4KTZA

Lactococcus phage 67 ruvc
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
MKKILAINFSTASKKGEGTGYAFRKDGQVYVGSIKAYNPKKTAWERTFDIVNAIKDIIDEFDLKGYHLAIETPIMGRNRKHSITLANCNGYFIGAIDGLVNGYTFIDNSKWCSYHLISGKREQRKEESLELLKATGLVDSNCKDDNIADAYNILTYCEHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords RuvC endonuclease
publication title Mutants of phage bIL67 RuvC with enhanced Holliday junction binding selectivity and resolution symmetry.
pubmed doi rcsb
source organism Lactococcus phage bil67
total genus 57
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07066 DUF3882 Lactococcus phage M3 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4ktzA00
3C6TA 4CHPA 1YVUA 2P51A 4CJUA 4FLXA 4DF8A 1TK0A 2KTQA 4KTQA 3PO5A 4AHRA 1UA0A 1BISA 3SQ4A 3OYAA 1KTQA 1L3VA 1IKXA 3K5OA 3D0PA 4FLUA 3KD1E 5JS2A 3MEEA 1C0UA 1NK4A 1SL1A 4Z4CA 4CERA 3QEWA 4E1NA 1RILA 4DTJA 3RR7A 3A2FA 2DTUA 1HMVA 4DLEA 1SKRA 4C8KA 1I3AA 5KI6A 4ZTJA 1NK0A 1CZBA 3EY1A 4MQ3A 1R0AA 5HLFA 1SKWA 4ELTA 3NGYA 4O4GA 4CHNA 3OYDA 3HPOA 3CYMA 4W5NA 4HCCA 2IAJA 1WLJA 4C8MA 4CJ5A 1FKPA 4E1MA 4C8NA 1Q8IA 1HNIA 1TL1A 1HNVA 4CJEA 4CJWA 3VQCA 3HXMA 3L2RA 4N41A 2KZMA 3V1QA 3ZT0A 3LP3A 3C95A 2X6NA 4H4MA 4H4OA 1EKEA 1LW0A 3OJUA 4DQSA 3QERA 1WSGA 1DTTA 3SPZA 1BIZA 1BQMA 3SYZA 1ZYQA 4OGCA 3AA4A 1VSMA 3L8BA 4KB0A 1ZBLA 4AH9A 2OZMA 3D45A 1X9WA 3V9UA 1UOCA 3LPTA 1TGOA 1Q9XA 1IKWA 1SUQA 2OZSA 4DTPA 3CQ8A 5DK5A 2RF2A 4C8OA 1WNSA 2ATQA 3RRGA 3CM5A 1IG9A 4M3RA 3NCIA 4IDKA 4CJRA 4NCGA 2YHBA 3PX0A 4N56A 1ASWA 2Y1IA 3QEPA 4QCLA 4RW6A 4CHOA 3NF6A 1LWFA 1JL1A 3U6FA 1X1PA 3M8QA 4CHYA 3LZJA 3NF7A 3QEXA 3LP0A 3AVJA 3CFPA 4M3UA 4FM1A 1JKHA 2R7YA 5J2NA 2BANA 3ZSYA 2X78A 1DTQA 3PO4A 3NH2A 2OPQA 4FZYA 1GOAA 3ZSOA 1WSHA 3K2PA 2HMIA 