4MLR | Genus

Total Genus 115

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	115
sequence length	296
structure length	295
Chain Sequence	KNIIIGAMTALITPFKNGKVDEQSYARLIKRQIENGIDAVVPVGTTGESATLTHEEHRTCIEIAVETCKGTKVKVLAGAGSNATHEAVGLAKFAKEHGADGILSVAPFYNKPTQQGLYEHYKAIAQSVDIPVLLYNVPGRTGCEISTDTIIKLFRDCENIYGVEASGNIDKCVDLLAHEPRMMLISGEDAINYPILSNGGKGVISVTSNLLPDMISALTHFALDENYKEAKKINDELYNINKILFCESNPIPIKTAMYLAGLIESLEFRLPLCSPSKENFAKIEEVMKKYKIKGF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	dihydrodipicolinate synthase
publication title	Tyrosine 110 Plays a Critical Role in Regulating the Allosteric Inhibition of Campylobacter jejuni Dihydrodipicolinate Synthase by Lysine. pubmed doi rcsb
source organism	Campylobacter jejuni
total genus	115
structure length	295
sequence length	296
chains with identical sequence	B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature	ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date	2013-09-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00701	DHDPS	Dihydrodipicolinate synthetase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4mlrA00

1TV5A 2J27A 1P5BA 3N73A 3QH2A 1WYIA 3O1NA 4PA8A 3B8DA 1N7KA 3LBMA 2YYTA 1W5OA 2ZZ2A 3W2UA 3GB6A 1XFBA 3TH6A 2DU2A 1QO5A 5AHEA 1LROA 4MLJA 1X1ZA 1XCFA 1G4PA 1I45A 1LBMA 1IIGA 2DP3A 4UTLA 3PUEA 4XTIA 2F7FA 4LNYA 3W1PA 3W2KA 3TMLA 3MHUA 1TPB1 2HSAA 2CLLA 4Y90A 3A9IA 1TTIA 1QWGA 1I2NA 1SZFA 4CQ8A 3SSJA 2CLIA 2WNNA 1DOSA 1OFAA 1R46A 3M0ZA 3I65A 3FKKA 4LTSA 4A22A 1N55A 4DPPA 5AYXA 4HNUA 5HR6A 3P67A 1SO4A 2GOUA 2X1UA 3FA5A 3LOTA 1TJRA 3NL3A 3R8RA 3HB9A 4GFSA 1I8JA 4GWEA 2VFEA 1K8XA 3W7EA 4GUHA 3RMJA 1KBJA 3NR0A 2EAWA 3NPWA 1PHQA 3UWWA 5K9CA 2B4GA 3KVMA 1H50A 4P2VA 2ZBTA 2ZDRA 1FBAA 2EF9A 2VFGA 5G2WA 2QF7A 4UTMA 1WDWA 1ZAJA 4P61A 1AL7A 5D2TA 1Q3NA 3NVTA 3TQKA 2WOQA 5G1TA 1KFKA 2DZUA 4IMFA 3W86A 4M19A 1G69A 4Z1BA 2YX0A 3HIJA 4K8HA 3F1QA 2J9XA 1SQ7A 3LLFA 4JTEA 1QPNA 1W3TA 3B05A 3O05A 3KFTA 4TR9A 3N9RA 4BI5A 4DF0A 1W5MA 3B04A 2CLFA 3LI1A 4UTKA 2A85A 3TDFA 1FCQA 1RZMA 1TPDA 2W6RA 1H51A 3ATZA 3GLCA 4UR7A 4UTWA 2AAMA 1T99A 3TFXA 3W71A 2E1DA 