4N6EA

Crystal structure of amycolatopsis orientalis bexx/cyso complex
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
244
structure length
244
Chain Sequence
DEPWLKIGAREFRSRILVGIEQYDSVPLVRDVLNAAGADVFITTVDPDNRRSSLLLMDLADELPLDDFTWIGTTSFARTKESALRSARILRDSLGIEILKLDVRGDDNTPDNAGTVEAARELRAEGMELLPFILPDLATARALEEAGCAALRVMASPVASGRGIANPAAIRELIEQIGIPVVVEGGIGSARHVAEAMELGASATLVNTALVRAESPLLMAAAMRQAALAGLLSYESGPMPEVAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/biosynthetic protein
molecule keywords Putative thiosugar synthase
publication title Co-opting sulphur-carrier proteins from primary metabolic pathways for 2-thiosugar biosynthesis.
pubmed doi rcsb
source organism Amycolatopsis orientalis
total genus 80
structure length 244
sequence length 244
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05690 ThiG Thiazole biosynthesis protein ThiG
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4n6eA00
2Y89A 1UUOA 1VHNA 2DZTA 2CLHA 3LXAA 4AHOA 1GG0A 1PS9A 3MWAA 1LYXA 5F2IA 3EWZA 2FDSA 3EWWA 2HSAA 4IMEA 3W1UA 3A22A 2ZYFA 2ZZ2A 4DBDA 3LI1A 3W2UA 4A29A 4UFKA 1QNVA 3I7RA 3W84A 5G5IA 4C1LA 2CLOA 1KM1A 5C5YA 2FQIA 3QPYA 3ELFA 3L5AA 2C13A 1TCDA 2E6AA 1GWJA 4TR9A 4BK9A 3BW3A 3DAQA 3W7PA 7TIMA 1L6WA 1S5VA 5KINA 3FJ6A 2W0UA 3W2LA 3KFTA 2ZA1A 4ADUA 1AK5A 2VKZG 4PC8A 1IGSA 1J5TA 2TSYA 4MFDA 1H1YA 4RJEA 1K03A 3LCXA 4M7SA 3S1VA 4LT9A 1YDNA 1DORA 4NU7A 4HPXA 5D05A 4Z08A 3M44A 4FIRA 3GAKA 3HG3A 3NR0A 3S6DA 3IIPA 3V75A 4M6VA 1GYLA 4RZ5A 2QDGA 4GC4A 1TQJA 2A7PA 4U4MA 5EYWA 2CZEA 2FB3A 3CEPA 1A5SA 3B05A 6ALDA 1IXPA 1WDWA 3T44A 3N9SA 4OGZA 1Q45A 1W5OA 4HN4A 2ZZ1A 4LRSA 1QAPA 4NJIA 3R12A 5HQEA 2WV8A 5CZJA 4UTTA 1B4KA 2YZRA 4IMDA 3MHGA 1WV2A 1GEQA 3NL2A 4O0KA 4EF8A 4IMCA 2A4AA 4UTWC 5LGZA 2Z1BA 2E5BA 5FF2A 5I3GA 3N2MA 2ZRWA 4UC5A 4K39A 1S3HA 1TPVA 5I3KA 3MBDA 4S1FA 3LTPA 3LTYA 1K8YA 3OEXA 3IRDA 3L9CA 4O11A 3W1RA 5K2ZA 5FI8A 3UZ5A 2BX7A 2VFGA 3K30A 1YTKA 3JRKA 4UFIA 1IXQA 3W7EA 2P0OA 4I7WA 3OVPA 1K7XA 3NPWA 4JICA 1HL2A 3LCWA 5I3JA 3WJZA 5K4ZA 5E1QA 2ZRVA 2HS8A 1K02A 3DGRA 4IUOA 5EPDA 