4LDEA

Structure of beta2 adrenoceptor bound to bi167107 and an engineered nanobody
Total Genus 175
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
175
sequence length
457
structure length
454
Chain Sequence
DAENLYFQGNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYAADEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKFALKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein/hydrolase
molecule keywords Lysozyme, Beta-2 adrenergic receptor
publication title Adrenaline-activated structure of beta 2-adrenoceptor stabilized by an engineered nanobody.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 175
structure length 454
sequence length 457
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ldeA01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4ldeA02
1C61A 1T8AA 1P64A 259LA 1CU0A 1CV4A 1M0MA 3OAXA 146LA 1L61A 2QPEB 196LA 2F47A 2R4SA 218LA 1PXSA 4TL3A 1CU5A 1C60A 1LYFA 1PQJA 3UZAA 1CU2A 3ZPQA 1L75A 2ZZLA 3C7YA 1QUDA 201LA 3OE0A 1F88A 159LA 3SBBC 3V2WA 1QKOA 1L12A 4LZMA 1VGOA 2F95A 5B2NA 1P56A 1ZURA 186LA 167LA 1L79A 1JFPA 242LA 3EH4B 1C6LA 3QJRB 4EIYA 5BR5A 1L48A 145LA 1JTNA 3NY8A 253LA 1KY1A 3DQBA 1L25A 1R2NA 2RB0X 2J4YA 5C1MA 1LGXA 3NS0A 5A8EA 1L65A 246LA 250LA 2B6YA 2QARC 2EI4A 4IB4A 1F4ZA 1L21A 120LA 1QTHA 3VGAA 1QTVA 1D3MA 1S8JA 109LA 4XXJA 3UTWA 4PXKA 2RB2X 5ITEA 1D9WA 1L28A 1L41A 4EXMA 2KSBA 5B35A 2JAGA 1OYUA 3FADA 130LA 170LA 1QS5A 2JAFA 3UTYA 3DKEX 1G0LA 1OVHA 2HUMA 3HT8A 1L07A 3VW7A 3HH4A 1BRDA 1KW7A 2KSAA 4I7LA 3AYNA 2BRDA 4I7QA 1ZWNA 4OO9A 4ARQB 4G7SB 4ARQA 108LA 4EKRA 1O0AA 2RBPA 3QBKA 4XT3A 152LA 3DMVA 4EA3A 1C6DA 2YCYA 3C81A 3DN8A 237LA 2LCBA 3UONA 4HYXA 4QRYA 1X0K1 5FJGA 178LA 2ZIYA 3QBLA 4KLYA 1L68A 2HULA 1Q5JA 4G7RB 3RFMA 1KY0A 144LA 233LA 1NHBA 2I20A 211LA 1L05A 2R4RA 262LA 2I21A 1SSYA 1L83A 1L98A 1L92A 1LGUA 3NYAA 1L9HA 2HPYA 1C8RA 1QT4A 1D3FA 4S0WA 4N4WA 3UZCA 150LA 1L73A 1L69A 1PQIA 176LA 1L33A 2B73A 2F2QA 1KGBA 261LA 1GZMA 1H2SA 1L11A 251LA 4QI1A 1LYDA 5H2NA 1L17A 163LA 3EH3B 1T8FA 4PJZA 1L0KA 3UTVA 1S8LA 122LA 129LA 3C8RA 4EPIA 3QDCA 5G54A 3OE6A 248LA 4WW3A 5G53A 3DMXA 2NTUA 1L93A 3C80A 128LA 252LA 2Z55A 2YCXA 2KSYA 160LA 1LI2A 161LA 2OEAX 3RUNA 4ARMA 3LZMA 1CV5A 1M0KA 1OV5A 1TLAA 2O4WA 243LA 4BEYA 1C69A 1QSQA 1L0JA 4I7SA 2O79A 1HZXA 1U19A 3ABWA 206LA 