4NRSA

Crystal structure of glycoside hydrolase family 5 mannosidase (e202a mutant) from rhizomucor miehei in complex with mannobiose
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
416
structure length
416
Chain Sequence
SEFAFVKIASDGKGFTRYGEPYLIRGANYWQGMNLGADDCSGGDRKRMELEIKQMAEMGINNLRVMASSEGPDDQPYRMRPSMMPQPGKYNEGVFVGLDYLLDTMDRYNMTAVMTLGNFWQWSGGFGQYVAWITGNQTIPYPVGDVTYDEFTQFAARFYNDSEIAPKANKLFKDHIYTVQNRRNTVNGKIYKEDPVIMSWQIANAPQEAPASWFEEISTFIKKGAPKHLVSAGLESKLDEYDFDRAHDHKNIDYTTCHCWVENWGIYDPADPDGLPHANEYMHDFLESRSKWAAQLNKPIVMEEFGMARDAWRNPEDETYKYLPSTPTSHKDEYYQKAFNQIVSLASNRSFSGSNFWAYGGEGRSTYPPNPYGMVWLGDPPHEPHGWYSVYSNDTTVQIIKDYNANLLKVQKELSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Exo-beta-1,4-mannosidase
publication title Structural insights into the substrate specificity and transglycosylation activity of a fungal glycoside hydrolase family 5 beta-mannosidase.
pubmed doi rcsb
source organism Rhizomucor miehei
total genus 157
structure length 416
sequence length 416
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.25: Beta-mannosidase.
pdb deposition date 2013-11-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4nrsA00
2V38A 2J78A 2DH2A 2G4FA 3W28A 4ACYA 1CXLA 2UY4A 1BPLB 2E9BA 4W5UA 3MMDA 4YHEA 4AIOA 2W62A 4P7LA 4D6GA 2CESA 1J0JA 1SMDA 4W85A 2DSKA 4ZENA 3L2MA 3DC0A 1CGUA 1V6VA 1KFWA 1HIZA 2QMKA 4H04A 1DHKA 3LPFA 1TCMA 4LYQA 4S3JA 1GOOA 3VGFA 4AZHA 2EBNA 2A3CA 2IXUA 1V02E 2XGIA 1E1EA 2YOCA 2FHFA 2Z1SA 1WCGA 2ZIDA 2FDMA 2PBGA 3VINA 1KGUA 5C8BB 2JALA 2CBUA 2YBUA 4F79A 3ARRA 1XC6A 3UESA 4NRSA 2WVTA 4LX4A 1BVNP 3CTTA 5E6YA 4RL3A 2EPOA 4V27A 4PCSA 5CZKA 1BYAA 3W4RA 2NT1A 1UD2A 3W6LA 1UKQA 2WMIB 1S46A 4Q7NA 1DWFM 3K1DA 4CVUA 1GJUA 3VD7A 3WKZA 3CUIA 2WHMA 5AYIA 1TUXA 1NQ6A 4RE3A 4MNJA 3G6MA 3SURA 1GQKA 3VX0A 4N0RA 1MQRA 2OWWA 3UEQA 3CZLA 1AVAA 3UERA 1J0YA 3WL1A 2XFFA 3W24A 5CG0A 2X1IA 2WVUA 1BSIA 4W8AA 3AHTA 4W7WA 