4MLJA

Dihydrodipicolinate synthase from c. jejuni, y110f mutation with pyruvate bound to the active site
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
295
structure length
294
Chain Sequence
NIIIGAMTALITPFKNGKVDEQSYARLIKRQIENGIDAVVPVGTTGESATLTHEEHRTCIEIAVETCKGTKVKVLAGAGSNATHEAVGLAKFAKEHGADGILSVAPFYNKPTQQGLYEHYKAIAQSVDIPVLLYNVPGRTGCEISTDTIIKLFRDCENIYGVEASGNIDKCVDLLAHEPRMMLISGEDAINYPILSNGGKGVISVTSNLLPDMISALTHFALDENYKEAKKINDELYNINKILFCESNPIPIKTAMYLAGLIESLEFRLPLCSPSKENFAKIEEVMKKYKIKGF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords dihydrodipicolinate synthase
publication title Tyrosine 110 Plays a Critical Role in Regulating the Allosteric Inhibition of Campylobacter jejuni Dihydrodipicolinate Synthase by Lysine.
pubmed doi rcsb
source organism Campylobacter jejuni
total genus 119
structure length 294
sequence length 295
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4mljA00
1FCUA 5AHFA 2CZEA 1GVSA 4UUIA 1VZWA 4LVAA 3TV8A 3KVKA 4UMCA 1K8ZA 3FKRA 2KZHA 2ABAA 1SZNA 2DZTA 1KM5A 4NXKA 1YLVA 3B0UX 2DJLA 2J88A 1AW1A 2Y70A 1GVFA 5AHLA 1F74A 4WUIA 3NDOA 4QQ3A 4Q4KA 3PM6A 2YDAA 1KM4A 5AYYA 1TJRA 1OABA 3E0IA 3W2KA 2V5LA 1VHNA 5CPOA 2V0TA 2GPTA 5G2IA 3WJSA 2VXNA 2HS8A 3UWZA 4AXKA 3TFCA 1Z41A 3QMSA 3BG9A 4RJEA 4M19A 4LU0A 4NNCA 3W7DA 3M0ZA 3PAJA 5DCBA 1S3HA 5G4WA 4UTWC 3BPWA 4PL2A 1AW5A 4KFNA 5KZEA 3QSRA 1TPUA 1H50A 5K3VA 4FX6M 1UBSA 1A5SA 4JNMA 2QDGA 3G1HA 4FXSA 4S2BA 3MMTA 4AHQA 3G1AA 3W7QA 4MZ1A 2JKAA 1KM3A 3TC7A 1PCKA 3CLMA 3W2JA 1MXSA 3G0UA 3S5OA 4O57A 1K02A 2VELA 3G1YA 3QW4B 3W7GA 2RDTA 4P2VA 3TX9A 3M5YA 1ZALA 1HO4A 3GAKA 5EMUA 1VQTA 3MO7A 2BLEA 1W31A 4NX0A 4LVFA 4JYEA 3BV4A 1YADA 3L5AA 3A9IA 3RMJA 3VCRA 3WK1A 4ORMA 4O10A 1WA3A 2VENA 4UTTA 2R8WA 4K8HA 1CI1A 2OJPA 1Q6QA 1KM6A 4JICA 3LCFA 2EKCA 2FJKA 4XBSA 3NL2A 1UASA 3MYPA 2FPYA 5KMYA 5HWJA 2Z2UA 1XDLA 5LZLA 3DFQA 3QQ1A 5I3IA 2NWRA 3QW3A 1SW7A 3UZ5A 1NF0A 3QQ0A 1M5WA 4IPJA 4UTMA 3M5VA 3L65A 1U83A 3GXNA 3GR8A 3BLFA 4YCPA 3LTPA 4DEFA 5E0KA 5D2YA 1OVDA 3V1PA 1MSSA 3G24A 4KFOA 2VFDA 3GYEA 4I9AA 2D73A 