4OFTA

C- orthorombic nagst1
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
206
structure length
206
Chain Sequence
MVHYKLTYFAIRGAGECARQIFALADQEFEDVRLDKEQFAKVKPDLPFGQVPVLEVDGKQLAQSLAICRYLARQFGFAGKSTFDEAVVDSLADQYSDYRVEIKSFFYTVIGMREGDVEQLKKEVLLPARDKFFGFITKFLKKSPSGFLVGDSLTWVDLLVSEHNATMLTFVPEFLEGYPEVKEHMEKIRAIPKLKKWIETRPETLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Glutathione S-transferase-1
publication title Structure of glutathione S-transferase 1 from the major human hookworm parasite Necator americanus (Na-GST-1) in complex with glutathione.
pubmed doi rcsb
source organism Necator americanus
total genus 71
structure length 206
sequence length 206
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4oftA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4oftA01
4USSA 4K1FA 2HRFA 3LXZA 1Y25A 3UOMA 3DXBA 3FZ5A 18GSA 2CX3A 4FIWA 1WJKA 4NHWA 3ZL5A 3UARA 2VL2C 4MZCA 1TXXA 3HY2A 1SKWB 1EEMA 1G7EA 3IR4A 2X64A 1TKDB 3HCZA 3TRXA 4MJAA 2OBKA 2PMTA 2L57A 2H71A 5DALA 2PPTA 1FVKA 1V57A 2LV3A 3H93A 3O3TA 1JFUA 4WBJA 4Q5QA 2PUKC 5LCZA 1YEPA 2B6MA 5HR0A 1ST9A 4ID0A 4KW6A 2R6KA 1OE7A 1EGOA 5IIZA 1NHYA 2M46A 3CTGA 4POKA 5D96A 1MTCA 4ECJA 2UZ8A 3KTLA 3M1GA 3US3A 2LRTA 3BCIA 3QR6A 1QMVA 3FW2A 1KBNA 3GRXA 4IVFA 3TUEA 1A8LA 1T4YA 4N0VA 5ECQB 4JU5A 1G0TA 1X5EA 5LD0A 1B4PA 3RPPA 3GH6A 3M3MA 3L9SA 3FR3A 1ERTA 1F37A 2YN1A 1F3BA 2QC7A 4FYBA 3W8JA 2FA4A 3F6FA 4GLTA 2HFDA 1ERVA 2EIRA 4XRAA 2PWJA 1SYRA 1J08A 2DBCA 5HR2A 3VK9A 1R26A 2DJ3A 2GQMA 4MH2A 2WGRA 1RQMA 4DEJA 2FGXA 2IIYA 4ML6A 4NPBA 2C80A 4K0NA 2C1YA 1TK8B 2LJAA 2G0FA 4MPFA 4EKZA 2H01A 4O7HA 1YKAA 5CP1A 3GHAA 1Z9HA 1FO5A 4OD7A 2E2GA 13GSA 2Z9SA 2WULA 4AJ6A 4OO4A 4Q5RA 