4MOZA

Fructose-bisphosphate aldolase from slackia heliotrinireducens dsm 20476
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
PKITRDQVKVPADVLADARETYIDNYMKATQGTGRLMLFACDQKVEHLNGDFYGEGIDISDSDPEHLFKIADQGVCGVMAGQRGLIARYAADYPNVNYLVKMNSKTNLVKTAQDDPYSPQLHDIEAVLAMRDNGVNVVGLGYTLYLGSEYEATMLAEAGQLVAQAHEEGLIVVLWIYPRGKAVGKDEKAPTTIAGAAGVALCLGADFVKVNPPVATEDKTSAENLAVASAAAGRTGLVCAGGSTVEAKVFLQQLHDQIYIGGASGNATGRNIHQRSLDEAVRLTKAISAITLADYDVDRALAVFNGEEDFALHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Fructose-bisphosphate aldolase from Slackia heliotrinireducens DSM 20476
rcsb
source organism Slackia heliotrinireducens
total genus 104
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4mozA00
1G67A 5AHIA 1ME8A 1N55A 2Z0IA 4QM1A 3BG5A 1FBAA 1X1ZA 3WFAA 1AG1O 3MYOA 4I9AA 3IIPA 4JTFA 3PB2A 5D30A 4MY1A 4MFDA 5U7SA 2FLIA 2QF7A 3OG3A 5I3FA 2I9EA 3ZWTA 3QYQA 2VEKA 4O16A 2ZRZA 1JQVA 3HB9A 1KTBA 3VNDA 5AYXA 3P8IA 1FY6A 4P2VA 4X9SA 1RR2A 3G0UA 4YWIA 3MI6A 5BNKA 2JGQA 2X1TA 5ABTA 1ZY9A 4UFHA 1ICQA 1RQBA 2QR6A 1OJXA 1W5QA 3BLEA 4DO6A 3BG9A 3DENA 3G22A 1OX4B 1JRBA 4JTLA 1K8XA 3ZFHA 2R94A 4EOUA 3ZR4A 1G4EA 5I3HA 5HUOA 4NX0A 1O95A 2V81A 2JBMA 1X6UA 3P61A 1WX0A 1Q6RA 5C5YA 1TQJA 3NR0A 5EYWA 3M0ZA 4AH7A 3G3MA 3WK0A 1MO0A 1JR1A 1G6CA 3VE9A 1PHWA 1SO3A 3LGEA 4MUZA 1Q3NA 4YCPA 1LLWA 1I2QA 4JTSA 3NPWA 3F4WA 2YFOA 4ADSA 1Z42A 2HTMA 3RNDA 3KHJA 4TMBA 3NM3A 1XM3A 2VFGA 4MY9A 3S1WA 3EXTA 4MKNA 3EXSA 2WNZA 2YR1A 4ZQOA 1E51A 1KLZA 1OF8A 4UR8A 1EP3A 1QO2A 1LROA 1S3HA 4AXKA 4H3DA 1OFQA 1KA9F 1KM3A 4DO4A 3CWOX 1TIMA 4N9CA 1VCVA 5AN7A 5K9XA 1SO6A 1X7FA 5EL1A 1OFEA 2QAFA 3W2UA 3WJYA 2AQWA 4Q33A 2DZXA 3N9SA 5L9FA 1VZWA 4GBUA 5GVJA 1LORA 1UUOA 1TRDA 1A50A 3GKFA 1TTIA 3MO7A 3LTPA 5CZTA 4I7WA 2A5HA 2NX3A 3B0VC 4CNPA 1D9EA 4JXCA 2DZTA 3W2MA 5F2MA 3O8AA 4O13A 5AC7A 