4K6AA

Revised crystal structure of apo-form of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli at 1.8 angstrom resolution.
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
MRHPLVMGNWKLNGSRHMVHELVSNLRKELAGVAGCAVAIAPPEMYIDMAKREAEGSHIMLGAQNVDLNLSGAFTGETSAAMLKDIGAQYIIIGHSERRTYHKESDELIAKKFAVLKEQGLTPVLCIGETEAENEAGKTEEVCARQIDAVLKTQGAAAFEGAVIAYEPVWAIGTGKSATPAQAQAVHKFIRDHIAKVDANIAEQVIIQYGGSVNASNAAELFAQPDIDGALVGGASLKADAFAVIVKAAEAAKQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Structural, kinetic and proteomic characterization of acetyl phosphate-dependent bacterial protein acetylation.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 98
structure length 255
sequence length 255
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2013-04-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4k6aA00
5AHLA 1GOXA 4E38A 3NL2A 2YW4A 5F4SA 1Q6RA 3B0PA 2EKCA 3S5OA 3LI1A 1TPVA 3R5EA 4BK9A 4UTKA 5DLCA 3G0XA 2B4GA 1R2TA 4AWSA 1Y0EA 2ZZ2A 4M6QA 3T4CA 1JVNA 3WK1A 3HB9A 4UTWA 1H7OA 1PCWA 4KWVA 3B0VC 2ZZ4A 3M5XA 2CFFA 2CZEA 1KTNA 4GUHA 3C2VA 5D2VA 4MZ8A 2BX7A 2TRSA 3NQMA 3MYPA 4IOTA 4FX6M 3U6WA 1Z41A 2X16A 2R91A 1SO5A 4MLJA 1WYIA 1QPOA 3UYCA 1H51A 3UXAA 4O14A 1W1ZA 1XDLA 1GQNA 3K30A 4WQ6A 2ZRXA 3KAOA 2ISWA 3A24A 3TW6A 1LROA 1BKSA 3CTLA 1VRDA 4FHAA 3PSWA 2P10A 1KM4A 1Q6OA 3A21A 5LNVA 1E51A 4IX2A 2A21A 3M16A 2HS8A 2FPTA 1SO3A 3UPBA 1V5XA 1NF0A 3HJZA 1IIGA 3QQ0A 3DI1A 3EKLA 1B9BA 3G1VA 2Z6JA 3I7RA 1W5QA 4FXSA 1OABA 1DKWA 4L4LA 4N9CA 3LV6A 4CLMA 2OT0A 1FXQA 3G18A 1OFBA 2JKEA 4YL2A 5FEXA 4RZ5A 3BG9A 1P1XA 5AFDA 1FWSA 1GG0A 1OFEA 4ZQPA 3A22A 3LHTA 2FFCA 3LBCA 1A5BA 3A5VA 2DZSA 4RV8A 5G2IA 5AYZA 3GIYA 3NM1A 4MZ1A 4WOZA 2GOUA 1EP3A 3LCHA 3SY5A 4JYFA 2EHHA 4O4WA 3TDFA 3MHFA 3VCRA 2B7PA 3WJZA 3IIXA 1J4EA 1Z48A 2FQIA 4X2RA 2XFWA 3KFTA 3GYEA 1A5SA 3FYOA 4Y6GA 2G95A 4O1CA 3QPZA 3CIWA 2ZZ1A 1P0KA 1SZGA 4YMZA 3E12A 4UFMA 5E1QA 1J5TA 2RFGA 2P1FA 5EA9A 5G1TA 2C6QA 2PRLA 3HIJA 3WJWA 3DU0A 1D3GA 4LV9A 1VCGA 4NJIA 3S1WA 2I14A 2QJIA 5KINA 2GQ9A 4MUZA 3TC7A 4ZMGA 