4MO5A

Crystal structure of anmk bound to amppcp and anhmurnac
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
365
structure length
345
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLAFNLPWLQEHLARHAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPAGSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 110
structure length 345
sequence length 365
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo5A01
3VF4A 5AZJB 5TKYA 1U2VB 4BRPA 5AFUA 1RFQA 3LDPA 4CZHA 1BUPA 3VGLA 2FXUA 4EIAA 2GWJA 1BDGA 2ZGZA 3ZX3A 3UKRB 2A5XA 3LDLA 4YDUA 4I6MA 3DXMA 4XEIA 3CJCA 5AQHA 3H1QA 1NGCA 1HUXA 1GLFO 3O8MA 1GLBG 4FWNA 3HTVA 1X3NA 2OANA 5AQMA 4GY2B 5BN8A 4JHDA 2FSJA 3QBXA 4BVOA 3S41A 5LJVA 1ZXOA 5EX5A 1KAZA 2Q1NA 3DXMB 3GBTA 4I6MB 3CJ1A 4K43A 3AAPA 1HKBA 1EQYA 4JNEA 1H1VA 3QFPA 4K41A 5AQXA 3D2FA 4DHYA 1K8KA 3H46O 1WUAA 5AQFA 3R8EA 2P9PA 5AQQA 4BR4A 3H45C 1GLDG 5JMVA 1QZ6A 2D0PA 4M63C 4H0TB 3TU5A 2IVOA 3U4LA 5JICA 2EWSA 4H0YB 4FWMA 2P9KB 3WXLA 2A41A 3HM8A 4NB4A 1MWKA 1K8KB 2A3ZA 1BOTO 2D1KA 4H0PA 4BC5A 5KPTA 1MA9B 2ASPA 1BO5O 2QWOA 1GLCG 4FOEA 4FOIA 2E1YA 2QWNA 4NO7A 3GL1A 2QWRA 1V4SA 4BG9A 1NMDA 5EY4A 1SAZA 4B1XB 4C23A 3EKUA 3VF2A 4H0XB 2Q97A 2QWQA 4EAHD 2E88A 2F9WA 3LDNA 3M1FA 3A5OC 1KAXA 2E2NA 2W41A 2YI1A 4ISFA 3LDOA 5AQPA 3F9MA 4PKIA 3G25A 3IMXA 4CI6A 2IIRA 2PBDA 4BQLA 4GNIA 3A0IX 3C7NA 5BPLA 4WQ5C 3WUHA 3B8AX 2CH5A 3O1BA 4BR2A 3CJ7A 1IG8A 1DGKN 2E1ZA 5AZIA 2NLXA 5FPDA 4Z94A 5EVZA 3CIPA 3WEEA 5EXWA 2E8AA 1TYQB 2HMPA 2QW9A 1QQMA 1YAGA 5AR0A 3U8XA 3KZBA 4M7XA 5F2RA 3BF1A 3FR0A 3WEEB 3MN7A 4FO0A 3L4IA 5AQNA 1QZ5A 2YHXA 3O4WA 1ESVA 4IWVA 5AFUH 1ZBSA 4FPBA 2V7ZA 3AAQA 3AY9A 3WXIA 2GEMA 3HSCA 2YHYA 2P9UB 3CETA 4CZIA 5AZJA 5BREA 4EHUA 2QWPA 2A42A 4PL8A 4DQ8A 3CQYA 2GUPA 1NGAA 4IO8A 3FZLA 1NBWA 1C0GA 1C0FA 4Y0WA 2Q36A 4HTLA 5ADXA 2AA4A 3ATUA 4CZEA 4M7YA 3WQUA 2W40A 4ISEA 4CJ7A 3QBWA 3QB0A 4BRGA 2Q0UA 5LY3A 2HF4A 4CZLA 2FF3B 1WOQA 5AQTA 3VGKA 1ATNA 2WUSA 3AARA 3H3NO 3FZMA 3UKUB 1HKCA 3TPQA 