2Y7EA 2QR6A 1EA0A 1L9WA 3LHVA 1KM2A 1P1XA 1B57A 4MZYA 4O12A 3PBUA 3M7WA 4O1DA 3A22A 4K7YA 5U7SA 4K38A 3S1WA 4PL1A 1ME8A 4TX9A 3LTYA 3BARA 1TIMA 4UCGA 1KA9F 1LCOA 2ZA2A 2NX9A 2H3DA 1IXPA 3P8JA 3UD6A 2ATSA 2V2HA 3B8DA 3I68A 3LM7A 4QM1A 1OFEA 2QJIA 1VR6A 2CLMA 1XM3A 1C9DA 1W5MA 1TB3A 1FBAA 3W7HA 4UMAA 1H7PA 3G18A 3P67A 3LXAA 3C2RA 3O05A 5BW6A 1OFRA 4WD0A 3UPWA 2Q3RA 1OX5A 1F73A 3WJYA 4DO5A 1W5PA 3N73A 3TXVA 4CCDA 1IXOA 3LTSA 2Y7GA 1IXNA 4K37A 3FS2A 5TIMA 3UNDA 3TW7A 4PC8A 1WBJA 4IUOA 5HUOA 1K8YA 1WYIA 3EXRA 2HMCA 5FI8A 2JK2A 3LRLA 4RKAA 1NFBA 1VCGA 4JDYA 1R2RA 5DY2A 1AW2A 3B04A 3ZWTA 2J9XA 4YCOA 1GVQA 2RDUA 5C2XA 1TCDA 2ABBA 3ELFA 4RZ6A 3TQ0A 2A5HA 4B5NA 4UTUA 2C13A 3TSBA 4K7VA 3G0SA 1GJPA 1SO4A 4WOQA 4YWIA 4JS3A 3W83A 3ZFHA 3DHFA 1DKWA 3BW3A 1OJXA 4L4MA 4UFMA 5C55A 4XBKA 2HTMA 1JR1A 2NXGA 2VFIA 5TQLA 4X3ZA 4U4MA 4JTHA 1F2JA 3TDFA 3S5YA 3W1PA 1DQXA 3ATYA 4IX2A 2FB2A 3LBMA 1O5KA 2GVGA 3NO5A 3CEPA 1I2QA 3HG3A 3GDMA 3WK3A 4QAIA 1EUAA 3C56A 3DFPA 4UTLA 1GPWA 3CTLA 4NXSA 2VEPA 5DELA 3NR0A 3W7RA 4LT9A 2DZWA 1GEQA 3NM3A 2PC4A 4XUGA 1KBIA 1T8XA 3L21A 3TQKA 1HO1A 4JTFA 3W2NA 3CIWA 1SQ7A 1JJKA 2P0OA 2E77A 1F7BA 3EWBX 3N34A 1G67A 3I7QA 1K7EA 1TV5A 4LNYA 4NX5A 1XCFA 4DPPA 1FCVA 1XUZA 5AB3A 4MY8A 3MI6A 3LOTA 3NQCA 3EWZA 1JUBA 5C5YA 1PCWA 3LI0A 3PBWA 4IXHA 4LS0A 1TQXA 1OFOA 4WXZA 3SFKA 1Q6OA 4FX8A 1XXXA 3N19B 3IVTA 2VC6A 2X1SA 3G3MA 3FA5A 1KFKA 3NQ6A 1XC4A 5G4EA 3NAVA 2GJNA 1HTIA 1P4CA 4OBTA 4IJBA 2QCDA 1GTEA 4BFAA 4JTTA 3SSJA 1H7OA 2QCCA 2EGZA 3GLCA 4JTEA 4NJIA 5F2GA 2CLOA 5K2ZA 2G5WA 3LCGA 4FO4A 5E93A 1KTCA 4UTTC 1YDOA 1VYRA 3EXTA 1XBZA 2C19A 1B4KA 3LCLA 1IGSA 1FUYA 1BKSA 1OK4A 4RX0A 1PE1A 2Y89A 3C52A 5LGXA 4HPJA 4HT3A 5DY3A 2JKEA 4BI5A 1VYPX 1ZJIA 3HPSA 1S5WA 1D3HA 1QPNA 3NQ7A 1JCNA 1GYNA 4FNQA 3UWUA 2DZXA 4LVDA 3E49A 2NWSA 1JRBA 1L6YA 3AO0A 3LV6A 3P81A 4ZMGA 1GQNA 4UNKA 3W3OA 1OX6A 2ZZ3A 5KSWA 2FPTA 3T78A 4RCXA 4UTWA 3L5LA 4CNPA 4AWTA 3W1AA 3FEMA 2ZTKA 3EWWA 1FWTA 2YX0A 1DBTA 4AHPA 2X2GA 1ZHAA 3C4UA 5BMWA 4UFKA 5AHEA 3QPZA 5DBUA 4DF2A 3G1VA 3IGSA 5EL1A 4A2SA 3LCXA 4ZQOA 5CSSA 2Z0IA 1I2OA 4JY9A 3OA3A 1ZY9A 4N4PA 2Y7FA 3HGOA 2B7QA 3W7JA 3P8IA 3TR2A 5HINA 2XN0A 3TFXA 3UY8A 1W56A 4LVGA 2B4GA 3C2EA 4LV9A 2HSAA 4KKXA 3JRKA 1FDJA 3GKFA 2WNNA 3W1NA 3TJLA 3TQVA 2CLLA 4IMGA 1GZGA 4XTIA 2ZZ1A 4NJKA 1VGAA 1VH7A 2ZCGA 4GFSA 3HOJA 3DAQA 4UFLA 1VCFA 2BWGA 3S5NA 1VCVA 3JR2A 5AYXA 1AL8A 3HGRA 1F6PA 5FF0A 1BTMA 4CNOA 3NA8A 4ZQMA 3W1TA 5F2MA 1VRDA 4JX4A 4M6PA 1H63A 2A6NA 3IRDA 2W0UA 4GXMA 3WK2A 1WDWA 1XL9A 1QAPA 1WBHA 3HO8A 4O1CA 1QPQA 1D9EA 1JRCA 3L0KA 1OFAA 3NPWA 1GG0A 5D2VA 3NPVA 2QCGA 3W70A 1A5BA 1G4PA 1XBYA 1TYGA 4M7TA 3L68A 3TH6A 1KW1A 3R89A 3OEXA 5CPNA 4NZFA 1K8XA 4AWSA 3G22A 4GUIA 1X1ZA 4WY0A 2C15A 1H51A 1F05A 5F2LA 5AHMA 4MY1A 1KFBA 1OFDA 4GUHA 4OV9A 1PS9A 5HR6A 3H54A 2E6FA 3O6CA 2X16A 3EWYA 3O06A 2TRSA 1AMKA 3HMJG 3B0VC 3PVFA 1KFJA 3R8RA 4W9TA 3PC0A 4POCA 2V8ZA 4HKPA 4N2YA 4QISA 1ICSA 2DZSA 4JDBA 4PA8A 2A7NA 4UIOA 1QPOA 3TC6A 5FF2A 5HJLA 3DKLA 2C14A 3QC3A 3L9CA 2NUYA 5D2WA 1W5NA 1H7WA 4FNPA 2QJGA 4O50A 1RD5A 4S2CA 1Q45A 1TRDA 3PY2A 3OHIA 4FNRA 5K9CA 3C2VA 5LNRA 3LHYA 3LRMA 4Z1DA 1QOQA 1HG3A 1FX6A 4OHQA 4JY8A 4LRSA 5BNKA 1TTIA 1GYLA 1WQ5A 4Y6GA 3L0NA 1LM1A 3E12A 3DFSA 1LRNA 2R91A 3GR7A 3WJZA 3LB0A 4NVTA 3B4UA 1OFBA 4A22A 2ZZ7A 3PUEA 2H3BA 4O8RA 3F1QA 1NF7A 4GWEA 3S1VA 5EPDA 5K9XA 4AF0A 3GB6A 1P0KA 2Y88A 1FCQA 3A5VA 3S8HA 3USBA 2CLFA 3LLDA 5J5DA 2A21A 3NPUA 2QCMA 5EY5A 3W75A 5D2TA 2ZQ0A 3PUOA 2DORA 3CWOX 3TXZA 4HPXA 3VFLA 3TA6A 1VPXA 1O4UA 4H3DA 2OZ0A 3DHDA 1GG1A 4IX0A 2ATMA 1W3NA 2G95A 2J9YA 2CFFA 2IQTA 4HN4A 4FX7A 3TNOA 3T7VA 1YXDA 5I3FA 1LORA 3IIPA 3O15A 3UZJA 3A5FA 1EP3A 3S42A 4NT0A 2FTPA 5LKYA 4YL2A 1G6CA 3C61A 1EEPA 2VEIA 3UYCA 3P74A 3OIXA 5AC8A 3QM3A 4I7WA 4J9JA 3SR7A 4O19A 5CZJA 4ZQRA 2V2CA 3TMLA 1NAL1 2ZRXA 5HULA 4MJMA 3BGGA 2BZNA 2H8ZA 1SSDA 3NL3A 3IVSA 1KV5A 5U4NA 4PCFA 3W1UA 3IEBA 5MHBA 4XWUA 3DKJA 3H53A 4O15A 4O1AA 4HSOA 3CB8A 1JCYA 3OG3A 3QEZA 4JTJA 4O28A 4IOTA 4DF0A 1F5ZA 4FIQA 4R7JA 5K7JA 1GT8A 4YMZA 1H7RA 2E09A 1QPRA 3VE9A 2WKJA 4XKYA 3R13A 1R46A 5DXYA 3U6WA 3KXQA 4MZ8A 2QCDB 3BG5A 2C6QA 3LLFA 2B0MA 1F6KA 4X9SA 5I3JA 3HPXA 4GRSA 