The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
94
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structure length |
94
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Chain Sequence |
RYKIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
|
| molecule keywords |
Caspase-7 subunit p20
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| publication title |
Combined inhibition of caspase 3 and caspase 7 by two highly selective DARPins slows down cellular demise.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
18
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| structure length |
94
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| sequence length |
94
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2013-07-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IC4 B; 2XZD B; 1I3O B; 1SC4 B; 3GJT B; 3EDQ B; 2XZT B; 4DCJ B; 1RHR B; 3R7N B; 1SC3 B; 1RHJ B; 2CDR B; 3R7S B; 2CNK B; 1NME B; 3R5J B; 2C2Z B; 2QL5 B; 3D6F B; 1ICE B; 1QDU B; 3EDR B; 2H48 B; 3R6L B; 1QTN B; 4ZVT B; 2QL7 B; 1RWK B; 2C2M B; 4ZVO B; 5K20 B; 4ZVS B; 1SC1 B; 2QLB B; 1RHK B; 4DCP B; 4ZVU B; 1BMQ B; 5IC6 B; 3D6H B; 2QL9 B; 2XYP B; 2H4W B; 3QNW B; 2Y0B B; 3GJS B; 3R7B B; 2C2K B; 2DKO B; 1RE1 B; 2H5J B; 2Y1L B; 3GJQ B; 1RWO B; 2C1E B; 2CJX B; 1RWN B; 1RHM B; 2FQQ B; 3P4U B; 1RWP B; 2H54 B; 1RWW B; 2H65 B; 3P45 B; 3IBF B; 2C2O B; 3GJR B; 4LSZ B; 2QLJ B; 3KJQ B; 2HBZ B; 2HBY B; 1PAU B; 1I51 B; 4ZVQ B; 3IBC B; 4JB8 B; 4DCO B; 1GFW B; 2H5I B; 1PYO B; 4ZVP B; 3NS7 B; 3R6G B; 3D6M B; 2CNL B; 2P2C B; 1RWX B; 2CNN B; 3KJF B; 2XYG B; 1RWM B; 3SIP B; 1RHU B; 2H4Y B; 1IBC B; 1F9E B; 2QLF B; 2H51 B; 2HBR B; 2HBQ B; 2XYH B; 3KJN B; 2CNO B; 2CJY B; 1RWV B; 1RHQ B; 4ZVR B; 3RJM B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VV2 B; 2P9G A; 2ZJP Q; 3T1Y F; 4I68 A; 2KRR A; 5EWF A; 2NZ4 A; 4WPA A; 1QTM A; 4O3P A; 2F8H A; 3R5G A; 1FVQ A; 4FF1 A; 3CDB A; 4XTT A; 4J9R A; 1Z2Z A; 2AX1 A; 2YKN B; 1VHI A; 3GQC A; 3D0I E; 3Q86 A; 3T19 A; 3JTN A; 4LRA