4NNAA

Apo structure of obca
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
524
structure length
493
Chain Sequence
TSLYITAAPIGAVPFLDPFEATFIPSFLLEGFFDADRCASIAADLKTDGWEVVPAGGRLLQVGHAQPIRWTRHPPRLAAPNAAHFPPWLAALSNKLARRIVLQLTTYGWIVSEQGDLLWEHERQHHYLPPALIEAIEKESPALLKNMEEAGWIACAAGYWQAGKARSPYLPITPEAITEETIRSMRAGAAVVHLHTRDLSDRRRIEIPGLGVVTVGSQRNQIVLDDYDAIVPMVKREPAAILNLSTSVRGDRHGARSKLRRAHLFYDDVGSAPEVASLSPAAVVFQGGGGYDNAPDFLDAQFDHFERVGTRPEVEVFNHAIVDNATSLYRDRLLRTGKPVLFMLVAGVDQYRRDPITGEVEDDSLIARVVREEISSLLADESADSHRRAVELAIGQLRPVVERLRASFPVSKISILLPGPMQNLLVDVALGLGLDGIRVGLEDGLTVNDARVPGGVRARGTWEQVSLVREELLGRGATILTAAQVRDMFGLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Lyase
molecule keywords OBCA, Oxalate Biosynthetic Component A
publication title Structural Basis for Bacterial Quorum Sensing-mediated Oxalogenesis.
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia glumae
total genus 158
structure length 493
sequence length 524
ec nomenclature ec 4.1.3.-:
pdb deposition date 2013-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05853 BKACE beta-keto acid cleavage enzyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4nnaA01
3HG5A 1NF7A 4L4MA 4MY9A 2ZRXA 1SPQA 2H8ZA 4P2VA 2QKFA 1JJKA 3EWZA 1QNVA 3NPWA 2VEIA 3K30A 2ATSA 1S3HA 1UJPA 5FEPA 1KM0A 1XM3A 1KFBA 4E0CA 3SJ3A 1TPFA 4A21A 3Q37A 4LS1A 2QR6A 5E0KA 3EXRA 2ALDA 3G3DA 5K2ZA 1U83A 2V2HA 4MIMA 1RV8A 4JTEA 3QQ1A 4Z0SA 2NUWA 2A7NA 4UXDA 2Y7GA 2BTMA 3DFPA 3G1FA 4O11A 2XN1A 4O50A 3C8FA 3O05A 5I3GA 1Z44A 3EEGA 4E38A 1TPDA 4N6EA 4O1AA 1W0MA 3NYZA 1R2SA 5KTLA 1OFPA 4DF2A 1KFLA 3LCFA 4JX5A 4LWWA 1EP3A 1GJPA 3S9YA 5AHLA 1B9BA 1JUBA 1TPVA 1TPWA 2V30A 2QCLA 5D33A 2BXVA 2VFGA 3MYOA 3WJWA 3M41A 1O94A 5DN1A 2H90A 3WK3A 3UPBA 2A85A 3T7VA 3GDRA 1ZALA 2FTPA 2CLKA 4W9TA 4UFMA 2ZQ0A 3PM6A 1VZWA 4FNSA 4Z08A 3QSRA 4K7VA 1XFBA 2QCCA 2CZFA 2V2CA 1S5WA 1TIMA 1H1YA 4RR4A 5FF2A 2A6NA 4IMGA 3TKFA 3C52A 1R46A 3NR0A 3A21A 2YW4A 3GAYA 5CPNA 1R2TA 1L9WA 3PULA 5HWJA 4WQ6A 5FF7A 1AL8A 5HMSA 2VFDA 3I7QA 4UTTA 2C3ZA 2QEZA 1JVNA 1DBTA 4IMCA 1H7OA 4PL1A 1TPH1 3F4NA 4JX4A 3NQ6A 5G2HA 4ZL1A 5F1VA 5DBUA 4JNMA 