2ZZ6A 3LCLA 5CPMA 4HHPA 3KRSA 1O5XA 4E2DA 1QO2A 5AYXA 3P67A 1BWKA 4OT7A 5KSWA 1VHCA 2F84A 3CIWA 3E12A 4JTLA 3DHFA 3PSWA 2Y63A 3LRKA 3W6YA 3L0GA 2C14A 3WJYA 1GVOA 2VENA 1GTEA 3LCGA 3S9YA 3HPXA 1W5MA 4UTWA 4HNNA 3NA8A 3G1DA 4DPQA 3P80A 1KFEA 4M19A 1LBLA 2JKPA 1JUEA 2VOMA 2YR1A 3DFNA 3P84A 4NT0A 1OG0A 3S5YA 3FEMA 1DOSA 1VYRA 1H62A 1YLVA 1K3UA 2R14A 1LOSA 1SZFA 1TIMA 1P1XA 3STGA 4GFSA 4M6QA 5HWNA 1R47A 2H8ZA 5CG7A 2RDUA 1LRNA 1GVQA 4NX0A 3F03K 1XBZA 3I68A 3S8HA 4CNPA 2WSRA 2A7NA 3M9YA 1I2OA 1EWEA 3BW4A 5MHBA 1LBFA 1LCOA 1RD5A 1QPNA 2V30A 1XL9A 2PRHA 2GPTA 5BRBA 4X9SA 4MY9A 4NVTA 2VXNA 2C1HA 4JDYA 2B0MA 5D32A 3N3MA 3O15A 1GG1A 1QMLA 1VQTA 3GAYA 1DJQA 1OHLA 2C3ZA 3FFSA 3PVFA 4E0CA 1HUVA 2O7SA 4E38A 4GUHA 1W54A 3C2EA 1HO1A 4GBUA 4MOZA 4QITA 3OVQA 2VEKA 3LDVA 3NNTA 1YTEA 3NQ8A 2E09A 2ZA3A 3KAOA 3I6RA 4HSNA 3QH2A 4O50A 1ZY9A 1G4TA 2JGQA 3KRUA 3PAJA 4NNAA 3L68A 1F05A 2A6NA 3C4UA 3Q2DA 4FNSA 1AL7A 1FDJA 4RXGA 5F2MA 1GTHA 1JCLA 1MO0A 4CNNA 2QCHA 3IVUA 3STEA 3A23A 4N02A 4RK8A 4UMAA 4MYAA 4PFMA 1FDZA 4XTIA 1EP1A 1OYBA 2QKFA 3L5MA 4UNKA 1OK4A 2NUYA 1K7FA 1WOBA 3GK0A 1D3HA 1KA9F 2Q3OA 1KM5A 4O14A 3NQGA 4L4LA 4YLWA 4RV8A 3LCIA 1L6YA 3N34A 1SZNA 4DO4A 3MUXA 1KLZA 3IIVA 4K38A 3W1NA 5KITA 1LROA 1RPXA 3WK1A 4A22A 1EX5A 3GLCA 4A3UA 4JR5A 4KFOA 3BG5A 1ML1A 1OVDA 2EF9A 2CW6A 3GR8A 4JYEA 4O17A 1SQ7A 2J24A 4O54A 3HJZA 1IXOA 1VC4A 3ABSA 3P5YA 2FPTA 2QJIA 3ZR4A 3G18A 1OFAA 2Q8ZA 3O16A 2X2GA 3HBLA 1YYAA 3MW7A 1PE1A 4LNYA 1N55A 4LS1A 3O05A 1KTBA 1FWWA 3GXNA 4FEZA 2QUVA 2WSQA 1B3OA 1QDSA 1TTQA 5G1TA 3U6WA 2BSLA 3SJ3A 1TPB1 1P4CA 3MYPA 1RR2A 5E93A 1KLYA 4O57A 3G1AA 1IXNA 5K9XA 5G2HA 4DXVA 5A5WA 1H60A 2Y88A 3NQ7A 4XWUA 3LRLA 2E6FA 4A2SA 2VFDA 1ZALA 1VRDA 2B7QA 3PB0A 3PF3A 3NYZA 4PH6A 3CLMA 4BF9A 2JKAA 2ZDRA 1W5QA 2FLIA 3IVTA 4K36A 1D9EA 2WNQA 3NQFA 3TJXA 4R33A 5G4EA 2BWGA 4Z1AA 3H54A 1IIGA 1PIIA 2YFNA 3Q58A 5BMXA 1Q6LA 2V5LA 4MFEA 3G1YA 1O60A 5FF7A 1Q6OA 3DFOA 3BLIA 4LS0A 4O0ZA 3DENA 5CZSA 3EX3A 2J9ZA 3EWXA 1R30A 5K3VA 5HR6A 3G1VA 3IIXA 3FA5A 4DBEA 5BNKA 4WOZA 5LKYA 1SPQA 3Q94A 1ICQA 3G0SA 5HWMA 