1S9EA 1A5XA 1T8EA 1B92A 4CFAA 3SUQA 5DMRA 2F8SA 3SV3A 4PWDA 4I2QA 3L2QA 4O44A 4DQQA 4XIUA 1RTDA 2YKNA 5D3GA 4F4KA 1A5WA 1QHTA 3DRSA 4CJ4A 3QNNA 4F3OA 2W42A 2BDPA 1NK8A 3IRXA 4CGIA 2G8HA 2A1SA 3P1GA 5HRPA 1S5JA 1RTJA 3O3FA 3ZT3A 2Y1JA 1VSKA 1HYZA 4E89A 1CZ9A 4DF4A 3HK2A 4I9LA 4IFVA 4KREA 1LWCA 2HNYA 3VQBA 3IAYA 4CCHA 1JLAA 3L2VA 3L3VA 4CHQA 2KW4A 5KTQA 3C6UA 3CG7A 3NH1A 4HUEA 2HHUA 3RMAA 4AHUA 3JYTA 5J2PA 1BL3A 3VQQA 2HVIA 2D0CA 3OYMA 3AVNA 3VA3A 4DU3A 1RDCA 4CF1A 4EP4A 1N6QA 4OVLA 4CF9A 2VWJA 1ASUA 1J9AA 4FJNA 2F8TA 3SV4A 5CZ2A 5CY4A 1KVBA 5T7BA 3KD5E 4KI4A 1S9GA 4N47A 4M42A 3HSTB 4W5OA 4E7LA 2D0BA 3DLHA 2D5RA 1Y97A 1L3TA 4BE0A 4FLZA 4OKEA 4OJRA 3VQ8A 3OS1A 3OYFA 4IG3A 4E0DA 2AJQA 4B8AB 2IS3A 2KQ2A 3LAMA 4OPKA 4HHTA 4LH5A 5CYMA 4FZZA 3K58A 3P5JA 4LSLA 4DMNA 1RTHA 1Z25A 2RN2A 5KGWA 5J1EA 1D9DA 4FJHA 4CHZA 2HVHA 3ZSRA 2VG7A 4B9UA 1X9MA 2G8IA 2G8KA 3T19A 3M8RA 4BDYA 4DSLA 3SNNA 1L5UA 4K8ZA 3TAEA 3KLGA 4UQGA 4OLAA 2P1JA 1B9FA 3T1AA 1JXEA 1YTAA 3NBPA 1S1VA 4I2PA 3KLIA 2FBYA 4CJKA 4F3TA 5C25A 1XHXA 4EZ9A 3LWMA 1KFDA 3AVBA 4Z4EA 1RT6A 3NH0A 3DM2A 1BIUA 4Z4GA 1U45A 4CJ3A 3ZSXA 2OPPA 1Q9YA 3T3FA 2GV9A 2X6SA 3VQPA 4DTOA 1N5YA 3VQ9A 3L3UA 4CFBA 3RR8A 3G10A 4OPJA 3LALA 4M45A 3SJJA 1NJZA 3MEGA 2WOMA 3KTQA 2P5GA 1JLFA 3AVKA 3TAGA 3K5MA 1NJWA 2HHQA 3V6DA 3U3GA 1T7PA 3IS9A 4FVMA 1TV6A 4NYFA 4WE1A 3V1OA 1O1WA 3ZSVA 1W0HA 4O0IA 4IFYA 3TAMA 2YNGA 2HHSA 4CEAA 4Y1DA 4DTNA 1U49A 1GOBA 3WNFA 4KPYA 5HRRA 3RWUA 1U4BA 4B3OA 5J2QA 2PYLA 2HHVA 1RT2A 3VA0A 2XY5A 1CXUA 1NJYA 3DLRA 4AHSA 2VWKA 1HYSA 3K57A 4DFJA 2BGGA 3TARA 1LAVA 3AO5A 4DFMA 3AVMA 4DSFA 1HPZA 3OS2A 5HRSA 4IG0A 3TAPA 2HHWA 1HJRA 4KAZA 1J53A 1WN7A 1TL3A 3THVA 4M3XA 1RBTA 1LW2A 5FRMA 4FJ5A 1LAWA 3QINA 2YNFA 4DSIA 4NCAA 3MAQA 4KKOA 