4LC8A

Crystal structure of the mutant h128n of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor bmp
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
222
structure length
222
Chain Sequence
DVMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSNPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLLNP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Crystal structure of the mutant H128N of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor BMP
rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 84
structure length 222
sequence length 222
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2013-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lc8A00
5AHNA 3GXTA 4UTMA 3WJSA 3GK0A 1GG0A 1VLWA 4UCGA 3SI9A 3W1MA 4DF2A 5EA9A 4HPJA 1PIIA 1O5KA 1NAL1 4KWVA 4UFHA 1JULA 2FPYA 1TPEA 1PE1A 1ZJIA 1VCGA 2HSAA 3GNNA 4FXSA 4O4VA 2YW3A 2Y89A 1ONRA 2WSQA 2WNZA 3CEPA 3TXZA 4FIQA 3BG9A 4MPQA 5CPLA 1JJKA 4XBKA 5F2LA 4QIUA 1J2WA 3HPZA 3M7WA 3A23A 5CKSA 4ZMGA 1OFBA 3RU6A 4JD4A 1A53A 4CCDA 3LHTA 3LXBA 4E38A 4AF0A 4O10A 1W37A 3WFAA 4JTIA 3TAOA 3W1QA 2JKAA 4Q33A 4MLRA 2QUUA 1YTEA 2R94A 2GQAA 3IRDA 1XCFA 3C8FA 3VE9A 3W1NA 5F1UA 1ZAHA 3ATZA 1UUMA 1GTEA 5D05A 3M6YA 4QAIA 1KTBA 5DELA 2CLHA 4O1CA 3PM6A 2ZFAA 4GUIA 2A85A 2EKCA 4L4LA 4AH7A 5EMUA 3C6CA 3CM4A 2C1HA 5J5RA 2NX1A 1TPFA 2ABBA 4AF0B 3HQ1A 5HWJA 4GRSA 4JY9A 4EF9A 3QQ0A 2BSLA 4UC5A 4AHPA 5AYYA 3AO0A 3P84A 4P61A 1B9BA 2ZRWA 3C3NA 3GDTA 4HSNA 3TJLA 1YADA 5E1QA 3BLIA 5LGZA 3O16A 3BK0A 4ORIA 1OABA 3DKJA 1J4EA 1JUBA 1LBFA 2WNQA 2DJLA 1R46A 4RZ6A 2AGKA 1CX9A 3L0NA 3V75A 4WX2A 4UTTC 5CPNA 5EBUA 4YWIA 1RPXA 3UWUA 2UV8G 3F4WA 5KMYA 3BGGA 3KX6A 1IXQA 1NF0A 2B7NA 1HO4A 5D2WA 5G4EA 3RNDA 1AMKA 2XFWA 1XBZA 2H8XA 1SQ7A 1ICPA 4AHQA 4IOTA 4N02A 3P82A 4CCEA 1OK4A 1FQ0A 1W5NA 2TRSA 3E96A 3S5OA 5FF4A 3WK1A 3TK7A 1KFBA 4S2CA 2LLEA 4OQVA 2Y88A 4MYXA 3W6YA 4BI5A 2Y6ZA 3SECA 3W1LA 4WUIA 4A3UA 4C1KA 2ZZ1A 3M5VA 3C2RA 3NXFA 3R12A 3V1PA 1TV5A 3LXCA 3NL6A 3DXIA 3NQVA 1C8VA 3GKAA 