4LW7A

Crystal structure of the mutant h128s of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor bmp
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
220
structure length
220
Chain Sequence
DVMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSSPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Crystal structure of the mutant H128S of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor BMP
rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 86
structure length 220
sequence length 220
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lw7A00
2FB3A 1YDOA 3JR2A 2OT0A 2P0OA 3UPBA 5LNUA 2BTMA 1DVJA 1W3IA 4GFSA 4QNEA 3UYCA 2LLEA 5DBUA 5LNRA 4UFJA 5D2WA 2JKEA 1XCFA 1W5PA 2X16A 4O4WA 1AL7A 3A22A 5SWUA 3BARA 4DF1A 1MO0A 2ZRWA 5D33A 5E93A 2Y7EA 4UCGA 5A5WA 3RK8A 5LZLA 2QEZA 4EF9A 4AVFA 4DO6A 2YSWA 3CTLA 3P74A 4H6KA 4D2JA 3L0NA 3NQEA 2Z1BA 4GRSA 1TV7A 2F7FA 3QQ1A 4A2RA 5KTLA 3G1DA 5LHFA 2CZFA 2A5HA 1OK6A 8TIMA 3DKLA 2VEPA 4NQ1A 1GVOA 2Y61A 2CZEA 3HIJA 4AB4A 1Q6RA 5U4NA 5FEZA 4CCCA 2V81A 2I14A 1WOBA 2QCEA 1E51A 3SGUA 3W07A 3W84A 5DXYA 3N73A 3NL5A 1JCLA 3IVUA 3TMQA 1K8ZA 2C19A 3W7CA 2QF7A 3M9YA 4GUIA 3LXAA 3NNTA 4QIUA 4NJHA 1Z48A 3HPXA 1GVSA 3Q2DA 1X7FA 2ABAA 3EX2A 4O1BA 3GNNA 2B4GA 1KM0A 3N19B 3W1XA 2E5BA 4DF2A 3G1XA 5TIMA 2JBMA 1GJPA 3R12A 3W2UA 1H5YA 2YX0A 3MBDA 3W7LA 1RR2A 3BVJA 2NUXA 4GUFA 4MZ1A 3EWXA 2A2IA 1OYCA 1GYLA 4LOCA 3PBWA 3RU6A 3FYOA 3S5YA 3TFCA 4E0CA 3TCEA 2C13A 4QJ1A 1TYGA 1SU5A 3NPVA 2YFNA 1EUNA 3UZJA 2EAWA 3H54A 4LT9A 1ICSA 4NNBA 3VNDA 4BWLC 2TRSA 1XUUA 2H8ZA 3LLDA 4UFIA 1SO5A 3LM7A 4RCXA 4TR9A 3B04A 4O16A 1FX6A 5AHLA 3C0JA 3S6DA 5F2IA 1A53A 2VEIA 3MYOA 1P0KA 3W7IA 1YXCA 2R94A 3FFSA 3KRZA 5AHFA 3S0CA 4PEKA 2XFWA 1F05A 4DBDA 5F1UA 1P1XA 2ZZ6A 2VXNA 4FNPA 3SZ8A 1XL9A 3Q37A 4ADSA 3QMSA 