The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
|
sequence length |
116
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structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
|
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| total genus |
25
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-12-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3J7A P; 1IBM K; 4JI8 K; 1HR0 K; 4JYA K; 4YY3 K; 2UUB K; 5BR8 K; 5A2Q O; 2UUC K; 1IBK K; 4LF8 K; 2HHH K; 4KHP K; 1N33 K; 4X64 K; 2ZM6 K; 3T1Y K; 4DR2 K; 4DV4 K; 1FJG K; 1XNR K; 4DV6 K; 2VQE K; 3JAM O; 4CW7 B; 4CVN E; 3OTO K; 2UUA K; 3J7Y P; 4JI4 K; 4JI6 K; 4V19 S; 1J5E K; 4LF6 K; 2E5L K; 4DV1 K; 4JI5 K; 4DV0 K; 4DR6 K; 4NXM K; 4DUY K; 1IBL K; 4NXN K; 4LF7 K; 4LF4 K; 1XMO K; 4DUZ K; 4X66 K; 2F4V K; 1N32 K; 4OX9 K; 2UU9 K; 4LFA K; 4JI0 K; 4B3S K; 2UXD K; 4DR3 K; 1I94 K; 1N34 K; 4JI3 K; 4X62 K; 4K0K K; 4AQY K; 4GKK K; 1HNZ K; 4B3M K; 4DV7 K; 1N36 K; 5LMN K; 4JI1 K; 5FLX O; 3T1H K; 1XNQ K; 4B3R K; 2UXC K; 1HNW K; 1XMQ K; 2VQF K; 4DR5 K; 5LMU K; 4LF9 K; 5IT9 O; 1HNX K; 4DR4 K; 3J80 O; 4B3T K; 4LFC K; 5LL6 Z; 4JI2 K; 2UXB K; 4LF5 K; 4DV5 K; 4JI7 K; 4DV3 K; 4DV2 K; 4DR7 K; 4GKJ K; 4X65 K; 3J81 O; 4LFB K; 4YHH K; 5AJ3 K; 4JV5 K; 5IWA K; 4DR1 K; #chains in the Genus database with same CATH topology 3KLH A; 3OYL A; 5B8H A; 3EYZ A; 3WXI A; 3JS6 A; 3O9S A; 4KH4 A; 2WTU A; 4CEQ A; 1XUP O; 1TV6 A; 2UUC K; 2QW9 A; 3ZSW A; 3OYA A; 2DTU A; 2QWM A; 1ZBI A; 2GBZ A; 3DLE A; 4YDU A; 4CZG A; 3R9P A; 3OYC A; 5EY4 A; 3PLA A; 4UY8 O; 1VRU A; 4MLE A; 3A5L C; 2F7T A; 1T7P A; 1D9D A; 1K9M O; 1WBB A; 1Q82 O; 5C42 A; 2IDO A; 3T1A A; 3PSI A; 2F9T A; 3NH0 A; 4M45 A; 1FW6 A; 4GV9 A; 3FZM A; 1EET A; 3ZT4 A; 4HCC A; 3Q7B A; 4Y0W A; 4KRF A; 3VEN A; 4O0I A; 4LF7 K; 1HNI A; 1N5Y A; 4RTF D; 3CCJ N; 3KKR A; 1CZ9 A; 3P1G A; 4LFA K; 1OH8 A; 1NJX A; 4I7F A; 3NGY A; 1P90 A; 1NKC A; 4TSX A; 2G8U A; 4H03 B; 3VTH A; 4CEE A; 4U67 L; 