4LA1A

Crystal structure of sjtgr (thioredoxin glutathione reductase from schistosoma japonicumi)complex with fad
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLQRTIESAAVIVFSKTTCPFCKKLKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSVIQKALSNFSKIETVPQMFVRGKFIGDSKAVLNYHNNNQLQAIVNENKYDYDLIIIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKIAVLDYVEPTPMGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHSLEDAQHFGWSLDKSEISHDWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVSLRDNAVTYLNARGMLLSPHEVQITEKNKKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAIEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVVGASYVALKCAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEITQLKPVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKLNCEAVGVKLDKNGRVVCSDDEQTTVSNIYAIGDINAGKPQLTPVAIHAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDNDIEVYHSHFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRISDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKEDFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKRSGGSAAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin glutathione reductase
publication title Crystal structure of SjTGR complex with FAD
rcsb
source organism Schistosoma japonicum
total genus 197
structure length 586
sequence length 586
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2013-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 4la1A04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4la1A01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4la1A02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4la1A03
4D04A 3ZIJA 2PYXA 1PJ7A 2R3XA 2ES7A 3UKKA 2WDRA 2O85A 2YZUA 3BI5A 1PDHA 1QMVA 3APOA 4NXIA 1GESA 3SGLA 2C65A 1K0OA 4JBBA 3IWAA 5EB4A 2JZTA 3Q6JA 2D2ZA 1CQGA 4I2UA 2VD1A 3G5SA 2H1GA 2IPAA 1B48A 2GDRA 4K5RA 3UJ1A 2IMKA 4KSOA 1IUXA 3P1WA 1YKAA 3FRCA 1GNEA 2N5AA 3DK8A 2H1DA 3UKHA 5KN1A 3AE9A 2YWOA 3VPQA 3ADAB 2HSYA 3F6FA 1CJCA 1PJ5A 2C0FA 2M46A 2GR3A 2CZ3A 1AAZA 5J9BA 5J7XA 3M12A 1DNCA 1XVWA 1EV4A 1ZMCA 4C5OA 1SU9A 2FBWA 1YQ3A 3ALLA 2H89A 5IMCA 1BGNA 3CMIA 1KNRA 3ICRA 2WU5A 4HB9A 5ER0A 6GSXA 1BEDA 2IJYA 4C3XA 1GSUA 1D7LA 1TRBA 4PUFC 3ICSA 1DSBA 5G31A 4MJAA 2FWEA 1NHQA 1GSFA 4KNDA 5B6NA 1KSUA 1OJCA 2C66A 3NNEA 1F9MA 5L71A 3ATQA 2H76A 3RPPA 5CO3A 1F3PA 5LV9A 2WOWA 4CHSA 3E0UA 