4RXFA 2FQIA 1EA0A 1Q6OA 3SR7A 3UD6A 3N3MA 3ABSA 3UZ5A 3C3NA 1RZMA 5F4XA 3G1DA 1H7NA 5LGXA 3P74A 3R12A 4R33A 2RDUA 4FNTA 1LTDA 3S5OA 5DBUA 1IXQA 1GVFA 4RV8A 1FCQA 4PEKA 1GZGA 2V0TA 4MIMA 3BLIA 3NVTA 4N4PA 4MZ8A 4I7VA 4NNCA 5K9CA 4BF9A 3LTYA 5E0KA 3EKLA 2JKEA 3G18A 3C2RA 3S1VA 4RZ4A 4HNUA 3GDTA 3QZEA 4M6VA 2ZTKA 3EX2A 5EKYA 3NZRA 4M5PA 1GWJA 3NQ7A 2TRSA 5HJLA 3S6DA 3SZ8A 1O5KA 4LS2A 4A29A 2Y85A 3ELFA 2YYUA 1VPXA 3PG9A 3TC7A 3WJSA 1VRDA 4TIMA 2EAWA 1Q45A 2I1OA 3LCFA 4ZMGA 3W74A 3EX6A 4PA8A 4K6AA 3HG2A 1L6WA 5CPMA 1AL8A 3LCGA 5AOUA 3KOFA 3O1NA 3TA6A 3TE9A 3SFKA 3DKJA 3F4NA 1GVSA 4IPJA 4PODA 5AFDA 1YPFA 1G4SA 1UCWA 5E1QA 1L6YA 3Q58A 1YADA 5G1TA 4AWUA 1JCXA 4BI6A 3FJLA 2QJIA 1GJPA 3M41A 2NV1A 1G4TA 3W1MA 1TREA 5FF2A 2E6YA 4C1KA 3WK1A 2J9ZA 3T44A 4N6FA 1CW2A 2NZLA 1FCBA 3HG5A 4K7VA 1ALDA 4ADUA 3PSWA 1DBTA 2AGKA 1ZALA 1RPXA 4TR9A 1U5JA 4D2JA 3C56A 2JK2A 3UWZA 4K7YA 2BSLA 1R30A 1QPQA 1ICSA 2NX9A 3O6DA 4FNUA 1WQ5A 1X1OA 4Q32A 3QPYA 3LB0A 2GVLA 4NXKA 3W6YA 1PE1A 4K38A 1PVNA 2C13A 4IX2A 3BARA 3L2IA 1H61A 5DLCA 3QQ1A 1W5NA 3KRZA 3LRLA 2NUWA 1B4EA 1H50A 2CLKA 2CZDA 2YZRA 4Z1BA 3M6YA 1WOAA 1PHQA 2NXHA 1VH7A 1KV8A 4JYEA 1QPRA 1TPC1 2V5LA 4CQ8A 3QMRA 1OFOA 4GJ1A 3LTSA 1JUBA 3LHUA 4LS1A 3UZJA 3G24A 4PTNA 2ZA3A 3CU2A 2Z1BA 1N8FA 2VEMA 4AB4A 2V9DA 5G2IA 3ATZA 3VFLA 4O17A 3NA8A 3W22A 1WV2A 2E5CA 3UXDA 4JIPA 3B06A 3HG4A 2GPTA 4WXYA 2NUXA 4UMBA 3PBVA 5T26A 3GYEA 3G0SA 3TJLA 1IIGA 3KAOA 3PC0A 5HWNA 5H91A 1AMKA 4IXXA 4M19A 3CB8A 3TROA 2B7PA 1TTQA 2RKXA 3L9CA 3TSDA 2CLEA 3TX9A 3EX4A 2Q8LA 4CQ9A 3P60A 5CPLA 4CNOA 3LERA 1QPNA 4FIQA 4UTTC 4NJIA 4Y90A 3H54A 4PH6A 1YTDA 5AHFA 5TIMA 4IMDA 1UBSA 3MHUA 2CLMA 4S2BA 1Z44A 5CSSA 3NPUA 1KM6A 2OT1A 4JTEA 3BGGA 3W72A 4RCXA 4LUJA 1W54A 3MI3A 2QUUA 6TIMA 3W7PA 3VKJA 4UC5A 1TB3A 2NWRA 3LHWA 4RZ5A 1C8VA 1OK6A 3LHVA 3TC6A 