4N9E | Genus

Total Genus 172

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	172
sequence length	480
structure length	471
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title	Fragment-based design of 3-aminopyridine-derived amides as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT). pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	172
structure length	471
sequence length	480
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2013-10-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4n9eA02

4BI5A 2B4GA 1T8XA 2V2DA 2A85A 4DXVA 3NL2A 2QCEA 1F05A 3DHFA 4TMBA 3W1QA 4IX0A 3ZR4A 4MJZA 4ZMGA 1B57A 3THAA 3CWNA 1H7WA 3M16A 1B3OA 3QPZA 3NQDA 5H2ZA 3LM7A 3G1AA 5U7SA 1I2RA 5DCEA 2KZHA 3W7MA 4ZZ9A 1TTPA 1OFRA 1SW7A 5CPMA 1SO5A 3UYCA 1SO4A 3W23A 3LCXA 1OX4A 1AW1A 4M6QA 2H3BA 1OF8A 2P10A 3LRMA 1A5CA 4NX5A 4NVTA 3T78A 1N55A 1LBLA 1OABA 1KV5A 5TQLA 3QJAA 1H1YA 1GT8A 4O1DA 1K7FA 4MUZA 1GTHA 1HUVA 4ADSA 3STFA 2HS6A 4HNTA 1KM1A 1OF6A 3FLUA 2BWGA 3OEXA 3BARA 3QH2A 2YYUA 3C8FA 4R33A 1KM4A 4ICNA 3B0UX 3TKFA 1EPXA 4M6PA 3O6CA 4UMBA 3S42A 4N4QA 1H1ZA 1PV8A 1K7XA 2NZLA 1FWTA 1PL9A 3CTLA 2GVLA 4FO4A 3KVLA 3C0JA 4N9EA 2WSQA 4WZHA 3TXZA 1JCLA 3RU6A 2WNNA 1FX6A 3C2FA 4N6FA 3TDFA 3VCRA 3LHUA 1U5JA 3PS7A 4JTJA 4AAJA 2E6DA 1QCWA 5L6UA 1VRDA 1ZALA 1TTQA 3NA8A 3G8RA 4JDYA 4DO5A 5K9DA 4MZ8A 2P1FA 4AF0B 4E2DA 1FCVA 4XKYA 1EB3A 3N34A 2V30A 3A21A 2B7NA 4MFDA 2ATSA 1LRQA 3G1XA 5TBOA 2ZZ4A 1YADA 4FNRA 4OHQA 2E77A 5FEPA 1XL9A 1TPB1 3MHFA 4XTIA 4LRSA 2V2CA 3A5FA 3W88A 3PR2A 1UUMA 3WK1A 4JIQA 2A7RA 4WUIA 4CQAA 3BPWA 1DKWA 2HSAA 3P5ZA 1L9WA 4QNWA 4RXFA 3F4NA 4O11A 3PBYA 4WX2A 4UTLA 1GVOA 4DPPA 4CNNA 2JGYA 2JKPA 5BMWA 3VFLA 4ADTA 2VFGA 3S1VA 4DPQA 5HR6A 4EOUA 3EEGA 5EYWA 2EKCA 4GE8A 2H8XA 2E1DA 1CW2A 3W7DA 1F73A 1OFPA 3DKLA 2J88A 2YYTA 4NNCA 1I45A 1G69A 4O13A 3G1VA 3FEMA 4O57A 1OFQA 3EWZA 1A5AA 3UWYA 1YTDA 4Z08A 4NXSA 3KAOA 2XN1A 4N9BA 2H6RA 2VEKA 1ZAIA 5A5WA 3NVTA 1K03A 2V0TA 3TQVA 2FJKA 4K7YA 2RDTA 1ZAHA 2GQ9A 2VXNA 1R2TA 3MI2A 1AL8A 3AO0A 2C1HA 3RMJA 5HWJA 2Y85A 3E49A 2ISWA 4EF9A 3NL5A 5C6MA 5DCBA 3DAQA 5HWMA 5KTLA 3SGZA 3LHTA 1K3UA 2Y7FA 3NQ6A 1KFKA 3LXCA 3MP4A 4O0ZA 4K8HA 3Q2DA 1OYBA 1TO3A 5F2LA 4UNKA 5EKYA 2I14A 5H91A 2ZBTA 4JN6A 5C2XA 3ATYA 2V2HA 4D2JA 1RQBA 1THFD 3GDTA 4AHOA 1YYAA 2ZTKA 4X9SA 1NF0A 4HT3A 2J9XA 3BGGA 4LS1A 3NQ2A 5I3KA 3PM6A 4HPJA 3H55A 4FX8A 3W1NA 3LI1A 5KZEA 4NJGA 3W1MA 5LNWA 3E12A 1Q6RA 4MY1A 4UFKA 2Y89A 3QZEA 3SGUA 1OVDA 4Z1DA 2CLHA 3ABSA 3O06A 2HTMA 4XKYB 3C2OA 4I7UA 2NXIA 3SY5A 3O6YX 3WJYA 1ZHAA 2D73A 2CLLA 1H50A 1TPH1 4QIUA 3TMQA 1OFBA 4MZYA 1QFEA 1XBXA 2G5WA 2E09A 4UFLA 3NAVA 2DZSA 1TRIA 4JYEA 1AW5A 1YDOA 3G1SA 3LXBA 1KW1A 4UCGA 3PVFA 1VGAA 1A5BA 2PC4A 2FQIA 2VELA 1LBMA 1UJPA 1G67A 1M6JA 2W79A 4LY8A 2G95A 3BK0A 1JULA 1VH7A 3V1PA 3EB2A 4LVBA 4GUGA 5F4SA 3NG3A 3LDVA 2ISSA 1LBFA 4UXDA 4UTUA 3S8HA 3EWYA 4FX6M 3JRKA 1SW0A 1MO0A 4EF8A 1K8ZA 1OX5A 2ALDA 1S5TA 2NUWA 1KM3A 1YPIA 2C3ZA 5DBTA 1KFEA 3PUDA 5F2IA 2NLIA 1XKYA 3GKAA 3S5ZA 5E93A 4C1KA 3NR0A 3G18A 1I2OA 1Y0EA 1KM5A 1UUOA 4GBUA 1O4UA 1DHPA 4Y9AA 1H60A 1O60A 5G5IA 1B9BA 4FX7A 3DFQA 3QSTA 2Y63A 3W76A 2FFCA 1OYCA 1JCNA 3FJLA 1K7EA 4LTSA 2A6NA 1TJPA 3NO5A 5G2IA 3KX6A 1AL7A 3HBLA 3W7IA 1TPEA 2C16A 1UASA 1H7XA 1GJPA 1QPNA 1WV2A 3SECA 2A21A 1V5XA 1LLZA 2EGZA 3E02A 4NXKA 1F5ZA 3HB9A 1W54A 2GQ8A 2Q8LA 3TIMA 4FB7A 3W07A 1H51A 5KSWA 4A21A 3NQFA 1SFJA 1YPFA 3UWWA 3A24A 3QSRA 4UFJA 1LOQA 4UTHA 3DFTA 2GVGA 3PWAA 4IMEA 4LWWA 2CWNA 3H53A 4M6VA 4Z1AA 3TR2A 1ZY9A 3N3MA 3P82A 3NPVA 3P62A 1GYNA 4K7VA 5BMXA 4O50A 4GXMA 1KTBA 4L4MA 4K37A 2QCLA 2J9ZA 5AN7A 1KFCA 3WFAA 4DF1A 1TB3A 2DORA 2G96A 3ABQA 2CZEA 4P2VA 1SZGA 5I3HA 4AVFA 2QAFA 4O15A 4JTFA 1HL2A 2CLIA 2A0NA 5J5DA 4FHAA 4WQ6A 5D04C 3HQ1A 1JRBA 5HULA 2V5BA 5AYZA 4ADUA 3M5XA 2VFHA 3OHIA 1MEWA 1F2JA 4AXKA 1JCXA 4QJ1A 3G22A 4TU1A 3SR7A 1C29A 3MI3A 3O15A 4I7WA 1LTDA 4JIPA 3L0NA 4UIOA 2RKXA 3IVSA 1UCWA 1FDYA 1IGSA 3MHGA 4KKXA 1F76A 1QNVA 2QCMA 