4KBOA

Crystal structure of the human mortalin (grp75) atpase domain in the apo form
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
376
structure length
374
Chain Sequence
AVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENAEGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPFKIVRASNGDAWVEAHGKLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSEDKVIAVYDLGGGTFDISILEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEKAKCELSSSVQTDINLPYLTMSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Stress-70 protein, mitochondrial
publication title Crystal structure of the nucleotide-binding domain of mortalin, the mitochondrial Hsp70 chaperone.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 374
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4kboA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4kboA04
1S22A 4CZHA 3O08A 1GLCG 3TPQA 3VESA 4PL7A 2V51B 2CGLA 3EO3A 5KPRA 1MWMA 2PAVA 3VPZA 2ASMA 1QQOA 1RFQA 3R6MA 3SK3A 3WEEA 3QDKA 4GY2B 1IJJA 3O5BA 2YCHA 1NGBA 2AP1A 2IVPA 3S41A 3VGKA 2Q97A 4CZLA 5BN9A 2CH6A 3TU5A 5KPTA 3LM9A 1S3XA 2P9LA 3EKSA 3VEVA 4FWSA 4K42A 1G99A 4WQ4C 3CHWA 5BREA 1BA0A 4L3QA 4BROA 5AQUA 3B8AX 1E4GT 2IVNA 2W40A 4YDUC 3JS6A 4CZGA 4XEIA 1HLUA 2HMPA 4IJNA 5AQXA 3UKUA 4FOIA 4FO0A 1GLJO 3ZETA 4CZEA 3G25A 5F2RA 3QFPA 3R9PA 2QWOA 3VF6A 2E2NA 4JHDB 3O4WA 4PKGA 3CI5A 5BRFA 3ZX0A 4BR2A 3WUHA 2YJEA 4GNIA 2A41A 4H0TB 1X9JA 5EXWA 3HTVA 1MA9B 5KQDA 3M3ZA 1ATRA 2Q0RA 3C7NB 4DCHA 1IG8A 5AQNA 1TUUA 2YI1A 4E1JA 4BRLA 4FWLA 2V7YA 3MCPA 1NGIA 1HJOA 4BQLA 1ZC6A 2QWMA 3ENOA 2QWPA 4AM6A 5AZIB 3J8AA 1QZ5A 2FSNA 3VGLA 1T44A 2D0OA 2YHWA 5KPZA 2PBDA 2P9SB 5AQYA 2UYTA 4CZFA 3M1FA 1NMDA 4BREA 5B8HA 3MDQA 4ISFA 3QMLA 4QS8A 3MN7A 1WUAA 3DJCA 2F9WA 3WQTA 1ESVA 3IFRA 3ZX3A 2P9UA 5AQSA 3LL3A 5LJVA 3C7NA 4O8KA 2AA4A 3HZ6A 2VWBA 4B1YB 3VEXA 5AQZA 1YXQA 4DB3A 4H0XB 3R8EA 2E8AA 