1VZWA 3M16A 4CCEA 5L9FA 2OJPA 3DFPA 1BEUA 1U83A 2NLIA 1GTEA 3P81A 4JY8A 1VS1A 4UMAA 3N3MA 5GVJA 2V2DA 4GNJA 5F1VA 2Z6JA 3SR7A 4MZ8A 1A5CA 4RKAA 4IWWA 2V81A 3GAYA 3KRUA 1XBZA 1ZALA 1J5TA 3TUUA 1YDVA 4CLMA 2C3ZA 3TU9A 3RU6A 3GZ3A 1H5YA 3LTYA 1I2OA 2QCNA 3E9AA 4X2RA 3M5VA 5CPOA 4UFHA 1XL9A 4GXMA 4O53A 3FJLA 4UC5A 4A2SA 2B7OA 3A22A 2QCHA 2Y63A 3M43A 1DL3A 1TPVA 3MMTA 1G7UA 2CWNA 1OFDA 3E49A 2DZXA 3PWAA 4JR5A 1JQXA 2TMDA 1UCWA 4GRSA 1LORA 3UYCA 1Z44A 4OT7A 4Y96A 3R89A 4CCCA 3BG5A 4C1LA 4UNKA 5LNRA 3FEMA 4TO8A 5FEZA 3LGEA 3VE9A 3NL2A 1KA9F 4MOZA 1EP3A 3ZS4A 1T0OA 2ZZ1A 5LZLA 4QM1A 4N4PA 4H6KA 2DZVA 4LWWA 5L6UA 4QAIA 4O1AA 3NYZA 5CZJA 3HGOA 3BO9A 4O8RA 3LHYA 4RZ6A 4FNPA 5D03A 3T40A 1EB3A 3EWUA 5U7SA 4Q4KA 1KBIA 2YFNA 2Z1BA 1IXNA 1W1ZA 3H53A 1I4NA 3BLFA 4DBDA 2E6DA 4FNQA 4MKNA 5BRBA 2PRLA 4PFMA 2E6FA 3W7PA 4UXDA 2EKCA 4MYXA 4MUZA 2RKXA 4H3DA 1OJXA 1F05A 1JCMP 2VOMA 3W7DA 1THFD 3WK0A 1XUZA 4K6AA 5FF2A 4LRSA 3S8HA 3G1AA 4ZZ9A 1KV8A 1F76A 3Q94A 3RK8A 1WA3A 3CEPA 2OMAA 3Q2DA 2FFCA 5D2XA 1VR6A 2OX1A 4LVFA 1GT8A 1TPC1 3FYOA 3DAQA 3W76A 1KLZA 3M7WA 3A5FA 2J9YA 3N19B 2ATSA 2OT1A 1I2PA 3BW4A 3EXRA 1ONRA 5FEXA 2ZZ4A 2WSYA 2BZNA 3ABSA 5FF7A 4R34A 3W7HA 1VGAA 3GKFA 5CPNA 3USBA 3UZJA 3W9ZA 5EMUA 3I7QA 3L5LA 2QJGA 4IUOA 1LLWA 4UFLA 1YYAA 1AL8A 4ZMGA 2YW4A 5HWMA 3EKLA 2Q3OA 3VFLA 2R91A 4AF0B 4C1KA 2HS8A 4N9DA 5CPMA 1TREA 4LS0A 5LKYA 3NQFA 1JQVA 4PH6A 3BW2A 3T44A 1K7EA 1D3HA 3MI6A 4HN4A 2WNZA 3NOEA 4FIQA 3G1SA 1FDYA 1VLIA 4FX7A 4YXGA 4S2BA 4ADTA 3EWXA 2YSWA 2OT0A 2FDSA 1TQJA 2OCZA 1NF7A 3GAKA 4UTHA 5I3JA 2DZWA 3M44A 2W0UA 5H91A 2NXHA 2XFWA 2LLEA 1GEQA 2OZ0A 2JBMA 3G22A 5DELA 3YPIA 1XDMA 3G1YA 4TU1A 5EKYA 1FXPA 3BW3A 4K36A 1H7OA 1H60A 1PV8A 3MI2A 5FEWA 2JGYA 2VFFA 2C1HA 1XBYA 3BARA 3UPWA 1AW2A 4N4QA 2B0MA 1SFJA 1NAL1 1W3IA 3TC7A 1UBSA 4QSHA 4LRTA 4CNOA 1VYPX 4HKPA 3W22A 4G1KA 2WSRA 5BMXA 1KFLA 4NNAA 1N8FA 4TMBA 3C4UA 1GPWA 4J9JA 1FCBA 3UY8A 2YCEA 1G4EA 4RXGA 5CGQA 1JUKA 4WQ6A 2VENA 3L0NA 4HSNA 1FWSA 3QC3A 2A21A 4D2JA 1KM6A 1WBJA 2Y7FA 5IM51 3UD6A 4DQWA 3QEZA 4Z08A 1SSDA 1TSIA 1ZFJA 5I3FA 2V2CA 4ZQOA 3W7QA 1RQBA 4HNVA 2BWGA 3L5AA 3L66A 