4NSBA

Crystal structure of the complex of signaling glycoprotein, spb-40 and n-acetyl salicylic acid at 3.05 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNYGSQRFSKIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLWPGWRDKRHLTTLVKEMKAEFVREAQAGTEQLLLSAAVTAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFRGNEDASSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSYTLASSKTDVGAPISGPGIPGRFTKWKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAIKDVLARV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Chitinase-3-like protein 1
publication title Crystal structure of the complex of signaling glycoprotein, SPB-40 and N-acetyl salicylic acid at 3.05 A resolution
rcsb
total genus 120
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4nsbA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4nsbA01
1B0IA 3WF2A 1EQCA 5BWFA 5E6YA 1ITCA 1JFXA 1H0GA 3AXHA 3PZVA 2WHKA 3FXYA 3WBAA 5D8ZA 2W4XA 3S6TA 4Z2GA 4U2YA 1WDPA 1UR0A 2C8NA 1JDDA 5HNNA 1HNYA 2JALA 1MXGA 5EB8A 2VOTA 3GTNA 3VVGA 3FW6A 2YDSA 4D6DA 3AHVA 4UOQA 4H8HA 4CD4A 1DHKA 3ARYA 2GK1B 2EPKX 2QHAA 3AYSA 3CZJA 3THCA 4W85A 3J7HA 3OB8A 2ZOXA 5EMYA 2GJXB 1YQ2A 1RD6A 2EEXA 1CZ1A 3II1A 4LYPA 5DT7A 1ZJBA 2G4FA 1W3JA 3CGTA 5C70A 4R5EA 3WQ4A 3WSUA 4IUGA 1OSEA 5BXPA 1CXEA 2XYLA 2VZOA 4CU6A 5I23A 2XFFA 4DWSA 5A2AA 1J11A 2E8YA 3OG2A 5HPCA 3WNKA 1XSIA 4PMUA 5A8MA 3WY1A 4BZYA 3BMVA 1E4LA 3VILA 1G0CA 3PZNA 2XG9A 2ZX6A 2YA1A 1UQYA 2CHNA 4HOWA 2OSWA 2RGMA 2OYMA 2AAAA 1KWKA 3CH9A 4EAMA 3OLEA 1BVNP 4UZUA 1E71M 1HF6A 1SR0A 3ZT7A 1TA3A 3PN8A 2BXZA 4CN4A 2ZXAA 1QHPA 7CGTA 1VEPA 1FHDA 2DQXA 1JZ5A 3W37A 4HPGA 4PTXA 2D24A 1UWRA 4GPNA 4KGJA 1MW0A 1ZBCA 2ZWYA 1HN1A 5M03A 1J18A 3BLPX 2WC7A 1B1YA 2G3JA 3ARWA 3WQ6A 3SUSA 1JDAA 2J75A 4MJ4A 1JZ6A 3AIQA 3T2PA 1JZ2A 2W67A 2PWDA 5A6KA 2J7FA 3CZ8A 1PX4A 4MADA 1ZU8A 3TA9A 