4LS0A

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with dh01b0033
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
364
structure length
364
Chain Sequence
GDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with DHO1B0033
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 140
structure length 364
sequence length 364
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2013-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ls0A00
2RHGA 1W3TA 3LCGA 1ZAJA 3BG5A 3L5MA 4TMBA 3TFXA 4MLJA 3UPBA 1W3NA 1B3OA 3EX6A 3BGJA 4I7UA 3QM3A 3A21A 2OX1A 1F2JA 3MP3A 5MHBA 2FFCA 2XFWA 4HSNA 4MOZA 5HJLA 1IIHA 2AAMA 3P67A 4O19A 1WBJA 1LDCA 1SPQA 4Z08A 4ADUA 3EXTA 5HMSA 3PUOA 2OMAA 4MIMA 3W7OA 2V2DA 2ZZ7A 1KFBA 1QDSA 1ICSA 3BW3A 3LDVA 4CCEA 2YYUA 3PWAA 3S1UA 2RDUA 3N3MA 4RLIA 1OX5A 4XTDA 4LUIA 5D2YA 4O53A 5AHNA 1G4EA 1JUKA 3O8AA 3TW7A 1ME7A 1GQNA 1LCOA 3PS7A 4KWWA 5CZ0A 4LVDA 2H90A 4UTLA 1KM4A 3EWUA 3T78A 4GJ1A 3ABOA 4EF8A 3QJAA 4JTHA 1JVNA 3CC1A 2ZRUA 2A6LA 2X30A 3QMTA 3B06A 3GR7A 3NR0A 5ABTA 2E5DA 1W56A 3GDKA 4AHOA 5K9XA 4JYDA 5HWMA 3VFLA 4QITA 5AHIA 2ZQ0A 4TMCA 1DVJA 3LCXA 4JEQA 1L2UA 3W2MA 1LRNA 4JIQA 1EPXA 1QR7A 5L6UA 4Y8FA 4ZQRA 3A5FA 1GVOA 1VS1A 2NXIA 3NPVA 4KFPA 3PSVA 3LHZA 4U4MA 3W7MA 5I3IA 3DGRA 4UFIA 1TPC1 2QCGA 4OV4A 3S1XA 4GUHA 5AC7A 1W31A 1TTJA 3IIOA 2QCLA 4N2YA 2NX9A 1NAL1 5BW6A 1JR1A 1UBSA 3A22A 3DFPA 3LOTA 1DV7A 1WOBA 3G8EA 4AVFA 4LV4A 3VI2A 4ADTA 1OYBA 2CLLA 3M41A 3N2MA 4L4MA 3HG3A 2YDAA 3P60A 4AWTA 1NF0A 4NX5A 3HG4A 4NVTA 4UFLA 2WKJA 2P1FA 4NQ1A 1H63A 3RFAA 3DKJA 2CW6A 3PVFA 3EX2A 3DFOA 1SZEA 4ZQMA 4LY8A 1YTEA 1TTIA 1EX5A 4M5PA 2DZXA 2C0AA 4CCCA 4FNSA 3W2KA 4BF9A 1JRBA 2E5CA 1W5MA 4DO5A 2QUUA 3TA6A 5LNUA 2BSLA 1DJQA 2WJZA 3QF0A 1DQWA 5D30A 3W70A 2HTMA 3GXTA 3W73A 2ZZ6A 3QPZA 2NZLA 4OQVA 4IMCA 3RLUA 3I65A 2EHHA 3TNOA 4UFKA 3C56A 3KHJA 4DF0A 3NQ8A 1ZHAA 4IMDA 3AO0A 3NNTA 1OK6A 3TR2A 1U83A 3L21A 3S42A 2CLEA 2Z6IA 4P2VA 3C61A 2Y63A 2H8ZA 