2H71A 2YLWA 2Z9SA 2C70A 1XWGA 1F37A 3C4NA 1XW6A 4G2EA 5IPGA 1EL5A 1THOA 2HXKA 2RUFA 1F3AA 3GHAA 5HHFA 3TKSE 5HR3A 3NHOX 4DGKA 5EY6A 4K8MA 3D8XA 3M0OA 1AQWA 2CAIA 4L5LA 1GSNA 1T3BA 3CNTA 1O8XA 1U88A 2BCGG 1TI3A 5GRTA 1ELIA 2MMAA 4B65A 3F8RA 2PU9C 3D6IA 4IS0A 4O32A 3KTBA 3AEEA 4X0XA 3F63A 3UIWA 1D7YA 4ADWA 3E1TA 4U8OA 4ZL7A 1OJDA 4H4QA 3IR4A 3LJRA 5IOWA 2VIMA 5F07A 3T37A 3N9JA 2YLSA 3NLCA 1PHHA 2UZZA 1GETA 4KAEA 5DVBA 2CV4A 1L9EA 5EVOA 2B9WA 4L5OA 1MOKA 1IUSA 1K0AA 4H4WA 2H0IA 3K7MX 2GAGB 4EE0A 1CL0A 1SD8A 2LKUA 5DQSA 3VI5A 3HJMA 3FR6A 2X8HA 3CTYA 1S3DA 4BVYA 5IMFA 5J9CA 1FB0A 5ECIB 2NPXA 1Q4JA 2B7KA 2XVJA 1HQOA 4A65A 4YSYA 4WR5A 1IYHA 2YANA 3E3EA 3CNPA 2G2QA 1PN0A 5FWGA 3VWVA 2O7KA 3NGCX 1KF6A 3DGHA 1BQ7A 5BULA 3OC4A 1SKRB 1YKCA 3ZTLA 3HHVA 2GQFA 3RHCA 2VRMA 2IVDA 4Z43A 3H93A 1S2QA 1JHBA 2H30A 2CVJA 1DE1A 2H6YA 3TKRA 1EP8A 1YQ4A 1BX9A 4I5QA 1OC8A 1GRXA 4PQ1A 4U8JA 4WF4A 3FK8A 2X3NA 2FCHA 1MD4A 1XDIA 4YQUA 1NENA 2B1LA 4ZBDA 1TW9A 5F06A 5ABRA 3CPJG 4HOJA 3AEAA 1SJZA 3EC3A 3HDCA 2FNOA 4V1Ap 3FKFA 1T7PB 18GSA 3CRUA 4IBPA 2XVEA 2BTOT 2WP9A 3REDA 4EM3A 4K6XA 4EKZA 3IOSA 2QGVA 3AE2A 4H7UA 3C8EA 1LU4A 4I6XA 4TVEA 2IN3A 2R5GA 3CTGA 3O0HA 1ON4A 3IV4A 3PGTA 3Q74A 2H72A 1R5PA 5DBJA 3V3NA 2OA1A 1CQHA 2V61A 1HD2A 2YOIA 4PNGA 4Y4LA 4IVOB 4JEDA 5EB5A 1GXFA 3LG6A 5ECLB 2FGXA 3IE3A 2OE3A 3KLJA 2L4QA 3VURA 5A5KA 2RABA 2R4EA 4ZILA 5KVIA 1CBOA 2ZBWA 3UOZA 3AYIA 4H4UA 2XFNA 1LQTA 3RP6A 3TRXA 5IM9A 16GSA 2GQLA 3L9UA 4K5SA 4YT0A 2B7SA 1O94A 2I3YA 5EL8A 1ZX9A 3ZMLA 4XWRA 4UDPA 2P31A 1XBSA 4K1FA 1O6JA 3CGEA 2B3SA 1SK1A 3CPIG 4O5QA 3D22A 1SJIA 2MMOA 1WWJA 2YPMA 1ZOYA 2GMJA 4TR0A 1Y25A 2WBAA 5HYMA 1B4VA 4D73A 4NPBA 1DJNA 2JB2A 2BK3A 3D4TA 3COXA 4XHMA 4YH2A 4LU6A 2DIZA 4RSLA 4Y4NA 1XOAA 5JWRB 3RP8A 4B63A 2WCIA 2WFCA 2C0EA 4ECJA 2GMHA 4K9ZA 2JADA 2E4GA 4TRXA 2WDQA 2PGTA 1RYIA 4OCEA 2VOCA 3P4PA 4A9WA 4U8KA 1YEXA 1TP9A 4EC0A 3KMOA 4XWZA 1U3IA 4XS1A 2L6DA 1FB6A 1GTHA 2YQUA 1ZZYA 1ZYQB 4PABA 2GLRA 4M52A 3EE2A 4QQ7A 1I9DA 3TKQA 1FHEA 1QQ2A 2REMA 3VWXA 3AB1A 1W4XA 2MYGA 3VWWA 1ACVA 4TR4A 1FVJA 5ECKB 4BPYA 2APGA 2F9SA 10GSA 4EMWA 5KWFA 3HA9A 2W0HA 3H4KA 1PS9A 2GEWA 3D21A 1TRSA 3FW2A 2O8VB 1AW9A 5E59A 3QPMA 1DOBA 3K30A 3V76A 1THXA 3L9SA 2OJLA 1BG5A 1KNPA 2Q0KA 1PBEA 2I4AA 5FMHA 2C67A 5KN0A 4WCTA 3NTDA 2BXSA 3UOVA 1H81A 1RSGA 1BF3A 2L6CA 2C64A 1S3AA 1AUCA 1TTZA 3NN6X 1OJAA 