A; 4DR7 F; 4WKR A; 5MAO A; 3O2I A; 3V2U C; 3I5A A; 1SJF A; 2C2M B; 2CPD A; 4DPU A; 4QCL A; 1RHK B; 5E3R A; 3KLE A; 1QAX A; 4YHH F; 3D3B J; 2MQN A; 3T1A A; 5ETN A; 3DDI A; 3T5J A; 2OPR B; 1IQZ A; 3PCO B; 1ZTT A; 3V6H A; 2OML A; 2Z2Y B; 3S6E A; 3J7Z T; 4DV0 J; 2B5J B; 1PBA A; 1HYS B; 2IM2 A; 2JX2 A; 5IV4 A; 2MKI A; 1DJ0 A; 4XIU A; 4ZPB A; 3D2W A; 1NK4 A; 1WSV A; 3IP0 A; 4OI6 A; 1RAI B; 4LQ9 A; 5ETR A; 2IVY A; 5HJY A; 3EGV A; 1HLW A; 2EBG A; 2V5H G; 3H59 A; 1MRO B; 1KVI A; 2X1B A; 1C4A A; 2KJW A; 1SL1 A; 4RJV A; 2FJA B; 2RIJ A; 4FYV B; 2BA9 A; 4X65 J; 2CUY A; 2RS2 A; 2VB6 A; 3PW2 A; 2AEF A; 4X62 J; 2AGP A; 3RUB L; 3T1H J; 1FKP B; 2XB2 D; 1ZAW A; 4OZ5 A; 3T41 A; 2IM0 A; 2FYX A; 2OPS A; 1FRL A; 3MDF A; 3DNC A; 2W2M P; 4PYA A; 1U6B A; 3CCT A; 3HVA A; 3HKZ D; 2W9B B; 1S6U A; 4K59 A; 3SFG A; 1EHW A; 1U1K A; 3QGG A; 2J7K A; 1C1C B; 2BQR A; 2G2O A; 2CQ0 A; 3B6B A; 4FYX B; 2FB0 A; 4F4A A; 1SBR A; 1F3V A; 4AL6 A; 3HJF A; 3KHL A; 2AMC B; 2B8P A; 2HBY B; 1M90 T; 3CVK A; 3M2R B; 4I6Y A; 2RML A; 3BV8 A; 2GV1 A; 1JLQ B; 5JVH Q; 4PEO A; 2KM8 B; 1S9E A; 1PIE A; 2C3U A; 4KB7 A; 3CJS A; 4I7F B; 5DQI A; 3BBB A; 3V6D B; 5J2N A; 3EDQ B; 4QJV A; 3HHE A; 3W3S A; 4X64 J; 3FZB A; 4CT9 A; 2P5V A; 2HIY A; 4ES1 A; 1MWY A; 1VDH A; 2YNG B; 2FC9 A; 2KXN B; 3R6L B; 3LTO A; 5B0A A; 5AXM A; 2OEJ A; 3MEE A; 3G8Q A; 3O44 A; 4AYB D; 3PR4 A; 3OTE A; 2HHQ A; 5GAE U; 2GO9 A; 1APS A; 3EYZ A; 3CCV S; 3C46 A; 4U95 A; 5HQL A; 1X0F A; 3NOG A; 4MYU A; 3CO9 A; 5G0R B; 4ENO A; 3RAQ A; 1DQA A; 4RNO A; 3J7A N; 2UUC J; 1RTH A; 1YIT S; 2D74 B; 4USM A; 3PR5 B; 1KRP A; 3TUJ C; 4C8K A; 2COL A; 4MKV A; 4DFK A; 3T6B A; 3DLG A; 4WYL A; 2HQF A; 4A48 A; 1IKV A; 3ZZ0 A; 2RD5 C; 3E51 A; 1X7V A; 1BWE A; 1NPK A; 2R8I A; 1S99 A; 3PAC A; 2R7X A; 3R1L A; 2DIU A; 1EAY C; 4YOE A; 1RAJ A; 7FDR A; 2NPF A; 1XC9 A; 2BJ9 A; 4FXW A; 1QD1 A; 1NHK L; 5IQ6 A; 1VQ6 S; 4TY9 A; 2PII A; 3GYG A; 4DU7 A; 5JMN A; 1HMV A; 3CSK A; 4F3O A; 2DNH A; 3DRS B; 3IWL A; 2HZV A; 4N8O A; 2VBY A; 2KXF A; 2XWX A; 3FBB A; 4E8U A; 1RCO B; 2DK2 