1CENA 4AD4A 1B2YA 4UZSA 1R7AA 1JNEA 2DH3A 1HL9A 3VGFA 3GNRA 2VVNA 1UOKA 3WMCA 3ZM8A 2D0FA 2CCRA 2VZTA 5FIPA 1JNDA 5DF0A 4ZENA 1R87A 1R8LA 2VC9A 2XGBA 4LX4A 1QNRA 2PF0A 3N04A 1GOQA 1HKJA 1W9PA 1W2PA 4RL3A 1CNVA 1FFQA 4NZCA 1ZL1A 4NI3A 3MMWA 4M24A 2V3FA 2XVPA 1V02A 3WMSA 1UH3A 2VCCA 1J12A 1J0JA 2X05A 1U30A 2DIJA 3L4XA 4HA4A 2D23A 4UQDA 1WCGA 2VRKA 2WVVB 2FGZA 2FHCA 2X2YA 1PJ9A 2ZXBA 3VIOA 4OJYA 1HVQA 1KQZA 3MU7A 3AMLA 2VZSA 5LYRA 3WELA 2GJRA 1X6NA 1BVZA 3WBEA 1XH0A 5I24A 1WB0A 3L4ZA 1BQCA 5CPQA 1J01A 3BCDA 2UY5A 1QBAA 2QMKA 3QR3A 2VX4A 5C71A 2WC4A 2G8ZA 3KE0A 1JZ8A 3NUKA 1PX3A 1ESWA 3BXWA 1CLXA 2XM1A 4CD5A 3EYPA 1H0IA 1W1PA 3NDZA 4W87A 2OYLA 3CUHA 7TAAA 2VQUA 3PZIA 1ZJAA 3UG4A 4YHGA 1JZ4A 3SCVA 4MAZA 1TG7A 1UYQA 4CUCA 2VJXA 3AXXA 3AS3A 4NF7A 1HKMA 3VOCA 2GDUA 1E6QM 2AMGA 3KWXA 3WIJA 2WWCA 1SMAA 4OOZA 4UQEA 2BY1A 3AIEA 4R27A 1I1XA 4JFSA 4M82A 1UKOA 3BAIA 1V02E 4AEFA 1UH2A 3PHAA 1KBKA 3MKKA 3WNOA 2PB1A 1DTUA 3AOFA 3CUGA 4OZOA 5AYIA 5ECUA 5CLWA 1DWIM 3K8LA 1EOMA 4E8CA 3W38A 1XD0A 1OIMA 1RP8A 1UZ1A 1GVIA 4JL1A 4ACZA 3AIVA 4Z2KA 4W7VA 4UCFA 4CU8A 1JYNA 1NH6A 2QLYA 1N82A 2YA2A 4X9YA 1DWAM 3AISA 1UKSA 2PWHA 5CGTA 3ZR6A 4D72A 1KCKA 1HJSA 1E6ZA 4HTYA 2E8ZA 1UA7A 3AXIA 1W1YA 1ISZA 5D9NA 2CXGA 1NP0A 1MXDA 1CXFA 1VBRA 1HP5A 4UQAA 4AIEA 3KL0A 2J7EA 1OD0A 4AZCB 1L0PA 1V3IA 4JKLA 5BXSA 4JFWA 1CGVA 2TAAA 2VUYA 3HJEA 3GH7A 4AWEA 1KXQA 3WNNA 3TTSA 1MWOA 1CLVA 5I5RA 4JFTA 1E4IA 1TUXA 2YL9A 1FH9A 4BQ4A 2BVTA 1C3FA 1MFUA 4RE3A 3VD5A 5DT5A 1V6UA 4OBSA 3LPGA 1B3ZA 2PC8A 2VX5A 1EDGA 1BGAA 2EJ1A 3VNZA 1EOKA 4LYQA 3POHA 1B90A 1B9ZA 1VFFA 1ISVA 2WMFA 4PMQA 4Q7NA 2JEPA 1JGIA 2E9LA 2YDQA 2OSYA 4WLCA 4Z2JA 1GQLA 3RPMA 1GUVA 3AIRA 1MYRA 2ZE0A 3RM8A 1UA3A 3QOKA 2J25A 2CEQA 3WF0A 4ATLA 4A3HA 1OGBA 1KGXA 1KGUA 3PZOA 2YL6A 4U31A 2VZVA 4ZXOA 1FHLA 1XV8A 3RM9A 4UFHA 3ZJ8A 1OGSA 4CD8A 4M1RA 