4DTRA 4MFBA 1QSLA 4KRFA 3SPYA 1D9FA 4ID1A 2G8WA 3HPGA 3PV8A 2Q3SA 4OLBA 1J5OA 3ZT2A 4CEQA 3VQDA 4RW8A 3OYBA 4FLWA 3B6OA 5HROA 5I42A 1HRHA 4CK1A 3AVLA 1SKSA 4E3SA 1I39A 3K59A 4N5SA 3OYIA 1UA1A 2Z1GA 2FBXA 1L3SA 2JLEA 4Z4HA 4W5QA 3VQEA 1BCOA 1BGXT 4M3TA 3O3GA 3V9XA 2QKBA 2RKIA 4DG1A 4Z4IA 4DTUA 2JGUA 1ZBIA 1KCFA 2Z1IA 3AA5X 1BI4B 4CF8A 1NOYA 4DSKA 4DWIA 4M3WA 1ZBHA 2PY5A 1T03A 4DFPA 4EZ6A 2RPIA 3DOKA 4CJVA 2DFHA 3NDKA 4CGJA 1LWEA 4K8XA 1T05A 4FM2A 2B5JA 3SCXA 4KHNA 1DLOA 1S1UA 3M8SA 1C1BA 4DFKA 1CLQA 1NOZA 2IOCA 3LANA 3TANA 5SWMA 2XY8A 1EETA 4TSXA 4GW6A 3RMBA 4IKFA 1KLNA 2KFZA 3LZIA 3TI0A 4CFDA 3E01A 3QIOA 5HRNA 2BE2A 4LH4A 3BDPA 3PX6A 2O4GA 1JLEA 3QETA 3ALYA 1KRPA 4ELVA 1IKYA 4CJFA 4L8RB 1FK9A 1BQNA 3ZT1A 2DFEA 4JS4A 3NGIA 3RMCA 4QOZB 4Q0BA 1KVAA 4FJMA 1B9DA 1JLCA 1MU2A 1VSHA 3QLHA 4W5TA 2NUBA 3KK2A 1JXBA 2GUIA 1TVRA 2ZE2A 3OYHA 2XHBA 1QSSA 1SV5A 3PUFA 1JLGA 4NYNA 3LDSA 3QNOA 1S6QA 4B08A 5C24A 3FFIA 3SQ1A 3TR8A 4CK2A 4KHUA 1RBSA 4I7FA 4FZXC 1F21A 1UWBA 3AVGA 3ITHA 3OYNA 3SQ2A 2HNZA 3DLEA 4FJ7A 1VSEA 4AHTA 2E4LA 1VSIA 5CYQA 4KTZA 3HT3A 1RT7A 1CXQA 3G0ZA 3F9KA 4B9NA 1W9HA 2QK9A 3OYJA 1S1XA 1TKTA 3O4QA 4CJPA 3MEDA 1KVCA 1QS4A 1WSIA 3WNGA 3TABA 1YTUA 4FK2A 2HNDA 2B4JA 3AO3A 1RT1A 4FW1A 4CF2A 3K5LA 1YT3A 1LV5A 2PYJA 1XI1A 2QKKA 1NK6A 3AVIA 3CFRA 1REVA 1QQCA 1VK0A 3O4NA 2YKMA 3KJVA 2G8VA 4G1QA 4BE1A 3V9WA 3S9HA 5J2MA 4KHQA 4DQPA 3OYKA 4LY7A 3F73A 1SL2A 2PZSA 4ELUA 2FBTA 4BWMA 4OGEA 4FJLA 2HB5A 3HJFA 4B8CA 2YHAA 3ISNC 2XY7A 4FJGA 4FK4A 1C6VA 4YNQA 5HBMA 3KIOA 3K5NA 1J54A 3I0SA 3KLHA 4BACA 3RRHA 1GOCA 1RTIA 3AA3A 3BGRA 3I0RA 4E7JA 4DLGA 1IH7A 4GMJB 4EP5A 3AVAA 1RDDA 4CEEA 4CIFA 4PA1A 4RW7A 3NGZA 3HP6A 4R5PA 3P83D 1QSYA 1RBRA 2DFFA 4CF0A 4DSEA 1WAJA 4E7KA 4BDPA 3OYCA 