4O7HA

Crystal structure of a glutathione s-transferase from rhodospirillum rubrum f11, target efi-507460
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
222
structure length
222
Chain Sequence
MRRLYHHGLSPAARKVRVALAEKRLDYEAVIEETWIRNESFLAMNPEGEVPVLVEADGLTITDGWAICEYLEEVYPEPSLLGGPAAMRAEVRRLVAWFDRKFNREVTEPLVREKLLKRVISGGAPDSRQIRAGRANVHTHLRYISWLIDRRRWLAGDMLTYADITAACHLSLIDYAGDVPWEDHPQAKEWYALVKSRPSFRPLLTETISPIRPPRHYADLDF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glutathione S-transferase
publication title Crystal structure of a glutathione S-transferase from Rhodospirillum rubrum F11, Target EFI-507460
rcsb
source organism Rhodospirillum rubrum f11
total genus 92
structure length 222
sequence length 222
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2013-12-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4o7hA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4o7hA01
1DE2A 4KB3A 2H6ZA 3MNGA 4K7NA 1XVQA 1O81A 3GL3A 4MCUA 3FZ4A 1PMTA 4N30A 2O7KA 3L9UA 2K8SA 2FNOA 5KN3A 2BMXA 3HZ8A 2E7PA 1I5GA 2HXKA 4P3YB 2GS3A 1HNAA 1VF2A 5ECHB 3CBUA 3RHBA 2LEGA 1AQWA 6GSTA 2XBIA 5D73A 4I5QA 1UA5A 4ZIJA 1NW2A 2DBCA 3H1NA 4V1Ap 4GQFA 4FIWA 3FR6A 2DJ0A 2LNSA 2LTKA 5INYA 3VPTA 2GVPA 4HQSA 3CRTA 2H76A 4AJ6A 4KGIA 3E3EA 2GLRA 3LXZA 5ECSA 1SU9A 5B6MA 2WS2A 3HKRA 4JR6A 3LXTA 3BOAA 3ZVJD 1TU7A 2H70A 3KP9A 3GKNA 3WD6A 4USSA 4YQMA 2KHPA 2GGTA 4MJBA 2I81A 4NV5A 2FY6A 2DIZA 2IWTA 1YY7A 4IJ3A 3BCKA 3GH9A 4OCFA 1T1VA 4AJ7A 1GLQA 2H0GA 3NOFA 1J9BA 1SJ6A 1FG4A 1E6BA 1V58A 4OWYA 1PX7A 5JWQB 4F2IA 2E2GA 3IR4A 2DMLA 2VL3A 3EINA 1M99A 2HYXA 1SKWB 2OJLA 4KSOA 3GFKA 2VD1A 1XIYA 3GTUB 4KSMA 2C0EA 1EEJA 5CRHA 2JL4A 3KMNA 1WJKA 3FHKA 2PBJA 1R7HA 3I69A 1A8LA 