4LC6A

Crystal structure of the mutant h128q of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor bmp
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
222
structure length
222
Chain Sequence
DVMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSQPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLLNP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Crystal structure of the mutant H128Q of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor BMP
rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 85
structure length 222
sequence length 222
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2013-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lc6A00
1KFEA 5DY3A 4ADTA 5G2WA 3FOKA 2CZFA 1FQ0A 2OT0A 4O19A 3WFAA 2Y7FA 1TPWA 3CPRA 3R12A 3WK1A 1P4CA 2QJGA 4UTTC 4ZQNA 3W72A 2AGKA 4IQLA 1WQ5A 2NUXA 2QCEA 3PUOA 3HF3A 1JCNA 2ZZ4A 3B0UX 3BK0A 1F5ZA 4Y6GA 5AC8A 4Y90A 3ZR4A 1L6YA 3H54A 4NJHA 3IIVA 3W2KA 1XBYA 3BO9A 4N6FA 3U2OA 4R7JA 5D33A 5FF3A 2ZZ3A 3CT7A 5E1QA 5L6UA 4WY0F 3NQGA 1OYAA 1O5KA 3LV6A 4UIOA 1FWSA 4UMCA 2F7FA 2C3ZA 4WUIA 3S8HA 1WDWA 3MHGA 2ZTKA 1RQBA 4OU1A 2Z2UA 1VGAA 2VFEA 1KBIA 3LBCA 3VKJA 3NQDA 3C2FA 1KTNA 4CNNA 4UNLA 4OBTA 3WJWA 1JJKA 3IGUA 3WJYA 3LXCA 4QAIA 3USBA 4Z1DA 3TW6A 5CSRA 3MYOA 4IX0A 3W1UA 5FEWA 3PG8A 4FNSA 5LNWA 1HO4A 3S1UA 2DORA 4O54A 1T8XA 1OJXA 3M6YA 3TXVA 1KM6A 3SZ8A 5AYZA 2W79A 5ABTA 4CNPA 3C0JA 1M6JA 3S9YA 3BW4A 5G1TA 4CCCA 1VLIA 1G4PA 3W2MA 1C8VA 4C1LA 5BW6A 2ZRUA 3GDMA 1R47A 3EX4A 3PS7A 3S5ZA 3W2JA 1QCWA 1LBLA 1Q6LA 1FDYA 1P1XA 4HNVA 4W9TA 1FCBA 1EP3A 5KMYA 3S1WA 3MI2A 4WXZA 3DI0A 3W7QA 3THAA 2CLFA 3FKRA 3O1NA 1ICPA 2HTMA 2Q3RA 3A24A 1KV8A 2A2IA 5AHEA 1GJPA 3TH6A 4S2CA 4IPIA 4O28A 4IGHA 3W23A 1UB3A 2ISVA 1PCWA 3P74A 4BI5A 4IJBA 4P61A 3SGZA 2Y7GA 3W71A 5EBUA 2QDHA 2DZPA 4N4PA 2FLIA 2ZZ6A 3KRUA 4JDYA 1B57A 1VYRA 4K39A 3C4UA 5EMUA 3GAYA 1JVNA 4M7TA 1MXSA 5K4XA 2O7SA 1RZMA 3W07A 3P61A 3CLMA 3U6WA 3BLEA 5DN1A 2WSYA 4HSNA 2B7OA 3SR7A 5CPMA 2NXGA 1XBZA 4WX2A 3CWNA 