4PL8A

Structure of rabbit skeletal muscle actin in complex with a hybrid peptide comprising thymosin beta4 and the lysine-rich region of cordon-bleu
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
356
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis of thymosin-beta 4/profilin exchange leading to actin filament polymerization.
pubmed doi rcsb
total genus 123
structure length 356
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4pl8A03
5AQIA 3ULEA 3CHWA 3VESA 3ZX3A 3DXKA 2FF6A 3HTVA 2VYPA 4JD2B 1DGKN 2E1ZA 4CJ7A 2QWNA 3CJBA 5AQFA 4K25A 3IFRA 3BEXA 2DPNA 4M7YA 1GLBG 4RCHA 3MDQA 3H6EA 4IZ9A 2A40A 1NGDA 5FPMA 2P9KB 2Q2RA 2Q31A 4JNEA 3EL2A 4WQ5C 1JCGA 4FWQA 1GLCG 3VF4A 5AQMA 5TKYA 1Y64A 5AQGA 4CZHA 2Q36A 4CI6A 5EX5A 2P9LB 3FZLA 5AZIA 5JMVA 4CZKA 1MA9B 2YHWA 3MN9A 2FLOA 1QQMA 2GUPA 1X9JA 3U9ZA 5KQ8A 4BC5A 1WUAA 4JN4A 3VPZA 2HF3A 4WYBA 4BR2A 3UB5A 4DCHA 4PKIA 4FL9A 1NGGA 5AQPA 4CD1A 4FWPA 4H0PA 4QS8A 5FPEA 4XEIA 2D0OA 2HOEA 2P9SB 4LC9B 4BRLA 1ATSA 1QZ5A 1JCFA 3F9MA 3H1QA 4CZEA 1CZAN 2Q1NA 4CBWA 2W41A 5BREA 5AQJA 4FOEA 2P9PB 4BR0A 5KPRA 4IXCA 3AAPA 1KXPA 1NGAA 4CZJA 1S3XA 4DQ8A 1YAGA 3KZBA 3GDQA 1MWKA 3RSEA 4BC4A 2QM1A 4WQ5A 4BRAA 4I6MB 1HX1A 4RWTA 1BUPA 1K8KA 4H5RA 2CGLA 4FO0A 4H0TB 4CZFA 1NLVA 3QMLA 2GELA 1U2VB 3JS6A 3G25A 2CGKA 1WOQA 3ENOA 5F2RA 3O80A 1Z05A 3EKSA 3MMVA 5EVZA 3WXJA 2YJFA 4MLHA 2E2NA 4ISEA 3UKUA 2VCPA 2F9WA 1NWKA 5BPMA 3IMXA 1NGIA 2P9UB 3QFPA 5AQYA 4JD2A 1E4FT 2PAVA 4H5VA 2IVOA 2J4RA 3CIPA 3MCPA 2F9TA 4H0XB 4HTLA 1U6ZA 3WUHA 3VF6A 4BC3A 4B1XB 5AQHA 1BWFO 2AA4A 3CQXA 4FPAA 3VEVA 2BUPA 4BR5A 1Z6RA 1BDGA 3D2EB 2I7PA 3VOVA 5AQVA 1NGCA 2P9LA 2E8AA 1BA0A 1H1VA 5AQXA 4BRMA 3WXLA 2A6AA 2PBDA 3GBTA 2ASPA 3A5NC 3W0LA 3CI5A 5AQNA 4BG9A 5AQUA 4FWMA 4XH5A 2IVPA 3LM2A 3VEOA 3U4LA 2ZF5O 4IJNA 1NGJA 2P9IB 3CETA 4L3QA 3R6MA 2P9SA 4MO5A 3U8XA 2P9NB 5B8HA 1HLUA 4DB3A 3FFKB 2GWKA 4BVOA 3WXKA 3R8EA 3CJCA 3GOIA 3DWLA 4BG8A 4FPBA 4BROA 5BRFA 4ISFA 2QWRA 2P9PA 3FGUA 3L6QA 3H3OB 4H5WA 