4N9DA

Fragment-based design of 3-aminopyridine-derived amides as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
479
structure length
469
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title Fragment-based design of 3-aminopyridine-derived amides as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 169
structure length 469
sequence length 479
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4n9dA02
1FCQA 2OT1A 4WQ6A 2EAWA 1I4NA 4OQVA 3PS7A 3O05A 2CLHA 4HT3A 3W2JA 1KM4A 2VEMA 4UTLA 2V2DA 3G1SA 3PY2A 2ZA2A 4UTWA 1LOQA 3GNNA 3C52A 3OA3A 4AH7A 5AHFA 2Q3OA 2H3DA 3CQ0A 2ZZ5A 2CLMA 4A2RA 1CI1A 1H63A 2XN2A 4S2BA 3E9AA 4E38A 5EYWA 5DY2A 3VE7A 1TCDA 3IVTA 5HWJA 5KMYA 1KV5A 4A22A 3NR0A 4MIMA 1ZAIA 1KBIA 1G4PA 3W2KA 1B57A 2DZSA 3B0PA 3WK0A 3EWBX 4JXCA 5AYXA 4O14A 3R12A 3W7IA 3PB0A 1ME7A 2I1OA 2DZXA 2E6YA 3LCHA 5G1YA 4UTHA 3L65A 1O94A 2Y63A 1KM1A 3NL2A 3PF3A 4N6EA 2FPTA 5I3JA 4OT7A 3G3MA 1TJPA 3LI1A 4HSNA 3SIZA 1H1YA 1RQEA 1SSGA 1GVOA 5J5DA 5AHLA 1TO3A 2FB2A 3TC7A 4UMCA 3P84A 1SZGA 4MVAA 5SWUA 3PM6A 1PHWA 3MUXA 3LLDA 2ZRUA 1DV7A 3TR2A 4AAJA 4DXVA 3C2VA 5GVJA 3N73A 2BX7A 4YMZA 2QEZA 4DBDA 4ONVA 4UC5A 2I9EA 4O11A 1EUAA 1UUOA 1R47A 4MY9A 3KRZA 1F6PA 4RXGA 3QM3A 3M43A 2VFIA 4P2VA 3UPBA 3GNDA 5I3HA 2VELA 1K8XA 1W0MA 2J9XA 3L67A 3BG5A 3G1XA 2ISVA 4DELA 3NQCA 4KWWA 3OVPA 3O63A 1G67A 5LNRA 4LS0A 3IRDA 2YR1A 2CLFA 3LHWA 1JUBA 4AVFA 5FI8A 3EXTA 1LZOA 1SW0A 1NAL1 2ZZ2A 3OG3A 1X7FA 1T99A 3UPWA 1L6WA 1P4CA 3A5FA 5D09A 4OV4A 4PEKA 3W7PA 2WQPA 4CNOA 1TSIA 2V5BA 4O1BA 1GEQA 6ALDA 5I3IA 3S5OA 3W7OA 1KM6A 3K30A 4PA8A 2AQWA 2R91A 4JGDA 1DHPA 4PCFA 1I2NA 1OFEA 3W86A 5D05A 2VFEA 2ZBTA 3SY5A 5HULA 2QUUA 1QR7A 1RR2A 2QAFA 3E49A 3O6YX 3GZ3A 1ICPA 1H7OA 5LNWA 4O50A 2HSAA 1TJRA 1H7WA 1PCWA 3BLIA 3QMSA 1F76A 3DI1A 4N4PA 2WSYA 4HNTA 1EP1A 2WSRA 3G1HA 4ALDA 2PCQA 4JTLA 1ONRA 3DFSA 3NXFA 4O4WA 1U5JA 3N3MA 4S2CA 1KTCA 1WX0A 3PBUA 3MYPA 2QCHA 1I2QA 3PUEA 1L2UA 3U8GA 