5HJLA 3FA5A 1SO3A 1LBFA 3A5FA 1J5TA 1W54A 4XWUA 2OT1A 1QOPA 4X22A 5J5DA 3M16A 3QRHA 4O1BA 1GG1A 3UWYA 5D2TA 5AB3A 1W5QA 3W7JA 3O6CA 4MZYA 4M6PA 2QCNA 2QAPA 1EP1A 2ZBTA 5FEZA 1YYAA 2E5BA 3E49A 3W1RA 5KINA 1C29A 2QR6A 2BSLA 4DPPA 5K3VA 4HHPA 3STGA 2QCHA 2EPHA 4FX6M 1DOSA 4E38A 4G1KA 1QDSA 1FCUA 2ZTJA 3QMSA 4HNTA 3G0SA 1TIMA 3KVJA 3P8JA 3LCWA 3VE7A 3DHDA 1KM5A 2H3BA 5AC6A 3HG3A 1WAUA 5BMXA 1HTIA 3G0UA 1TQXA 2JGQA 3LI1A 4AHOA 5A5WA 2NX9A 3NPWA 1YPFA 1HG3A 1SSDA 1QO5A 5FF2A 1D9EA 3TQVA 4E0CA 2JKAA 5BOOA 1JQVA 3W2UA 3SY5A 4FIRA 3BG9A 3WK0A 1LP6A 3TW7A 1O94A 3W1QA 3L5MA 2B7QA 4JTHA 3LGEA 2BXVA 4MKNA 1A5SA 3NZ1A 3LCFA 5D09A 1OFQA 5G1YA 2V81A 1TJPA 1WV2A 4LS0A 5F2IA 1KBJA 2IQTA 1JCMP 2B7NA 3P7YA 3TQKA 3TE9A 3O16A 3DENA 2RDTA 2VFDA 1GQNA 1IF2A 3NL2A 4LVFA 4OV9A 3TC6A 1TTJA 3MBFA 2FPYA 1KM1A 1LLWA 2ZA3A 2A0NA 2RKXA 3L65A 4K37A 4MFDA 3OA3A 4JTTA 4UTTA 3QQ0A 1DQWA 4DO5A 3HIJA 6TIMA 3LCXA 1SSGA 4N9DA 1VZWA 2A6NA 5I3GA 4WOQA 1OX4A 2ZFAA 2VKZG 2QKFA 3EB2A 1V5XA 4EF9A 1JRBA 1QMLA 3KVMA 3EX3A 3G1HA 1I2RA 1AW2A 4MZ8A 4PCFA 1A5AA 5LGXA 2FPTA 4FNUA 2D73A 3QEZA 4LC6A 1SQ7A 1B4EA 3IRDA 2EGZA 1R2TA 1JR1A 2A21A 5C2XA 3LTPA 4O8RA 3IGXA 2GQ8A 1K8XA 4MJMA 3TFXA 2QCMA 3HPZA 1Q6OA 3Q37A 2C16A 4A3UA 4FHAA 2H3DA 1I4NA 3S5OA 4O10A 5IBXC 1TPVA 1H5YA 3B0PA 1TTQA 1H63A 4GRSA 4HKPA 4UTIA 3VE9A 2RHGA 2QDGA 4RLIA 4PH6A 5F1VA 4JDBA 3TV8A 2Y88A 4RX0A 3W1LA 2VEIA 2CWNA 4LRSA 3OIXA 4ALDA 5LHEA 2WV8A 4MUZA 4O4VA 1F2JA 3LRLA 1PCKA 4ICNA 4FIQA 4H6KA 4PA8A 5K2ZA 3GX9A 1VQTA 1VRDA 3W7EA 5D02A 3TX9A 1PIIA 3G1SA 3PB2A 1S5WA 4I9AA 3UXAA 1FX6A 1XUZA 4HPJA 5AHMA 2WKJA 1SU5A 4JY8A 4JTLA 3CQ0A 3LV5A 2Y62A 5HINA 1TMHA 1KTCA 3BPWA 2R8WA 5LKYA 4BFAA 3M1ZA 5DCDA 1WXJA 3S6DA 4WY0A 2ZRXA 2H8ZA 5LNUA 2QUVA 1EUAA 5HNRA 1L9WA 1MEHA 3TMQA 4ZQCA 3TR2A 3ANYA 3PM6A 2Y61A 1H7WA 4DO4A 1UJPA 3ATYA 3DKLA 4MY9A 4AF0A 3TSDA 1AL7A 4P2VA 3F1QA 2WNNA 5D2VA 3N2XA 2CZEA 4NZFA 5AHFA 4FX8A 3DBPA 1QOQA 5EL1A 4M19A 4QM1A 3W73A 1LLZA 2E1DA 3NYZA 4POCA 4BWLC 4UFIA 1YPIA 1S5TA 1L6SA 1IXPA 