4ZL7A 2C4JA 2VCQA 2MYGA 4EF0A 2R2JA 5B8AA 3MAKA 1TK0B 3APQA 2YJ7A 4L5OA 1K0CA 1GWCA 3IE3A 3OR5A 3D6IA 4DVCA 1DUGA 4MA9A 1MDKA 1GTIA 3VFIA 1V40A 1LBKA 4PNFA 3IAM2 4K6XA 1PL2A 2FD3A 3P90A 2JZTA 2VD1A 1T00A 4FYUA 1A0RP 3EURA 1JZWA 1M9AA 3TKQA 5F07A 1AAZA 4N11A 3HHVA 1EV4A 5CRHA 2LRCA 2VUPA 4NV5A 4XIHA 1WRYA 4OFMA 5IMFA 4HJMA 2JSZA 4LL4B 5EL8A 3KCMA 2VIMA 4FH8A 2CVDA 1K3YA 2YJHA 2O85A 3KGKA 12GSA 1XWCA 3I6AA 3APSA 4AF2A 5IPGA 2HRKA 4IBPA 3FZ9A 1GRXA 3ZMKA 1EP7A 1EP8A 2N5BA 2A4VA 2E0QA 5ELGA 2CVKA 4MF6A 3HDCA 14GSA 1OKDA 1XVWA 5DBQA 5KN3A 4X43A 5G5FA 2OBIA 3M8NA 3TCOA 3GV1A 1MD3A 2C8UA 3FHKA 3CRUA 4V2MA 1XWGA 2L4CA 1Y6EA 2EIOA 4O5RA 2B1KA 3A3TA 2MMNA 4PXOA 3EC3A 3HYPA 1QK8A 5L71A 1YZXA 2DMLA 3EU4A 2LNSA 1ZMAA 3J7Yk 1XWBA 4DSRA 1U3AA 4BVXA 4MJCA 1S3CA 3RHCA 1IYIA 3MDKA 2H70A 5H5QA 3A2VA 4LMWA 1K0AA 2OE0A 3RHBA 1ZOFA 4ECIA 5J3RA 2LKUA 2LRNA 2L5LA 2OE3A 2HI7A 4YQVA 1AQVA 4K7OA 3SWLA 2VCXA 1GTAA 2RUEA 1S3AA 3BCKA 2CQ9A 2WRTA 1XW9A 1AC1A 1WPIA 4WR5A 2AB6A 2LQOA 3ZRDA 4XS4B 4HZ2A 4ZB6A 2K8VA 4OMVA 4KCEA 3ZMLA 5EY6A 4TR1A 2X8GA 1JZOA 4MF7A 2OJLA 1DBYA 1UA5A 1JZDA 3F4RA 2YZUA 3MWHA 1GUHA 3DIEA 4V2LA 5IM9A 1WWJA 2K6VA 2DJ0A 1A24A 1YDKA 3ZREA 4G2EA 2XBQA 3QAWA 1A2LA 2DMMA 2OKAA 2C0GA 2L5OA 4HEA2 4GWRA 5AN1A 3TJFA 4IQ1A 4HJ2A 1DE1A 3A2XA 2IJYA 3C7MA 1FHEA 1PX6A 1DE2A 1Z7PA 5GSTA 2OA7A 2XPDA 2HZEA 3EMXA 1ILOA 1TRSA 3IK7A 2R37A 3LWAA 4HU9A 3MSZA 1PA3A 3VPTA 5IOXA 3I69A 4ULXA 4KUNA 5B6NA 2WS2A 1MD4A 3ZIVA 4L0UA 2X8CA 5HFIA 2OE1A 1QQ2A 2H73A 1SU9A 2FHEA 1CQGA 3RBTA 3UVHA 2VL9A 2NDOA 4XS1A 5CREA 1X5DA 4LMVA 3HZ8A 3FZAA 4MJBA 4K2DA 2QSIA 5DJLA 3R3EA 4XRDA 4PQIA 1H75A 3BD2A 1MDJA 2H75A 2R5GA 1FVJA 2O7KA 3ZVJA 4I5QA 1R7HA 6GSSA 2GS3A 2WJUA 