4N9BA

Fragment-based design of 3-aminopyridine-derived amides as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
479
structure length
469
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title Fragment-based design of 3-aminopyridine-derived amides as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 163
structure length 469
sequence length 479
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4n9bA02
1UASA 3DH7A 5C2XA 4O0ZA 2H8ZA 4IPIA 4AMAA 5HULA 1H5YA 4Q32A 2YW3A 3NPWA 1LRQA 4Z0SA 3LI0A 4G1KA 3NO5A 3NQEA 4HN4A 3T7VA 5C6MA 2Y85A 1OFQA 5FF0A 5CSRA 1Q6LA 3CHVA 3Q94A 3QW4B 3TA6A 5AHNA 5FF7A 2ZTKA 1TV7A 1ZY9A 2I1OA 3I7SA 4WUIA 3DZ1A 3YPIA 2JBMA 3IVSA 2A4AA 2J9ZA 2NV1A 1LBFA 4UFJA 2BSLA 3HGJA 3LHZA 3P82A 3F4WA 4AXKA 4QAIA 4NNAA 1AL8A 3W7JA 4UFMA 4O16A 5G2HA 3G1VA 5D02A 1HUVA 3NAVA 3IGXA 4JDBA 3U6WA 2BTMA 2GPTA 2YFOA 2E77A 3I7RA 4AWSA 1VQTA 3P81A 5KINA 1HFBA 5LZLA 1TPDA 3EEGA 3SECA 4QSHA 3N9RA 3CPRA 3NL6A 1Z41A 1D3GA 4NX0A 1H63A 1OF8A 2Y7EA 2ZA3A 3TQ0A 1B57A 1SFLA 4ZQPA 4JGDA 3QRHA 4UFHA 2DZPA 2CZDA 4UFIA 3IIZA 3TH6A 1R46A 3M7WA 3C2OA 3M5XA 1XUZA 1TPEA 3W3OA 3GZ3A 5DXYA 1BWLA 3BVJA 1YDOA 3VFLA 5U7SA 3O8AA 1GPWA 3BARA 2ALDA 3UWZA 2ZRXA 3G1YA 1XDMA 3L21A 3W23A 1W37A 1DJQA 5F4SA 1XFBA 3L2IA 2Y88A 4ZQRA 1OK6A 1TQXA 4JXCA 5DCDA 4AHPA 2C18A 4FX7A 4O8RA 1EUAA 3L65A 4R34A 5F2IA 1EX5A 1VS1A 1XCFA 3UWWA 4O28A 3W2MA 2YR1A 1XI3A 4H3DA 4Z1CA 1NFBA 3HBLA 1VYSX 4DPPA 4CCEA 3P84A 2VFGA 3Q2DA 3MBDA 2YSWA 1YXYA 1FCQA 2Y7GA 2EAWA 3PG8A 4JTGA 1I2PA 4TIMA 3PSVA 3A21A 3GYEA 1ICSA 1KM0A 2Z0IA 1I45A 3LCFA 4NJKA 3MMTA 4FNPA 3ABOA 4UCGA 2AQWA 4DEFA 5HWMA 1KW1A 4OU1A 3C3NA 2VFHA 1PV8A 3VI2A 4IPJA 3KVMA 2VC6A 4JDYA 4N9DA 3OG3A 1YTDA 3LXCA 5J5DA 1LLZA 5CZTA 1PIIA 4GE8A 1W5QA 1UUMA 1LRNA 2QCDA 1Q3NA 4CNPA 2ABBA 3GR7A 4S2CA 4BK9A 1TB3A 3NPXA 3MUXA 5J5RA 4HKPA 1OHLA 3FS2A 4A2SA 4O19A 1SO6A 1A53A 1XC4A 5IM51 1DL3A 1DQXA 1S3HA 5LNUA 3LLDA 3PS7A 1WDWA 1VC4A 1YLVA 