4PGT | Genus

Total Genus 81

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	81
sequence length	210
structure length	209
Chain Sequence	MPPYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRKYVSLIYTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
molecule keywords	PROTEIN (GLUTATHIONE S-TRANSFERASE)
publication title	Structure and function of residue 104 and water molecules in the xenobiotic substrate-binding site in human glutathione S-transferase P1-1. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	81
structure length	209
sequence length	210
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date	1999-03-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02798	GST_N	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A	PF14497	GST_C_3	Glutathione S-transferase, C-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1050.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	4pgtA02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4pgtA01

3HJPA 5C04A 3TRPA 1AIUA 4HI7A 1WWJA 2FUG2 4AJ7A 1JZOA 1SYXA 1SL1B 2GSQA 1THOA 2IMDA 2E7PA 1A2LA 3IRAA 4MK3A 4IGJA 4KDXA 1A2MA 1SKSB 4HJMA 1EV9A 4IJ3A 2L5LA 2DJ1A 1QXHA 5EY6A 1NM3A 4GTUA 5IO2A 2VAFA 6GSTA 1B9YC 2MMNA 6GSWA 2LNSA 4XRDA 4POKA 2QC7A 2QKEA 1X9MB 1EGRA 5ECMB 5A4UA 3LGCA 2LKUA 4L5LA 1GL8A 4PUFC 3BCKA 3TJFA 2CT6A 4F03A 3PPUA 5AIVA 5HFIA 1QQ2A 2YV9A 1AW9A 3TKSC 4YQMA 4MF5A 1O6JA 1Y25A 1WMJA 3EMPA 2HXKA 3EE2A 4OO5A 1MDJA 4K7OA 2BJXA 11GSA 1Z7RA 1WJKA 3QCPA 4FYBA 4L0UA 5J3RA 1TW9A 3TOTA 2ES7A 5IPGA 2MBTA 1A8YA 3TRXA 1Z9HA 4X43A 3EC3A 1V9WA 1ST9A 5AN1A 1AQXA 1XBSA 5IMCA 1XZOA 2L6CA 1YJ6A 4RQXA 4CDOA 4N0ZA 3RPNA 1TI3A 1TRUA 2L5OA 3DVXA 1K0OA 2VCTA 5G5FA 1MDIA 2H6ZA 2G0FA 3GMFA 2MBSA 2PVQA 2K9FA 3GHAA 1BJXA 4TRXA 1S3CA 4HJ2A 3P2AA 4MJBA 1GULA 3G7YA 4MLYA 3IK7A 3CBUA 1M2AA 4TXOA 3DEXA 3HVVA 1TXXA 2GZZA 4IP6A 1DBYA 3O3TA 3ME7A 2E2MA 1Z3EA 4PX1A 1YZXA 3TB2A 3ZLPA 3F4SA 5LCZA 4KDUA 3WGXA 3GNJA 2GSSA 4E8EA 2V2GA 3ZFLA 4XS4A 3DWVA 3EU3A 3CSJA 2B1LA 2GS3A 1SU9A 2HZFA 4OCFA 2XPEA 5B7CA 1F3AA 4QL7A 9GSSA 2CZ3A 1NHOA 