4PMMA

The structure of trka kinase bound to the inhibitor n-(3-cyclopropyl-1-phenyl-1h-pyrazol-5-yl)-2-{4-[3-methoxy-4-(4-methyl-1h-imidazol-1-yl)phenyl]-1h-1,2,3-triazol-1-yl}acetamide
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
291
structure length
285
Chain Sequence
CVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLDKMLVAVKALKESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords High affinity nerve growth factor receptor
publication title Maximizing diversity from a kinase screen: identification of novel and selective pan-Trk inhibitors for chronic pain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 94
structure length 285
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4pmmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4pmmA01
2A0CX 4KS7A 4QNYA 4ZP5A 3FJQE 4YLKA 4EQCA 3Q3BA 5CALA 3R8UA 4X3JA 5A6NA 2GTNA 2XK6A 3GFEA 3PDTA 3FDNA 2XRUA 4AZSA 4MBIA 2WMBA 4AE6A 2UV2A 3B8QA 3TTJA 4HVIA 2XIXA 3EJ1A 5E8XA 4EC8A 2C5OA 3UO5A 5K3YA 4IB1A 2OZAA 4MF1A 4C37A 4YC8A 5E8SA 4MAOA 5HU3A 4TW9A 3N9XA 2QCSA 1YXUA 3MJ1A 4FYNA 4JT3A 4ANLA 2GS7A 4CV9A 4QMQA 2ITQA 5A4TA 3GU4A 5K4IA 5FP5A 5CAQA 4PWNA 1Y8GA 3QGYA 3JPVA 2HZ0A 5T6KA 1CSNA 5HE3A 2R64A 4PMTA 2ETRA 1KE5A 3RZFA 2BRHA 3ZZWA 5DT0A 4CT2A 4YJOA 4LRKA 1UU9A 3LHJA 1OVEA 4DEEA 2QOOA 2EXCX 3AC2A 3ULZA 4LV8A 5HG5A 1NY3A 2XBAA 3WF9A 3E62A 4CCBA 3OXZA 5CLPA 3PYYA 5F4NA 4AA0A 5JGDA 3HUBA 3VBYA 4AGDA 2I6LA 1PXMA 3HV5A 3LFDA 5I9UA 2J0KA 3UZPA 4F09A 2XMYA 4LUDA 2C68A 2QC6A 3GGFA 3ALNA 3PG3A 4RX7A 2PY3A 4PDPA 1JBPE 3GCUA 3C4FA 4WUNA 5AP2A 5HTBA 5CAPA 2WQMA 3GC7A 1BKXA 5I0BA 4USFA 5HNBA 4O84A 2PE1A 3HKOA 4PDYA 4OAUC 3OEZA 5CX9A 3TDVA 4A9TA 3MPTA 5LMKC 3FI3A 4FZ6A 4CRSA 4Z16A 3DKGA 3VS2A 4C57A 3Q4UA 2X2KA 5CF4A 3GC8A 5DMZA 3I0OA 4DF3A 1WBSA 3ZU7A 2HYYA 1AGWA 4X3FA 4CFFA 3TL8A 2UVZA 3G5DA 2E9PA 1KE9A 3VW8A 4BTJA 4E26A 1MUOA 2YZAA 5BYYA 4FTMA 4QYYA 4B99A 3MTFA 3JS2A 2VN9A 3MGYA 5JKGA 3G2FA 3WIGA 4KBAA 4I22A 2YEXA 4QMPA 4FEQA 4LUEA 2WTKB 2OWBA 3TTIA 4NIFA 4FV8A 2W7XA 2B7AA 