1Q7Y O; 4DTP A; 1XWL A; 3VES A; 4JEP A; 3QEI A; 3AVH A; 3UKR B; 4DV7 K; 2ZF5 O; 3VQ8 A; 3Q7C A; 3SV3 A; 3T1H K; 4B3R K; 2KLA A; 3ZYY X; 1Y97 A; 4DR5 K; 4Z4G A; 1VSF A; 3TI0 A; 5IT9 O; 5HBM A; 1JLC A; 4ELU A; 4CGG A; 4FK4 A; 1Z26 A; 3UKU A; 3OYH A; 4KHN A; 1SUQ A; 4KTZ A; 2GWJ A; 2P9S A; 2AP1 A; 1TUU A; 3G4S N; 4Z4E A; 1JCG A; 4BG9 A; 3TAQ A; 2IC3 A; 4GV3 A; 3EKU A; 4JK7 A; 1WN7 A; 4CIE A; 1S1X A; 2OTJ N; 1NGG A; 5AQT A; 5AZJ A; 3DI6 A; 4FM0 A; 4BC3 A; 1I3A A; 2HHT A; 3DLB A; 1S9G A; 1K6Y A; 3K5M A; 1YJW N; 3KVG A; 3UIQ A; 4J2A A; 2QWN A; 4BRA A; 4H0P A; 2NRW A; 4RW7 A; 3H3N O; 3LWM A; 1ZXO A; 4FPB A; 2KW4 A; 4X64 K; 2ZM6 K; 1XNR K; 1YTA A; 3BP8 A; 4K42 A; 3H08 A; 3NF6 A; 5DM7 L; 3EZ5 A; 3JAM O; 1ZC6 A; 3OTO K; 3NAE A; 1WBD A; 1X9W A; 4CJR A; 4JKG A; 4CJQ A; 2I5J A; 3M1F A; 1BI4 B; 2HST A; 4GVM A; 4O44 A; 3WQT A; 2RE2 A; 3D2E B; 4DSE A; 3AVC A; 3R6M A; 1NOZ A; 4OVL A; 1TAU A; 3QIP A; 4CJK A; 3MN5 A; 1VHX A; 2PY5 A; 5KTQ A; 1GLJ O; 4B1U B; 3TU5 A; 2YHA A; 3VQ5 A; 4U7B A; 2QWQ A; 4RWT A; 1O1W A; 3CD6 N; 2ASM A; 4CJW A; 3TAR A; 4C8O A; 3S3N A; 1BUP A; 1JL2 A; 3AVA A; 3HL8 A; 1TL1 A; 4JI3 K; 4CBW A; 3MXM A; 5E41 A; 3KLI A; 3AA5 X; 4ILH A; 2OA8 A; 4C8M A; 3KK3 A; 3MWP A; 4W5Q A; 1XMQ K; 1RT2 A; 2VQF K; 2HHW A; 4IG0 A; 1X3M A; 3RTV A; 2P5G A; 3T19 A; 3P39 A; 3H1Q A; 3K0S A; 1R59 O; 2OPR A; 2ITM A; 3CI5 A; 3NHG A; 1NK7 A; 2A40 A; 4HUE A; 3DXM A; 1BWF O; 2D4W A; 5BR9 A; 4O8U A; 4E1N A; 3TR8 A; 2FF3 B; 4JNE A; 3ID6 A; 1IV0 A; 1JLB A; 4KPY A; 4DR1 K; 1DEJ A; 1U49 A; 3DOK A; 3THW B; 1W2B M; 2P9P B; 1KVA A; 2RHK A; 3QEV A; 1KVB A; 3WNE A; 4CEA A; 2KQ2 A; 4ELT A; 5AQG A; 1OH6 A; 3LAL A; 3MCA B; 4CK3 A; 4H5T A; 3K9K A; 2G8K A; 3AVK A; 5C10 A; 4JKE A; 3TSQ A; 1DLO A; 4YDU C; 4JKF A; 3U9D A; 1NJY A; 1IKY A; 4EAH D; 1NJW A; 3OYN A; 3WXL A; 4ICL A; 3VN5 A; 3SQ0 A; 3DWL A; 1E3M A; 4DV6 K; 3HXM A; 4CBX A; 2D0A A; 4CF2 A; 1M90 O; 2JGU A; 4IBN A; 1U2V A; 4B9M A; 1ZYQ A; 4V19 