4ORMA

Crystal structure of plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase bound with inhibitor dsm338 (n-[3,5-difluoro-4-(trifluoromethyl)phenyl]-5-methyl-2-(trifluoromethyl)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine)
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
YNPEFFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVSSPNTPGLRDNQEAGKLKNIILSVKEEIDNLEKNNIMNDEFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
publication title Fluorine Modulates Species Selectivity in the Triazolopyrimidine Class of Plasmodium falciparum Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 149
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2014-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ormA00
4DPPA 2Y61A 1E51A 3T78A 1C9DA 1HL2A 3TA6A 1YPFA 3W7MA 2OJPA 4UFHA 3T44A 3MBFA 3TFCA 3W23A 2YDAA 2Y88A 3R13A 1G6CA 3TMLA 1I2RA 4A22A 3BG3A 4LT9A 1VJIA 3FYOA 1ICSA 4HNUA 4EF8A 3NPXA 4EOUA 3LHTA 4FB7A 2ZZ1A 3V75A 5EKYA 3W76A 3M5XA 1JCLA 2ZZ6A 5K2ZA 4DBEA 1VC4A 4O1CA 3NGJA 3H55A 5D30A 2PE4A 3W1QA 3WJSA 1DL3A 1UJPA 4U28A 3S1XA 1ZAIA 1OF6A 4FIRA 3DGRA 4FIQA 4NXSA 1VS1A 3KX6A 2VFGA 4DF2A 4EIVA 3PB2A 4O28A 2V9DA 3NL2A 1YXCA 1TPEA 4HKPA 5CPOA 3NQAA 2E6DA 3S5YA 2NLIA 3TCEA 1TQJA 1ZAJA 3LCXA 4KFPA 3L2IA 4WXYA 1JCMP 5SWUA 4XBSA 1JUEA 1YTDA 3ZR4A 3M0ZA 4DO6A 4AAJA 5K9DA 2VFEA 1W1ZA 4OHQA 4Z1CA 1LOSA 4RX0A 1QFEA 4DF1A 5FF7A 1W56A 4Z0JA 1N8FA 2F7FA 2PRMA 1I8JA 1QOQA 3AJXA 4IMCA 5F2GA 4TR9A 4NX5A 3PBVA 2QCCA 3HGJA 1GVQA 4ORMA 2BWGA 4HHPA 2TSYA 3MJYA 4RCXA 1XDLA 1XL9A 1Q6QA 1GYLA 4O15A 4K7YA 1SR9A 3P5YA 4O53A 1OVDA 3QMSA 3P8JA 3T7VA 5F1UA 3NQDA 3PBWA 5CSSA 5AHLA 2V82A 3BO9A 1ML1A 2H6RA 4HSOA 4P61A 3TXVA 5G1YA 1EX5A 3CEUA 4MZYA 1A5SA 5IM51 4HSNA 1V7YA 4JTUA 1FWNA 1UASA 5ABTA 1FCBA 4PL2A 1QO5A 1U5JA 4GC4A 4LRSA 1GTEA 1O5KA 