4KWVA

Crystal structure of human apo-qprt
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
285
structure length
285
Chain Sequence
DAEGLALLLPPVTLAALVDSWLREDCPGLNYAALVSGAGPSQAALWAKSPGVLAGQPFFDAIFTQLNCQVSWFLPEGSKLVPVARVAEVRGPAHCLLLGERVALNTLARCSGIASAAAAAVEAARGAGWTGHVAGTRKTTPGFRLVEKYGLLVGGAASHRYDLGGLVMVKDNHVVAAGGVEKAVRAARQAADFTLKVEVECSSLQEAVQAAEAGADLVLLDNFKPEELHPTATVLKAQFPSVAVEASGGITLDNLPQFCGPHIDVISMGMLTQAAPALDFSLKLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]
publication title The crystal structure of human quinolinic acid phosphoribosyltransferase in complex with its inhibitor phthalic acid.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 285
sequence length 285
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2013-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4kwvA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 4kwvA01
3W74A 4YCPA 3NPVA 3THQA 3HMJG 2WV8A 3A5VA 1BKSA 3EX2A 5SWUA 3W7NA 1XI3A 4NNBA 3VE9A 4NZFA 2C1HA 2OZ0A 3NGJA 3PUEA 1H7PA 3M44A 3NQEA 3ABOA 3M41A 3PWAA 4HN4A 5CG7A 1YDNA 4FXSA 1H50A 3TQVA 1TB3A 3NM1A 3DFQA 4H3DA 4RZ4A 4BI7A 3L5LA 5HR7A 4GC4A 3TFXA 3L9CA 3T78A 4ZQPA 3W2KA 2VFFA 3GAKA 4EOUA 1W5QA 2QCDB 1G7VA 1QDSA 4N4QA 1OX4A 3HJZA 5D37A 4DPQA 1K8ZA 2NWRA 1WDWA 5CPMA 2WNZA 3W1QA 5HINA 1VC4A 4UNLA 5DY3A 3N19B 3PC0A 3PUDA 2TPSA 4FB7A 4Y8FA 4JDYA 1W3IA 1VRDA 2HS6A 1T96A 3A5FA 2Y63A 2CLHA 3CTLA 5LGZA 1JQVA 1W31A 1X8FA 3MMTA 5MHBA 1AK5A 3FYPA 3LRMA 4B5NA 3GXNA 3U8GA 4PL2A 5CPLA 1GVQA 3IEBA 4JX5A 4FF7A 4Z0SA 2A7RA 3QPYA 4ML9A 1K7FA 3WJYA 1TQXA 4X9SA 3NQVA 3G8EA 4O17A 3PVFA 3BG9A 5HWNA 5F2MA 2X1TA 5G1TA 4YXGA 2Y7EA 4NJJA 3UWZA 2BWGA 1GQNA 3BPWA 3UPWA 1ZY9A 2YXGA 2QCNA 2Y70A 5HWJA 4IUOA 3PBWA 4LNYA 1Q6LA 3QF0A 1DQWA 3C56A 1G4SA 2NLIA 1XM3A 3LCXA 2GPTA 1QOQA 3ATZA 1G4PA 3N73A 5C2XA 4WY0B 1G6CA 1EUNA 3B4UA 2KZHA 2TYSA 1A5SA 3RLVA 4N6FA 1QPRA 1OHLA 3ZFHA 5C6MA 5K9DA 3QMTA 4O10A 4DO4A 3B8DA 3IIPA 2YPIA 4I7WA 3NQDA 3NYZA 3STGA 3LM7A 4RK8A 4OU1A 1KBIA 4GJ1A 1WA3A 4MUZA 2ZZ2A 3W83A 2GQ8A 1O95A 4LVFA 4RXGA 1GTEA 4MZ8A 5F1VA 2Y61A 1GJPA 3EKLA 1SO4A 4NXSA 5BMWA 1L6SA 4QISA 1R47A 3BW3A 2YFOA 1JRCA 3TMQA 3UWYA 1KM2A 3UXDA 5AHFA 3W7MA 5KINA 1ZAJA 1IF2A 1LDCA 4IPIA 5AC6A 3PR2A 2BSLA 3UY7A 1JCLA 2Y62A 1LRTA 3CIXA 3HF3A 3KRSA 2V81A 4MOZA 4HKPA 1KM1A 5LHEA 2J27A 3PBYA 1SO6A 5G4EA 1FBAA 4LS2A 3LBCA 3WK3A 1XBVA 4UFKA 4JGDA 2C15A 3SW6A 3UYCA 2GOUA 3KRUA 2YDAA 1P1XA 2E6YA 3LCWA 4OHQA 4JX4A 1Z41A 4ZZ9A 3KRZA 4LUJA 3TSBA 4MFDA 2ABBA 3T40A 1MZHA 3M5ZA 1KA9F 2YZRA 4ZQMA 5EYWA 2EPHA 1WAUA 2DZTA 2YSWA 4QNWA 4WQ6A 5E1QA 5LNWA 1M7OA 3P80A 3QW4B 3BG5A 3T4CA 2H6RA 1X7FA 4Y9AA 3A21A 5AHNA 4FO4A 4JEQA 3FOKA 3MUXA 3NZRA 2H8ZA 3U6WA 3GXPA 4M6PA 1XL9A 2QCDA 3P61A 2V5BA 1IXQA 1LBFA 1QR7A 2E6FA 3PSWA 3TJXA 5FF2A 4Q33A 3LTSA 3NO5A 2HS8A 3NR0A 4O13A 4XUGA 5DELA 3INPA 1YDVA 3QQ0A 3SJ3A 3C2RA 1OFEA 1GVFA 3CEUA 1GYLA 1UCWA 3W7CA 3LXBA 3L0KA 3N9SA 2NUWA 5D2VA 5D2TA 4A3UA 3M9YA 2GJLA 3BGGA 3T7VA 1XDMA 1ZENA 2WSYA 5K2ZA 3A9IA 3L68A 2A7NA 2A0NA 1RV8A 3MYOA 1KTCA 1OF8A 1SZGA 1SFJA 2Z1BA 4FX7A 1W3TA 1F74A 3ZS4A 4OGZA 3I65A 3G0XA 3W1NA 4MIMA 2NXHA 3IVUA 4JICA 1TCDA 3WK0A 3G1SA 3NQ8A 3B05A 3CHVA 3QFEA 3SFKA 3F1QA 4ORIA 2WQPA 2ATSA 4LC8A 5AHIA 1EP1A 3BO9A 3MYPA 3MBFA 3HB9A 4EF8A 2FPYA 3BW2A 1EWEA 3STFA 3HG4A 3H55A 3TC6A 2FJKA 1YYAA 3DENA 4TO8A 3EXSA 2VFIA 2PC4A 2PE4A 1LP6A 1OFAA 3NQCA 5KITA 3NQGA 2QCLA 3GDLA 1XC4A 4N9CA 4ZQNA 1PL9A 2YYTA 4KWVA 2CLIA 3MP3A 3Q37A 4AWTA 4UTTA 3IVTA 1GG0A 1HUVA 4AF0B 2GJNA 4LY8A 4NU7A 3G1HA 3UY8A 4JTTA 4U4MA 4KFPA 2NX1A 4WZHA 1ML1A 1JCXA 2CZ5A 4XWUA 2ZZ7A 2Y7DA 3C3NA 2GQAA 4FIQA 4A2RA 4K36A 4HSOA 3DZ1A 5FF3A 3ANYA 5CPOA 2EAWA 3L2IA 4O57A 2G96A 2RDUA 4JTFA 5LHFA 3VE7A 1LCOA 2ZRWA 4GUIA 3ABQA 3SIZA 4IMCA 1TTPA 2F7FA 3E12A 3TCEA 3PAJA 1K7XA 3HGRA 3OA3A 3SR7A 1UB3A 3QMRA 3W22A 3BVJA 4BI6A 1UBSA 1YTDA 2DZUA 2QUTA 4YLWA 4PCFA 5LGXA 1FDJA 1W5NA 4IGHA 4QITA 4HT3A 1HFBA 3T44A 3G18A 5U7SA 2W0UA 3W1UA 3NQ7A 2ZFAA 3SGZA 3C52A 4A22A 3LHYA 2NWSA 1EUAA 1OG0A 1PIIA 2JGQA 2ATMA 1JQXA 1H5YA 5F4WA 3UD6A 3QZEA 1EX5A 1VPXA 3TIMA 5D05A 3S1VA 2QEZA 3FJLA 2NV1A 2Y89A 4GUFA 5G2WA 3C2OA 3P5ZA 4Y6GA 3R89A 