5BRHA 1TUUA 2A41A 5BPNA 2V52B 5BN9A 3ZX2A 3A0IX 3C7NB 1NBWA 1S22A 1YUWA 3LDQA 4M7XA 5AQLA 2W40A 4I6MA 3ZEUB 4FWOA 1HUXA 3FLCO 3QFUA 4FWRA 5AZJB 2KHOA 3QB0A 5ADXA 5FPDA 1KAZA 4B1WB 2A3ZA 1GLAG 3VENA 3FZHA 1DEJA 3H3NO 1Q18A 2FSKA 2Q0UA 3CERA 4HWIA 1U2VA 4PKGA 1V4SA 5F0XA 4IJAA 3VERA 3ZETB 3O1BA 3R9PA 3CJ7A 4PL7A 4EHTA 1GLFO 5KPTA 2P9UA 3MN7A 1XC3A 3O8MA 1SAZA 1C0FA 2YHXA 5AQWA 4A62A 4H03B 3AAQA 4BRCA 2WUSA 1J6ZA 4BGBA 2CH6A 3H46O 3A5OC 1X3MA 3QDKA 1BOTO 5BPLA 3HM8A 5AFUA 4B9QA 3LL3A 2V7YA 3A5LC 1BU6O 3HBTA 4BR9A 3ID8A 3EO3A 4DHYA 4A2BA 1T6CA 3DXKB 2E88A 5AQKA 4AM7A 4PKHA 1IJJA 5BRDA 3VGLA 2E1YA 3WQTA 3IDHA 3U9DA 1TUYA 3KVGA 1LOTB 1G99A 3D2FB 2QWOA 3HZ6A 3LDLA 2YI1A 4FSVA 3DJCA 2YJEA 2P9IA 2ASOA 1SZ2A 4O8KA 1LCUA 5AQTA 4MO4A 5JICA 1QHAA 2P9NA 2ZGZA 3VEYA 4IO8A 2Q97A 1TYQB 2D1KA 1T6DA 3WXIA 4Y0WA 3LDNA 2UYTA 3UKRB 4YDUC 2P9KA 4KBOA 4GNIA 5I9EB 3VEXA 5LY3A 3MK6A 1RGIA 1MDUB 4BREA 1MWMA 2ZGYA 3BP8A 3WQUA 3L4IA 1NM1A 1YVNA 2A42A 4FWLA 3LDPA 3ZEUA 4BR7A 2IIRA 3MN6A 3SLCA 5AZJA 4FWKA 3M6GA 3SK3A 2HF4A 2ITMA 3A8YA 4BQLA 4CBXA 2ZWHA 4ISGA 3BUZB 1RDWX 3GG4A 2D0PA 4BRKA 1NGFA 4EAHD 4FWNA 3QBWA 3TPQA 1QQOA 1RFQA 2CH5A 2E2QA 2AP1A 3DAWA 3QBXA 3ZETA 4BVPA 2NRHA 2E20A 5ELZA 5AQZA 3M3ZA 4QS7A 5ADXH 4A2AA 3VF2A 4BRNA 3CJAA 4CZMA 1KAXA 1QZ6A 3O1WA 1K8KB 3O6WA 1ZBSA 2QXLA 4H5NA 1QQNA 3O5BA 3UKUB 4YDUA 3ENHA 4J8FA 4NO7A 3VGMA 1NGEA 5AQRA 1GLEG 3L0QA 4E1JA 4BRHA 3GE1A 2E2PA 4H0VB 3VGKA 2H3GX 1C0GA 2NLXA 4JHDB 3WEEB 5AFUH 1ATNA 2QWLA 4O5FA 4H0OA 2QW9A 4PL8A 1ZC6A 3ZX0A 1GLLO 3MN5A 5BR9A 3CJ1A 1DKGD 3D2FA 2IVNA 3O4WA 2FXUA 1HJOA 3S41A 4IWVA 2Q0RA 3FE1A 3JXUA 1ZXOA 3QICA 4WQ4A 3AY9A 1TYQA 3LM9A 5FPNA 3SMPA 4XH1A 1IG8A 3FR0A 3UKRA 2YHYA 3BF1A 3HSCA 1XUPO 4GY2B 4XH4A 1HPMA 2QWQA 4BRQA 4QS9A 4EIAA 3DXMB 3C0BA 3D2EA 3H45C 3I8BA 3M1FA 3ULEB 3B8AX 4C23A 2HMPA 1EQYA 4A61A 1KAYA 4EHUA 1HKGA 5EXWA 4BRPA 1R59O 3SJHA 3CQYA 3EKUA 5AR0A 2EWSA 3FZFA 4CD3A 1NMDA 5EY4A 1P8ZA 4B1VA 5AQOA 3GL1A 5LJWA 1D4XA 4NB4A 4M63C 3J8AA 2NZTA 