1JUKA 4WUIA 2E6AA 3VE9A 2JGYA 3KHJA 5CZSA 3T7VA 1KFKA 5AYZA 3KX6A 4IX0A 3EXSA 2OZ0A 1QPQA 3G0UA 4S1FA 3LHYA 4IPIA 3EWYA 5I3FA 4XTDA 3F1QA 4N02A 4AEOA 4O1DA 5LNWA 4Z0JA 3W2KA 2ZZ2A 3PUEA 1BTMA 2Y85A 3OIXA 3W72A 3EX6A 3PAJA 1UBSA 2ISWA 4UMAA 4ZZ9A 1CI1A 1JQXA 1HFBA 4PFMA 4NJJA 1PL9A 4Y9AA 4U4MA 3WK3A 5AC8A 1SW3A 2O7SA 1VRDA 2GPTA 2ZRZA 1QFEA 3KXQA 4TMCA 1C8VA 2CLKA 1KTBA 4S2CA 5D2XA 1J2WA 2C6QA 1FWWA 4Z08A 4UFHA 4OV4A 1PE1A 3SECA 2C1HA 3IGUA 2Y88A 4G1KA 3NQDA 1SR9A 1H60A 3W2NA 3BLFA 1JCYA 4LS0A 4PH6A 3IIOA 4AHPA 3W1RA 2Y62A 4FB7A 3TAOA 2V30A 5DY2A 3NVTA 1XFBA 5HULA 3MHGA 3QZEA 4O0KA 3NOEA 5AN7A 3E0IA 3PM6A 1M5WA 3QMTA 1GVFA 4WD0A 2ZZ1A 4MFDA 3G1VA 3OVPA 1HTIA 3P80A 2YXGA 2G97A 3A24A 1X8FA 3DFTA 4E2DA 3TU9A 4K7VA 5CZJA 1ML1A 4OE7A 4W9TA 3P84A 5AC7A 2GVJA 1OHLA 3HQ1A 1TPH1 3B0PA 1DJNA 4ZQCA 1AG1O 3DH7A 2AQWA 3STCA 4ZL1A 2E1DA 3NQ6A 3W23A 1WYIA 1DQWA 2RDTA 1L6SA 4JX5A 3ANYA 1XDMA 4GE8A 1Q45A 4YXGA 2ZBTA 2DZXA 2KZHA 4CQ8A 4MJMA 1A50A 3DU0A 3NR0A 3GZ3A 3STGA 2I1OA 3VKJA 1HG3A 2X1TA 2WV8A 3G24A 2QJIA 3C2OA 4N9EA 3VCRA 5D2VA 4IOTA 3UY7A 4FNRA 3MI6A 4LVGA 3G0XA 2NLIA 5DCBA 1VR6A 5EBUA 2NWSA 1YXYA 3O8AA 2E6DA 3P67A 4KWWA 3STEA 3TKFA 1FDJA 1XDLA 3E49A 4ZQNA 2QAFA 1MSSA 3S42A 2DZTA 1LRNA 1O5XA 4O57A 1W5MA 1KLYA 5KZMA 3HGRA 1OF8A 4A29A 2W6RA 3LCHA 3FLUA 1KFJA 3C2EA 1JCJA 4IPJA 4O52A 2D73A 3NL6A 4JIQA 3UPWA 3DZ1A 5J5RA 5C55A 1GT8A 5FEPA 1G6CA 1TPFA 4ONVA 4LV4A 5E0KA 1LROA 4GJ1A 4RXGA 1YPFA 4UTJA 3V1PA 3S1WA 1HUVA 2W0UA 3CEUA 3LCLA 1FCQA 3W1NA 1C9DA 5AB3A 5CSRA 4FEZA 1YDVA 3G22A 3W22A 3A5VA 1ZJIA 1T99A 4POCA 2ZRUA 2ZDRA 2ZCGA 4ICNA 5HWNA 2H90A 3KRSA 3O63A 3LI0A 5FF2A 1S5TA 2AGKA 3C61A 4GUHA 2VEKA 5AC6A 1JCXA 2V9DA 4JDYA 1LRQA 4LVFA 5D05A 3SFKA 2RDUA 3GXTA 3QSRA 1F7BA 3M7WA 3GXNA 1LM1A 2WNQA 4RX0A 4NU7A 4P2VA 3LI1A 3TQ0A 4YMZA 