4N6F | Genus

Total Genus 82

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	82
sequence length	242
structure length	242
Chain Sequence	DEPWLKIGAREFRSRILVGIEQYDSVPLVRDVLNAAGADVFITTVDPDNRRSSLLLMDLADELPLDDFTWIGTTSFARTKESALRSARILRDSLGIEILKLDVRGDDNTPDNAGTVEAARELRAEGMELLPFILPDLATARALEEAGCAALRVMASPVASGRGIANPAAIRELIEQIGIPVVVEGGIGSARHVAEAMELGASATLVNTALVRAESPLLMAAAMRQAALAGLLSYESGPMPEV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Putative thiosugar synthase
publication title	Co-opting sulphur-carrier proteins from primary metabolic pathways for 2-thiosugar biosynthesis. pubmed doi rcsb
source organism	Amycolatopsis orientalis
total genus	82
structure length	242
sequence length	242
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-10-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF05690	ThiG	Thiazole biosynthesis protein ThiG

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4n6fA00

4DQWA 1CI1A 3E12A 3EEGA 1M7OA 5LNSA 4K37A 4CNOA 1TV8A 1UJPA 4GWEA 4LVFA 3UPBA 3A24A 3HPXA 2RHGA 1VH7A 2VEIA 2YW4A 3QPYA 4HNVA 3STFA 1TPEA 3EX1A 3MW7A 3OVPA 5G2WA 4O10A 3VCRA 1G7VA 5CPOA 3DI1A 3LXCA 4ADUA 1KM6A 3TMLA 1JRBA 4NXKA 1OF8A 1UUOA 3RNDA 4DXVA 2WSQA 2WPBA 3B8DA 3HB9A 4BWLC 3NL5A 1TB3A 4BF9A 4QNEA 1KFKA 2A0NA 1N7KA 3QSRA 4ZQRA 3TW6A 4JS3A 2QCCA 3HG3A 2P10A 2VXNA 5LNUA 1O60A 2JGYA 4JX5A 3M44A 3HGSA 3F03K 3NEVA 3TC7A 1OFQA 2GOUA 4YMZA 3PB2A 4N6EA 3WJYA 3PBUA 3G1AA 4N9DA 4AEOA 1ZHAA 2PC4A 3PWAA 1KM1A 2GVLA 3LHVA 3VNDA 3ABQA 3DFOA 4JNMA 5TIMA 3VE9A 3T4CA 2YR1A 5EKYA 4NNBA 4Y90A 2RDWA 4POCA 4DF0A 5HWNA 2J27A 3NG3A 1DHPA 1WAUA 2BWGA 3ABOA 2UV8G 4W9TA 2C18A 4OE7A 3W88A 1F5ZA 2OMAA 3W85A 1LBMA 3LBMA 1EP3A 1AL8A 3VI2A 1H7OA 3G8RA 5LHEA 3DXIA 1VYSX 4NJGA 3W71A 3NQFA 5HMSA 3CU2A 4AXKA 2DZPA 2NLIA 1FCVA 2WNNA 3W2LA 1VCFA 4AH7A 5AHNA 1AW1A 4JR5A 3UWYA 3FYPA 4RLIA 3FFSA 1ZJIA 1SZNA 4N9CA 2QAPA 4X2RA 2E68A 3FJLA 3S1XA 4S2CA 4FXRA 3DKLA 2VFDA 3MP3A 5FI8A 2E6AA 2QCDB 3RF9A 3Q58A 3R5EA 3TC6A 3SW6A 2DU2A 3LTYA 4AMAA 2P0OA 4HNUA 5CZ0A 3PULA 3BGGA 3NPXA 3W84A 1W5NA 1I45A 5L6UA 1HG3A 