3W2NA 4LV4A 3W7HA 3UY7A 3C0JA 4LRSA 2QUUA 1PL9A 3QPYA 3NQFA 1G4TA 3HO8A 4FF7A 1K8ZA 3TFXA 2VFEA 3BLIA 3IGSA 2C16A 4X9SA 3L2IA 3GK0A 4WXZA 3S6DA 3V1PA 3NG3A 3PSVA 4XBKA 1ICSA 1XM3A 3G1HA 4HNUA 1XXXA 1H60A 1AK5A 4HIBA 4OE7A 1I2NA 1T96A 3H55A 2E6AA 1H5YA 3W88A 4IPJA 1Q6LA 3TMQA 3C8FA 4C1LA 1U83A 3L65A 3KRUA 1OFDA 5BW6A 1TB3A 1H1ZA 1ME8A 2WSQA 3HG5A 5AHNA 1WBHA 1X7FA 2RDTA 5KITA 3PR2A 1TSIA 2TPSA 2NUWA 3RK8A 3M6YA 4FNPA 4UTIA 4MZYA 1LBFA 4MOZA 3W1UA 3DFQA 4HNNA 3W2KA 1F5ZA 1PV8A 1A5CA 1GTEA 3UXDA 5FEWA 2VFIA 2WPBA 4EF8A 3W86A 1HFBA 1W56A 3STGA 3SSJA 4JTGA 1LCOA 3IVUA 4IGHA 3GXNA 3P81A 3LCWA 3GX9A 3W1PA 3PUOA 3NQDA 3SJ3A 3MBDA 1WOBA 1PS9A 3B4UA 4MLRA 2ZCGA 4EWND 2DORA 2DZPA 2WSRA 4DBDA 1VC4A 3RLUA 1ICQA 1JULA 4N9DA 1F6KA 3FKKA 3G24A 5EKYA 4KFPA 1H62A 4ONVA 2X1TA 4O11A 1HO4A 3WJXA 2CLIA 3LV5A 5ABTA 3W75A 5BMWA 2X30A 4LVDA 4LVGA 1JCNA 4EIVA 4RCXA 1TO3A 4J9JA 3SFKA 2NUYA 1W37A 1DQXA 1KM6A 2VXNA 4XZ9A 3TJXA 3KHJA 1FXPA 3W2UA 8TIMA 3M47A 3LLFA 3LGEA 3S1VA 4O13A 1OX4B 4FEZA 4UTMA 4UFJA 3LRKA 3O63A 3DFPA 4ZQMA 3LCIA 2OZ0A 3NQVA 3DGRA 1TJPA 5D2XA 5DN1A 4UMAA 1JUKA 3TFCA 1YDOA 3BG3A 1P4CA 3NEVA 4RKAA 1TCDA 2E09A 3UWUA 1LORA 1ZJIA 2BZNA 1SUXA 2OX1A 5G4EA 4Z1CA 2AAMA 4GFSA 3NZRA 3G3DA 1A53A 4U4MA 2DU2A 3LRLA 3CB8A 1W54A 2BXVA 1S5TA 3HGSA 3U2OA 3HG4A 1AG1O 3STCA 1WBJA 2DZXA 2QJHA 2EAWA 2WSYA 3SGZA 4GNJA 4PA8A 3F03K 2Y7EA 2V2DA 5EMUA 1XCFA 3L5LA 3HBLA 2C15A 4K38A 3Q2DA 3HG2A 3O6YX 3TNOA 1QAPA 2GQAA 1X1ZA 2PE4A 3AO0A 3LLDA 4I7VA 2OT1A 3NPWA 3VE9A 4O15A 1ZHAA 3W1NA 3S1XA 1YDVA 1PIIA 3W74A 4JTIA 5HULA 4M7TA 3P5YA 3RLVA 3CIXA 1L6YA 1Z42A 4HKPA 4AVFA 3UPWA 2NXIA 3PULA 3THAA 3LCLA 3TXZA 5C6MA 4JX5A 1LZOA 2Q3RA 3LB0A 5G5IA 3GB6A 3RNDA 4O0KA 5AN7A 4O19A 2O7SA 5EPDA 2V2CA 1L6SA 3TW7A 2RDWA 1TREA 3JR2A 1F05A 2GJLA 5FEZA 1SFJA 4BI6A 4NJKA 1VCVA 3LTPA 3QW3A 4O12A 4NNCA 3CWOX 3KOFA 3QC3A 3LXCA 2FPVA 3PG9A 4FIQA 3G1FA 4O17A 4UFIA 4CNPA 3NO5A 2CW6A 3ZFHA 1DVJA 3RU6A 4PEKA 5DELA 4B5NA 5F1UA 2A85A 2ISVA 3WJSA 3ZWTA 4AF0A 4E2BA 2YW3A 3MYOA 5FF2A 3EX4A 2CZ5A 5CPMA 1I8JA 3BO9A 