1EV9A 3TKSC 1A2JA 2OACA 2B7RA 3VRAA 2B5XA 4OWYA 1ERVA 4YTMA 3I6DA 4V2NA 3IHGA 4EMJA 1PA3A 3AY8A 3FBSA 4D73B 2LS5A 3WGEA 1TOFA 2X64A 2NVKX 2LJRA 5J41A 2C4JA 3QVPA 4EL1A 1OE7A 3QD9A 4AJ6A 3ZRDA 3RNMA 3UMAA 3ZITA 3ZFBA 1F8WA 1OJ9A 5A4VA 5A4UA 4J31A 1GRGA 1UN2A 1YEPA 4J34A 2R9ZA 4HDEA 1REOA 2LJKA 3L9VA 4B64A 1EP7A 1JRZA 1SEZA 4I59A 4HQZA 4D03A 1ZK7A 1NSWA 4O92A 4APNA 1EZKA 1K0BA 5AISA 3QSMA 4YQMA 4N9XA 1GP1A 4Z2UA 2DMLA 3V1WA 1GSDA 3FR9A 3P4QA 4OO4A 1GPEA 3TCOA 1L9DA 2MMNA 2GQKA 3CGCA 5EPFA 4AT0A 2DJJA 1OKTA 2CULA 1KTEA 3L4NA 2CVBA 3EYTA 1QXHA 3I69A 2P5RA 3P90A 3GH6A 1Y56A 4Q5QA 4FK1A 2EIOA 4EQRA 4NV2A 2IWTA 1XCCA 1KSSA 5B8AA 5HR1A 5JCKA 4MZBA 19GSA 2V2GA 4QL7A 2XLPA 1WP0A 1GUKA 1X5EA 1PKWA 3BI4A 3DMEA 3KMNA 3AEDA 2BS4A 2GS3A 1X5CA 1K3YA 5CP1A 4TM0A 4B69A 2DSAA 3IK9A 2WULA 3VR8A 2GV8A 2YLZA 2LSTA 4U2TA 4AP1A 4HU9A 1G7OA 4L8EA 3Q6OA 3F4SA 5HFIA 3JCML 3ZYWA 2AAQA 1VF2A 1F3BA 5B7CA 1V9WA 5INYA 4IA6A 2R0CA 2X8CA 2JSZA 4K0NA 4TM1A 3SWLA 2DJKA 4J36A 2JB3A 1R7HA 2WB9A 5M10A 4RG3A 2YV7A 4P3YB 3HVSA 2L5LA 1GH2A 1JNZA 3QFAA 3IPZA 4V2MA 1O8WA 3HVXA 5CNWA 3GSTA 3IRAA 4IVMB 5L46A 2LRTA 4H2PA 3HJOA 2XFQA 1JZWA 4CNJA 3F8UA 2GQWA 4FH8A 2DJ0A 4KCAA 4X9MA 1M9BA 3KD9A 1Z7RA 2WETA 1Y56B 3AD8B 1G6YA 2P0GA 2H19A 3G9BA 2LJAA 2GAHB 2Q6UA 3GRXA 4MK3A 3HJPA 4YSZA 2VQ7A 4AGSA 5ID2B 4AOSA 2DJ1A 2VCXA 4ECBA 1BAYA 4N30A 2ARDA 3UARA 4OFNA 4GXZA 3ALMA 1K4QA 4GDEA 1FW1A 3IC9A 3LORA 5CYYA 5KOWA 1T4YA 4NEWA 3H8LA 1B8SA 2LRNA 4EMIA 2XC2A 3TJKA 3MAKA 3ED3A 4ZB9A 3UCLA 4AOXA 1SL2B 1XWKA 2LV3A 2H0GA 1WRYA 1VF1A 1GRBA 1PMTA 3UKAA 2LTKA 5HFGA 4OVIA 4X9NA 4L0UA 1SKSB 3AEBA 1GUMA 4RUVA 4MABA 3UP5A 2JU5A 3M9JA 2HRNA 4MA9A 4ZIJA 3TOUA 3F3RA 1GNWA 4LLRA 3LZWA 3ERWA 5G2ZA 2NDOA 4GTUA 3ZREA 1E6BA 4RI7A 2YP6A 4N10A 5IPYA 2IMEA 4IVFA 2YLRA 2R4JA 1EBDA 2C80A 2AB6A 1JEHA 4POBA 3CSJA 5AN1A 4DSSA 3TRQA 2V41A 1ZKQA 1O73A 2E2MA 1YF1A 4MLYA 5KN2A 1O95A 2VCQA 4EQXA 3LEFA 4GUVA 4U2SA 2LQQA 3TGZA 2VZ2A 4I2TA 5B6MA 1MTCA 1OAZA 5AGYA 1YQ1A 4F2IA 4WX1A 5CRWA 1GLQA 2XHFA 3ZDNA 1HYUA 2ZZ0A 4H4YA 2JL4A 2OKAA 4KDYA 3HXSA 2VOUA 2OBKA 3QAWA 2FUG2 1M0UA 3GD4A 3I9V2 3K7QX 2AQJA 2H66A 5ECNB 2JK6A 4MPGA 4C3YA 5LCZA 4MF5A 4REKA 6GSSA 4LL4B 3RHBA 2XLRA 3GKMA 3TRPA 2YWLA 4WKWA 2WGRA 1K0LA 1XVQA 4TKYA 3GIXA 1GTBA 4OCGA 2V5ZA 1TDIA 4WXTA 3QAGA 3DD3A 2XBQA 3UVHA 1XW9A 1JLVA 1V2AA 2VL9A 3FY7A 3R2QA 1PGTA 1USBA 1MXTA 