2LKUA 3PINA 3QPMA 2CZ3A 3ZFLA 2PWJA 2C3NA 3F4TA 2VCTA 1Z5YE 4ZB9A 4TR3A 2YOIA 4D73A 4HUAA 4OO5A 5C00A 3DGQA 2L6CA 1NHYA 4LL1B 2H01A 4KF9A 2HZFA 3ISOA 5B8BA 1XXUA 4QL7A 2HSMB 1F2EA 3WT2A 1G0TA 1XCCA 1TXXA 4K6XA 3TGZA 4HEA2 1F9MA 1R5PA 1S3CA 3IAM2 5F05A 3R2QA 3N5OA 2HSHA 1I9DA 2NPBA 4NWYA 3ME8A 3IC4A 4YQVA 4PURA 1BQ7A 5DQYA 4MZBA 6GSSA 4TR4A 2CVDA 2H1BA 2MMZA 3VWVA 5F06A 4JE1A 2NDOA 1A2LA 3WT1A 2HQTA 3TRQA 4XRDA 3DVWA 3IRAA 3CSHA 2N5AA 3L9VA 1O85A 4GSTA 3LJRA 3NZNA 4LA1A 5DALA 3HYPA 2TRCP 4N0VA 1UN2A 2R6KA 4XS1A 2J9HA 1ZCPA 3UIWA 3UMAA 3KD0A 4JZQA 5IMZA 3KXOA 3ERWA 3CMIA 5HQPA 3O6TA 1C72A 2H1GA 4PNGA 1OC9B 3RPPA 4EKZA 3P90A 4N11A 4CW9A 2VLUA 2P5QA 2QSIA 3GIXA 4DSQA 4BA7A 3WGEA 1ERUA 2ZUPA 4XHMA 1ERWA 5KN2A 1XZOA 2YCDA 1XW9A 2CA8A 3IA1A 2DLXA 3R3EA 3TKRA 4I2UA 3A2VA 1QK8A 2TIRA 2R4VA 3G7JA 3M9JA 1AXDA 1K3LA 5ID2A 5CO3A 3A3TA 3D6IA 3IC8A 3EMXA 1VRSD 4G19A 4K0NA 3P2AA 1EOGA 1B4PA 1V98A 4PQHA 2K8VA 5IPGA 1QGVA 4TR1B 2VL2A 2CV4A 2IIYA 2ZCTA 3I43A 3ME7A 1VF1A 3KCMA 5IMDA 1AC1A 3VI7A 1OC8A 4KX4A 1CQGA 3HD5A 3EE2A 1F37A 2WB9A 1BYEA 2PPTA 1VF3A 2PU9C 2NTOA 1FB6A 1O7UA 4O5RA 4MABA 2EC4A 5B7CA 2F8AA 1O6JA 1TK8B 2REMA 3VI5A 3UEMA 3IK9A 1BJXA 1O8WA 2V6OA 4BVYA 2CT6A 2OKAA 1PKWA 4WBJA 2VD0A 1SYRA 3EURA 1SD8A 3F3RA 2GDRA 1FVKA 4RQXA 2KOKA 4GCIA 3TDGA 5LCZA 2H1AA 1U87A 1XW6A 1OC3A 3DKSA 1FW1A 4FYBA 4Z7XA 3SBCA 1SJZA 3GYKA 3FK8A 3APOA 4O32A 2WFCA 4XS6A 2L5LA 2QGVA 3M1GA 3CTGA 2MMOA 2I4AA 4MLYA 1RW1A 2YZHA 4AJ8A 3ZTLA 1JZOA 5CYYA 4L0UA 1R4WA 3N9JA 1Z6NA 2C0GA 2EIQA 2HRKB 1TRUA 3TKQA 3IAS2 4G0KA 2FCHA 4K9ZA 1SK1A 3KZQA 5G2ZA 3EVIA 1XBSA 1FB0A 4OFMA 3PPUA 3C1RA 3GHAA 3C7MA 4J2FA 1GNWA 5DJLA 5IO0A 1GRXA 1MD4A 4RI7A 4ECIA 4J56E 1GL8A 5G5EA 2LRNA 2MBSA 1X0RA 