1P14A 5M53A 4U6RA 4MF0A 4BF2A 5ICPA 5IA5A 1M52A 4U80A 2UZNA 3PPJA 1SVHA 5HE0A 2BFYA 1X8BA 2YCRA 3CJFA 4LGHA 4QMVA 3UYSA 2EXMA 2UZTA 4AUAA 3HAMA 4ZEGA 3D5XA 2FSTX 3G33A 3ZTXA 1REJA 3QYWA 3FMHA 1NVSA 4DAWA 3PSDA 4XEYA 5E8TA 2FVDA 3E63A 1JKTA 3OXIA 4F63A 1ZYSA 3AQVA 1Q8TA 3E3BX 1YXSA 2P2IA 1W0XC 5E7RA 4TWOA 3Q60A 5HLPA 3OWKA 2VWXA 1SYKA 3AGLA 5CY3A 5AFVA 3MWUA 3MA6A 5EQEA 5IDPA 4ZTRA 3I1AA 2IZTA 4ONAA 3PRIA 1XHAA 4J53A 1ZARA 4I4FA 1XH9A 2I1MA 5ANOA 1Q5KA 4CG8A 3LPBA 4LOPA 4GT4A 3QTXA 2X39A 1OM1A 3ETAA 3HMOA 4L00A 4HYHA 3DZQA 1RE8A 4F70A 5LXMA 4E4LA 3W2SA 3GVUA 3ZOSA 3A4OX 3L9LA 4FV7A 2CKQA 2OXXA 2BZHB 3CBLA 3LMGA 5AUTA 2HK5A 2WIHA 3UVQA 4FNXA 5I9VA 3F6XA 4QQCA 5ANDA 1Z57A 4U0IA 4D2SA 2F2CB 4BVUA 4DFLA 4E20A 2R3HA 5KUPA 2XZSA 4R1VA 4OTPA 1BI7A 1HCKA 2PE2A 3IKAA 3PUPA 4YLJA 4DFXE 4FTOA 3GFWA 3PVUA 3MDYA 2W9ZB 3RPYA 3I5NA 3UIXA 1TQMA 4IJ9A 4DCEA 4Y72A 1M2QA 2EB3A 3T3UA 5EM8A 3PP0A 5BYLA 5CVHA 5IQHA 5KZ0A 2AYPA 1WBPA 1OBGA 2BCJA 1YHSA 1PXLA 1BX6A 4RX8A 4IIRA 2Y0AA 1TKIA 4KBKA 4RC2A 2ZDUA 3POZA 4ITIA 4BKJA 2G15A 2HENA 3QTIA 2QKWB 3PP1A 5ETIA 4H36A 4PUZA 4YC6A 4BCGA 4R5SA 2ZMDA 3CJGA 2XNOA 3GQIA 3R73A 5K0KA 3QQJA 3SW4A 3ZYAA 4C3PA 2V22A 3EQGA 2Z7LA 4JAIA 2PVNA 3MJ2A 5DT4A 3RGFA 1WBWA 3SA0A 2GHGA 2SRCA 3MN3A 3OCTA 4U8ZA 4AAAA 1V0PA 1ZOHA 2W1EA 1YOJA 1YWVA 5FM3A 1WBOA 4FC0A 2ZV7A 5B2LA 2C6KA 3CE3A 3ORKA 3F2RA 4E5WA 4MD7E 5AV4A 4EI4A 3MFUA 5KBRA 4HJOA 1STCE 4R6VA 4RIYB 5H8EA 4C33A 3NMUF 3A8XA 3ZM9A 5ANGA 5AR5A 4E93A 2BRBA 4IVAA 1H1PA 2XP2A 3D15A 4MD8E 4P2KA 4DCAA 3C4CA 3KXZA 3BQRA 4XV3A 5IH5A 4ANBA 2QONA 5DHJA 4EHGA 5AM6A 4ZSGA 2BHEA 4FG8A 5HQ0A 4FSYA 4E8AA 1ZYCA 4TYHA 3UC3A 1LEWA 2GHMA 4QOXA 3VS1A 3WZEA 3ZUUA 4DFNA 2J7TA 3RCDA 1REKA 5FUTA 2X81A 4GJ2A 4P4CA 2AC3A 2RF9A 1IASA 1M7NA 4LG4A 4BDEA 2NNWB 1H1QA 3QC4A 4XOYA 3CSVA 3QRJA 5L6OA 2ZJWA 2VTHA 3R1NA 4F6SA 4RLKA 2PVFA 2CJMA 2GFSA 1ZYDA 3DJ6A 3O7LD 2C5XA 2JLDA 3FQSA 4FKPA 2X4FA 4BGGA 3G6GA 2BALA 5M4UA 5IQAA 4YJQA 2R3LA 4K77A 3SC1A 3NUUA 4EH3A 5LMAA 3NGAA 3RWQA 3P9JA 5AA8A 2PK9A 4FIIA 4YZ9A 4F4PA 