1PVNA 4N9EA 1TRIA 1OFQA 2VENA 4AMAA 2YYUA 2QCEA 1K7FA 3I6RA 4MLJA 5TQLA 3I68A 5CSRA 2G96A 1KM3A 1H7NA 4LVDA 3QMTA 4JTHA 4JD4A 1W5OA 3GYEA 4UFJA 1K3UA 1TPWA 1TV7A 1MO0A 3WJWA 2Y6ZA 3P7YA 3PUEA 1W5MA 4XQ6A 3W1XA 4XTDA 2FPYA 5G2WA 4TO8A 5LNRA 5CZSA 3W9ZA 3KRSA 3KAOA 4RZ4A 2JKAA 2YZRA 1L6WA 3U8GA 3PG8A 3WJYA 5L9FA 3FIGA 4FNUA 3L0GA 3CQ0A 2Y62A 3W85A 1TPC1 5D2TA 1KTCA 1SZNA 2A7NA 1LOLA 1TCDA 4WX2A 3TJXA 2DZWA 5LKYA 4O10A 3GXNA 2C16A 3INPA 1LBLA 3STEA 2DZTA 4Z08A 4MPQA 4LWWA 3I7QA 4O4WA 3TV8A 3C2EA 4WD0A 5D04C 1VLWA 5MHBA 3IEBA 5I3JA 2RDUA 1XDMA 3TROA 3CWNA 5BRBA 2A1YA 3QW4B 3EEGA 1JRBA 3W72A 1ADOA 1WXJA 4JTSA 4JXCA 4NT0A 1EWDA 3G0UA 3C2OA 4JTTA 2B4GA 3MO7A 2ISSA 3NR0A 1SO3A 3L0NA 4ZQMA 2QCHA 1TPB1 1YLVA 3U6WA 3N2XA 1QCWA 4GE8A 4UFIA 1GVFA 4MY8A 4UMBA 1X6UA 4QSHA 3L21A 3LHWA 4MKNA 2EHHA 1GVSA 1H7PA 4LS2A 4O19A 1TMHA 5I3HA 3PSWA 1VCVA 1AW5A 3E9AA 2QCFA 1YXYA 5K4XA 5D2YA 4PTNA 4BF9A 3BVJA 2WV8A 4NUWA 3EWWA 2I1OA 1FCVA 3W2NA 5J5DA 1FDYA 3PS7A 3FKRA 3M41A 4LS1A 4MIMA 2H90A 4UIOA 1O5XA 3G3MA 2BTMA 4ORIA 1DOSA 3QPYA 1WAUA 3G22A 4AHOA 4WZHA 1THFD 4G1KA 2FB2A 4ADSA 5LNWA 3CPRA 1G4SA 2NXHA 1LZOA 4UCGA 1SZFA 3FFSA 4LVFA 5U4NA 4UUIA 3UWWA 3JR2A 4QISA 1GVRA 4OV4A 4S2BA 1Q3NA 4LV9A 1QNVA 4QM1A 1KBJA 2B7PA 4UTTC 5LNSA 5DCDA 4FXRA 3TMQA 4IPIA 2YFNA 2YR1A 3W75A 3M1ZA 4MVAA 4PEKA 2NWRA 1X1OA 3G24A 2X1RA 1QOPA 1Q6LA 1W3NA 5KSWA 2WQPA 3W7GA 2ZZ7A 5AYXA 4CCDA 2VEPA 2GQ8A 3OVPA 2NWSA 4I9AA 4DXVA 3L9CA 2BSLA 2RH9A 1LM1A 4CNNA 2HS6A 4NU7A 3MYPA 5AYYA 2WNQA 5AC8A 1G7VA 5U7SA 4PODA 3CC1A 3TSBA 1AL7A 3ABQA 5G4WA 1OHLA 1EEPA 1A5AA 4ALDA 1AW1A 4JY9A 2DZPA 4WJEA 2TRSA 1OX5A 4N6FA 2OMAA 4GUIA 3RLVA 5H2ZA 3C2VA 3TSDA 3LCHA 1BTMA 4S1FA 4CQ8A 3YPIA 3NEVA 1PL9A 1TV5A 3DFTA 3BLFA 1LROA 1RPXA 3V1PA 2B7OA 4L4LA 2E1DA 3N14A 2E5DA 1NVMA 3TC6A 1TSIA 2E6AA 3NQ8A 1OJXA 1TJRA 4I7WA 1HG3A 