2GEMA 2D4WA 2Q36A 4H5NA 2ITMA 3VERA 4HWIA 4QS9A 3FZFA 5AQMA 4JNEA 5BPMA 1BU6O 2P9SA 3DXKB 4BRDA 3C0BA 3VF2A 1HX1A 3O1BA 3UB5A 4MO4A 2P9PB 4A62A 1NGGA 4H0YB 5AFUA 4BQZA 5KQ8A 2HF3A 4I6MB 4NO7A 1U2VB 1Q18A 4NB4A 4FOEA 5BRHA 5I9EB 1KAZA 3OHRA 5EX5A 1NM1A 1OKJA 4JD2A 3SMSA 4CBWA 4BG9A 1E4FT 5AR0A 3WT0A 3U9ZA 1MWKA 4BR0A 5FPNA 1H1VA 3IDHA 4FWMA 3GG4A 1TYQA 2HOEA 2E1YA 1X3NA 1Z05A 3FGUA 3O8MA 4RTFD 4F9OA 5AQLA 1CZAN 4ISEA 4FPBA 3D2FB 3H45C 4B1UB 1V4TA 3CJCA 2E88A 1K8KB 4CD3A 2HF4A 3AAQA 3FLCO 4CZIA 3ATUA 4BGBA 5AZJB 4FL9A 3QBXA 4DHYA 4K25A 3MN9A 1GLBG 4I6MA 5BRDA 3VOVA 5FPEA 1NGJA 2EWSA 3CJBA 3CQYA 5E84A 2A6AA 3ZEUB 1C0GA 1QQMA 4M63C 4CZKA 5JLHA 2P9IB 1QQNA 3D2EB 5AQHA 2QW9A 3I33A 3FE1A 3RSEB 3DAWA 4PKHA 5EOYA 3H3OB 3MK6A 5AQJA 3P4IA 5JLFA 3QICA 3A8YA 3VEWA 2CGKA 3CJAA 1JCFA 3KHYA 2NLXA 3D2FA 2I7PA 4B1VA 4FPAA 3A0IX 1JCEA 2E2OA 3CQXA 3CJ7A 1P8ZA 2H3GX 3FZLA 3LDNA 2IIRA 2YHXA 2Q2RA 4PKIA 1XQSC 3VGMA 5F1XA 1DGKN 4K43A 1GLLO 4B1XB 1BUPA 2ZWHA 5AQQA 4BRNA 4BRFA 1J6ZA 1QHAA 3EZWA 4BRKA 4B9QA 5EVZA 2P9NB 4ISGA 3VETA 4BR4A 4AM7A 4BR5A 2P9IA 1KXPA 4KBOA 4JN4A 3RSEA 3HI0A 5AQPA 2P9KB 1YVNA 5AQFA 3U4LA 3HSCA 3A5LC 3O6WA 4JHDA 2FXUA 1YUWA 4CD1A 1WOQA 5TKYA 4BG8A 5ADXH 4B1WB 1XC3A 3KVGA 1D4XA 2ASPA 3BF1A 3LDOA 3UKRB 1RGIA 3BUZB 1HUXA 3MN5A 1HKBA 1ZBSA 3W0LA 4BRGA 2ZF5O 5FPDA 2E1ZA 3CJ9A 4M7XA 1KAXA 3SLCA 2QWLA 4BVPA 4EIAA 4H5VA 3I8BA 1GLDG 3SJHA 5AZIA 3FZKA 3VEZA 1KAYA 5LY3A 3L0QA 5FPMA 2YJFA 2NRHA 4J8FA 1RDWX 1NWKA 3ZX2A 4FWOA 3VENA 1V4SA 1T6DA 3FR0A 3WEEB 2ZGZA 2QM1A 1EQYA 3AY9A 1BA1A 3LDQA 2VCPA 1SZ2A 2GWJA 3ENHA 4C23A 4IZ9A 2OANA 4H5RA 4XH4A 4FWKA 1DEJA 4FWNA 3GE1A 4BRIA 1MDUB 2A40A 1LCUA 5AQRA 3AAPA 3MN6A 3O1WA 2ASOA 2VYPA 2P9LB 4IWVA 5AQWA 2D0PA 3VEOA 3GOIA 3M6GA 4EHUA 4MLHA 3HBTA 3W3DA 3U8XA 3A5MC 3ATVA 5EY4A 2Q0UA 3L4IA 2F9TA 3BP8A 2FSKA 3DXKA 3VEYA 1ATNA 4WQ5A 3ULEB 1HKGA 4BVOA 3CETA 5AQGA 3DWLA 