2C16A 3LLDA 1SSDA 3PG9A 1W56A 3B05A 3LV6A 4AWTA 3HG4A 2GQAA 1TTIA 3PVFA 2NX3A 3UWZA 1KA9F 3MW7A 1OYAA 4FNPA 4O0KA 5D2WA 4JY8A 1FWRA 3CEUA 4IXHA 3A24A 5KZMA 3BARA 4WY0F 3CB8A 4R53A 3NEVA 5HNRA 3IIPA 2ISWA 4JYFA 4O17A 3TIMA 1GPWA 4RKAA 3EWYA 1TV5A 1VLIA 3BG3A 3DHDA 3S5YA 5F2IA 1I2PA 1D3HA 3MBDA 1A5SA 1NF0A 3PS7A 1QCWA 4GRSA 2QCNA 2ZA1A 3G1SA 3GLCA 3G3MA 5I3FA 4A3UA 4NJJA 1TV8A 2R94A 5CKSA 3DFOA 3M5VA 3KHJA 3QEZA 5D09A 1FDYA 2GQ8A 4NXSA 1GVRA 3GKAA 4QM1A 1OFQA 2E09A 4FNRA 3W07A 3EWBX 3N2MA 1JRCA 5AC8A 4UMBA 4PA8A 2BX7A 4FNQA 3W7NA 4YXGA 1I2NA 1I4NA 4DO6A 2G95A 2JK2A 3QQ0A 2EKCA 5LHEA 4O12A 5D2VA 2ZZ2A 4LY8A 1I2OA 1FUYA 1ICPA 1LBLA 4MYAA 1XUZA 4XUGA 4NU7A 5F2GA 5HR6A 1OFDA 4MPQA 2Z1BA 3GXNA 1XUUA 2TPSA 1IXNA 2J24A 4CLMA 1AK5A 5AYXA 3T4CA 1HFBA 1OYCA 4JTFA 3TAKA 5KITA 1OFRA 1J5TA 3IRDA 5HUPA 3B03A 4LUIA 2PC4A 4G1KA 5HWNA 1OF6A 4JIQA 3FLUA 5IBXA 1B3OA 3O16A 1KFKA 3NQFA 1WDWA 3UPWA 3QPYA 2H8XA 2YCEA 4MUZA 4HPJA 4JTTA 6TIMA 3NZ1A 4IX0A 3BW4A 3I7RA 2B7NA 2NV1A 3ATYA 4DBEA 3LV5A 3OA3A 5D05A 3PSWA 3G24A 4OV4A 5SWUA 1V7YA 3W87A 3W7EA 1W5PA 4AMAA 3FJ6A 2PE4A 4OGZA 3VKJA 5BMWA 4RJEA 1K02A 3C3NA 1H7RA 5K4ZA 1O60A 1PCWA 5EA9A 4DQWA 2C15A 3MBFA 3BLFA 1KFJA 5TBOA 2WSYA 1A5CA 1X8FA 2LLEA 5HJLA 1YDOA 3HOJA 3Q58A 1ME9A 3W7DA 4IOTA 2ISVA 3E12A 5EPDA 4BF9A 3M5XA 3O6CA 1P5BA 4GNJA 1R2RA 3CLMA 2V8ZA 1XBVA 3O6DA 3STFA 3QM3A 4UNKA 3RF9A 1W3IA 3OIXA 3BW2A 3PBUA 2JKPA 2EPHA 3DXIA 1GVFA 2PRMA 1HG3A 1MZHA 2PRHA 3LCXA 3BLEA 3T55A 3W7IA 3UQNA 4WX2A 4AAJA 3IGSA 3NNTA 3TFCA 1TO3A 3E9AA 4UNLA 1W5OA 1OYBA 1PCKA 3MJYA 1FWSA 2Q3RA 3SY5A 1CW2A 5GVJA 4GUHA 2DZSA 5AYYA 1AMKA 5I3KA 1VCFA 1SW3A 4C1LA 3E02A 3P81A 2PURA 3FFSA 3G8RA 4ZQRA 3W2LA 3TU9A 2EGZA 4ORMA 3LHYA 2ZA3A 3CIXA 2G5WA 3W74A 5KINA 3UD6A 3N3MA 1A5BA 2Y61A 3S5NA 3GAKA 3MO7A 1F5ZA 4JTKA 1ONRA 3EX6A 4AHQA 1F6KA 3QFEA 1C29A 4NJIA 2VOMA 4DO4A 2FB3A 4O0ZA 3MYPA 5D03A 3MHUA 3MP5A 2V9DA 2X1SA 2ZRYA 3S6DA 4CCCA 3BGGA 4XTDA 4JR5A 1WOAA 1RPXA 1YLVA 4I7WA 1NFBA 2A1YA 1KFCA 2AGKA 4MFDA 3FYOA 1EUNA 4QNWA 1S5TA 3W6YA 3N34A 3BPWA 3L5MA 1QPNA 1KLYA 3S5ZA 2RHGA 2YYTA 3L66A 4JN6A 1PS9A 3P82A 3PBVA 3TDFA 2FB2A 3TV8A 