3U7VA 1JZ2A 1E0XA 4AD0A 1KR1A 1JAKA 3BSHA 1ZBVA 3WD3A 3ZOAA 3VDCA 3A4XA 1RP8A 3WDPP 4AXNA 2ZXDA 2XGBA 1VRXA 5I3DA 3ARYA 3WDIA 1Q6DA 4CN1A 2DSUA 3SUSA 5I78A 1K9TA 6CGTA 1JZ7A 2YKKA 3VMPA 4BQ3A 2ZICA 5GQBA 3BAWA 3I3EA 1C92A 1TA3A 4AC1X 2CITA 3GXDA 1JDCA 1MXGA 3VMNA 2G3NA 3WF0A 2F2HA 3SUVA 3CHCA 3PBGA 3TONA 4NZCA 2C7FA 4LPCA 3WQ6A 1W1PA 1C7SA 3VIJA 4CU8A 3SCSA 3VD9A 2QPUA 1V08A 2JF7A 3OIHA 2FHCA 5A6SA 2WMJA 1MFVA 4EAMA 1ISZA 4M29A 1MWOA 1Q4NX 1FH9A 3GZAA 3WNPA 4XB3A 2J62A 3UG5A 4GO8A 3AIUA 3I3DA 4W8LA 5A3HA 1B3ZA 2DSWA 4WK9A 1WKYA 3RIKA 1TR1A 4M8UA 8A3HA 2BVTA 2JIEA 3TOPA 5I5RA 3KL5A 2XJ7A 2DT3A 3BAYA 4LYPA 3AHZA 3QHOA 4UFJA 1EXPA 4P7RA 3S2CA 1FFQA 2J47A 5CGTA 4AISA 3BXWA 4JHZA 3VGEA 1SYTA 3THDA 3UR7A 2WC3A 1E4LA 4DWSA 3BMVA 2DT1A 2UY3A 5IFPA 1JNEA 1NH6A 1ZBWA 1RP9A 5BYWA 4M80A 4J3SA 3BAKA 5GNYA 1CZ1A 3AYRA 3PN8A 1FA2A 1NP0A 3T0DA 3J7HA 3GNOA 1C93A 3VTRA 1VBUA 2WHJA 3IJ8A 2WZIA 5M5DA 4WLCA 2O9RA 3ARTA 1OIFA 4QLJA 2GK1B 4UFKA 4HOZA 3FHAA 4MB3A 1OWQA 1HL8A 1UWSA 4W87A 3AS3A 4AD1A 1XYZA 3MUZ1 1TE1A 3IAPA 1HJSA 5EFFA 3EDEA 3ZT6A 1QNQA 3WQ5A 1QVBA 4W7VA 1NP2A 4GO9A 1VFUA 2ZWYA 5HOSA 2FH6A 4ACZB 1UZ4A 3AIRA 3VGBA 3VIKA 3K46A 2VOTA 4OZOA 3WF4A 2J7DA 2PWEA 5LYRA 1GONA 1Q6FA 1Q6GA 5HPOA 3VX1A 4MAZA 1EDTA 4BA0A 4A3YA 4D1JA 2GDVA 1PZ3A 1EOMA 2DPEA 3WDJA 2ZUSA 1E6SM 3WF1A 4HU0A 2OWCA 3FAXA 3ZT5A 4D6IA 1TG7A 1GORA 4WKAA 5KEZA 2UWFA 2ZWZA 5FCZA 3GDBA 3RDKA 5GNZA 4H8VA 1M53A 2JEQA 1W3JA 1OINA 2OYLA 2CETA 4QFUA 3SCVA 3DYOA 1ISWA 4BQ4A 5D9MA 1A3HA 2J8GA 1GHRA 3II1A 3MV01 4MNLA 2VCCA 3PZOA 2VTFA 2VMFA 2D0HA 4Z2LA 3GBDA 1V0LA 1HX0A 4UZSA 3CPUA 2EPLX 4GZEA 1JYNA 2J4GA 1HN1A 1GPFA 3VIFA 1G94A 1Z32X 3WEMA 1Q6EA 3PZIA 1UD3A 2XG9A 4PMZA 2BY3A 1QI3A 1OB0A 1ZBCA 2VI0A 1AQ0A 3F5JA 2XHYA 1O7AA 3UETA 3RCNA 1UKSA 1FHDA 4LGXA 1OGBA 4DUVA 1C91A 1ZJBA 1E71M 2DH3A 3LMYA 4M81A 4B16A 5A2CA 1W3HA 1CTNA 2VL4A 3AS1A 3ZIZA 1UH3A 4UOQA 2E3ZA 5A6LA 3A47A 3IK2A 4AEFA 4TOQA 