2JACA 1XPVA 3HJMA 1U3IA 4ECIA 4O32A 4TR1A 3ZITA 2O85A 2FY6A 2CVKA 2KLXA 4O92A 2FWFA 1PN9A 10GSA 2CQ9A 4DSQA 1M9BA 4ML6A 4K0GA 1AQWA 2BMXA 5ECIB 3R3EA 1HNCA 4CW9A 3RHBA 2GSTA 1K0NA 1GWCA 4HUAA 4ZBDA 5IOWA 2VL9A 5ECQB 3GL3A 3NIVA 2DMLA 2C1YA 3TKQA 4MJAA 3ED3A 5D93A 2VO4A 2F51A 1V40A 2CZ2A 1MD3A 2YWMA 3GSTA 5AGYA 4IELA 1BYEA 1EGOA 2YZHA 3KD0A 5HFGA 2OE0A 2GQMA 4TR0A 1UC7A 4MMMA 2OBKA 16GSA 3OR5A 3CXGA 3C73A 2PGTA 1G6YA 3M9KA 2LQOA 1YDKA 2DSAA 1U87A 3UJ1A 3GURA 3F4TA 1TDIA 1H4OA 2LQQA 1BAYA 5F8BA 1A2JA 1M99A 3HVXA 4ID0A 4V1Ap 4O7HA 1SK2A 1XWGA 2K8VA 4MPFA 2MMZA 4WETA 4IHUA 2VD1A 3N5OA 1X5CA 1GUKA 1B9XC 3EU4A 3GA4A 2I1UA 1YKCA 4N0VA 2GDRA 3LEFA 3VLNA 5E4WA 2RIIA 2CX4A 3ZVJD 2LS5A 3GYKA 1GTIA 1J08A 1E6BA 4ZILA 1XOAA 2YANA 3VURA 2GSRA 4F0BA 2L4QA 1EWXA 2ON5A 1DE2A 3J7Yb 3KMOA 2HRFA 2A2RA 4TN8A 2HZEB 4YQVA 5DAKA 3U6VA 3CRTA 2AJQB 1X9SB 4NPBA 4XIHA 4ILFA 1RK4A 5COHA 3D0ZA 3QFBC 4TOPA 3F3QA 22GSA 1SJ6A 4DVCA 4BL7A 3EURA 3HXSA 5HR1A 4IBPA 1BX9A 4HQZA 3QPMA 3UBKA 1A0FA 3IAM2 3L9UA 2VCQA 4Q5RA 3D5JA 3HCZA 1GSQA 1BG5A 4PNFA 3HYPA 3IC4A 3LQ7A 8GSSA 4ZXGA 4HOJA 2ZNMA 1ERUA 3ZL5A 4EDYA 3MSZA 2B7KA 5HR0A 3ZFBA 1ERVA 1TU7A 3G7JA 4RI6A 4NAXA 3ZREA 3UMAA 4Q5NA 4IS0A 3QAGA 2H74A 2E0QA 3IC8A 3GTUB 3D6IA 4OFNA 2RLIA 2B6MA 1RW1A 2MMAA 1V98A 2O8VB 3C1RA 5CP1A 3FR6A 1GNWA 2HSMB 2YZUA 3IOSA 5FHIA 3J7Yk 1TP9A 1VRSD 2VIMA 1WRYA 5J9BA 4I8BA 1Z5YE 2IMKA 5D9WA 3HJOA 4OFTA 4MABA 1G0TA 4EC0A 1YQ1A 3GRXA 3NOFA 2HRKB 1YEPA 3VWWA 1XWAA 2PN8A 2VM2A 4KGIA 1GUMA 3IE3A 2FGXA 5CREA 4J2FA 4KNDA 4EL1A 2VM1A 3TOUA 3WGDA 5DALB 4X0XA 4PXOA 1Q4JA 1QFNA 4I6XA 2YN1A 3CYNA 3KTLA 3C71A 1KEBA 1IYHA 4DSSA 1O73A 2V6KA 4J56E 2DIZA 2FWGA 3DKSA 3TJJA 1K0BA 3FR9A 1MEKA 5GSTA 4O5RA 1EOHA 1W4VA 1G7EA 3CMIA 2KOKA 1UA5A 1Q98A 3F0IA 3CSIA 4GCIA 3GKNA 3EYTA 3F8UA 2YWIA 2VL2C 1PX6A 2J23A 1WIKA 4JR4A 2DJ3A 3GUSA 2YWOA 1K0AA 4X1UA 1WPIA 2LSTA 1JLVA 2LTKA 4ZIJA 2A2SA 5A4WA 3DMLA 3KCMA 1QUWA 1TRWA 1PD21 2DJ2A 2LJRA 1JZRA 1B4QA 2IMFA 1U6TA 1PMTA 5DJLA 4XTSA 1KNGA 4BWQA 1GSUA 3IAS2 6GSSA 3VWXA 5GZZB 2JSZA 3E0UA 1SYRA 4MA9A 5IOXA 3TGZA 1F6MC 2H1BA 5CRWA 