4LVGA

Fragment-based identification of amides derived from trans-2-(pyridin-3-yl)cyclopropanecarboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
479
structure length
469
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title Identification of amides derived from 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 165
structure length 469
sequence length 479
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lvgA02
2CLIA 3O06A 4AWSA 4UTTC 2YX0A 3C4UA 4K38A 3G8RA 2J9YA 1EWEA 1GVRA 3W7IA 3QF0A 2QJHA 3W71A 4JR5A 5D2VA 3HGJA 2X30A 3E12A 4Z1AA 3STEA 3NQCA 3EKZA 2H8XA 1NAL1 3A5FA 3BW4A 3TMQA 1TQXA 3QM3A 3SGZA 3VE7A 3A21A 3QPYA 3NZ1A 1DJQA 1VZWA 1SZFA 4JX6A 3NOEA 1OX6A 4KWWA 1TPUA 2DJXA 3FS2A 3CEPA 2W79A 3G1SA 3R8RA 2C3ZA 4MZYA 1JCMP 4POCA 4S2CA 3NQAA 3HBLA 4PL2A 5LNRA 2ZDRA 3VI2A 1GWJA 2CLLA 1QPNA 4O18A 3HG2A 3C56A 5D33A 4XTDA 5HWJA 3A9IA 3NQ6A 4M5PA 4OU1A 4R33A 3O1NA 3QZEA 4O11A 4WQ6A 2WSQA 4N9BA 1TPH1 1THFD 1RQHA 4FNQA 1FCVA 5AFDA 4JN6A 1RD5A 1I2OA 3CIXA 4CQAA 1W1ZA 4O50A 4NT0A 1XKYA 2X16A 4TR9A 4O12A 3LHWA 1W5MA 3LTYA 4NX5A 4FIQA 1G4SA 3SY5A 3ABSA 3KRUA 4TMBA 3CEUA 5F2IA 3TR2A 5FF0A 1RQEA 2WSYA 1ICPA 4RZ6A 3MW7A 5D32A 4AHPA 5CPOA 2FTPA 3RLUA 5IM51 1J4EA 5K7JA 3EXSA 5CZJA 1GG0A 1VC4A 3STGA 4O1DA 1H7NA 3TXZA 5D2WA 1G4TA 3LHUA 2NWRA 2YW4A 4H4IA 4ZMGA 3UQNA 1F5ZA 1GTHA 4DO5A 3JRKA 1YTDA 5G2IA 2ZRWA 1P0NA 3W2KA 3OVRA 2C18A 4O1BA 3RFAA 4JTHA 3NM1A 3LHZA 1W3IA 4MFEA 2NX1A 3THAA 4E0CA 1KFCA 2YXGA 4RK8A 4LVAA 1JCYA 3T4CA 4IQLA 2JKEA 3IGSA 4HKPA 1MSSA 5FESA 1R47A 5EKYA 1H1YA 1H62A 3VNDA 2TRSA 1VCVA 3PF3A 2GQ8A 4UTJA 4JD4A 1FWRA 3W1PA 1YDNA 3LHTA 1P1XA 4KWVA 1A50A 1G7UA 1K7FA 3UWZA 1MEHA 3S42A 3N9SA 1BTMA 2HS8A 4Z08A 3HF3A 2G97A 3LXBA 1V5XA 3TSMA 2Y89A 1G7VA 2W6RA 3IEBA 5EMUA 4JTGA 3N9RA 1TPEA 4FF7A 3P7YA 2Z1BA 3T55A 2E68A 2VFHA 3W7QA 1TV8A 4CCEA 1BWLA 4K7VA 5BNKA 3TFXA 3G8EA 1IF2A 4N9CA 1A5SA 2R94A 2NWSA 1ZCOA 5FEPA 1CI1A 4YXGA 3HGSA 2ZCGA 4KFOA 