3R2QA 5GAND 1PMTA 2B7KA 3UL3A 3EE2A 2VAFA 3QAVA 1EOHA 1OKTA 2JU5A 5ECSA 2A2SA 2BTOT 2AJQB 3IA1A 2P0GA 5F8BA 3ZVJD 3LQ7A 2I4AA 5DALB 3WT2A 3WGEA 3DVWA 4PQ1A 4G0LA 2A2RA 2VCVA 1AUCA 4K8MA 4QL7A 4LLRA 2ALBA 2VD0A 1SL2B 3F3RA 3HJMA 2I81A 4GSTA 1V9WA 4OFTA 3RAZA 4G19A 1ACVA 4TXVA 1XOBA 4YAPA 1X9SB 5D9VA 4MK3A 2YV7A 4F0CA 2NPBA 1YKCA 4GF0A 3KJYA 3UVTA 5F06A 4WXTA 4ZB8A 4GQFA 2YWIA 4KAEA 3DKSA 4NHZA 3HVVA 2H6YA 3GX8A 1XZOA 3ZITA 3ZIJA 3TKSC 2J9HA 6GSWA 3H4KA 2KP1A 4F2IA 4NMUA 1URMA 2VM1A 3DMLA 2J23A 4LA1A 4KDYA 2ZCTA 2K9FA 1FOVA 2C0DA 1HNCA 3HVSA 4EXJA 3LYKA 5DJMA 4ZBAA 2B7JA 3G7JA 3GMFA 4IELA 5COHA 3V1WA 4K7NA 4P3YB 1LJRA 2ZNMA 2BMXA 3UMAA 1GSUA 4HOJA 3CSHA 4POLA 4J56E 4I6XA 1M2DA 3LJRA 2GSRA 3FYGA 1W4VA 2MMZA 1XOAA 4GSSA 3FK8A 3O76A 3VI7A 4K7IA 3Q6OA 3H79A 3KXOA 5G5EA 4F82A 1C72A 3EU3A 4Q5NA 4YQUA 3FRCA 2CAIA 2KUCA 1KEBA 4WR4A 3GN3A 3VWXA 5GSSA 3ED3A 4BWSA 5DCGA 1NM3A 1VF4A 5CAXA 4ACSA 2GSTA 5DQSA 1TI3A 4ZBDA 3IC4A 5JWQB 4J57E 3FEUA 5J4UA 1EWXA 2EC4A 2NVLA 2HQTA 5A4WA 5H5SA 3QMXA 3GIXA 2VCTA 1R5PA 3HVXA 1X9WB 4AGSA 4KA0A 1JHBA 2H74A 2GGTA 4H86A 4MLYA 5CNWA 3L78A 1R4WA 5DAKA 1E6BA 2ON5A 3GTUA 1PD21 2IMDA 1BQ7A 4Q5FA 1F9MA 3IAS2 4K9ZA 4L8EA 3ERWA 5D9WA 3N9JA 3F0IA 1U3IA 1Z6NA 2MBSA 1B4QA 1TU8A 2PVOC 1T4ZA 1NW2A 1GL8A 1G6WA 5J41A 2DJKA 5IO2A 3GSSA 5HR1A 4V2NA 2IFQA 3QFBC 1EOGA 3LORA 1GNWA 2DIZA 2LEGA 4N30A 5CRGA 2HRKB 2EIQA 3GKMA 3IRAA 4MZBA 2HSNB 4WKWA 4KDUA 1TRUA 1RK4A 3M9JA 3GKKA 2PERA 4MP4A 3L0HA 3PGTA 2PU9C 2DLXA 1GNEA 5ABRA 1SK0A 4JE1A 2GSSA 4TN8A 2PN8A 4Z7XA 3HZ4A 5ECRB 1XBSA 2IL3A 1VRSD 1K0BA 4KCAA 2X99A 1G6YA 17GSA 1O8XA 2VLUA 2AAWA 1XFLA 5BMUA 2RIIA 3F4TA 3LSZA 5KN2A 1SKSB 5J5NA 9GSSA 3KP9A 4HI7A 5J9CA 4BVXB 1XWAA 