1OGGA 1PZ2A 4JCMA 1E0VA 3OLIA 2GJPA 1CTNA 3N12A 2WHJA 2J78A 2VNCA 1KBBA 2WZIA 2XFYA 3AMGA 3SCSA 3QHOA 4K68A 2W66A 3WEMA 4D6JA 3E1F1 5CXPA 3NCOA 5ABFA 2UWFA 4NRRA 2EO7A 4RE4A 3AMCA 2V3DA 1GOOA 2D3LA 2VZUA 1MFVA 2EBNA 1NQ6A 1Q6EA 1NM9A 2WLYA 1GVYA 2FGLA 2V3EA 1EHAA 2GDVA 2DSWA 4V28A 3ZOAA 2BXYA 1WO2A 5CPTA 3TP4A 4L4PA 1GJWA 4DWSC 1JF5A 4KRTA 1UD2A 2X0YA 2V38A 3RO8A 2WCSA 3K8KA 3DC0A 3MSDA 3U5YA 4GO8A 3VD9A 4E2OA 5A2CA 5ABHA 4CD6A 5A6JA 2GK1A 1CXKA 4JKMA 1Q6CA 1UD5A 3UR7A 4QLKA 3PTQA 2J7HA 2GJXA 3VD7A 4UQCA 5JIWA 5IHRA 3GM8A 5CSYA 4P8VA 3VM7A 2WMGA 1GQIA 2CBUA 2WAGA 1C8XA 1CPUA 1E1EA 1JZ7A 3CZEA 3KZSA 3L4UA 2CBVA 2D3NA 4GIAA 4D6EA 1J0IA 1X1NA 4UQ9A 2YOCA 3CPUA 3GH4A 1LJYA 2DT1A 5EFFA 4DUXA 4CKQA 1BYDA 4MB5A 4WKHA 4AEEA 3O9NA 4BQ2A 4URIA 4AXNA 4P8UA 1UWQA 3GNOA 2CHOA 3WUFA 4D6HA 4CU7A 2VTFA 1XH1A 3G6MA 4W86A 4ZE5A 1LL7A 4UFJA 3UG5A 2DSUA 4D6GA 1W32A 4IISA 4UNIA 5HDRA 4TVDA 4PBGA 1E70M 1JXKA 1LG2A 1CXLA 2WBKA 1WPCA 2J79A 3W26A 2ZICA 4HMEA 4HMCA 1TCMA 2UY3A 1EA9C 5CJ5A 4WKAA 3NSXA 3MO4A 3I3EA 3PZTA 4D6CA 3BH4A 4HPHA 2DSVA 1H2JA 1EH9A 3A4XA 2W62A 3OA5A 5BROA 1NARA 4F9DA 3HMCA 1Q6DA 3AHXA 1WNOA 4FLRA 4GI9A 2WVUA 1LWJA 5BRQA 3EMCA 3EDEA 2GVYA 3SIMA 2V3GA 3LPOA 2WVSA 4H2CA 3K46A 1UR4A 4GZJA 2WM0A 1B3VA 3OGSA 5LA1A 5M5DA 2XFRA 2JFEX 3O6AA 1QW9A 5D8WA 3VUPA 1XSJA 4AD1A 2BY3A 3FY1A 3QHNA 5CSUA 1QNQA 5LA2A 1A47A 1CBGA 1CYGA 1E6SM 1UQZA 3U7BA 1WP6A 1K9EA 3CUIA 4JIEA 1UZ4A 4AZBA 4CCCA 1ZBVA 1W1VA 5GNXA 1E6PA 3WH9A 1VJSA 4DUWA 1UR8A 3AROA 3N1AA 4B9ZA 2WVVA 2VI0A 3VINA 3SCWA 2VX6A 4CD7A 1Q6FA 1CGXA 3DYOA 1BTCA 2XWEA 4MAVA 1AVAA 4H41A 5A6MA 1WDQA 3ZSTA 2OWXA 3GXIA 5AYBA 3BAYA 1HT6A 1AQMA 5E0FA 2V5CA 2WZHA 2F61A 4CVWA 1UG6A 2ZWZA 1C93A 1ZBKA 2CBIA 2YL5A 3ZT5A 2J8GA 3ZSSA 4PUEA 3ZO9A 5I0DA 4M56A 2CESA 2ZUNA 2VR4A 4XX6A 1W9UA 4TX6A 1KXHA 2CKSA 1UD3A 1W1TA 1QOXA 1V03A 1HKIA 