4NZCA

Crystal structure of chitinase d from serratia proteamaculans at 1.45 angstrom resolution
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
398
structure length
397
Chain Sequence
AHAASYLSVGYFNGGGDVTAGPGGDINKLDVTQITHLNYSFGLIYNDEKQETNPALKDPSRLHQIYLSPKVADLQLLPVLRKQNPELKVLLSVGGWGARGFSGAAATAESRAVFIRSVQQVIKQYHLDGIDLDWEYPVNGAWGLVESQPADRANFTLLLAELHKALDKGKLLTIAVGANVKSPQEWVDVKGIAPYLDYINLMTYDMAYGTQYFNSNLYDSKQWPTVAAADRYSANFVVDNYLAAGLKPAQLNLGIGFYGRVPKRATEPGIDWDKADAAKNPVTQPYFTARETAVFKAMGLDLTKDSYFKYNDIVSKLLNDPQRRFTAHWDSDAQVPYLTMKSAEGKPLFAISYENPRSVALKADYIKSKGLGGAMFWEYGADDNNRLAHQLAESLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Glycoside hydrolase family 18
publication title Structure of chitinase D from Serratia proteamaculans reveals the structural basis of its dual action of hydrolysis and transglycosylation
pubmed rcsb
source organism Serratia proteamaculans
total genus 128
structure length 397
sequence length 398
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4nzcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4nzcA01
2J47A 1Q6CA 1FH9A 5AC5A 4Z2HA 4AD1A 3I3BA 2YBUA 2DPEA 1CGYA 1V03A 4JL2A 1V3JA 4AZCA 2J79A 2O9TA 4MPKA 3O2LA 2YDSA 2ZUMA 3ZO9A 1VF8A 4EE9A 2W63A 3VINA 3W29A 3BH4A 1A47A 5GNYA 3QHNA 1QPKA 4CU8A 3ARWA 1EDGA 2E4TA 1ZBKA 2Y8KA 3F4VA 3GH5A 2PF0A 2WVVB 1H0GA 1H5VA 3OIHA 4R27A 3VIIA 4HA4A 1VBRA 5GPRA 3T08A 3AS2A 1M7XA 4W88A 2G3IA 1UZ4A 4X9YA 2QMJA 3NDZA 2YIHA 3BMWA 3KL5A 4GO8A 3WD4A 1MQPA 1CLXA 3AZRA 3VX0A 3AFBA 1J11A 2PWEA 3EDEA 4HU8A 4MNJA 5A8QA 4UOQA 4AZCB 3FHQA 1J0YA 3VPLA 4WKAA 1XV8A 5ABEA 1OINA 2GDUA 3MUY1 4FLRA 5DT7A 3CZJA 2J75A 4CCDA 4UFIA 1WPCA 4D6HA 5DO8A 1JGIA 4B9ZA 4J3UA 1NOUA 3FXYA 1UG6A 1XSKA 1B3WA 2UY5A 4YPJA 3W26A 4GKLA 4PMDA 5D9OA 1HIZA 1E43A 2VI0A 1XH2A 2VCAA 4QLKA 2FH6A 1JAKA 5AYBA 5IHSA 4UZUA 1NOFA 3ZJ7A 4JFTA 3K4AA 4MDOA 3OLIA 1WZAA 4HPGA 4P8XA 1JFXA 2WZIA 2WANA 2XJ7A 1OSEA 3EMCA 2JIWA 3VIOA 1LL7A 1PX3A 4PSPA 1HJQA 3FNDA 1E4IA 4J3VA 3CUIA 3AS0A 1QW9A 2YL8A 4BF7A 2DH3A 3RM9A 1JD7A 1XCXA 1JI2A 3EDDA 3FW6A 2VCBA 4MAVA 1BYDA 2W5FA 3K4DA 1ODZA 1UD2A 3ZT5A 