2FC0A 3SZ2A 1TKXA 3ZSQA 4M3YA 4DS4A 4ZTFA 3JSMA 4AHCA 3KLEA 3NAEA 4DTSA 3L2WA 2G8UA 3TWHA 5KRSA 4O55A 4B9LA 1VSLA 3VQ5A 2Z1JA 1XWLA 3PY8A 1TKDA 4DQRA 2IDOA 3DI6A 4H8KA 4FLTA 1RT4A 3V1RA 4QAGA 3OYGA 3NF8A 2XO7A 1EP4A 3WNEA 3SUPA 4FK0A 3VQ6A 4FJJA 4CJTA 2OYQA 3AVHA 2I5JA 3DOLA 4ID5A 4F2SA 4HUFA 4FLYA 1TK5A 2ZD1A 3VQAA 4KHYA 2IC3A 1D8YA 4Y1CA 5KRTA 1BCMA 3EYZA 3V9SA 3VQ7A 3QO9A 1K6YA 1HYVA 4O0JA 3RTVA 3LAKA 3QIPA 4DS5A 5HP1A 4LSNA 1RBUA 3OYEA 2G8FA 3DLGA 4IBNA 2XRIA 4CEBA 4FCYA 3SUNA 5FDLA 4E19A 3MXJA 4CJQA 3KLFA 1U47A 4F2RA 4B9SA 4J2BA 3AV9A 3QEVA 1U04A 4KFBA 3L2UA 4FJIA 5C42A 4E7IA 1BHLA 1FXXA 3AVFA 3C94A 3KKRA 2X74A 2YV0X 1QE1A 3ZSZA 4BE2A 4FJXA 3M8PA 3LP2A 5FRNA 4B9MA 2EHGA 4CJLA 1KFSA 4FJ8A 2B6AA 3SUOA 4FW2A 4DQIA 1EX4A 4J2AA 2E6LA 3O3HA 3QESA 4KV8A 2VG5A 1RCHA 4OKKA 3S3NA 5K14A 4JRPA 4Z0UA 1U48A 5CZ1A 1Z26A 1ZBFA 1WSEA 2ETJA 4M3ZA 1RBVA 5SZTA 4FM0A 2A1RA 2OA8A 3HP9A 3SQ0A 3SI6A 3KK1A 2FBVA 4KHSA 4FYDA 3ASMA 3NFAA 4PY5A 3LP1A 4CJSA 4W5RA 2XY6A 1ASVA 1C0TA 3H08A 3QEIA 4KTWA 1JLQA 3HVRA 1RNHA 1TAUA 3AO1A 3CM6A 4N76A 4OKJA 3OS0A 1VSDA 4ZHRA 1A5VA 3TAQA 4HVJA 4CIGA 3VQ4A 4FXDA 1IKVA 3MXMA 1X9SA 4ICLA 2E6MA 3HM9A 2KZZA 1NK5A 1SL0A 4CEDA 3DLKA 3EZ5A 2O4IA 3OJSA 2P5OA 1WSJA 3OY9A 3VN5A 1JL2A 4FLVA 4DU4A 4Q5VA 2VG6A 3LWLA 4KHWA 3B6PA 3V81A 2ITGA 4F8RA 2HHXA 1IO2A 3V9ZA 2F96A 4J2EA 3PX4A 4J2DA 4CE9A 4I9QA 1VRTA 3DLBA 1NJXA 1TKZA 5KGXA 5E41A 3AO2A 2YNHA 4DU1A 4NCBA 1WAFA 4CGGA 1C1AA 2YNIA 2ZQBA 1VSFA 4AHVA 5FROA 1NKCA 3HPHA 2GBZA 4CGFA 4BDZA 5I3UA 1RT5A 3AVCA 4CFCA 4CEFA 1NKBA 4LD0A 3DRRA 3U3YA 3NE6A 4FJ9A 1C1CA 4B9TA 2HW3A 3KKSA 5EU7A 5JS1A 1VSJA 4CEOA 1FKOA 4CESA 1ZBUA 3HYFA 2D0AA 4HCBA 4RW4A 1RDBA 4KI6A 1ITGA 4GVMA 3TAFA 4M41A 1XC9A 3DRPA 1VRUA 4JS5A 4KO0A 4CGDA 