1LCOA 4N4PA 4M6PA 3IIXA 5G4WA 2NX3A 4UR8A 3STFA 5CGQA 3QYQA 5LNSA 4LVGA 4TMCA 4OV4A 3YPIA 5D2VA 3W7KA 5KZDA 3LV6A 1Z42A 1H7XA 5AHLA 3FYPA 1QAPA 2JGYA 3GDMA 3IVUA 4O18A 4HSOA 1R47A 3HG2A 3L5MA 4JY8A 1JCJA 5D30A 1RV8A 2Z2UA 4IXXA 3R89A 1YDNA 2Y85A 3BV4A 4MUZA 3QF0A 2V5LA 2YXGA 3W1TA 2H3DA 1YTKA 4PA8A 4XZ9A 2YFNA 1FDZA 3NAVA 2BTMA 1JUEA 1K02A 1EPXA 2DP3A 1TPH1 4QSHA 3TROA 1KFJA 5CPOA 4AVFA 3CB8A 1IIGA 2WQPA 3L2IA 5CSRA 3G1AA 5DY3A 3W83A 3RMJA 2WNNA 3O07A 3STEA 3UZ5A 3N3MA 4K38A 1GWJA 2GJNA 3A9IA 1AW5A 3O6YX 2B4GA 4R53A 1IXNA 3HG5A 3LCHA 2EGZA 3OA3A 4MZYA 5K2ZA 4OGZA 3D0CA 3DFOA 1DKWA 2EF9A 3TQ0A 3W7EA 5D2YA 3G1HA 4UTWA 3PB0A 5L6UA 2ZBTA 1PL9A 1R2SA 2QCFA 4M6QA 3UY7A 3LB0A 2C0AA 2QCCA 2D73A 3A24A 3CWNA 3IVSA 3MI3A 4UTWC 4HT3A 1O94A 2J24A 2DZUA 5I3IA 1GYNA 1OFEA 2A0NA 3W7DA 1RQHA 3W87A 3O1NA 1WDWA 1RVGA 2Y61A 5G1TA 2DZVA 1XC4A 4N9DA 3HGSA 3DZ1A 4WOZA 1YLVA 3G3MA 4UTIA 5E0KA 4MY1A 3W7IA 4QISA 1DJQA 3NQAA 3CLMA 1RR2A 3W3OA 4IMGA 5F2GA 1B4KA 3LHVA 5AHEA 2QR6A 3C61A 5H2ZA 3LRKA 1PCKA 4LVFA 2CLOA 5U4NA 3DHFA 5AC7A 5FEPA 2GVJA 1XXXA 4Y9AA 3VE7A 1SFJA 3HGOA 2QCDA 1C29A 4I9AA 3C2VA 1N55A 2B7PA 3C2FA 3TSDA 2YGYA 2QF7A 3HJZA 1IXPA 1X7FA 2P10A 1QPNA 3L0GA 2OJPA 4JYDA 4DF1A 4YLWA 3HGJA 1JCMP 4O0KA 3KHJA 2VFDA 4PC8A 2PRMA 3EKLA 3W23A 1V5XA 1GVRA 3QRHA 1G4TA 1QFEA 4N6EA 1J5TA 3EX6A 4ZZ9A 5LHFA 1KFKA 3OHIA 5DN1A 4IPJA 2NXGA 2PC4A 1IGSA 3L67A 3W7LA 5F1VA 3TQKA 1IIHA 3BLEA 5TBOA 3B4UA 1EUAA 3TNOA 1HG3A 3NQ6A 4LC6A 1ADOA 3P62A 1BKSA 1LROA 1VPXA 3LTSA 4CNNA 4DQWA 2EPHA 1K7FA 4HN4A 2A5HA 1R2TA 1HL2A 1FWNA 5HMSA 1Q6LA 4EVZA 1U5JA 4UMAA 5D2TA 2YFOA 3TJXA 1FX6A 3GDRA 2CFFA 3SY5A 1N8FA 4Z1AA 4MFDA 5K4ZA 2J27A 4MJZA 3CT7A 3MBDA 5AHIA 5K9DA 1W0MA 3LRLA 3EX1A 3S8HA 2EHHA 1BWLA 1JUKA 4YCOA 4IMEA 2E09A 4IMDA 1LZOA 3BLFA 3S0CA 2EAWA 4MKNA 1KFCA 2A1YA 4X22A 1TJPA 2Y7GA 3QPZA 4TX9A 1NEYA 3MP5A 5CZ0A 3O05A 5BW6A 3IIOA 1PHQA 2BZNA 1K8ZA 1TTJA 3EB2A 2CZ5A 1UUOA 1H7RA 4JYFA 3I7RA 5AB3A 4WXYA 1OFQA 1G4EA 4XTDA 3S5NA 3FIGA 1T8XA 3P8JA 4S2BA 4JYEA 