4ZE4A 2J77A 3BH4A 1WDSA 4LXFA 3WH8A 1PX8A 1CBGA 4P7NA 1M03A 3LPPA 4QLLA 1DWAM 1BVZA 4QAWA 3M07A 4D72A 3ZJ8A 5HNNA 1LL4A 2GK1A 3AFBA 3WBAA 3WQWA 2CBIA 4QLKA 1PPIA 2WK2A 1X6NA 1B3XA 4EANA 2V3EA 1H09A 3WF3A 3OZOA 5A2AA 4U31A 1KWKA 2JEPA 4CUCA 2BHUA 3SUWA 3VDAA 2VZVA 3WNOA 1B30A 3O9NA 3W0KA 5I79A 1XCXA 1M01A 3U5UA 3WN6A 1ZU8A 2WM0A 4FMVA 3ZM8A 3VD4A 1VIWA 2RGMA 2D20A 1M7XA 5BXSA 2O9PA 1JZ4A 4H2CA 1R7OA 2A3HA 3TTOA 3A3HA 3MUY1 3NYDA 1UKTA 4HZ8A 4D71A 4CD6A 3POHA 1JFHA 4MNKA 3RMEA 1EH9A 1E3XA 1HL9A 1UWTA 3AMCA 1BYBA 2WYSA 1CGWA 4PMOA 5KZ6A 1US2A 4GI8A 2E8YA 5A6MA 2ZXBA 5DT7A 3WUBA 4JFVA 3ZT7A 3SCTA 4F9JA 3CUFA 2W5FA 2VCAA 2VZSA 1KGWA 2VQTA 3VDHA 2WZEA 2PF0A 4TXEA 5D8WA 4W93A 2WVSA 4BS0A 5FKYA 4GI6A 4B9ZA 1NOUA 1QHZA 1H11A 1WNOA 5I2UA 3NDYA 1DWJM 4CD4A 3L2LA 3MANA 5E0CA 4MB5A 1NOFA 3VMOA 4PMVA 4HOXA 3L4TA 5JIPA 4BZYA 3WQ4A 1LG1A 2E40A 3GXIA 2O92A 4IISA 5I0DA 1JXKA 5EBAA 5ABFA 4AIEA 2G3MA 4LQ1A 4FF5A 2XIBA 1GZJA 2JIWA 2B31A 2QV4A 4UCFA 1EQPA 2XTKA 3WUFA 1H1NA 4PMRA 3WENA 1NOWA 3SUTA 1OT1A 2RGLA 3SCPA 3BLKA 3NSNA 1NWUA 2XVGA 5IHRA 2E8ZA 2BVYA 4E2OA 4UFLA 2E0PA 2DT2A 1UWUA 2J75A 1HKKA 4PRWA 1U2YA 1UR2A 1TA3B 2A3EA 2AAAA 6A3HA 4W84A 3OLIA 4KRUA 2VUYA 4MB1A 4PMQA 3GH7A 1ISYA 1JAEA 1XHGA 4U5KA 2ZUTA 4YN5A 2W63A 4TTUA 5D8ZA 4AZCA 5M03A 3F5KA 3GH5A 1TVPA 4P8VA 4WJXA 1VEPA 2JE8A 3EDKA 3PZQA 3ALFA 1N82A 1ZB5A 1QPKA 2GJRA 3W27A 3WNLA 4AD4A 4J3TA 2XVNA 1CXEA 2WHKA 4XV0A 1ODZA 1ZL1A 1CDGA 2E9LA 3SCRA 3BAJA 1PZ2A 3L4ZA 3TA9A 3SCQA 2CKRA 2MANA 2Y8KA 1CIUA 1R8LA 3GYCA 4LYRA 4AZIA 1J0IA 4CD8A 3WH6A 4FLSA 4V28A 5DT5A 1V3JA 3M46A 2XSAA 1F4AA 4UQEA 1B3YA 3THCA 4AZ6A 1CYGA 4AEEA 4OUEA 1CENA 3GNPA 3VPLA 4DWSB 4HPHA 3MV11 1AMYA 1QW9A 3AMGA 1UWRA 2AOSA 1IV8A 1WZKA 4D6CA 2D0FA 4RE4A 3CHDA 1EOKA 1XRVA 1HVXA 2PB1A 2DEPA 3IANA 3AJ7A 1U33A 3AIEA 1HVQA 2DSVA 4U2YA 1FH7A 3WDHA 4J3WA 1ZBKA 1NWSA 3WQVA 3PHAA 4C7GA 3AI0A 3U7BA 3ZMRA 4AD3A 4UQCA 3K8MA 4CCEA 1V3KA 2W66A 