S; 3CC7 N; 2E5L K; 3O4Q A; 2WBN A; 2PZS A; 2ZE2 A; 1YAG A; 3MK6 A; 5D3G A; 4YOW A; 3MN9 A; 3MXJ A; 3LPT A; 4KHS A; 2NNW A; 3MN7 A; 1Z6R A; 2JWL A; 3H45 C; 1YUW A; 3CQ8 A; 1I94 K; 3ZEU B; 1NGB A; 3CC2 N; 3VGK A; 4ZTJ A; 4H0O A; 3LAM A; 4BR4 A; 3KKS A; 1P8Z A; 4IFY A; 5LMN K; 3AAQ A; 4KB0 A; 3VMF B; 4CD1 A; 5JVG L; 1UA0 A; 1WSE A; 3ZX3 A; 5JMV A; 3NF7 A; 2NRZ A; 4DQI A; 4B3T K; 4DU3 A; 2AJQ A; 2EHG A; 3ZCM A; 5GAH P; 1NK5 A; 5LL6 Z; 4LH4 A; 2QK9 A; 4CJP A; 3VET A; 2ZJP L; 3VEZ A; 4FXD A; 1YVN A; 3U3Y A; 3SJJ A; 4K8X A; 4FYD A; 2KTQ A; 3QNO A; 4ISF A; 3SMS A; 3DRS A; 1WUA A; 1Z05 A; 1NM1 A; 1IJJ A; 4N47 A; 4IOC L; 3EO3 A; 2NLX A; 3AVB A; 1HNV A; 4IOX A; 2OYQ A; 3FLC O; 1BA0 A; 1HQE A; 1Q81 O; 3LZJ A; 1VQK N; 3AAR A; 2ZGY A; 4JHD A; 4FVU A; 4FWO A; 4KI4 A; 5HP1 A; 3U9Z A; 4FLU A; 1NKB A; 4OJR A; 2HHH K; 1BIZ A; 3C7N A; 4A57 A; 4ID5 A; 3O1B A; 4B8A B; 5T7B A; 3D2F A; 3I0S A; 3VQQ A; 1QSL A; 5KI6 A; 1M1K O; 4O0J A; 3SAH A; 4B9S A; 5EOY A; 4HWI A; 1WSH A; 3AVM A; 4CVN E; 4EHT A; 4PL8 A; 1MWK A; 3DYA A; 4BC5 A; 5JS1 A; 3KZB A; 2VYP A; 5AQZ A; 2P9U B; 3RR8 A; 3V4I A; 4PA1 A; 3CJA A; 3JYT A; 3NH1 A; 3ZT1 A; 4RW8 A; 3OYJ A; 3IMX A; 3THV A; 3VF4 A; 3ALY A; 2GUP A; 3V1Q A; 3OHR A; 4IXC A; 3G25 A; 3ISN C; 3CC4 N; 4L8R B; 4IDK A; 2P9L A; 2UXD K; 3CJ7 A; 1L3S A; 3C6T A; 4AHV A; 3MCP A; 2ASP A; 4X62 K; 3IG1 A; 1EKE A; 1TVR A; 2NRR A; 4NYN A; 4DSL A; 3P38 A; 4IFV A; 5FRN A; 1YTU A; 4CZH A; 2GTD A; 1OVY A; 3VQC A; 2WC9 A; 1EO1 A; 1ESV A; 2KFN A; 1KD1 O; 1UOC A; 3VQ6 A; 1TKX A; 2YKM A; 3LP3 A; 1KC8 O; 3NH2 A; 3N4P A; 2OZM A; 1XC3 A; 3FR0 A; 3LDP A; 3VEV A; 1CZB A; 1R0A A; 4DV5 K; 4FZX C; 3I8B A; 4Q5V A; 3OBW A; 4FOE A; 3BZK A; 4FWS A; 4BRO A; 2E2P A; 4IOA L; 3P5J A; 1HX1 A; 5EU7 A; 3CQY A; 3K57 A; 3O4N A; 3K9J A; 2KFZ A; 1WOQ A; 2CGK A; 1VQM N; 3KHY A; 3LDO A; 5AFU H; 4YOV A; 2HB5 A; 1L3U A; 3FZH A; 3K5O A; 2Y1I A; 3SUN A; 1X9J A; 3L0Q A; 4M3R A; 4DFP A; 4DG1 A; 4FJ5 A; 4G1Q