1F05A 4O0ZA 2W6RA 3FJ6A 3UPBA 3G0SA 3TX9A 4AHQA 3WJZA 2FJKA 3HJZA 1QPNA 1Q6RA 3B0PA 1WOAA 1EUAA 3SJ3A 3ZFHA 4PFMA 2H3BA 3G1FA 2OT1A 5C5YA 4GUGA 2VC6A 1CI1A 3SW6A 2E09A 2NV2A 2FB3A 4GWEA 3SIZA 2QDHA 6ALDA 1LDCA 1ZAHA 1YDVA 1ME9A 6TIMA 3FJLA 1EP1A 5DCBA 3A5FA 4M7SA 5D37A 2CLMA 1PHQA 3KRZA 4YLWA 3E0IA 4ONVA 5LZLA 3GAYA 5AHIA 2JBMA 4IUOA 1WA3A 4K37A 3PUDA 4UTHA 4AB4A 3FYPA 3LRKA 4H6KA 3MI3A 5FEWA 2H3DA 3LM7A 2ZZ4A 3IIVA 3STFA 3UWYA 1K7XA 4K38A 1H7XA 1KFKA 3QM3A 1LBMA 1MSSA 3S1VA 2IQTA 4KFNA 2ZA1A 3W7KA 2YPIA 4MOZA 4O1AA 3W7NA 2QKFA 1SUXA 2WNNA 1YXDA 2H8XA 2E5CA 4NZFA 3NG3A 1FDZA 5D09A 3KVMA 1N7KA 4O57A 1KM0A 1YPIA 4JDBA 3RU6A 3N9SA 3DFNA 1A50A 4FNPA 2OCZA 1B3OA 2OX1A 3PF3A 3MP3A 1ZFJA 3GB6A 8TIMA 4FF7A 4GJ1A 1H7OA 3W7QA 4LS0A 1T0OA 1TV8A 1TTJA 2VFDA 1QDSA 4UTJA 1EP3A 3M6YA 1ME7A 2Z6IA 1N55A 3W7RA 3NQ7A 1IXNA 4OBTA 4BI7A 4TX9A 4UTUA 2NX1A 4Z0SA 4ZQPA 3VNDA 3G1SA 5K4ZA 3W07A 3B8DA 3N3MA 1FBAA 2V5BA 4LV4A 4WOZA 4IX2A 3RF9A 2VKZG 5CPNA 3MUXA 3TQVA 2ZCGA 1OFOA 3MMTA 3OG3A 1XXXA 5K9XA 1P4CA 3DBPA 1I2PA 3HB9A 1AMKA 3DAQA 3LI0A 3W22A 3UYCA 1AK5A 2B7NA 1KM1A 4ZQOA 4UTMA 4DF0A 1VZWA 5DY3A 4DQWA 1H7WA 4A2RA 2ZRZA 4XWUA 1OF8A 5BOOA 1KTBA 5CPLA 3SR7A 1KV5A 1ME8A 2XN2A 4JYDA 2ZTJA 3G1VA 4WY0B 2ISWA 3W3OA 2A7PA 1FXQA 3W7JA 2HS8A 5EBUA 4NX0A 4A29A 5HULA 1AL8A 1DQWA 1TIMA 2YX0A 4ICNA 2HTMA 2ZA3A 5AC7A 1DORA 4LVBA 1JQXA 3OA3A 4FNRA 1FWRA 3SGZA 1MEIA 2EAWA 1Z44A 1LYXA 4XKYA 3PBUA 3R2GA 3S9YA 5FESA 4UNLA 3GDMA 4WOQA 4C1LA 4ADUA 5BNKA 5AOUA 1VGAA 1G4PA 3R5EA 3EXTA 1PE1A 5CZTA 4DELA 1QWGA 1OX4A 5AHFA 1L6SA 5F2LA 3WJXA 1SU5A 1M6JA 1W5NA 3TW7A 2X2GA 2DZXA 4HIBA 3L68A 3IIOA 1WDWA 2DJLA 2J24A 2ZRWA 3B06A 4M6VA 2BLEA 2FPTA 3MW7A 2FLIA 3G0XA 5CG7A 1DJQA 2UV8G 3P62A 1S3HA 4JEQA 5FI8A 1TTPA 4RXGA 2GQAA 2Y7EA 2Y85A 1IXOA 3I65A 1V5XA 3PSVA 4O4VA 3W7PA 1WBJA 1IIGA 3W1MA 