3STFA 4PTNA 3GKFA 1TV7A 1VYPX 5D05A 5HINA 3KRZA 1NFBA 3ATZA 5D38A 1OX4A 3QRHA 2CWNA 4JYDA 2CZ5A 3ABRA 2ZZ4A 3EWZA 3DH7A 3FEMA 2CZFA 3LI1A 1SO3A 1Q3NA 1WBHA 3S8HA 3WK1A 2A21A 3NAVA 1LRTA 4A2SA 4AB4A 4EF9A 1X1ZA 3LTSA 4Y9AA 4LC6A 1EWDA 3UXAA 1SW0A 3L0GA 3SZ8A 1OYCA 4YMZA 3N34A 3QYQA 1VJIA 4K7YA 4NU7A 5I3IA 3FLUA 1FWTA 1K7EA 1FQ0A 3PBWA 2KZHA 2VENA 3Q58A 3TU9A 2JGQA 3VKJA 4U4MA 3W7KA 3M41A 5D09A 3CU2A 2NX3A 3DFPA 3NL3A 4ADTA 2E5BA 3MJYA 2A4AA 2DZWA 5DLCA 2RDWA 4HPXA 1DQWA 3TE9A 3W9ZA 4HT3A 4GUFA 5CPNA 2OCZA 2A7RA 5DCEA 3T7VA 3F4WA 5CZTA 3I7RA 4UCGA 1KTNA 5L9FA 1XCFA 6TIMA 2GQAA 2J6XA 1Z48A 2GJNA 2Z6IA 4IMDA 1G4PA 3GDTA 5D02A 4PEKA 1YDVA 3C52A 4LV9A 3NQFA 3W07A 3KAOA 3G3MA 4Q32A 3E49A 5HWNA 3MWAA 1O60A 3LXAA 3C61A 2FFCA 2YYTA 2P0OA 5D30A 4AF0A 4TIMA 5CSRA 1PCKA 1ICQA 1XDLA 1YPFA 3NL5A 3R13A 1LROA 4UR7A 4E38A 1VH7A 4XKYB 1GVOA 4A3UA 3QSTA 2YFOA 3FJ6A 4JGDA 1OYBA 2EKCA 3BK0A 4O1AA 1UASA 3GIYA 1TPFA 3T44A 5BMWA 1KV5A 2R14A 1T0OA 5EYWA 5C6MA 4WOQA 4UC5A 3M5VA 2WO5A 4IMEA 5AHIA 5F1VA 1OVDA 3KVKA 4CQ9A 2GQ9A 4HIBA 1LCOA 3WJXA 1WYIA 2G95A 2JKAA 1SW3A 3EXTA 4WD0A 4E2DA 1F76A 1TRDA 3IIVA 4JTLA 4MJMA 3EEGA 1OF6A 2EHHA 3NQVA 4K39A 3W2UA 2VKZG 4O53A 3GDKA 2NUXA 3GKAA 3BGJA 3L66A 3NM3A 5C2XA 1DJNA 3S1VA 3W74A 1GOXA 2H3DA 3W7EA 1AL8A 1ZFJA 2NLIA 3H53A 5FF4A 5F2GA 3IVSA 4Z0SA 1XBZA 2ZZ3A 4N6EA 1X8FA 3NYZA 3HOJA 1K02A 2ATMA 4N2YA 3OG3A 3QC3A 1SW7A 3P74A 2A6NA 4O15A 3W1AA 3MYPA 1L6WA 2B0MA 4JTSA 4A22A 1WDWA 2ZA3A 2QF7A 1OFOA 3GX9A 3DZ1A 4LT9A 1JCLA 2CFFA 3BARA 1K03A 2VOMA 3R2GA 4EIVA 2BLEA 3M44A 1OFPA 3LBMA 2C16A 4DBEA 2CZEA 2XN0A 4RV8A 4M7SA 3EWUA 3LCLA 1SO5A 1UUMA 3B4UA 3GVGA 5HNRA 1ZHAA 1JJKA 1AG1O 3LRLA 2Q8ZA 1Q6QA 1F74A 3W73A 3GYEA 5BW6A 1TPDA 3EX6A 4TX9A 2B7NA 1KFEA 3EKLA 5AC6A 4RCXA 4DO6A 4O17A 3IIZA 4ZL1A 2FB2A 4ZQPA 1S5TA 1NF0A 3L9CA 3KVJA 1KFBA 1F73A 3MUXA 2XN1A 2Y7FA 1ME9A 1W0MA 4NVTA 3MI2A 3W7LA 3UZJA 3G24A 1QPQA 1KW1A 3C2EA 2Y62A 3R89A 3KHJA 3NL6A 