4IOTA 2VEIA 1JRCA 2NWSA 3NDOA 2VOMA 4JS3A 5D05A 2A1YA 2NV2A 4JTGA 3W7CA 2A2IA 5DCBA 4HSNA 2NXIA 5DXXA 2C19A 2E6FA 2QEZA 5EY5A 1F7BA 3RLVA 3CEUA 2Y7EA 4O1BA 2EKCA 2ISVA 2QCEA 3KVMA 4LUIA 2VFDA 2TSYA 4FIRA 3UXAA 3GDRA 1F6PA 1AW1A 3JRKA 4CLMA 4JGDA 1XBVA 5HQEA 3FS2A 3EWYA 4O12A 1GYNA 3R5EA 1LLZA 4LVAA 3M5ZA 2V2DA 2GUUA 3G8RA 1S5WA 2VELA 4O4WA 4XBKA 4UNKA 2VFEA 4EF8A 3P8JA 2XN0A 3TMQA 3O6YX 3UYCA 5LHFA 2QCHA 3W76A 2I14A 1MEIA 2A7PA 1VGAA 1XBXA 1WBHA 4JNMA 4Y96A 1OFAA 2ZZ7A 1K8YA 4M7SA 2Z6JA 1P0NA 3HPSA 5CKSA 1YDNA 1LP6A 5K3VA 4DXVA 1ZJIA 1LOLA 4NVTA 3SGZA 1I2RA 2WPBA 5AC8A 2CU0A 4LNYA 3CM4A 1ME9A 1SZNA 2A7RA 3S5ZA 3LOTA 3TH6A 1AK5A 2BZNA 4N9DA 1DQWA 3L5LA 2X1UA 4JTKA 1M7PA 2ZZ3A 4P61A 4QIUA 1KFEA 5KSWA 3TK7A 1KM2A 4UTTA 4OQVA 1B9BA 3N2MA 1VHNA 3QFEA 5AHEA 4KFOA 3Q37A 1QO5A 3TXZA 1SPQA 2V5BA 3GXPA 2YW3A 5CZJA 3W86A 1DVJA 3TR2A 4GNJA 1JVNA 1P5BA 4FB7A 4QITA 4UNLA 4N6EA 3LM7A 2CZ5A 2GVGA 3AJXA 4NNBA 4JDBA 2GJNA 1V7YA 3HIJA 3SY5A 3DH7A 2C6QA 4DPQA 3NQCA 1H7PA 3RK8A 3NL3A 5D2YA 4LY8A 1VLWA 2X16A 4QJ1A 1Z41A 3CWNA 3VE7A 3FFSA 2FIQA 2ZZ2A 4UFKA 2ZRXA 4JTIA 3T4CA 3USBA 3W07A 1HUVA 3JR2A 1SW7A 3GDKA 3UWYA 4LRSA 4LTSA 3CTLA 3EEGA 3PB0A 1XL9A 3P5YA 3Q94A 3W7HA 2FPVA 3EWBX 3UWUA 3LV6A 1K3UA 3UNDA 3LBMA 1OFPA 2X1RA 4IXHA 4AMAA 4GC4A 1DHPA 3P84A 4Z1CA 4HT3A 3W87A 2WSQA 4O18A 3TMLA 3I6RA 3BW3A 1GTEA 4DBDA 3PULA 3NPVA 3BW4A 4GUGA 2DZWA 3TQ0A 4JDYA 3H55A 2J9YA 1K7EA 3N9RA 2ALDA 3GK0A 3W9ZA 4ORMA 4CCEA 5K2ZA 1WXJA 3MI2A 1SUXA 5HWJA 3GVGA 3CT7A 3S42A 4NJHA 3RFAA 4OT7A 3LRKA 3LX9A 2P10A 3STEA 4O1AA 2PRLA 3IGSA 5K9DA 4CNNA 4O11A 3DI0A 1GYLA 1KFJA 3FJ6A 3HGJA 3DAQA 2QAPA 2QCDB 1CI1A 4AWTA 4BI5A 5FESA 2J27A 1VCFA 4PC8A 2A21A 1DJQA 3M5YA 3IIOA 2YYTA 1LBMA 1OX4A 2CZFA 5MHBA 3UWQA 3P80A 1P1XA 1PS9A 1YDVA 5AC6A 2PRMA 3LCXA 2Y70A 3YPIA 2VFIA 3P7YA 3NM1A 3M44A 