5LJVA 2ASMA 2FSJA 4BGAA 1ATRA 3HI0A 1XQSC 3ATVA 1BG3A 1X3NA 5AZIB 3UE5A 3WT0A 4CZGA 5JLFA 4MLEA 4K42A 4BC2A 4B1ZA 3EZWA 3TU5A 1E4GT 5E26A 1BO5O 3KHYA 4BRIA 1T44A 4RTFD 3EN9A 2FSNA 5CE3A 1HKCA 4EFHA 4F9OA 3ATUA 4FOIA 3CJ9A 5E84A 4K41A 4K43A 2A5XA 2QWMA 3C7NA 4FWSA 4Z94A 3I33A 3O08A 3D7EO 3P4IA 5AQQA 3VETA 2V7ZA 2CGJA 1ESVA 2VWBA 5AQSA 3IUCA 4JHDA 3WEEA 2YCHA 3SMSA 4BQZA 3VEZA 4CZIA 1JCEA 1BA1A 2E2OA 3W3DA 5F1XA 4WQ4C 3FZMA 3FZKA 1SQKA 1V4TA 2D4WA 2OANA 2GEMA 3LDOA 3OHRA 4B1UB 5BN8A 3RSEB 4BRDA 1GLDG 4AM6A 2FF3B 2GTDA 4CBUA 3A5MC 1NGBA 4JAXA 5KQDA 4B1YB 4H5TA 3AARA 5JLHA 4H0YB 1YXQA 2V51B 5EOYA 4BR4A 2QWPA 3H1VX 4BRGA 1GLJO 5KPZA 2I7NA 4CZLA 4BRFA 3VEWA 1OKJA 2GWJA 3DXMA 2BTFA 3BF3A 1HKBA 1NGHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQIA 4JI6K 1CXUA 3ZCMA 2O8CA 3ZSZA 4BE1A 3AA5X 2FF6A 4KV8A 4JD2B 3CJBA 1J5EK 4K25A 3NGIA 1GLBG 4ILHA 4IZ9A 4FJLA 1LV5A 5HOOA 4JNEA 3CQ8A 3HRGA 1JCGA 1RBSA 1EP4A 3M5RA 4C8OA 1VSMA 3V1RA 1ZBUA 1WAJA 4JKGA 3HJFA 4BWJA 3FZLA 4KI6A 3PLAA 3H08A 4CGIA 3OYIA 4DUZK 2FLOA 2GUPA 2DFHA 4R79A 3E9OA 4O44A 3U9ZA 3CCEN 2X78A 4JN4A 4KB0A 3VPZA 4R5PA 2PZSA 3CD6N 4NYNA 4DCHA 3K59A 1JJ2M 3PIOL 4FL9A 1NGGA 5AQPA 4B3MK 4IFVA 4WFAL 3SUPA 4H0PA 1TL1A 4JK8A 4BDZA 3TARA 5J2QA 1JCFA 1S72N 1ILYA 3H1QA 1C1AA 1RDUA 1CZAN 3CMAN 1WSIA 5AQJA 4A59A 1VQ8N 3ENBA 3LAKA 4CZJA 2Y1IA 1YAGA 3L2VA 3ZT4A 4HUFA 3RSEA 2OTJN 3CG7A 2HHHK 4KHWA 3VQPA 4DWIA 4BRAA 3K5LA 1T8EA 2HNZA 4CGFA 4Z4GA 4B8AB 4CK3A 1K8KA 4CEEA 3K2PA 4QAGA 3AVGA 1EXQA 4UY8O 4H0TB 1UA0A 1NLVA 4GV3A 3LAMA 1W0HA 3M8QA 1WOQA 3SQ4A 3ENOA 3CCQN 5EVZA 4A5BA 2VG5A 2YJFA 3NH1A 4ISEA 2KFNA 4C1NI 2VCPA 2F9WA 1NWKA 3ZT1A 5C12A 2WOMA 3LDSA 2QA4N 3RR7A 3SAHA 4N5SA 3TSPA 2OYQA 4LD0A 2F9TA 3HOSA 3LP1A 2UXBK 4CJKA 2AA4A 3IRXA 4BR5A 1T3VA 1BDGA 2I7PA 3VOVA 4CGGA 3O3GA 5AQVA 3UIQA 1TKTA 3THYA 4PWDA 1RT3A 2PBDA 2ASPA 4CJWA 1HNVA 3AVAA 1SL2A 4FJHA 5AQUA 4XH5A 3VEOA 4IBNA 1QHTA 3OYFA 5JS2A 4GV9A 4IJNA 4E0DA 2BANA 2P9SA 3R6MA 1N8RO 2GWKA 3THVA 5CHIA 