A; 3VGM A; 3NDK A; 1NGA A; 4FW2 A; 3I56 N; 5C0Y A; 1JCE A; 3L8B A; 3B6O A; 4DB3 A; 3J7Y P; 3PX4 A; 1VSJ A; 3KIO A; 4K43 A; 4R5P A; 3CFR A; 2FBY A; 1D8Y A; 4FJH A; 4JK8 A; 3UKR A; 5AQP A; 3CCQ N; 1KVC A; 1VQP N; 3LDS A; 5HOO A; 2V7Y A; 4RW9 A; 3O6W A; 3L2W A; 1LAW A; 5C2F A; 4QOZ B; 4FLZ A; 3EN9 A; 1N32 K; 4E7K A; 1HPM A; 1HYZ A; 3ID8 A; 1VQN N; 4F3O A; 2HNZ A; 4JKC A; 4F2R A; 3HST B; 5LJV A; 4OGE A; 1YJN N; 1FKO A; 1JLQ A; 1OH7 A; 2IAJ A; 3QFP A; 4K0K K; 4DTO A; 2HBK A; 4KFB A; 1BGX T; 3TWH A; 4FJ8 A; 2OPP A; 1HQU A; 5LMU K; 2QI2 A; 1TL3 A; 4F2S A; 4LF9 K; 3NF8 A; 3H3O B; 3CJ1 A; 3SLC A; 4JAX A; 3HJF A; 2RKI A; 4CHQ A; 4JS4 A; 1GLL O; 1RDU A; 4NO7 A; 5HRP A; 3VQ4 A; 2IVP A; 5I9E B; 1KAY A; 4NB4 A; 4LFB K; 2LSN A; 4HHT A; 4BDZ A; 3MWT A; 3IDH A; 3KLE A; 2FBV A; 1NJZ A; 2E4L A; 3MMV A; 3NMU A; 3ZSR A; 3AO4 A; 2W6L A; 1HR0 K; 1BI4 A; 2Z1I A; 3QEP A; 3CYM A; 5AQU A; 1ILY A; 2HW3 A; 3D2E A; 3FZL A; 2B6A A; 1C0T A; 1ZBL A; 2IVO A; 2X78 A; 5E84 A; 2A41 A; 1HKG A; 5C25 A; 4B8C A; 4F3T A; 4FWN A; 3DLK A; 4AHR A; 1QE1 A; 1JJ2 M; 4IO9 L; 2Y1J A; 1NG9 A; 1U6Z A; 2DPN A; 3NBP A; 3SQ4 A; 5AQV A; 3T69 A; 3QET A; 3QB0 A; 2QWO A; 2FBX A; 2WFB A; 4JI6 K; 3RSE B; 4DQR A; 1ZBH A; 4JD2 B; 3SZ2 A; 1REV A; 3CQX A; 5JLF A; 5KPT A; 3L4Q A; 1WNS A; 4BVP A; 1OKJ A; 2D5R A; 3DAW A; 4FZY A; 1H1V A; 1SS6 A; 5BN9 A; 2JLE A; 3FGU A; 2PYJ A; 2F4V K; 1QHA A; 1GLB G; 3LDN A; 3K5L A; 3SK3 A; 3EE8 A; 4JI0 K; 2E2O A; 3R3L A; 2BAN A; 3V9S A; 3M8P A; 3V1O A; 3WQU A; 5M1P A; 1S1V A; 1DT9 A; 4BVO A; 4CJT A; 1VSH A; 4FZZ A; 1EWR A; 4CES A; 2Z1J A; 3C65 A; 3BZC A; 3L4I A; 2NUB A; 4M63 C; 4BY9 C; 4CHO A; 3THW A; 4BG8 A; 3AVG A; 4E7L A; 4OKE A; 4DQQ A; 1RFQ A; 1VQ6 N; 3PO4 A; 2R7Y A; 1SV5 A; 3QML A; 4EP5 A; 5GAE P; 4JI2 K; 4BR5 A; 1GLD G; 4CGJ A; 3SPY A; 1VQ5 N; 4JI7 K; 3ULE B; 1EWQ A; 1KTQ A; 2P9K B; 1I39 A; 4YOT A; 4BRP A; 1SZ2 A; 2YX6 A; 3OYD A; 4WE1 A; 3DJC A; 4Q0B A; 1B9F A; 1RTD A; 5C24 A; 3VQD