5CNWA 1K0MA 1R7HA 1DSBA 2GQKA 5B8AA 4AJ6A 5L71A 2EIRA 1TJDA 3CRUA 1V58A 1WP0A 2VCVA 4DSRA 2C4JA 3FYGA 1ZYEA 4MZBA 5AIXA 1ABAA 13GSA 1NW2A 2RM5A 2WZ9A 2L6DA 3L0HA 2PVOC 4KB3A 3UAPA 4NHZA 2PBJA 1YF0A 4G10A 4IKHA 3O76A 2GQLA 4ZB6A 5HR2A 2P31A 1TRSA 4BWSA 3KJYA 1EP8A 3M1GA 2GZPA 2JZSA 2I9HA 2H1AA 3HD5A 4KX4A 3C7MA 5INYA 2OACA 3F63A 4LL4B 3Q19A 4FH8A 3QFAC 2AAWA 2B5EA 1T4ZA 1GRXA 2DLXA 3G7IA 2IJYA 2H0HA 5J9CA 5DCGA 4USSA 1GSDA 4MH3A 2IPAA 3PH9A 2E2GA 2GVPA 2H1DA 4FQUA 2HT9A 5IMZA 1IYIA 4NXIA 2AB6A 2OE1A 2FWEA 4ZB9A 5ID2A 4TR4A 2GTUA 2PMTA 4ULXA 2YJ7A 3LFLA 2WB9A 3W6GA 1BQ7A 3ZTLA 2R5GA 1ACVA 1ML6A 1GTUA 2AV4A 4K9ZA 4MH2A 1XXUA 3H1NA 2M72A 3LYKA 2I4AA 2B5XA 1TK5B 3C1SA 2REMA 4G0LA 3HHVA 2IFQB 1T7PB 3R2QA 4KAEA 4TXVA 2EIOA 4NWYA 4EUYA 3MAKA 4XHMA 2R6KA 4D73B 1A0RP 4HZ2A 4AJ8A 3RDWA 4XRAA 2F9SA 2OA7A 2LRNA 2B5YA 4L0WA 4LL1B 5DBQA 3APQA 3HVSA 3FZ9A 2H30A 5D96A 2KP2A 2GZYA 3A5WA 4N10A 4MF7A 4K7IA 2OKAA 1XW9A 5G1LA 4N30A 3LWAA 2FNOA 2C8UA 3KIJA 1XCCA 4K7NA 1V2AA 4TVEA 3HY2A 2IIYA 1PL2A 3ZRDA 2H0GA 1RQMA 1M7TA 3QAVA 5B6NA 3WT2A 4OMVA 3E9JB 1VGLA 3KMNA 3GKKA 2IMIA 3ERGA 1GTBA 5EPFA 1K3YA 1GSSA 2K8SA 5H5RA 4ACSA 2VOCA 3RBTA 3ZVJA 2CA8A 1SJIA 1GLPA 3GKXA 3ZIVA 2VLUA 3ZYWA 2DJ0A 2RM6A 2YPMA 2FD3A 5B8BA 3F6DA 2LNTA 4TR3A 2VCZA 1T4YA 1GLQA 4PUAA 1XOBA 1R5PA 1SKRB 4FYUA 1TRVA 1FHEA 5GSSA 5IPHA 5IQYA 5LNKe 3KH7A 4ECJA 2DC5A 4GWRA 4ZL7A 2JSYA 5DCHA 1MTCA 2LEGA 2WCIA 3FR3A 3PR8A 4PQIA 2WFCA 2LRCA 4EO3A 3ZMKA 2K18A 4GSSA 1NHYA 3L9VA 4L8EA 1HNBA 1K0CA 2HZEA 3VPQA 2MZCA 4I2TA 2L4CA 3AY8A 2F8AA 4ISDA 5JCWA 3APSA 1GSFA 3I69A 2O7KA 2FA4A 1G7OA 3HZ8A 3IA1A 1TK0B 3I9V2 3F6FA 2X8CA 2HRNA 3MWHA 2X64A 4AF2A 2R4VA 1ZZYA 3W8SA 3WYWA 3GV1A 1M2BA 2JZTA 5EL8A 1T1VA 2K6VA 4HS1A 3KXOA 2HSNB 2P5QA 4ECBA 5JCUA 1N2AA 2C0EA 2NVLA 5IMVA 2YNXA 4WKWA 4PTSA 4QQ7A 7GSSA 3QMXA 2XPDA 2AUVA 1O8XA 3GTUA 5DJMA 2UZ8A 4POLA 3F4RA 2NDOA 3TRQA 3GSSA 1ZMAA 1GUHA 3IK9A 2X99A 2H75A 2HSMA 3Q6OA 5LD0A 4N11A 1FB6A 1FOVA 2VLVA 1PGTA 4OFMA 1EZKA 2Z9SA 3ZMLA 4MJEA 1PSQA 4KCAA 1XIYA 1LU4A 2HRKA 2H71A 1Z6MA 3CSHA 3VK9A 2DJJA 4YQUA 4TW5A 5IM9A 