3FKRA 3Q58A 4X2RA 1SO5A 2X1RA 3W71A 3QH2A 2H3DA 2BTMA 4NX5A 4AXKA 3R5EA 4O50A 4AWUA 5KZDA 2Q3OA 5AN7A 5L9FA 4X22A 4WXZA 1WOBA 2C6QA 4HIBA 4NUWA 3UPBA 3NPWA 1ONRA 3F4WA 1OX5A 2Q8LA 1PHQA 1ZNNA 5AFDA 3GDKA 4MY9A 4ADTA 2X1UA 3HG3A 3BK0A 1JUBA 1KTNA 1YTKA 3L21A 4TX9A 1IXOA 2CLEA 3HGJA 2G97A 4FX6M 4QJ1A 2X16A 3DU0A 4K7YA 3GK0A 1LBMA 1FXQA 4JTLA 3WK2A 3LBMA 4AHQA 2FB3A 2R14A 3GDTA 3S1UA 3LTYA 2WJZA 5CZSA 4O1AA 4TU1A 3V1PA 4ORMA 2C18A 1M6JA 1WX0A 3F03K 5D2XA 4S2CA 1XBXA 3TW6A 3UNDA 3DAQA 3PM6A 2DZPA 4HPXA 4MJMA 3W07A 1QWGA 1X1ZA 4Y96A 1JRBA 5LNSA 3P7YA 4ZQRA 1OFRA 5G2HA 1JUEA 1VJIA 3IRDA 5I3FA 3QSRA 4YWIA 4JYEA 1YTEA 3N9RA 1ME7A 2OJPA 3LHUA 2ISVA 4X3ZA 4EIVA 4QM1A 3KOFA 5CZ0A 1RD5A 4M5PA 1LBLA 2ZA3A 4D2JA 1YPFA 2NV2A 5EY5A 4O54A 1SR9A 4UTJA 3NZ1A 2QCCA 3MWAA 2PRHA 3HOJA 4PH6A 4Z1AA 1K3UA 4XBKA 3ATYA 1JJKA 1NVMA 3THAA 1W5MA 4HNUA 4O12A 2E1DA 1XBYA 2JBMA 3C2VA 1O60A 3W73A 3G1DA 3W7LA 2ZRZA 2G5WA 3CM4A 5H91A 1PVNA 1A5CA 1RPXA 2X2GA 2A2IA 4JTJA 1RVGA 2AQWA 5EA9A 1PS9A 3CB8A 2QJHA 1O4UA 3LB0A 1Q6OA 3GVGA 1XFBA 4RR4A 4QIUA 2CFFA 2WSQA 1SQ7A 3STEA 4LVDA 5D2YA 2V82A 4ALDA 1YADA 2NZLA 2ZQ0A 3LXAA 3DXIA 3FKKA 4NT0A 3M47A 5AOUA 3O05A 1I2NA 3NQMA 1VH7A 4I9AA 4IQLA 3MP4A 4RJEA 4N2YA 1TSIA 1IIGA 3LHZA 5E0KA 1C29A 3G0SA 2E5CA 3IIOA 3WJZA 4KWWA 4LVGA 1NF0A 4K39A 2J9YA 4QAIA 2D73A 3W86A 1YXCA 4Q32A 5J5DA 3W1PA 2A6NA 1LM1A 3NL6A 3NPUA 3BW4A 3GZ3A 1SW0A 3I68A 4JTSA 3K30A 2J9XA 3S0CA 3LRLA 2ZZ6A 3B0PA 2C13A 2VOMA 3TA6A 4RXFA 1TPC1 5F4SA 1G4EA 2V2CA 3S5ZA 2V5LA 1DBTA 2RFGA 4LS0A 4H4IA 4JDBA 5D02A 4UMAA 1GTHA 2PRMA 4CQ9A 4UFJA 2CLMA 1KM4A 2YW4A 2JGYA 2QKFA 3B04A 1GG1A 4NX0A 3EWUA 3NVTA 2ZRXA 1TPB1 2E68A 1F05A 1OFOA 5ABTA 2EGZA 2VENA 3UQNA 5D09A 4CQ8A 4GUGA 4R7JA 3HBLA 3TMLA 4TMCA 3HQ1A 5LNUA 1N8FA 1F73A 4I7UA 3W76A 3N3MA 3DH7A 3MJYA 1S5TA 1WYIA 4JTKA 4CLMA 1VR6A 2B0MA 4GRSA 1LTDA 4N9BA 1DOSA 4AB4A 5AYXA 5AHEA 1I2PA 1D9EA 1VHNA 2Z2UA 3WFAA 2CZDA 4WOQA 4E2DA 2ZDRA 5E93A 1JCMP 3G24A 1NF7A 1VLIA 1R2SA 3GNDA 2HSAA 2Y7FA 4DQWA 3O07A 2YYUA 2O7SA 1OYCA 1UJPA 1BWLA 1W1ZA 2JK2A 2UV8G 5CPNA 