1TUXA 3N13A 2ZX8A 1XD0A 1H09A 3IJ9A 3POHA 4XZWA 4U5KA 3W53A 3ZR6A 1WZMA 1JXKA 1S46A 3VMOA 2ZIDA 1JFHA 1PZ2A 3N18A 1EO7A 5CPSA 2IUZA 4FLSA 1E4MM 2BVTA 3SUTA 2WLZA 2X09A 2WMIA 4HMEA 4CN6A 1JZ5A 1QI0A 1BTCA 1LL6A 3MMWA 3MANA 4FLQA 2PBGA 1VIWA 3ARZA 4GQQA 4EK7A 1W1YA 1E0VA 3MMUA 5A2AA 2WYSA 5ABFB 4BS0A 4GZJA 5FIPA 3WD1A 3WQVA 3L4VA 4W7UA 2E3ZA 4PMXA 1NQ6A 3WNMA 4JIEA 2E40A 7A3HA 2VL4A 3PZUA 1UKTA 2G3JA 1NWUA 4CD8A 1UD8A 4A4AA 3WD0A 1V3IA 2W92A 3CIVA 3VGGA 4TUFA 5HPOA 2WC7A 2VZVA 5HXMA 2AOSA 5DFAA 3MO4A 1M53A 5BRQA 2YL5A 4RE3A 5A6JA 2J62A 5JBFA 4HPHA 2J8FA 2WPGA 3T2QA 4LX4A 3WEZA 2RGMA 4JHZA 4FLOA 1W91A 1KXQA 3KWXA 5EFFA 1EOKA 4AZ7A 1SR0A 1W3LA 2WMIB 1HVQA 5I0DA 1WDPA 4W5ZA 3NCOA 4M1RA 1AQHA 3WH8A 2AAAA 4WSKA 3WL0A 1CXFA 1JF5A 2ZUSA 1XHGA 1QNPA 4HA3A 1MFUA 1EQPA 1TFVA 3A3HA 1JI1A 1H3GA 4UQDA 3T2PA 1WAWA 4ACZA 2CBJA 1HJVA 4PMUA 1JYVA 3MMDA 2VCCA 2BNJA 4YHGA 4ZE5A 3CH9A 3VNYA 3ZJ8A 1RD6A 2VZSA 3WUBA 1EH9A 1L8NA 2CBUA 4M80A 4W8AA 2FHCA 4GI6A 5ABGA 1HJWA 4PRWA 1V0NA 4KH2A 4AXNA 1GQKA 2UY4A 1WCGA 2EPLX 1DP0A 3IK2A 5CLTA 1OGBA 3W4RA 2VNCA 4U2ZA 2OWCA 1J0HA 4OKDA 1FHDA 1J0JA 3ARTA 4W5UA 4OBSA 3CHFA 1SMAA 1PX8A 3EDKA 2CITA 1R86A 2FHFA 3PHAA 1TMQA 1C8YA 3OB8A 1B30A 1ZJAA 4LPCA 1E6NA 3SCQA 1E6XM 2UY3A 2C7FA 1V0MA 2GVYA 4JKLA 4R5EA 3CHDA 1E0XA 4KRUA 1JDDA 4AC1X 1WB0A 3N1AA 3MKKA 3VDAA 1EA9C 2XWEA 4AZBA 2J78A 3J7HA 4QCFA 2QF8A 1UQYA 3ECQA 4M24A 2WMJA 2CIPA 1W2PA 3K1DA 3MV01 2VRQA 3AOFA 2YKKA 2VOTA 1UR9A 1QW8A 1R7AA 1LF1A 1VRXA 1KGWA 3CUFA 3HJEA 1QI2A 3AHVA 1ZJBA 3WNOA 4ACYA 4LYPA 4U31A 2D3LA 2NT1A 4H2CA 2W62A 3AHXA 3PBGA 5A95A 3AIWA 4UR9A 3GYCA 4OJYA 5BYWA 4D6JA 5I2UA 4IUGA 1UYQA 4B16A 1GQIA 3AMKA 1EXPA 2DEPA 5CXPA 1Z32X 4DWSB 1BG9A 1TZ7A 4P7OA 3QGVA 1W32A 4CGTA 2XYLA 4MDPA 1QBBA 4Z2LA 3F5LA 4OOUA 1OGGA 2YJQA 5E6YA 1JZ7A 2OYKA 3PZNA 3VGBA 3CHEA 4BQ5A 5A6AA 4AD0A 1VFUA 1P6WA 4BCEA 1GUVA 4AIOA 4QDMA 1CGVA 1LWJA 5M5DA 3KE0A 2NSXA 4TX8A 4TVCA 3A4AA 3GXMA 3AXXA 3PZIA 4CD7A 2X05A 2J7EA 3BSHA 4MNMA 2WCGA 1DWHM 1CGTA 1K9FA 1PZ3A 3NDYA 2FHBA 5LA0A 3PN8A 5DF0A 2EPKX 3IJ8A 4U5IA 4TVDA 1WDQA 1KCLA 1XSIA 4BQ2A 8A3HA 4K68A 3WF4A 