4NJHA

Crystal structure of quee from burkholderia multivorans in complex with adomet and 6-carboxy-5,6,7,8-tetrahydropterin
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
TYAVKEIFYTLQGEGANAGRPAVFCRFAGCNLWSGREEDRAQAVCRFCDTDFVGTDGENGGKFKDADALVATIAGLWPAGEAHRFVVCTGGEPMLQLDQPLVDALHAAGFGIAIETNGSLPVLESIDWICVSPKADAPLVVTKGNELKVVIPQDNQRLADYAKLDFEYFLVQPMDGPSRDLNTKLAIDWCKRHPQWRLSMQTHKYLNIP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 7-carboxy-7-deazaguanine synthase
publication title Radical SAM enzyme QueE defines a new minimal core fold and metal-dependent mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia multivorans
total genus 67
structure length 209
sequence length 209
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.3.99.3: 7-carboxy-7-deazaguanine synthase.
pdb deposition date 2013-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13394 Fer4_14 4Fe-4S single cluster domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4njhA00
1O94A 4NJHA 4NQ1A 1Z44A 3LDVA 1VS1A 3W7QA 2VFHA 1EB3A 4ML9A 2ZZ1A 3CM4A 3DFTA 2Z2UA 2QUUA 1YPIA 3NQ8A 4XQ6A 5FEXA 4IMGA 4IOTA 3HQ1A 2QCLA 3CEPA 4O57A 1O4UA 3P84A 3T55A 4JTLA 5DCDA 3LCHA 3VKJA 2E09A 1TYGA 2RH9A 4GFSA 2Y89A 3GDRA 3TIMA 3MHUA 4M5PA 3W7MA 1YDNA 2Q8ZA 3TDFA 5AC6A 4QQ3A 4JS3A 1VH7A 3R8RA 3NQAA 1OX4A 3EX4A 1ADOA 1R30A 5KTLA 5KINA 1DORA 4FX7A 1RQHA 3N9RA 1O95A 1H7WA 3E49A 3IIXA 2G95A 1A53A 5BW6A 1ML1A 2FDSA 3E12A 8TIMA 3USBA 1ZCOA 3GR7A 4GWEA 5LGXA 3T4CA 1VYPX 2DZUA 3IIOA 3W6YA 2J9XA 3NNTA 5LNWA 3VCRA 4O1CA 5HWJA 4KWVA 3I65A 4N6EA 1FWTA 4OHQA 3T78A 1OX4B 4UC5A 1KFEA 4TIMA 4OBTA 4OV4A 4H6KA 3HG2A 5LNVA 1YLVA 3JR2A 1J2WA 3TW7A 4IMCA 2ISVA 3M5XA 2ZFAA 5LNRA 2J9YA 4AF0A 3SZ8A 3W87A 2NLIA 3TFCA 4U4MA 3RK8A 3UYCA 4POCA 1GOXA 3W7IA 4UMBA 4X2RA 1FCQA 3C52A 3GVGA 2GUUA 1I2PA 3B06A 2B0MA 3BV4A 3HGOA 2VFDA 4N02A 4IJBA 4O14A 3NQ2A 5K9CA 5I3JA 2WSRA 1WBJA 3UY7A 3L0GA 1HO1A 2C6QA 2VEMA 1TIMA 1W3NA 4IPJA 1OFBA 2NXHA 2OT1A 1XBXA 3SFKA 1K7EA 3S5ZA 4JDBA 3G8RA 1AW2A 1DBTA 3G1YA 4AF0B 1OX6A 1ZALA 5G4EA 3B8DA 4UTIA 1UASA 1OFRA 3OHIA 1SZGA 