5H2KA 181LA 1P8HA 1QTCA 3ODUA 168LA 1L30A 2RBQA 3GUKA 1L37A 184LA 1CUPA 2YDOA 3PQRA 3VI0A 4I7JA 4BUOA 4DKLA 4BEZA 212LA 3HWLA 4EKSA 214LA 151LA 1L77A 1CV1A 3QAPA 1L86A 111LA 199LA 1K28A 1KW5A 1CV3A 2RBRA 4IAQA 256LA 1SWYA 2OTYX 225LA 3F8VA 182LA 4NC3A 4BV0A 2OTZX 2AT9A 2IGCA 241LA 4PK0A 3C7WA 3DNAA 2B6WA 2Y01A 4J4QA 2OE7X 5JJNA 156LA 175LA 5I14A 5KKHA 3K2RA 1L96A 3ZPRA 3QJUB 1SX2A 171LA 213LA 2B72A 2L78A 3NY9A 1M0LA 230LA 3COCA 4AMJA 1G1VA 1PY6A 2Q9EA 1CV6A 1AT9A 3HH6A 3QJQB 1BRXA 3C9MA 5G28A 1G1WA 3D4SA 4MBSA 1QS9A 4Y9HA 1TN5A 2RBOA 3RZEA 1L00A 191LA 1P36A 3HTDA 4LDLA 1C6PA 3HAQA 3DN1A 5G2CA 4XT1A 1L19A 3GULA 1F50A 1L99A 3P0GA 5J7AA 1L10A 258LA 3GUJA 1T8GA 4K5YA 3QBIA 3GUMA 1JGJA 1CV0A 1GU8A 1CWQA 3G3WA 147LA 5H2OA 172LA 127LA 1KNIA 1L84A 3SN6R 185LA 2Y04A 4IAPA 3HTBA 2NTGA 3HDEA 239LA 3CAPA 3KJ6A 4G71B 4W59A 1LN6A 1P6YA 1L55A 2F93A 1X0SA 2B6ZA 187LA 1QUOA 4I7RA 1CU6A 1IW6A 1JV6A 2YDVA 1L42A 4WAVA 1QSBA 3VVKA 119LA 113LA 5ITCA 3HAOA 2I35A 3QBGA 5B0WA 114LA 5AHYA 6LZMA 3A7KA 4MQTA 1C62A 2YCZA 1L71A 1L63A 4ARPA 1P8IA 3AM6A 4I7KA 1P3NA 215LA 1D2YA 2A4TA 1LWGA 4ZPUA 1L02A 4YXCA 1S54A 2O7AA 148LE 1DYGA 3DN0A 4I7NA 164LA 254LA 5H2HA 1QKPA 3X3BA 177LA 1L03A 3HU8A 1L97A 189LA 1B6IA 3F9LA 4G70B 3DN4A 2QPDB 4HWLA 1L27A 4W58A 104LA 137LA 1L94A 1E12A 1LYIA 3GUNA 2L6XA 5H2PA 4AQNA 1MGYA 1C63A 1CVKA 1LWKA 3OE9A 3HARA 1L09A 4HYJA 4GP4B 5B6ZA 1G0KA 2RAYX 1DYDA 1L22A 3DN3A 3QJSB 4AMIA 4JQ6A 1L34A 4I7TA 3HASA 1L08A 107LA 1UAZA 1ZYTA 1L26A 1QTZA 1L35A 112LA 2RAZX 5F8UA 3X3CA 205LA 1OVJA 222LA 2OE9X 165LA 4A4MA 3C8QA 247LA 4JR8A 220LA 1L66A 1L51A 1I6SA 1CU3A 3BVDB 1P37A 1KS3A 1CX7A 1L32A 3GUIA 1IXFA 5G2DA 3HDFA 1QUGA 1EHKB 1QTDA 4XTLA 4GYCA 1L45A 1XJIA 1L15A 1G07A 1SX7A 1L53A 3SB5A 197LA 173LA 103LA 2LNLA 232LA 1QHJA 1L31A 1D2WA 4GPOA 3CDVA 244LA 4G72B 1G06A 115LA 5A45A 2VT4A 4G7QB 4ARLA 1DYCA 1QT3A 3HUAA 4W51A 3C83A 2M3GA 3CDTA 1C6MA 1L13A 1Q5IA 1L18A 2NTWA 1L52A 1L89A 4JKVA 5ETZA 2OU9A 1TN0A 4L6RA 5DHGA 3UTXA 1L24A 4X32A 140LA 7LZMA 4FBZA 4GP8B 1L14A 1DYAA 1PQOA 257LA 1LI3A 4LDEA 3S3CB 157LA 1L88A 2OU0X 4W54A 1L16A 102LA 2G87A 141LA 1C6QA 5H2LA 1FBKA 123LA 4UG2A 1C6EA 2OU8A 4ARJA 5JJEA 5LZMA 192LA 149LA 3SB6A 1L46A 4MD2A 3GUPA 240LA 4X1HA 1L38A 1P46A 1C6GA 5AHZA 2PEDA 3SB8A 4OV0A 1L57A 1XJUA 1BRRA 1S52A 1LW9A 2YCWA 2B7XA 