4LDLA

Structure of beta2 adrenoceptor bound to hydroxybenzylisoproterenol and an engineered nanobody
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
457
structure length
454
Chain Sequence
DAENLYFQGNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYAADEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKFALKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein/hydrolase
molecule keywords Lysozyme, Beta-2 adrenergic receptor
publication title Adrenaline-activated structure of beta 2-adrenoceptor stabilized by an engineered nanobody.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 166
structure length 454
sequence length 457
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ldlA01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4ldlA02
137LA 2B73A 1QT6A 3CDQA 1P3NA 2RBPA 2Z6BA 1C6KA 177LA 2JAFA 3RZEA 199LA 1L19A 3CDVA 181LA 3HU9A 248LA 3C7YA 256LA 1CU0A 1L34A 4EXMA 1G1WA 5JJEA 3HDEA 5H2PA 5B0WA 225LA 2X72A 5BR5A 1L05A 2NTGA 145LA 217LA 119LA 3OE8A 213LA 5H2IA 3UZAA 3S8FB 1CU6A 1C6JA 1O0AA 166LA 196LA 1VGOA 4FBZA 3EH3B 128LA 1DYDA 2B75A 224LA 5B6YA 155LA 1XIOA 2YDVA 3DNAA 5H2NA 3HH5A 1L97A 3FADA 2I1XA 2VT4A 3QBIA 5DYSA 2B74A 3QJVB 1L57A 1ZWNA 5BR2A 3HH6A 3UZCA 1L86A 1UAZA 1L77A 1L20A 1L60A 1OWYA 2O4WA 237LA 253LA 1D3MA 4I7NA 3HDFA 147LA 167LA 236LA 3K2RA 186LA 1PY6A 5KKHA 2QARC 223LA 3SB9A 2G87A 2J4YA 1F4ZA 1SX2A 1G0KA 2JAGA 1C68A 2LNLA 2QPDB 1PXSA 4GP4B 1L38A 2KS9A 1L04A 1OVKA 4LDOA 159LA 1QUGA 2ANVA 1QUHA 230LA 3DKEX 3QAKA 4LDLA 4HYJA 1F88A 3HTGA 5AZDA 1C6GA 4I7QA 1XJUA 4I7KA 4ARMB 1IXFA 1X0I1 5A44A 150LA 1P7SA 1L88A 3HAOA 3DDLA 3C8QA 1XMEB 3T45A 3ZPQA 1L17A 4GP8B 3ZEVA 2RB2X 1L74A 1M0KA 3SB5A 240LA 2OTYX 5H2LA 4BV0A 5AHZA 1LWGA 1CU3A 1L72A 4I7JA 5H2KA 1L96A 197LA 2QPEB 2KSYA 1L84A 4XTNA 2RB1X 3QBGA 1OYUA 3HUAA 4IAPA 3HASA 252LA 5DHGA 4MBSA 5B6ZA 1DYGA 1S53A 1T8AA 1L82A 1P46A 1MGYA 1C67A 2F32A 1L40A 103LA 130LA 4PK0A 1S52A 176LA 4LZMA 1CVKA 1C6HA 2RBRA 5G2CA 5ITEA 251LA 3S3BB 4I7PA 1SSWA 3C9MA 2HUKA 4NC3A 173LA 1E12A 2R4SA 2B70A 1H68A 2M3GA 