1OB3A 1TVOA 5DR2A 2IW8A 3FMMA 3I81A 4RJ4A 3D0EA 3PZEA 3SD0A 4TYJA 4GKIA 3KN5A 2Q0BA 3MIYA 3PXFA 3C5UA 4O91A 4OLIA 5CU0A 4K2RA 4RWLA 2P0CA 2WD1A 2C1AA 4IB3A 4PX6A 4QMTA 3ANRA 5B2MA 1FBNA 4QMYA 3UP2A 3C9WA 3DCVA 4W9WA 3FSKA 5IH6A 2CPKE 4QP2A 2VNYA 3HECA 4R3RA 5KCVA 3D9VA 4PRJA 2DUVA 3G9NA 5C9CA 2P3GX 4QQ5A 3RAKA 1OL1A 3BBTB 4KIQA 5GNKA 3WF7A 3LXNA 3BU5A 4IAAA 5L8JA 2QG5A 3Q6UA 4L3JA 5TT7A 2IW6A 3O8TA 2ZM4A 4D58A 2EXEA 2YIYA 1I09A 2ACXA 3G51A 3VUHA 2PMNX 5DRBA 1E9HA 4A7CA 3ZBXA 2C6TA 4PNIA 2ITYA 4YJRA 4AQCA 4BTKA 3HA8A 4WSQA 3WE8A 4BCFA 2XK9A 3KVWA 4ALWA 3R83A 5K5NA 5M55A 1JSTA 2PUNA 3WZKA 2OIBA 2X7OA 2Y4IB 4O0SA 5B2KA 4ANMA 4AW0A 5BUIA 1OGUA 3NYVA 2PMIA 4FV3A 3DKFA 4OTQA 3TJCA 3BHTA 1UNLA 3VUGA 5GZ9A 2C69A 3LVPA 4I3ZA 4X3FC 3DJ7A 2QR8A 4G3CA 4V01A 5IDNA 3GC9A 3Q5ZA 3R63A 3ANQA 5J8IA 2R3OA 2X2MA 2A19B 4XP0A 3VW6A 3RPRA 5EW9A 3NX8A 4FSZA 3IO7A 2HY0A 1BUHA 4YBJA 4RC3A 4EH9A 3NZ0A 2E2BA 3VUDA 4HW7A 5E4HA 2JDTA 2XUUA 3PTGA 4M7IA 5CSXA 5EW3A 3SXFA 3LMHA 4CQEA 3HRFA 2C4GA 3KGAA 4IFCA 3Q2MA 2Z2WA 4FKVA 4R7HA 2HZNA 4L42A 2ZDTA 3GQLA 5L2SA 2WMSA 3BI6A 4O1PA 3FLSA 4E6QA 4FIEA 2QODA 3SX9A 3TIZA 4WOVA 3V5LA 4JR3A 4G5PA 3UPXA 4XG9A 3UIUA 3JY9A 1JKKA 3WZUA 2VO6A 1UKIA 4GIIA 1H07A 3QQLA 2R3QA 4UWYA 3F5XA 3QUPA 1OUKA 4UYNA 3IOKA 5HIBA 4Y85A 5HVJA 5CYIA 3C0HA 5FLFA 5I5ZA 5D10A 2XNMA 3SHEA 4RIWB 2EWAA 1DS5A 2XIYA 5FBOA 3NUNA 4CKJA 2PMLX 4F1OA 2ZVAA 4M67A 4Q2AA 3V5JA 3UNJA 1XH6A 3S3IA 4UMRA 3QKKA 3HZTA 3ALOA 3FL5A 1CKIA 2XYUA 4MYGA 4MXOA 4TZRA 4QTAA 2P33A 3R22A 2JD5A 3UGCA 3ZMMA 4U43A 1OKVA 3COKA 3OCBA 1GIIA 2GNHA 4BZDA 3NCGA 3D94A 2REIA 4C61A 4CD0A 2XNBA 5CSWA 4RT7A 4GK4A 4M69B 4DGOA 2BDJA 4AT3A 4RVTA 2C0OA 4XYFA 1NW1A 2ITTA 5JFWA 4LGDA 4AZEA 5M4CA 5GIPE 4K11A 4ZS0A 2W4JA 3PA5A 3KRXA 3R8LA 2YABA 4APPA 3DAEA 1B6CB 3PXYA 4KINA 3ZH8A 4FT3A 4Q5EA 3IONA 3ZO3A 4O2ZA 4YTIA 1Q8WA 5LARA 1SVGA 4YGAA 4D55A 4Z7HA 4DGLC 3BYSA 3IW4A 4EKLA 3B2TA 3KULB 5DT3A 4G16A 1U5RA 3UOLA 2GU8A 3KMWA 3GBZA 4WRGA 3QTWA 2VX0A 4GYGA 4LV5A 5DN3A 4RA4A 4TXCA 5TKDA 1QL6A 4QTDA 4QRCA 