A; 1U49 A; 5ETT A; 2V0N A; 3QGI A; 5ITH A; 3MCN A; 1WKK A; 3K5O A; 2DNZ A; 1YSJ A; 3OTO F; 4GC6 A; 2GHP A; 3I82 A; 1BXN A; 4IR9 A; 3MAQ A; 1M1H A; 2WW8 A; 1SUQ B; 3ILL A; 1VYA A; 3CIZ A; 5H9E J; 1FXR A; 3ZFV A; 3NGU A; 3QWP A; 4M5G A; 1VBY A; 2EG2 A; 2YWK A; 1NK9 A; 1MWZ A; 2HFU A; 1WC3 A; 2ADB A; 1OO0 B; 4DSF A; 1S9G B; 5L38 A; 2HPU A; 2VG5 A; 4LF5 F; 2E5L F; 3WX4 A; 4ZIV A; 1IQT A; 3FQK A; 1RT1 B; 3FUY A; 5CD4 H; 3DI6 B; 1XWL A; 2RRN A; 4IDK B; 2XSF A; 4C11 A; 4U7C A; 1Q81 T; 2YH1 A; 5D0R A; 3BKF A; 4YN3 B; 3HHL D; 1SJR A; 4DX6 A; 3IS9 B; 4RW4 A; 3HFK A; 5A8R A; 4CH7 A; 4RWX A; 2KZM A; 4TLQ A; 3HSJ A; 1H7X A; 3K89 A; 5KFD A; 3L7U A; 1IKW A; 3DM2 B; 4DQS A; 2O67 A; 4CLZ A; 4AT1 B; 2KTQ A; 2CPJ A; 1KTV A; 4CT8 A; 4IG3 A; 1TV6 A; 3AJD A; 4CO4 A; 1TL7 A; 3PW5 A; 1K1S A; 4F3Q A; 2ZH4 A; 2KFY A; 1G2E A; 5ETL A; 2KU7 A; 3LWL A; 2HRY A; 4DCO B; 1V5I B; 3T5L A; 1BQM A; 4NA1 A; 4ED8 A; 3IBW A; 4CH1 A; 4Q0B A; 2HVH A; 2Y8Y A; 3KLI B; 3DLE A; 1Y5I B; 2QTW A; 4NOH A; 1OIA A; 2PSZ A; 4Y2C A; 2ZNY A; 1RHJ B; 1X0P A; 1VCT A; 4LF7 F; 2HHX A; 2UZA A; 3W9J A; 3DGP B; 4L6V 3; 2AYB A; 2GIF A; 1IBL F; 3C16 A; 2H48 B; 9RUB A; 1FCA A; 4DV3 F; 3R1H A; 4FXV A; 4Q5V A; 1S48 A; 3MMC A; 3IM8 A; 5BXI A; 3M32 A; 2VKR A; 2HHT A; 1T02 A; 1CUL B; 1YJ9 S; 2RDD A; 1ARO P; 3S8S A; 2JHE A; 2PC6 A; 1FWL A; 1VRQ C; 4DEZ A; 4IOA Q; 3H4D A; 4MYT A; 2G9O A; 1YJ7 A; 4OX9 J; 4EI2 A; 1DFD A; 1YLX A; 3IM9 A; 3S01 A; 3EGN A; 3PRD A; 3MAA A; 3M8Y A; 1RAH B; 1JKH B; 3UCZ P; 3T9N A; 3KG0 A; 1WOS A; 2ATL A; 5KOW A; 3H40 A; 4IH5 A; 2CIM A; 1RGV A; 3PX6 A; 1JJC B; 1OMS A; 4IR1 A; 4BWM A; 3GCW P; 3BH7 B; 2W9A A; 2JEI A; 1WG1 A; 4LF5 J; 1GX6 A; 1OWX A; 2NRE A; 3CDA A; 1TU0 B; 5AE3 A; 3MEG B; 1KON A; 4A8X A; 2OPP B; 3IMQ J; 2Z4P A; 2LQB A; 1C1B B; 5E5N A; 4LRD A; 2CQG A; 3BYP A; 1RAG B; 2WK4 A; 1ZPV A; 1Z1Z A; 2M70 A; 2UXD J; 2VBW A; 2X1G A; 1UCN A; 4ECS A; 2C2E A; 1QSS A; 2QMU B; 3M2V B; 4TQR A; 3OFF A; 5KFQ A; 3CDW A; 2IDL A; 5A6W A; 2XEX A; 4FZV A; 3W9I A; 3ILJ A; 3ENW A; 5F8J A; 4A8W A; 