2HFDA 3F3RA 3FHKA 4K6XA 2TRXA 3IDVA 2BTOT 1M2DA 1TTZA 1TKDB 2V1MA 4POMA 4V2NA 2VLTA 3TJGA 1LBKA 1HQOA 5J41A 1R26A 1F37A 5DALA 3M0FA 4XCSA 3GN3A 5J4UA 4GXZA 2FWHA 1S3AA 3KM6A 4DEJA 1R5AA 3FEUA 5G31A 4MF6A 1K3LA 2C80A 1XW5A 2C0FA 4PGTA 2PERA 3D22A 2DJKA 4G0IA 4G9HA 3ZIJA 1XWCA 4G0KA 2PUKC 19GSA 2CVBA 1F3BA 4EVMA 2JL4A 2G2QA 2HE3A 1EEMA 3IPZA 3LJRA 1WOUA 1JZDA 2WULA 2X8GA 4KCEA 3TUEA 1FG4A 3P7XA 2C3NA 5A5KA 3EWLA 3GH9A 5DVBA 2ALBA 4WBJA 3FKFA 1EEJA 4K0NA 3LXZA 1SKWB 2ON7A 3BBYA 5IMDA 3APOA 2QGVA 3KZQA 4IQ1A 1K0DA 1ZCPA 5ELGA 4EDZA 3MDKA 3D4MA 3ME8A 3V1WA 5J5NA 1AQVA 4WF5A 1SENA 5JWOB 1AXDA 3MNGA 1J0FA 1Z7PA 2N5BA 5F05A 4NMUA 1EV4A 3VFIA 3FRCA 4PURA 5G30A 2DMMA 1H75A 5D73A 1XFLA 1R4WA 2YV7A 2OADA 1YKAA 3A2WA 1KTEA 2YOIA 1I9DA 3M8NA 4KF9A 2JADA 3GFKA 1OC9B 4EF0A 5JCGA 5KN2A 4Q5FA 5ENUA 1FO5A 2O87A 3PINA 5GAND 2WGRA 1SL0B 2I81A 4GF0A 1VF1A 2EC4A 1AUCA 4KDYA 2LV3A 1U3AA 3TKPA 1SK0A 3LORA 4JR6A 4CHSA 1OAZA 4V1Ag 1GTAA 5CYYA 4PQHA 5ELAA 3IV4A 3SWLA 3DIEA 3TKRA 4ML1A 5IIZA 1X9WB 3L4NA 3TJKA 5G5EA 1QGVA 1SJZA 4KA0A 4KSOA 2QSIA 5IO0A 3FK8A 2C0DA 5A4VA 4YAVA 4IVFA 5DQSA 5DDLA 3FW2A 2YWNA 4IJIA 4ZBAA 4BA7A 3ERFA 2WJUA 3VPTA 1CQHA 4ECCA 2B1KA 3KP8A 1WE0A 4FYCA 2H66A 4PNGA 1BEDA 2HYXA 5E59A 3LG6A 5BMUA 3E3EA 1FW1A 1GP1A 4XS1A 4JE1A 2M46A 3RHCA 1OYJA 4KE3A 3ISOA 3LXTA 4G2EA 3A3TA 3WD6A 2L57A 4RQRA 2HSYA 2AHEA 4J57E 1ERWA 2IFQA 1OKDA 2IWTA 4WEYA 4YH2A 4V2MA 1URMA 4ZL9A 4NHWA 2KP1A 3TKSA 3WGEA 2KHPA 3U5RE 1F9MA 4HU9A 3DD3A 4WR5A 3Q74A 1UVZA 5D8IA 3UARA 1J9BA 1M9AA 5CAXA 2VL3A 5G2ZA 2H70A 4D73A 4BVYB 3BJ5A 3UIWA 2DBCA 2XBQA 1QMVA 3VWUA 4I97A 5C00A 3A2XA 2KUCA 4BVXB 4JEDA 1ON4A 5KN0A 5ECOB 2TRCP 2V6OA 1DUGA 3C8EA 3M3MA 3QR6A 3GX0A 1JHBA 2I3YA 2AYTA 2XBIA 5B6MA 2VCWA 1O85A 2EIQA 4IN0A 3QD9A 1EOGA 1A23A 3HA9A 4OWYA 4GLTA 5KN3A 1FB0A 1X0RA 2C0GA 2H1GA 2LJKA 2CAIA 2GT5A 2X8HA 1FAAA 1PL1A 1TOFA 3IXRA 2C3QA 4I2UA 2GT6A 3BOAA 2NBSA 1ILOA 1VF2A 5ECHB 6GSVA 3EVIA 1PRXA 4HEA2 4NV5A 5AISA 5ECRB 4WXTA 2N5FA 1GH2A 3SBCA 4AGSA 6GSUA 4GSNA 2LJAA 1OE8A 1UN2A 3D4TA 2RUFA 3I6AA 1PA3A 4GQCA 2PU9C 2HRAA 4RI7A 5CRGA 4Q5QA 