1CI1A 5A5WA 5AYZA 3RMJA 1TPFA 1ICSA 1VCVA 1TV8A 1QAPA 3TU9A 3R12A 1YXDA 1TPUA 2TSYA 2WPBA 1QPOA 4UCGA 3NNTA 4EF9A 3L0NA 3FYOA 4GBUA 2QDGA 1SZEA 1GZGA 3EB2A 3TNOA 1H60A 4O18A 1FDYA 1W37A 3QM3A 3W7OA 3LCFA 1I4NA 1K7EA 1BTMA 5C55A 1ZAIA 3BV4A 4O1CA 1OFBA 5HUPA 1JCNA 2OCZA 3I7RA 4LW7A 4BFAA 3P81A 3O63A 4WUIA 3QQ1A 4Z08A 5G5IA 3TR2A 1Q6QA 2E6DA 2QR6A 1VYSX 1FWWA 4AMAA 1AL7A 2FLIA 5FEPA 4BR1A 1WQ5A 4MLRA 1ADOA 2DZVA 1TTIA 8TIMA 3L5MA 3EXRA 3TQKA 2DZWA 4LV9A 2OT0A 3JR2A 2E6AA 1U5JA 1UUOA 1UASA 5LZLA 1P0KA 4PA8A 4HNNA 2FQIA 4IPJA 4O0ZA 4WD0A 4S2BA 3LV5A 5G2IA 4DF2A 1MSSA 4LU0A 1F5ZA 4QQ3A 4DF0A 1B57A 3LHWA 4QNEA 1RQHA 2HTMA 3IGXA 2V8ZA 4BWLA 1QPNA 3ABSA 4E0CA 4JIQA 2ZZ1A 5J5RA 3GR8A 4DELA 3TUUA 4IXHA 1H1ZA 4O0KA 3C8FA 2XN2A 3OVRA 1VCFA 3I6RA 5I3HA 3W1LA 3W2LA 2ZZ4A 4WXYA 4ADUA 5AHMA 3TV8A 2QCFA 1DJNA 3S5OA 3B0VC 3FA5A 4WY0F 4W9TA 1OFPA 3TSMA 4N6EA 5EL1A 1KLZA 1FX6A 5F1UA 3PG8A 2W6RA 1I45A 1VZWA 4ZL1A 2AAMA 1TMHA 1I2OA 4UFMA 4O52A 3PB0A 2P10A 5BRBA 4UFLA 3CIWA 5FF7A 5I3GA 1AW5A 2OX1A 3IGSA 3LHVA 1LRQA 4LRTA 1KFEA 3DHFA 5TIMA 4Z1CA 3W1TA 3EWBX 5I3IA 2V2HA 1TQJA 4CNOA 3M7WA 4UR8A 4E38A 3CWNA 3HIJA 4EWND 4JTUA 5LNRA 3GDMA 3NG3A 3PY2A 1IIHA 2X1SA 3H53A 4K37A 3QMSA 3E9AA 5F2LA 3S9YA 1DORA 3GXTA 3P84A 1ZALA 3EX6A 1N55A 1TTJA 4JYDA 4Q4KA 1DV7A 1RZMA 3M43A 1T0OA 1Y0EA 4OT7A 4K8EA 4RV8A 3OG3A 3MI6A 3E0IA 3HPXA 1VQTA 4PL1A 1R30A 4L4LA 4DPPA 5DBUA 4KFNA 2YX0A 2WO5A 2E5DA 3NDOA 3LX9A 1KW1A 4JTIA 3PULA 5D38A 3QPZA 3DFOA 4Z1BA 1ZAHA 3B06A 3C4UA 2QJGA 2ZYFA 4JR5A 1FCBA 1SFLA 4BK9A 4AHPA 5KMYA 1N7KA 5IM51 3DGRA 3EWXA 3LCIA 1W3NA 4BWLC 1WBHA 2DU2A 3MHFA 4L4MA 2FFCA 2DZSA 1KTBA 3LCGA 1W5PA 2Y6ZA 2NXIA 2YW3A 3BLEA 3NL5A 1TJPA 4JN6A 1H62A 5GVJA 4DBEA 4KKXA 3IVSA 3PG9A 5IBXC 4WJEA 1DHPA 3TE9A 1R46A 3M6YA 3W85A 2H90A 2VELA 4JIPA 3JS3A 3W23A 3KX6A 1OFDA 3KVJA 4GUJA 4R33A 3DFPA 5D33A 3W7EA 3QC3A 4ADSA 4Y90A 1KM5A 5LKYA 3H54A 3W1XA 1JCYA 4PC8A 4K7VA 4U28A 2R94A 4DO6A 4JXCA 4UTHA 3N14A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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