4UTIA 3PR2A 4LRTA 3KHJA 2A85A 3KOFA 1MEWA 4AHPA 5AHMA 1XKYA 1VZWA 3LBCA 1TB3A 4JDBA 4MY1A 2DZSA 5DELA 4JD4A 3V1PA 5LNRA 5FESA 3UY7A 1H7OA 3TAKA 1TV7A 1BEUA 5BOOA 3S5NA 3TW7A 2QJGA 2ISWA 3GIYA 1DQXA 1ZAJA 4O1CA 5AHEA 3UYCA 3TW6A 3P5ZA 1TQXA 4NJKA 3T7VA 3P61A 1F7BA 1I45A 5L9FA 4OWGA 1JVNA 4O18A 1U83A 1QR7A 3P62A 5LZLA 5DCDA 4IQLA 1RQHA 3FJLA 3LHTA 3GB6A 3PBUA 3W7CA 4UFJA 2R94A 4ZQRA 3CTLA 3LHZA 1MEHA 4LV4A 4TO8A 3EXTA 5BW6A 1YDOA 2VFEA 5KZMA 2Z2UA 2DU2A 3JS3A 4MKNA 4PODA 5D38A 4ZQNA 3GVGA 1RV8A 2JKEA 3THAA 3B0UX 4K6AA 4O12A 1H61A 2R91A 5C2XA 1EIXA 1JCNA 2PURA 4NJHA 4ICNA 1P0NA 5HR7A 4FNTA 3EKLA 3W73A 1PV8A 1H1ZA 3GYEA 3MP4A 4N4QA 1FY6A 1KM3A 3M1ZA 3MI6A 2CU0A 4FX6M 1OFEA 4EVZA 1G7UA 3O6DA 4YWIA 3QSTA 3P8IA 2FB2A 1J2WA 3WK2A 1P0KA 3MO7A 1KM4A 4AVFA 4RX0A 3LB0A 3CIXA 5KZDA 1VCVA 1ME7A 1QWGA 3E02A 3GNNA 1SU5A 3S42A 1E51A 4QAIA 2GVGA 3H55A 3VFLA 1K7EA 2J6XA 2ISSA 3SSJA 3QEZA 1WXJA 3TIMA 1FQ0A 4JTFA 3A5FA 1PCKA 1X1OA 3W23A 3N14A 4BR1A 1T0OA 5D30A 3NM1A 3YPIA 2A5HA 2X1RA 5TQLA 3P7YA 2V81A 3TCEA 3OIXA 1H50A 3TV8A 3QF0A 2X30A 3LCHA 3HQ1A 4JTHA 3BGJA 3OBKA 2V8ZA 4HSOA 2DJLA 1JUKA 5AFDA 2Y70A 2QEZA 4K8HA 3CB8A 3MJYA 3TFXA 3W07A 1C8VA 3NQVA 5AN7A 3STCA 1QCWA 2H6RA 1UJPA 4OHQA 4UTTC 4U28A 3MP5A 1JRCA 3JR2A 3FLUA 2VEPA 5AHFA 1VYPX 3O1NA 4AEOA 3M5ZA 2NV2A 1LRQA 2GOUA 4FNUA 3LLDA 2VFHA 3LXBA 4UMBA 3T78A 2VC6A 2P10A 2HTMA 1PHQA 2JBMA 4PA8A 2CLFA 2YCEA 2ZZ3A 4X22A 2ZZ5A 3UPBA 5TIMA 3TAOA 1XXXA 3BW2A 4LV9A 2V2HA 1AMKA 4H3DA 5FEPA 4FX7A 3W7RA 2NXGA 2YSWA 3LHVA 4CCCA 4TIMA 3P74A 4LOCA 1K8ZA 5GVJA 3DH7A 1MEIA 5AHNA 3W75A 1X8FA 4TMBA 4N9DA 1JCXA 2VELA 3PB2A 3W86A 1DKWA 3PS7A 4JNMA 4Z1CA 1XUUA 4O53A 1DL3A 1I2RA 4JTKA 2G96A 4JXCA 4OV9A 3LHYA 3MMTA 3TQKA 4Y90A 3W7LA 1R2RA 3W2KA 4ADSA 1FCVA 1QFEA 4FX8A 4WXYA 2QCLA 4NNBA 2G5WA 3DFQA 4UFHA 3UWQA 4POCA 5D2WA 1W0MA 4RLIA 1VR6A 5CPNA 3WFAA 2QCFA 1W5PA 3M47A 1FXPA 2WNNA 2WO5A 2QR6A 4O8RA 3FOKA 3L66A 2ATMA 4LWWA 2KZHA 4QIUA 3W2MA 3A5VA 3O63A 4GRSA 3NPUA 4DF0A 4UIOA 2V2CA 1GVFA 3VNDA 1AW1A 4C1KA 1FX6A 1FXQA 2GQ9A 1R46A 2LLEA 1SSGA 1DVJA 3L5LA 5CPOA 