3TKFA 4QJ1A 2DZPA 4AH7A 2RH9A 5D33A 5K4XA 3FFSA 1A5CA 2G97A 1TMHA 4TU1A 3LBCA 4KWWA 1SSGA 1EIXA 2WPBA 1LBFA 4G1KA 2F7FA 3PSWA 4O52A 3QF0A 5FESA 1KFCA 2P10A 1FWSA 2PCQA 5D02A 1Z48A 4MVAA 3W7PA 3BGJA 3GNDA 3RLVA 3QSTA 3M5ZA 4OE7A 1NSJA 3LHTA 4O54A 4E0CA 1H7XA 4GJ1A 3VKJA 1KM0A 3B05A 4DQWA 2PE4A 2X1TA 4LV4A 8TIMA 3DBPA 3DXIA 4YLWA 4HNNA 4NJHA 4RXGA 3IIZA 2CZFA 3E02A 1IIGA 4RK8A 2CZDA 3SJ3A 1SFLA 2Y61A 1JCJA 3L0GA 3NOEA 4ZQPA 4N02A 3DI0A 3GZ3A 5FF4A 4LUIA 1ZAIA 2J27A 3ATZA 3NPXA 1VS1A 2C16A 3PG9A 3PSVA 2ZZ4A 3PS7A 4O0ZA 3Q37A 1TRIA 3MHFA 4FHAA 4ZVJA 4MY9A 1ADOA 2LLEA 3C0JA 1QOPA 1R2TA 3THAA 3PF3A 2GVLA 2QDHA 1I2RA 4K6AA 5ABTA 1E51A 1HFBA 1TPC1 3W87A 3LDVA 1JCMP 1YDVA 3W7KA 3GVGA 3DU0A 5D09A 3S1UA 3IVUA 4UFJA 3T55A 2EF9A 1OYAA 4RZ5A 1J2WA 1ZCOA 2BTMA 1THFD 5K9DA 2DP3A 2ZFAA 1SR9A 3W71A 4LS2A 3MI2A 5CPLA 3QRHA 1RR2A 4N6EA 4JN6A 2W79A 3E9AA 5AYZA 1TV8A 3MW7A 3EXSA 5H2ZA 4FXRA 1DORA 2H8XA 1JVNA 1XI3A 2C0AA 3NZRA 2DZUA 3LERA 4GC4A 5I3HA 4N9DA 4KFPA 3EX2A 3SI9A 1QR7A 2ZRVA 2Q8LA 1O95A 4UR8A 1MEHA 3NNTA 2VEMA 1UUMA 3GXTA 3QZEA 1ZAHA 1T0OA 1QO2A 4JXCA 1YPFA 4Y90A 1LBMA 4AB4A 1AL7A 4UTHA 1DV7A 4LW7A 4WY0F 5AOUA 4EOUA 4P61A 3NQEA 1ME9A 3ZWSA 4WQ6A 1ALDA 1ZAJA 2G96A 3B03A 4JX6A 4WY0B 4I7VA 2YFOA 3TCEA 5CG7A 1FY6A 1H61A 1QFEA 1UJPA 1D3GA 2QKFA 1UB3A 3W1XA 2VKZG 3OVRA 3WJXA 1WOAA 1TSIA 4OQVA 3W84A 1ME7A 1SZGA 4PEKA 5HWMA 1J4EA 2OMAA 3EX1A 4ZQCA 1FDYA 3HG5A 3FOKA 5CKSA 3VE7A 3R2GA 1YXCA 2I14A 3IIXA 1DOSA 4IWWA 3UWWA 4BI6A 1FDZA 2YYTA 3NQDA 3NM1A 3NQ2A 2GQ9A 3GDTA 3CT7A 1FWNA 2VEKA 4ORIA 1ML1A 5KITA 3EEGA 4AMAA 1C29A 3O1NA 1BEUA 5IBXA 1WX0A 1A53A 2TYSA 3SY5A 4FIRA 1TJPA 1RQBA 4BWLA 1GOXA 1FWWA 4MYAA 2ZZ2A 4MOZA 3D0CA 5DCEA 3W1MA 1B4EA 1EP1A 3PR2A 1LOLA 3L2IA 4GBUA 1XFBA 5K4ZA 4N9EA 3FYPA 1B3OA 5GVJA 1TV7A 1I2NA 1RV8A 4R34A 3G1FA 4LC8A 1O60A 4AF0B 3KRSA 2V81A 4ZQNA 3W6YA 3TAKA 1RQEA 5D04C 1TO3A 5CGQA 1FXPA 1T96A 3M1ZA 3HGSA 3HQ1A 3SIZA 1MEIA 1K7FA 4NZJA 4O14A 5HR7A 3M6YA 4KWVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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