1VCGA 3S9YA 4M7TA 4QISA 2WPBA 1ME7A 3W3OA 1AG1O 3UWUA 3LCFA 3RLVA 1IXQA 1SO5A 3PSVA 3G3MA 1BKSA 3O6CA 1RQEA 3P8JA 3VE7A 1H7NA 3H54A 2NXIA 3JS3A 3L2IA 4WXYA 3LTPA 3MBDA 4O11A 3UWZA 2VEPA 1O5XA 4ZQCA 4A3UA 2Z2UA 3P80A 1NSJA 4OV9A 1KV5A 4KWVA 2NUYA 4E0CA 1XUUA 4ONVA 4XQ6A 3JR2A 3OHIA 3OVRA 3MHGA 3QYQA 4U4MA 3B03A 1Z41A 4JTSA 5DY2A 1WOAA 3I7SA 3S0CA 1VHCA 2PURA 1VLWA 1SU5A 1LOLA 2YPIA 2A6NA 4DELA 1TV7A 3R5EA 5IBXC 3FJ6A 3UWYA 5F4WA 1KM0A 3ZR4A 5AHLA 5D32A 4JTKA 3CTLA 3QW4B 2NV1A 2QUVA 5G2HA 3LHZA 4FEZA 1OK4A 5D04C 4XBSA 3O07A 1EEPA 2R14A 1JCJA 4M7SA 4ZL1A 1SUXA 1NVMA 1A50A 3HGJA 5HUOA 3UQNA 2ZTJA 3PBYA 1W5NA 5J5RA 3CPRA 2CLEA 4LY8A 4R7JA 2EHHA 2V2HA 1ML1A 3W7RA 1EX5A 2QCFA 5HQEA 5C54A 3QFEA 1B4KA 3B0PA 1TPFA 3IGXA 4DO5A 4GUIA 3EX4A 2A2IA 4PTNA 4UTTC 3S5ZA 1XXXA 2C14A 4S1FA 3FKRA 2Z0IA 5HINA 3KRSA 3PS7A 1WQ5A 4IGHA 3STFA 3HQ1A 3SJ3A 1B57A 3CC1A 3M1ZA 4NX0A 1OFPA 4K7VA 1LDCA 1F2JA 2VEIA 3O63A 2A5HA 4MPQA 2GJNA 5BNKA 1W31A 4I7UA 4MFDA 3NQVA 2IQTA 2WJZA 3W7JA 3C56A 4AHPA 3QPYA 3LDVA 1LRQA 4MVAA 4FXRA 5CPLA 4MY1A 2JK2A 1KTNA 2WO5A 4RZ5A 4UUIA 1FDZA 5C55A 3CEUA 4IJBA 2G96A 4LVGA 1BWKA 1FQ0A 2X1TA 1P1XA 2RDWA 3W73A 3LCHA 4FNUA 2ZRWA 3SIZA 3QQ1A 3C8FA 2BTMA 1JRCA 1FDJA 2H90A 4DO4A 3TKFA 3NQGA 1L6WA 4O0ZA 3W1AA 5CSRA 1O4UA 2CLKA 4AH7A 2FPYA 3FIGA 3QMRA 4GUJA 1M7PA 3IVUA 3WFAA 1ZHAA 1AW1A 3IGUA 3NQ8A 1SW3A 3TAKA 3TMQA 4AHOA 4ADUA 1K7FA 1W8SA 1EP1A 1H7XA 1P0KA 3WK1A 2E77A 1NEYA 3M47A 4NZFA 1ME8A 3PB0A 5AYYA 3LV6A 3M6YA 2GQ9A 4FNRA 1RVGA 3ABRA 4WOZA 4NT0A 1HFBA 3W23A 2JGQA 3L5MA 3PUOA 4YCPA 4LUIA 3MBFA 3AO0A 4NU7A 4YCOA 2WNQA 3TXVA 4JDBA 4TX9A 1W54A 1CX9A 2H3DA 5E0KA 1PS9A 4NNCA 3LCIA 5TBOA 3W1RA 1JCYA 3BGJA 3C2FA 4Y9AA 5DXXA 4Y6GA 4MFEA 3L0KA 1LOSA 2Y7DA 1GG1A 5AHNA 4RR4A 2HTMA 3NPXA 4NNBA 3DFNA 4O14A 3W1NA 3LHUA 3KRZA 4FNSA 4IMEA 4KKXA 3PBVA 4M6VA 1SW0A 2VKZG 1ALDA 4JYEA 4UFIA 4E2DA 4BWLA 3L0GA 1TPEA 2X16A 2ZZ5A 2V5BA 4WXZA 2X1RA 3U2OA 5HWNA 4NJGA 3HG5A 1YTKA 1HO1A 5DN1A 5C6MA 3QW3A 1W3NA 2O7QA 5U4NA 1TO3A 4DXVA 3LHVA 3EB2A 4MYAA 2GPTA 1QNVA 5FESA 3UXDA 4UMCA 1A53A 3NPUA 1XKYA 3EKZA 4CNNA 2JKPA 4NJKA 1ZNNA 3GXTA 1LRNA 2ZTKA 