3DGRA 2FDSA 4O1BA 3GDKA 4N4PA 4MPQA 2QDHA 3W83A 3B06A 1HO4A 3IIPA 4TMCA 3S0CA 2Z6JA 1K8XA 1EP1A 1FWWA 4KWVA 4UNLA 5D2YA 4WD0A 5F1UA 3I7SA 2H3DA 2QR6A 1PHWA 4FXRA 3GDLA 3GDRA 3G0XA 3VI2A 1L6SA 2FPVA 3BW2A 4QAIA 1DBTA 3RFAA 1DL3A 3I68A 4NZJA 3W85A 3W7LA 3LOTA 3TJXA 1WBJA 1TIMA 4DEFA 3SFKA 3QW3A 3IV3A 1OG0A 4Y6GA 4IPIA 1TV8A 4OV9A 3UNDA 1IXNA 2FPYA 5DCDA 3WK3A 3MBDA 3TSMA 5K9XA 4MJMA 3MBFA 3DH7A 5D30A 2NUXA 3DFSA 4LV4A 3TU9A 3EX6A 4ZQRA 4I7VA 4UFIA 1OFAA 1VCGA 2ZRVA 3W2LA 1S3HA 3BG5A 1LCOA 5DXYA 3KRUA 5C5YA 1OFOA 1HFBA 4WOZA 2Y7GA 6ALDA 1OX6A 3UPWA 4OQVA 1TRDA 2YSWA 4HPXA 3EX3A 1GEQA 2LLEA 4IWWA 3NQVA 4CQ9A 1IF2A 5G2HA 4ORMA 2B7OA 4AF0A 3F1QA 3TQ0A 3P84A 1JR1A 3JS3A 5D2VA 2WNQA 4LT9A 4PODA 3M6YA 4P61A 3W7PA 1A50A 1SO6A 1JQXA 3PG8A 2C19A 2Z6IA 3OBKA 4LVFA 2C18A 2YFNA 2PRHA 3NZ1A 5CSRA 1I2PA 4PTNA 2VEMA 4X2RA 3N9SA 2VFIA 4WY0F 1VHNA 1RPXA 4O4VA 4NUWA 1TPDA 4QSHA 5DXXA 4PA8A 3UZJA 1YDNA 1QDSA 4JYFA 3G1DA 2R8WA 1OFEA 4FXSA 4FIRA 1NAL1 3QQ0A 4PCFA 1Q45A 3CU2A 5F2GA 4HKPA 4NNBA 4XBKA 1VYPX 3M43A 3NGJA 1TREA 4LC8A 3W2JA 4O18A 3A23A 2O7QA 4UTKA 1KM2A 3M41A 4N2YA 1PVNA 3IIOA 4ONVA 3IGXA 3W1PA 3UY7A 4MOZA 1VYRA 1W5NA 5FESA 5HWNA 2F84A 2Q3OA 4Y8FA 3G0SA 1LYXA 2I1OA 3LCIA 4OT7A 3NYZA 5D33A 3UXDA 4M7TA 3E9AA 3QC3A 3I7RA 4XWUA 2R14A 2V5LA 4JNMA 3FA5A 4KFOA 4O54A 5FF2A 3A22A 5G1TA 3G0UA 1GQNA 3BLIA 1YDVA 1T99A 4O10A 2WOQA 4RZ6A 2ZZ3A 2WO5A 3BLFA 1W5MA 3D0CA 3G3DA 4GUJA 3B03A 1XXXA 3W7KA 2QUTA 2YDAA 3HG5A 3HF3A 2QAPA 3BLEA 3BO9A 1R47A 1H7RA 3W74A 1QPQA 5CPLA 1JUKA 1GOXA 4PL1A 4KFNA 3DI0A 1VC4A 3CIXA 3SIZA 4A2RA 3MMTA 4A29A 3GNNA 2X1TA 1VLIA 3W7HA 2C15A 2BLEA 1QWGA 4MZ1A 3KOFA 3CLMA 3N2XA 3QEZA 4IPJA 1WQ5A 3DFNA 5CPOA 4MVAA 1XUZA 3B0VC 2J6XA 4RX0A 1YXDA 3S1XA 4BWLA 2NX3A 1GVSA 5AC8A 1PCKA 1HTIA 2WSYA 3BW3A 3LLDA 5CGQA 5DELA 3FOKA 1GVQA 1NSJA 4FNQA 5HUOA 2ZZ1A 1VR6A 3V75A 2E68A 2NXHA 1R2SA 3ABOA 3SSJA 3GZ3A 3IGUA 1G4TA 5HQEA 3TMLA 4TO8A 4JTSA 3NL3A 3N2MA 3OIXA 5BRBA 2ZZ6A 3EWBX 3R89A 4MLRA 3TW7A 