1Z6MA 4NMUA 3F63A 4CHSA 2A2RA 3GH6A 2AYTA 1O8XA 5FT3A 3ZFBA 5D9VA 4O7HA 3GSSA 1A0RP 2VCWA 4I6XA 2IN3A 1M2AA 4OFNA 1GSUA 2FHEA 2C1YA 4G0IA 1CQHA 3ZVJA 3FKFA 1X9WB 3GN3A 3GX0A 2WDUA 2LJRA 3BCIA 3D5JA 3IXRA 2M72A 4TN8A 1XWGA 1K3OA 1YQ1A 1VGLA 5DVBA 5HFGA 2YPMA 3TOUA 1S3AA 3G7IA 4PQ1A 1BG5A 2GT5A 1OVNA 2IMIA 2CAIA 1GTBA 2FD3A 2H72A 1PQNA 3SWLA 5ABRA 2VL2C 3AY8A 2IFQB 1DE1A 2GT6A 5D93A 2VCVA 3PGTA 3Q74A 3F6DA 4E8HA 4MMMA 2VL9A 4FYUA 4MJCA 3VWXA 4RI6A 2KLXA 1K0BA 4IVFA 3F6FA 1QMVA 1H75A 4BL7A 5BMUA 3LYKA 4L8EA 1GP1A 4KNDA 2XBQA 2EIRA 3O3TA 5J9CA 3GA4A 3DIEA 1HQOA 2AB6A 1KNGA 4ZL8A 3VURA 1HYUA 5L71A 1K0CA 2QKEA 3QAWA 4K8MA 2X99A 3Q6OA 12GSA 3MSZA 1OE7A 4BWSA 3IOSA 1SL0B 3ZIVA 5CNWA 1SJIA 4HU9A 2DSAA 1MD3A 3LWAA 4HJ2A 1F3BA 4OFTA 4KAEA 2FA8A 1NSWA 4TXOA 1OKTA 2YZUA 3LGCA 1YZXA 4OD7A 3WGDA 2L57A 1U3IA 2CQ9A 1GTIA 1ZYEA 1FVJA 5IPHA 2YP6A 1LBKA 4TR0A 5IQYA 1Q4JA 5IOXA 3HVSA 2HZEA 3FR9A 4E8EA 2HRNA 1EZKA 1XWKA 2JADA 3CTFA 4GWRA 2YWMA 5EY6A 2X8GA 5F0GA 4G2EA 5EL8A 3F8UA 4KE3A 3DRNA 5G31A 4MZCA 1JFUA 3BJ5A 4HQZA 20GSA 2FWHA 3D4MA 6GSXA 4QL9A 5J9BA 4NHZA 2LJAA 3VFIA 4QQ7A 1B8XA 4NV2A 1AW9A 2WCIA 4ZL9A 1Z9HA 3D22A 2R37A 4EL1A 2CVKA 3FYGA 4MA9A 4WKWA 3EC3A 3D21A 2YJ7A 4WBRD 5IMCA 3M3MA 1DBYA 3UBLA 4BWQA 1THXA 4K2DA 2LRTA 1X5EA 2H1DA 2H30A 1Z7RA 4IBPA 5HFIA 3DYRA 4WF4A 3Q18A 4EC0A 3M8NA 3ZLPA 1M9BA 1GSDA 4ZBAA 5ECIB 4FO5A 5DCHA 1GUKA 4XS4B 5F8BA 1T3BA 3TUEA 2DMMA 2JSZA 1GSFA 3LG6A 3U5RE 1MDJA 2K18A 4PUFC 4POMA 3C73A 2F3MA 4NAXA 4MPFA 4TW5A 3HJMA 3P8WA 1QQ2A 4FQUA 2L5OA 1YF1A 3L0HA 3PH9A 4G0LA 3UOMA 4X0XA 3RBTA 4WXTA 3US3A 2PN8A 3TB2A 4RQRA 3ED3A 1A2MA 1BX9A 3H4KA 4EDYA 2G2QA 4IELA 1B48A 3CXGA 1TDIA 1X5CA 4ECJA 4XRAA 3M0FA 3LQ7A 2WRTA 3WYWA 1AUCA 4KUNA 