2XPKA 1RP9A 3BAJA 5DFAA 1VEMA 2A3HA 3EMZA 1Q4NX 4DM1A 2Y2WA 1KQYA 4FLQA 4AISA 5LA0A 3CLWA 1GHRA 4MDOA 3L4WA 3ZMRA 4F79A 1UR9A 1PIGA 2XVKA 1V0KA 3UEQA 1GOIA 4PMDA 2O9TA 3OLDA 3VX0A 1B31A 2WMIB 4GINA 4UFIA 4PCTA 2HISA 2Y8KA 3WENA 3CHCA 1G1YA 1E9LA 4P8WA 1BF2A 3CHEA 2OLHA 2J47A 4PYSA 3VIGA 4TTUA 3F5JA 4XV0A 3AS1A 3JUGA 4MDPA 1NWUA 3SCQA 1CWYA 1UKQA 4EE9A 4J3SA 4PMYA 1JDCA 1X6LA 1O6IA 3AMDA 2G3MA 3VGEA 1H4PA 2CIPA 3APGA 3WDQA 1LQ0A 1NOUA 5A6SA 5ABEA 1S46A 2FHFA 3U57A 3FAWA 2IXVA 4W7UA 4QLLA 3LPPA 1CGUA 3FAXA 1E55A 1UD6A 4KWUA 2WMJA 5FCZA 3B8SA 2XSAA 3CZGA 3T0DA 4W93A 2CNCA 2CYGA 4AZHA 1UKTA 5E70A 3VMNA 5HXMA 5FOOA 2FDMA 1J0ZA 4AZCA 4FK9A 4N0RA 4PMZA 1CXHA 3TTQA 3WF3A 3K1DA 1JXJA 5CGMA 2BHYA 3PZGA 4LYRA 2A3CA 5JH8A 2Z1KA 3BAWA 3N18A 2WHMA 1UD4A 1ISYA 3W4RA 1E4NA 1E72M 4IPNB 3RJXA 2BS9A 1CGWA 1JF6A 4FMVA 1HP4A 1MQPA 4EANA 4Z2LA 3K8MA 3W6MA 3VIFA 2OWWA 2YLLA 2GSJA 5JIPA 1UUQA 5I78A 4H8UA 7A3HA 3AZTA 1UHVA 1QHOA 3NYDA 1CGTA 4W8LA 3WUGA 2XJ7A 4NSBA 1FP9A 6A3HA 4M8UA 3WFLA 2YDRA 2ESCA 4WIWA 1GNXA 1V08A 1ITXA 3OGRA 2X09A 2FH6A 1J0KA 3ZQ9A 1LG1A 4FLSA 1FH8A 1WDRA 3NJ3A 3W29A 1UKPA 4AZIA 2DH2A 1HJQA 4PUDA 4J3XA 2C7FA 4CCDA 4HMDA 3OIHA 1C7TA 1JAEA 2DDXA 5A6BD 4MTVA 1HJWA 3NSNA 4PSRA 2VRJA 4MNMA 2XHYA 4NRSA 4HP5A 4V27A 3NDYA 3ARZA 2Y24A 3ZIZA 2D0HA 2QMJA 4LPCA 3SCNA 3BCFA 3AMKA 1B30A 1KXTA 1QPKA 2WSPA 4HU0A 3W82A 5E6ZA 1DWJM 1NOWA 1QVBA 3F5LA 2WW5A 2BNJA 3CO4A 1BFNA 3F4VA 3VMPA 4KMQA 3VIMA 2WZEA 3RDKA 1GCYA 2WHLA 1CGYA 3EDFA 4AD5A 1W91A 3N15A 1JAKA 1XRVA 3OBAA 3RM4A 4UTFA 4TVUA 2ZUWA 5HBFA 2OYKA 9CGTA 4WF7A 1NP2A 4P7LA 1IT0A 5M3WA 3WDRA 1CXIA 1QNSA 1BLIA 3VGBA 3EMQA 1GONA 4E8DA 5CPSA 4LXFA 1PEZA 3DECA 4GQRA 4QLJA 3IJ9A 5A69A 3WUEA 4JFVA 4W8BA 2WKLA 2Z1SA 2YA0A 1FP8A 3K4AA 3SCRA 3RIKA 3W27A 1LF1A 3CBWA 5FL1A 3WQWA 3VIHA 1A3HA 4HOXA 4PMVA 3PZQA 3ZR5A 1EIBA 1WE5A 1E3XA 