3L2QA 4LFAK 4JKCA 2ATQA 4KHNA 5DK5A 4DSKA 4BG8A 4E3SA 4ELVA 1S6PA 1QVFM 4KPYA 3AGKA 3MXMA 3L6QA 4DFJA 1UOCA 3DLKA 5D3GA 4H5WA 2YKNA 2G8IA 2V52B 3U6FA 1KVAA 2W40A 2HBMA 4I6MA 3FLCO 3IG1A 5AZJB 2W6KA 5ADXA 5FPDA 1KAZA 3WNEA 4JI5K 3SAGA 1TAQA 4CK1A 4E7KA 2YNGA 3VQAA 2D0BA 4A5AA 3VA3A 4NLBA 1NNEA 3VERA 3KIOA 3CCJN 4DFMA 3P5JA 3O8MA 1C0FA 4A62A 1RBRA 3CM6A 3TI0A 1SL1A 1J6ZA 3G6EN 4DR4K 1N36K 4B9QA 1XNQK 3A5LC 4FJKA 2RHKA 4E72A 1BU6O 4BR9A 1XC9A 2NRVA 4OPKA 4DV4K 4DHYA 2E88A 5AQKA 2D0AA 3L8BA 3THXA 1NK8A 4PUOA 4CJPA 1TK5A 5E41A 1YJWN 3MX5A 3KVGA 3RR8A 4KHSA 1LOTB 3WNGA 1Q8IA 3PSFA 3KD1E 1X9WA 4AHVA 1RDDA 4M45A 3O3HA 2ZD1A 3AVBA 1K73O 4NXMK 3CPEA 2ASOA 4JKHA 3BZKA 1LCUA 3HPGA 2P9NA 4Z4CA 1YJ9N 2Q97A 1TYQB 3WXIA 4IO9L 2JWKA 4KREA 3L2WA 2UYTA 3LP2A 2P9KA 3DLBA 3SQ0A 4GNIA 1MWMA 1QS4A 1WSGA 3KK3A 4CFCA 3ZEUA 3MN6A 3SLCA 4FJ8A 1NKBA 3EE9A 3M6GA 2HF4A 2ITMA 1Q82O 3A8YA 4BQLA 3SPZA 4BY9C 4B08A 1KVBA 4ISGA 4AHTA 4JKBA 3BUZB 4BRKA 2D0PA 1L3TA 4CJUA 1A5WA 2ZJPL 4FWNA 4KHYA 1QQOA 3DAWA 2CH5A 5LMUK 2AP1A 4DR6K 3SYZA 3AA2A 5AQZA 1IH7A 5ADXH 4CEDA 3VF2A 4CEZA 3NVMA 4FLXA 1KRPA 4CHQA 2EX3A 1BIUA 2WTUA 1XHZA 3T7ZA 1QE1A 4CF2A 4KTQA 3ZSQA 3NF6A 4DV6K 2GX9A 3VGMA 3VA0A 4GKJK 1GLEG 3AVHA 1Q7YO 3CPWM 2H3GX 1NK7A 2QI2A 1YHQN 3B6PA 4JHDB 5EU7A 3WEEB 1ATNA 2QWLA 4O5FA 1OH8A 3ZX0A 1BHLA 2VG7A 1GLLO 3MN5A 1GOCA 3D2FA 2IVNA 3F73A 1TKXA 1HJOA 5FROA 4CJFA 1XMOK 4CEQA 5CZ1A 4WQ4A 4W5QA 4MQ3A 1KC8O 1NOYA 4N41A 3OYDA 1VSEA 3R1XA 4ICLA 3E66A 4OKKA 1IG8A 4IOAL 3BF1A 3SQ2A 2O8EB 3L3VA 3RMCA 1HNZK 3J7YP 5J2PA 3PIPL 2XY8A 2IGIA 4HVJA 4B8CA 5FLXO 5C10A 4AQYK 2UXDK 3TAEA 1NJIO 1DTTA 2HBJA 4BRPA 4EHUA 5LMNK 1VQKN 3CFPA 4IG0A 4RW4A 2HNDA 4JK9A 1YT3A 2EWSA 3FZFA 4FJMA 4B1VA 5FRMA 1I94K 4DTOA 4BECA 4OKJA 3J8AA 2ASMA 4FZYA 2Q3SA 1S9GA 3ATVA 1HYVA 3UE5A 4KHPK 4CIGA 1SS6A 1U49A 4K42A 3TSUA 4CCHA 5E26A 1Q86O 1TVRA 4RTFD 3ALYA 4QCLA 4F9OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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