2E6YA 1B4EA 3L0NA 3AJXA 3TAOA 1SPQA 3K30A 3QMRA 2E5CA 2UV8G 1VCGA 2GOUA 3UWVA 4Y6GA 5HQEA 4O15A 3FFSA 4O1BA 2NWSA 3HPZA 3QZEA 4UFKA 1T8XA 3R12A 4HSNA 2DZSA 1GVQA 5EYWA 2ATMA 3KRUA 1NF0A 4BFAA 3P8JA 5LNWA 5KMYA 3G8EA 2NXIA 4N4PA 4C1KA 1W5OA 5D2VA 2X16A 3NM3A 2CLHA 1AW5A 2DZUA 4PODA 4RV8A 4M7TA 5KZEA 2VEIA 4MZ1A 1VHNA 3W74A 5DLCA 1DQWA 3TU9A 3A9IA 1I2RA 2A7PA 2H3DA 3N19B 3DFQA 5KTLA 4UIOA 3SGUA 1V7YA 1QMLA 4ONVA 3E9AA 3QPZA 3N14A 1SSGA 2QDHA 3KVKA 1JRBA 4ALDA 4MFEA 1C29A 2X1RA 2ZZ4A 1D3HA 2ZYFA 5AYZA 3WJSA 3QQ1A 1N7KA 2VXNA 3BW2A 5HR6A 4AF0A 1Y0EA 3INPA 4NX5A 4ADTA 2A85A 2KZHA 3WFAA 1K3UA 3M5YA 3LRLA 4XWUA 1I2OA 1UUOA 4JTSA 2OJPA 4JN6A 1XBZA 2E6AA 3PG9A 4TMCA 4LC8A 4Q4KA 3F03K 3W84A 5LSMA 2NX3A 3S1VA 3ZWTA 3GVGA 3W7HA 2GUUA 1VCVA 5LNSA 1TTIA 2DJXA 4NZJA 3I7QA 3VCRA 1C9DA 2TYSA 3S1WA 4FNRA 1R2TA 3CIXA 3EWZA 4IOTA 2FQIA 3CWNA 2BZNA 4JY8A 1T0OA 3QF0A 1ZAJA 3O05A 1YXDA 3HIJA 1VYPX 3M9YA 2D73A 3PF3A 1TRIA 2QCFA 3NDOA 3QYQA 2DJLA 4FIQA 5HWNA 4MLJA 5D30A 3UWUA 1TREA 1RV8A 5LNVA 3TJXA 1OYBA 1SW3A 3A22A 3E12A 3R13A 2CZEA 3S8HA 5AYXA 3O6YX 4XBSA 1OF6A 2V0TA 1UB3A 3NOEA 4IWWA 1EB3A 1DKWA 2G95A 2FFCA 5D04C 3C6CA 1DOSA 4CLMA 3WK2A 4Y8FA 4EIVA 4M6VA 4AEOA 4I7WA 2QUUA 4RXGA 3P62A 5K2ZA 1JR1A 4DF2A 1KTBA 5AN7A 4AHOA 3TW6A 3TDFA 4Y96A 3L5AA 4LUIA 3UD6A 4IMDA 3KVJA 5LGXA 1SU5A 3W22A 3G3MA 1FCUA 3BO9A 1W56A 1F76A 3B04A 2Q8LA 4E2DA 1XUUA 1LBLA 3W2NA 4N2YA 3FJLA 3V75A 2PURA 3O6CA 2C3ZA 5FESA 5LGZA 4XKYA 3W7RA 1NVMA 4WY0B 2ZA2A 3DFNA 1GVRA 3HGRA 4CCDA 4UMBA 4R33A 3TAKA 4D2JA 4IXHA 2QUTA 2HS6A 1W54A 1A50A 3LHYA 4QIUA 1J5TA 1KM1A 2Y61A 1QPQA 3M41A 4POCA 1YYAA 4PL1A 5EKYA 5T26A 5FEXA 4WZHA 4GBUA 3MI3A 3N2MA 4HNVA 4AWUA 2WSRA 1EP3A 2C19A 2V2DA 3W7MA 1QR7A 4JIQA 1XBVA 3MWAA 2RDWA 2P10A 2XN0A 4UTHA 4M19A 5AHEA 4Z1BA 3CWOX 3E0IA 3SI9A 2V2CA 1F2JA 4JTFA 3EKZA 4Z1AA 3QMTA 4UTKA 3ZFHA 3UXDA 2NXGA 5G2WA 3VE9A 4GRSA 3SFKA 3W1PA 3IIVA 4GFSA 3EWYA 3BGJA 3W2LA 1F05A 2H3BA 1KLZA 3EX6A 