5A8GA 4OBTA 3TQKA 2YFOA 1TPEA 3GDKA 5I3KA 3CHVA 5D2WA 1IXNA 3C61A 3GR8A 3NPUA 1KV8A 3MO7A 4ML9A 5D32A 5D30A 5LNUA 4LWWA 3F4WA 4NXSA 4MY8A 1YYAA 3BG5A 1I2QA 3NQ8A 1TPB1 2A1YA 5K9CA 2DP3A 4JTSA 2NLIA 2WJZA 4UMBA 2P0OA 2VC6A 4DPPA 1TPH1 2GQ8A 2BSLA 2ZRZA 4LW7A 3DZ1A 4UFKA 4O16A 4I7WA 1XL9A 4RR4A 5K2ZA 1KM2A 1PVNA 4BR1A 4RLIA 4MFDA 6ALDA 2W79A 2E68A 5DCEA 4JY8A 4JTFA 3SIZA 3FLUA 2V9DA 3S5NA 5H2ZA 5FESA 2VFGA 4AAJA 4JTJA 5CSRA 4XUGA 2V2HA 4OQVA 3QYQA 4H3DA 1S5WA 4FB7A 2GVJA 1R2RA 5C54A 2BTMA 1NVMA 3LBMA 3PF3A 4WY0B 2WNZA 5CZSA 4Q33A 5DY3A 4NZFA 1TRDA 2Q8ZA 5U4NA 4POCA 3KX6A 3TUUA 3TROA 3P8IA 1ADOA 4Z1DA 1NEYA 5CKSA 4JN6A 1SW0A 3CEPA 4LT9A 4S2BA 3ABOA 3KXQA 3W2JA 1QPQA 1JCLA 1OHLA 4JICA 3M43A 3HPZA 4NZJA 3UWYA 4MKNA 3EXTA 3F4NA 3GXTA 4Z1BA 2VFDA 1VJIA 3NDOA 3ZS4A 2NX3A 4RJEA 2XN1A 3JRKA 1EP1A 3M0ZA 5J5RA 1TMHA 5I3FA 2JGQA 3D0CA 3IV3A 5CGQA 3W73A 4EF9A 1XBVA 1B3OA 3W7LA 5HNRA 3LXAA 3GDLA 3B8DA 3EB2A 2ZFAA 3OHIA 2FIQA 3S42A 1WDWA 2YZRA 3CEUA 5CZTA 1NAL1 3M9YA 3R2GA 1G4SA 1ME9A 4CNNA 1FUYA 3TIMA 4HN4A 1QWGA 3FIGA 4Q4KA 4N9BA 2VFHA 3DKLA 2RHGA 3TXVA 1FY6A 3TAKA 2VEIA 2F7FA 1HL2A 3QH2A 4N9EA 2Y7GA 4NU7A 6TIMA 5IM51 3FEMA 3MW7A 4UNLA 3W70A 4Z0JA 4EOUA 3LOTA 1EP2A 2Z6IA 1Z44A 1C29A 1K8XA 3W84A 3S1UA 5BNKA 1GYNA 3S5ZA 4ADUA 4MFEA 3STEA 2B7NA 2QCDA 3LHVA 2V82A 1G4EA 4IXHA 3MMTA 1KFJA 3N34A 5AB3A 2ISSA 5AHIA 5K4XA 2CLOA 4FNTA 1W5MA 3GNNA 5DXXA 2NXGA 1SZEA 5C55A 5KZEA 2DJLA 1OK6A 3ANYA 4IMEA 1H61A 4TMCA 3MI2A 4WZHA 1FDZA 4OGZA 4ICNA 4KKXA 3TSDA 5LGZA 1WA3A 1GPWA 5HUPA 4N4QA 3W1QA 3NL6A 1JRBA 3FFSA 4UTWC 1XUUA 3O6CA 5LKYA 4JTLA 1KBJA 1VQTA 1IGSA 4FXRA 3TE9A 4OHQA 1R47A 1OF6A 4FNRA 5G1YA 1MXSA 4YLWA 3LHZA 3TV8A 3TX9A 2XN0A 2CZDA 4YCPA 3EX2A 4UR8A 3VKJA 3NOEA 3W7CA 5J5DA 3NQEA 5HWJA 3B04A 3UZ5A 4M5PA 2WOQA 1ML1A 2YR1A 1LM1A 5HINA 1FQ0A 1TTQA 3T7VA 1DJNA 2GVGA 1FWRA 2GJNA 1TQJA 1OFAA 3BK0A 1DHPA 3HGRA 3Q94A 4C1KA 1SW3A 5TBOA 2CLEA 3PBUA 3THQA 4GBUA 3NL5A 3PUEA 3IGXA 1F76A 5LHFA 1HTIA 4K7VA 2J9ZA 2H6RA 5EYWA 4NVTA 2DZUA 4E2DA 4IMFA 3C2RA 2CLMA 5KZMA 4O1DA 1GEQA 