3W7EA 1L9WA 3M1ZA 2CLLA 1B57A 3U6WA 1S5VA 1OG0A 2WNQA 4Z1BA 1FDYA 4PA8A 2NWRA 2NV1A 1EA0A 3W2KA 3PS7A 1R30A 5K3VA 1ME7A 1TPC1 3WJZA 4K8HA 4MPQA 3B03A 4KKXA 3W73A 4LNYA 1W37A 1R46A 1ML1A 4GXMA 2CLIA 4E2BA 1SSGA 3KHJA 2AGKA 2ZYFA 1O4UA 1QPNA 3QMRA 1LM1A 3LBCA 3O6CA 5D33A 3B0UX 1Z44A 3HOJA 3PG8A 3QJAA 4UTKA 1H63A 3C2EA 1HTIA 3P80A 3G0XA 4JTTA 3C2RA 2YSWA 3QFEA 3QW4B 4OBTA 2ABAA 5KINA 3IIVA 2QKFA 4JTJA 3G8EA 3N9SA 3I7SA 2XFWA 1FDJA 3H54A 1LOQA 3HF3A 3MP5A 4ZQOA 5AYZA 1TTQA 3TV8A 5A5WA 1L2UA 1G4EA 2H3DA 2YPIA 1FXQA 4K6AA 2WNZA 4UFHA 3FJ6A 5F1VA 4FIRA 4A29A 2NXIA 1W8SA 2Q3RA 1L6YA 3ZWSA 3NR0A 4ALDA 4FB7A 3TJLA 1GWJA 5F2LA 4UUIA 4PL1A 4L4LA 1F05A 4JIQA 4FF7A 3UWZA 3NA8A 3CLMA 4MKNA 3SR7A 4DF2A 1QOPA 4OU1A 1OFBA 2Y7FA 2VFFA 4Z1CA 4GE8A 2EKCA 3S8HA 5J5DA 2PURA 3TW7A 3C61A 2E5DA 1K8XA 1FBAA 3L5MA 5AHMA 4FNPA 3VKJA 1A5SA 3QYQA 4A3UA 1PIIA 1VQTA 1ICSA 5EA9A 2VFIA 4LS1A 3UWWA 4MY1A 3ATZA 4ZL1A 4LC6A 3TE9A 4RX0A 4O15A 5HJLA 2QCDA 2CLFA 3M6YA 2W79A 1H61A 3RU6A 3G24A 4D2JA 2PRLA 3KX6A 2V5BA 1I2QA 3P7YA 3PBYA 4QSHA 4R53A 1XKYA 4NZJA 5HULA 3INPA 2YX0A 1BKSA 4K38A 2B0MA 5EY5A 4WXZA 3W87A 4XUGA 3GXNA 1YTEA 4GUHA 3A5FA 4IXXA 4JYEA 4BI7A 4GUGA 1W31A 2FFCA 5DCEA 2XN0A 3EWWA 4U4MA 2J9ZA 3TSBA 1C9DA 2EF9A 3LHWA 3W86A 5K9XA 2A4AA 2QUVA 1M7PA 3DH7A 2H3BA 3NO5A 4KFNA 4RZ5A 4JY8A 1Y0EA 4XBSA 1TPVA 1RV8A 2ZZ7A 1W5MA 1LLZA 1R2TA 3UZJA 4JDBA 4M19A 4YLWA 1U5JA 5K9CA 4NT0A 1SW0A 3W2UA 4IMCA 3PC0A 5AC8A 1DV7A 4JD4A 3E96A 3QSTA 1AW2A 1AG1O 2VFHA 3GKFA 4I7WA 1Q3NA 5G1TA 2E6YA 3BO9A 1UASA 3TK7A 3C6CA 5HR7A 2C15A 5I3FA 1NF7A 1WXJA 3G1FA 5LNVA 1OYAA 1GOXA 4FXSA 1KM2A 3V75A 1DJNA 1YPFA 3DU0A 2YFOA 4IQLA 3AJXA 4UFIA 3EXTA 3NL3A 4N2YA 4QIUA 1QPOA 2IQTA 4AVFA 3M7WA 3OVQA 3G22A 3TNOA 1DKWA 3A9IA 1XL9A 1XM3A 3P67A 1P0NA 2DZTA 3PF3A 3QH2A 4B5NA 4N6FA 3W7PA 3FIGA 2ZRVA 4UTTC 2ATSA 4HPXA 4LW7A 5K4XA 3LI1A 4C1KA 1FCBA 3LTPA 1XFBA 4NQ1A 3GK0A 2OT0A 4IX2A 5IM51 2FB3A 5MHBA 4DO4A 4G1KA 4WUIA 4JTEA 2GJNA 3QC3A 3M47A 3PB0A 4IMGA 3MBDA 2CLHA 1PL9A 1KM0A 1A5BA 4NNAA 4UR8A 4UTWC 4BK9A 3S42A 4UMAA 3IEBA 1G69A 5EMUA 1QOQA 