5CSRA 5FEZA 1JCYA 3EWWA 5BMXA 2RFGA 1LCOA 2ZZ2A 4MPQA 3G8EA 2WO5A 1GYLA 2QF7A 2OJPA 2VEKA 2VOMA 2ZRWA 1O60A 1JCXA 5F2LA 3TX9A 4LVFA 2VENA 4K8HA 3NG3A 4Y8FA 2DZVA 4KFOA 4AH7A 1JCNA 2FFCA 1I2RA 3QRHA 4H4IA 5U7SA 4LVBA 2G96A 3W74A 1RR2A 3W9ZA 1OG0A 3LTSA 3W2LA 1TPH1 2WQPA 2YXGA 3IGXA 4O0KA 2EKCA 1LOQA 2HS6A 1R2RA 3IIZA 4UMCA 3W84A 3A5VA 1ICSA 2YYTA 2PRMA 4YLWA 7TIMA 3PBWA 3W22A 2ZRXA 3DKJA 2Y7EA 3LXAA 1H7NA 2NX1A 1KM2A 4IXXA 4YCPA 1UCWA 3BO9A 3E02A 3W7GA 1OJXA 3DZ1A 4MY8A 1KM6A 1R2SA 4IX0A 2ZRYA 3O05A 4J9JA 3DAQA 3SECA 2WV8A 2GJNA 3S5YA 3W70A 1MXSA 3B05A 5K3VA 3G0SA 1VC4A 2DZSA 4O16A 4JNMA 3W7NA 1FUYA 1MZHA 3TUUA 5MHBA 2Y85A 5CPNA 1HG3A 1Q6RA 5KMYA 4TX9A 5G4WA 1YYAA 3GYEA 3QW4B 1H1ZA 3C61A 6ALDA 4K7VA 3DFPA 3G0UA 1G7VA 2JGQA 5I3GA 1F6KA 1WA3A 5CZTA 1JUBA 3W3OA 5GVJA 4Z1AA 3LHZA 1HUVA 5D03A 2V5LA 1OFEA 4M7TA 1XC4A 3NZ1A 5KZEA 3GKAA 3DFOA 3CIXA 3UQNA 1LOLA 3THQA 1TQXA 3G24A 4JTGA 1EX5A 4O4WA 4CQ9A 1KTCA 4MZYA 3BG9A 1G69A 1H7RA 3EWUA 4NXKA 1DQXA 3SY5A 4AWTA 4FNUA 2FPVA 3GK0A 5HMSA 3T7VA 5DN1A 1JUEA 2A7PA 3W1LA 4Z1CA 2FB3A 1XUZA 2NXGA 2Y7FA 3UWUA 1SSDA 4GJ1A 2H3BA 3CHVA 1IXPA 2W6RA 1X7FA 2Z6JA 4AXKA 1OYCA 1JQXA 2H90A 5AHMA 2OX1A 4UTKA 2Y6ZA 4JR5A 1W54A 1SQ7A 1NAL1 4GRSA 4O4VA 4DPPA 1K8YA 3LHYA 2C3ZA 4PA8A 4JEQA 3W23A 1KLYA 3WJWA 3MUXA 5AYZA 3NXFA 3NQ6A 4DF1A 5FESA 3ZR4A 2P1FA 5LZLA 5DY2A 2RDUA 4UR8A 4A2SA 4FO4A 4LUJA 4UTUA 1EPXA 1I2NA 1EIXA 4OV9A 1CX9A 3KHJA 5AHLA 3NL5A 1QPQA 3NR0A 1GZGA 3W1PA 2A5HA 1X6UA 2QCGA 1WYIA 4QAIA 1YADA 3RLUA 4UTTA 2CLOA 5CZSA 3QM3A 3QQ0A 2O7SA 1N55A 1RPXA 5HNRA 1G4SA 4BWLC 3UD6A 1V5XA 1XM3A 1DQWA 5T26A 1GT8A 2R94A 4NNCA 3WJSA 1RD5A 1JCMP 4AB4A 3MI3A 4QNEA 3LCWA 3P5ZA 3ABOA 4NNBA 4LRSA 5AB3A 3EXRA 1H7XA 1DJQA 4AHQA 5LHFA 5DLCA 4A21A 5H91A 4O19A 5F4XA 4XTIA 3EWYA 2ZA1A 1S5TA 2WNQA 2E6AA 4RV8A 1P4CA 4MVAA 2NX9A 2A6LA 1KFLA 3S5NA 5D2TA 4DEFA 2QDHA 4WOQA 1VCFA 3UWZA 3FLUA 3LHVA 4BF9A 5G2HA 4ONVA 2YPIA 2CLHA 2QEZA 1OHLA 1N7KA 5EBUA 3NZRA 1VHNA 1XBVA 3B4UA 5FF7A 3C3NA 3O16A 1YXYA 3MMTA 1F73A 3G1HA 2ZTJA 1W5QA 3PS7A 2B4GA 4O53A 3WJZA 4GUIA 3P5YA 1R2TA 4BI5A 4JTEA 