4BC2A 3GL1A 3UE5A 3UKUB 3JXUA 1HKCA 2P9PA 5JICA 2D1KA 1NGDA 1TUYA 3ZETB 5BPLA 3CIPA 3H3NO 1NGFA 1U2VA 3WXLA 4BRPA 5BR9A 2V52B 2Q1NA 3DXMB 2FF6A 3AARA 4BC4A 4Y0WA 3IMXA 2NZTA 3BEXA 3WXIA 1BOTO 3LDPA 1Z6RA 4BC3A 4CBUA 2GWKA 4EAHD 5LJWA 1DKGD 2KHOA 3U9DA 3H1VX 3CJ1A 2GTDA 2QWNA 3LDLA 2E2QA 4FWPA 1JCGA 3KZBA 2CH5A 4MLEA 3ULEA 2FSJA 1K8KA 2GUPA 3A5NC 3FZMA 3FZHA 4H0VB 3QFUA 2DPNA 1T6CA 4DQ8A 4JAXA 4WYBA 1ATSA 4WQ4A 1R59O 4RCHA 5AZJA 4H0OA 4CI6A 2FLOA 4FWQA 4HTLA 2A42A 4FWRA 4FSVA 4YDUA 2J4RA 4M7YA 4EFHA 2QXLA 4EHTA 2QWQA 1BO5O 3ZEUA 1BWFO 1NLVA 2P9UB 3DXMA 4BGAA 4BR9A 3D2EA 4B1ZA 3QBWA 5BPNA 1BDGA 4BC5A 1NBWA 3HM8A 4IXCA 4H5TA 1XUPO 3GBTA 5F0XA 1NGHA 2V7ZA 5AQTA 2BTFA 2A5XA 5CE3A 3VF4A 3EKUA 5AQIA 4LC9B 3WXKA 5AQKA 1U6ZA 5ELZA 4MO5A 2BUPA 3F9MA 2FF3B 3WXJA 4RWTA 5BN8A 2A3ZA 1HPMA 4A61A 4IJAA 1ZXOA 2YHYA 4CZMA 3ID8A 2ZGYA 3GDQA 1NGCA 1BG3A 3EL2A 4BRMA 1YAGA 5AFUH 3CERA 4A2BA 4BRAA 3L6QA 2GELA 2IVOA 2P9NA 3LM2A 2Q31A 3WQUA 3D7EO 2E2PA 5JMVA 3H6EA 2CGJA 4CJ7A 4H0PA 1GLAG 3SMPA 3H46O 4QS7A 2E20A 4BRCA 1LOTB 1Y64A 4BRQA 4H03B 2P9KA 2W41A 3IUCA 4JD2B 1GLFO 1QZ6A 4XH1A 4BR7A 4XH5A 3O80A 3H1QA 4IO8A 1X3MA 5ADXA 3UKRA 4CZJA 2I7NA 4BRHA 1C0FA 3EN9A 1NGEA 5AQOA 5E26A 1SAZA 1NGAA 1TYQB 1SQKA 3FFKB 4H5WA 3MMVA 4PL8A 4A2AA 4O5FA 4WQ5C 4CBXA 5AQVA 3BF3A 4Z94A 4K41A 3A5OC 2WUSA 1GLEG 2QWRA 3QB0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TAUA 4CZHA 1XNQK 3Q7BA 3TPQA 3E7UX 3OYBA 3CCSN 1VQLN 1MWMA 5CHIA 3VPZA 4BECA 1HYSA 3R6MA 3SK3A 5DM7L 1EX4A 1K73O 4E1NA 2GV9A 3P83D 2YCHA 4W5TA 1X9MA 3S41A 1C0TA 4AHCA 4IFVA 2PZSA 1NKEA 3EZ5A 2CH6A 4X62K 1TGOA 4B3OA 1VNBA 3VQBA 2VG5A 2HNZA 2YNFA 4DU1A 4KHWA 3E66A 4HCBA 4LFCK 3KLEA 2W40A 1NU0A 3AO4A 4OJRA 3CQ8A 3LWMA 2IGIA 4KHPK 3E7RL 2BANA 4IJNA 4FM1A 1A5VA 1ZUTA 5M1FA 4CZEA 3G25A 3QFPA 3OYHA 5HRPA 4JHDB 1S1UA 3ZX0A 1TL1A 4BR2A 3D6RA 3TWHA 5KGWA 4DR4K 3SQ4A 2HVIA 