229LA 4BWBA 1E0PA 3HT8A 2Z55A 1C6PA 3VW7A 258LA 1C63A 142LA 5AHYA 3EH4B 4KLYA 1L22A 1P64A 1L29A 3HT7A 1QKPA 165LA 5G28A 4UG2A 2I21A 187LA 112LA 1DYFA 1F50A 4EKQA 3C9LA 226LA 1L15A 3X3BA 110LA 3HWLA 4EPIA 1B6IA 3GUPA 1QKOA 3UONA 215LA 4J4QA 1XJIA 1LI2A 4JR8A 1C6AA 3C8SA 151LA 221LA 3DN6A 3ODUA 1L32A 3GUJA 2RBSA 1L02A 1CWQA 2F2QA 1D2YA 1L95A 3QJQB 1L80A 146LA 1U19A 143LA 4YXCA 113LA 3VI0A 4FAAB 3SB8A 4EKSA 1OV5A 1CTWA 4OV0A 1QTCA 123LA 170LA 3RUNA 2Y01A 1NHBA 1PXRA 1OVHA 2RBNA 1L23A 3SB6A 4FPDA 1T8GA 1L81A 3UTYA 1L12A 1P2RA 1QS9A 3HUKA 4L6RA 1L46A 195LA 1L10A 2KSBA 212LA 3QJRB 3HT9A 1L98A 2OE9X 3DN4A 4WAVA 1L06A 1P8UA 3QJSB 1L62A 2B6YA 4LDEA 3COCA 3NS0A 4EJ4A 129LA 3DMVA 3QJTB 2B6ZA 3EH5B 2F95A 1L64A 1L87A 125LA 1LYDA 4I7SA 140LA 1P8HA 168LA 2HUMA 3GULA 3VHZA 1L99A 4QRYA 1QTVA 1QSBA 2B6XA 1C8SA 5H2OA 1P8IA 4S0WA 3OAXA 243LA 1KW5A 5A45A 5B2NA 3HAPA 1I6SA 5JJNA 4IAQA 241LA 1KG8A 4AMIA 235LA 1QT8A 4W52A 4ARJA 3P0GA 1JQUA 3MBVA 1X0SA 4W54A 4G7RB 1JV6A 3L64A 1PQKA 1LYIA 259LA 1L59A 2YCXA 4YX7C 1G0QA 115LA 227LA 184LA 3UTXA 1C6NA 2RAZX 198LA 220LA 1LPYA 4ARLA 2OTZX 3FI5A 5B6WA 3GUOA 2L6XA 1L85A 1L91A 2OU9A 2Y04A 1L83A 1DYBA 4PXKA 4ZPUA 1C6IA 1VJMA 122LA 4JKVA 4MD2A 1SX7A 5B35A 2KSAA 1CV6A 2B7XA 1XEPA 4W59A 1L09A 3DMXA 4TL3A 1L28A 1L70A 3CDTA 1LI6A 1CU5A 1L08A 1L51A 1L71A 1SWYA 209LA 1L35A 1EHKB 3QBKA 5EN0A 4HYXA 4MQSA 4AMJA 1C60A 1CUPA 1DZEA 172LA 261LA 4N6HA 1KS3A 1LGUA 1D3JA 7LZMA 3QBLA 3GUIA 102LA 111LA 161LA 3L2XA 5B34A 3UTWA 1L27A 1LI3A 3OE0A 3SN6R 4EA3A 242LA 4DJHA 5I14A 1OVJA 3PWHA 3NSBA 1HZXA 1L36A 1L41A 178LA 1Q5IA 180LA 1C6CA 1CUQA 1T97A 4JQ6A 1OWZA 192LA 1CU2A 2RBQA 2RB0X 1L52A 4W57A 127LA 3SB7A 4EIYA 1G0JA 114LA 4XTLA 1L45A 1L61A 1L33A 5G36A 2R4RA 5G2AA 2OE4X 1KMEA 231LA 246LA 2OU0X 164LA 232LA 1D3FA 4DAJA 2YCZA 1JFPA 4GBRA 5A8EA 1P2LA 171LA 5G53A 1G07A 3V2WA 1P56A 1C69A 1CV5A 1S51A 4GP5B 1L21A 3EMLA 4GRVA 2ZZLA 3HUQA 1LYHA 2ANXA 1JV7A 5F8UA 169LA 2Y03A 1KY0A 1L67A 158LA 1C6DA 210LA 2CUUA 3SBAA 2ZIYA 3ABWA 3AYMA 3GUMA 141LA 1G0MA 2Y02A 4G7QB 4ARPA 1BRRA 3PDSA 2YDOA 