A; 4YY3 K; 4M3W A; 1NK0 A; 3E1Y A; 3UE5 A; 4CCH A; 4GNI A; 3MX5 A; 4XH4 A; 3OY9 A; 4DSF A; 1S22 A; 3LDL A; 1WLJ A; 2Q3S A; 4DV4 K; 3OYE A; 3THY B; 4B9T A; 2A42 A; 2F8S A; 4LSN A; 3MN6 A; 3E01 A; 2V52 B; 4DFJ A; 3OBY A; 1LW2 A; 2UUA K; 3VF2 A; 2YI1 A; 1NGE A; 3LAN A; 3ZEU A; 4A62 A; 1EP4 A; 4MO4 A; 5AQQ A; 3K2P A; 2E2N A; 3C95 A; 5EXW A; 4DTJ A; 5AQJ A; 3EL2 A; 4GVE A; 3U3G A; 3NCI A; 1EXQ A; 4PKG A; 3SI6 A; 5AQW A; 4IKF A; 2G8H A; 1NK8 A; 4B9N A; 3H46 O; 1BA1 A; 4OLA A; 1U4B A; 1VQ8 N; 5AFU A; 3AV9 A; 4KI6 A; 5GAD P; 2O4I A; 1C0U A; 5GIP A; 3AO3 A; 3SBG A; 1KFD A; 4YOU A; 4FOI A; 1SL1 A; 4L3Q A; 3QBW A; 1JLA A; 4CZL A; 3CFP A; 3U6F A; 2QKB A; 2YHB A; 4CF0 A; 1G15 A; 1UA1 A; 2E1Y A; 2X6S A; 3C94 A; 4B9Q A; 4OKK A; 2BDP A; 2Q97 A; 2E88 A; 4FJJ A; 2DY4 A; 3L3V A; 3KK1 A; 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2E20 A; 1S6P A; 5BRF A; 4LSL A; 2YHY A; 3VQE A; 3VEY A; 3AGR A; 4J2E A; 4IJN A; 3UKU B; 3NGI A; 3J7Z O; 3T7Z A; 3CPW M; 4AM7 A; 4CED A; 3QDK A; 1MA9 B; 4CJU A; 3QEW A; 1QQN A; 4AF1 A; 3JXU A; 3BEX A; 1Z25 A; 4BR2 A; 4DU1 A; 4BAC A; 5BPL A; 4B1Z A; 2ZJQ L; 3T3F A; 4C8L A; 3I55 N; 4JV5 K; 4GY2 B; 5M1F A; 4O5B A; 2PBD A; 4DHY A; 5AZJ B; 1K8K B; 3QIN A; 3J7A P; 3CCE N; 1CZA N; 2GEL A; 4CHN A; 3HRG A; 2IS3 A; 4OPH A; 4DLG A; 2FC0 A; 1L3V A; 2D0P A; 2UUB K; 1IBK K; 4BRE A; 3LAK A; 3CFO A; 2Q31 A; 4E0D A; 4FJL A; 3PY8 A; 4XIU A; 4DFK A; 2XY7 A; 1LWE A; 4RG8 A; 5TKW A; 4WFB L; 4CZI A; 2Q2R A; 3WNH A; 1QVF M; 3E9O A; 3CF5 L; 5ELZ A; 5AQM A; 4AH9 A; 1KQS M; 4LC9 B; 2QA4 N; 1SKS A; 4FK0 A; 3SQ2 A; 2A1S A; 1QVG M; 4BE2 A; 3KLG A; 4KHQ A; 1T6C A; 4I2Q A; 3CME N; 4QS8 A; 3V9U A; 1YHQ N; 1TK0 A; 1N8R O; 2BGG A; 4B1Y B; 2Z1G A; 1IG9 A; 4QCL A; 3AA2 A; 3ITH A; 2VGN A; 2YJE A; 4DTX A; 5J2M A; 5BN8 A; 4FLT A; 3CCS N; 2Z1H A; 5FDL A; 3NVK A; 3LP0 A; 2QXL A; 3LDQ A; 2VG7 A; 1JCF A; 2BH1 A; 3W3D A; 4BR9 A; 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