3B0UX 1P0KA 1RQEA 3UXAA 2JGYA 1NSJA 3VNDA 4GUJA 4FHAA 3CU2A 3TK7A 1FBAA 4FF7A 4LT9A 1GZGA 2E5DA 3P80A 1ZJIA 5LKYA 5CZJA 3W2KA 4JX4A 3UYCA 4NUWA 1UJPA 1YPFA 4JYEA 1A5CA 5F2LA 3G8RA 3LBMA 2OMAA 2I14A 5K4XA 2FPYA 2VEMA 3DU0A 3IEBA 3W9ZA 1W8SA 1DV7A 3CTLA 3DI0A 5LHEA 3IGSA 3C2VA 3GIYA 1JQXA 1JCLA 3TXZA 2E68A 3CLMA 2PRHA 3TKFA 4TMBA 1PCKA 2VEPA 2H6RA 2J9XA 2CU0A 2RDTA 4QITA 3PULA 3BG5A 1MXSA 1G6CA 3LB0A 3LXBA 2E09A 2RHGA 2Y62A 5HUOA 1JUEA 3PSWA 1DORA 3GDRA 4H6KA 1FWWA 3BLIA 1K7XA 2WSQA 5AFDA 3OVRA 4IUOA 3T44A 4NNBA 4PCFA 2R91A 5I3HA 2Z6IA 4OV9A 5F1VA 2QCNA 3T40A 3W1UA 4MFDA 1CW2A 1GJPA 5K9DA 3O1NA 4N6EA 3LHVA 2DZXA 4IX2A 3C52A 2A6LA 3NQAA 1Z42A 2YXGA 1GTEA 1WV2A 1ML1A 4RZ5A 1ICQA 5E1QA 4XQ6A 1R30A 1Q6RA 2WJZA 3W7CA 4UNKA 2QJHA 2QJGA 3PR2A 4YCOA 5EY5A 2NUWA 2C15A 2TSYA 2B7PA 1EEPA 2VELA 2QCMA 2W6RA 4LVBA 3FIGA 5TIMA 5K3VA 1HO1A 4M7SA 1IIGA 2TRSA 3QEZA 4MOZA 4B5NA 1WQ5A 4DO6A 1G67A 3SY5A 1FDZA 2RFGA 5KZDA 1YADA 2C14A 2GQ9A 4BI7A 3NPVA 4RKAA 5L9FA 3HG5A 3DFOA 1SW7A 1K7EA 5DY2A 4H4IA 4UMAA 3NZ1A 1QWGA 4HHPA 3IVUA 2BLEA 3HG4A 3LCGA 3OBKA 3EXSA 4ADSA 3OVPA 4FNQA 5CPMA 4A21A 4N9CA 3B05A 1M7PA 5K7JA 2Z6JA 1OX5A 2E6FA 3RU6A 3LX9A 5AC6A 3B06A 4O4WA 3VE7A 4Z08A 1F6KA 1FWTA 1O4UA 1ZAHA 2A6NA 1PCWA 1JCXA 2NXHA 5CSSA 2C0AA 1ZENA 2NV2A 3TR2A 3HGSA 3W2JA 3NPUA 1LZOA 5I3KA 4BI6A 4MJMA 1GG0A 1LM1A 5I3IA 5DBUA 3T55A 2DZWA 3LXAA 1T96A 4LU0A 1F6PA 3EWXA 4KFNA 1KTNA 1K03A 1K8XA 2CZ5A 4N9EA 3NM1A 4HIBA 1A5SA 3QMSA 2ISSA 3W7OA 2QAFA 3LI1A 1LROA 3AO0A 5AHIA 1B4KA 5DCEA 1FDYA 4UXDA 3RFAA 3I6RA 3SGZA 3GLCA 3MBFA 4OGZA 4KFPA 4UTTA 5IBXA 4MUZA 2EPHA 1SQ7A 3UY8A 4NU7A 5HJLA 3DBPA 1AK5A 4LNYA 1SSDA 4FNSA 1G7UA 1S5TA 1TPFA 2ZQ0A 1WXJA 2Y7DA 3NQ6A 1QO5A 3HG2A 3MHGA 3KX6A 4AWTA 1FCBA 2YW4A 3UWQA 4FNTA 1X1ZA 2C1HA 4RLIA 1H7WA 3LTPA 4LTSA 5GVJA 2CLLA 3ZWSA 4UC5A 1TYGA 1LDCA 2A2IA 4WXYA 3CC1A 1OK4A 1O60A 2OT0A 1ZALA 2GVJA 1HO4A 3PUOA 4RX0A 3RK8A 1YDVA 5G4EA 1R47A 2P0OA 3TSDA 4YMZA 