1BG9A 1AQHA 4RE2A 5D9OA 3WEOA 5JUVA 2E0PA 1JYVA 2WVTA 4PMXA 4D6IA 3ZJKA 4F66A 4D1IA 2WLZA 2WC3A 2Y5EA 3OGVA 1FOBA 4KH2A 5A1AA 2VX7A 1F4HA 2A3BA 3WDPP 1KWGA 3WDJA 1VBUA 4LGXA 2QV4A 1MW3A 2G41A 2CBJA 1CECA 1W9DM 4IM4A 4ACYA 3UESA 3CMJA 3AI0A 4WSJA 3TTOA 1QNPA 3QOMA 1B3XA 1PZ3A 1LLOA 2NT0A 5HPOA 4UFMA 1JI1A 2ZUVA 1FA2A 1QBBA 1OM0A 3AIUA 5I79A 3BGAA 1R86A 4AD2A 4MNJA 1PIFA 2ZX7A 1EQPA 3VTRA 1KR1A 3N17A 4YPJA 3WNLA 4ATDA 2VR5A 2XGIA 3VGDA 4HA1A 4HOZA 5D4YA 2ZIDA 3VKKA 3L4YA 1K9TA 2ZX5A 3WNMA 3UCQA 5GNYA 4JHOA 1GPFA 1L8NA 3WN6A 3BAKA 1K9FA 3VM5A 3VX1A 3WL0A 1OB0A 1MVYA 1W3HA 3MSGA 1BYCA 2O9RA 1HJUA 3AQUA 1D7FA 1QW8A 1SMDA 1JYXA 3KEHA 1XC6A 2XIIA 5IDIA 1CEOA 1E5JA 1ODUA 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 4AD0 A;  5IFP A;  1RH9 A;  3GBD A;  5IFT A;  3A6O A;  1GHS A;  2JIE A;  2OWC A;  3TOP A;  1C92 A;  3WF4 A;  1VIW A;  4ACZ B;  2DIE A;  1EO5 A;  1GJU A;  4YN5 A;  3A4W A;  3WQ5 A;  1LWH A;  5FD0 A;  5E0C A;  1VRX A;  5A8O A;  3WQV A;  4Q22 A;  2VVS A;  1YHT A;  2WCA A;  3VD3 A;  3CHF A;  1ODZ A;  2XM2 A;  3WNP A;  5BYW A;  3AJ7 A;  3WDI A;  1E1F A;  3LMY A;  4BS0 A;  1UR2 A;  4XB3 A;  5M17 A;  1VJZ A;  2VCA A;  4AZG A;  3B9E A;  4CN6 A;  5D9P A;  5I3D A;  5JBF A;  4B3K A;  4AY1 A;  1WAW A;  5E09 A;  5HOS A;  2CPU A;  3GXM A;  5GQB A;  2JIW A;  3PZU A;  2FHB A;  5EBA A;  1LL6 A;  1R85 A;  3VD4 A;  3AFB A;  1JD9 A;  3CHD A;  3AYR A;  3UR8 A;  3EDK A;  3WD2 A;  1XGZ A;  1XHG A;  4P7O A;  8A3H A;  1NWS A;  4ZE4 A;  3WDH A;  1HVX A;  4TVC A;  2XVG A;  3AIW A;  5JBD A;  4D71 A;  4M81 A;  4HZ6 A;  3CMG A;  3RIL A;  3WD3 A;  2A3E A;  1QI5 A;  3I3D A;  2DGA A;  2VO5 A;  2VCB A;  2J7G A;  1V3H A;  1E6N A;  2IUZ A;  4LQ1 A;  3AIC A;  4C7G A;  3KL5 A;  3A3H A;  1TR1 A;  1V3L A;  2ZUM A;  1B3Y A;  1BYB A;  3GNP A;  4XZW A;  4PMR A;  1M03 A;  1W3K A;  2O9P