3OE8A 1G0PA 4YXAC 2B6TA 4GRVA 4DJHA 3CODA 125LA 1L95A 4GP5B 1LYHA 4W55A 1L29A 1P2RA 4FA7B 2B74A 2RH1A 3HT7A 236LA 4IARA 5H2MA 1GUEA 3PBLA 4EKPA 3C8SA 3PWHA 4KNFA 1L64A 1OVKA 1C6CA 1S53A 1L74A 1CUQA 3HANA 3HT9A 174LA 5TGZA 3HUKA 4LDOA 5A44A 1D3NA 3UG9A 1L36A 1L60A 2Q9DA 1L43A 3FI5A 1C6FA 5EN0A 4W56A 2RBSA 1QUHA 3C82A 1L87A 1L80A 3C7ZA 4EPFA 3SB9A 1C64A 1LYGA 1QTBA 2X72A 1G0GA 1SWZA 2LZMA 1OV7A 3PDSA 2F32A 4EKQA 3SBAA 1L58A 1KG8A 158LA 1QT6A 142LA 1L62A 3CDQA 3GUOA 238LA 3C9LA 1UCQA 221LA 1L70A 1DYBA 2B6XA 5DHHA 1OWZA 2HUKA 1CX6A 1C3WA 2RBNA 209LA 162LA 4MD1A 139LA 131LA 229LA 3G3XA 1C8SA 5H2JA 5DYSA 118LA 1L01A 1BM1A 1FBBA 1JQUA 3G3VA 5BR2A 3HTFA 1PQDA 1LGWA 4W57A 1L56A 231LA 1C6IA 180LA 5LWEA 1C6AA 1H68A 190LA 4L35A 5B6VA 200LA 235LA 1JV7A 3EMLA 1E0PA 3SB7A 5JJJA 260LA 1L90A 2ANVA 1AP9A 3QAKA 1DYEA 1T97A 1L67A 3S8FB 217LA 5B6YA 2I1XA 1CTWA 3CDOA 3EH5B 2WJKA 1L54A 2Y02A 1KG9A 3T45A 183LA 2Y00A 249LA 1QM8A 4MQSA 4XTOA 3CDRA 1XEPA 1PXRA 1G0JA 1LYJA 3HAPA 4X31A 1L04A 1L39A 1LLHA 166LA 1QT7A 1KMEA 5H2IA 4BWBA 5B6WA 198LA 1P7SA 1C6JA 4W53A 1L82A 224LA 1G0QA 3NSBA 1IW9A 2Y03A 2LC9A 1G0MA 5AWZA 226LA 3HUQA 2NTHA 1DZEA 3S8GB 3VG9A 2B75A 1L06A 5AZDA 4UHRA 4N4YB 1WTHA 155LA 1X0I1 3DN2A 4YX7C 234LA 3VHZA 227LA 5AX1A 228LA 1C6KA 3ZEVA 219LA 3V2YA 3HH5A 1P2LA 2WJLA 4QIDA 3S3DB 1R84A 1VJMA 4N6HA 5AX0A 2CUUA 245LA 1L23A 4EJ4A 210LA 1L91A 1DYFA 2B70A 138LA 3JR6A 1C6HA 188LA 1OWYA 2RB1X 2KS9A 223LA 1LPYA 4PXFA 2ZFEA 3DDLA 4FAAB 1L0MA 1LI6A 5B34A 1L72A 3DMZA 1L47A 3L2XA 1S51A 110LA 3S3BB 1L59A 4BVNA 1XJTA 143LA 1C65A 3HTGA 4W52A 4ARMB 1C67A 4DAJA 3AYMA 3FA0A 4GBRB 4GBRA 1C6TA 4I7OA 3REYA 5B6XA 126LA 3L64A 1QT8A 1EPYA 1C68A 1L50A 1L76A 1T6HA 1LYEA 2QB0B 1C66A 4FPDA 4E97A 3HT6A 4I7MA 5G36A 1L20A 1SSWA 4I7PA 3PXOA 2OE4X 255LA 2Z73A 4XTNA 3QJVB 1P5CA 3MBVA 3HU9A 195LA 2Z6BA 3WQJA 1C6NA 1L40A 1XMEB 1C6BA 1D3JA 5G2AA 1PQMA 169LA 216LA 1L81A 3QJTB 1JTMA 2ANXA 1L44A 1XIOA 3HH3A 1L49A 1PQKA 3DN6A 1P8UA 1L85A 1QT5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C61A 1T8AA 2YBLA 3QNGA 1M0MA 1L61A 196LA 4IATA 1IP4A 1LJ4A 3WL2A 1AT5A 1LKRA 1CU5A 1G7IC 1C60A 1PQJA 1LHJA 1UC0A 1CU2A 1QDTA 1IP2A 1VGOA 5APDA 3SBBC 4H92A 2F95A 3K3TA 186LA 2LZTA 1JFPA 3A91A 2F4GA 1C6LA 1YAPA 1HEOA 145LA 3NY8A 1RJCB 1BWJA 3GXKA 3N9CA 4ZIXA 4WM6A 3NS0A 3LZ2A 