The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFKKFKHLKTEAEMKASEKLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAKLKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Crystal structure of Horse heart ferric myoglobin; D44K/D60K/E85K mutant
rcsb |
| source organism |
Equus caballus
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| total genus |
62
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-11-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2OH9 A; 1IDR A; 5HLQ A; 1LFV B; 4MQH B; 1WLA A; 1LFL B; 1CH7 A; 2W72 C; 2VYY A; 1S5X A; 101M A; 1J3Z B; 3GDJ A; 3WHM A; 3ZJM A; 3UHI A; 4G1V A; 1A4F A; 3WCT D; 2M6Z B; 2MBW A; 1YHU A; 3UHZ A; 1NWI A; 1MWD A; 1MNI A; 1GBV A; 2MGL A; 3WCP A; 2W6V B; 5KER A; 2DN1 B; 4XS0 A; 1S5X B; 2ZST A; 3GDJ B; 1O1K B; 3WCU D; 1A4F B; 3OO4 B; 1M9P A; 4ZVA A; 4IT8 A; 3GQR B; 1AZI A; 1SPE A; 1GBV B; 1LTW A; 3WCP B; 2O5B X; 5KER B; 1MDN A; 3FH9 B; 2AA1 B; 4QAU A; 1XZ2 A; 1XZ4 A; 1Y4R B; 3ZJL A; 1SPG A; 1M9P B; 2FAL A; 3WR1 A; 1N9H A; 3E4N A; 4FWY A; 3E55 A; 1XZ2 B; 1XZ4 B; 1BZZ B; 3NG6 A; 1DXC A; 2QSP B; 3G52 A; 4VHB A; 103M A; 3ZJR A; 2R50 A; 1NZ3 A; 1A3N A; 2PGH A; 1LFY B; 3OO5 A; 1MOB A; 5CMV A; 2D5Z A; 3NG6 B; 2VHB A; 2KSC A; 2R80 A; 3A5A A; 1NZ4 A; 3KUO A; 1O1L A; 1Y4Q B; 1C7C A; 1A3N B; 1O1O A; 4AVD A; 108M A; 7HBI A; 2Z6N A; 2D5Z B; 2OIF A; 1CO8 A; 3ONZ A; 3KMF C; 5CN6 A; 1HJT A; 2HBC A; 3GQP B; 2BWH A; 2HHD A; 4HRR A; 4WCH D; 2RAO A; 1ABY A; 1X9F C; 3UHW A; 2BKM A; 1Y4P A; 3VRG A; 2W6Y A; 1MNJ A; 1MLS A; 2HBC B; 1SDK A; 1XZV A; 1BZ1 A; 1EW6 A; 1KFR A; 1NQP A; 1GCV A; 4HRR B; 4C44 A; 1ABY B; 1Y7Z A; 4HSW A; 3A5G A; 1LA6 B; 2ZS1 D; 3MJP A; 4L7Y B; 4PQB A; 3MKB B; 1SDK B; 1MLJ A; 4PQ6 A; 1BZ1 B; 3WCT C; 1NQP B; 1NGK A; 1GCV B; 4MQK B; 1LFT A; 3LR7 A; 1LH7 A; 1Y22 B; 3MJP B; 1BIJ A; 3PEL A; 4HRT A; 5CNE A; 2MGC A; 2D2M B; 3UHY A; 1S69 A; 5JDO F; 1LFT B; 2MGM A; 3QM7 A; 4DC8 A; 1YEU B; 1BZ0 A; 2MGB A; 4G1B A; 5IKS A; 5M3S A; 3PEL B; 4HRT B; 3LB4 A; 1YEQ A; 4PQC A; 2QFK A; 2EB9 A; 3D1A B; 4FH6 A; 2GTL A; 1M6C A; 3UHR A; 1J7Y A; 1MBS A; 2O5M X; 4KMW A; 1DXV B; 1HBG A; 1I3D A; 1JP6 A; 1Y5K B; 2SPN A; 2GTL B; 1K0Y A; 1MLL A; 1CG5 B; 1QSH A; 3IC2 