3DN2A 1KNIA 3OE9A 219LA 1C6LA 1GZMA 2F93A 238LA 1IW9A 2LZMA 3QAPA 4MQTA 211LA 1L0MA 1QT7A 3SBBC 1L65A 2WJKA 3HH4A 139LA 1L90A 1L13A 120LA 1L39A 1QUOA 3HANA 5J7AA 4I7OA 3G3WA 1QTZA 3GUKA 1C6FA 3WQJA 1L03A 1CV4A 250LA 126LA 5H2MA 1QSQA 1CX6A 1L0JA 1BRDA 3HH3A 1AT9A 188LA 2Y00A 4EPFA 1L43A 4XTOA 182LA 1L01A 3DN1A 1C62A 1T8FA 1L76A 3HAQA 4N4YB 3F8VA 4ARQB 1H2SA 1L25A 1L75A 4I7LA 3NYAA 3HTDA 5ETZA 262LA 2Z73A 254LA 1CV0A 1SWZA 249LA 1C6QA 1JTMA 5C1MA 4G70B 3BVDB 3QDCA 3C81A 1M0LA 3CDOA 4N4WA 4GPOA 216LA 1LGWA 3HTFA 1M0MA 1L89A 1PQDA 1D3NA 4QI1A 1PQIA 4ARMA 1L16A 191LA 1DYEA 4W58A 1C6EA 3C80A 3DQBA 4X31A 5JJJA 1UCQA 1X0K1 3HU8A 2B72A 1L53A 1L63A 1P37A 2L78A 1L0KA 4L35A 1KY1A 1IW6A 5LWEA 1L24A 245LA 1LWKA 3G3VA 1C61A 107LA 1LLHA 3OE6A 2O79A 2RBOA 3JR6A 3PBLA 4IB4A 3S3CB 2NTUA 1C6MA 2OU8A 2QB0B 3C83A 3AM6A 5B6XA 1L26A 1PQMA 1P5CA 2NTHA 2HPYA 1TLAA 3VVKA 1KG9A 1C3WA 5AX0A 1P36A 4PJZA 257LA 1C6TA 3DMZA 185LA 3GUNA 190LA 5ITCA 1QT5A 1L37A 1L94A 2BRDA 1DYCA 247LA 4W53A 1LW9A 157LA 1L31A 2Q9DA 1R2NA 1S8LA 4XT3A 1QM8A 1GUEA 233LA 1L18A 3DN3A 3CDRA 4W51A 5FJGA 5H2HA 206LA 2O7AA 4OO9A 4IARA 1PQOA 1C65A 3NY8A 1L14A 108LA 1CV3A 2OEAX 189LA 1L11A 5G2DA 2A4TA 1QUDA 3HT6A 3LZMA 260LA 1D2WA 149LA 109LA 6LZMA 4W55A 163LA 2PEDA 4EKRA 1G0GA 2IGCA 160LA 3C7WA 1L79A 1JTNA 3S8GB 4DKLA 200LA 2ZFEA 4BUOA 1QTBA 1PQJA 4I7TA 3ZPRA 3AYNA 4K5YA 3X3CA 1L92A 239LA 1ZURA 1XJTA 1QT4A 5TGZA 1L73A 1QHJA 4G71B 1CX7A 4XT1A 1FBKA 3G3XA 1JGJA 3PQRA 2LC9A 3CAPA 4A4MA 3C82A 5AWZA 1C64A 1C6BA 4G72B 1FBBA 2AT9A 2OE7X 4QIDA 156LA 1G1VA 1S8JA 138LA 4MD1A 1WTHA 1L93A 1TN5A 2YCWA 1T6HA 4PXFA 1KGBA 1BM1A 3HTBA 3DN0A 175LA 1L54A 4ARQA 1R84A 1L9HA 1L48A 1LGXA 2Q9EA 2I35A 214LA 2EI4A 131LA 4WW3A 1LYJA 3HARA 4G7SB 3PXOA 4E97A 255LA 3REYA 5LZMA 2F47A 2YCYA 3VGAA 5B6VA 2B6TA 1CV1A 4X32A 1L00A 1D9WA 1LYEA 118LA 1C8RA 4Y9HA 1OV7A 222LA 1BRXA 4FA7B 2LCBA 3NY9A 183LA 4I7RA 152LA 1L49A 4BEYA 201LA 174LA 1LYGA 2RH1A 3D4SA 1TN0A 4UHRA 2NTWA 1C66A 3UTVA 1QTDA 5H2JA 3RFMA 3FA0A 2B6WA 1L69A 3C8RA 228LA 144LA 1L58A 4I7MA 5G54A 1S54A 5AX1A 