5HNLA 4LT2A 246LA 250LA 4IB4A 4GCBA 1UIAA 1QTHA 4TUNA 3VGAA 3UTWA 4NGIA 1F0WA 2RB2X 1OYUA 3WXUA 1LMOA 1BHZA 3UTYA 1G0LA 4B4IA 4CGEA 1BRDA 1L07A 3TXHA 2HECA 5C6JA 2KSAA 1BB3A 1REMA 1ZWNA 4ARQB 2ZILA 2CGIA 1LZYA 2RBPA 4HYXA 4H91A 4ZEEA 1L68A 1Q5JA 3RFMA 1YANA 233LA 4RLMA 1NBYC 3MGWA 2MEAA 1JJ3A 1GFTA 4NGOA 1L98A 1L92A 3NYAA 1L9HA 1QT4A 1D3FA 150LA 1L73A 176LA 1YAOA 5APCA 5KXLA 2PC2A 1JKCA 1LYDA 5LXWA 163LA 4YEMA 3EH3B 208LA 1YQVY 3UTVA 2Z37A 122LA 1IORA 1LHMA 2BQIA 3WU7A 3A90A 5DN5A 3ZVQA 3WW6A 160LA 1LI2A 2OEAX 4HTNA 1CV5A 2O4WA 1TLAA 1GEVA 2I6ZA 1LHHA 1C69A 2DQIY 2BLXA 1HZXA 3WMKA 1LJKA 3ODUA 2YDOA 1L37A 184LA 3PQRA 1SQ2L 1LMPA 1GB3A 4EKSA 214LA 1GE1A 2D4JA 5KKIA 225LA 3F8VA 4LFPA 3CQLA 4DC4A 4NFVA 1LYOA 3AGHA 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 5H2I A;  4BWB A;  5B6W A;  198L A;  1P7S A;  1C6J A;  4W53 A;  1L82 A;  224L A;  1G0Q A;  3NSB A;  1IW9 A;  2Y03 A;  2LC9 A;  1G0M A;  5AWZ A;  226L A;  3HUQ A;  2NTH A;  1DZE A;  3S8G B;  3VG9 A;  2B75 A;  1L06 A;  5AZD A;  4UHR A;  4N4Y B;  1WTH A;  155L A;  1X0I 1;  3DN2 A;  4YX7 C;  234L A;  3VHZ A;  227L A;  5AX1 A;  228L A;  1C6K A;  3ZEV A;  219L A;  3V2Y A;  3HH5 A;  1P2L A;  2WJL A;  4QID A;  3S3D B;  1R84 A;  1VJM A;  4N6H A;  5AX0 A;  2CUU A;  245L A;  1L23 A;  4EJ4 A;  210L A;  1L91 A;  1DYF A;  2B70 A;  138L A;  3JR6 A;  1C6H A;  188L A;  1OWY A;  2RB1 X;  2KS9 A;  223L A;  1LPY A;  4PXF A;  2ZFE A;  3DDL A;  4FAA B;  1L0M A;  1LI6 A;  5B34 A;  1L72 A;  3DMZ A;  1L47 A;  3L2X A;  1S51 A;  110L A;  3S3B B;  1L59 A;  4BVN A;  1XJT A;  143L A;  1C65 A;  3HTG A;  4W52 A;  4ARM B;  1C67 A;  4DAJ A;  3AYM A;  3FA0 A;  4GBR B;  4GBR A;  1C6T A;  4I7O A;  3REY A;  5B6X A;  126L A;  3L64 A;  1QT8 A;  1EPY A;  1C68 A;  1L50 A;  1L76 A;  1T6H A;  1LYE A;  2QB0 B;  1C66 A;  4FPD A;  4E97 A;  3HT6 A;  4I7M A;  5G36 A;  1L20 A;  1SSW A;  4I7P A;  3PXO A;  2OE4 X;  255L A;  2Z73 A;  4XTN A;  3QJV B;  1P5C A;  3MBV A;  3HU9 A;  195L A;  2Z6B A;  3WQJ A;  1C6N A;  1L40 A;  1XME B;  1C6B A;  1D3J A;  5G2A A;  1PQM A;  169L A;  216L A;  1L81 A;  3QJT B;  1JTM A;  2ANX A;  1L44 A;  1XIO A;  3HH3 A;  1L49 A;  1PQK A;  3DN6 A;  1P8U A;  1L85 A;  1QT5 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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