1NM3A 4I97A 2CZ2A 4AF2A 1M9AA 4DVCA 3KMOA 1TW9A 4LMWA 3TRPA 5HR3A 1PD21 5IO2A 2CVBA 5AIVA 2OACA 5GSSA 1N8JA 3RPNA 3H8QA 2RM6A 2MBTA 2ES7A 1TJDA 2V2GA 1HD2A 1JZDA 4PXOA 5JCWA 4MJEA 5J5NA 4KDYA 1X5DA 1SK2A 3DVXA 2F51A 3QR6A 8GSSA 2LQQA 4RUVA 4HJMA 3LSZA 1NHOA 13GSA 3ZMLA 2JZSA 1FAAA 3CSIA 3C1SA 3GMFA 2R5GA 3W6GA 5KN0A 4J57E 3F4SA 3GTUA 4EUYA 1SL1B 2PUKC 4JR4A 4HOJA 1Y25A 4IN0A 4HDEA 3KJYA 2ALBA 4ACSA 6GSYA 1XFLA 4KDXA 3F3QA 4FYCA 5JWRB 1TP9A 1KTEA 4DSSA 17GSA 5EPFA 5F07A 2L4CA 3FZ5A 1M0UA 2X64A 2RLIA 3UARA 4V2NA 5JWOB 4IQ1A 1GSQA 2BTOT 2O8VB 4ZB8A 3RDWA 3CRUA 2HSMA 4HS1A 4MJAA 2WULA 3DEXA 2DJ2A 3QDNA 3FEUA 1T7PB 3TOTA 3H79A 4MF6A 3QFBC 1J08A 3HY2A 4MK3A 2IMKA 2K6VA 4JU5A 1IYIA 3KTBA 2YJHA 5E4WA 3HA9A 1QFNA 1O73A 4EO3A 4MP4A 3J7Yb 4K7IA 3GKKA 1GULA 2JSYA 2V32A 5G1LA 1TK5B 2YWNA 2YWIA 1ZL9A 1KEBA 5AISA 3LYPA 5CP1A 2M80A 2GQMA 5DAKA 2GSQA 2L59A 4PX1A 2TRXA 3DD3A 1Z7PA 2H0IA 3UBKA 4YQUA 5CRWA 5IMFA 1A24A 3LEFA 2H74A 5FWGA 1K0AA 4G10A 4Q5QA 1DSBA 1UC7A 5DCGA 5HR1A 5GSTA 3H93A 4ZL7A 3FZAA 1R26A 1A8YA 5AIXA 1PRXA 3E0UA 2MMAA 1VF4A 1GSEA 1HNBA 3TCOA 1OC9A 2ON5A 4LLRA 4Q5FA 4GRFA 3MWHA 2AAWA 1OAZA 1ZGNA 2KUCA 2LRCA 3ZREA 4WF5A 5D96A 1R5AA 1U88A 4IQAA 4ECCA 2JU5A 18GSA 4OO4A 1G6YA 2J23A 1WWJA 3GKMA 1EWXA 2VCXA 1WRYA 3LORA 3IDVA 3UVHA 2HSYA 4TXOB 2LV3A 5E59A 3QOUA 2GSSA 2OBIA 2OE3A 1GH2A 1ZYQB 3VK9A 2LJKA 3TJFA 5ECRB 4Q5RA 2OE0A 1F3AA 1B9XC 2VLTA 3IK7A 1ABAA 2FWGA 3APSA 3ERFA 4HU7A 2E2MA 4KA0A 2OADA 1AAZA 1TRVA 3ZMKA 2HZEB 5ECLB 3KM6A 4TR1A 4XCSA 2VUPA 2RM5A 2I9HA 4K0GA 5KN1A 3TKSE 2XHFA 2WGRA 2WJUA 1U6TA 2HNLA 4GSNA 4G9HA 5C04A 3A2WA 1BAYA 4HI7A 2IL3A 5J4UA 2MYGA 2C4JA 1K0DA 2VM1A 4LMVA 4ZBBA 3IE3A 2G0FA 3S9FA 3GURA 2FWFA 3ERGA 1XVWA 2NVLA 