1SFLA 2VFIA 3EB2A 3EX1A 2JK2A 1LOLA 1GTHA 4JTKA 2VFDA 1W3TA 3BO9A 4MFEA 1O5KA 1Q3NA 1ZY9A 1UJPA 3W2LA 4KFOA 1KFBA 3BGJA 2PCQA 3O6CA 3LCIA 1A5CA 4ALDA 5DXXA 1O60A 1LYXA 1TQXA 1KM2A 2BWGA 3OG3A 2HS8A 3BW3A 1H50A 1F5ZA 1YTDA 4LRTA 4CQ9A 4JTLA 4P61A 2O7QA 2C0AA 3LCXA 4YLWA 3F4NA 3STFA 4UUIA 2R8WA 3PY2A 3D0CA 1ONRA 3FJ6A 2ZZ4A 3C3NA 3SR7A 1LOSA 3TJXA 4EVZA 3BLIA 3BW2A 3PBUA 3LRKA 3DBPA 1DORA 3LTYA 1L9WA 3L2IA 3PUDA 7TIMA 5K7JA 4MY1A 4WJEA 1W5OA 1XBZA 1AL8A 3HPSA 3TA6A 4AH7A 4WXYA 2X1UA 4IWWA 3TFXA 3UXAA 1S5WA 2BLEA 3ABRA 5IBXC 3WK0A 4I7WA 3W88A 2J6XA 3I7QA 3CB8A 2ISSA 3GKFA 1ALDA 3IV3A 1LLWA 3MMTA 1K03A 5EY5A 4BF9A 1NF0A 1OFQA 3IGXA 3P7YA 4O1AA 1VHNA 4LUJA 4GC4A 3LBMA 2A6NA 5KMYA 3H55A 3ATZA 3ZFHA 1YXDA 1FXQA 3EWZA 1H7PA 3W7KA 2CZDA 4MIMA 1FY6A 1LORA 1ZCOA 2ZZ5A 2QCCA 4PCFA 1K7XA 4E2BA 3B05A 4DQWA 4QAIA 4IMEA 3PG8A 3G8RA 1SO6A 1ME7A 2A4AA 3CWNA 5D2YA 4Z1CA 3MP4A 1QOQA 4BK9A 3QMRA 1EP3A 2WSQA 3A9IA 3Q58A 1JR1A 4PODA 3O6YX 4L4LA 3GDRA 4DEFA 3GAKA 3MHUA 1LBLA 3R5EA 5I3JA 3W1QA 1EB3A 1ADOA 4WX2A 1KTCA 1OG0A 4FHAA 4O50A 1PV8A 2ZRXA 5BRBA 5CKSA 3MP3A 4HT3A 2FPTA 3LTSA 1KBIA 4OBTA 2OT1A 1VQTA 1FUYA 3LCFA 4UTUA 2HS6A 3UZ5A 1VH7A 1VYPX 3PB0A 3THQA 3WJYA 3W7QA 5BOOA 4HIBA 1G4PA 2UV8G 4CQAA 1PVNA 2ZTJA 1FQ0A 1TTQA 4N9BA 2QCHA 2X1SA 5DLCA 4AXKA 1N8FA 2B7PA 2B7NA 3G1HA 3UY8A 4JY9A 3M5VA 1W5QA 3DAQA 2X2GA 3VI2A 1SUXA 4FIRA 3BW4A 5HR6A 2YCEA 4UNLA 2Q8LA 3WJWA 3GR7A 1H7NA 4JD4A 5G4EA 2Z6JA 1OYBA 4OWGA 2ZQ0A 1IXNA 4J9JA 3PULA 1AW1A 2JKPA 3QH2A 3LRLA 3IIZA 1KM6A 4N9CA 2VFFA 3ZR4A 4GXMA 3W7DA 1OFDA 4XBSA 4AHOA 4QQ3A 3C2FA 3GKAA 1JJKA 4JS3A 1J5TA 1QPNA 2EKCA 1K7EA 3CIWA 4XUGA 1GYNA 1J4EA 1YTKA 2WSYA 1K8XA 3PBVA 3GLCA 4WY0F 4JTGA 2HSAA 1U83A 4Z1AA 4NZJA 3VE7A 3LBCA 1R46A 3G8EA 5F2LA 2GOUA 5HQEA 3G0SA 1G7VA 3N9RA 5G1TA 1NFBA 2CLEA 1SO4A 