4N2Y | Genus

Total Genus 81

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	81
sequence length	209
structure length	209
Chain Sequence	MKQLILALDVMDGEKAMEIAKKVAEHVDRIKVNYPLVLSAGVGIMKRLSEIKPVIADFKIADVPYTSSLIARIAFENSAESVIVHGFVGSDTLREVCRVAEEFGGKVYAVTELSSPGGEEFMSAVSLKIVEKAKEAGCHGLIAPSTRIERLREIRKAAGDMEILCPGIGAQKGSIEAVKYADGIIVGRGIYASGNPAEEARKLRRVLKI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title	Crystal structure of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Archaeoglobus fulgidus rcsb
source organism	Archaeoglobus fulgidus
total genus	81
structure length	209
sequence length	209
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date	2013-10-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4n2yA00

4POCA 3EB2A 4ONVA 1LROA 2H6RA 4ADUA 3MP5A 1VRDA 4UTWA 2E1DA 4E38A 2VC6A 2YX0A 3DFOA 4Y9AA 3EX6A 3LLDA 2C13A 4N02A 3OVRA 3NL3A 1EWDA 3TQVA 2E68A 4NJKA 4LOCA 1IIHA 4NJJA 3W1RA 4LRSA 5E1QA 3UQNA 3L0GA 3G1HA 3IGUA 1ZENA 2YR1A 1LORA 3QMSA 1HO4A 4WXYA 3NDOA 4OV4A 2DJLA 2V81A 4I9AA 2Z6IA 1Q6OA 4O1BA 5KZEA 4YXGA 3QMTA 1F73A 3MO7A 5HMSA 5FF2A 2VEMA 1TPC1 2GQAA 5LNWA 1XBYA 3S5NA 3NPXA 3GR7A 4O54A 4BK9A 3R8RA 3STEA 3HMJG 3DI1A 1QO5A 2QUTA 1SW3A 1JJKA 3TW6A 1KM0A 2DORA 5G4EA 1ONRA 2NUWA 1RVGA 1G7VA 1R2RA 2H3BA 1TB3A 5FF4A 3LCHA 4ZL1A 4ZQCA 4A3UA 2HS6A 2OJPA 4GUJA 4RZ6A 3DFNA 3L0NA 4FHAA 5HWMA 3NPWA 5AN7A 4O15A 3IVUA 2A7PA 2V5BA 3DGRA 2X1SA 1QDSA 1AMKA 3DFSA 4IOTA 5AC6A 1QPNA 1Q45A 3MHFA 4AMAA 3PR2A 3LV6A 3KRUA 4PCFA 3QJAA 3W1XA 2B7PA 4HNNA 4FNTA 2QUVA 3W23A 2QDHA 1EP1A 3E49A 3PG9A 1JUKA 3FIGA 1FWSA 4NX0A 4JR5A 1YTKA 1ZALA 2VFIA 4NNBA 1Q6RA 1B9BA 3JS3A 3KXQA 4UTUA 1I2PA 3QSRA 3VE7A 3STFA 3MBFA 2QCMA 2ZTKA 1VLIA 3PWAA 3RNDA 3OEXA 2DZXA 2CLEA 3IV3A 1KM5A 4AH7A 3P8JA 4CNNA 3A23A 3W7DA 2B4GA 4JTSA 3G1YA 1B4KA 4IQLA 3W73A 1S5TA 4MYXA 3PSVA 1B57A 5AHIA 1DJNA 1TJRA 3DKJA 1R46A 3A9IA 4PL2A 1VPXA 2V8ZA 1YPIA 4HIBA 3CIXA 3O07A 2GPTA 2E6FA 3F03K 5DY2A 1F05A 4JTGA 4P61A 4QSHA 1VH7A 3HJZA 2G97A 4TMCA 1SZFA 4OU1A 4MZYA 4U28A 