A; 4UUR A; 2MGG A; 1K0Y B; 1OR4 A; 1A9W A; 1VWT A; 4NZI A; 1Y7C A; 4MQC A; 1DTI A; 4NK2 A; 1NWN A; 2IN4 A; 1Y5F A; 3S1J A; 4ESA B; 1YEN B; 3GQG A; 1Y0C A; 1MBO A; 3UHC A; 3EU1 A; 1NEJ A; 3EDB A; 4FC3 B; 1AJ9 B; 3QJD A; 1CP0 A; 3E5O A; 3ORD A; 1T1N A; 3HC9 A; 3GQG B; 2MGA A; 2MYA A; 2ZS1 C; 3G46 A; 3EU1 B; 1A0U A; 5HY8 B; 1K1K B; 1KD2 A; 3IXF A; 4MQI A; 3ZJI A; 2XKH A; 1Y09 A; 1RQ3 A; 1UFJ A; 1A6K A; 1T1N B; 3QZZ A; 1CQ2 A; 2R4Z A; 1A0U B; 2AUP A; 3UHB A; 1Y01 B; 2GL3 A; 2H35 A; 1Y09 B; 1YMA A; 1MNH A; 3SZK B; 4NI0 A; 1OUU B; 2G11 A; 102M A; 3HRW B; 1OJ6 A; 5EOH A; 1Y8I B; 3H57 A; 4MBN A; 1XXT A; 3G4W A; 1FCS A; 1HBH B; 2LHB A; 1YHU D; 4O4T A; 2B7H B; 3MYM A; 1XXT B; 5EYS A; 3DHT A; 1C7D A; 1TES A; 2OLP A; 3O89 A; 5E29 B; 1GDJ A; 1HGC A; 2V1F A; 1LJW B; 1M6M A; 2EVK A; 1UC3 A; 3DHT B; 1GBU A; 1C7D B; 1Y0A B; 1EWA A; 4F6I A; 1O1M B; 1JZK A; 5CHQ A; 1A6N A; 1CH4 A; 4TWU A; 2GNV A; 3ECZ A; 2V1E A; 3GOU A; 5E83 A; 3QQQ A; 1JEB A; 1GBU B; 5AZR A; 2ZLV B; 2QSS A; 5HLU A; 2E2Y A; 3VRF A; 3GOU B; 3D1K A; 1Y85 A; 3WI8 A; 3MOU A; 1WVP A; 4HSX A; 1V75 A; 1MWB A; 2QSS B; 4C0N A; 5ILP A; 1NZ5 A; 1NS9 A; 1Y8H A; 1V75 B; 1Y83 B; 1MLU A; 3PI9 A; 2HCO A; 1NS9 B; 3AG0 A; 3NFE B; 4XDI A; 2VYZ A; 1A9W E; 3OJ1 A; 2HCO B; 2MGF A; 3RJN B; 1UMO A; 2BLI A; 4NXA A; 5EU2 A; 3GKV A; 2G12 A; 2C0K A; 2ZSR A; 2DN3 A; 1OBM A; 3B75 B; 3AQ8 A; 1ECO A; 1SI4 B; 1YE2 A; 1A3O B; 3QQR A; 1MYJ A; 1JWN A; 2SPM A; 2H8D A; 3ARK A; 5CND A; 1OR6 A; 3D17 B; 2HBF A; 3DUT B; 1MCY A; 4N7P B; 4H0B A; 1HV4 A; 1Y4B A; 1YE0 A; 1YCB A; 3UHD A; 1Y8K A; 5ILM A; 2O5O X; 2ZLT A; 1Y4V A; 1HAC A; 2AV3 A; 1A01 B; 2HBF B; 5HAV A; 3R0G A; 1HV4 B; 3MBA A; 2D6C A; 1Y4B B; 2LH3 A; 3UHT A; 1BAB A; 1Y8W B; 3P5Q A; 2D2N A; 3MJU A; 2PEG B; 1OFK A; 2V1K A; 3ED9 A; 3KUN A; 2GTL D; 4YU4 B; 4U8U A; 2XKI A; 5CNB A; 1G0A A; 3WCV A; 3WCW A; 1HBR B; 5D5R A; 3P5Q B; 1X46 A; 1J40 A; 1UIW A; 4MQJ A; 2GRZ A; 1O1P A; 2AV0 A; 4U8U B; 2NRM A; 1G0A B; 3WCW B; 1HRM A; 1BVC A; 1YOG A; 1FDH G; 1ABW B; 1B86 B; 5EUI B; 1J40 B; 1UIW B; 1Q1F A; 2VLY A; 3QM8 A; 1MNO A; 2HBD A; 3PI4 A; 3LB2 A; 3U3E A; 2V1G A; 1XZU A; 1SWM A; 3HYU A; 1MLG A; 1IRC A; 1XZ5 A; 1CBL A; 1YCA A; 1YVT A; 4F6F A; 