4UTTC 1XUZA 1M7PA 4NZFA 3W86A 5HWMA 2Y7GA 5D09A 1EPXA 4O8RA 5G2IA 3W7OA 3HGOA 2V2DA 4UR7A 4UTHA 3LHVA 1XBXA 3S5NA 4Q32A 4UMBA 2YYTA 4E38A 4LU0A 4RR4A 3MW7A 2NXIA 3O07A 4LC6A 2QJGA 5H2ZA 2R14A 5G5IA 4IMDA 4TMBA 4Z0SA 3QEZA 2V2CA 3NQ7A 2BZNA 2NX1A 5K4ZA 3TQVA 1QAPA 4I9AA 5HJLA 3QSTA 1EP2A 3PVFA 4O18A 5D03A 2ATSA 4KKXA 2AAMA 4UXDA 4AWTA 2HMCA 4ADTA 2QCMA 4UNKA 4GUJA 4A2SA 4NXKA 5D04C 4N6FA 1GOXA 1Q6OA 2F84A 3DFOA 1KM3A 3NM3A 3KRUA 3WJXA 3CEPA 4XZ9A 1G4EA 3EKZA 3UWUA 1R2RA 3ZWTA 4HNNA 5FI8A 3HO8A 3N2XA 4CCEA 5CGQA 2DORA 5DCDA 1W31A 2C14A 1TTPA 3T40A 2A7PA 5D37A 2QDGA 3BPWA 1LDCA 3E96A 5F1VA 3N9SA 5CPOA 4XWUA 1X6UA 4JYEA 4O28A 5AFDA 1TV5A 3L21A 2DZSA 3NQMA 3W74A 1X1ZA 1ZENA 1FWTA 3N34A 4N2YA 5TQLA 1RV8A 1ZFJA 4UTMA 2FJKA 2V0TA 2XN1A 1TPEA 1VHCA 1WBJA 2E09A 1TREA 5KZDA 1YTEA 1FWRA 1TQJA 1XM3A 4NXSA 1KTNA 3DHDA 1KFLA 3A5FA 1TPVA 4JX4A 2DZUA 5EYWA 4K37A 4Q4KA 1RVGA 2VFEA 4WXZA 5AOUA 1H7XA 3B8DA 2GVGA 3TXVA 4Z1DA 4LV9A 2DJXA 4FX6M 2Y63A 2Y7FA 5T26A 3UWWA 2TPSA 4JX6A 3EWUA 1TJPA 2BSLA 3W1MA 1TJRA 2A7RA 5L9FA 3E9AA 1MEWA 1Z42A 4O17A 1W56A 5I3GA 4JDBA 3DFQA 4R33A 5U7SA 2GQAA 3QJAA 1VCFA 5D38A 1V5XA 4DELA 2A21A 3ABOA 3GDMA 3ZWSA 2YGYA 2E5CA 4JYFA 5K3VA 3F03K 4XKYB 4HHPA 4ZVJA 2PURA 2I9EA 1QPRA 4QISA 1YDNA 1W1ZA 1YLVA 3IVTA 5AHIA 4GWEA 4EF8A 3B0VC 3L0GA 1FWSA 3HOJA 2C18A 1F2JA 4RK8A 4M6QA 3C6CA 3GYEA 1VS1A 4BR1A 4HKPA 1ZALA 4UTTA 2J9YA 2Z6IA 3MJYA 1QNVA 1JUEA 2ALDA 3W1UA 1DBTA 4FO4A 3L5LA 2TMDA 5CPMA 1W0MA 5CPNA 4JTSA 1IXPA 1G7UA 3LHWA 1N55A 2H3BA 3ABQA 4ZQOA 5K9CA 3FS2A 4QITA 2BX7A 3GK0A 4UFLA 2VENA 4MUZA 3LV5A 5C5YA 2P1FA 2G95A 3G1SA 3KVKA 2FDSA 1T0OA 1LRTA 3CU2A 5HINA 3TSDA 4AMAA 1WV2A 3PBYA 3AO0A 4JR5A 3NPUA 5KSWA 1RZMA 4QM1A 1WA3A 1I2QA 4WOQA 3M5ZA 2W79A 2WNZA 4X2RA 1WX0A 3TMLA 2QUVA 4HPXA 1LZOA 4DF0A 3M47A 1ICPA 1SZFA 3L5MA 