4L4M | Genus

Total Genus 164

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	164
sequence length	480
structure length	471
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title	Structural and biochemical analyses of the catalysis and potency impact of inhibitor phosphoribosylation by human nicotinamide phosphoribosyltransferase. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	164
structure length	471
sequence length	480
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2013-06-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4l4mA02

4O18A 1VHCA 2EF9A 4CQ9A 1SUXA 1XXXA 5EPDA 2QJHA 4QNEA 3QPYA 1ICPA 1A5SA 4UTTC 2QCLA 2RKXA 1F05A 2J9XA 4LVFA 1QOQA 1YADA 4WQ6A 3MW7A 2GJLA 1SFJA 4IX0A 5TIMA 4I9AA 1DQWA 4MJZA 4MOZA 1HO4A 3L0GA 4DF0A 4MVAA 4I7UA 1W56A 4FXSA 3BV4A 4MKNA 1G4PA 1ZALA 2Q3OA 2XN2A 3LV5A 4O10A 1Z44A 3F03K 2E77A 1M6JA 1LLZA 3FLUA 4JEQA 4GNJA 2J24A 5L6UA 5BNKA 2A6LA 3TW7A 4BWLC 2B7OA 1W31A 4GE8A 3NQAA 1QCWA 3QW4B 2HS8A 4ONVA 1H50A 1LOQA 3NDOA 1G4SA 1Q6RA 2ALDA 3NQVA 1XDMA 1YPFA 1EWEA 1JQXA 3OVQA 1DJNA 1F74A 1K7EA 2GQ8A 1KLYA 3PM6A 4NJKA 3TAOA 4RX0A 3CB8A 1KFCA 4QSHA 1TMHA 2A0NA 3KHJA 3LHZA 4DBDA 4MLJA 2QCDA 1X8FA 4BI7A 1XI3A 2X1TA 2YR1A 3W22A 1E51A 3UY7A 4DBEA 4ML9A 4M6QA 3HGRA 3LCFA 3M6YA 3NM3A 4UTLA 2NUYA 4U28A 1TPWA 4RZ6A 1D3HA 2WKJA 3VCRA 5KINA 3R5EA 1MO0A 2VENA 3NL5A 3OBKA 4O12A 4CCCA 1FCUA 3GAYA 3THAA 3RLVA 3WJXA 1WBHA 4AVFA 4J9JA 1RV8A 5BOOA 5D32A 1EA0A 3B0UX 2TPSA 4Z1DA 3TK7A 1QDSA 1PHQA 2C6QA 3W7DA 4QJ1A 4DPPA 1JUKA 1YPIA 2ZRZA 3O63A 2ZFAA 2CLLA 4G1KA 1QPRA 5BMWA 3GB6A 1PL9A 3NR0A 3TIMA 2V5LA 1B4EA 2I1OA 1H62A 2VEKA 3W85A 1W1ZA 1AG1O 1OFOA 4DO4A 3NPWA 3W9ZA 3LBCA 3NQ2A 5F2IA 5K7JA 2OJPA 2PRMA 3EX3A 1LCOA 3W75A 5EYWA 3P60A 1DJQA 5HMSA 3F4NA 3SZ8A 3GXPA 1L2UA 5AYXA 5A8GA 1X1OA 4JD4A 3KVJA 4GUIA 3TJLA 5D09A 3C3NA 1KBIA 1EP2A 3CEPA 2X1UA 3GDTA 4Z1BA 3DI0A 5KMYA 1TTPA 3QQ1A 4IJBA 4NXSA 4RZ5A 1LRNA 1VR6A 1YXCA 2TRSA 3PUEA 3W7QA 3QRHA 3MYPA 1AL8A 