1QTMA 4RW9A 3UIQA 3DYAA 2DY4A 1G15A 4CGHA 4CK3A 1HQUA 2OPSA 4CECA 4DTMA 4DSJA 1C0MA 2LSNA 3NHGA 1WSFA 1XHZA 2OPRA 4JLHA 4CEZA 2QXFA 2WONA 4PQUA 4HUGA 2Z1HA 3WNHA 1TK8A 3DMJA 1EXQA 2IGIA 3MECA 4RG8A 3OYLA 3CFOA 4JRQA 1D5AA 3HVTA 3ULDA 1L3UA 1JLBA 1RDAA 4O5BA 1HQEA 1TAQA 3V4IA 3ZSWA 3I8DA 3HO1A 4Z4FA 1KSPA 3AA2A 1NK9A 2HHTA 3NF9A 3S3OA 4YFUA 1KLMA 4BWJA 4KB1A 2KFNA 3OVNA 4C8LA 4FJKA 4B9VA 3ZCMA 4CIEA 3AO4A 4HTUA 1RT3A 4DTXA 3ZT4A 1S1TA 1BI4A 3S3MA 1S6PA 1NK7A 3IG1A 3KK3A 4E7HA 2EX3A 1UAXA 4PUOA 3LPUA 1S1WA 3HL8A 4AILC 3MXIA 1NKEA 3RMDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C6TA 1YVUA 3FZLA 3CIPA 4FLXA 2KTQA 3Q7BA 4AHRA 3UB5A 1BISA 1L3VA 1C0UA 1XC3A 3EKSA 4GNIA 3SAHA 3CJAA 4DLEA 4C8KA 4ZTJA 3DXMA 3M1FA 4MQ3A 1YHQN 3NGYA 4M63C 3HPOA 5GINA 4W5NA 2IAJA 4C8MA 4B3TK 4C8NA 1HNIA 3L2RA 2KZMA 3VTIA 1WB9A 3WXLA 3C95A 2X6NA 4H4MA 4DUZK 1EKEA 1JCEA 1LW0A 3MN9A 4CBWA 4DQSA 3SYZA 4OGCA 1VSMA 2YJEA 1DGKN 3L8BA 5GIPA 4AH9A 1TGOA 1IKWA 3QBXA 4K42A 2ATQA 3O80A 4CJRA 3LDLA 4N56A 2Y1IA 4QCLA 3MN5A 4RW6A 4WFBL 3G71N 4MO4A 2O8EA 3BUZB 1BA1A 3QEXA 5AQLA 4JI1K 1DTQA 3NH2A 4FZYA 1A5XA 3AGRA 5HL7L 4O5FA 5DMRA 3SV3A 4PWDA 3L2QA 4DQQA 4XIUA 1A5WA 1QHTA 3MWPA 3C65A 2W42A 1EWQA 1NK8A 3THYA 4CGIA 5HRPA 4CZLA 1S5JA 3WEEA 2Y1JA 3AAQA 3L6QA 3CERA 4E89A 3G25A 2JWKA 3ULEB 3L2VA 2KW4A 5KTQA 3CG7A 2PAVA 1NGEA 5F1XA 3OYMA 3VA3A 1RDCA 1N6QA 4CF9A 2VWJA 4FJNA 2F8TA 5CZ2A 1KVBA 3IKMA 3HSTB 3THXA 4E7LA 2D0BA 2D5RA 4BE0A 4FWLA 3ID6A 2AJQA 3LAMA 3CF5L 4OPKA 2QA4N 1IV0A 3D6RA 4BC4A 5AQFA 3K58A 4LSLA 1Z25A 5KGWA 5J1EA 1D9DA 2HVHA 2YX6A 1HNXK 3GG4A 1J5EK 3CJ9A 3T19A 4BDYA 4IOAL 2YJFA 1BA0A 3R1XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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