3IIVA 4YXGA 1BKSA 4JYEA 4Z1AA 1K02A 3QYQA 2WOQA 3O1NA 3UY8A 5C54A 4QISA 2X16A 2WPBA 4JXCA 3BPWA 1PV8A 2EAWA 1XBZA 3NEVA 4LVGA 1ICPA 2CWNA 3W1TA 1AW5A 1N8FA 2P10A 5U4NA 1JCNA 2A21A 2DP3A 4D2JA 1DBTA 1KLYA 3EWBX 4TO8A 4EIVA 3ABSA 1GTEA 2GVJA 1QPNA 2I1OA 1H62A 5F4WA 3WK1A 4BWLA 1XBVA 3W74A 1W3IA 1MO0A 5IM51 1TV8A 4IJBA 1SW0A 2ZRWA 1K03A 1XDLA 5BMWA 2A4AA 1KM6A 1ML1A 1TPB1 3UNDA 4JTKA 3CWOX 2QJGA 2ISWA 3P5YA 4IPIA 1EUAA 4NNAA 1T99A 5A5WA 3HOJA 1WDWA 5AB3A 1PHWA 3M1ZA 4ZL1A 3ZFHA 5G2IA 1Q6LA 4WXYA 1ONRA 3SGZA 3MW7A 4AWSA 4K6AA 4JTTA 3R12A 1DORA 3G1VA 2E77A 4LVBA 1O5KA 3S9YA 4IPJA 1G6CA 3CU2A 3ELFA 3HB9A 3SY5A 3WK3A 3HMJG 4DQWA 1TV5A 3L5LA 4MZ1A 1LTDA 4DEFA 5IBXC 2QUVA 1RVGA 1Q6QA 3W6YA 4JTLA 5K9DA 3ABQA 5G1TA 2J6XA 3IVUA 6TIMA 2Y62A 4ORMA 3WJSA 4LRSA 1SW3A 4QNEA 2TYSA 2QCEA 1AK5A 3HPSA 3L67A 4O1AA 2B7QA 3GKFA 1JUBA 4GE8A 4R34A 2FPTA 3THAA 1UCWA 5LHFA 4OU1A 2F7FA 1JCLA 1F6PA 3S5YA 1I2RA 3SFKA 2VFEA 3DU0A 4NJGA 1OF6A 4IUOA 4HNNA 1ZAHA 2FQIA 2X2GA 3W1LA 2V2CA 1TCDA 4MLRA 2WSRA 5F2IA 5AHFA 1H7WA 1H60A 1D3GA 3TC6A 2Z2UA 3K30A 2FJKA 1H7XA 3DFNA 5G2HA 4LRTA 2GQ9A 1TV7A 1TTPA 1KM5A 2C18A 4XQ6A 1TB3A 3WJWA 3LCIA 1P4CA 2TSYA 1VQTA 3F03K 1HUVA 2ZZ2A 4KFOA 3N73A 3BARA 2VELA 4IMEA 1J5TA 3W1RA 5G4EA 3PBUA 2HS8A 3RLVA 2R94A 1W5QA 3GYEA 3LXCA 3NGJA 2D73A 4FNUA 3BLFA 4M6PA 2QCHA 3SZ8A 1GEQA 4C1KA 2Q8LA 3BK0A 3QFEA 4RXGA 4HN4A 4LW7A 3TH6A 5LNSA 1SR9A 5HNRA 2V9DA 3MO7A 3SECA 5EKYA 2G96A 3LERA 3IVSA 1OG0A 2VEIA 4UTKA 3PM6A 4BWLC 3G1DA 3H55A 1YADA 2JKPA 3B0PA 3NPUA 1TRDA 4N4QA 3B0VC 4IQLA 3G1FA 1WYIA 4A2RA 3CEUA 5CPNA 3T40A 1OFPA 3NG3A 2NUXA 1VR6A 2VFIA 3M9YA 4QJ1A 3EEGA 1KTBA 2ALDA 4HNVA 4LC8A 4HSOA 3FYPA 4ZVJA 1N55A 4LS2A 2QCCA 1JQVA 3W7KA 4A3UA 5E1QA 3RF9A 2QKFA 3G0XA 3JR2A 1AL7A 1S5WA 3IGXA 1IGSA 2B7NA 1DL3A 3L9CA 5CZTA 5BRBA 1F6KA 3H53A 3PBWA 4FIRA 2E1DA 2V30A 2CLHA 4JGDA 4UTWC 1WQ5A 1D3HA 1H7OA 3FS2A 4B5NA 4JS3A 4EOUA 4GC4A 5H91A 1ME8A 3HG2A 4NU7A 1FWRA 4K8EA 1KTCA 1F74A 