3OEXA 4I7WA 5AHLA 3FIGA 3NGJA 5CSSA 2V30A 3N2XA 4ADSA 2DJLA 4UTUA 4JX6A 3QFEA 1JUEA 2QJGA 4AXKA 2YW4A 3CLMA 3TCEA 3W84A 4WXZA 5I3IA 1GPWA 5MHBA 5CPOA 1DVJA 3DFTA 2ZTKA 3O6CA 1JRBA 4PL2A 1LDCA 5J5RA 2JBMA 5FF7A 3PB2A 4LRSA 3S6DA 1SO4A 2Z0IA 5D38A 4CLMA 4GJ1A 5LNRA 4FNSA 3N2MA 1UB3A 3TC6A 3CT7A 3JS3A 3LI1A 2J9ZA 2Y89A 2H90A 1OF6A 1JCXA 2XN1A 3CU2A 1M7PA 1Q6OA 4ICNA 1I8JA 1A50A 4JIQA 4FIRA 4WY0A 4WX2A 1YDNA 3O8AA 1SZNA 3HOJA 1ICSA 3GDRA 1Q45A 4DO5A 1W3NA 2A7PA 4AHQA 3EWYA 8TIMA 1KFBA 3G1VA 4OGZA 4RLIA 3NPUA 5LHEA 1JULA 1S3HA 1MEHA 1XBZA 3SSJA 2VEIA 3SGZA 3WK1A 3PSVA 1HO1A 1F5ZA 4AWUA 2CLHA 3MI6A 3DGRA 2ZA1A 1JR1A 3V75A 3FKRA 1H61A 1W3TA 3N14A 2VKZG 4Q33A 3P5ZA 3MP5A 3NM1A 4FNUA 3N9SA 1ZHAA 3NO5A 2FQIA 2CFFA 3QSRA 5TBOA 4RV8A 1M5WA 1XKYA 2D73A 1QOPA 1ZY9A 4W9TA 1JCNA 3KOFA 1CI1A 2ZDRA 1RQEA 3W7PA 1XC4A 2TSYA 2WO5A 1D3GA 1THFD 1H51A 1K03A 3R12A 3N19B 3DFNA 1RD5A 3TFCA 5LSMA 2J6XA 5BW6A 3HO8A 3BW3A 2DZPA 4OU1A 1F2JA 3D0CA 4WZHA 3S9YA 3EWWA 4UTKA 3LI0A 1VQTA 3UWZA 2QJIA 3WK0A 3WJZA 4K6AA 1CW2A 1ICQA 1PS9A 1KTNA 5DELA 5E93A 1KLZA 5CZ0A 3UWWA 3M5YA 4ZMGA 3HB9A 3UD6A 3NQ8A 1WX0A 1XBYA 3EEGA 1XBXA 4UUIA 1SPQA 2E6DA 3BLFA 3QH2A 2FDSA 1PHWA 2ZCGA 3SJ3A 2UV8G 1OJXA 3UNDA 3UPBA 1OFQA 3H54A 2W0UA 2QCDB 3CWOX 1TRIA 1FWTA 1GYNA 3EKLA 2Z6JA 1SR9A 2OT0A 1YDVA 1KM3A 1IXOA 5DY2A 3EX6A 4WOQA 1AL7A 5I3KA 5U4NA 2H6RA 5HUPA 2GVLA 3B04A 5C2XA 3LRMA 1IXPA 4PL1A 4PODA 2C14A 4IMFA 3DHFA 1UJPA 5E0KA 4O4VA 3QYQA 3W88A 1JRCA 3G22A 1HUVA 5F4WA 4K39A 4LTSA 1QO5A 5AOUA 3FOKA 1I2QA 2VFIA 3EWZA 1YXDA 2DP3A 4ZZ9A 1UASA 1F6PA 3R13A 4ORMA 5AYYA 4MYAA 1GTEA 3DFOA 2CU0A 1G69A 4N9DA 2I14A 4K8EA 2X2GA 2YGYA 4YMZA 1SW0A 2FTPA 2Y6ZA 3U6WA 1G7VA 3DU0A 3IVSA 1GVRA 4RKAA 3DKJA 4IMEA 1QO2A 2AAMA 2V0TA 3UWYA 5EA9A 1ZJIA 3PWAA 1TCDA 3LRKA 2J88A 4H3DA 4UTIA 1VYPX 4CCDA 3NEVA 5EBUA 1P0KA 1DV7A 1CX9A 3ABOA 4O1DA 3RNDA 3TA6A 3PBUA 4X22A 5SWUA 2NZLA 1KFJA 2Y88A 5IM51 5A5WA 2ZZ4A 1PIIA 5IBXA 2CZDA 4MZ1A 2F84A 1LTDA 3DH7A 4YXGA 4A2RA 3TX9A 