3NVTA 1XCFA 4JTEA 3NL5A 1OABA 3LDVA 3M5ZA 3N34A 1KFEA 2EF9A 4Q4KA 1W0MA 2ZRYA 3W87A 1ZNNA 2YCEA 1UUMA 4JTLA 4X2RA 5C55A 4K36A 5KZMA 1GTHA 5D05A 5G2IA 1XUUA 1TTQA 1GYNA 3N19B 4A3UA 5G2HA 3SSJA 3LBCA 4QITA 3NOEA 5G4EA 3RLUA 3GR7A 1G4EA 2JKPA 4N9CA 2X1SA 5D2WA 3EX6A 3IVTA 1T99A 1JCYA 2V30A 1W3IA 2QUUA 4QNWA 4Y8FA 3B03A 1GQNA 4JDYA 2C6QA 3NQMA 1FY6A 4OE7A 5EL1A 1D9EA 4Y96A 1YTKA 2QCDB 1ZHAA 3EX1A 1K8ZA 1JR1A 4N4QA 3HPSA 4WQ6A 4U4MA 2C1HA 3UWQA 3R89A 1H51A 3WFAA 4RZ5A 3A22A 5AHNA 3W1NA 1WYIA 2P10A 1MEWA 5HR6A 3M44A 4UMCA 4LNYA 3E49A 3S1WA 4H4IA 3S6DA 5DCEA 1PCKA 1IXQA 1OYCA 1EB3A 3P82A 3DENA 3W84A 4NVTA 1B4EA 4IWWA 4AEOA 1B4KA 3W83A 4DBDA 1TQXA 1FXPA 4JTGA 1B9BA 2V8ZA 3O6YX 4FHAA 1ZENA 4MZ1A 1FDJA 3JRKA 3TC7A 1PS9A 1SO5A 2R14A 5KTLA 2E6YA 3DXIA 1GPWA 3U2OA 1KTNA 5CZ0A 2A4AA 4UTIA 3SECA 2G97A 1P0KA 4JIPA 5BW6A 3M16A 4M6QA 1XM3A 3IRDA 4RLIA 2CLHA 3NQFA 3KVJA 4NJHA 3TH6A 1TPDA 2PC4A 5D02A 5HINA 3W1TA 3BW3A 5DY2A 4JR5A 3EX4A 3GDKA 3NNTA 3QH2A 3UD6A 4IX0A 3TXZA 2QJIA 1IXPA 4ZQCA 1LLZA 3IV3A 3HG5A 1LCOA 2DU2A 4XUGA 1SZEA 4AF0B 2YGYA 3O6DA 1K7EA 1W8SA 4MFEA 5HUPA 1ICPA 2ZZ2A 3TIMA 4R7JA 4A2SA 3LRLA 1MXSA 4LU0A 4M5PA 3NDOA 2CU0A 1BWKA 2CLEA 4JTFA 5FEZA 5CPMA 1DQXA 3HG4A 3ZWTA 3EXSA 1EUNA 3HBLA 4OV9A 3A5VA 4NXKA 2Z2UA 4BWLC 3CB8A 1SO6A 2A0NA 4OGZA 1NEYA 4NQ1A 4K39A 1Y0EA 4L4MA 3RFAA 4O13A 3LCGA 2GUUA 3S8HA 2X1UA 3TW6A 4HNVA 3LHZA 2B0MA 2ATMA 1VLIA 3QPZA 4RXFA 3O1NA 5AYZA 3NPUA 3HMJG 4IOTA 3QF0A 3UWUA 3HGSA 3NA8A 2Y7FA 3QZEA 4A21A 4HPJA 3OBKA 3NQ2A 2YFOA 2QR6A 4QJ1A 4JX5A 3W70A 1I2NA 4UFLA 1JCJA 4PA8A 3QSTA 3GKFA 4O11A 5AHMA 1Z48A 3BK0A 3KXQA 1IF2A 2FPVA 3W1LA 3STGA 3ZS4A 3SZ8A 3QQ1A 1QPRA 3OHIA 1PV8A 5AN7A 3TQKA 3DZ1A 4FXSA 3DFOA 2O7SA 4R33A 4GFSA 3GDLA 3A21A 3HIJA 4UXDA 2ZYFA 3NZ1A 1JUBA 5D38A 3G1HA 1C8VA 1SQ7A 1RQBA 5DXYA 1P0NA 2XN0A 3G1XA 2VFHA 