1XWCA 1Q98A 5A4VA 4L5OA 3HDCA 4PGTA 5HR2A 4YAPA 2JACA 1MDKA 3VLNA 1G7OA 3EU4A 5J3RA 3KP8A 1TTZA 3BBYA 1E2YA 1QUWA 2K9FA 1XOAA 3V1WA 4D73B 3HVVA 5D9WA 2IPAA 3W8JA 2PERA 4IGJA 3WGXA 2P0GA 4BVXA 1GWCA 1K0NA 2XPEA 2H75A 2P5RA 2AV4A 5IMVA 5ECNB 7GSSA 2XPDA 4ML6A 4L5LA 3EWLA 3KEBA 3VPQA 4EE0A 2PVOC 4TKYA 1WOUA 2GZPA 3HZ4A 5G30A 6GSVA 2HRKA 5G5FA 2RUFA 1XPVA 1XWBA 1G7EA 4WEYA 5ECMB 1RK4A 2BJXA 1SL2B 1EEMA 3KH7A 3HXSA 5H5SA 1ZOFA 4IJIA 1MTCA 2V1MA 3OR5A 6GSUA 4L0WA 1EOHA 3A5WA 2GSRA 4F0BA 1FHEA 1QXHA 5DALB 2A4VA 3QFAC 3PR8A 4JRRA 1MEKA 1XWAA 1ZMAA 4IKHA 4OMVA 1A23A 4NHWA 1EV4A 1M2BA 4ISDA 2B1KA 2R3XA 2AHEA 1TI3A 4ZXGA 2H73A 1PL1A 4LL4B 3F0IA 4PUAA 1OKDA 1T4YA 1A2JA 3CSJA 3ZYWA 1Y6EA 2C80A 3JCML 4ID0A 1USBA 4V1Ag 4OCEA 3GKXA 4IS0A 1YF0A 11GSA 4KW6A 2GTUA 1TK0B 5JCGA 4NPBA 2AUVA 1YJ6A 2HE3A 5JCUA 2C3TA 2B7KA 1M2DA 2YANA 4TOPA 2MMNA 2IFQA 5H5RA 1HNCA 4PQIA 2XC2A 4YAVA 3QMXA 3FR3A 4GQCA 4ECBA 2FGXA 1SENA 4KCAA 3VWUA 2LS5A 4IP1A 5ID2B 2H6YA 5AN1A 1GSSA 1W4VA 1WIKA 3IV4A 3MDKA 1WMJA 2VOCA 2H8LA 2VM2A 2HT9A 4DSSB 3UJ1A 1N2AA 2UZ8A 2E0QA 4NXIA 1J0FA 4EVMA 3QAVA 1YEXA 4DSRA 1PKZA 3U6VA 4JBBA 3GSTA 2B5XA 1V2AA 5DJMA 5GAPD 5CREA 2VCZA 5LNKe 4TVEA 4GTUA 3EYTA 1XOBA 1EV9A 1V57A 5EVOA 2HRAA 5HR0A 3NIVA 5DBQA 5FHIA 2QC7A 3CYNA 1LU4A 2VLVA 1TOFA 3GNJA 4XIHA 4GSSA 3TKSA 1JLWA 2M46A 2HRFA 3F9UA 3RAZA 1PA3A 3FRCA 4BVYB 3UL3A 2RUEA 5DDLA 5B8AA 1TI1A 4JEDA 4KH7A 2LUSA 5IM9A 1SD9A 2IMDA 4TRXA 5DAKB 1WE0A 4I8BA 3UVTA 22GSA 1K0OA 1RQMA 3UAPA 2LNTA 2RIIA 2VIMA 3I9V2 2X8HA 5D9XA 3LFLA 5H5QA 3L9SA 2I1UA 2KP2A 3F4RA 4YH2A 3QD9A 2VAFA 2L4QA 4MH2A 1EP8A 5GZZB 2YNXA 2GQLA 4N10A 3KIJA 4IP6A 3HJOA 4KCEA 2YWOA 1GNEA 3EU3A 4DEJA 1SKSB 1GUMA 2H71A 5ECPB 2GZZA 2B6MA 3D4TA 2CX3A 