4O1CA 4DQWA 2VKZG 3P5YA 2PRMA 2A6LA 3LERA 3W7EA 2XN0A 4GRSA 1KFJA 1R30A 3MW7A 3LXAA 4JEQA 5F1VA 2X1RA 1TJRA 1S5VA 3UWQA 4NJIA 1DJNA 3RLUA 3CPRA 1OK6A 1X1ZA 3TAOA 1F6KA 5AHMA 1EWDA 3C4UA 1TPVA 2GUUA 4DBEA 4UR7A 3NPUA 1H62A 1GG0A 1J2WA 1P1XA 3IRDA 5K2ZA 3NPXA 4HSNA 4QITA 5BNKA 5LNRA 4O16A 4O14A 1XBZA 3B05A 3LCLA 3CB8A 5F4WA 3VE7A 4ZL1A 3USBA 3A9IA 3W3OA 3IIXA 4OU1A 4QM1A 3QMRA 3P81A 3U6WA 2GQAA 5IBXC 3L0KA 4ZQNA 3OA3A 2HMCA 3N14A 5D38A 3UPBA 3Q58A 3W1RA 2FPTA 1KTNA 3TAKA 2F7FA 1VHCA 1L6YA 5D37A 3N9RA 1RV8A 3GVGA 5GVJA 4GC4A 3L65A 3W2MA 2GVJA 1FWRA 5D32A 3LV6A 3SI9A 2DZTA 2WSRA 4FNSA 3WJSA 3B4UA 3FKKA 4BWLC 4LOCA 1FQ0A 1IXPA 4WXZA 3IEBA 5AOUA 5FEZA 3M0ZA 5U4NA 4JTLA 2GOUA 1N8FA 3WJWA 2FB2A 4YLWA 4YWIA 3RNDA 3DFOA 5LGZA 2ATMA 2E5BA 1XC4A 1BEUA 2CU0A 4JTUA 3OG3A 3L66A 4DO6A 3NNTA 4UTWC 3NL6A 3INPA 5FF0A 1VCFA 3FYPA 3W73A 1W5OA 3R5EA 2BXVA 2CZ5A 3UWZA 1CX9A 1SZFA 3LGEA 3BV4A 4LS2A 4JTGA 5T26A 5LKYA 4WXYA 1LOSA 1C9DA 4PH6A 2CFFA 4UTJA 1MZHA 1ONRA 2B7QA 2YGYA 4O52A 4UFHA 1I2NA 2GPTA 2ZRYA 4GUHA 5KITA 2QJGA 4AHPA 1ALDA 4IXXA 3P74A 3OVRA 2ZDRA 4IUOA 3MUXA 2WV8A 3MYOA 4GWEA 3LTYA 3W1UA 1KFBA 3TCEA 1W37A 3TA6A 1M7PA 3BG9A 3LCWA 2CLEA 3FIGA 4PEKA 1QPRA 4RJEA 1SU5A 3O8AA 1RZMA 3PUEA 3EKZA 4N9DA 1O5XA 1VS1A 1X6UA 4AHQA 1T0OA 4HIBA 4LUJA 3TSDA 4JTIA 2CZDA 1QR7A 2ZRUA 3W7RA 5G4WA 4K8EA 1ZCOA 1PS9A 3O16A 2DZPA 3L5MA 4DBDA 1KLZA 1VQTA 1LLWA 2V81A 3T40A 1Q6OA 1W3IA 3HPSA 1FBAA 3L0GA 2TYSA 1MSSA 1PE1A 5KMYA 4MY9A 3YPIA 3N19B 2J24A 2C6QA 1W31A 3LI0A 5LHEA 5DLCA 1JCYA 1OYAA 3GR7A 3MJYA 2Y61A 2C13A 3HGJA 1U83A 5HR7A 2OZ0A 2WNZA 1H63A 1L6WA 3B8DA 3MWAA 3PSVA 3PC0A 4Q32A 4XUGA 4ZQCA 2H90A 1LM1A 3PF3A 1TPUA 1J5TA 1GPWA 2E6FA 3EKLA 4Y90A 3LHVA 1G6CA 2QKFA 1JUEA 5HNRA 2YXGA 3R13A 3LHWA 3TV8A 3C2EA 3W7GA 3W75A 1JCJA 1FWSA 2YCEA 3WJZA 3LV5A 1YXCA 3S1WA 3W9ZA 2OJPA 2RHGA 4ZVJA 4R53A 3QQ1A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4N9EA

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