4EOUA 4FHAA 2A7RA 2H90A 3ABOA 3GLCA 3K30A 5AC8A 1FCBA 1TIMA 1OFRA 3DENA 3LERA 1VYSX 2DZTA 1O60A 4MYAA 4ALDA 3VCRA 3SR7A 3PSVA 2Z6IA 1GJPA 1RZMA 1VZWA 3P5ZA 2C16A 5G1YA 4AWSA 3BW4A 1YPFA 5FF7A 3M5ZA 2C18A 2QAPA 1QO5A 2H6RA 3PAJA 2YSWA 3DKLA 1Y0EA 3DI1A 3MP3A 3P5YA 3QMTA 4ML9A 3NQEA 4UFKA 3M41A 4NNBA 1P0NA 4O50A 1LORA 4JIPA 3KRUA 3ANYA 5U7SA 3BG5A 3FJLA 2G96A 5FF2A 1PHWA 1KBIA 2GPTA 1LOQA 3GKFA 4FNTA 1E51A 4PFMA 3QZEA 3PG9A 1GVSA 5D38A 3W7MA 4M7SA 2TSYA 3N34A 4S1FA 2F7FA 2WO5A 2NV2A 2X1SA 2NWRA 3C2EA 1GOXA 1WX0A 5C54A 1I2PA 1OX4A 4H3DA 3T40A 1K8XA 1BTMA 1H7NA 3EXSA 4MJMA 4PODA 5I3KA 2Y63A 1TRDA 1EA0A 3NQCA 1AL8A 1JCYA 4JTGA 5FEZA 4AAJA 3OIXA 2C14A 1P4CA 3USBA 2VFGA 2YCEA 2E6AA 1KFLA 4P2VA 4WOQA 3O06A 3KRSA 1UJPA 1M7PA 1LLWA 2WKJA 1F6PA 3C2OA 4K8HA 4BK9A 3G8EA 4QNWA 1K8YA 3QMRA 2QAFA 4ZQPA 3DFNA 1I4NA 3PBWA 2WSRA 3HG3A 3W7JA 4CQ9A 3T4CA 3AJXA 1I2RA 1W5PA 1N7KA 1OX6A 3DHDA 2CU0A 1OX4B 4JTSA 3H53A 4FNQA 2GJLA 4GC4A 4PCFA 3FKKA 1FCVA 3DFSA 1LRTA 1WV2A 5I3GA 4LOCA 5BMWA 3DBPA 2QCNA 1HFBA 3THAA 3E9AA 1YDVA 1QCWA 3P67A 3TKFA 4RXGA 5F2MA 4Q4KA 3NPWA 1VYRA 5L9FA 3S5YA 1GQNA 1TPUA 5EY5A 1VHCA 7TIMA 2VFHA 1A50A 4LS1A 4OBTA 1VC4A 4OHQA 3QSRA 1S3HA 1TJRA 5AC6A 3U6WA 3NOEA 3PBVA 3T7VA 4UFIA 1H7OA 3RF9A 4A29A 5KZMA 3NQGA 2ZA3A 2YYTA 1JRCA 1W56A 1TRIA 3W1PA 2VC6A 4O28A 1WQ5A 3GAKA 2ALDA 3RFAA 3OBKA 2DZWA 2W6RA 4UMCA 3HO8A 1ZAJA 1JQXA 3GYEA 1K03A 1TYGA 3B03A 2GOUA 4O53A 1GVQA 4RV8A 3PC0A 4JX4A 4GUJA 3MO7A 4IX2A 3P7YA 3ELFA 1DL3A 4PH6A 5F2IA 1FCUA 2YPIA 4M19A 2DZPA 3T78A 3IGUA 1G4SA 1OK6A 1EP3A 2FIQA 1JQVA 2CLLA 1JCLA 1KLYA 4I7VA 2VEKA 1YXDA 3STCA 1KFEA 2CLFA 4BF9A 3B8DA 3UWQA 3HF3A 5AYZA 2KZHA 4FX8A 1P5BA 1YTDA 1D3HA 4HPXA 4NXKA 1F2JA 3DGRA 3TW7A 5K4XA 2FTPA 1FWWA 2H3BA 3LCWA 2XN1A 4JR5A 1SZFA 3FJ6A 3ZWSA 4OV9A 3LBMA 1EWDA 3N73A 4KFPA 3TXVA 4JICA 2CWNA 3PUEA 3NR0A 3TMQA 4IGHA 1VR6A 4GFSA 2TPSA 1XDLA 3M16A 3GDLA 2YYUA 3CWOX 1NF7A 2A4AA 3MYOA 2FQIA 5BNKA 4UTTA 4E2BA 4JTKA 3E12A 1K7XA 4FNRA 2YX0A 5DBTA 2WPBA 3NDOA 5AN7A 3P60A 1ME8A 