2RF2A 3KOYA 1U45A 3HTVA 1XHXA 3HRGA 5FRMA 3M3ZA 3EE9A 4CHZA 4CHYA 1P00A 4DF8A 1T7PA 3RRGA 2YI1A 4ILHA 4IG3A 2V7YA 4MDAA 1NGIA 2IS3A 2OPRA 4B8CA 4AM6A 3OYAA 2QWPA 1RT7A 3J8AA 1QZ5A 1K6YA 3VGLA 3HPHA 5KPZA 3OTOK 3L56A 3OYEA 1JLAA 3VTHA 1NMDA 1UA1A 4BREA 5J2QA 1GOBA 3KP0A 3KOZA 4ISFA 1VAZA 1VRTA 3MN7A 4XJXA 1ESVA 1TK5A 2D56A 5C15A 1T8EA 2P9UA 3LL3A 2A1RA 3PUFA 3LZIA 3DI6A 3EEQA 1C1CA 2O8DB 1U49A 5AQZA 3R8EA 2E8AA 1J53A 4H5NA 3VA0A 2IOCA 4Z4IA 3LP0A 3SYZA 4HWIA 2PYLA 1I6FA 3TAMA 1DQ7A 3BZCA 4DLEA 4FJHA 4JNEA 4BRDA 1LWFA 1LWCA 3VF2A 4OPKA 4RW9A 2O4IA 2IC3A 3O1BA 1RTJA 1JLCA 1I94K 5KGXA 2EX3A 2P9PB 4H0YB 2HF3A 4NO7A 4O5BA 2YIOA 3THWB 1Q18A 3TAEA 1VQ8N 4DV2K 3V6DA 4FJLA 4KH5A 3CPWM 3G4SN 2G8IA 1KAZA 4HHFA 5EX5A 3CCMN 4JD2A 4Z4FA 1LQIA 3F9KA 4JLHA 1TKXA 3ZT4A 3U9ZA 1TKDA 2W6KA 4HTUA 1GPTA 3TARA 3VTIA 4PUOA 2HOEA 2E1YA 4RTFD 3CM6A 3AV9A 5AQLA 1KV0A 1CZAN 1J5OA 3D2FB 1V4TA 3G6EN 2LT8A 3KK3A 4CD3A 2HF4A 3U3YA 4O44A 3K5NA 4F2SA 3ATUA 4DQPA 1ZVEA 3HOSA 4WF9L 2DFHA 4FL9A 4DQIA 4K25A 2NRVA 4B9LA 1JLBA 3VOVA 5FPEA 4JK8A 5JS2A 1NRBA 3CQYA 4JI5K 4IEEA 4CF2A 4FK0A 3CPEA 2MN5A 1QQMA 4M63C 4YOYA 4N56A 3CCRN 4C1NI 3DLKA 5AQHA 3A2FA 3M8QA 2QW9A 3DYAA 1LAVA 5EOYA 3H3OB 3MK6A 3S3NA 1NK8A 2W6LA 3VQEA 3A8YA 4KFBA 4OLAA 3OA9A 3CJAA 2XY8A 4OLBA 2NRXA 3D2FA 4JS4A 1HNXK 4M3WA 1IBKK 4B1VA 2BRZA 1JCEA 2E2OA 2H3GX 1SL0A 2JWKA 3KWGA 2OZMA 3VGMA 5KRTA 2Y1JA 4BRNA 4FJJA 2GX9A 4Z4HA 1J6ZA 3TAGA 3CXCM 5E41A 5EVZA 4OO1J 1ASWA 3C65A 5I3UA 3KLIA 4BWMA 4DMNA 1OH7A 4YORA 4IDHA 3A5LC 1BMRA 4CK1A 1L3TA 4CD1A 4F2RA 1D4XA 3UKRB 2KZZA 4CJQA 1LV5A 3IG1A 4FZZA 2BDPA 4Z4CA 1U4BA 2YHAA 1ZBSA 4CECA 3AO3A 3BDPA 3CJ9A 3THVA 4AH9A 4CE9A 1Z25A 4W5NA 4EIAA 3TAFA 3IRXA 3SJHA 4JK7A 3KHWA 4CIFA 1B9FA 3OYFA 4LD0A 4CFCA 4V1DC 3KWIA 3L0QA 1Q7YO 2NRHA 2ETJA 2HHVA 5LL6Z 3LAKA 3NF6A 2X6SA 1ICAA 3VENA 3BZKA 1T6DA 1RTDA 1WB9A 4ZTFA 3OYJA 4ID1A 4IKFA 3L2VA 