4NJGA 3EWUA 4WOQA 5E0KA 1JRCA 3UPBA 1Z48A 1E51A 1L6WA 5SWUA 1GEQA 3CEPA 1THFD 2JKEA 3NQ7A 3NEVA 1KFLA 2QCGA 4GUHA 2QJIA 1U5JA 3LHTA 5D09A 4FIRA 3MI6A 1LRTA 3H54A 2ZFAA 1TPWA 3KRZA 1MZHA 4GUFA 1H1YA 5D33A 1KFCA 3GK0A 4I7UA 4AVFA 4UTJA 2F7FA 2I9EA 4MY1A 5KITA 3UZJA 5EA9A 4JS3A 3W7GA 1OFOA 1O94A 5F4WA 1H50A 3DHDA 1Q45A 3MJYA 3LRKA 1F74A 1W3NA 3LOTA 1SZFA 1B9BA 1LTDA 3MYPA 3GDTA 3O63A 4R7JA 1MO0A 5BNKA 1FXQA 4JTHA 4LW7A 1UCWA 3PBVA 1PE1A 4YWIA 1L6YA 1ZAIA 2V2HA 3RMJA 3GDMA 4LY8A 3WJYA 1ME7A 3GDLA 4MZ8A 1G69A 4JTTA 1ZFJA 1QDSA 3OIXA 1ICPA 2Q8ZA 1F7BA 3P61A 1FWSA 1MEWA 1DBTA 1F73A 5BOOA 3FJ6A 1A5AA 1DHPA 1G4PA 3P5YA 2CLIA 1OX4A 4MZYA 1AMKA 2QUVA 1OFPA 1M5WA 1XL9A 3R8RA 1JCJA 1MSSA 4DO4A 1GOXA 5DBTA 3U2OA 2QCLA 4ZQOA 3QSRA 2QCDB 3C8FA 4L4MA 5I3FA 2G5WA 3O15A 4R53A 2CFFA 4MY9A 1K8YA 3TX9A 4ZQMA 3OEXA 3IIPA 4OQVA 4Q33A 3S6DA 3D0CA 2FLIA 1OFEA 2J27A 4FNUA 2LLEA 2Z1BA 3HPSA 4PEKA 4WQ6A 4O1CA 1JUBA 5A8GA 3TFXA 4DELA 1ME9A 4NZFA 3PUDA 1EIXA 2IQTA 1ZHAA 4DF1A 3HJZA 1NAL1 1GG1A 4JEQA 4XUGA 2NX9A 4LOCA 3W1MA 4BF9A 4JTJA 2VFEA 2CWNA 2NZLA 1KM4A 3GKFA 3PAJA 2EHHA 4JTKA 4RK8A 2HS8A 4RZ6A 2H8XA 1J2WA 3L0GA 3W1NA 4LV4A 3NQMA 5L6UA 4RJEA 3NQ8A 1TPC1 4JTEA 1LOSA 4RCXA 1JQVA 2OCZA 3NL3A 4LS0A 3M43A 2WV8A 3DENA 4JIPA 5KSWA 5AHMA 3I68A 1I2QA 2ISVA 3G1FA 4Y9AA 2A1YA 3QJAA 3UNDA 1IXOA 1SO4A 1L6SA 3DAQA 2YGYA 3HG3A 4BI5A 4YCPA 2WNQA 5FEWA 3E49A 2X30A 3GDKA 3PC0A 1G7VA 3BV4A 2NWRA 3L68A 3P67A 1RR2A 5D2XA 3G1AA 4K7YA 3MHUA 4TX9A 1S5WA 5D2WA 2RDUA 3TQVA 3TROA 3FKRA 2FB3A 4KKXA 4O53A 1GTHA 1JUKA 2QCEA 1VLWA 3S5ZA 5H2ZA 2WQPA 4CNOA 4EOUA 2ZRVA 3LRMA 2DZTA 4AF0B 5I3GA 2JK2A 4MYAA 6ALDA 3ABSA 4O50A 5FF2A 5CGQA 2AGKA 1D9EA 3W6YA 3EKLA 4L4LA 5D03A 3LBCA 4WXZA 2YFNA 5MHBA 1VH7A 3E96A 5D38A 2JGQA 5D37A 1VPXA 3PUEA 1QFEA 4O11A 3G0SA 3QW3A 1M7OA 4XTIA 3W1LA 4FXSA 3M6YA 3W7QA 3M47A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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