2QCNA 1FXPA 3NQ8A 4HHPA 3KXQA 3NQDA 4WY0B 2BSLA 2FDSA 5DLCA 1W5OA 3TH6A 3PSVA 3NQ2A 2I9EA 4MFDA 2GQ9A 1LCOA 1OFOA 1X7FA 3TFCA 1TSIA 1JQXA 3A5VA 5DN1A 1VPXA 3FA5A 5HUPA 3W7IA 4O53A 1R2SA 1FWNA 3W1QA 2GQAA 4JX6A 3NL6A 1B4KA 2X16A 3W7HA 4IJBA 5LNRA 2WQPA 1JRCA 2RH9A 4AF0A 3JR2A 2R94A 1TREA 3H55A 3STGA 3LLFA 2TYSA 3CWNA 3LI0A 2V81A 4JYFA 4NJJA 4DO5A 2A7NA 1XBVA 3MMTA 1QO2A 2VFGA 5DY3A 3GR8A 1OHLA 2CZEA 4FNTA 4CCCA 1WDWA 5DELA 1IXNA 1IIGA 3LRKA 3QMTA 5D04C 3MHGA 3LCLA 3VE7A 3BW4A 3LDVA 4K36A 2Z6IA 3W7NA 1H7PA 7TIMA 3C56A 3I7RA 1DOSA 3MHUA 1W5PA 5F2MA 3F4WA 2GVGA 5G5IA 2DZWA 3O6DA 1PV8A 4DELA 2NXHA 3QZEA 2OX1A 3S5ZA 2WV8A 3NM1A 3TDFA 4ADTA 1D3GA 3BLEA 1YTDA 3O05A 1YXDA 4LT9A 4ORIA 5BMWA 2AQWA 3CQ0A 5KZEA 4NNCA 1O94A 3C52A 3W83A 1OYBA 2QCHA 1VYRA 4YWIA 5BNKA 1ALDA 5TBOA 2ZTJA 4JTUA 5IBXA 1L6SA 5FF0A 3PM6A 1GTHA 3R89A 5KTLA 3MI3A 2ZQ0A 3BW2A 3GZ3A 5AYYA 3GNDA 4ZVJA 4LTSA 3HPZA 3NAVA 1JR1A 1H7NA 1MEWA 2BXVA 2PE4A 5AYXA 3ZWTA 4Z0SA 4I7VA 4O17A 3S5OA 5K9DA 5U4NA 4JICA 4WY0A 3W7KA 5FESA 3GXTA 1DL3A 4MJZA 3CIXA 4HKPA 3LB0A 2CFFA 3DAQA 3NPVA 3IVSA 4CQ8A 5AHIA 5LNWA 1YADA 1GT8A 4IXHA 3L0KA 3RMJA 4UMCA 1XUZA 2CLKA 4MZYA 4DO6A 1H62A 3DFNA 4P61A 3C2FA 3TQVA 3P61A 3TMQA 4RXGA 2OT1A 3K30A 3FYOA 4KWWA 2EAWA 3G1VA 3CC1A 1YYAA 3T7VA 1THFD 3LX9A 3T55A 1OK6A 5C54A 5J5RA 3DZ1A 2PCQA 3OEXA 3L67A 4XZ9A 1M5WA 5SWUA 3GX9A 4FIQA 3N34A 4UNKA 1BEUA 3WJXA 4UIOA 2O7QA 4NU7A 1GVRA 4JTIA 1H1ZA 4KFPA 2CWNA 4JGDA 5G1YA 4P2VA 3EWYA 1QMLA 1OFDA 1H7WA 1K02A 3UXDA 2VFEA 2VC6A 4WZHA 1TPDA 3QMSA 3NYZA 1EX5A 4ZQPA 3UY7A 3GDLA 4LUJA 3KRZA 4MZ8A 1IF2A 3CB8A 5D2TA 4ZQMA 4DBEA 5BRBA 3HMJG 1RZMA 3FKKA 3RLUA 3NQ6A 3O6YX 2YGYA 3DBPA 1HUVA 5K4ZA 2O7SA 1HL2A 1TV7A 1Z48A 3JS3A 4GUJA 1I2PA 3CT7A 2A7PA 4QQ3A 2ZDRA 1UCWA 4AHOA 1UB3A 1SZFA 2VEMA 4A22A 1XDMA 4E2DA 2VKZG 3TU9A 1B3OA 1JJKA 2QDHA 3OVRA 1GG1A 3GLCA 2E6DA 4FX8A 5AB3A 3IIZA 2FPTA 4CQ9A 4ICNA 3R8RA 3E49A 4BI6A 5DBUA 4UTLA 1CW2A 3IGSA 3GVGA 5CZTA 1SUXA 1L6WA 4M5PA 1RQEA 3W1PA 1WX0A 3EX6A 3PY2A 1MEIA 3MWAA 1TPFA 3STEA 1WBJA 4DF1A 2Y6ZA 1SZGA 4BFAA 3KVJA 1QNVA 1KTNA 