3WK3A 3C2EA 3EX3A 2QKFA 3W1AA 4TX9A 2YZRA 4IUOA 1G4SA 1IF2A 4UNLA 1EEPA 1KW1A 1SFJA 3BLFA 1SO6A 1W3TA 3TFXA 3LCFA 3QEZA 1MO0A 2HS6A 4ZVJA 2GJNA 1SO3A 3FA5A 4DF1A 3MBFA 3C61A 2C13A 5F2MA 3EB2A 1LYXA 3FKKA 3LOTA 5LSMA 3B05A 2VC6A 3DFNA 1AMKA 1LRNA 4NX5A 4UFJA 3NPWA 4ZQNA 4OGZA 3MP3A 2A2IA 3SJ3A 1M5WA 3RFAA 1OYCA 2QCMA 4HKPA 3HQ1A 1VLWA 3FIGA 3ANYA 2NUWA 4ZQMA 1KFKA 3SGZA 2YFNA 3DFTA 3EWUA 1H62A 3KVJA 1HO4A 1WOBA 5ABTA 2BZNA 3FOKA 4CNPA 1TRDA 3CWOX 3KAOA 2GVJA 4NJKA 2ISSA 4NZFA 2B4GA 4JS3A 2ZRXA 3UWZA 3KRSA 1ZY9A 4FHAA 4HPXA 2DZUA 2B7QA 5KITA 3NL3A 4LOCA 1WQ5A 4EVZA 3WJXA 1MEHA 1GOXA 3ELFA 3THQA 3GDTA 5D04C 2FPYA 4GE8A 1F73A 3M5YA 3EEGA 3W7RA 3ZWTA 5F4WA 3S42A 4P61A 4ZZ9A 1RPXA 1YXDA 3R2GA 4IPIA 3UZ5A 4UXDA 3U2OA 2PE4A 3TU9A 1T96A 4XQ6A 5C55A 5F2GA 3NQAA 3I65A 3C6CA 5KZDA 2FIQA 3W1PA 3WK2A 3HF3A 3P5YA 4RJEA 3BG9A 5EBUA 5K4ZA 2Y7GA 3L5LA 1LP6A 1A53A 5EPDA 2VFDA 4HN4A 3RU6A 3EKZA 1P0KA 2WNNA 4LUJA 1SZFA 3NNTA 5EY5A 3IGXA 4BK9A 1KFLA 2ATSA 1QO2A 4FX8A 3M41A 2Y89A 3SW6A 5HWNA 5D2VA 1JCYA 1XBZA 3HPZA 5G2WA 5DELA 2Z6IA 2QJGA 4QQ3A 4YLWA 4RLIA 2O7SA 2CZDA 1GVFA 3HGOA 2A7PA 1QOPA 2FTPA 3LCXA 1HUVA 3P61A 5C5YA 2E5BA 2CLLA 2V30A 1Q6LA 1GT8A 4MZ1A 1VCFA 2ZRVA 3T44A 3IIOA 3S6DA 1PIIA 4YWIA 2G96A 1XDMA 2NUXA 5G1TA 4O53A 4GC4A 3GXNA 5HR7A 4IGHA 5FEWA 4E2DA 4IMGA 1EWEA 1UASA 1PL9A 3BGJA 4JEQA 3EX6A 4TU1A 1Q45A 4DPPA 5HNRA 2E5CA 4IXHA 4N6FA 5LGZA 1AL7A 3PSVA 3T7VA 5F2IA 2VOMA 5HMSA 3N14A 1XUUA 1O5XA 1TTQA 1UCWA 5D2XA 4Z0SA 4RZ6A 3W1TA 4TIMA 1FWWA 5FEXA 1LROA 2QCLA 1XI3A 1VCGA 3HG4A 2UV8G 1THFD 1ZJIA 3BLEA 3O1NA 3R89A 4LVFA 2NZLA 3NM1A 1YXYA 4NVTA 3UXDA 3N34A 1AW1A 1YDNA 4NNAA 1KFJA 1I2PA 4X9SA 5KTLA 4HSOA 4LW7A 5LZLA 3G0SA 4FNUA 3TC6A 5KINA 1OFDA 1TV8A 4MY8A 4GBUA 3WFAA 2WOQA 5AC8A 2E6DA 4IMDA 1M7OA 3CWNA 4EOUA 1IIHA 2NX9A 3NVTA 4UFLA 4BI7A 3STCA 2RHGA 1Z48A 2KZHA 3G8RA 4QJ1A 4O18A 3LBCA 4MLJA 4MFDA 3CU2A 2ZZ1A 2E1DA 1JUKA 3LCWA 1YPFA 5F4SA 2A21A 3NQEA 4MZYA 3L68A 