4JYDA 7TIMA 3TC7A 4A29A 2C18A 3PG8A 3LB0A 2E77A 3GR7A 4UIOA 2J9XA 3NPVA 5CZTA 4CNNA 3A22A 3IIOA 2DZPA 2Y7EA 1XXXA 2QUUA 1TB3A 3L0NA 1G4TA 4M5PA 5KMYA 3INPA 1FCBA 1TPC1 4O16A 3UWQA 4UTJA 1X7FA 3BGJA 1OK4A 5H91A 1XBXA 3P61A 2ISSA 3UXAA 3G8EA 2A7RA 5HUOA 4S2CA 4UR7A 3LX9A 3HB9A 4O54A 1OHLA 1C9DA 4IUOA 5EYWA 1WXJA 1JCLA 3DU0A 1Q6QA 3S42A 3LXCA 3EX3A 1JQVA 4TIMA 1EEPA 3W7MA 4MZ8A 5F4XA 1JRBA 4Q32A 1FBAA 2VEMA 1GG1A 3DFTA 3M44A 5DY3A 1ZHAA 1PE1A 3UWVA 2YX0A 3N9RA 4LUJA 1SW0A 5T26A 3CM4A 3MI6A 1KM2A 1EP2A 3TK7A 3NPUA 3B04A 1SQ7A 3OVPA 2JGYA 5BMXA 3LRLA 1EP1A 1H61A 1H5YA 1TQJA 2WPBA 4YCPA 2RDWA 1I8JA 1H7XA 2ZZ6A 3GVGA 3MP4A 3NL6A 3I68A 2VELA 3E0IA 4KWWA 3TNOA 3D0CA 3TSMA 2ZRVA 3GNDA 3WJXA 1L2UA 1FQ0A 1G7VA 1T8XA 1KFEA 2UV8G 4A2SA 1ML1A 4Q33A 3ATZA 4UTWA 3NQGA 5AHFA 5TIMA 2V2DA 4LS0A 4Y6GA 3TJLA 3HF3A 4OHQA 4O13A 1G4PA 4A22A 3PUEA 3EXTA 5DLCA 2WKJA 2YR1A 2ZFAA 3G0XA 1RZMA 1SU5A 4HNTA 2VXNA 3BW3A 4PH6A 3LBCA 3P5ZA 3HG2A 4Y96A 3UXDA 5FESA 2ZRUA 3SZ8A 3CWNA 4HSOA 5AHMA 1LDCA 2V5LA 5AHEA 3UWWA 2VFIA 3UZJA 4ZVJA 1FCQA 1H62A 3PWAA 2Y7FA 3QJAA 5F4WA 2CLMA 4LOCA 1X1OA 1MEHA 4HT3A 4N02A 4NX0A 1RR2A 2QJHA 4IX2A 1G6CA 2E5BA 3QRHA 3W3OA 2QUVA 3O15A 4X3ZA 4LVFA 2Y85A 2I9EA 4LV4A 1SO5A 3S8HA 4O28A 1SZEA 4YL2A 4P61A 5LGXA 3KX6A 4YCOA 3UZ5A 3V1PA 1TTQA 5C2XA 3W75A 2VFHA 3WJZA 4O1DA 2E68A 4XWUA 1WA3A 2YFOA 2GOUA 3TQKA 4X22A 2CLHA 4NNAA 5LNVA 4RZ6A 2JKEA 4UFKA 4WJEA 5BNKA 3F03K 3QC3A 1TPEA 4XQ6A 1VYPX 2C0AA 4QAIA 1B4KA 1F73A 4CNOA 1YXDA 1WYIA 2P0OA 3FEMA 4IMFA 5F2MA 3U8GA 5U7SA 1YADA 3ZWSA 4L4LA 1VQTA 3P60A 1LM1A 2ZBTA 1EA0A 4NJKA 3IIZA 2ZA2A 4IPIA 2CZEA 1XBZA 3TA6A 4ZMGA 3RMJA 3HGSA 2QCEA 5E93A 4NUWA 3FOKA 2J9YA 3DFNA 3LHTA 2H3DA 3TROA 3TH6A 4BK9A 1H60A 3WFAA 2E1DA 2DZXA 1HL2A 1OFBA 1IGSA 5CPLA 2WOQA 1GYNA 2GJLA 2WNZA 3GIYA 1GYLA 4OQVA 3EKZA 3M0ZA 4Z1CA 3RFAA 2PCQA 3GB6A 2GVGA 2GPTA 4QITA 3DI1A 3EWUA 4N6FA 3OVRA 1EIXA 1W3TA 3SW6A 2FJKA 2WQPA 3W7OA 4IXXA 1TCDA 5KZEA 1R30A 3B06A 4DO5A 5HWMA 2Z2UA 3RLVA 4LW7A 3W7CA 4B5NA 1ADOA 4CQ8A 1TQXA 1YPIA 3NQAA 1LYXA 2DJXA 4OBTA 1F76A 4JTLA 2Y70A 4K8EA 4M7TA 3M7WA 1VR6A 4PC8A 3KOFA 1UUOA 3G1AA 1FWWA 1ALDA 1M7OA 