3TW6A 3DBPA 3LTPA 1TPUA 3P82A 5F1UA 4M6VA 3YPIA 3SGUA 3S1WA 1SFLA 4GUHA 4UFJA 3TU9A 2C18A 2NX3A 5EMUA 2F7FA 2E5CA 1EPXA 4RK8A 1DQXA 4UFIA 5AYZA 5C55A 3QEZA 5T26A 4PCFA 1LROA 1QPNA 4FX6M 1VCGA 4NX5A 3BG5A 3A23A 1H5YA 1WYIA 2VOMA 1ONRA 4MYXA 3IGXA 2JGYA 3ABRA 4O14A 5FF4A 4QIUA 1KFLA 4GXMA 4ZQCA 3PG8A 4QITA 3W7RA 3L65A 3S5YA 2PRLA 2ZYFA 3QMSA 4N2YA 3QSTA 4YWIA 1L6SA 3UPWA 2B7PA 4AF0A 4WY0B 2DZUA 2O7SA 4O1AA 1WOBA 4AWTA 3PC0A 1H7WA 5D30A 2QCEA 4ADTA 2A1YA 2BSLA 1EX5A 3TKFA 3ZWSA 1HG3A 4JTUA 4Z08A 1S5VA 2VFEA 4JYEA 5E1QA 4XBSA 2BTMA 4NJHA 3QJAA 1ZCOA 2ISWA 2AGKA 4K8HA 3EWXA 3ZR4A 4D2JA 1KTBA 1TO3A 1ZAJA 4K36A 4OE7A 2NXIA 3ZFHA 5AC8A 3UZJA 4UR7A 1OX4B 4FXRA 3CIXA 3M16A 3W1MA 3PB0A 3LCXA 4GUFA 3G1FA 3AJXA 3DHDA 5D04C 2J27A 2WSQA 2X1RA 1FWSA 3W1UA 1GT8A 3DXIA 4KWVA 3NL2A 4OV9A 3Q94A 3P8JA 2A4AA 3MBFA 3G1HA 2FPVA 4O52A 3TR2A 4N6EA 4EWND 3LB0A 3GNDA 5D2VA 1KTCA 2W79A 3B8DA 3O16A 4UCGA 4ZQRA 1SZFA 2QCNA 3IIZA 1KV5A 1HL2A 3E0IA 1WV2A 4S2CA 4AAJA 4DF2A 1LBFA 1TREA 1WQ5A 3N9RA 1L6WA 4WY0F 1G4TA 2ZZ3A 3GIYA 4X9SA 2VELA 1BEUA 3L67A 3IIXA 2XN0A 1K8YA 2RH9A 3O05A 4LV4A 2HTMA 2PURA 3W7GA 1VLWA 1OFDA 4UNLA 3EXRA 4IPIA 1W5PA 1H1YA 4JX5A 3PBWA 2WNZA 2FJKA 4EVZA 2OX1A 2A5HA 3LGEA 3PAJA 1LZOA 1LOLA 5D2YA 2JKEA 2WPBA 5K9DA 1OG0A 1SU5A 3C2RA 1TPDA 1RQHA 1JVNA 4EIVA 2Y7EA 4UXDA 1YLVA 3E49A 5FF3A 1GTHA 3EXTA 4IXHA 1EP3A 1V7YA 2YYTA 2RDTA 5F2LA 4AEOA 2FPTA 3LLDA 2QEZA 3UWUA 3IVTA 1X1ZA 2E5BA 4UNKA 3A21A 5C5YA 3L21A 4LS2A 5DBTA 3W7MA 5ABTA 4QNWA 5CPNA 5IBXC 1VYRA 2JGQA 3W7KA 3ABQA 4FNTA 1VZWA 3K30A 4BI6A 5DN1A 3S8HA 2E1DA 3JRKA 4A2SA 1Q3NA 2R94A 1GZGA 2JK2A 3DFSA 4ZVJA 4ZQNA 4MZ8A 3O06A 4MY1A 1EUAA 4MPQA 3E02A 5AHMA 3C56A 2Q8ZA 3IGUA 3W07A 3CWNA 1K02A 1TPEA 1UBSA 3W76A 2CZEA 3NPXA 5G1TA 3NQ7A 3HBLA 1GOXA 4Z1AA 2Y61A 4O4WA 3G1AA 1WAUA 3HGSA 4NQ1A 1T8XA 1UUOA 4GUGA 4HSOA 5DY3A 4X2RA 4E0CA 5AC7A 4HN4A 4WOZA 2DU2A 4AH7A 3KXQA 5HWMA 2LLEA 5DXXA 1FCVA 4NNCA 2FPYA 4LU0A 1ADOA 3G3MA 1GJPA 3CTLA 4S1FA 3LCGA 4LRTA 