2ZF5O 1X9JA 2VWBA 4H5WA 3A5MC 3EL2A 2ZGYA 1GLJO 2P9KA 1T6DA 5AQJA 1BA0A 2A40A 3ATVA 3DJCA 1Z6RA 2AP1A 4BRIA 1TUUA 2DPNA 1ATSA 1OKJA 3ENOA 3VOVA 1HPMA 1E4GT 3EO3A 2P9IA 5F0XA 4PKHA 3FZKA 1XUPO 1QQNA 2CGLA 4BROA 3HZ6A 4MO4A 4BRHA 3O08A 1MDUB 2FSNA 4A2AA 5CE3A 3SMSA 3IFRA 5E26A 2KHOA 2D0OA 2P9IB 4K42A 3J8AA 5AQKA 3ULEB 5BN9A 1RDWX 3CJBA 4BGBA 3O1WA 3R9PA 5JLFA 5KPZA 4H5TA 4BR7A 2ZWHA 3RSEB 3MN9A 3ZEUA 3VENA 3VPZA 1R59O 3ZX2A 1LOTB 4BC2A 3EN9A 3MDQA 4CD1A 3CHWA 5JLHA 3ZEUB 4FWLA 2QXLA 4QS7A 3JS6A 1CZAN 3JXUA 1XQSC 3SJHA 1NGBA 2Q0RA 3HBTA 4BC3A 2QWLA 1RGIA 2Q31A 5AQRA 5AQOA 4L3QA 5E84A 1TYQA 4BR9A 4CBWA 1T44A 1DKGD 2NRHA 5AQIA 1NGJA 3HI0A 3FFKB 5BPNA 3O5BA 3L0QA 4BREA 3QDKA 4BQZA 4IXCA 4PKGA 4RWTA 4H5VA 3VESA 4O8KA 4CZKA 1JCGA 2P9SA 2E2OA 3H3OB 4BR5A 4B1WB 3LM9A 3MN5A 3WXKA 5KQDA 2BTFA 1NLVA 2P9UA 3VEVA 2F9TA 2P9SB 1TUYA 3LDQA 5LJWA 3D2EB 2P9NB 2P9LA 5FPEA 5F1XA 4RCHA 5BRDA 4MO5A 3VEXA 5FPNA 3WXJA 4KBOA 4CBUA 3MMVA 3CJ9A 5KQ8A 2D4WA 3QICA 1MWMA 2P9LB 4DCHA 2H3GX 1E4FT 1BWFO 4CZGA 5EOYA 1SZ2A 4CZJA 3M6GA 4F9OA 3A5LC 1HX1A 1GLLO 5AQLA 1BA1A 3UE5A 3BUZB 1KAYA 4FWSA 2CGJA 3SMPA 1NGHA 1NGIA 3I8BA 2A6AA 4H03B 2V52B 4EHTA 3UKUA 1ZC6A 2FF6A 3W0LA 4DB3A 2Q2RA 4BRDA 3OHRA 4B1ZA 4B1YB 3VF6A 3CQXA 4CD3A 2BUPA 3U9ZA 3WT0A 5BPMA 3LM2A 3IDHA 4BRNA 3C0BA 3M3ZA 5BRHA 4BRCA 4H5NA 3GOIA 5AQVA 1QHAA 1NGDA 3VGMA 4BRFA 1DEJA 3QMLA 4FWOA 4QS8A 1Z05A 4A2BA 3D7EO 2YHWA 4MLEA 2ASOA 1HKGA 2VYPA 3IUCA 2HOEA 2J4RA 4WQ4A 4AM7A 2GWKA 2FSKA 1YVNA 1JCEA 3ULEA 2UYTA 3MK6A 3FGUA 5AQUA 3DAWA 3UB5A 5FPMA 1ATRA 2HF3A 3FLCO 3RSEA 4E1JA 3H6EA 1XC3A 2QM1A 4A61A 4CBXA 1BU6O 2I7PA 3VEYA 4JHDB 4RTFD 4BGAA 4XH1A 4FPAA 3O80A 3FZFA 4FL9A 5KPRA 2FLOA 4BVPA 4EFHA 1P8ZA 5AQGA 3QFUA 3BP8A 4JD2A 4BC4A 3ENHA 3R6MA 3A8YA 4B1VA 5B8HA 3LL3A 2QWMA 5I9EB 3L6QA 4IZ9A 3D2FB 4O5FA 1NWKA 2E20A 3EZWA 4B9QA 2P9PB 2V51B 4JD2B 2NZTA 3SK3A 4J8FA 4BRAA 1X3MA 4K25A 5AQYA 3GDQA 1T6CA 1S3XA 1BG3A 3A5NC 3MCPA 1U6ZA 1YXQA 4BRMA 3GG4A 3ID8A 5AQSA 4LC9B 4ISGA 