3SYZ A; 1RDR A; 1YTY A; 3KK2 B; 2DGQ A; 2I0X A; 4PPD A; 3P4U B; 5KFB A; 2LQ8 A; 2RF2 A; 2MQ8 A; 3CED A; 2CPI A; 1S0M A; 5ETS A; 4C8L A; 2J5A A; 1RT2 A; 1RTI B; 3FCW A; 5CYQ B; 4HHU A; 3EPG A; 3R2C J; 1NPP A; 5C24 A; 1T9W A; 2HHV A; 4WTO B; 1QY7 A; 2RDI A; 1KP6 A; 3HFV A; 2E1P A; 1YZ7 A; 3FSY A; 1FNO A; 1LWE A; 5DDR C; 2XNQ A; 4PXE A; 4DCJ B; 3IRX B; 4M5N A; 1FRJ A; 3QGH A; 4DL6 A; 1KOH A; 1UVJ A; 1WKJ A; 2C2Z B; 4A8M P; 4EFA C; 1MN7 A; 1HIY A; 3WIV A; 2RHQ B; 1WDT A; 3I0R B; 5J2Q A; 4LF7 J; 2HS4 A; 4JI4 F; 1S1W A; 1RAA B; 2K2P A; 5BR8 F; 4O4G B; 7FD1 A; 3VGS A; 2YPZ A; 1IBK F; 3FFI B; 3UWT A; 4F26 A; 3PW4 A; 3L7P A; 1ZS6 A; 4OJ1 A; 1RZM A; 3E01 B; 1I5O B; 2FVC A; 2Z30 B; 3V4I B; 4N5S A; 2E1A A; 3I0S B; 1HNV A; 2L41 A; 1SQG A; 3CCR S; 3KJQ B; 1A9N B; 1FDB A; 4B17 A; 1RUS A; 2HVI A; 2QG9 B; 3NGS A; 3SBM A; 2V8V A; 2JOQ A; 1F5A A; 3BYR A; 2HND B; 3RGI A; 1L3V A; 1YKW A; 1N6Q A; 1XK8 A; 3PKY A; 1HD0 A; 1SQF A; 4KV8 A; 5KG2 A; 3HM9 A; 2DH8 A; 4Z7Y A; 4OJ3 A; 3DU6 A; 4QWB A; 2OH2 A; 3DFE A; 2AP6 A; 5LSR A; 2V4J A; 1JJH A; 4OYA A; 2UV8 A; 4ZPA A; 2MKK A; 4D3H A; 1J5O A; 1TVR B; 2VBX A; 4PCQ A; 4I2P B; 1VJQ A; 3PEJ A; 1NH8 A; 4IO9 Q; 4TKT A; 1DTT A; 1XNR F; 1RE1 B; 3SQO P; 5L1K A; 1MNE A; 2KJV A; 2OEM A; 1D8Y A; 2BVZ A; 2VOP A; 2XI3 A; 4M5K A; 3P45 B; 4F2R A; 2DR8 A; 3JTO A; 2YKN A; 3LPY A; 2VPY B; 3CW2 C; 2E29 A; 4QR1 A; 1JK9 B; 2JZ5 A; 2GS8 A; 3DRP B; 1MLA A; 4ZVH A; 1H2V Z; 1KOO A; 2R7Q A; 3IGV A; 1EQM A; 2MZJ A; 2GMJ A; 5DDQ C; 4ZCI A; 3H5S A; 2GHW A; 1FJ7 A; 1FX4 A; 2OPR A; 4B9L A; 3Q8Q B; 3L3C A; 4O3Q A; 3D7S B; 2CZ9 A; 2VON A; 2XNR A; 5KFP A; 3MCM A; 3PIP Q; 1JLF B; 2B5J A; 2G2Z A; 3UD4 P; 2HFO A; 5KFG A; 1HYS A; 1T8E A; 1QLN A; 4P74 A; 4ECW A; 4FVC A; 2UUT A; 4HAC B; 3QO9 B; 1A0O B; 3H90 A; 2HAI A; 1FFS B; 4JI6 J; 2R7U A; 5CD4 A; 3G6X A; 5A8K B; 3NCQ A; 2MB0 B; 4A8F A; 1MRO A; 3G9C A; 4JI4 J; 4I1T A; 5BR8 J; 1MSW D; 1ZET A; 3FEX B; 2B43 A; 3PYD A; 2ZD1 B; 4MFB B; 3HJV A; 3HSD A; 1N0U A; 5CCM A; 1VQ4 S; 4NYO A; 3JSM B; 6FDR A; 1OS5 A; 3D1H