3VMNA 1UUQA 1PJ9A 3ZJ6A 1V6YA 2WZHA 2VR5A 3B9DA 2YOCA 5F7UA 3LPPA 4EAMA 4LXFA 1QI3A 4AZ6A 4D6IA 1CGUA 4M82A 4PBGA 4ZE4A 5JBEA 1GQLA 4X0VA 1J12A 1G01A 1CWYA 1R8LA 3A6OA 1U2YA 1X6NA 3VDCA 2BY1A 1B3VA 1EHNA 1DWJM 4D6DA 4CCCA 3OZOA 4J3SA 1DWAM 4W93A 5KEZA 3EYPA 2DT2A 4M56A 4RE2A 3AROA 2D1ZA 3SUWA 1W3JA 1H4PA 5A6KA 3NSNA 3OBAA 3WH5A 2YA0A 1UKSA 2Y4SA 2BFGA 5GQBA 1BYCA 3N11A 4TXEA 3WELA 1V08A 1GJWA 2ZXAA 4URIA 3T0BA 1BGAA 1XCWA 3U5UA 3AIRA 2D0FA 1KCKA 3BLPX 3VD9A 3SCNA 3VKKA 4CN1A 1LWHA 1OB0A 1PBGA 2CCRA 3F5JA 3UERA 4NF7A 3ARXA 1VB9A 4GZEA 4UQBA 3WQ8A 1OCQA 4MNLA 1IZJA 1W3KA 1E9LA 4V27A 2BY2A 4P7NA 5HNNA 1UKQA 4P7LA 3EDFA 3LPFA 5LA1A 2O92A 3MV11 4OUEA 2QV4A 3UG5A 3L4WA 1I1WA 1HT6A 5A69A 2JALA 2WVSA 4HOZA 3RILA 1BYBA 1ZBWA 2BHYA 2XGBA 2ZX5A 3BAWA 1KGUA 4NZCA 1UD4A 5A1AA 1LLOA 3PTQA 1NWTA 2D22A 5D9PA 1KXVA 2B31A 2PWDA 1V3HA 1G1YA 2E9BA 3TTOA 5CJ5A 1CLVA 1UD6A 3AS3A 4E4PA 1KBBA 2ZUUA 2E9LA 2EPOA 2UWFA 2VURA 3WF3A 3PZ9A 4CCEA 5E6ZA 1F4HA 2BHZA 3MSGA 8CGTA 5FD0A 1LG1A 4F8XA 1CDGA 2GJRA 4GINA 4TTGA 2BXZA 3VD3A 3GXDA 1PX4A 1VEMA 1BLIA 3L4TA 1TE1A 2J74A 1DWGM 2WMKA 1VFFA 5E0CA 2OLHA 1OD0A 4HMCA 1KQYA 3AMCA 3ZQ9A 1Q6DA 4NRRA 2WSKA 4QAWA 4ZEPA 3S6TA 3THDA 2CBVA 1UWUA 3EMQA 1CXLA 2O9OA 2NW0A 1H11A 5TD4A 4U3AA 1VBUA 3OG2A 1EIBA 2VVSA 3RM4A 3WBAA 1OWQA 1BPLB 3AYRA 3DYOA 2DT1A 4L4PA 3N04A 1SMDA 4AEEA 1CTNA 2DT3A 1CGXA 2E9MA 1J01A 3UESA 1MW0A 1VJZA 3RJYA 1C7SA 1M03A 2A3HA 5EFDA 1W2VA 4MB4A 1WZKA 1J18A 1GHSA 5D9MA 2ZUNA 5DT5A 2A3CA 3SEPA 2EPNA 3CZEA 4PSRA 3T2OA 4W86A 2FDMA 4PMQA 4AISA 1AMYA 5A8OA 1US3A 1B3YA 2HISA 3VIGA 3CUJA 1PAMA 3ZT6A 4W7WA 1GOKA 2VZOA 3L4ZA 3CGTA 3WY1A 3D3AA 3MUAA 1IZKA 3SIMA 1UKPA 1K9DA 4H41A 3WFZA 1CENA 3A47A 4WF7A 1B90A 3VDHA 2VX4A 3U5YA 6CGTA 3N17A 1HX0A 4IPNB 3VNZA 1HKIA 3ARSA 3I3EA 2JEPA 3KL0A 4WKFA 1FHLA 1B1YA 2XVLA 3AICA 4E2OA 2X8RA 4AD4A 2VTFA 2CETA 3WEOA 3WH6A 5I78A 1D7FA 4KMQA 3BCDA 3AJ7A 1UWTA 2CHNA 1KR0A 1CEOA 1XC6A 4WSJA 1DTUA 1BSIA 1HP4A 2X0HA 3M46A 4P7RA 2WWCA 3AYSA 3SUVA 1UH2A 1X1NA 3SURA 4JCLA 2ZX7A 3T0AA 5I6SA 3BAKA 4KGLA 1WP6A 1E40A 2DGAA 1MFVA 1GQJA 1BG4A 9CGTA 3CMGA 1E4LA 1G5AA 