5COHA 1WP0A 4X43A 5AGYA 1JZRA 1V40A 6GSWA 4K7OA 4MDCA 1U3AA 1F6MC 1WPIA 4HZ2A 4ZBDA 2MZCA 3DXBA 14GSA 3M9KA 3O76A 4ILFA 1IYHA 2DC5A 3ZL5A 5CRGA 2YN1A 1TRWA 5ELAA 3GUSA 2GZYA 1JLVA 2I3YA 3KGKA 4WETA 4IHUA 19GSA 3EMPA 2KP1A 2C8UA 1T00A 1UVZA 2IMFA 2PVQA 3ZITA 3KH9A 5ECQB 2YV9A 2B5EA 1X9SB 2P31A 1BEDA 2D2ZA 4EF0A 1S3DA 1KBNA 1PN9A 1JHBA 4ZILA 4F0CA 10GSA 2H0HA 4XS4A 3ZZXA 4I2TA 2LQOA 5G1KA 1TRSA 4POKA 1ERTA 2HLSA 4POBA 1EGOA 1K0MA 3IPZA 4GF0A 3TJKA 1AIUA 4MPGA 3VWWA 1SYXA 3FZ9A 4Q5NA 2B5YA 2PMTA 5A5KA 5ELGA 5J41A 4MH3A 3IHQA 4K1FA 3W8SA 3L78A 3G9BA 2LSTA 3IBHA 4TXVA 2VCQA 4WR4A 1GLPA 3D0ZA 2O89A 5A4WA 2V6KA 1A0FA 3C71A 1B9YC 4FH8A 3TJJA 3GL5A 2OBKA 4H86A 2FA4A 4HZ4A 1SKRB 2OA7A 4V2MA 3Q19A 5IMAA 1SK0A 2HSNB 2B7JA 2H19A 2DJKA 2JZRA 4BL7B 3TKSC 4F9ZA 3ZRDA 2FLSA 4BPYA 1G6WA 1PGTA 2DJ3A 1PSQA 5IIZA 2ZNMA 5B6NA 4PNFA 5KEJA 1ACVA 4WR5A 1GSYA 2H6XA 3HCZA 1Z3EA 1AQVA 5D9TA 5DQSA 3APQA 3RHCA 3QAGA 5CAXA 3GRXA 3DMLA 4O92A 1ILOA 5IOWA 2F8FA 4CDOA 4ULXA 4F03A 4BVXB 1ZZYA 2H66A 1DUGA 3TJGA 1T4ZA 1PL2A 5HFKA 2HI7A 3P7XA 1OYJA 1YEPA 1FO5A 2PGTA 5ECKB 4GLTA 4MZWA 1JZWA 3HJPA 1PX6A 1GUHA 2N5BA 1THOA 3L4NA 2IJYA 4AGSA 3QCPA 1ML6A 3E9JB 1XW5A 1ERVA 2AJQB 2YV7A 1FOVA 1GTAA 5ENUA 1AQXA 1ST9A 3TRXA 2CAQA 3J7Yk 4PTSA 2F9SA 3G7YA 3TJBA 1ON4A 3FW2A 1TU8A 4IW9A 2GSTA 1MDIA 1OE8A 2NBSA 5CRDA 4ML1A 2CX4A 4ZB6A 2Z9SA 1B4QA 1YKAA 5GAND 2ON7A 4KDUA 2GQKA 2X8CA 3MAKA 1M7TA 3FY7A 5D8IA 1GTUA 1W89A 1EP7A 3KTLA 1EGRA 3C8EA 2R2JA 3GV1A 2L6DA 2B1LA 4XTSA 2C3QA 2JZTA 4X1UA 1YKCA 2VO4A 5ECOB 4EXJA 4MF7A 3HHVA 3GX8A 1URMA 3TKPA 3K8NA 3DWVA 3A2XA 1V9WA 4F82A 5LD0A 2A2SA 4POLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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