1WBJA 4RR4A 5F4XA 3NQ6A 1UUMA 1P0KA 1H1ZA 1PHQA 2BZNA 4FNQA 1QPQA 3QF0A 1ML1A 1O95A 2WQPA 2ZQ0A 3LCHA 2DZWA 1GYNA 4K38A 3VCRA 4BK9A 4DF2A 4WXYA 2YXGA 4UFJA 3IEBA 3DI1A 3DFQA 4XTIA 3GZ3A 4CLMA 2TYSA 1OABA 3M5XA 3T44A 3I7RA 4GUGA 2ALDA 2V9DA 4Q33A 4IWWA 3BLFA 3R8RA 1F6PA 2I1OA 2ZDRA 3PSWA 1AW5A 5DY2A 1H50A 4GJ1A 2EAWA 4AXKA 4O15A 4PODA 4M6QA 4PC8A 2QCCA 4QQ3A 5FF0A 3L66A 3PBUA 4LW7A 1LYXA 5CPLA 3DFNA 4HN4A 4HIBA 1WOBA 3O07A 3W7IA 4WD0A 5D2WA 4AWUA 3P60A 3LB0A 4JR5A 3ZWSA 2YFOA 4N9BA 1DORA 2E68A 2CU0A 3TAOA 4ML9A 4UTLA 3C61A 4IUOA 1DV7A 5CPOA 1DQXA 4MY8A 4KFOA 3T7VA 1W1ZA 3HG4A 4UXDA 4O11A 6ALDA 1JQXA 4MIMA 2LLEA 1LDCA 5IM51 3BG3A 2NX3A 1AMKA 4ZQMA 1TTPA 5LHFA 1JUBA 4RXGA 3GLCA 4QNWA 1SR9A 5EPDA 4O57A 1YLVA 5TIMA 1FCVA 3PUEA 1NAL1 2Q8LA 4DEFA 2WO5A 3O8AA 1BWKA 1K03A 3W76A 5LNSA 1NFBA 2YSWA 4CQ8A 1XXXA 2ATSA 1H1YA 5FESA 5EKYA 2A1YA 1VCVA 3R5EA 3PBWA 2JKPA 2DZSA 2BTMA 2ZRWA 4JD4A 2HS6A 4LVBA 2YW4A 4LRTA 2G97A 1LORA 4ZQOA 3GDTA 5EYWA 5HUOA 3C52A 3GVGA 4BI6A 3N73A 4IMDA 3NAVA 4Q4KA 4JS3A 2C6QA 1CW2A 1TPB1 1IXOA 2W0UA 3BV4A 3C3NA 1FXPA 3TC7A 3EXTA 4O12A 1XKYA 4JTIA 2VFFA 4O52A 4Z08A 3EXRA 3I7QA 2V8ZA 3G22A 1KLZA 3M5VA 1TREA 3UWVA 1VHNA 2NXIA 2G5WA 3IV3A 4ZL1A 3P80A 5LGZA 2NWSA 5D30A 1K3UA 2W6RA 2X16A 4FX7A 3RLVA 4MLJA 2AQWA 4OWGA 1W5NA 1TYGA 2QUTA 1TCDA 4XQ6A 2VFGA 2KZHA 4N4QA 3HGOA 1OX4B 1T0OA 3G1YA 3CEPA 1VYSX 5CZ0A 4TIMA 3EX2A 1RQEA 5AN7A 1G6CA 4NU7A 4JXCA 1W8SA 3M0ZA 3TAKA 3HPSA 1F6KA 1GVFA 5DELA 1JRCA 5DXYA 3V1PA 5FEPA 1WX0A 1ICQA 1AL8A 3BW3A 1UCWA 4OGZA 1SO4A 3IVTA 1GTEA 2ZYFA 3NA8A 3QM3A 3UWQA 4UR8A 3NQCA 2E5DA 3UQNA 1TPC1 3B4UA 3OVQA 3SSJA 1YXYA 4LNYA 1OFAA 2C1HA 4A29A 3LI0A 4O14A 3W1NA 4LOCA 3PR2A 3BW2A 1MZHA 3O63A 2V30A 1CX9A 3DFSA 1HL2A 5FI8A 5IBXA 1FDZA 3GDKA 3L2IA 1ONRA 3KOFA 3QQ1A 1F7BA 3M7WA 1OK4A 1J4EA 1NF7A 4YWIA 2ZA1A 4XTDA 4R34A 5AHLA 4Z1CA 2A7NA 2X1RA 2J88A 3L21A 3E12A 4JN6A 2JBMA 3UPBA 4DXVA 1K02A 2E6DA 1XL9A 1O5XA 4Q32A 3GAKA 3N19B 3P84A 3QMTA 3G24A 4LTSA 1H60A 2GVLA 4LC8A 4HSOA 3DU0A 1W5OA 4M5PA 