4M6PA 4PODA 1TPVA 4Z1BA 1ML1A 3NQDA 1YTEA 1JUEA 3SZ8A 2V2DA 3UWZA 3B04A 3W6YA 1EB3A 2R94A 1GYLA 2CZEA 4GFSA 5LGXA 3G24A 4K39A 4QNWA 3W1PA 3P84A 3NEVA 4XZ9A 4WXZA 5D05A 5G2HA 1VLWA 1SR9A 3OBKA 4Y8FA 1QOPA 2ABAA 1YDOA 3KHJA 1JULA 2VFEA 3NZRA 5F4SA 2GUUA 3HGRA 2WSQA 5FEWA 5FI8A 2TRSA 3SI9A 5FEZA 4G1KA 3NL2A 1KM6A 4UTIA 3M5ZA 3GDMA 1QMLA 4WY0A 1KLYA 3BW4A 1DQWA 3L0KA 3PBWA 3W85A 1F74A 1PVNA 3WK1A 3NZ1A 1FCVA 2Y62A 3G22A 4HSOA 2A6LA 3NXFA 5D2WA 2GJNA 4NUWA 3RMJA 3TQKA 3TSMA 4UTTC 2J9XA 2VENA 4S1FA 3WFAA 1QPOA 2NUYA 3GAYA 4IXXA 2QCGA 1OFRA 2PRMA 4JX5A 3M47A 1UCWA 4MY8A 1LRQA 3G0SA 2A5HA 4UTTA 1TIMA 1OFAA 5IM51 3OHIA 3B0UX 3EX2A 2VELA 1W1ZA 3ABQA 3ATZA 2O7QA 5LNSA 3UNDA 4K37A 2FJKA 1V7YA 1JCNA 1VS1A 8TIMA 3VFLA 3M43A 1QPQA 1WBHA 3M5YA 5BOOA 2IQTA 2WNZA 1ZFJA 1XCFA 1TPFA 5DXYA 4EF9A 2EKCA 4Z0JA 3BK0A 3BLIA 1WV2A 5D2YA 3MHUA 1FXPA 4HN4A 3QRHA 3QPZA 3SY5A 1BEUA 1GPWA 1S3HA 3W2NA 3TC6A 5LKYA 2C14A 4MJMA 1KFCA 3WJZA 4EF8A 4O13A 1W31A 3O06A 4C1KA 3CTLA 3GDLA 4JDBA 3G1VA 3LRKA 2EAWA 1LRTA 3UD6A 3BW2A 1W5QA 4O28A 3PG8A 2KZHA 1VQTA 2J27A 5L9FA 3N2XA 1GVRA 1QR7A 1K7XA 1GJPA 3FA5A 1KFJA 1K7FA 1TPDA 2X16A 3OA3A 2J24A 5HINA 1T0OA 3DXIA 4O1DA 1TPWA 2Z2UA 1DOSA 4MPQA 4IPIA 1X1ZA 3HOJA 3W22A 2QCEA 5T26A 4O4WA 3S6DA 1D3HA 2ZZ2A 2XN1A 4FNPA 3G1AA 4Z1DA 3KFTA 1B4EA 2YDAA 3V1PA 4UTHA 3CWOX 2ZRWA 1VCFA 3PAJA 3HG3A 3W1MA 2DU2A 4JIQA 2Y6ZA 4XWUA 1WOBA 5D09A 1HG3A 3C2EA 5G1YA 4QQ3A 2ZDRA 4K7VA 1JRBA 1KFKA 2QEZA 1EP3A 3T40A 3W2UA 3PBYA 1IXPA 3RU6A 2ZA1A 2YW3A 1SO4A 4QJ1A 2NXGA 2QDGA 4MYAA 2ZRXA 1OFOA 4Q4KA 1FWWA 3C8FA 3NQVA 4BF9A 1O94A 3W7OA 3HGOA 2XN2A 1P4CA 3QW4B 1O5XA 4CQ9A 3B05A 3FLUA 4MZ8A 4C1LA 1DL3A 1H50A 1UUMA 2TYSA 3M7WA 5U4NA 1M7OA 1LTDA 1N55A 1WA3A 4IMFA 1ICPA 1OX4B 2F84A 3H55A 4UNKA 3VI2A 1ME7A 1X6UA 3GXNA 1RZMA 1S5WA 1NSJA 3UWYA 5HJLA 3DHFA 2OT0A 4GUFA 2B7OA 3W1TA 3W7CA 3NQ6A 2X1RA 3MI6A 4LS0A 2A7NA 4J9JA 3IGXA 2GVLA 2Y63A 3MMTA 3NNTA 3C61A 3W7JA 1CX9A 2ZFAA 3P67A 1B3OA 4UTLA 3TK7A 3NPVA 3L5AA 3USBA 1FQ0A 3HG4A 1TPEA 5FF0A 2O7SA 3C6CA 2WJZA 