4Z24A 2F8AA 2EC4A 3R9UA 1FO5A 1PJ6A 1N4VA 2K8VA 1PRXA 5ECPB 3UEMA 4PAAA 3KGKA 4JNQA 4IV9A 1NHSA 2XLTA 1T00A 1WMJA 12GSA 1AIUA 3JSKA 4OPUA 1JZOA 3GKNA 1G0TA 2VCVA 1GRAA 3GD3A 3GV1A 4F9ZA 4FYCA 4DSSB 1EGRA 1F8SA 4FYUA 1TRVA 2B6MA 2M80A 1IJHA 4H4SA 1F2EA 2WESA 5KEJA 3A3TA 1QGVA 1CC4A 4LMWA 1FOVA 2YG6A 1F6MA 1EEMA 2RGHA 5DCHA 4ZB8A 4OD7A 3NT6A 2XPDA 2YM1A 1MDJA 1SK2A 4JQ9A 1NHRA 1GSYA 3P9UA 1FOHA 1NW2A 6GSYA 3A2WA 1PQNA 5F8BA 4HU7A 3W8JA 5G5EA 2A2RA 4IQAA 3UKFA 1W4VA 1PN9A 2X50A 2WOIA 3O76A 1Q1RA 4KA0A 1MD3A 2YJHA 1NHYA 1H82A 1A0FA 3GFKA 3QJ4A 4ECIA 4CY8A 3BCKA 4RG4A 5IMVA 1RK4A 1KDGA 5FS8A 1GRFA 2VAFA 4PGTA 2TRCP 3M9KA 5IOXA 1YJ6A 4DSRA 2WP5A 4QL9A 5HR2A 5IQYA 2FA4A 2GF3A 2WPCA 4BA7A 1CJ3A 3CNSA 3KPFA 3AYLA 17GSA 3HVVA 3G7YA 1COYA 5GSSA 4TN8A 4F0BA 2CZ2A 1E1KA 4HUAA 1LJ1A 3QDNA 4O7HA 9GSSA 4XIHA 3J7Yb 5A4WA 3VQRA 1T4ZA 2OLNA 1JNRA 2CQ9A 2AR8A 5GZZB 4POMA 2E7PA 4H86A 3C96A 4I8BA 4EF0A 2XCGA 1U3AA 5CREA 3F8PA 4UP3A 1H83A 2JB1A 1M2BA 2IMFA 3LFLA 3DA1A 4AP3A 2K8SA 4ZL8A 3NYFA 4MH3A 5IO0A 3GSIA 4PUAA 4ACSA 2QCUA 3OZ2A 2Q0LA 2R37A 4ML6A 5GAPD 2C75A 3LB8A 5JCMA 4GDPA 2QKEA 2GSTA 4OFMA 4WBRD 3M3MA 1LJRA 6GSUA 4FO5A 2CDUA 1TYPA 4TM3A 3M0FA 3EVIA 2YNXA 2A8XA 2VCTA 3D1CA 4Z7XA 1U6TA 5C3JA 4PQIA 3UTHA 3DJDA 1BYEA 4OPCA 3EAOA 3L78A 1UKVG 1TDKA 1K3LA 2ON5A 2XDOA 4IN0A 4I58A 3WE0A 2YM2A 1Q9IA 2JACA 2YLXA 2BK5A 5DBQA 2FJBA 5JCNA 1Z6LA 2C3CA 4Z26A 2EQ6A 2VVLG 3UBLA 3EMPA 5FS7A 3FG2P 1GULA 1YY7A 3W8SA 4LL1B 2PPTA 1F8RA 2ZZCA 1PXCA 3Q18A 4J57A 1LBKA 3QFBA 3VLNA 1X31B 3ISOA 2K9FA 3EMXA 4PXOA 3GX0A 1PBCA 2L59A 5FT3A 3CGDA 3KCMA 1VRQB 2QA2A 4GRTA 4KGIA 1S2YA 2JBVA 2V1MA 3GSSA 3EINA 3ZFLA 1D4EA 4TLZA 3GDPA 4C74A 1NG3A 2H01A 2GVPA 4GSSA 4NZHA 4YTNA 4TXVA 3CGBA 2A87A 2C3TA 3SFDA 2IL3A 2H75A 3O3TA 4G19A 2PUKC 4DSHA 1K0NA 3C73A 3GYIA 4TW5A 2CT6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1ERU A;  1ABA A;  3VWU A;  4KX6 A;  2C3Q A;  5JRB A;  1X0R A;  2FY6 A;  3DJE A;  4KSM A;  3ZVJ A;  4Q5R A;  5KOX A;  4E6M A;  3JVA A;  1R26 A;  1O85 A;  2V6O A;  5CRH A;  1GLP A;  5EOW A;  2B5E A;  3TKP A;  5CRD A;  3HPF A;  4E8E A;  2OE1 A;  5C2T A;  2V6K A;  1H84 A;  1EEJ A;  3GKX A;  3GL3 A;  4A6N A;  4ZBA A;  2OKT A;  2DBC A;  2R0P A;  1WIK A;  8GSS A;  1RQM A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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