2XN0A 1IXPA 5G1YA 2OT0A 3S1WA 3OHIA 3T40A 4UCGA 2YGYA 2QCGA 2Y89A 3TX9A 1O5KA 3NQ2A 1ZAHA 4O1CA 2ABBA 4QQ3A 3G1XA 1LLWA 4DEFA 1KBIA 3PAJA 5D37A 4DPQA 3HPSA 4ML9A 1AG1O 2DJLA 2QCDA 3W23A 2HTMA 4O18A 3W85A 4UFJA 4JY9A 1SR9A 1H7NA 1ICQA 1NEYA 3JR2A 3Q94A 2B7QA 1DOSA 3L5LA 5D2TA 5LNUA 3L0KA 1GVOA 4QNEA 1K7XA 1THFD 4S1FA 3GXTA 4AWUA 4QJ1A 4BWLC 1TJRA 3HGRA 1OG0A 1JCNA 2E6AA 3H55A 4I7UA 5FI8A 4HNUA 1IF2A 2A21A 2J27A 3C2VA 2TYSA 5LGZA 1AW1A 4GBUA 2YFNA 5DY2A 3H53A 4O19A 3ZS4A 1M6JA 2CZDA 4UFHA 3W86A 3TFXA 4EF9A 2NUYA 2P10A 1SFJA 2CLOA 3W7KA 3JRKA 1OVDA 3W84A 4BI5A 4AVFA 3MHGA 4R7JA 4Y9AA 1TTPA 3EB2A 4OE7A 3NGJA 4HHPA 1LOLA 2ZZ1A 3W2MA 3RLUA 4KWVA 4FXRA 2NV2A 3TW7A 3L67A 4UTUA 3KFTA 1FWTA 5DELA 1JQXA 2CWNA 2FPVA 3C4UA 5FF4A 4IPJA 3B4UA 1OX4A 2RFGA 5DCEA 5I3IA 3C61A 3STGA 3LXAA 3THAA 5FEWA 3SIZA 2V82A 3NQDA 1BTMA 4RK8A 2W79A 2E6FA 3N19B 3QMRA 1O95A 4UTTC 3WJYA 2CLFA 1BWKA 5H2ZA 2A5HA 3B0PA 1I45A 5HR7A 1DHPA 2ZZ7A 1W31A 4ZQPA 2ZTKA 4LVBA 3EX2A 1D9EA 1W5MA 5DCBA 1U5JA 2AQWA 3FS2A 3BVJA 1SSGA 4XKYA 3CPRA 1ZNNA 4PTNA 5D02A 1HO1A 1ZJIA 2FPYA 2RKXA 1SW7A 3W76A 3NAVA 4N9CA 1ZAIA 2I1OA 3TCEA 3NVTA 1VCVA 1H1ZA 4XBSA 1EPXA 2WNNA 2DZTA 3W1RA 4FXSA 2FQIA 3NOEA 4QSHA 3GYEA 2FDSA 3KVJA 4M6QA 4MFEA 5D32A 5BRBA 4RXGA 5G4EA 1N7KA 4O52A 1HTIA 3G0UA 1WQ5A 1IXOA 1EUAA 5D2XA 1PVNA 1W54A 1LOSA 3P62A 3W1TA 2NXHA 4PODA 1Z48A 2EAWA 5LSMA 3BLIA 5D04C 3LXBA 2X16A 1KM1A 3S1UA 1W1ZA 2ZZ5A 3DKLA 3BO9A 3LHWA 3RNDA 2NZLA 4LVAA 3SGZA 1XL9A 5K7JA 1RQBA 3LCIA 4JGDA 4WOZA 1UUMA 2C19A 3SGUA 3STEA 1JCJA 5K9CA 2C6QA 3R5EA 1UB3A 4FX7A 5A8GA 4NJGA 4K36A 2ZZ3A 3P67A 3B0VC 3N73A 1VYSX 2C14A 3HPZA 3NG3A 3IIVA 4LVGA 1XKYA 1K8XA 3EXSA 4WD0A 1OX4B 2YDAA 3NDOA 2DZUA 5EBUA 4RZ5A 3G18A 2R91A 1Q6RA 1LZOA 3PC0A 2JKAA 3LM7A 1VCGA 2DU2A 3HMJG 3Q2DA 3DBPA 4ADTA 4O1BA 2CW6A 3WK2A 5KZDA 3W7PA 2FIQA 1K7EA 1JCMP 2B7PA 2XFWA 1VPXA 3TUUA 1IXQA 5IBXC 1WX0A 4LV9A 1F2JA 3OEXA 3I65A 2TRSA 1F6PA 2ZZ4A 3EKLA 4FEZA 2O7SA 4XKYB 3MP3A 4X9SA 3M47A 3L68A 4N4QA 4JEQA 3DFQA 1KM6A 2BZNA 4GXMA 4Z1DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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