4FWKA 2I7NA 4JAXA 3BEXA 4BRKA 2ITMA 4CZFA 4A62A 3CERA 4BRLA 3H1VX 1YUWA 1NGFA 5AQZA 1J6ZA 2PAVA 4FWPA 1HJOA 1HLUA 3FZHA 3MN6A 3O6WA 3P4IA 4XH5A 4MLHA 1GLAG 3U9DA 5AQWA 5BR9A 3W3DA 4B1UB 2IVPA 4BR0A 3D2EA 2P9NA 4FWRA 5ELZA 4IJAA 3GE1A 2CH6A 1JCFA 4FSVA 4IJNA 3ZETA 1NGEA 3C7NB 3SLCA 2VCPA 2GELA 2IVNA 1Y64A 4H0VB 3WQTA 4AM6A 4PL7A 5ADXH 2GTDA 3ZETB 1LCUA 1GLEG 4JN4A 5AZIB 1NGGA 3KVGA 3DXKA 3VERA 5BRFA 4YDUC 4HWIA 2E2PA 1D4XA 1NM1A 1QQOA 4WYBA 4WQ5A 3VEZA 4BG8A 4QS9A 3CI5A 4FWQA 2YJFA 3BF3A 3DXKB 2ASMA 3VEOA 1KXPA 3KHYA 4WQ4C 1S22A 4BRQA 4CZMA 1IJJA 4H0OA 3DWLA 4XH4A 3VETA 1V4TA 3ZX0A 1G99A 2V7YA 1U2VA 2YJEA 3I33A 3FE1A 1SQKA 3CJAA 4H5RA 3EKSA 2CGKA 1Q18A 3UKRA 2E2QA 2YCHA 3VEWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSYA 3EZ5A 1U2VB 4BRPA 4YOTA 3R1XA 4DV7K 5FRMA 2Q3SA 3LAKA 4IFEA 4XEIA 2F7TA 4DSIA 1NGCA 1GLFO 2HNZA 1LWFA 2P1JA 3ZSQA 2EHGA 4FWNA 2G8WA 2OANA 4DQPA 3VQDA 3S41A 5LJVA 2HMIA 1KAZA 4DQSA 3DXMB 1QVGM 5M1PA 3PSIA 1EQYA 3CPWM 3BZKA 3MEDA 4K41A 4YOUA 4CK2A 1WUAA 5AQFA 3R8EA 5AQQA 3P1GA 4BR4A 5J2QA 3H45C 3TU5A 4B08A 1YTUA 5JICA 1B92A 5KI6A 1MWKA 4F2SA 3M8RA 4GV9A 3DI6A 4XIUA 2QXFA 3OTOK 4H0PA 4GV6A 4BC5A 5KPTA 3HXMA 2ASPA 3K5MA 1SL1A 1RBUA 4FOIA 3LP3A 3HJFA 3GL1A 3ZT2A 5C24A 1NMDA 1SAZA 4A59A 4C23A 3S3MA 4NXMK 4H0XB 4DV4K 4E7KA 4CGGA 5A2QO 2E88A 2F9WA 3LDNA 3M1FA 3A5OC 1KAXA 1ZBFA 1BQMA 2E2NA 4DTMA 1L3SA 5AQPA 3IMXA 3NHGA 5C12A 3C7NA 4FLXA 4WQ5C 1TGOA 1LW2A 4B9NA 4BR2A 4E7IA 1VSMA 3SV3A 1S1VA 3OYGA 4CF0A 1LAVA 4E1NA 3E1YA 1J5EK 3OYMA 5KGXA 5J2MA 3CIPA 4DFKA 1TYQB 2HMPA 1KCFA 4FVMA 3KZBA 3BF1A 3ZT3A 4YORA 4FO0A 1RTIA 3L4IA 4ILGB 2HHQA 4DV2K 1RT2A 1D8YA 1FW6A 4N56A 5AFUH 3C94A 3L2VA 3E01A 4JV5K 4BE0A 1Q9XA 3AGKA 1S5JA 3J81O 3NCIA 1NKEA 4R79A 4KHUA 4K0KK 4OKJA 1W0HA 1W9HA 1WSGA 2FBXA 4O44A 4Y1CA 3G4SN 1IH7A 2HVHA 1NBWA 1C0FA 2UUBK 3ATUA 4M7YA 3WQUA 4X65K 3ENBA 4ISEA 3CYMA 3AVMA 3QBWA 4FLTA 5LY3A 1YJWN 5GADP 2ZD1A 1WBDA 1WOQA 1HYVA 5IWAK 2VG6A 2O8FB 3RRHA 4FW2A 3H3NO 