4LVDA 2WO5A 1VGAA 3I68A 1G7VA 4PTNA 3TROA 2Q8LA 4FNTA 3PG9A 4BFAA 1LRQA 5AB3A 1WBJA 2XN1A 1LBFA 3UZJA 4OWGA 3KVLA 1ZAJA 1MSSA 1VH7A 3ABRA 3M6YA 3G24A 3BW3A 3P81A 3TQVA 2PC4A 2VFGA 1EUNA 4KFOA 1AW5A 1OFQA 4JICA 4O16A 4B5NA 2YGYA 1OHLA 2P0OA 1LDCA 4A3UA 2Z0IA 3RK8A 1SPQA 1JRBA 3LLFA 2R14A 3YPIA 3I7QA 3SGUA 5LGXA 2X2GA 3NZ1A 4IJBA 4YCPA 2A4AA 4JX5A 5FF7A 4OV9A 2NWRA 4UFHA 4ZQOA 5AC7A 1A5AA 1A5SA 4KWVA 2ZQ0A 3S1WA 1H60A 3NQVA 1UUMA 2JKEA 1PHQA 1U83A 1OYBA 3IGSA 3BPWA 3T55A 1YPIA 3E02A 1SW7A 1VJIA 1G4TA 3FYOA 5FEPA 1VPXA 3SZ8A 1FXPA 1XBYA 4BI6A 4UTIA 1S5WA 2GQ9A 2VEKA 3MHGA 3B0UX 1VZWA 4UIOA 3KFTA 1VHCA 3QSTA 4O0KA 2ABBA 3NPXA 3CB8A 4DF0A 4JIPA 2EHHA 3OHIA 1H7NA 4ZQRA 4Z0JA 2ZRYA 3A22A 2P10A 4DF2A 1DBTA 2CZFA 3LHZA 2D73A 3DKLA 3PG8A 1Q6RA 2YSWA 3FS2A 4QNWA 1K8ZA 3QQ1A 3NEVA 1W5QA 2BTMA 1YDOA 1AG1O 4WOZA 4DQWA 2VEIA 3CC1A 1X8FA 4A29A 1OFRA 4FXSA 1GQNA 4FNRA 3V75A 4LC6A 3VI2A 1UB3A 3UQNA 2OMAA 5FF4A 3LERA 4O15A 5C2XA 2X1RA 3AJXA 4MYAA 2B7NA 1G4EA 3W23A 3QFEA 4Z1DA 1ZENA 3B4UA 3GIYA 1QPRA 3M9YA 3G1FA 4WX2A 2HTMA 2J27A 3HBLA 4LTSA 4R34A 3QMRA 4A2SA 3P60A 4YL2A 2GQAA 3LV5A 3W9ZA 1WOAA 5C6MA 1X1ZA 4LU0A 1KA9F 4JY8A 3HIJA 5CPMA 4NJHA 3USBA 3HB9A 1H7PA 1FBAA 5E0KA 1KM5A 3G3DA 2GOUA 4JR5A 4JDBA 3GAKA 2WJZA 2Y85A 3C0JA 2C19A 3Q37A 5K3VA 3M5VA 4TR9A 2NXIA 3CHVA 5IBXC 2Z6JA 3B03A 1S3HA 1WA3A 2ZFAA 3L0GA 2OZ0A 3MYOA 4LRSA 3UXAA 2RDWA 2Y7FA 3EWZA 3TQKA 5BRBA 2WNZA 3QYQA 4A21A 4HNVA 4JN6A 4NX0A 3P74A 2A7RA 2CLIA 3W7QA 3QW4B 4R53A 4JYFA 2FFCA 2J9YA 4GWEA 2X1SA 1DJNA 5EA9A 1W31A 2X1UA 1ML1A 1TMHA 3UWVA 2FDSA 3FFSA 3HGJA 4O0ZA 2Y7DA 1SR9A 1Q6OA 5E1QA 1TQJA 4CQ8A 1JQVA 1GG0A 1TV5A 1ME8A 4ZL1A 3U6WA 1JCMP 4NJIA 4FO4A 1GVQA 4K7YA 3NGJA 3TMQA 2CU0A 4AWSA 4FNQA 1JCJA 2B7OA 1LBMA 5DBUA 3JR2A 3N19B 4GUFA 3LXAA 5LKYA 3MI2A 1RV8A 1XM3A 4ADSA 1HL2A 3QZEA 1WXJA 1TIMA 2H8XA 3BV4A 2E77A 4GXMA 4AWUA 3W75A 1W5MA 4JYDA 3W88A 2WPBA 3G1YA 5G2HA 1YDVA 4QM1A 3BW2A 1L6YA 3TJLA 2O7QA 