3TK7A 1QR7A 3DFOA 2ZFAA 3DENA 3GVGA 1F73A 4IMCA 4IPIA 4NZJA 4AB4A 5KTLA 3KHJA 4M6QA 4MIMA 3LTSA 2JKAA 3WJSA 2QR6A 3SGZA 5EYWA 4JEQA 1IXPA 3W7NA 3MP5A 2CZ5A 1FY6A 1YADA 4UMBA 1KFJA 5E93A 3E96A 2GQAA 3NGJA 1YXCA 4WY0F 4O1DA 3DHDA 3TSDA 5C5YA 5LSMA 5KINA 1EP2A 3TC6A 4X9SA 5K2ZA 3TNOA 1ZY9A 3EWZA 3G1XA 4PEKA 4WX2A 3G8EA 4ZQMA 5E1QA 3HG4A 3OBKA 2NWSA 2QCGA 4N9CA 5DY3A 3EWWA 3LHTA 2I1OA 3MP4A 3W7OA 1TYGA 4K39A 4R33A 1A5BA 2H8ZA 3F03K 1TV8A 1JCNA 5F2GA 3QSTA 1QPRA 3C6CA 2A7PA 1K7XA 1LLZA 1GVRA 4LC6A 3RLUA 4O17A 3EXSA 2A7RA 5HJLA 3SFKA 4WZHA 5H2ZA 4XBKA 5FF4A 5LNUA 4I7WA 4JIPA 4KWWA 5I3KA 3T4CA 3S1WA 3B0VC 3W1TA 3TSMA 4N6FA 3KX6A 3GDRA 4UTUA 1UB3A 2Y6ZA 3LI0A 1PVNA 4PODA 2FTPA 5D30A 1HL2A 3NQDA 1Q6LA 1D9EA 3PM6A 1JR1A 4Z1CA 1VYRA 2R8WA 1F7BA 4AWUA 4FX8A 1FUYA 1FX6A 2CZEA 2ZZ6A 3GR7A 3CIWA 3W2NA 2NX1A 3M5YA 3SY5A 3WJXA 2XN1A 2A0NA 3PB2A 3DFSA 3R2GA 4K7YA 3CM4A 5AC7A 1C9DA 1TPUA 3UPBA 1S3HA 3S5NA 3HPZA 1TRIA 3CLMA 3GNNA 1FWRA 1YTEA 2YR1A 3HPSA 1H7RA 3G8RA 3LX9A 4Y8FA 3S1XA 1VYSX 1ICPA 1YLVA 5AHIA 4L4LA 2RFGA 3EX2A 3QM3A 3W7LA 3G18A 2B7QA 1R47A 3THQA 2E5DA 2TSYA 4O4WA 4N9BA 1OFOA 5CZ0A 1NF0A 5FF0A 5K7JA 4FHAA 4KFOA 4M5PA 1VHNA 3PBUA 4AAJA 4AMAA 3S1VA 4X22A 4BFAA 5KSWA 3G1VA 5K3VA 2UV8G 5F2LA 1KTBA 3JRKA 3G1FA 4LV9A 1LM1A 1JULA 2ZA2A 4HT3A 2QJIA 2PE4A 4JN6A 3EXTA 1SR9A 3TE9A 3W2JA 4JTIA 3MI3A 4FB7A 4DF1A 4TMCA 4IMDA 4DEFA 3O15A 1QDSA 1FCUA 2VEMA 2WKJA 3SI9A 4FNTA 3NG3A 2ZRVA 5CG7A 4UTWC 1UASA 3LCXA 3PG8A 3W74A 1XDLA 3DFQA 4JTGA 5TQLA 1QAPA 2NWRA 3GDKA 4UCGA 3W85A 4IPJA 2RDUA 2J6XA 4LVBA 4PC8A 2QCEA 1S5VA 3GDLA 1R2TA 1H7WA 4XKYA 4CQ9A 1G6CA 1Q45A 1VCVA 4AHQA 5AB3A 3GXNA 3S42A 6ALDA 4K37A 3G1HA 2H3BA 5LHEA 4X3ZA 3UZ5A 1KFEA 3NQEA 1I2RA 3W07A 5AHFA 2Q8ZA 3MJYA 1GQNA 3TROA 3W2LA 1B9BA 3PAJA 2YZRA 2QDHA 4JICA 1VRDA 1TPWA 3NA8A 1T8XA 4IX2A 2QCDA 4OQVA 2CZDA 5DCEA 1L6SA 4O16A 4PCFA 1LZOA 3DBPA 1VQTA 4WJEA 5KZMA 1W56A 4S2CA 4EOUA 3CWNA 4MZYA 1BTMA 3WK2A 3W87A 1DJNA 1H63A 1FWNA 1YXYA 1TRDA 1I2QA 1MEWA 1V5XA 1H7PA 4RK8A 5D2WA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4MLRA

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