5FEPA 3LHYA 5EMUA 1NF7A 1FQ0A 4CQAA 1RD5A 1ZJIA 1I2OA 3I7SA 1FWSA 3GDTA 3NL6A 4UTWA 3DKJA 3GDRA 3RMJA 4JX6A 1TREA 4AF0A 3HQ1A 2GVJA 4LVAA 1HUVA 3LHUA 2NX3A 3W1PA 1OFDA 5TIMA 3C4UA 5BMWA 4HT3A 5FF3A 2YW3A 3O8AA 1LOQA 3NQGA 2GQ9A 1WBHA 4M6PA 2ABAA 3ZWSA 2JKEA 2A7RA 1JCNA 4R34A 5KINA 3IGUA 3I7RA 3DHFA 3TR2A 5D03A 1TYGA 3O16A 4AWUA 3S42A 3TKFA 1OX6A 2NZLA 3LGEA 3L5AA 3GXTA 3W7EA 4CCEA 1XI3A 3E96A 4EWND 4E2BA 2OT0A 2VOMA 1VRDA 3K30A 2WSRA 4FX6M 1VCGA 2ALDA 2A6NA 2CZEA 5AB3A 3ELFA 1S5WA 2TYSA 5A5WA 1XC4A 2E5BA 5F4SA 1OFEA 2NUYA 4JY8A 5C54A 1GG0A 2TMDA 1R2SA 4N4PA 1QPOA 3W2UA 2C15A 2DZVA 3GNDA 2QCMA 3A9IA 1KFBA 3G1AA 5I3IA 1YDNA 3C3NA 4O52A 2DJXA 2ZDRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1UKQ A;  1AFS A;  3W7M A;  2O9R A;  3NSN A;  3T44 A;  4KT2 A;  2Y5J A;  4G56 A;  1KFW A;  3EZ4 A;  4GYF A;  1HXJ A;  2UY5 A;  4GAB A;  4E6M A;  1S2A A;  3SB0 A;  4Z42 C;  4HNU A;  4EF8 A;  2OGY A;  3NPX A;  3LHT A;  5HOS A;  2E7F A;  3IAC A;  2BGN E;  5A94 A;  2QJM A;  1JZ7 A;  2QLY A;  5K2Z A;  2XIM A;  3ENL A;  5D30 A;  1Q8J A;  2X0Y A;  1DL3 A;  4B90 A;  1UWT A;  3GYC A;  1ZAI A;  1W1V A;  2XZ9 A;  1XYZ A;  1FWF C;  2QII A;  2VFG A;  4HPG A;  4JQA A;  4M6U A;  4HTB A;  4HHL A;  1CCW B;  4CGT A;  1EBG A;  3AI0 A;  3PZ9 A;  1YXC A;  1TPE A;  4HKP A;  4B3Z A;  3WBW A;  2DQX A;  2E6D A;  5E5C A;  3S5Y A;  1NDW A;  5H1W A;  1ZAJ A;  4KFP A;  3FGC B;  3WLP A;  4FAM A;  2ZUT A;  4WKH A;  3VMP A;  4KIE A;  2F2K A;  4XBS A;  3WLT A;  3M0Z A;  1GHR A;  4DO6 A;  4C6B A;  4AAJ A;  4CCZ A;  4C60 A;  4OHQ A;  4QLJ A;  4Z1C A;  1LOS A;  4RX0 A;  1QFE A;  4DF1 A;  3ITC A;  3R11 A;  2WMH A;  1QNQ A;  2F7F A;  2PRM A;  1QOQ A;  3RU8 X;  4LCQ A;  1UA7 A;  2GK1 B;  2AAA A;  1XKJ A;  4HGX A;  3F2D A;  3PBV A; 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