2X2GA 1WA3A 1TSIA 1KTNA 4NJJA 2E1DA 2XN0A 3QH2A 5AHMA 4N9EA 2RFGA 3DU0A 4IJBA 3GIYA 3B05A 3MBFA 1W3TA 3NZRA 4PTNA 4XWUA 2VEMA 1EWEA 4KFNA 2QJHA 4O57A 3QEZA 3LDVA 3LOTA 5SWUA 3LBCA 3KOFA 3LX9A 1EP1A 5GVJA 3S1XA 1R30A 1GVFA 2E5CA 4XQ6A 3QW4B 3N14A 3W1RA 1YDOA 1IF2A 1RQEA 3GNDA 1F74A 4O16A 5AFDA 4FIRA 5F4SA 1T99A 4RZ4A 2ZZ2A 3CEUA 3BARA 4K7VA 3L9CA 3WJXA 4MVAA 2FB3A 1LRQA 3W2LA 5G2WA 4ZQRA 2PURA 3HG4A 3LCLA 1I45A 3EWYA 1I2NA 3T55A 2B7OA 3R2GA 5AOUA 4XBSA 3NL2A 2A2IA 3EXRA 1KW1A 1SW7A 2ISSA 2F84A 3LM7A 4JTEA 3M44A 3NQMA 1YPIA 1GZGA 3G0XA 4HNVA 1OX5A 3C52A 3LTPA 1VRDA 1SZGA 3GX9A 3G8RA 3W2MA 2VELA 4J9JA 2AAMA 1G7VA 3G1VA 4TIMA 3MUXA 1W5OA 1BEUA 2FPTA 5J5DA 4JS3A 4UMBA 1LLZA 5D04C 2NWSA 1G4PA 3NL3A 2NXIA 2ZZ4A 1F6KA 1QOQA 2JBMA 1GT8A 2CZEA 3WJZA 3IVTA 4BR1A 4LRSA 3SFKA 2VEIA 3TH6A 3M43A 4WY0F 1L6YA 4TR9A 4NX5A 5DXYA 3QQ1A 2QEZA 2RDWA 4BWLC 2WJZA 3GB6A 1LBLA 3ZWTA 4O11A 2V2DA 4O52A 1TPB1 3I65A 2GVGA 3W2JA 4JTTA 1WOBA 3CHVA 3Q58A 3FLUA 3UD6A 2B0MA 5KTLA 3PVFA 3EEGA 2I1OA 3LCIA 4K8EA 2JKPA 2A7NA 3BW3A 2NUWA 3DAQA 5K9CA 1H63A 4HNNA 1W31A 3MP4A 1I8JA 3W1UA 3NL5A 2W79A 4DF0A 4GBUA 4JGDA 1ZALA 5G2HA 4JTHA 2X16A 3TE9A 1TV8A 1SUXA 5HWMA 1XBYA 4LY8A 1B57A 4LVDA 5EPDA 4A2RA 3LI0A 4LVAA 2CZFA 1H60A 4AEOA 3NPUA 2OMAA 3OVPA 3W7NA 3NNTA 2QCGA 5CZJA 1SW0A 2IQTA 1VJIA 3EXTA 1FWTA 3B0UX 2NUYA 3IIZA 1XI3A 4DO5A 2E77A 1F5ZA 3NA8A 4BFAA 1JCNA 3M5YA 3Q37A 2HMCA 1WAUA 4Z1BA 1TPWA 5LNRA 3N9SA 1Q3NA 2J88A 1TPDA 2V82A 3UWVA 4QJ1A 1JCXA 2FDSA 3EWWA 3EWZA 4UIOA 3LI1A 3W84A 1JVNA 2VFFA 5CSSA 3QFEA 4TMBA 1KBJA 5F4XA 3UXAA 1SFLA 4N9CA 2RDUA 4WXZA 2ZZ6A 3A5FA 3PY2A 3NZ1A 4M6VA 2CLEA 5DCDA 2RHGA 3G18A 1ML1A 2RKXA 2Y7DA 1M6JA 3KVLA 3TDFA 4UNKA 1W3IA 4CLMA 4NX0A 5DCEA 4RK8A 2E68A 3CQ0A 4LVBA 4RX0A 3STGA 5FESA 1I2OA 3WJWA 2GQ8A 4W9TA 5LNWA 1WYIA 1GVOA 5FEXA 1P1XA 1VQTA 1GG1A 2FJKA 1JR1A 5A5WA 6TIMA 1CW2A 3E0IA 2Y7EA 4DELA 4Q32A 1QDSA 3JR2A 3TQVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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