3FZMA 2NRRA 3TPQA 4CJFA 4DFJA 1BA0A 3IAYA 2A40A 3U3YA 2AP1A 5CR4A 4BRIA 2DPNA 3ZLJA 1E4GT 1EXQA 5F0XA 4JI4K 1FXXA 1XUPO 1QQNA 3NF8A 1NK9A 1MDUB 1S1WA 1VSFA 3QEPA 4HUEA 1ZBUA 5E26A 2D0OA 4I9QA 3TTCA 3ULEB 4M3TA 4N76A 1RBSA 4YHHK 3CD6N 3I56N 4H5TA 4E3SA 3NGIA 3OYLA 1O13A 4JK9A 3VPZA 3B6PA 1X9MA 1VQ8N 1LOTB 4JLHA 2YV0X 3CPEA 3M8QA 1QSSA 5I3UA 3SPYA 4B3SK 5HL7L 1QE1A 3JXUA 1QQCA 4KPYA 1NGBA 3HBTA 4BC3A 4KH5A 3OYDA 2ATQA 1RGIA 1TYQA 3VTIA 2YHAA 1W7AA 2OPRA 4CECA 1OVYA 4ILHA 5BPNA 4DTPA 4MDAA 1VSJA 3L0QA 4BREA 4YOXA 4PKGA 3C6TA 3I8DA 1SL2A 4CJRA 5M1FA 3H3OB 1WSFA 1A5WA 1R0AA 1RNHA 2X78A 1D5AA 3LM9A 3MN5A 1P90A 1RT1A 3CCJN 2YNHA 4JRPA 2BTFA 2F9TA 1XMQK 5T7BA 3CCVN 1GOAA 2P9NB 5I42A 1HYZA 1XI1A 5K14A 5F1XA 3VEXA 3CQ8A 4CBUA 3MMVA 5KQ8A 3NH1A 2P9LB 1E4FT 4CZJA 5AQLA 4IEIA 2F96A 3TARA 3MAQA 3SMPA 1NGHA 4OGEA 1XNQK 3K59A 3AVFA 4O0IA 1RT7A 5JS2A 3RMBA 2FF6A 4BRDA 4BY9C 4KKOA 4KH6A 3LM2A 3IDHA 1JL1A 5BRHA 4H5NA 1HQEA 4AH9A 4OX9K 1VK0A 1S9GA 3M5RA 3SZ2A 2Z1IA 2BGGA 4OO1J 4X66K 3QNOA 1IG9A 4HVJA 4IO9L 1U49A 4KB0A 1QS4A 4MLEA 3D7EO 3MX2A 2VYPA 4H4OA 3IUCA 4IOXA 1I3AA 5AJ3K 4M3RA 3JSMA 4KHYA 4CIEA 4WQ4A 4AM7A 3CCUN 4FJKA 3ULEA 1NKBA 1ZBLA 4LSLA 3FGUA 5AQUA 1U48A 5FPMA 3FLCO 4ICLA 5GAGP 3H6EA 1SL0A 1FKOA 4CW7B 2QM1A 4A61A 3V9WA 2I7PA 2B4JA 4JHDB 5HRPA 3SCXA 4GV3A 5DK5A 3Q7BA 2VG7A 4FL9A 4MFBA 4BVPA 3TR8A 3AVBA 5AQGA 1BIZA 3VQ8A 2O8CA 1S1TA 4BC4A 2OYQA 4CHZA 2G8KA 1D9FA 5I9EB 4IZ9A 3TAPA 2E20A 1VRUA 4CK3A 1NG9A 3VMFB 2P51A 4K25A 3SQ1A 2QI2A 4BDYA 4CHYA 4LF6K 1J54A 5AQSA 1VQ4N 4LC9B 3F5TA 3TAMA 2I7NA 4BRKA 2ITMA 3TWHA 4M3XA 3H1VX 1YUWA 1NGFA 3VQCA 3C6HA 1J6ZA 4FWPA 4MLHA 1IBLK 3CCEN 1XHXA 4DTNA 5E41A 4B8CA 4KHNA 3AA4A 4WFBL 2P9NA 4CGDA 3OYNA 4FWRA 4CEFA 4IJAA 2DFFA 1S1UA 4CCHA 3SLCA 3RTVA 1VSIA 1Y64A 4DU4A 3PLAA 3AO3A 1WNSA 5CYMA 4WE1A 1S72N 4FK0A 1GLEG 2O8BB 2QK9A 3DXKA 3RMDA 1I39A 1NK6A 3OYJA 4UQGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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