148LE 4EKPA 3KJ6A 1G0LA 4BVNA 1Q5JA 3A7KA 4KNFA 1G0PA 4XXJA 4HWLA 1SSYA 3CODA 1L30A 1EPYA 2HULA 3VG9A 1LN6A 1LYFA 1L07A 1L55A 1QS5A 1QTHA 1QT3A 4AQNA 5DHHA 1L56A 1GU8A 1L66A 234LA 4BEZA 1G06A 244LA 2RAYX 1L42A 3S3DB 1P6YA 3F9LA 1DYAA 1AP9A 4X1HA 205LA 1K28A 1ZYTA 4GBRB 4W56A 2I20A 1KW7A 162LA 1L68A 3C7ZA 218LA 3UG9A 2WJLA 3DN8A 1L47A 104LA 1L44A 4YXAC 3QJUB 4GYCA 3V2YA 1L50A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GFHA 3WL2A 4DQ5A 2XJWA 2RBPA 1VDTA 1GF0A 2BLYA 3CDVA 2D6BA 2FBDA 2HU3A 4DD1A 4KL7A 1IWVA 5H2IA 4GLAA 1C6JA 1T3PA 1IR7A 6LYZA 2B5ZA 2B75A 1DYDA 6LYTA 1L57A 1ZWNA 5BR2A 3HH6A 1IP1A 7LYZA 2LHMA 208LA 3K2RA 167LA 1ZVYB 186LA 3AB6A 2QARC 2CGIA 4TX7A 2G87A 1CNSA 1C68A 2LNLA 1PXSA 4GP4B 2IHLA 1L04A 1OVKA 4LDOA 1QUGA 3HTGA 5AZDA 1C6GA 4I7QA 1DKKA 3KAMA 4I7KA 9LYZA 1IXFA 4HJYA 1GF5A 1X0I1 150LA 4CGEA 1BB7A 1B7PA 3T45A 1L74A 5H2LA 2OTYX 1CU3A 1QSAA 4KT3A 2QPEB 4E3UA 4WG1A 3QBGA 5DHGA 3HASA 5APFA 252LA 5B6ZA 3A3QA 1T8AA 4ZFPA 1REXA 1P46A 2ZYPA 5ITEA 5I4WA 251LA 2ZYCA 2HUKA 1E12A 1IWYA 2R4SA 229LA 1E0PA 3VW7A 258LA 4QGZA 5AHYA 4N8ZA 1P64A 1L29A 3HT7A 2BQLA 1REYA 1UC0A 1LZYA 4EKQA 3C9LA 226LA 3HWLA 2G4PA 3GUPA 2MEDA 1C6AA 3C8SA 4HP0A 5KXTA 1GBOA 1GB8A 4ML7A 5L3HA 2F2NA 5APEA 1L02A 4DD3A 1D2YA 1L95A 1WQOA 4EOFA 146LA 4DT3A 113LA 4LYBA 1LMQA 1QTCA 170LA 4EMNA 2Y01A 1NHBA 4WM2A 1PXRA 5LVIA 2RBNA 1L23A 3GXRA 3SB6A 4FPDA 1L81A 4MCKA 1BGIA 1P2RA 1QS9A 5KXMA 1L46A 195LA 1D0MA 1LZRA 3QJRB 3HT9A 2OE9X 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1L13 A;  120L A;  1L39 A;  1QUO A;  3HAN A;  5J7A A;  4I7O A;  3G3W A;  1QTZ A;  3GUK A;  1C6F A;  3WQJ A;  1L03 A;  1CV4 A;  250L A;  126L A;  5H2M A;  1QSQ A;  1CX6 A;  1L0J A;  1BRD A;  3HH3 A;  1AT9 A;  188L A;  2Y00 A;  4EPF A;  1L43 A;  4XTO A;  182L A;  1L01 A;  3DN1 A;  1C62 A;  1T8F A;  1L76 A;  3HAQ A;  4N4Y B;  3F8V A;  4ARQ B;  1H2S A;  1L25 A;  1L75 A;  4I7L A;  3NYA A;  3HTD A;  5ETZ A;  262L A;  2Z73 A;  254L A;  1CV0 A;  1SWZ A;  249L A;  1C6Q A;  1JTM A;  5C1M A;  4G70 B;  3BVD B;  3QDC A;  3C81 A;  1M0L