3LBCA 2WNNA 1AG1O 3NQ2A 1PHQA 3TMLA 4K36A 1H63A 5KZDA 4NXKA 1F2JA 1WOAA 2E6AA 3WJYA 5HWJA 4NZJA 3KOFA 2NXHA 4GUIA 2ZQ0A 3MW7A 4IX0A 3R89A 3W1QA 1FWTA 5G2IA 3W76A 4MY1A 3FEMA 1OFPA 1JR1A 2Z0IA 3I7QA 4E2DA 1SZNA 4DO5A 2DZPA 5MHBA 3LBMA 2RHGA 4O53A 2Y88A 4IJBA 1EA0A 5DLCA 4AVFA 4OV9A 3BLFA 2Y61A 2EGZA 3EX3A 4ZVJA 4TO8A 4M6VA 4LVBA 5AFDA 2W0UA 3GX9A 3H54A 4JXCA 3OVQA 1O4UA 3W7RA 2QCNA 3TX9A 4WD0A 3LHUA 2R14A 2J88A 2Q3OA 1TPH1 4PTNA 1F5ZA 3T7VA 1FDJA 1H7XA 1SU5A 2NXIA 4LV9A 4LU0A 3L21A 1ZAHA 3DBPA 3PY2A 1FCBA 2E5BA 1SO5A 3QQ0A 3U6WA 6TIMA 3PB2A 3F4WA 3PVFA 5CKSA 4PL1A 4N9BA 1YDVA 4NX5A 5I3KA 4RR4A 2GVGA 5FESA 4JS3A 1H51A 3TCEA 3C2FA 3GK0A 6ALDA 1W5NA 2WQPA 1I2NA 2EF9A 4IMCA 1AW1A 4NT0A 3EWXA 2A7RA 4LS1A 4KFOA 1EUNA 3SIZA 2NV2A 1QPRA 2RDUA 2NV1A 2ZZ5A 3TAOA 3NGJA 3EEGA 1KM3A 1SUXA 3QQ1A 1WXJA 4HNVA 3BLEA 2WOQA 5BMWA 3PBVA 4M5PA 4HPJA 3EXTA 1FCQA 2AGKA 2RDWA 2CLKA 4CNOA 3BW3A 1O60A 4Z1CA 4IX2A 1QFEA 4MFDA 5D04C 2RFGA 2A85A 3E0IA 1I8JA 4MUZA 2DZTA 1NAL1 1OHLA 4IMDA 4E0CA 4DF0A 2QCHA 1VR6A 2FDSA 1TPUA 4FB7A 5KMYA 1NFBA 3S9YA 4ORIA 2WO5A 3NQFA 4IXHA 4JYEA 1SSDA 1W3IA 3LCIA 5HQEA 4O0ZA 3TC7A 3LCFA 1ICSA 5LNVA 1XDLA 4O1AA 2V30A 4FIQA 3IGSA 1LYXA 1ZJIA 2V2HA 1KTCA 2ZBTA 4QNEA 1SO6A 3W9ZA 3ZWSA 1A5BA 4QISA 5AHMA 1TYGA 1TJPA 4EOUA 3N34A 4O8RA 1I2RA 3M0ZA 3RK8A 4XBSA 1K8ZA 3MWAA 3QEZA 1LCOA 2BXVA 2CLOA 3TJXA 1K8YA 3FYPA 4LY8A 1IIGA 2GQ9A 1E51A 5E93A 3TV8A 1OK6A 4MIMA 3W2KA 3G0XA 4JD4A 3W2MA 3L65A 3THAA 4ZQNA 2CZ5A 4H3DA 4N6FA 3G18A 1KFEA 5I3HA 4AEOA 2CLFA 3E96A 1BTMA 2ATMA 3QFEA 1DKWA 4UFIA 5E0KA 1GEQA 3GNNA 3UWQA 1YTDA 1X7FA 3GNDA 4OHQA 1TQJA 1C9DA 5F2IA 3TE9A 1QNVA 1W3NA 2HS8A 4LC6A 3EWBX 3S5YA 3PC0A 3R5EA 1KFBA 1SSGA 4UTJA 3DU0A 1Z41A 3MBDA 3NM1A 3FYOA 1TV8A 5FF3A 3ABSA 3N9RA 4O12A 1DJQA 5D37A 3W7EA 3W7MA 3UY8A 3HG5A 4RZ4A 4HNUA 2QJIA 1AW2A 1A53A 3NPUA 5KTLA 2H8ZA 2YYTA 3W7NA 3EX4A 4RK8A 4N2YA 2CLLA 2C15A 2OMAA 5K9DA 3P80A 3TAKA 3QSTA 1FDZA 5FF7A 4YLWA 3LOTA 3TXZA 1KBIA 4UFLA 5C6MA 3I6RA 5BRBA 1DVJA 3L67A 4DO4A 2FTPA 5DCEA 1LBMA 4S2CA 