1YHTA 1V3LA 1WDQA 3AMDA 5EB8A 4M82A 5BXPA 2XVLA 5F7UA 4N42A 2FHBA 4GQRA 2WCGA 2OYMA 3CZKA 1ISXA 1GOKA 1UR4A 3VU2A 3O6AA 1W1VA 3WUGA 3L4UA 4AW7A 1KWGA 1LQ0A 2XFYA 2YIHA 4L4PA 4MDPA 2BY1A 4OOUA 3ECQA 1MQPA 2DQXA 4CN6A 1JF6A 1B90A 2BY2A 1I75A 5IHSA 4UFMA 1CWYA 1EQCA 1DWHM 3VD5A 3AXXA 4X0VA 5CSUA 2QPSA 2WWCA 4DM2A 1KCLA 2QF8A 1OCQA 1L8NA 1C8QA 3B9AA 4AZBA 3W81A 3F5LA 2EPMX 2BNJA 4NRRA 1H3GA 5BXTA 2DSZA 4WSJA 1Q6CA 1W9PA 3OGVA 4CGTA 3WDQA 1QNRA 4CU7A 5CJ5A 1PEZA 2NW0A 2VR4A 1R85A 1UR0A 1CGVA 3K4AA 4D6HA 1DTUA 3POCA 4JHOA 3NJ3A 4MPKA 3T09A 2VX6A 4J3UA 5A8OA 3OLDA 1GUVA 3ZJKA 3BLPX 4PTWA 3U57A 2W4XA 5A1AA 2VC9A 4U3AA 1V0KA 4X9YA 2J7HA 1V0MA 1XD0A 2BS9A 4JFSA 5A6AA 3SCNA 3B9EA 4D6DA 1AQHA 2EQDA 3A6OA 5ABEA 1E5NA 1GQJA 2CNCA 2OLHA 2WMHA 1LWHA 1WB0A 3PTKA 2XVPA 2WAGA 4GXPA 1UH2A 2YJQA 4PMYA 4W8BA 1KXHA 4J7RA 3QOKA 2D23A 2DT0A 2VRKA 3MUIA 3RM4A 3GH4A 5I77A 5CQ1A 4AZ5A 4AWEA 3W6MA 2EEXA 4JCMA 4PN2A 4YPJA 3L4XA 4MNMA 1J10A 2GJXB 2WLZA 5D9PA 1W3KA 2PWFA 3W25A 4XZBA 4MTVA 1W1TA 1O6IA 5FIPA 3PZVA 1FH8A 3UR8A 5AC5A 3ARQA 3ZO9A 3N12A 4AD2A 2PBOA 1MQQA 1E0VA 1HKIA 5LA1A 3CZ8A 5HXMA 2HVMA 4FLOA 1JYXA 1QNPA 2XM2A 4RE2A 2D24A 2VRQA 2J79A 4U2ZA 1VFMA 4P7QA 4A3HA 5LA2A 3W53A 2D22A 3KE0A 1GNXA 5E09A 4F66A 2ZXQA 5ECUA 3VIHA 1VFFA 3MMUA 3VIOA 1JFXA 3WBEA 2BXYA 2Q8XA 2QLYA 5I24A 4X0NA 4PBGA 3AYSA 3WH5A 4WKHA 1WDRA 2XSBA 1AQMA 4YHGA 5ABGA 4GPNA 2Y5EA 4E8CA 1JXJA 4TVCA 1LL7A 3WY1A 1WPCA 1GJWA 1BG9A 3PZNA 3OLEA 5D9OA 5I23A 1E4NA 1V02A 4URIA 3L4WA 1L0PA 5JIWA 3VIMA 1WAWA 1QI4A 2PI6A 4JFTA 5CGMA 2PWGA 3AZTA 2YL8A 3BAIA 4Z2GA 1UHVA 1BYDA 1DWGM 3WD4A 5E70A 1JD9A 5BROA 1OIMA 3SIMA 5A6BA 1SFSA 4FLQA 4GI9A 5E6ZA 3APGA 1V03A 1UG6A 1X1NA 1CXFA 4HZ7A 3QOMA 1GQLA 1KQYA 3KL3A 4IM4A 4U33A 1C8XA 1ZS2A 3QHMA 3W82A 1QI0A 4AY1A 1FHLA 3CH9A 3ZR5A 4WSKA 2GFTA 2VNCA 1MYRA 4P8UA 3ARXA 2DDXA 3CMGA 3WQ8A 1UD4A 1ITXA 2PC8A 3TTSA 2YA0A 1ODUA 1RPKA 2YA2A 3GTNA 5DEZA 3ZSSA 1PBGA 