5D2XA 1AL7A 4Y96A 3C8FA 4AB4A 5DXXA 2B7OA 3E0IA 1QAPA 4NZFA 2H8ZA 3KOFA 3R13A 1B9BA 2TMDA 2WSYA 2B7NA 1AK5A 3QRHA 1KTBA 3O07A 3UWUA 3GDKA 1KFCA 2I14A 1H5YA 3W1AA 4OQVA 4E0CA 1HO4A 2X1TA 4LRSA 1QCWA 1SSDA 4UTUA 3PBVA 5FF2A 1QDSA 3HG4A 4O13A 1NFBA 2DORA 3NQEA 3M0ZA 3E02A 1JCYA 2Y7EA 1LOLA 3W72A 1I4NA 1EB3A 3GAYA 5K7JA 1WOBA 4E38A 3IVUA 4LWWA 4M6PA 1ZY9A 5G4WA 3N14A 1I2OA 1Q6LA 2NUXA 1XBYA 3UQNA 2A85A 4JTHA 2CZ5A 3TX9A 3ABRA 3BPWA 1JVNA 3F4NA 3L66A 1VS1A 4YCOA 1TPWA 1WYIA 3KRUA 1G67A 3NQ7A 1P0KA 4AHPA 5I3IA 4IGHA 3P5YA 3LCHA 1JUKA 4TR9A 4UFLA 4NUWA 2VENA 4L4MA 5I3JA 3W1UA 3NM3A 1SW3A 4N02A 2QR6A 1KM5A 4RKAA 4R7JA 1ZAHA 3SFKA 1EUAA 3EXRA 3L0GA 1SW7A 5KITA 4JX4A 2ZA2A 4DPQA 3PSWA 3T44A 4O18A 5I3HA 1HO1A 4O28A 3UXAA 1QO5A 1QR7A 2Y63A 1TQJA 1GTEA 4UFJA 4J9JA 3MO7A 4WX2A 3HGRA 5D02A 1MXSA 3N19B 3QEZA 3BVJA 2J9YA 1P5BA 1UBSA 4GJ1A 3TR2A 1QWGA 1MEHA 2V2CA 5AFDA 1GVFA 3MYOA 4CLMA 1N8FA 3QM3A 3NDOA 3S5NA 1ZCOA 1F76A 1EIXA 5HR6A 5G2IA 2TRSA 3HGJA 1BWLA 1H7XA 2NWSA 1Q45A 1JUBA 1TMHA 3LV5A 4Q32A 4UNLA 3W1RA 3O15A 2NXGA 2X1RA 1VCGA 2ZRYA 8TIMA 3JRKA 2EGZA 3NNTA 4JN6A 4PEKA 2QCMA 4Z1DA 3I68A 1NVMA 3S6DA 1FCQA 1F2JA 1TTPA 2NX9A 3TXZA 3S0CA 1RQBA 2ZA1A 5E93A 3KFTA 4IOTA 3U2OA 4XTIA 1JULA 3ELFA 1SR9A 4JTGA 3PVFA 5FF4A 5C55A 4NX0A 1LLWA 1OVDA 2GQ8A 4JY9A 4PTNA 3STCA 2A6NA 1GYLA 4YXGA 4MYAA 1LDCA 4LVAA 1SQ7A 3SI9A 3LTSA 5I3GA 4AF0B 2ALDA 2ZZ2A 3PBWA 2FB2A 1FUYA 4NJIA 4ZQCA 3MUXA 3T40A 4EF8A 3NQVA 1DBTA 5AN7A 3W1TA 3RK8A 1SO6A 5CSSA 4BI5A 3W7QA 4GRSA 5AOUA 1NEYA 2RDUA 5D05A 1YXCA 1X1ZA 1KA9F 2TPSA 4Z08A 4UFKA 2ZZ1A 1DQWA 1FWRA 1K8ZA 2Y85A 3O1NA 3HJZA 1EUNA 1KM4A 2JGQA 3MBFA 3HG5A 3P60A 3A21A 4A21A 3OG3A 2B4GA 2X1UA 2FPVA 5D2WA 4MLJA 3SSJA 4Q33A 2G96A 4JTKA 3QPZA 1K8YA 2WOQA 5AC7A 1SO3A 3NL2A 1VLIA 2LLEA 3G1YA 3F1QA 1VGAA 4LC8A 3W07A 3EX3A 4DPPA 5FEZA 2YXGA 1PCWA 1F6KA 5LHFA 2JKEA 4QITA 3ZFHA 1W3TA 2CU0A 3UPWA 1TCDA 2QJHA 1TIMA 2YZRA 3CEUA 1TPB1 3IIPA 3ZR4A 3I7QA 1FWTA 2NUWA 3M5YA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4N6FA

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