3M9YA 3CTLA 5DCBA 3S0CA 5F1UA 2V82A 3PVFA 3THAA 5K4XA 3GDTA 3H54A 1SFJA 1HTIA 4Z0JA 4NX0A 2JKPA 1SW0A 3G3DA 3UY8A 1N8FA 4R53A 4Z08A 4NJIA 2CLMA 3PUEA 5LKYA 4FX6M 4ZQRA 2CZEA 1I8JA 2NWRA 3GDMA 1GTHA 1F74A 3BGGA 1S3HA 3EX2A 3CWNA 3LV6A 1G4TA 2X1RA 4K36A 4XUGA 3C56A 4O54A 2GVGA 2ZRZA 4ZQPA 3OVQA 3IVSA 4LV4A 3TAOA 1XBYA 2VKZG 4K39A 1LBLA 3W1MA 4B5NA 3PWAA 4ZQNA 4JD4A 2ALDA 2YFNA 4KWWA 1OABA 3NQ7A 3DFSA 3TA6A 2CLIA 3W7KA 3GB6A 3BW2A 3M44A 3MP4A 2FPTA 3DHFA 1HFBA 3W1RA 2DZXA 5CG7A 2GJLA 1RQEA 3LLDA 5BMWA 1TJRA 2W0UA 3S5OA 3O8AA 1L6SA 3PBUA 1TRDA 2E6YA 3ABSA 2QDGA 3W76A 1Q45A 3LV5A 1OF6A 4HPJA 3TC7A 2FPYA 4FNRA 4GXMA 4GUJA 1OK4A 1FCBA 4H3DA 1T8XA 5G2WA 1L2UA 2ABAA 4X22A 3TJLA 3W1QA 5C5YA 3LXCA 2YR1A 3C0JA 3HF3A 4ZZ9A 3LTYA 4LY8A 3HGJA 3TSMA 2P0OA 1VZWA 2LLEA 3L21A 2OCZA 1GG1A 5AOUA 2NX3A 4L4LA 1ONRA 4AWUA 5F2IA 1YXCA 3W2JA 2EPHA 2NUWA 3V75A 5FF3A 3LB0A 1BKSA 2BSLA 1WX0A 4IQLA 3FIGA 1FXQA 1P1XA 1KM3A 2V81A 3W1NA 2VC6A 4O17A 3UWWA 3EXSA 3FYOA 1KV5A 1PVNA 3O6DA 3GXPA 1GWJA 3IVUA 3W7PA 4E2DA 3S8HA 1IGSA 2PE4A 3MHGA 1PS9A 4WJEA 3L68A 3MJYA 1V7YA 5D37A 4A29A 3W1XA 5C2XA 3OEXA 5AYYA 4Z1BA 3PB0A 2YDAA 4CQ8A 4CNPA 1NF0A 1YTEA 5AHFA 2QJHA 5HUOA 1A5SA 4RXGA 2HSAA 2XN1A 3A5FA 1VHCA 1D3HA 5EYWA 4XWUA 2F84A 2CFFA 4FX8A 4Z1DA 1T99A 4RLIA 5L9FA 3M5VA 4JYDA 4YXGA 5HR6A 2EF9A 3DFNA 1M7OA 2V2HA 3FYPA 1HL2A 4A3UA 3P82A 3N2XA 3BG3A 3INPA 4HNUA 2XN2A 3P8JA 4FIRA 4O28A 4MYXA 3GIYA 1I45A 1QPOA 5AHNA 4D2JA 3GNNA 5DBUA 5F2MA 3W72A 1QR7A 4AVFA 5BRBA 5J5RA 3GXNA 1M6JA 2V9DA 4S2CA 2WNNA 4JGDA 2PRLA 3HPXA 5SWUA 1CI1A 3WJYA 5AHIA 3PM6A 5D2YA 3W85A 1WAUA 3RLVA 3D0CA 3SW6A 1H60A 2DJLA 1SO4A 1AG1O 1AW1A 4RZ4A 5C55A 2FB2A 2OT0A 1FWSA 4O18A 1Q6LA 5AC8A 1F76A 2NV2A 2QCEA 1TRIA 2GVJA 3E96A 1LDCA 1TQJA 4O0ZA 4JTUA 3U8GA 3Q2DA 3W75A 2ZA2A 1GG0A 4YWIA 1O5KA 2X16A 1W8SA 2QCDA 4N9CA 3WJXA 4FNQA 1TTJA 3LM7A 4N9EA 3MBFA 5F1VA 3A9IA 5CZJA 4Y9AA 1KTBA 1ME9A 1IIHA 2GQ9A 2V2DA 1KBJA 4JX6A 3HGSA 4JYFA 4M7SA 1ZENA 2CZDA 2CW6A 3G0XA 2YYUA 3NQCA 2FQIA 5C6MA 1D9EA 3IRDA 1BEUA 4CQAA 2WPBA 1W1ZA 4FF7A 3WK0A 3CB8A 2DZWA 1TV8A 3DI0A 1LBMA 