4MOZA 4UC5A 3P82A 4AHQA 3CU2A 3MI6A 3LRKA 5HR6A 1QPRA 2E77A 4EOUA 4WY0B 3LHTA 1SPQA 3PSVA 3NZRA 1XI3A 1EPXA 2EF9A 2V0TA 3GDLA 3PUDA 4PL2A 4IXHA 1M5WA 2J24A 4AF0B 3G8EA 3GR7A 3IIZA 4LVDA 4OHQA 3QH2A 2BX7A 3LHVA 1RV8A 3T78A 1UUOA 2QJHA 5LZLA 1BTMA 2YZRA 1KFLA 2HSAA 1H7PA 1Y0EA 3MUXA 1Q3NA 2Y6ZA 2WSRA 1PE1A 2NX1A 5HULA 1W5PA 1OX5A 4U28A 4XZ9A 3FEMA 4RZ4A 1SUXA 3DFPA 4AWSA 4BWLA 3NL5A 3OG3A 2QUUA 3D0CA 4EVZA 1I8JA 1ZAHA 1L2UA 3MWAA 3ZS4A 2ZZ7A 2YPIA 3A9IA 3LDVA 1R2RA 1R46A 4QNEA 5DBUA 3QZEA 1Z44A 1NSJA 3B03A 1G4TA 2FIQA 1TRDA 3FJLA 3DAQA 3PBVA 1DJNA 1BEUA 3O06A 4ADUA 4PL1A 2DJXA 4L4LA 1EWDA 1ZAIA 3V75A 4KWWA 4NQ1A 3SFKA 2X1SA 3TDFA 3CC1A 1OG0A 3T55A 1C9DA 3W3OA 3UWZA 5K7JA 5SWUA 3O15A 3HOJA 3W1PA 1DKWA 1S5VA 3G3DA 1Z48A 1ZALA 4NJKA 3W85A 4IMFA 1ME9A 2BWGA 4RV8A 4I7WA 3FFSA 2CFFA 4NJJA 4YMZA 4TX9A 1A5CA 3NL6A 2ZZ1A 3HGRA 3KRZA 3LHUA 2B4GA 2NWRA 3S5YA 3C2RA 1YDNA 5F2GA 4IMEA 1H61A 3O6YX 4JX5A 3W7OA 2X1UA 4MYXA 4ADSA 4FEZA 3IVUA 4K36A 2I9EA 1KM3A 3NPUA 3W1MA 4RKAA 5G2HA 4FB7A 3MW7A 3PG9A 1I2OA 3KFTA 3W88A 4AB4A 4WOZA 2TRSA 3N3MA 3K30A 4RK8A 3PY2A 1I2PA 1Z42A 2HS8A 3HGSA 1LBMA 4YCOA 1TV5A 4TU1A 1OF8A 1YXCA 2ABBA 4NXSA 4O0KA 1FWTA 1GVOA 5D32A 4LVAA 1H51A 2GOUA 2JGYA 3ABSA 1PL9A 4R53A 1H7OA 1W31A 3KAOA 2VEPA 1Q6QA 1G67A 2ZZ2A 3CIXA 3TK7A 2GVJA 5C54A 5DCBA 3UXDA 2A85A 3INPA 4UTKA 4TR9A 1R30A 3UYCA 2YYUA 3W7PA 3M5YA 1MSSA 2Z0IA 1DJQA 1F73A 4DELA 2PRHA 2E6FA 2C18A 4MJZA 1YTKA 3KVKA 1VH7A 3SECA 5G5IA 1XUUA 4UMAA 1KW1A 2GQ9A 3L67A 1IIHA 5EY5A 1LZOA 1Q45A 3BG5A 3L9CA 4QISA 4A2RA 5H2ZA 4Y9AA 3UNDA 2CLIA 5I3HA 2DZTA 3SI9A 4XBSA 2E6AA 1W56A 1RR2A 3LBMA 5AYYA 2DZUA 4LWWA 4YCPA 3ZWTA 4LS1A 2DU2A 1DHPA 1TO3A 4A22A 4ZQPA 1T99A 2Y85A 4AHPA 2ISSA 4GFSA 4CCEA 1I2QA 5AHIA 1OFOA 4JTSA 3M43A 4MLRA 3EKLA 1KLYA 2GQAA 1HUVA 3M44A 1IIGA 4MFEA 3GKAA 2DJLA 3GXPA 4ONVA 5D2XA 2ZZ5A 3GDRA 4NJIA 4ZQRA 4D2JA 3ABQA 3EWXA 4MPQA 4NNAA 3PAJA 3STEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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