A; 3OSP A; 1CVJ A; 2H5I B; 1KSP A; 2FVS A; 3H25 A; 5IS2 A; 2XC9 A; 1FKP A; 2BAC A; 1IR0 A; 3GG1 A; 2D69 A; 2QLF B; 4X4N A; 4QIF A; 1TMJ A; 4V19 X; 3JAM U; 5A76 A; 4OI0 A; 2D3O 1; 1VQ7 S; 4W90 B; 1KQS R; 3TA2 A; 1MN9 A; 1OYD A; 5LMN J; 2W9B A; 3K8V A; 2LQ5 A; 1S0N A; 2EK1 A; 1T3O A; 4DR1 F; 2CDR B; 4YQW A; 4KE5 A; 1NME B; 2IBO A; 1C1C A; 4KGX B; 3SCJ E; 3LH2 S; 4TQS A; 1HR0 F; 1Q4R A; 1JLB B; 3AOB A; 4MTP A; 3SCI E; 3ZZY A; 3BQ0 A; 3JYT B; 1VRT B; 1U1L A; 2J0X A; 3U02 A; 2FVR A; 4K2X A; 3EUN A; 1GH8 A; 1JLQ A; 2PT0 A; 4OZN A; 3OUY B; 2AYG A; 3NGR A; 3Q8S B; 3V6D A; 3P49 B; 1RU1 A; 1RJJ A; 2WCX A; 2B6A A; 1R8P A; 3CT9 A; 1XNR J; 1Q1K A; 5SZT A; 4LBI A; 2A6O A; 4ZPW R; 5DZ7 A; 2OPQ B; 4LT6 A; 2R7V A; 2YNG A; 4FYY B; 3P5B P; 2RHS B; 1UJ4 A; 5CZX A; 3ZNJ 1; 1N5T A; 1HWK A; 1UL3 A; 4OX6 A; 2KG1 A; 3C6U B; 2V50 A; 4USK A; 3F0N A; 2XLK A; 3EGZ A; 1T9Y A; 3RR7 A; 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5D4L A; 5ETO A; 3OHA A; 2GJ2 A; 3EZ5 A; 4ECX A; 1C0U B; 2PE8 A; 1HNZ F; 3IS9 A; 4K2J A; 3KDN A; 3SIP B; 3HSG A; 1RTJ A; 3W2W B; 3RAX A; 4UOG A; 3J7Z 5; 4I2Q B; 3ZZP A; 5KFN A; 1H38 A; 2C42 A; 1I3O B; 4RNN A; 5L1L A; 1QUV A; 1FJG F; 2GC8 A; 1SCJ B; 4N7T A; 1S77 D; 3DM2 A; 3I96 A; 1FDA A; 1UWB B; 4JV5 F; 2PEH A; 2UVW A; 1S7I A; 2W24 A; 3CCZ A; 2C2N A; 1KKH A; 4JI7 J; 2HHS A; 3D66 A; 3TR5 A; 2E5I A; 1U1M A; 2LA4 A; 3QBC A; 5L46 A; 3ITH A; 3B4D A; 1N33 J; 2CPZ A; 2UVV A; 4WP9 A; 3NG8 A; 5K14 B; 1MML A; 1B7Y B; 4DPY A; 4K0K J; 5EHH A; 3D67 A; 3QNW B; 4RW7 A; 3T9Z A; 3VR1 A; 4DFP A; 3C19 A; 2ASJ A; 1UJ5 A; 1D9A A; 3CCQ S; 3MAH A; 1QE1 B; 2B9E A; 2VFV A; 3M8Q A; 2F9J A; 2Z0G A; 4QZV B; 2VOD A; 1WF0 A; 1N36 F; 1ROF A; 2DGW A; 3DGP A; 2E1C A; 1UVK A; 4YR0 A; 3R6G B; 3D6M B; 2LXU A; 2IVF B; 1DTQ B; 4ECY A; 1K1Q A; 1D3W A; 1VRU A; 2DB1 A; 1PYS B; 2ZNZ A; 2F65 A; 5F8I A; 2R2S A; 1GEH A; 1TK8 A; 3MCS A; 2AJQ A; 1VK8 A; 2BAN A; 1LK5 A; 1S76 D; 2CPE A; 3HPO A; 2ZZT A; 1I94 J; 1FK9 B; 5L8R C; 4DZD A; 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