3KGKA 1HNAA 1TK8B 2YP6A 3HKRA 2HNLA 5ID2B 5ECSA 1XVWA 1U88A 3UL3A 6GSXA 2MYGA 2M80A 2IL3A 3FZ4A 3KTBA 5F07A 3DXBA 5JWRB 2R3XA 2P5RA 4NV2A 4K1FA 2R2JA 2MMOA 2ZCTA 4PQ1A 1B4PA 2D2ZA 4ZB8A 2YJHA 1A8LA 1GSYA 5ABRA 3VWVA 2YCDA 1T3BA 2CV4A 4LMWA 1Y6EA 2H8LA 1HYUA 4TXOB 1JZWA 4EE0A 3M9JA 4JU5A 1OE7A 2V32A 2H0IA 3ERWA 3DYRA 5FWGA 5H5QA 3DVWA 3FZ5A 2FA8A 1O8WA 1G6WA 2VD0A 4K2DA 4XS4B 4IW9A 1E2YA 1JFUA 1Z6NA 1B8XA 4G19A 3P8WA 1PKWA 5D9TA 1XWBA 2NPBA 5F06A 2GGTA 3IBHA 1XWKA 2A4VA 4TR1B 3A2VA 20GSA 4YAPA 5CO3A 1X5EA 2GLRA 2OJLA 3H8QA 3NZNA 4IP1A 1OC8A 1ZL9A 1VF3A 3US3A 1GSEA 2XHFA 1OC3A 2DIYA 4QL9A 4EXJA 3PGTA 3L78A 5HFKA 3S9FA 1N8JA 4KW6A 1SK1A 2B3SA 2ZUPA 3KH9A 5DQYA 5F0GA 1USBA 3Q18A 14GSA 4JRRA 1OKTA 2HSHA 1QK8A 3BCIA 2J9HA 3HZ4A 3KEBA 1THXA 1MD4A 2WRTA 2WDUA 2HQTA 3D21A 3K8NA 1EP7A 4MP4A 3UEMA 4IQAA 3H4KA 1X5DA 2HI7A 3HDCA 4HQSA 2XC2A 4MJCA 3H93A 2R37A 3IR4A 2FLSA 18GSA 4L5OA 1SD8A 1SD9A 4GRFA 3JCML 2H6YA 3TCOA 2B7JA 17GSA 2OE3A 2C3TA 4LMVA 4XS6A 3DGQA 4KUNA 1YF1A 6GSYA 3KP9A 1ZOFA 3TKSE 1TI1A 4HDEA 3LYPA 4JBBA 1S3DA 5JWQB 4Z7XA 1O7UA 4MCUA 1LJRA 5ECPB 4H86A 2RUEA 1AAZA 3UVTA 4LLRA 4HU7A 1MDKA 3QAWA 1XW6A 1ZYQB 3GKMA 4ZBBA 3EINA 4WR4A 12GSA 2CAQA 4GSTA 5DAKB 2H19A 2OBIA 3UVHA 3L9SA 2F3MA 3F9UA 4K8MA 3I43A 1A24A 5G1KA 2CVDA 5HR3A 1FVJA 1F2EA 1JLWA 4OD7A 2JZRA 2F8FA 4BL7B 3RAZA 1OC9A 2N5AA 2P0GA 5CRDA 2L59A 3GIXA 2IMEA 1O81A 5ECLB 2NTOA 4GQFA 4RUVA 1YY7A 3W8JA 2H76A 1OVNA 2V41A 4EKZA 5IMFA 5CRHA 1V57A 2FCHA 2HLSA 4MDCA 4V2LA 2O89A 2PPTA 3IHQA 3GL5A 3N9JA 1KBNA 4I5QA 2PWJA 1I5GA 5EVOA 4OO4A 2FHEA 4F0CA 1YEXA 5IMAA 3UOMA 1W89A 3CTFA 4MZWA 4HZ4A 3DRNA 5KEJA 2VUPA 2H73A 4OCEA 1VF4A 2LRTA 4KSMA 2H6XA 5ECNB 2H01A 3TDGA 4POBA 1ZGNA 3FZAA 1CQGA 2VL2A 3FY7A 3WT1A 4MZCA 3UBLA 1SL2B 2TIRA 3VI7A 5ECKB 2CX3A 1B48A 1XVQA 2VCXA 2IN3A 2LUSA 1ERTA 2H72A 1T8EB 4MPGA 5H5SA 5GAPD 3BD2A 3GH6A 4WF4A 3GX8A 4ZL8A 3G9BA 3LSZA 4E8HA 5HQPA 3O6TA 3CTGA 3VI5A 1C72A 4WBRD 4TKYA 4DSSB 1K3OA 1FVKA 2JU5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4PGTA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations