA 2E3ZA 1NP0A 2VCCA 5AY7A 1W9VA 2WC7A 4PTWA 4M81A 3PZGA 1PX8A 2J77A 3PTQA 3WDPP 3IJ8A 4P8WA 2DT0A 3AIBA 3A3HA 5CQ1A 3WH8A 1UYQA 1F4AA 2OYLA 5I77A 1AQ0A 2G3MA 5HNNA 3T0BA 1VEOA 2V5DA 4Z2HA 1QI0A 3W6MA 3AIEA 1JYWA 3EDFA 5A69A 1XCXA 4W84A 2O9RA 2VCBA 4D6FA 1CGVA 3VM5A 1H5VA 1V3KA 1E15A 5IDIA 2W67A 1GCYA 2G4FA 2VX7A 4ZE4A 3LPOA 2YLLA 1DTUA 3W81A 5A95A 1UH2A 1CPUA 3ZT7A 1ZL1A 2GJXA 1JZ6A 3CZJA 2XGIA 4W5UA 4RE3A 1HKKA 3WH5A 1CGYA 1C3FA 4FMVA 1LLOA 3T0DA 1NM9A 2D3LA 2VT0A 1EH9A 1EXPA 5DT5A 2D3NA 2BV9A 3VINA 1EGZA 4ACZB 2WBKA 4PMDA 5I2UA 3AIVA 4W8LA 1G1YA 1JDAA 3PZNA 4E8DA 1SR0A 1PIFA 3MMWA 1EOKA 2VZVA 5DMYA 3WQ8A 3N9KA 1K9FA 2OSXA 3AOFA 3ARRA 1V0LA 2XFYA 1UKTA 3D5HA 3GDBA 4JL1A 4PMXA 4ATDA 1NWUA 1MQQA 5HPOA 1HT6A 1B9ZA 3U7BA 5A2BA 1EHAA 4AZCA 2D22A 2JIEA 1BPLB 1QPKA 4TX8A 4OKDA 1B30A 1J0HA 4IISA 1UKOA 4PTXA 4F8XA 4BF7A 1E6SM 3DYOA 1V0KA 5M17A 3NJ3A 5ABHA 2WKGA 3OBAA 4IM4A 1E3ZA 4CD7A 1GUVA 3VIKA 4BQ2A 4TUFA 3WF3A 1WB0A 2GK1A 1NARA 3VO0A 1CEOA 3THCA 1CDGA 2W61A 1V03A 2O9TA 2EEXA 3AROA 2DPEA 2W66A 3K46A 1EO7A 3GXMA 1B3WA 3WELA 4JFUA 1WZKA 2ZUTA 1C91A 2AMGA 2WMKA 3UR8A 2J74A 2YL9A 4PEEA 2DSKA 3W4RA 1KWGA 2PB1A 4CVWA 1GOMA 4PMZA 4U5IA 3PBGA 1JNDA 1XH0A 3QGVA 2C8NA 4HTYA 3BC9A 4FLQA 2D2OA 4QLKA 1J18A 3UCQA 2VZTA 5IHSA 1J0JA 5LYRA 3AZTA 5KZ6A 1ZBKA 2BY1A 1X6NA 4C7FA 1BYDA 5ECUA 3THDA 3WNLA 2XIIA 3SEPA 1R7OA 1E0VA 4P8VA 6TAAA 3TTQA 3VDBA 5I0DA 3MUAA 4PCSA 3PTMA 4E4PA 4S3KA 5DFAA 4B9YA 4HMDA 2WVTA 3WMSA 1CYGA 1UQYA 4Q7NA 1K6AA 2F2HA 7TAAA 4WKFA 3WDQA 2X09A 5DF0A 1UD8A 3AIUA 3QHMA 2XVPA 1E4IA 2CBUA 3IAQA 1E9LA 4D72A 1TUXA 3VMPA 4WIWA 3AQUA 3WD4A 4TXEA 4W87A 2ZXQA 3PZVA 4V2XA 1V3IA 1QNSA 5A6BA 4JHOA 4JCMA 1HN1A 2VNCA 3MV11 5EFDA 1JXJA 1OINA 2VO5A 3PHAA 1RD6A 2G8ZA 3B9DA 3UG5A 4CN4A 2OYMA 4HA4A 5DO8A 4P7NA 4PRWA 3WL1A 4KGJA 4KRUA 4YHGA 4CCDA 2VZUA 4OZOA 3VDHA 1J12A 2YOCA 3BMVA 4URIA 4ZENA 3ZMRA 4MNMA 4ACZA 2CKSA 1EA9C 3F4VA 1V6UA 1HJXA 5JIPA 4HP5A 3WF4A 1GORA 1JDCA 1ZU8A 3ALFA 1MXGA 4EE9A 4UOZA 4QAWA 4PUEA 2FGLA 1CENA 4NRRA 1HJQA 1OM0A 1QVBA 2FH8A 4M8UA 1UKSA 3ZR6A 1KXQA 2GJRA 2OSYA 3CMJA 1XSJA 4L4OA 2DSZA 3MANA 1UWQA 1JGIA 3ARPA 1BFNA 1EIBA 1KQZA 2Y8VA 1VJZA 1GOWA 1YHTA 2E8YA 3WD0A 1E3XA 2EPMX 3KEHA 1GZJA 4AWEA 1ITCA 3VMNA 3AS2A 3CUHA 4GO8A 4CKQA 4OUEA 2WMHA 2D0HA 3ARTA 3VGDA 2XVLA 3HJEA 1JDDA 5FL0A 4P7QA 1C8YA 4KH2A 1J0YA 1B3ZA 2O9OA 2E9MA 1D7FA 3WH6A 3N18A 4ZXLA 2JEQA 5CPTA 1BLIA 1LL7A 2BHZA 3ZIZA 3SCPA 4N0RA 3CUGA 3BLKA 4XZWA 3SCUA 2ZUNA 3NUKA 1H1NA 1UWIA 4R27A 4H41A 2EPOA 4NZCA 4IPNB 4MNJA 2J7HA 1H11A 1KGUA 2GUYA 4LXFA 1C8XA 1QNPA 2Z1KA 3I3DA 2NT0A 1FFRA 1ODZA 2VZOA 1CLVA 2YA1A 1E43A 3AHZA 2VCAA 3AIQA 4JKLA 4RL3A 5BRQA 2VRQA 5GQBA 4PMNA 3OLEA 3WEZA 3OZPA 1W9PA 3MUZ1 3L2LA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4K68A

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Chord Diagram

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