3MP4A 5KINA 2R91A 1T8XA 5HWNA 1PHWA 5TIMA 2QCDB 5AC7A 2QJHA 5K9CA 1EWEA 3T78A 1CI1A 1TRIA 3GB6A 4WOZA 2P0OA 3P8IA 2PRLA 1F7BA 3B0PA 2C19A 4JTLA 1LBLA 5HR6A 1OFBA 3LHZA 2ALDA 1H1YA 1OYCA 4GNJA 1I4NA 4KFNA 1U83A 3RFAA 3LV5A 4R33A 1OX4A 3MYPA 5HUPA 3S1XA 2YW4A 3W2JA 5I3FA 2TPSA 4LTSA 1ME8A 1VJIA 3EKLA 1SPQA 3MI3A 2HTMA 4FNQA 1THFD 4HSNA 1OK4A 3W1UA 1RD5A 4ICNA 3A21A 2GQ8A 3PS7A 3FKRA 3F1QA 4GBUA 4N4QA 3G8RA 4AHPA 4X3ZA 3O6YX 5U7SA 3HPXA 4W9TA 5C54A 4EIVA 1KA9F 3TMQA 1TCDA 4AWTA 1KV8A 1VZWA 1PV8A 1M5WA 4HKPA 1EPXA 3EWWA 3NQAA 1LOSA 5G2WA 3G1XA 5EL1A 3C3NA 3GZ3A 5EY5A 3Q2DA 2HMCA 1XKYA 3GDKA 2A4AA 1MEIA 3VE9A 3NR0A 1K7EA 3M44A 1W56A 4U4MA 4BI7A 5DBTA 3WJSA 3LLFA 4AWUA 1OFQA 3R12A 4K8HA 1H7RA 3W7GA 2V9DA 3EXSA 4RXFA 1W0MA 4PFMA 2ZZ3A 4JDYA 5DCBA 4EWND 1X1OA 3IIZA 4LUIA 1NEYA 2I14A 3W83A 1K8XA 4FO4A 2W6RA 2VOMA 4Z0SA 2JKAA 5F1UA 3TDFA 5AHFA 3I68A 3DENA 4GRSA 1OF6A 1T96A 1ALDA 1OYBA 3GDRA 4QAIA 2PURA 1KFLA 4ZQPA 2TSYA 4MVAA 4EVZA 2J9YA 2QCLA 2YPIA 2FLIA 4YL2A 3YPIA 3W88A 1ICQA 1FUYA 3W7IA 3P82A 4NJHA 2A0NA 5D2TA 1G4PA 4AF0A 1W3TA 3P7YA 3C2OA 1NF7A 4IWWA 3UPBA 2W79A 4ZQRA 5A5WA 3BG5A 2CW6A 1TREA 1XBVA 3MUXA 4ML9A 2TMDA 2VXNA 5HUOA 2YYUA 1D9EA 4ZQMA 3MYOA 1EIXA 1KM2A 4JIPA 4RZ5A 4UR7A 2JKEA 2X1TA 1PS9A 2DJXA 3DAQA 2RKXA 3W71A 1Q3NA 4JGDA 1WYIA 3R13A 4JY9A 3V75A 4FIRA 1XUZA 4N9CA 2FPVA 3I65A 3LI0A 4UFHA 1VYPX 2R8WA 1AL7A 4CLMA 3L2IA 4LVDA 2RH9A 3HBLA 2A21A 4BI5A 4N9EA 2GJLA 5C55A 1GG1A 1Z42A 1GVFA 2BWGA 2C1HA 4TIMA 3UXAA 3KAOA 3UWUA 3SGUA 4LS2A 4N4PA 4LWWA 4MY9A 4TMBA 2X30A 3LTYA 4JICA 3LX9A 3BG9A 2Q3RA 3M1ZA 3K30A 3W1NA 1GOXA 5K3VA 1H7WA 3BGGA 5HR7A 2CWNA 2UV8G 3IIOA 2FFCA 1QO2A 2QCFA 1LOLA 3B4UA 4UCGA 3A22A 1OVDA 2B0MA 1ZAIA 3BGJA 1MEHA 4R7JA 2CZDA 1FBAA 4WOQA 1KTBA 2G96A 3GVGA 2FQIA 2PE4A 5LGZA 2J6XA 4JTHA 3T44A 4K8EA 2ISVA 4X2RA 1HO1A 1RR2A 3NQCA 3IVSA 5J5RA 4LVGA 3NQGA 1SW0A 2NWSA 4IUOA 4AAJA 3C0JA 3HGJA 5K9XA 4KKXA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4N2YA

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