3P86A 3R1SA 5FTOA 4MH7A 4OTFA 5F1ZA 4DTBA 3ZSIA 2WNTA 1G3NA 3PE1A 2ITNA 2OJ9A 2WMUA 1WBVA 3AT3A 4UY9A 4ZY6A 3ZHPC 1YHVA 2HZIA 2WPAA 4DFUA 2AUHA 4HVDA 2QO7A 4AW2A 2UW3A 4EH7A 3GB2A 5HG7A 3ORPA 2GQRA 3RM6A 5HIEA 1YOMA 3KRRA 3LXLA 2WB8A 2XK3A 3HGKA 5CQWA 3QZHA 1XBAA 4G6LA 2ITWA 2VWZA 4S2ZA 5AAEA 4I0SA 2RFDA 3CQWA 3GU6A 3TXOA 5BPYA 4FBXA 1AQ1A 3QTZA 5FTQA 3NW7A 2F7XE 3MFRA 2E9OA 3KU2A 4YPDA 4C36A 5L8KA 5FTGA 1KOAA 3PIZA 4EUTA 5DGZA 4QP1A 3PZHA 5JFSA 4JLCA 1F5QA 2VX1A 4M97A 1V0BA 2HIWA 3EN6A 4FTAA 4EONA 4Y73A 5AM7A 4B8MA 4ZSEA 4GT3A 3F9NA 2VTAA 3ACKA 2PZIA 4MXXA 3V3VA 4CT1A 2VGOA 4G2FA 3QWKA 4YJSA 5A4QA 2VD5A 3BV3A 4AU8A 2A1AB 1B39A 3BHYA 3RZBA 5HZNA 3MESA 4JDHA 4DEBA 5HO6A 4YHFA 1W98A 4FKSA 4JBQA 4M14A 3FMNA 3OHTA 5BYZA 2NRYA 3AXWA 3RHKA 4D2RA 3KCFA 3W1FA 2G01A 2W5AA 3THBA 4IJPA 3MY5A 3W8LA 2GNIA 1JSVA 4RLLA 4AFJA 5FP6A 3O0GA 3LOKA 5CT0A 3KK9A 1IA9A 4CLJA 3AC8A 3N51A 3VN9A 4BKYA 2WMRA 3FC2A 3OWLA 4FTTA 4ZMFA 4EWQA 4O27B 2B4SB 4C4JA 2OXYA 3EFLA 3E8EA 3QAME 3PLSA 2F49A 3EQHA 5BVKA 5E8WA 3W33A 3A7HA 4DH7A 5J87A 1H08A 5A54A 2XB7A 3L9NA 5BMMA 1PKDA 3VBWA 4ANSA 4EZ5A 2ZV9A 2RL5A 4NM3A 3IPHA 5FD2A 3LM5A 4RVMA 5JH6A 2OJJA 2X4ZA 1JNKA 5EI8A 3W2RA 3EQCA 3ODZX 3NSZA 3KK8A 1NVQA 1W83A 3OXTA 4BICA 3F61A 1XH7A 4DC2A 4BIDA 2OBJA 1YOLA 2GPHA 2VZ6A 2Q83A 4FV2A 4M8TA 4FK3A 5EDQA 3II5A 2B9FA 1U54A 3KVXA 2VWWA 4EOSA 3VS6A 4DT8A 3EFWA 5IMXA 3R8MA 4FA2A 1ZZ2A 3DBDA 5EQYA 4W8EA 3ZO1A 4RWIA 4FGRA 2OICA 3PXRA 3OMVA 3R8VA 3ZLWA 4J97A 4C3RA 4EH8A 3AOXA 4BR3A 5BVWA 3VNTA 4BDCA 1A48A 4EJ7A 3NAXA 2I0YA 5C01A 4JG7A 1ZMUA 5HICA 3BELA 1IG1A 5IISA 4FUYA 5IA3A 4V05A 5L6PA 1H0VA 3FZ1A 4QMXA 5H2UA 5KE0A 2DWBA 4FKWA 3ZONA 4M68A 4O83A 2BAKA 2O3PA 3NYNA 5L2IA 3NYXA 5AR8A 3EFJA 1XKKA 3OS3A 3VUKA 2CNVA 2YIXA 4RQVA 2CHLA 2R3KA 3PIYA 4J8NA 4NH1A 3DNEA 3O50A 3QWJA 5DOSA 4D9UA 2B0QA 4RPVA 3FKOA 4GRBA 5EOBA 3GCPA 3UZTA 3ZDIA 4KIOA 5IA1A 3BV2A 1UWHA 3MVMA 3WYXA 1VR2A 2IVVA 5AMNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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