3DKLA 2QCDB 3LRLA 4MLJA 1S5VA 3NPVA 1A50A 4MJMA 2QKFA 1TREA 1H7PA 1NF7A 1QFEA 4AHOA 2ZRUA 4O8RA 4X9SA 2NZLA 3V1PA 4JDYA 2RHGA 5HQEA 3W7CA 3GX9A 2IQTA 3TK7A 4DO5A 1UB3A 4AHPA 4NNAA 3PBVA 5FF4A 2WSQA 4S2BA 1X1ZA 4MY1A 5D09A 3TE9A 1LLWA 4JTIA 4IGHA 4NX5A 3TQVA 3FJ6A 4UR7A 3ZFHA 4LS2A 4LRTA 4LS1A 4OWGA 5KZMA 2OMAA 3BPWA 3DHDA 5AC7A 1XUUA 4JTKA 1R46A 1R47A 1GVSA 1ZAIA 1M5WA 3QW3A 5CSSA 3O07A 4JXCA 3G1XA 4FNSA 4R7JA 1XCFA 5CPOA 1P5BA 1EWEA 4O1AA 1YTKA 2TYSA 3QMRA 2A0NA 4O50A 4O52A 3I7SA 3KRZA 1JRCA 1H7OA 4A2RA 1WDWA 4O1BA 1QPRA 1Y0EA 1OYAA 2I9EA 2EAWA 2X1UA 1C8VA 2DJXA 1RVGA 3K30A 4HPXA 1FX6A 2V30A 3C6CA 4ADTA 1GTEA 2Z1BA 1H50A 3M7WA 3KVKA 5DELA 4RZ5A 1PCWA 1F7BA 1UJPA 2GQ8A 4GUFA 3MO7A 2BX7A 2ISSA 2KZHA 2JKAA 4PCFA 3FEMA 3ATYA 3TQKA 3NVTA 2C0AA 2ZBTA 1KM0A 3P81A 3CLMA 3LI0A 3QSTA 5K4ZA 3EWXA 1MEHA 3PC0A 3LBMA 3BVJA 3CIWA 3N9SA 1VLWA 4WY0A 1SO3A 2C14A 2A85A 3QQ1A 3LX9A 4PODA 2QCCA 1SZEA 4ALDA 3BARA 3GDLA 4BI7A 4BWLA 5IBXC 3M0ZA 2BTMA 2R91A 1JJKA 1OK6A 2HMCA 1IF2A 1SW3A 4MOZA 1K02A 1PHQA 3ABQA 3PB2A 2C16A 1IXQA 1OVDA 2B7OA 2R8WA 4KFPA 4HNNA 3GDKA 3G1FA 5CGQA 4BK9A 3C2VA 5CPLA 3PR2A 3I6RA 3TXZA 2CU0A 3O15A 1SUXA 5EPDA 3I7QA 2ABBA 3LGEA 3LHUA 4WY0B 5F4SA 2E68A 3MI6A 4ORIA 3TFXA 3LCGA 2ZCGA 3VI2A 3KVJA 1FDJA 2VFGA 4HT3A 5G2IA 1ME7A 2EHHA 3EX3A 1GQNA 1L6YA 4EF9A 1PIIA 1DHPA 2G5WA 2JKEA 3W7HA 1RV8A 3LOTA 2DP3A 2OZ0A 1P0KA 4AAJA 1Q6QA 3MHFA 3TQ0A 3NDOA 5D32A 2XFWA 3G3MA 1B3OA 1F2JA 1K03A 4NT0A 4UTJA 3TR2A 2QCFA 1EP1A 3M47A 4BFAA 2CLEA 2Y70A 3W1UA 4JX4A 3TH6A 5LHEA 3LHTA 2YSWA 4RX0A 1W3TA 4JICA 3BLFA 3HBLA 1YXDA 4UTWC 4GE8A 2CLFA 4RKAA 3WK3A 3NOEA 5CPMA 3TMLA 3CQ0A 1NVMA 2ZZ7A 5E0KA 5CKSA 3W2NA 3KVLA 1FWWA 4ORMA 5D2XA 4DELA 3R13A 1H51A 4AEOA 3S9YA 3P61A 3A21A 3UZJA 4YCOA 1QDSA 3NGJA 4CCEA 2A1YA 3CPRA 2Y7GA 5D05A 1DJNA 1TV7A 3STEA 3LCIA 4NZJA 1ZJIA 1JULA 4QJ1A 4GC4A 1JCLA 2NUYA 4NJKA 3DFQA 4NJJA 1TPWA 3AO0A 1GJPA 1KBIA 2AGKA 4S1FA 1AL7A 5HWNA 3S6DA 3QPYA 4DBEA 3KOFA 4K6AA 4Y6GA 1DV7A 3VNDA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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