5KZDA 2ZFAA 1TV8A 3QC3A 1SW3A 3BVJA 2CLLA 1J2WA 1HO4A 3BV4A 4FX8A 4X3ZA 4WX2A 4FF7A 3LLDA 2QKFA 1T96A 3M43A 4XTDA 5AHNA 1RQHA 1OX6A 1EX5A 3OA3A 1D3GA 1W5OA 3CLMA 3QSTA 3U6WA 4OBTA 2B7NA 3QRHA 4E38A 1H60A 3PBWA 1Q6LA 3LV5A 3W7GA 1R2SA 2H8XA 3QW3A 3W7DA 2V82A 1OABA 3DU0A 1KTNA 1N7KA 4A3UA 4POCA 3TW6A 3C0JA 3H53A 4XWUA 3TQKA 3MHFA 1OYCA 1YXYA 3DBPA 2VENA 2H90A 3D0CA 3ABOA 4OWGA 1GTHA 4O19A 3E49A 5G5IA 1TPH1 3O06A 2BTMA 3STFA 2RH9A 2HSAA 4RLIA 4WJEA 4FEZA 4EIVA 4ZZ9A 4NJGA 3DZ1A 4CCDA 3OHIA 1DV7A 2FPYA 3VCRA 3CIXA 1NAL1 2AAMA 2HS6A 1TPEA 4GFSA 3CHVA 3QEZA 4FXSA 4O52A 4DF2A 1FDZA 4N9BA 2W0UA 2WQPA 3OEXA 4GUFA 2YFNA 3NGJA 3T78A 5KZMA 3PUOA 2X1SA 3TJXA 4ZQMA 5K7JA 3MYPA 1LZOA 4MJZA 2P1FA 2A7NA 1EP2A 2ZZ5A 3GR8A 1F6KA 5IBXC 2WOQA 3W7NA 3WJXA 3LRMA 4O4VA 4ZQNA 3NAVA 2ZRYA 4FX6M 4UMAA 4XKYB 4BFAA 2DP3A 3LCHA 5LNRA 1VYSX 3EWXA 4O53A 3BW2A 3JS3A 2WV8A 1KTCA 4JN6A 3P81A 3I65A 4IQLA 1PV8A 2CLIA 4N4QA 1IXOA 3PAJA 2Q3OA 1YYAA 2C1HA 3SW6A 3TKFA 3LI1A 4X2RA 4YCOA 4RXGA 4JTUA 1THFD 2OT0A 5G1YA 3N73A 1ZHAA 2V30A 1L9WA 2ZRUA 1JUEA 4WD0A 3QSRA 3NQFA 1H5YA 1SU5A 2FPTA 1WYIA 5HWMA 5FEXA 3V1PA 2Z6IA 2B7QA 5G2HA 3LLFA 1LBFA 3DFSA 2YW4A 2ZQ0A 4HSOA 1AW5A 3MBDA 2E09A 2WJZA 1LCOA 4RK8A 1TTPA 1YDOA 1GVQA 4LT9A 3U8GA 1V5XA 2QCNA 2C18A 4K36A 1BTMA 4Y8FA 3GKAA 4QNEA 3T40A 1U83A 1LDCA 3TFXA 3QMTA 1D3HA 3S0CA 3L65A 4MLJA 3R8RA 1WAUA 4EWND 1F05A 1OK4A 1ADOA 1XBZA 3TIMA 4O54A 3EX1A 1LOSA 3TXVA 3FOKA 3I7SA 4J9JA 3NPXA 3HG3A 1VCGA 4LVBA 2NLIA 2OZ0A 3W7KA 3PG8A 4ORIA 3CEPA 5D02A 2GVJA 2XN2A 4DPPA 1MXSA 4FO4A 3RU6A 4AWSA 2DJXA 3C6CA 5A8GA 4K37A 4QISA 2DZVA 1YPIA 3IVTA 3SSJA 1A5CA 3S1UA 1XDMA 4JEQA 2H8ZA 3M9YA 3E96A 1TPWA 1IXPA 3IEBA 2V2HA 3O07A 3RF9A 4NXSA 3GDLA 4WOQA 1HTIA 1TPB1 1B57A 3FKRA 4UTUA 1VC4A 3LCWA 4IUOA 3TW7A 1Q6QA 1KBIA 4C1LA 2Y88A 2H3DA 1OFBA 3LCIA 