1VH7A 1MZHA 2R8WA 4MUZA 1F76A 1P1XA 4OHQA 1M7OA 4UTJA 3RLUA 4PFMA 2QCMA 1H7RA 3EX1A 1VS1A 4IMCA 4LUIA 1W3IA 4FEZA 3RF9A 3M1ZA 1OX6A 4M7SA 3MP4A 3GKFA 1JQVA 2Y7FA 1ME8A 3I65A 5LGZA 1TYGA 3PSWA 2G96A 4JN6A 2C13A 1LRQA 1QWGA 1OFAA 3S5OA 1T96A 3SIZA 3IIOA 5HWNA 3L5MA 4S2BA 1FCQA 3UWVA 3TV8A 3VE9A 2CZ5A 2W6RA 3M47A 3BW2A 4PTNA 1TPC1 4LUJA 2V9DA 3PUOA 4O54A 3FJLA 4TO8A 4Y9AA 1BKSA 3GDMA 4XKYA 1A5CA 1Z42A 3ZS4A 4ZQOA 5I3FA 3W3OA 3M5XA 3TQ0A 2Y7GA 1TTQA 3GX9A 4NZJA 2ABBA 4IPJA 3OIXA 4GWEA 4NNBA 3B0VC 4O28A 3W70A 1JUBA 4LC6A 1OYBA 2CLKA 5LKYA 2B4GA 4ZL1A 2TMDA 1MEWA 2C3ZA 2VC6A 3L5LA 2QUVA 4O1CA 3RK8A 1O5KA 3TDFA 4CNPA 5KZDA 1FQ0A 1PE1A 1ZENA 5F4XA 3CEUA 4UTMA 3LTYA 3NQMA 2YPIA 4Y6GA 3U2OA 3TFXA 3S5ZA 1YDOA 5HR6A 1OF8A 3NXFA 3W7OA 3W2MA 3QF0A 3LTSA 2GOUA 4NZFA 3CIWA 3MO7A 1NF0A 4U4MA 3G0UA 5FEZA 5J5DA 1OABA 4JNMA 2A7RA 4JS3A 5DCEA 1PCKA 3B06A 4UIOA 3A9IA 3E9AA 4TMBA 1IF2A 2DZXA 3KX6A 1XUUA 4IWWA 4N6FA 4ZQMA 5I3GA 4NUWA 3SW6A 4DELA 3ABSA 3BG9A 3U8GA 2CLEA 4JTFA 2H3BA 3LLFA 7TIMA 1XUZA 2QCHA 1R30A 4TMCA 4BR1A 3A5VA 4DF1A 3C6CA 3QMTA 1L9WA 4JTKA 2QKFA 2FB2A 2QUUA 4E2DA 3THQA 1Y0EA 3PG9A 4RR4A 2EAWA 3P8IA 3BARA 3BLIA 4O16A 2OCZA 3TSMA 3OVRA 1XM3A 1QMLA 1LORA 1UCWA 5EL1A 1TSIA 3MI2A 3T4CA 1LM1A 4JICA 3F4WA 5G2WA 3EB2A 2ZRYA 3UY8A 3M44A 4FNPA 4H4IA 2QUTA 3NVTA 4JDBA 3TNOA 3DENA 1MXSA 2G97A 2E6FA 4JTTA 2E09A 3ANYA 3W1AA 2DZSA 2X16A 4UFKA 1YTEA 2QDHA 3LXCA 3W2LA 1GG0A 3NAVA 3SI9A 3C2EA 3G3DA 4LS0A 2O7QA 2Y62A 1H7XA 2V2HA 4LC8A 4LS1A 4LOCA 3P5YA 3Q58A 4BFAA 1WXJA 3G1YA 4LW7A 1ZAIA 1SO3A 5D05A 3MBDA 4TIMA 1EIXA 1PVNA 1PV8A 4M7TA 2GVJA 3NZRA 3UXAA 1H63A 2QCFA 3NZ1A 1IIGA 4HPJA 3BGJA 3L2IA 1FWWA 3UXDA 1WBJA 5FF0A 5HWJA 2Y85A 1AMKA 4MIMA 5GVJA 1DOSA 3LOTA 6TIMA 2YX0A 1FDZA 1I45A 3P67A 1OYAA 1F73A 3AO0A 3BW4A 3GYEA 1IGSA 4O50A 4PC8A 4NT0A 3HGOA 2B7NA 2A2IA 2BXVA 2NV1A 3GDLA 4DQWA 2VFHA 3H55A 1J2WA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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