4DUWA 4KWUA 4AYSA 4WF7A 3AIQA 4P8WA 1J01A 5ABFB 1CLVA 3W29A 2WKGA 3I3BA 1EIBA 4BQ2A 1XSKA 1KXTA 4WKFA 2GJXA 2ZX7A 1E70M 4ZEPA 4B9YA 3AIWA 3FN9A 4HA3A 2YLLA 2UY2A 5A8PA 1QHOA 1J0HA 3SUUA 1H41A 4TUFA 1C3FA 4F8XA 2V5CA 2BXZA 2F8QA 1E5JA 1W91A 1ITCA 2GJPA 1GCYA 3L4VA 2VR5A 3OBAA 1CEOA 8CGTA 5DMYA 1JZ5A 5IFTA 4OIFA 3TTYA 2Y4SA 4HZ6A 4U5IA 1XSIA 1WDPA 4AZGA 1W2VA 1TMQA 3AHXA 2V5DA 1GOQA 3CUGA 2VZUA 1FFRA 5HBFA 4MADA 2HISA 4CU6A 1E1FA 4AZCB 5DO8A 4KGLA 1UUQA 1JZ8A 1PX4A 1HJQA 3VGHA 3PZTA 5BRQA 3WSUA 4KMQA 3TP4A 4HPGA 6TAAA 1JZ3A 4HMCA 5BRPA 5FD0A 4ATLA 2WNWA 1D2KA 1C90A 3B9DA 1WE5A 1US3A 1XV8A 1R86A 1MW0A 4HMDA 4Z2KA 3SCWA 3CMJA 1WZLA 1XH1A 2WMFA 3DHPA 2BY0A 3KL0A 3FXYA 3PZUA 4OBSA 1EA9C 1W9UA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2V38 A;  2J78 A;  2DH2 A;  2G4F A;  3W28 A;  4ACY A;  1CXL A;  2UY4 A;  1BPL B;  2E9B A;  4W5U A;  3MMD A;  4YHE A;  4AIO A;  2W62 A;  4P7L A;  4D6G A;  2CES A;  1J0J A;  1SMD A;  4W85 A;  2DSK A;  4ZEN A;  3L2M A;  3DC0 A;  1CGU A;  1V6V A;  1KFW A;  1HIZ A;  2QMK A;  4H04 A;  1DHK A;  3LPF A;  1TCM A;  4LYQ A;  4S3J A;  1GOO A;  3VGF A;  4AZH A;  2EBN A;  2A3C A;  2IXU A;  1V02 E;  2XGI A;  1E1E A;  2YOC A;  2FHF A;  2Z1S A;  1WCG A;  2ZID A;  2FDM A;  2PBG A;  3VIN A;  1KGU A;  5C8B B;  2JAL A;  2CBU A;  2YBU A;  4F79 A;  3ARR A;  1XC6 A;  3UES A;  4NRS A;  2WVT A;  4LX4 A;  1BVN P;  3CTT A;  5E6Y A;  4RL3 A;  2EPO A;  4V27 A;  4PCS A;  5CZK A;  1BYA A;  3W4R A;  2NT1 A;  1UD2 A;  3W6L A;  1UKQ A;  2WMI B;  1S46 A;  4Q7N A;  1DWF M;  3K1D A;  4CVU A;  1GJU A;  3VD7 A;  3WKZ A;  3CUI A;  2WHM A;  5AYI A;  1TUX A;  1NQ6 A;  4RE3 A;  4MNJ A;  3G6M A;  3SUR A;  1GQK A;  3VX0 A;  4N0R A;  1MQR A;  2OWW A;  3UEQ A;  3CZL A;  1AVA A;  3UER A;  1J0Y A;  3WL1 A;  2XFF A;  3W24 A;  5CG0 A;  2X1I A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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