3GDRA 5FEXA 1W54A 3LHYA 3M16A 2Y70A 1JRCA 3V75A 2P10A 4PC8A 4QM1A 2GVLA 2JK2A 3DAQA 4JXCA 1OABA 1ALDA 1PCWA 3PVFA 5KMYA 1TTIA 2V82A 5EY5A 2DZUA 3LV6A 3ZFHA 2A6LA 3CPRA 4CLMA 2E6FA 5DN1A 1KTCA 1TQJA 3KXQA 4X9SA 5KZMA 2YSWA 3UNDA 1M6JA 1AMKA 5D03A 3STCA 2VXNA 4ZZ9A 1XXXA 4BFAA 5KSWA 8TIMA 3RU6A 4JY8A 2NV1A 1YLVA 1MO0A 2YDAA 2GPTA 2OT0A 4UTIA 3HPSA 3LCIA 2FLIA 5LHEA 2Z2UA 3SW6A 1SU5A 3L0NA 3EX2A 2QCDB 1OFQA 3A22A 2YW3A 1C9DA 2A1YA 4EOUA 5H2ZA 3L5AA 4OWGA 2OZ0A 4UFHA 1FWSA 1LBLA 3O6YX 5CZ0A 1H7OA 3P67A 2QCLA 4LRTA 2AAMA 3GXTA 1G6CA 3TAOA 1NVMA 5F2MA 3LV5A 1QMLA 1TPC1 3CB8A 3CQ0A 1A5BA 4GFSA 3U8GA 1LBFA 1H60A 1MZHA 1IGSA 5DY2A 4H3DA 3HGRA 3G1YA 4LNYA 1SO6A 2B4GA 1VLWA 2Q3RA 3CT7A 4IJBA 3DFSA 3L65A 1PL9A 1OFEA 1IXPA 1PS9A 3W85A 4JTEA 3HG3A 2HS6A 3NNTA 1GEQA 1KLZA 3PG8A 3NZRA 4UFMA 3O6CA 3S1UA 1A5AA 2LLEA 4AWUA 3HO8A 2E1DA 1VCGA 1D3HA 4RKAA 3I68A 1JVNA 2ZRVA 5K9XA 1Q6LA 2WNZA 1WOAA 2ZRZA 1OYAA 2EGZA 3BW2A 1RQBA 1QR7A 1LRQA 1P5BA 3V1PA 1YYAA 5AN7A 1KM2A 3NO5A 3C0JA 2VFGA 3UWVA 4JX4A 1QOQA 1JUBA 4BWLC 5E93A 3VE9A 4WY0A 1KM3A 2NV2A 4O14A 3T40A 2QJIA 2ZZ2A 1AW5A 4TU1A 3LCWA 3B0PA 4NJJA 2C0AA 5I3KA 2NXIA 2C14A 3HPZA 4NXSA 1LM1A 4IMGA 1YXCA 1W5PA 5CKSA 1Y0EA 1TREA 5L6UA 3LX9A 2I1OA 4O28A 1TPB1 2RDTA 1ICSA 1VYSX 2WQPA 4FNRA 3ZS4A 1SUXA 3L0KA 1OFDA 1Q6RA 2NUYA 3LCHA 1J5TA 4O4WA 1W31A 1G69A 4QIUA 2UV8G 4JNMA 4QQ3A 4XBKA 1ZJIA 4IMCA 5HJLA 4GNJA 2ZZ7A 3W1LA 2Y7EA 3W86A 5EBUA 1LYXA 3W1UA 1HO4A 2FIQA 4YLWA 5GVJA 3P62A 3QPZA 4MFDA 4LS0A 4N9EA 4FEZA 3CIWA 3GB6A 1O95A 4MKNA 3FKKA 2X2GA 4XQ6A 4NZFA 4HNVA 1OFBA 4WXZA 5EA9A 3NGJA 4K8HA 1X6UA 3RMJA 4LS1A 1IXNA 1LOLA 1B4EA 3W1TA 4JTUA 1TJRA 4NNCA 1W3TA 4D2JA 3G22A 4HN4A 3FA5A 6ALDA 3IVUA 3PAJA 3RLVA 2C13A 4FX8A 3PSWA 3L68A 5LNUA 2TMDA 1UCWA 3G1VA 2QKFA 2J9ZA 3B05A 4MUZA 2G96A 3EB2A 2VC6A 1I4NA 4ZQRA 4O54A 4UMAA 3TC7A 1LBMA 3LRKA 3BGGA 4BI7A 4PODA 3U6WA 4UFLA 3QQ1A 2PRHA 2ZRUA 5CSSA 3MP3A 3RNDA 2Z6JA 3P61A 5KZDA 1TPWA 4E2BA 3QFEA 2ZQ0A 4LVBA 2A5HA 2H6RA 2QJGA 4BF9A 2QCCA 3TW6A 3DENA 3DI0A 3JR2A 2CW6A 1IXQA 3N2XA 4UTLA 5FEWA 1OFRA 1WOBA 2A2IA 4LV4A 4YCPA 1ADOA 1TYGA 3TW7A 4JDBA 4DXVA 4BR1A 2VFDA 4DEFA 4WJEA 3O8AA 1QNVA 1L6SA 3IIXA 1LTDA 3PC0A 5KZEA 1FWNA 5U7SA 3H55A 2BZNA 4FB7A 3Q94A 5K2ZA 3GLCA 1C29A 4ORIA 1EP3A 3CC1A 3LLFA 1O4UA 5E0KA 3JS3A 1FX6A 1X1OA 3NVTA 2FPTA 2ABBA 5AYXA 3LI0A 1LOSA 4M6QA 1XUZA 1H1ZA 1OX4B 4MYAA 2VEIA 4HSOA 1EIXA 4UTMA 4LWWA 3DFQA 5BOOA 4ADSA 3RK8A 2ABAA 3G1AA 3PUDA 3RF9A 3WJYA 4MZ1A 3W7HA 1F2JA 2X1RA 2VEKA 1VHNA 3DKLA 4P2VA 1UBSA 1TJPA 4N4PA 1LLZA 1DORA 2NXHA 4AH7A 1XFBA 3IIOA 1H7RA 1H7PA 2TSYA 3WJSA 2PRLA 1O94A 5DBTA 1QAPA 1BWKA 2GJLA 2QEZA 1A53A 1SFLA 3ABOA 4FNTA 3B06A 1KFKA 4RLIA 5FF7A 3NQGA 3O07A 4DBDA 3LTPA 1W37A 3NDOA 3W1QA 4MLRA 3HIJA 3I65A 4JY9A 2PRMA 5AC7A 2PCQA 1GQNA 1OK6A 3DU0A 5LNWA 3TDFA 1EPXA 4IMFA 3NA8A 4LC8A 1TTQA 4N02A 5BMXA 4O19A 3FYPA 4DO4A 5HWMA 1GVFA 3GDMA 5F2LA 3DHDA 1ZAHA 5HR6A 4I7WA 5EPDA 4UTWC 5AOUA 5G1YA 1R2SA 3O05A 3B0VC 1TV5A 5D04C 3WK0A 1O5XA 3TC6A 3O16A 2V30A 1KV8A 2QAPA 4Q4KA 1OHLA 5I3HA 3PUEA 3L2IA 3OEXA 1DBTA 2O7QA 3LHVA 5IBXC 4BI6A 3BPWA 1KLYA 2FJKA 2HSAA 3NG3A 2W0UA 5CPMA 5TIMA 3P84A 1W3NA 5LHFA 3TFCA 1GJPA 1GPWA 2V2HA 1H5YA 1TTPA 3GXNA 4GUJA 4PFMA 3G1XA 3MBFA 3CHVA 2RDUA 3UY7A 1PE1A 4FXRA 3GXPA 3W7OA 2FB3A 5C55A 2EPHA 3DFNA 4ADUA 4TMCA 4CQ8A 4FNSA 2QCMA 3M47A 1PHQA 3PY2A 3PBYA 5AHFA 3FOKA 5G4WA 5FI8A 5A8GA 2ZRXA 4HNUA 5FEZA 4W9TA 5LGXA 2X1TA 1FXQA 4IX2A 2B7OA 3NQ2A 2J27A 4G1KA 4X2RA 4Z1CA 2ZTJA 3TH6A 1UUOA 4JTTA 3PWAA 3MO7A 3TJXA 4FNUA 3T78A 1DKWA 3N19B 1N7KA 3NQMA 4LU0A 4XKYA 5DXYA 4LVGA 1D9EA 1YDOA 3BLEA 3TQVA 1L2UA 3OA3A 2C1HA 1KM5A 1YADA 2CU0A 2OJPA 2V9DA 1QPOA 2VFIA 2YPIA 3G0XA 5J5RA 5KTLA 4UFIA 3NPUA 1OK4A 4JS3A 3NQ8A 3B04A 1WBJA 4J9JA 1IIHA 2PC4A 1S5VA 4I7VA 3UWQA 1ZAIA 3EX3A 1TSIA 4DPQA 3LM7A 1SO4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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