3GDTA 3P8JA 3DH7A 2ABAA 3W07A 1H1ZA 1QOQA 4X3ZA 1H51A 4ADSA 1QOPA 2FPYA 1LLZA 4UR8A 1FWNA 5DBTA 1GPWA 1WAUA 3M0ZA 3MYPA 4UTUA 3NXFA 3TQKA 3TDFA 4XTIA 5AC6A 4NXSA 3UY7A 3GXPA 1J2WA 1WXJA 4R33A 3LHVA 3W1XA 4BFAA 2DJLA 1GTHA 3C2VA 3M16A 1QWGA 3NQMA 2E6FA 4E0CA 3ZR4A 2JKEA 3NAVA 4KFNA 5HQEA 4OT7A 4FNTA 1UUOA 1F5ZA 1IXPA 2ZFAA 5K2ZA 3DFTA 1TPEA 1YDOA 1XM3A 7TIMA 4MPQA 3TSDA 2QCFA 1XBYA 3LI0A 1X8FA 3QH2A 2QCDA 2RKXA 3DENA 5K4XA 1GWJA 2ZTJA 5LGZA 1BEUA 4AH7A 4ML9A 4N9BA 5FF7A 1I2PA 3OHIA 1VYRA 1T96A 4O10A 2WO5A 3EWWA 4WY0B 1GVFA 1FWTA 5H2ZA 1K7XA 4JDYA 4FNRA 1O5XA 2B7OA 1W5OA 2B0MA 2X1TA 4Y6GA 1YXDA 3S0CA 1YXCA 3THQA 3W75A 3F1QA 3O6DA 3EWXA 5J5RA 5DELA 1TPH1 4RKAA 1NVMA 1AMKA 1K8ZA 4M7SA 4Y96A 5F1VA 4MUZA 5LNVA 4JR5A 5D2TA 2ZZ5A 2ATSA 3CIXA 3QQ0A 2GOUA 5CPMA 3W7NA 1TMHA 1S3HA 4IX0A 4NNCA 2QAFA 2A7NA 1R2TA 1JCXA 4AAJA 1N7KA 4CQAA 3NDOA 3QPYA 2DU2A 3U6WA 4AHQA 4JTFA 4NX0A 3MJYA 3W3OA 3LHTA 1XXXA 4IMGA 5KSWA 3PSWA 4FO4A 5FEPA 2AGKA 4E38A 1T0OA 3HGJA 4LC6A 3FKRA 1P0NA 2A7PA 1WA3A 3O6YX 4YMZA 4PL2A 2H3BA 1GZGA 3UWWA 4NJIA 1TSIA 1ZALA 1VHCA 2JGYA 3S5OA 4O8RA 3W23A 2FIQA 3W7DA 3LCWA 3OBKA 2YCEA 3W71A 1HL2A 4O1DA 3NQDA 3LCLA 3LM7A 4JIPA 2WNQA 4UTTA 4K39A 3L0NA 4NJKA 4PFMA 5U7SA 3VE7A 3W2NA 3VNDA 5C6MA 4MZ8A 5D09A 1NFBA 4JNMA 2IQTA 1KM3A 1GG0A 3P8IA 2DZVA 4GXMA 3IIZA 3TAOA 3W7HA 3O05A 3DHFA 1VCVA 3I68A 3UXDA 1YDNA 1PE1A 5DXXA 3NM1A 3TXZA 4DPPA 4X9SA 1W5NA 3TCEA 4WX2A 2I14A 3KVJA 2EGZA 1JRCA 2LLEA 1G4PA 1FY6A 3M5VA 3P84A 3Q2DA 1S5VA 3R13A 3JRKA 4RXFA 1PIIA 3NQGA 1WBHA 3H54A 4JTUA 1RR2A 3DFSA 4FX7A 5D33A 4IX2A 5KITA 3OVPA 3PG8A 2EKCA 4QQ3A 3GKAA 4NZFA 3KVKA 3KVLA 4RCXA 3C8FA 4LUJA 5BOOA 3NL5A 5IBXA 4JYFA 3W7CA 4K36A 2E5BA 2Z0IA 3QMRA 2CZFA 3W76A 3TQVA 3ATYA 1OABA 1THFD 2YYTA 3QW3A 3A9IA 3NO5A 5I3KA 3W85A 3OEXA 1TYGA 3W7GA 4IWWA 3TXVA 2G95A 4I7VA 2Y7EA 1SU5A 3HGOA 1X1OA 2EPHA 1FXQA 1PVNA 4N4PA 1A50A 4UMBA 1G7VA 2C15A 3O07A 4KKXA 4JY8A 4OBTA 2H3DA 2NXHA 2VEMA 1GVRA 