2C3ZA 1R2TA 2A6NA 4HN4A 3W7LA 4PCFA 1W31A 3QPZA 1HFBA 1FCUA 2X2GA 3CQ0A 3NZ1A 4JR5A 3UWWA 1LRQA 3QJAA 4HNNA 1T99A 4WQ6A 4MZYA 3KX6A 3L66A 3WK2A 3A5FA 4JYFA 3PS7A 4XTIA 3MP3A 1I45A 3NQ8A 5BOOA 2J9XA 3KVLA 3UWVA 1H62A 4IMEA 4IWWA 2CLHA 1VQTA 1RD5A 4GRSA 3TCEA 2TMDA 2KZHA 4XUGA 2J88A 3R2GA 3L5AA 1FCVA 2IQTA 3ABQA 3W71A 4U28A 1YLVA 1OHLA 3A22A 2P0OA 1MZHA 1QDSA 3MP5A 2E5DA 4NX5A 4B5NA 1TYGA 3L21A 4UTIA 2EF9A 5CPNA 2QJHA 2Z2UA 1TSIA 3M16A 1G7UA 3F03K 4OGZA 4IMCA 1B3OA 4AAJA 3G0XA 3W23A 2YX0A 3HOJA 3W1LA 5FF3A 4WUIA 3HO8A 3GXTA 1VS1A 3GAYA 1EWEA 4O0KA 2WSRA 1TTJA 2O7QA 3E02A 1JUKA 5DXYA 4MY8A 1LBLA 4PL1A 3QF0A 2Y61A 2BWGA 3W1RA 4XBSA 5F2LA 4LC6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RW3 A;  3USZ A;  1FBA A;  5BXP A;  3K13 A;  3MYO A;  4JTF A;  1TZ9 A;  3WBX A;  2I57 A;  4GI8 A;  1QI0 A;  1CPU A;  3VXG A;  2PPG A;  2VC7 A;  5I3F A;  3QYQ A;  2VEK A;  4DJE C;  4O16 A;  1E0X A;  4ES4 A;  3KM8 A;  4ZBC A;  2OWX A;  3ENL A;  1IZC A;  3SJN A;  1VPY A;  5PTD A;  1YQ2 A;  4ZOA A;  2JE8 A;  3G0U A;  5IDI A;  3SRD A;  2G3I A;  3EA3 A;  3L7R A;  3MI6 A;  5T8G A;  2OTD A;  2YL9 A;  1PX3 A;  1UR8 A;  2OLA A;  4GAC A;  2XIM A;  2X1T A;  3P3B A;  1KWG A;  4XZH A;  3WEO A;  4DO6 A;  3LG3 A;  4P8W A;  4JEJ A;  4JTL A;  3KBN A;  3UXK A;  1GOR A;  4L6D A;  1OCN A;  4GAB A;  4PYS A;  1G4E A;  1B9Z A;  1WX0 A;  5C5Y A;  3GIP A;  1XKJ A;  4H9U A;  4TTU A;  4AH7 A;  2ISF A;  2CYG A;  1B0I A;  2VVN A;  1JR1 A;  1G6C A;  2J6V A;  3OO2 A;  2FMO A;  1WKD A;  1OG6 A;  3IUH A;  4GYP A;  4UQE A;  4DBU A;  2O56 A;  2YCK X;  1SVD A;  3MSR A;  1ZBK A;  1I2Q A;  5ABH A;  3F4W A;  1BQC A;  3LEN A;  3CAS A;  2Z1X A;  1Z42 A;  1AVA A;  1F8M A;  1VIW A;  2HTM A;  4QQU A;  5C70 A;  5AVN A;  4TMB A;  1OWQ A; 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