2KLXA 4ZXGA 1M9BA 4MH3A 5ECHB 2YP6A 2V41A 3TJKA 4PQHA 1XIYA 2DJJA 4DSQA 2VLVA 1XWKA 4KGIA 4GQCA 20GSA 2TRXA 1TJDA 2WZ9A 5GZZB 1M7TA 5IMCA 2HNLA 3DEXA 4IS0A 3CRTA 2AYTA 2H6XA 2F3MA 2IMEA 4TR4A 3CSIA 3TGZA 1TDIA 3C71A 3TJBA 3VWVA 5A5KA 1WE0A 1BJXA 1O7UA 1BAYA 3EMPA 1FAAA 1AQWA 2PVQA 5AISA 4ZL9A 3W6GA 3WT1A 1S3DA 2IN3A 3L4NA 1ZGNA 4TR1B 4IQAA 3EVIA 5A4VA 1MEKA 2DSAA 2JACA 3D4TA 5KN1A 1O8WA 2CAQA 2HRAA 3HKRA 1O85A 4HU7A 1WMJA 2H0HA 4ZL8A 1Q98A 4EC0A 1K3LA 1HQOA 5HFKA 4BVYA 1Z3EA 5INYA 1T7PB 1I9DA 3F3QA 3PH9A 2WB9A 5HQPA 5ECLB 4KH7A 1XW5A 3UAPA 4ZIJA 3QCPA 4YH2A 2VL2A 2QGVA 3S9FA 3DRNA 4RQXA 1GSEA 5FHIA 4WF4A 4ECCA 3BOAA 4KDXA 1ON4A 2M72A 6GSYA 3A5WA 1DSBA 4RQRA 2YWMA 3D22A 5CRDA 2L6DA 4NXIA 2O87A 4EL1A 1UVZA 4IP1A 1IYHA 2HZEB 2DJ2A 1QGVA 4KSOA 1KTEA 1YEXA 3EINA 2L6CA 4ECBA 1F2EA 3MNGA 2YWNA 1GSDA 4ISDA 3Q74A 3KTBA 1SD9A 2H1GA 3PINA 1FB6A 3WD6A 1KNGA 3GL3A 1THXA 1WOUA 5KN0A 2CA8A 3G7IA 3JCML 3IXRA 4QL9A 3ISOA 2FA8A 1ZYQB 1JZRA 6GSVA 5IMDA 1YF0A 1A8YA 5CO3A 4V1Ag 2HSYA 1PRXA 1SJZA 2RM5A 2H0IA 2OADA 5B8BA 1QXHA 3GKNA 2V2GA 3DD3A 1HNBA 1B8XA 1XCCA 3QFAC 3F8UA 1U88A 4MDCA 3K8NA 4F03A 5B7CA 1AIUA 4TOPA 1T3BA 2LQQA 4GRFA 4I8BA 3TKSE 4RUVA 5DDLA 2VM2A 3IOSA 5D9XA 1GP1A 3NOFA 4ZBBA 1Z7RA 1ZZYA 2TRCP 4K0GA 3RPNA 5HR3A 4O92A 2GZZA 1TP9A 3TRPA 4IN0A 2B5EA 6GSXA 4WETA 1QFNA 5G1KA 3KMOA 4X1UA 4CDOA 2I3YA 5ECIB 4L0WA 2LSTA 3H8QA 4YAVA 3N5OA 4JZQA 1A2JA 3LG6A 3BBYA 2MZCA 3C1SA 3HXSA 2XC2A 4OFNA 4KB3A 1YQ1A 2LJKA 4DSSA 4BL7A 3F4SA 5IMZA 3HA9A 3IBHA 1SENA 2V6OA 4ZILA 5IMAA 4HQZA 3DGQA 1B9YC 4V1Ap 3IK9A 4KSMA 3M0FA 3O6TA 5GAPD 1I5GA 2H1AA 5JWRB 3KZQA 3GA4A 2HZFA 2H66A 5AIXA 3D0ZA 1OC3A 4IJ3A 4JBBA 3KEBA 4I2TA 2GT5A 5DCHA 5ECNB 2WFCA 5LNKe 