1TRDA 2WOQA 4UTWC 5LNSA 2Y7DA 4MYXA 3ELFA 4Y8FA 3BGGA 3GDLA 1K02A 2B7QA 3NPXA 1BWKA 1NSJA 2NV1A 4BWLA 2C3ZA 1W3NA 3DKJA 2FPYA 4O14A 1NAL1 4IMCA 1IXOA 1KM1A 2YW3A 1R30A 1ZAJA 1A5SA 1G4TA 4X3ZA 3S1UA 5LNVA 2V8ZA 3I6RA 1GG0A 3T4CA 1H7RA 1SW0A 4FNUA 4A3UA 1B9BA 2RDWA 5KZEA 1NEYA 2X1RA 3TNOA 1D3GA 4JYDA 2G5WA 1OK4A 1KV8A 4ML9A 5EL1A 2EF9A 1F6PA 1F73A 4OU1A 2CLLA 1NF7A 4JN6A 5G2WA 1DJQA 1S5VA 3LGEA 2RKXA 1LLZA 5F4XA 2TYSA 1EUAA 2V5LA 4JTIA 2DJLA 5FF3A 2CW6A 4NVTA 5BMWA 5F2GA 5FESA 3HB9A 2VELA 4N9DA 4U28A 4UIOA 5I3HA 2Q3OA 4BI5A 4C1LA 5MHBA 4YWIA 1B57A 2V5BA 1KM4A 1RPXA 3H53A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4H19 A;  1YDO A;  3JR2 A;  3UPB A;  3G6M A;  3HFT A;  1CBG A;  4GFS A;  4GVF A;  3WQP A;  2OWW A;  3WNL A;  1EHN A;  2C91 A;  1KQZ A;  3WF1 A;  1GHS A;  1V0L A;  4TTG A;  1JAK A;  4O4W A;  4IP5 A;  1U1J A;  3A22 A;  4DF1 A;  5E93 A;  5LZL A;  3RK8 A;  2Y7E A;  3GC4 A;  4UCG A;  5A5W A;  3AHT A;  2QEZ A;  3WDH A;  2UY3 A;  3CTL A;  3P74 A;  4H6K A;  3CV7 A;  4CN1 A;  4D2J A;  3NQE A;  2Z1B A;  4OUE A;  1BYA A;  1XIS A;  3RDK A;  1R85 A;  2E4T A;  2YBU A;  3QQ1 A;  4QBX A;  3S46 A;  4A2R A;  3HZ3 A;  4B5T A;  4JTQ A;  2HRW A;  4HU3 A;  2XGZ A;  5FJI A;  3SB0 A;  1WCG A;  2CZF A;  1K6A A;  2FHF A;  2VEP A;  4NQ1 A;  2Y61 A;  4D8A A;  3W4R A;  4DZA A;  2VQU A;  5FEZ A;  4CCC A;  2V81 A;  3E0V A;  2CIT A;  1MXD A;  4KCV A;  3W07 A;  1E4I A;  2PFH A;  5C9X A;  5DXY A;  4WSK A;  1F3E A;  1TJ1 A;  1JCL A;  2D2H A;  3K1G A;  4WKF A;  4FXJ A;  1V6V A;  3LXA A;  4QIU A;  4E3T A;  4Y9O A;  1ZJB A;  2NQ5 A;  4O1B A;  1X7F A;  1XID A;  2CES A;  2B4G A;  1CCW B;  1SFS A;  2E5B A;  4DF2 A;  5TIM A;  4C6M A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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