3UHN A; 2VLZ A; 2HBD B; 1C7B A; 3WHM B; 3G4Y A; 4F6J A; 1MWC A; 3HYU B; 4M4B A; 1XZ5 B; 1YHU B; 1NPF A; 5EE4 C; 1MKO A; 3D7O A; 1Y2Z A; 3HEN A; 2O5S X; 1MTK A; 3H58 A; 3PT8 A; 1MYG A; 4XS0 B; 1GZX A; 3BJ2 A; 1R1X A; 1QXE A; 6HBI A; 1ECA A; 4M4B B; 3PI1 A; 3AQ7 A; 3D7O B; 1Y2Z B; 4IRO A; 1VXB A; 1GZX B; 1Y45 A; 2HHE A; 1SPG B; 2D2M C; 3HXN A; 1C40 A; 3OVU C; 4IRO B; 3WR1 B; 2ZS0 A; 109M A; 4OOD A; 5HBI A; 1Y31 A; 3ZJP A; 1A6G A; 1I3E A; 1VXE A; 1YHE A; 2ZT1 A; 1DTM A; 1C40 B; 2FRJ X; 6HBW A; 2VM0 A; 2AUO A; 5CNG A; 2FRF A; 2G0X A; 1V4X A; 2BK9 A; 1R1Y A; 2GKM A; 3UHK A; 3BOM A; 2PGH B; 3QJE A; 1YHE B; 1HBI A; 3UH6 A; 1V4U A; 3OO5 B; 5SW7 A; 4H07 A; 2R80 B; 2O5T X; 4G51 A; 1V4X B; 1IWH A; 3S66 A; 1O1L B; 1C7C B; 2LH5 A; 1VXC A; 1O1O B; 1SHR A; 4ILZ A; 3ZOL A; 2W72 A; 5SW7 B; 2Z6N B; 1IRD A; 3ONZ B; 1DO4 A; 2MGK A; 4NS2 A; 1YMB A; 1SDL A; 1S6A A; 3G4V A; 4G51 B; 3S66 B; 4H2L A; 3NML A; 2W31 A; 1SHR B; 1NIH A; 2W72 B; 2HHD B; 1MTJ A; 4L2M A; 2DHB A; 1IRD B; 2RAO B; 1YGF A; 1JL7 A; 1Y4P B; 3IA3 B; 3VRG B; 1MBA A; 1XQ5 A; 2V1H A; 1XZV B; 2HHB A; 1YMC A; 2DHB B; 1FDH A; 3A9M A; 1Y4F A; 1Y7Z B; 3OZU A; 1PBX A; 3PI8 A; 1JP8 A; 4MXL A; 1JP9 A; 3WCU C; 2HHB B; 1NZ2 A; 1J7S A; 1Y4F B; 1MBC A; 2ZSN A; 1PBX B; 3OK5 A; 1CH1 A; 4ROM A; 1BIJ B; 3PI8 B; 3K8B A; 1CH2 A; 3UHG A; 2BLJ M; 1O16 A; 4F6D A; 1V07 A; 2QMB A; 1O1I A; 5JDO D; 3A0G A; 1CIK A; 1LH5 A; 1DXU A; 1BZ0 B; 1S0H A; 4O2G A; 1LFZ A; 4ROM B; 3EOK A; 1YEQ B; 1MLQ A; 3ZJH A; 2EKU A; 5D1V A; 2HBG A; 2ZWJ A; 5JGG A; 1XYE A; 1LFZ B; 1DKE A; 1N9F A; 3QJB A; 3EOK B; 3KMF A; 1J7Y B; 1YZI A; 3UHX A; 1UVX A; 1VXF A; 3R5I A; 2VYW A; 2HZ3 A; 5JGG B; 1XYE B; 110M A; 2LH1 A; 1Y0T A; 1HSY A; 1X9F A; 3OZW A; 1QSH B; 1YZI B; 3IC2 B; 5CN8 A; 1FSL A; 3R5I B; 3WFU A; 2G14 A; 1VRE A; 3UHH A; 1RPS A; 3IC0 A; 3ARJ A; 4B4Y A; 1VWT B; 5C6E A; 1BJE A; 1HGA A; 3M3B A; 4N8T A; 2V1I A; 1J3F A; 1Y7C B; 4HHB A; 1YEO A; 3BJ3 A; 1CLS A; 4UIQ A; 3IC0 B; 4MQC B; 1HDS A; 1MNK A; 2HZ1 A; 5F2A A; 5MBN A; 1RVW A; 1HLB A; 2D2N D; 3LR9 A; 1J41 A; 1Y5F B; 1MYI A; 3M38 A; 3LHB A; 1J52 A; 4F6G A; 3WFT A; 1Y0C B; 1MLM A; 4HHB B; 1YEO B; 3BJ3 B; 1CLS B; 4U8U D; 1NEJ B; 2VRY A; 1HDS B; 1YVQ A; 3AT6 