A;  3CTT A;  5IXE A;  3AIB A;  1K6A A;  4Y7E A;  4QFU A;  5AC5 A;  1E6R A;  1BSI A;  3HU7 A;  4UFK A;  1VEN A;  3HN3 A;  4F8X A;  3ARR A;  3AZS A;  2PBO A;  4GZI A;  1G9H A;  1GOW A;  2EPN A;  2W91 A;  4OIF A;  1PPI A;  4KGL A;  5KEZ A;  1DWH M;  1IZJ A;  1TFV A;  1KCL A;  4MB1 A;  3WFZ A;  5I2U A;  2D2O A;  5BCA A;  2CKR A;  3VDC A;  3T0A A;  1JG9 A;  1E4M M;  1U33 A;  4GXP A;  4TX8 A;  3WL1 A;  2Y4S A;  1TE1 A;  3WH6 A;  4MPK A;  1E40 A;  2JF7 A;  1J9Y A;  4J3U A;  4U3C A;  4TXE A;  5BRP A;  4CCE A;  4W5Z A;  2GFT A;  2WMH A;  4J3V A;  3BC9 A;  2E3Z A;  1J0Y A;  4C7D A;  1UR1 A;  3WD0 A;  5ABF B;  3FN9 A;  1FH7 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2BOD X;  5CJN A;  7CGT A;  1FHD A;  3KCL A;  4HPG A;  1RD5 A;  3CIW A;  3S83 A;  1FKF A;  4C1L A;  4KGJ A;  3UZJ A;  1GVQ A;  1ZBC A;  2ZWY A;  3ITO A;  3B7X A;  1VRD A;  2YYU A;  3AIQ A;  2IKJ A;  2O55 A;  1JRB A;  1QPF A;  1OFD A;  1DV7 A;  5HJY A;  4IUO A;  5LNV A;  5C9Z A;  4HJF A;  1CEN A;  4AD4 A;  1B2Y A;  3UI5 A;  3RRX A;  2CU0 A;  3XIN A;  4XZH A;  5FJO A;  3PR2 A;  3T0T A;  3EXR A;  3NQD A;  2CCR A;  4WEV X;  5K9C A;  1JND A;  2ISD A;  2VC9 A;  1H7R A;  4LX4 A;  1QNR A;  2OEM A;  3E6E A;  5HJX A;  3DU0 A;  2GOK A;  4DO4 A;  3VA8 A;  1W9P A;  1W2P A;  2QJI A;  3NM1 A;  3VKJ A;  3P3B A;  4NZC A;  4NI3 A;  4JTD A;  2Z1V A;  1KT0 A;  2XVP A;  4Q6J A;  4FS9 A;  1PDY A;  3MP3 A;  5XIN A;  2FLI A;  4LS1 A;  1FWB C;  1YW1 A;  3H55 A;  1YXY A;  3L4X A;  4DPP A;  4UQD A;  1WCG A;  3FA4 A;  4HNC A;  4UTW C;  2XPB A;  4R9O A;  3BLD A;  5F2I A;  4ZO8 A;  1XDM A;  3VIO A;  3BG3 A;  3MU7 A;  5LYR A;  3WEL A;  4Q3M A;  1X6N A;  4QGC A;  2W3Z A;  5E1Q A;  2EJA A;  3UA3 A;  3L4Z A;  1QRQ A;  4LOC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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