5DY3A 3MI3A 1I2PA 2YW3A 5DXXA 1FUYA 1JJKA 3PULA 3D0CA 1B4EA 3NEVA 3ANYA 3B0PA 3O07A 3O6YX 3S1WA 1YXDA 3LCFA 4HNVA 3M43A 3W83A 1VH7A 2NLIA 2YPIA 4N6FA 4DELA 3M5VA 3W1TA 4MUZA 1MXSA 1TTIA 1SFJA 2P1FA 3W1PA 3W7HA 2NUWA 1N8FA 3PBVA 4ONVA 2RHGA 3W1LA 4MZYA 1I2NA 2ZQ0A 1VGAA 2ZFAA 1WQ5A 3RLVA 4N9EA 3W76A 1IF2A 3W1QA 4AWTA 3FKRA 2A2IA 3HG5A 5K9CA 5LNWA 3NPXA 4L4MA 3UWYA 2ATSA 2WNZA 2D73A 3GDRA 4FNRA 1TV8A 5DBTA 5D37A 3VE7A 1W3NA 2XN0A 5EY5A 1RQEA 5LSMA 2C19A 4MY8A 4EF9A 3I7QA 1GZGA 1JCMP 4N9BA 1FWTA 4AF0A 3F4WA 1W3TA 3FYOA 1T96A 1SZGA 1QPRA 1B9BA 1H5YA 1QOQA 3NPVA 1M5WA 3TC7A 2QCCA 1YPFA 4JTUA 4UR8A 2E1DA 2Z6IA 2A21A 1XUZA 3E96A 1ICSA 5ABTA 4AHQA 1RZMA 2A1YA 5FF4A 1BKSA 2NX1A 2PRMA 4XTDA 1WYIA 4WY0A 4JEQA 1H7NA 4LC6A 2NX3A 5D2XA 3C2OA 1W3IA 2BXVA 5A8GA 1TRIA 1EB3A 1GPWA 3QW3A 1FDYA 4D2JA 2V5BA 1OK6A 2EGZA 3NM3A 3VKJA 1GT8A 5CGQA 2H90A 1GQNA 3WJWA 4XZ9A 3HG4A 4NJGA 4KWVA 4UFLA 1VPXA 2B7PA 3W2NA 1MZHA 2VFIA 2DZVA 3S0CA 2J9YA 3GDKA 3W7JA 1FWSA 3Q37A 1G4SA 5D02A 2GUUA 3SGUA 4JTGA 3UD6A 5J5DA 4CCEA 3B06A 6TIMA 3BG9A 2GQ8A 3ABRA 4A21A 3LLFA 4LW7A 3PWAA 3I65A 3R8RA 1TMHA 4R7JA 3VI2A 3GX9A 1T8XA 3LRMA 3NL6A 2NWSA 1H7WA 1ZENA 2X1UA 3HIJA 1OX4A 1UB3A 1PCWA 4B5NA 1GYNA 1THFD 1F73A 5AC6A 1R2SA 2Y62A 4JYDA 3SZ8A 1KTCA 1TJPA 1EUAA 2ZTKA 4JN6A 3C2RA 5HMSA 2GJNA 1DHPA 3PBYA 3QMSA 1OYCA 4DPPA 2NUXA 1SW7A 3HO8A 4O1DA 3HGRA 3LHWA 4DF1A 5CZ0A 1G4EA 4YCOA 4I7VA 4MJZA 1XDMA 3P81A 3R2GA 1EUNA 3QM3A 1YDVA 4MZ8A 4O4VA 4O4WA 2QDHA 2GVJA 4RCXA 5CPLA 1XC4A 1EA0A 1G6CA 3M16A 3C3NA 1YXYA 3E9AA 2CWNA 3EWUA 3NAVA 3W88A 3WK3A 3G1SA 1KBIA 4H4IA 4X3ZA 4Z1DA 4O1AA 1XBXA 4UFMA 5T26A 3KVLA 4DQWA 3W7DA 3GZ3A 4K7YA 1QPQA 3C0JA 3NQDA 1A5BA 4HNTA 3DKLA 4EOUA 2OT1A 3M5YA 4FXRA 1ZJIA 1UUMA 5I3HA 2YDAA 2DZWA 2BTMA 1TPFA 3LV5A 2ISVA 2YGYA 2O7QA 4KKXA 4N6EA 2AGKA 4IPJA 1OF8A 3S1XA 4K8EA 4NQ1A 2ZRYA 4O19A 4UTJA 1F74A 1OABA 3PM6A 1NF7A 1TPDA 1WOAA 3RFAA 4IX0A 3T55A 3WJSA 4MZ1A 1LLZA 2QF7A 4PCFA 4GNJA 1LDCA 1WX0A 3L2IA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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