A; 3WCV D; 2R4W A; 3WCW D; 1LH2 A; 3MVC A; 1X3K A; 1BBB A; 3QJD B; 1J41 B; 3BCQ A; 3UBC A; 5CNC A; 1URV A; 3UHQ A; 1CH9 A; 1YVQ B; 1CH3 A; 1KD2 B; 4MQI B; 1CO9 A; 1RQ3 B; 106M A; 1BBB B; 2R4X A; 3PIA A; 1YDZ A; 3VAU A; 1BUW A; 2HZ2 A; 2QLS A; 2NX0 A; 2ZSO A; 1MTI A; 1V5H A; 2H35 B; 2MYC A; 1LH3 A; 4M4A A; 1QI8 A; 3A59 A; 1S61 A; 3PIA B; 4NI0 B; 1YDZ B; 1G09 A; 1FN3 A; 5CNF A; 1QI8 B; 1O1J A; 4KMV A; 1V4W A; 2G0R A; 112M A; 1GLI A; 1O1N A; 2GKN A; 5HU6 A; 2AUQ A; 1MYH A; 4MQG A; 4DC7 A; 1AJG A; 1HGC B; 2ZFB A; 1FLP A; 1IBE A; 1XCH A; 1UFP A; 4O1T A; 1GLI B; 4JYQ A; 2QU0 A; 2DN2 A; 4MQG B; 1RTE A; 1CG8 A; 5KKK A; 1MGN A; 4FWX A; 5F0B A; 2ZFB B; 1MBI A; 1IBE B; 1LFQ A; 3LB3 A; 1G08 A; 5E83 B; 2LH2 A; 2ZS0 D; 3AT5 A; 3VHB A; 4ODC A; 2QU0 B; 2DN2 B; 1JEB B; 1D8U A; 4DWU A; 1B0B A; 3BJ1 A; 3GYS A; 1RQ4 A; 2ZSX A; 1YG5 A; 2MGJ A; 1CG8 B; 3M3A A; 1LH1 A; 1NXF A; 3VRF B; 2D5X A; 1G08 B; 1TU9 A; 2GRF A; 3D1K B; 3AT5 B; 1Y85 B; 2QFN A; 3WFW A; 1MLH A; 1DXT A; 3O7N A; 3BJ1 B; 3ZHW A; 3ZJJ A; 1YG5 B; 2R1H A; 1Y4G A; 5CN4 A; 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3UHV A; 1MYZ A; 1ECD A; 2FRI X; 2W6V A; 2DN1 A; 1YHR A; 3UI0 A; 1XZU B; 1O1K A; 1DUK A; 1JDO A; 3MN0 A; 3AQ5 A; 3OO4 A; 1Y35 A; 3OZV A; 1YVT B; 1CPW A; 2CMM A; 3GQR A; 1NPG A; 1C7B B; 1MOH A; 1YHR B; 3TLD A; 1IT3 A; 3FH9 A; 2BW9 M; 2AA1 A; 4BJA A; 1HHO A; 3UGZ A; 1Y4R A; 2MB5 A; 2NSS A; 2MYD A; 1MKO B; 1Y35 B; 1OFJ A; 2HBS A; 1YGD A; 2MGI A; 3PT8 B; 1HLM A; 3BJ2 B; 1A0Z A; 4ROL A; 5CN9 A; 1R1X B; 1QXE B; 2Z6S A; 1GVH A; 2VEB A; 1HHO B; 4TWV A; 2ZFO A; 1BZZ A; 5JDO E; 4HBI A; 1LUE A; 2HBS B; 2QSP A; 1YGD B; 2MGE A; 1RSE A; 5AB8 A; 3LB1 A; 1A0Z B; 4ROL B; 1Y45 B; 2Z6T A; 2FAM A; 2HHE B; 1DO7 A; 1PMB A; 1DWS A; 3HXN B; 2ZFO B; 1LFY A; 1JY7 A; 2Z8A A; 3K9Z A; 2XYK A; 1MOA A; 2G0S A; 1YIE A; 2ZS0 B; 3WTG A; 1Y31 B; 105M A; 1Y4Q A; 3ZH0 A; 1MOC A; 4NI1 A; 6HBW B; 1JY7 B; 1MBN A; 2W6X A; 1YIE B; 2GTL C; 3WTG B; 1R1Y B; 2ZSQ A; 3HHB A; 3BOM B; 1Y5J A; 4JAC A; 1LHS A; 1MLR A; 3QJE B; 3W4U A; 3QM6 A; 1V4U B; 3GQP A; 4NI1 B; 1EMY A; 3UGY A; 1HBB A; 2NSR A; 1AJH A; 1IWH B; 3HHB B; 3AQ9 A; 1JZM A; 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