A;  3CDO A;  4N4W A;  4GPO A;  216L A;  1LGW A;  3HTF A;  1M0M A;  1L89 A;  1PQD A;  1D3N A;  4QI1 A;  1PQI A;  4ARM A;  1L16 A;  191L A;  1DYE A;  4W58 A;  1C6E A;  3C80 A;  3DQB A;  4X31 A;  5JJJ A;  1UCQ A;  1X0K 1;  3HU8 A;  2B72 A;  1L53 A;  1L63 A;  1P37 A;  2L78 A;  1L0K A;  4L35 A;  1KY1 A;  1IW6 A;  5LWE A;  1L24 A;  245L A;  1LWK A;  3G3V A;  1C61 A;  107L A;  1LLH A;  3OE6 A;  2O79 A;  2RBO A;  3JR6 A;  3PBL A;  4IB4 A;  3S3C B;  2NTU A;  1C6M A;  2OU8 A;  2QB0 B; 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 4G72 B;  1FBB A;  2AT9 A;  2OE7 X;  4QID A;  156L A;  1G1V A;  1S8J A;  138L A;  4MD1 A;  1WTH A;  1L93 A;  1TN5 A;  2YCW A;  1T6H A;  4PXF A;  1KGB A;  1BM1 A;  3HTB A;  3DN0 A;  175L A;  1L54 A;  4ARQ A;  1R84 A;  1L9H A;  1L48 A;  1LGX A;  2Q9E A;  2I35 A;  214L A;  2EI4 A;  131L A;  4WW3 A;  1LYJ A;  3HAR A;  4G7S B;  3PXO A;  4E97 A;  255L A;  3REY A;  5LZM A;  2F47 A;  2YCY A;  3VGA A;  5B6V A;  2B6T A;  1CV1 A;  4X32 A;  1L00 A;  1D9W A;  1LYE A;  118L A;  1C8R A;  4Y9H A;  1OV7 A;  222L A;  1BRX A;  4FA7 B;  2LCB A;  3NY9 A;  183L A;  4I7R A;  152L A;  1L49 A;  4BEY A;  201L A;  174L A;  1LYG A;  2RH1 A;  3D4S A;  1TN0 A;  4UHR A;  2NTW A;  1C66 A;  3UTV A;  1QTD A;  5H2J A;  3RFM A;  3FA0 A;  2B6W A;  1L69 A;  3C8R A;  228L A;  144L A;  1L58 A;  4I7M A;  5G54 A;  1S54 A;  5AX1 A;  148L E;  4EKP A;  3KJ6 A;  1G0L A;  4BVN A;  1Q5J A;  3A7K A;  4KNF A;  1G0P A;  4XXJ A;  4HWL A;  1SSY A;  3COD A;  1L30 A;  1EPY A;  2HUL A;  3VG9 A;  1LN6 A;  1LYF A;  1L07 A;  1L55 A;  1QS5 A;  1QTH A;  1QT3 A;  4AQN A;  5DHH A;  1L56 A;  1GU8 A;  1L66 A;  234L A;  4BEZ A;  1G06 A;  244L A;  2RAY X;  1L42 A;  3S3D B;  1P6Y A;  3F9L A;  1DYA A;  1AP9 A;  4X1H A;  205L A;  1K28 A;  1ZYT A;  4GBR B;  4W56 A;  2I20 A;  1KW7 A;  162L A;  1L68 A;  3C7Z A;  218L A;  3UG9 A;  2WJL A;  3DN8 A;  1L47 A;  104L A;  1L44 A;  4YXA C;  3QJU B;  4GYC A;  3V2Y A;  1L50 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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