3DHDA 3QMTA 3S8HA 3PSWA 3ZR4A 3L21A 4GRSA 1YTKA 2V2CA 3NG3A 5DY3A 3TA6A 2V2HA 5D32A 4EF9A 5AN7A 1TPH1 3OBKA 4MKNA 5BMWA 1SO4A 4ZMGA 4HIBA 5J5RA 2C14A 5LHFA 3UWWA 3GK0A 1TPC1 1OJXA 3HG5A 4GJ1A 2TSYA 4IWWA 3EX2A 3UWYA 1OX4A 4O57A 2ZYFA 1XC4A 2V5LA 2NX1A 1F2JA 5HQEA 1DQXA 2NUYA 1NF0A 2FQIA 5CSSA 1DL3A 3IIVA 3LI0A 2YXGA 1AL8A 3W1MA 4QIUA 3F4NA 3W1LA 5C54A 4UFIA 1FX6A 4JIQA 1OYAA 2NV2A 3LHYA 3B04A 8TIMA 4LV9A 4QISA 4UTWC 1VS1A 1XFBA 3STFA 1R30A 3IIZA 3NQ2A 5L6UA 3VNDA 2A6NA 4H3DA 3HO8A 2ZA3A 1K8YA 1P1XA 5F1UA 4Z1CA 3P82A 2C18A 5HR6A 3B06A 1D3GA 1DKWA 1KLYA 4LT9A 3MW7A 3CPRA 3BARA 4FNSA 4JTEA 1JUEA 2CFFA 4IQLA 3GXTA 2XFWA 4C1LA 4ZQCA 1ZFJA 4N2YA 4MYXA 5DN1A 2TPSA 2JK2A 4KFNA 3EKLA 3T78A 2NV1A 5DCBA 2Q8ZA 3L0NA 1QMLA 1EIXA 1FY6A 5D02A 3T40A 1A5CA 3SR7A 3GDKA 2QUVA 1VR6A 4LY8A 3QW3A 5F2LA 3NQ7A 5FF2A 5CPOA 2ZA1A 2Y6ZA 3UWUA 3M47A 3EX4A 4FNPA 1XBVA 4DO4A 4WY0A 4JYEA 3M7WA 2C15A 3S0CA 2YCEA 3G1VA 5EMUA 1ADOA 1LLWA 2J9ZA 4NZJA 5CGQA 4XBKA 3HG3A 5FF0A 2BSLA 3GR7A 3TDFA 5D2YA 3L0KA 2QDGA 4FXRA 3BO9A 3QRHA 4N9DA 1BEUA 3PWAA 3I6RA 5I3FA 1T0OA 4R7JA 3LRLA 3S5ZA 3QSRA 2FB3A 3EWYA 4Z1AA 3EX1A 2OCZA 4DBEA 1EX5A 3HJZA 1GG1A 5DCDA 1JULA 4UCGA 3QPYA 5CSRA 1EWDA 4UTUA 3TK7A 4IX0A 4N02A 6TIMA 3C56A 3HPXA 1B4EA 3GDRA 3MP5A 4XTDA 1IXQA 5H91A 1B4KA 4UMBA 5BMXA 4O52A 3M44A 3HGRA 1TPVA 1W1ZA 1ZAHA 2A5HA 3DH7A 4JY9A 1SO5A 3H53A 2E5DA 4JTHA 1HO1A 4K6AA 4AEOA 1SW3A 3E96A 4JTSA 3QF0A 3TNOA 1PS9A 1SFLA 3QPZA 3VFLA 3L2IA 3W74A 2GPTA 2HMCA 4UNKA 2R8WA 5TQLA 3UYCA 1I2OA 1GTEA 1TTJA 4ZQPA 2QCCA 3GR8A 4GUGA 1M6JA 3GKFA 1GZGA 3MHFA 5G4EA 1W3IA 3ATZA 3P7YA 3DFPA 1F05A 2RH9A 4GNJA 4LVAA 5D03A 1WAUA 3W70A 4MPQA 2TRSA 3INPA 1LM1A 1A5BA 4WD0A 4N9BA 5HJLA 3W83A 3GDLA 1YYAA 5AYZA 5AFDA 3KXQA 1J4EA 4Z1BA 1XKYA 3ZWSA 4EF8A 1JRCA 2Y88A 2ABAA 1GYLA 3STGA 2RDTA 4NJGA 3F03K 3EXRA 4WUIA 1TREA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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