3AZTA 1LL4A 3TTYA 1JYWA 3BAXA 2VC9A 2XHYA 3WQ6A 1JZ2A 3PZMA 1E56A 1UOKA 2C0HA 3WUEA 4UFLA 4OZOA 1KB3A 3VDBA 1V3KA 2JEQA 1SFSA 4H8HA 5DEZA 3ZM8A 2PWGA 2WWDA 2D0GA 1UD3A 2YA2A 1FA2A 1HN1A 1VAHA 4WKHA 2PWHA 4YN5A 5LYRA 4BA0A 3AS1A 1UA3A 4D72A 1HVXA 1V02A 3G6LA 2W66A 4B3LA 5IFTA 4OOZA 3APGA 3W28A 2D24A 5A8PA 2J4GA 1F4AA 5AY7A 2GDVA 3SUUA 4J3TA 1VENA 1V3LA 3WQ4A 3KEHA 1Y7VA 4CKQA 5E9AA 3CMJA 4AIEA 5EB8A 2OSYA 1G9HA 1B9ZA 1XYFA 5CZKA 1E72M 1FOBA 1NP0A 4FK9A 3SCSA 3SCRA 1ZL1A 3EMZA 2OYMA 2VQUA 4P7QA 3MUZ1 2ZUWA 3I3DA 1BHGA 2DQXA 3W6LA 2F8QA 1J0IA 1ISVA 2CNCA 4P8VA 2ZWZA 4HOXA 4HTYA 4J28A 4U33A 4BZYA 4Q7NA 1MQRA 1QNSA 1OIMA 3WBEA 5D8ZA 1HL8A 3ZT7A 2EBNA 3ARQA 3POCA 3M07A 3WIJA 2EQDA 4NSBA 3LMYA 1AQMA 1JAEA 4CN4A 1BVNP 3CZGA 1EQCA 3FAXA 3SUSA 2ZXQA 5A6BA 1M01A 2O9RA 2DSUA 5BXRA 3GNRA 2DH2A 4JHOA 6A3HA 3N12A 1DHKA 1V0KA 1EHAA 1ESWA 1MXGA 2GUYA 1TVPA 4PYSA 1E5JA 2WMHA 2VUYA 4QLJA 5I24A 1JG9A 4QCEA 5E70A 4QP0A 1G94A 2WMFA 3OGSA 1D3CA 2DSWA 2CBIA 4PMVA 2WHLA 2J7GA 2BV9A 3UG3A 2CESA 5I79A 1KQZA 3WDHA 5FCZA 1OM0A 4D6EA 1M04A 4KGJA 2D0HA 3L4YA 1JZ4A 4W7VA 3W37A 3L4UA 1GHRA 4AD5A 1OBAA 5HBFA 4D1JA 1GNXA 2XSAA 2EXOA 1H2JA 4HZ8A 3TA9A 2Y8VA 3WDJA 1U33A 3A4WA 3IAQA 3IAPA 3E1F1 5FKYA 3UR7A 1FH7A 3OLDA 3LPGA 5CPQA 3JUGA 4CU6A 4F9JA 2JF6A 2GJXA 3KL3A 1UWIA 4ACZB 1ODUA 1GOQA 4DUWA 2FGLA 4AWEA 1CNVA 4UFKA 2PB1A 2WZEA 3GBDA 1HKMA 4ZENA 3ZSTA 1JD9A 1W9UA 1HJUA 1BYAA 1CBGA 3GBEA 2VX6A 1C7TA 4L4OA 1E3XA 2WLYA 1GW1A 4ZXLA 1JNEA 1UH3A 1E3ZA 4UQEA 2OWWA 1JZ3A 3OLEA 3N15A 2Z1KA 3NIYA 5HDRA 3DHPA 3VX1A 4GXPA 2WVUA 5CGTA 2ZX6A 2YA1A 5M03A 4JFVA 1QNOA 2VT0A 2VRKA 5EBAA 3WN6A 2DDXA 2WC3A 4Y7EA 4XX6A 3ZJKA 3HMCA 2G8ZA 4UQAA 4H8VA 1H1NA 4P8WA 3QHOA 3WF2A 1HKKA 1CIUA 1E6RA 1HKJA 2GJXB 5ABHA 4PTWA 3VO0A 2G3MA 1E6PA 1R87A 3ALFA 4AIUA 4PN2A 4UCFA 1TR1A 2X1IA 1E70M 3GTNA 3W0KA 4HP5A 2FGZA 1UD5A 2GK1A 1CGWA 2E8YA 4PMYA 2XUCA 4H8UA 5BRPA 2RGLA 4J3XA 5JBDA 3ZR5A 5C70A 1DWFM 3OGVA 1XGZA 2WHJA 1KWKA 2J7BA 3DC0A 1MYRA 2WMGA 2V38A 4D6CA 1C90A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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