1B48A 1LU4A 1T8EB 5EVOA 1V58A 3TOTA 3UIWA 2VL3A 1HD2A 1XVQA 3CXGA 3UBLA 2GZPA 4G9HA 3LFLA 2HT9A 3ZTLA 2H0GA 5A4UA 2R4VA 2I1UA 4TR0A 2PBJA 5JWOB 2GQKA 4EVMA 3NIVA 4RI7A 1K3OA 3CTFA 4CHSA 1SJ6A 5H5RA 1PSQA 4MF5A 2RM6A 4L5LA 4XHMA 3VURA 4J2FA 3ZYWA 3FY7A 2VCZA 2H19A 4HDEA 2HSMA 3IC8A 1A2MA 2H6ZA 2HYXA 1VF3A 4MZWA 3KIJA 2YZHA 4GXZA 1V2AA 2HSHA 5IQYA 1U6TA 1GSSA 3QD9A 1TK5B 1JLWA 2L59A 2LJRA 2O89A 2YOIA 4GSNA 5D93A 1M99A 2VLTA 1SD8A 1OC9A 1OVNA 5E4WA 1TOFA 1FB0A 3SBCA 19GSA 3ZFBA 2N5FA 2FUG2 4JEDA 5DAKB 3TB2A 1VF2A 3GTUB 1GSYA 2JL4A 1QUWA 1ERUA 1ZYEA 4ZB9A 2GDRA 5HFGA 1SL1B 2HE3A 3DYRA 4IW9A 2WDUA 3FZ4A 2JSYA 3ERGA 3WGXA 4PURA 3D21A 2YPMA 2C0EA 3P2AA 2OACA 4PTSA 4TXOA 2FNOA 1SK2A 3U6VA 1EV9A 4I97A 4TVEA 2GLRA 3UJ1A 3ZLPA 3E0UA 2R3XA 2IFQB 3DWVA 1GTUA 1VGLA 4HS1A 4CW9A 5ID2A 2ZUPA 10GSA 2ON7A 4EDZA 2XHFA 5DQYA 3PPUA 3CMIA 4E8HA 2RLIA 4D73A 3GURA 2HXKA 4JRRA 3HJOA 1TTZA 1ABAA 1PQNA 2H30A 5ECMB 2QKEA 2REMA 1WP0A 3C1RA 4QQ7A 2KP2A 3KH7A 2IWTA 1J0FA 3KMNA 2CX4A 2K8SA 2WCIA 1N2AA 4I2UA 4KX4A 1WIKA 4PX1A 1T1VA 4PNGA 1BYEA 5J9BA 4BA7A 1ERWA 1GTBA 3DVXA 3TKRA 5JCUA 3BJ5A 1F6MC 3CYNA 1BEDA 4OO5A 4MPGA 3PR8A 4FQUA 2TIRA 2D2ZA 2C3TA 3P8WA 2KOKA 3TOUA 1CQHA 2B5YA 1EEJA 3IDVA 4WBRD 5FT3A 1GLPA 4GCIA 3C73A 3LGCA 4HQSA 1THOA 1O73A 2DIYA 1NHOA 3GL5A 4F9ZA 5DVBA 1YY7A 2E7PA 3A2WA 2LS5A 4XCSA 2P5RA 5F0GA 3IPZA 2V32A 5G31A 1Z6MA 2AHEA 2LTKA 2B5XA 2I9HA 3UBKA 3GSTA 3IV4A 4EUYA 3GYKA 1BX9A 3C8EA 4BVYB 3ME8A 2FWEA 5JCGA 4YQMA 16GSA 2HRNA 2FLSA 3P7XA 2N5AA 1RW1A 1TRWA 4N0ZA 3GFKA 2CZ3A 1Q4JA 2YANA 5ECKB 3AY8A 4XTSA 1GSQA 4NWYA 3TJGA 1PKZA 3I9V2 3HJPA 4IHUA 4POBA 5G2ZA 1AQXA 1BG5A 2XPEA 4OWYA 3Q19A 4BPYA 2C3NA 3GH9A 3F63A 1OE8A 2YNXA 2H8LA 