2CLKA 4O57A 4O1BA 3OIXA 4UFMA 3QSRA 4HPJA 3TUUA 2WSQA 2TMDA 1RZMA 1VH7A 3V1PA 5AOUA 3QEZA 3QW4B 1H7NA 3CWNA 3KAOA 3G0SA 1M6JA 1Z42A 2UV8G 4BI7A 5F4XA 4MY8A 1F05A 4MYAA 3W83A 4RR4A 1O60A 3W86A 3O16A 1Q3NA 5KZEA 4JTIA 1OYCA 3ZS4A 3NQ2A 5C55A 1Q45A 1YLVA 3UZJA 5AHEA 4DO6A 3TFCA 1SUXA 1KM0A 5DN1A 1L9WA 1FWWA 4UXDA 4G1KA 4O4WA 1G7UA 1KM1A 1P1XA 4QM1A 4LVAA 3PAJA 3LCFA 2NUYA 5HR6A 3TMLA 4PH6A 1XCFA 3F4NA 1ZFJA 3DAQA 3GLCA 2VXNA 3GAKA 4UMCA 1YXYA 1KTNA 3MHUA 4UTTC 3NQ7A 4RJEA 2BX7A 3L65A 1GG1A 2CFFA 2C13A 4JTSA 1G4SA 1TPFA 2A7RA 3W7JA 4DXVA 1LRQA 5FF2A 1FBAA 1FCVA 1QO5A 4O11A 3I7RA 1W0MA 1CI1A 1OHLA 4TX9A 2OJPA 4NZJA 3WJZA 4UFHA 2ATMA 1WX0A 2Y88A 1NF7A 4IGHA 4GUGA 1PCWA 1ME9A 1I2QA 1HO1A 1OFQA 4WQ6A 3W2UA 1QPRA 3EWYA 1AW1A 3Q37A 2RDTA 4NXKA 4J9JA 1VLIA 5D2XA 4I9AA 1BTMA 1TQJA 5DCEA 3SJ3A 3W1UA 3WK2A 2EF9A 3NL3A 8TIMA 3R2GA 5CZSA 4UTWA 4CQ9A 4JD4A 3TMQA 4IXHA 4DBDA 3L5AA 4CNOA 1VCGA 3TU9A 1UUMA 4NNBA 1OX4A 3G1AA 2Q3OA 3WFAA 2A5HA 4DPQA 1TO3A 2RFGA 3DBPA 3Q58A 3DHDA 3MWAA 2XN2A 2R91A 2PURA 3KOFA 5EBUA 2YW3A 1SO5A 2V5LA 3MMTA 1TPDA 4U28A 3STFA 4AXKA 3IGUA 1F7BA 2TPSA 4O16A 1EUNA 1OJXA 4Z1CA 3SSJA 4Z1BA 3BW2A 1EIXA 2BTMA 3HGRA 5C5YA 4FB7A 1RV8A 1GVQA 4GUFA 4O15A 1ZAIA 4S1FA 2J9YA 2C1HA 3S5NA 2A2IA 5AHMA 4O17A 1EEPA 4ICNA 2OCZA 5KZMA 3N34A 3C2FA 4YLWA 4AEOA 3L66A 3CB8A 3RMJA 5FEXA 5LSMA 4JTJA 1JUEA 1Q6RA 2W6RA 2VKZG 3CT7A 2WV8A 3BLEA 1NEYA 2ISVA 3P5ZA 3ATZA 3BG3A 2VFHA 3GB6A 2V82A 4UNLA 3M5ZA 4YWIA 3BV4A 2CLFA 3NQVA 3CM4A 4AWUA 1EP2A 4DF2A 2YX0A 3NQAA 2CZEA 1D9EA 2QDGA 3B4UA 4JX5A 3KVMA 4K38A 3FYOA 3W9ZA 3G22A 4N9DA 2P0OA 3IVTA 3LTSA 3W7PA 4HT3A 2DZSA 1IIGA 4LTSA 1EA0A 1IXQA 3S1VA 5D03A 2Z6JA 4AMAA 4UIOA 3W22A 2BWGA 2Y89A 1XL9A 2V5BA 4UUIA 5FEWA 5AC8A 5DCDA 3B04A 1C29A 1MEHA 3CTLA 2NWSA 4JICA 1OFBA 1L6WA 2ZRVA 5HWNA 3PG9A 1FUYA 3GNDA 3T55A 1CX9A 3NL6A 1GJPA 1VGAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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