1KV5A 2V0TA 1RV8A 1UB3A 3M7WA 1N55A 2QCCA 3SECA 1FWTA 5D33A 1OX6A 3BARA 4LNYA 2EGZA 3QJAA 3OEXA 1YADA 4H6KA 3C52A 4O4VA 4QNEA 3LI0A 2ZRUA 1OX4A 3LCGA 5LZLA 2YX0A 2RH9A 1LLZA 3W7PA 4Y8FA 3MWAA 3ZWSA 4Y90A 2VENA 3P62A 2ZQ0A 4BWLA 1IIHA 5HQEA 5I3JA 1I2OA 3O05A 3CM4A 4O1AA 3DFOA 3W71A 2A6LA 3DI0A 4U28A 3EWBX 3QSTA 1LOQA 4Z0SA 2QCDB 2JKPA 3O6DA 1SZFA 3INPA 3L5AA 1H50A 1MEIA 3Q37A 1YTDA 4FNQA 1RQEA 5D02A 3C3NA 1T99A 1K3UA 3Q58A 4PFMA 3USBA 3HPXA 4JTHA 2NWSA 4O53A 3PAJA 1KBIA 1G6CA 2F84A 4AWUA 1OFQA 3NVTA 3PS7A 4O50A 4HNVA 2VOMA 3EEGA 2ZZ7A 4ALDA 1IXOA 4QISA 1XBZA 3W83A 3NGJA 1FWWA 3ATYA 4JDYA 4JIQA 1TTIA 1RD5A 1KM5A 2NUXA 3EX6A 1OG0A 4Y96A 4LS1A 3G1XA 5CSSA 2QUTA 1F74A 1D9EA 4HHPA 4UFLA 3IVTA 3PWAA 2Y7FA 3HGOA 4QITA 4JX4A 3UD6A 3GKFA 3HMJG 2Y61A 3GAKA 1QCWA 3NM3A 4FIRA 5TIMA 3WK0A 4HSOA 4QJ1A 1O4UA 2RDUA 3MI3A 4ADSA 2PURA 4YCOA 4WD0A 3NQ7A 3S5YA 1GVSA 2ZYFA 1ZAJA 3ABSA 5F1VA 4A22A 4DO4A 5CPNA 4S2CA 1EWDA 5LGXA 1NSJA 1UBSA 5HJLA 2KZHA 1SFLA 2NX9A 3A5FA 3P74A 4Z08A 1XKYA 5AHFA 3W72A 2OMAA 1UUMA 3YPIA 2QDHA 2PC4A 2ZZ5A 4A2RA 2J9YA 2QAFA 4D2JA 1UJPA 5G4WA 3GKAA 1W0MA 4UUIA 2ZBTA 3UWVA 3NQGA 3QZEA 1KW1A 4WY0F 4ZL1A 4MY1A 5KMYA 1TPC1 4LVFA 5TQLA 1BEUA 3W1MA 1OJXA 1JQXA 1G67A 4OV9A 3SW6A 2X1RA 1ZENA 3OVPA 3IIZA 1JR1A 3MJYA 3HF3A 5CZJA 2Z0IA 3DBPA 4NJGA 1RZMA 2CLHA 1AW5A 3MUXA 3TA6A 3N9SA 1EB3A 1XFBA 3W76A 1VLIA 2ZTJA 2YYUA 1MEWA 1SR9A 4ZQRA 5AC6A 1TPFA 2C18A 1EUAA 2QR6A 1LYXA 5KSWA 4DF0A 4HPJA 4IJBA 2E6DA 2ABBA 2VEPA 2R14A 4IX0A 1HUVA 3IVSA 4MIMA 4TIMA 4QAIA 1TTPA 4OT7A 2TMDA 4IPIA 3UWQA 3QMRA 4JR5A 4JDBA 5I3HA 4O10A 4WJEA 1X1OA 1JCYA 4WY0A 3WK2A 4XKYB 2BWGA 2O7QA 4M6VA 4NT0A 4P61A 3TK7A 2QCNA 4EVZA 2EPHA 2GUUA 2A7RA 1RQHA 3NXFA 5F2LA 4JS3A 2QUVA 3RFAA 1EPXA 1DJQA 1AW1A 1XC4A 1W3NA 4MYAA 3CLMA 3I7QA 3PUDA 2PRMA 1ONRA 3TQVA 5A5WA 1H7PA 1B57A 4UC5A 3OBKA 4N2YA 3HOJA 3M5VA 2Y7DA 1EWEA 3A23A 1KTBA 2ATMA 1AL7A 1MSSA 3TC6A 1XDMA 1LRTA 1MEHA 1I2RA 4XBSA 1JUEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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