1N8JA 3KP8A 2CZ2A 2L4QA 3M9KA 5JCWA 4EO3A 3ZZXA 3J7Yb 2GQLA 8GSSA 2GT6A 2YV9A 2H1BA 1HNAA 2E2MA 3LEFA 1TU7A 2ES7A 5G30A 3VWUA 4NV2A 3W8SA 2JZSA 1J9BA 2G2QA 2YWOA 2HLSA 1PN9A 4MJEA 4IKHA 3WGDA 4LL1B 1Z5YE 3LXTA 2FWGA 3GUSA 2B3SA 2DJ1A 3CBUA 1MDIA 3GNJA 4TRXA 2CT6A 1V98A 1K0OA 1ZL9A 3TKSA 3TDGA 3FKFA 2F9SA 2H1DA 3ERFA 5IMVA 1PL1A 5FWGA 2CV4A 3CSJA 3VI5A 1SJIA 2GVPA 4KE3A 4N10A 5ECOB 1UC7A 4TR3A 3I43A 3L9UA 3Q18A 5IPHA 4HUAA 4FO5A 2H72A 3D4MA 2K18A 5IO0A 2FCHA 4TW5A 4E8EA 2IPAA 2GTUA 3QDNA 4ILFA 1G7OA 4NAXA 1OC8A 1M2AA 4PGTA 2O8VB 1A0FA 5B6MA 4F0BA 1AW9A 3VPQA 2FWHA 2KHPA 1M2BA 2JZRA 4G0KA 2F8FA 1GULA 1K0DA 1NSWA 2V6KA 4PUAA 5AIVA 4TKYA 3E9JB 7GSSA 1X9MB 4MMMA 1FW1A 1GLQA 1SKRB 1TI1A 5IOWA 4RI6A 1XXUA 1F3AA 1U87A 4DSSB 3GKXA 1W89A 1TW9A 4BL7B 4JR4A 1TRVA 2RUFA 1GH2A 1E2YA 4WEYA 4MCUA 3RDWA 5CYYA 1M0UA 1AXDA 2CVBA 4IP6A 4GTUA 3TRQA 3QOUA 3GX0A 4XS6A 2X8HA 1UN2A 1SK1A 22GSA 2MBTA 1R5AA 1K0NA 1ML6A 1SL0B 5G1LA 2AV4A 1PX7A 4O32A 4X0XA 2V1MA 5CRWA 1OYJA 3QPMA 1OAZA 4POMA 11GSA 2DC5A 1H4OA 3KD0A 4KF9A 2IMIA 1EZKA 5C04A 3F9UA 2AUVA 2LNTA 4G10A 2NBSA 5D9TA 3G9BA 3FR6A 5E59A 1USBA 2VCWA 3IHQA 3U5RE 5ELAA 4XS4A 1PGTA 3VLNA 1YF1A 1HYUA 5AGYA 1EGRA 1O6JA 3TKPA 5KEJA 2M80A 2NTOA 2GSQA 2H76A 2F8AA 4AJ7A 2BJXA 1VF1A 2HSMB 3NZNA 1GSFA 2FWFA 2B1LA 3LYPA 5C00A 3UEMA 3EYTA 3QAGA 3F6DA 2VOCA 4FYCA 1GUMA 3VWWA 2LUSA 3G7YA 5ECPB 4OCFA 4AJ8A 2IMKA 1GUKA 3L9VA 2YCDA 4KNDA 1OC9B 1K0MA 4EDYA 2JADA 1SYXA 2P5QA 5D73A 1O81A 2FY6A 3EWLA 5ENUA 5EPFA 1JLVA 1XW6A 4BWQA 4JR6A 4EE0A 3ME7A 2XBIA 4WF5A 4IJIA 2MMOA 3ZFLA 2C0FA 6GSTA 3TJJA 1YJ6A 2F51A 1PKWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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