4OX9K 2VCPA 4IZ9A 2YV0X 4XH4A 4ZHRA 1UWBA 3VQ8A 2ASOA 1QSSA 4M3RA 2D0PA 3U6FA 2OPPA 3M6GA 4EHUA 3HBTA 4ILGB 3L4QA 5CY4A 3KLFA 1VQ6N 4J2AA 2A1SA 2RPIA 4WQ5A 2XY6A 4Z4GA 5AQGA 3ZSOA 1SUQA 3E01A 3P31A 3UKUB 3AA4A 4OKKA 2HMIA 4FLWA 3ZETB 4DU3A 1JXCA 5BR8K 1BQNA 2P51A 3HXMA 4BRPA 5BR9A 3VQ4A 1YTAA 2UUCK 5J2NA 1NJXA 4Y0WA 2UUAK 4CEDA 3PLAA 2LJMA 4EAHD 4DWIA 1YHQN 3H1VX 4C8KA 3R1XA 3HPGA 3KK2A 1NKBA 2F8SA 1X9WA 3DOKA 1IG9A 2E2QA 4FWPA 1JCGA 4N47A 4FLYA 2CH5A 3A5NC 2W00A 1C1BA 3FZHA 1OVYA 2DPNA 1JZAA 4HCCA 1RDBA 1SKSA 1ATSA 4CJVA 1VSFA 2FC0A 3ZSYA 1SL1A 4DR2K 4DTRA 3SAGA 2JDQD 1QHTA 3ZSVA 4EFHA 4FSVA 1RNHA 4EHTA 2UU9K 3J7AP 1HJRA 3ZEUA 1EETA 1RTHA 2JLEA 1BK8A 2NNWA 5DMRA 4FJ7A 1NBWA 4LFBK 5F0XA 1NGHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1TAU A;  4CZH A;  1XNQ K;  3Q7B A;  3TPQ A;  3E7U X;  3OYB A;  3CCS N;  1VQL N;  1MWM A;  5CHI A;  3VPZ A;  4BEC A;  1HYS A;  3R6M A;  3SK3 A;  5DM7 L;  1EX4 A;  1K73 O;  4E1N A;  2GV9 A;  3P83 D;  2YCH A;  4W5T A;  1X9M A;  3S41 A;  1C0T A;  4AHC A;  4IFV A;  2PZS A;  1NKE A;  3EZ5 A;  2CH6 A;  4X62 K;  1TGO A;  4B3O A;  1VNB A;  3VQB A;  2VG5 A;  2HNZ A;  2YNF A;  4DU1 A;  4KHW A;  3E66 A;  4HCB A;  4LFC K;  3KLE A;  2W40 A;  1NU0 A;  3AO4 A;  4OJR A;  3CQ8 A;  3LWM A;  2IGI A;  4KHP K;  3E7R L;  2BAN A;  4IJN A;  4FM1 A;  1A5V A;  1ZUT A;  5M1F A;  4CZE A;  3G25 A;  3QFP A;  3OYH A;  5HRP A;  4JHD B;  1S1U A;  3ZX0 A;  1TL1 A;  4BR2 A;  3D6R A;  3TWH A;  5KGW A;  4DR4 K;  3SQ4 A;  2HVI A;  2RF2 A;  3KOY A;  1U45 A;  3HTV A;  1XHX A;  3HRG A;  5FRM A;  3M3Z A;  3EE9 A;  4CHZ A;  4CHY A;  1P00 A;  4DF8 A;  1T7P A;  3RRG A;  2YI1 A;  4ILH A;  4IG3 A;  2V7Y A;  4MDA A;  1NGI A;  2IS3 A;  2OPR A;  4B8C A;  4AM6 A;  3OYA A;  2QWP A;  1RT7 A;  3J8A A;  1QZ5 A;  1K6Y A;  3VGL A;  3HPH A;  5KPZ A; 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