The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
64
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDIEIRLFKSHPETLEKHDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Regulating the coordination state of a heme protein by a designed distal hydrogen-bonding network.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
64
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-03-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5HLQ A; 4M4A B; 1GDK A; 1XXT A; 4PNJ A; 2G12 A; 1J7Y B; 1YGF B; 1HBI A; 5E83 A; 1MBO A; 3HRW B; 3S1I A; 5HBI A; 1YHE A; 2BLJ M; 3AT6 A; 1XZ4 B; 1MKO B; 2W72 A; 3PI3 A; 1BZZ A; 4F6I A; 1RQA B; 2W72 C; 3QJE A; 2WTG A; 1MBI A; 2XKG A; 1MLJ A; 1YOI A; 1SHR B; 4U8U A; 2NRL A; 2MGF A; 3U3E A; 1TU9 A; 3HF4 A; 1BBB A; 1GCV A; 1BUW A; 5KER B; 1MNH A; 1BAB A; 2HBE B; 2DXM A; 2ZSY A; 5AZR A; 1YE2 A; 3WCT B; 1BZP A; 3B75 A; 3G4Q A; 2MYD A; 4H2L B; 1QPW A; 2DN1 B; 4ESA A; 3A9M A; 1S5Y A; 1CP5 A; 1Y2Z B; 1O1I A; 2AUP A; 1A00 B; 1Y35 A; 1VXH A; 2DHB A; 5EUI B; 1MLS A; 4HSX A; 3ZJP A; 4MXL A; 1R1X B; 2QSP A; 3MKB B; 1MYI A; 3RJ6 A; 1FN3 A; 3UBC A; 3WCU D; 1RTX A; 1V4U A; 4ROL B; 1N9H A; 2H35 A; 4FWY A; 1BZ1 B; 1AJ9 A; 2SPL A; 1GLI B; 1HGC A; 1LJW A; 1VXC A; 1YE0 A; 4O1T A; 4XDI A; 4U8U B; 1T1N A; 3QQQ A; 3HF4 B; 1LUE A; 1GCW B; 1OBM A; 2GTL D; 1X9F A; 1O1L B; 3UHV A; 4O4Z A; 2QU0 B; 3P5Q B; 1X9F C; 4WJG A; 1MWB A; 2GRH A; 2ZLW B; 4YU3 A; 3SDN A; 1CH1 A; 3VAU A; 105M A; 3GOU A; 1Y0C A; 5MBN A; 1O1O A; 2D2M B; 1IRD B; 1A6M A; 3ZJQ A; 1YGD B; 4FWX A; 2RAO B; 2EVP A; 1Y35 B; 3S66 A; 4UZV A; 2FRF A; 2ZFB A; 3EU1 B; 1HDB B; 1HBG A; 4HHB B; 2MYC A; 2GNW A; 1GBV A; 3CY5 A; 3QM9 A; 1A3N B; 4HRT B; 5JDO D; 2ZLV A; 1HAB B; 2ZFO A; 3QZZ A; 1Y7G B; 5EET A; 1QSH B; 4G51 B; 2ZFO C; 3VRG A; 3W4U A; 3QM6 A; 3IC0 B; 1YE0 B; 4NZI A; 2G0X A; 3WCP B; 1HLM A; 2Z6N B; 2HZ2 A; 1Y7D A; 1Y5J A; 3UHN A; 1N9F A; 3DHT A; 1HV4 B; 4F68 A; 2GKN A; 1J40 B; 1Y4V A; 5AZQ A; 2O5B X; 3NL7 A; 1LH2 A; 1MBC A; 1LH6 A; 3BJ3 A; 3QJC A; 4MQJ B; 1G9V B; 1NIH A; 1YEQ A; 1J3Y B; 3O7N A; 1QSI B; 1RQ3 B; 3HEP A; 1Y7C B; 110M A; 2SPM A; 2VLY A; 1Y8I B; 1F65 A; 1Y4R B; 4TWU A; 3S66 B; 1MOA A; 1A0Z A; 3DHR B; 1G0A B; 1FSX B; 5EV5 A; 2MGE A; 2ZFB B; 2GRZ A; 3G4Y A; 1G09 A; 2GKM A; 1Y5K B; 2R80 B; 1CMY A; 4PQB A; 2ZFO B; 2O58 X; 2VEB A; 1WMU B; 3A5A A; 3EDB A; 3M38 A; 1YMB A; 1CLS B; 3LB4 A; 1UFP A; 1MYJ A; 2QFN A; 2B7H A; 2GRF A; 1MLH A; 1YHR A; 2ZWJ A; 3K8B A; 2BW9 M; 1MNJ A; 1MTI A; 2ZS1 B; 1DXV A; 1DM1 A; 1Y4V B; 2W6V B; 2D5Z A; 1HBS A; 1O1N A; 1MLU A; 3NL7 B; 3TM3 A; 1XQ5 B; 3IA3 B; 3A2G A; 1DO1 A; 1O16 A; 3DUT A; 1J7W A; 1WVP A; 1O1P B; 1YFF A; 1VRE A; 1CO9 A; 1M6M A; 1NS9 A; 1Y0A B; 3GK9 A; 1LA6 A; 1MLQ A; 1K0Y B; 4MQC B; 1Y0D A; 2HBF A; 3KUO A; 2H8D A; 2O5M X; 4MQH B; 1A0U A; 3NFE B; 4TWV A; 1GZX B; 4B3W A; 1Y7Z B; 3PI4 A; 1HAC B; 3E4N A; 1UC3 A; 2O5Q X; 1MYZ A; 1V4X A; 1BJE A; 1Y22 B; 1HDS A; 1O1M A; 1AZI A; 3ZJL A; 1D8U A; 1HRM A; 1HBB B; 1HDA B; 2R4X A; 4N7N A; 1NZ2 A; 2QMB B; 2ZS0 D; 4NI0 A; 1M9P B; 2G0Z A; 1QXE B; 1DXT B; 1CP0 A; 1Y4P A; 1PBX A; 5JDO F; 1UX9 A; 2HHB B; 1Y4F A; 1NQP A; 1FCS A; 1NEJ B; 3PI9 B; 4L7Y A; 3ARK A; 3AQ9 A; 1DO4 A; 1RVW A; 1JEB A; 2PGH B; 2MGK A; 1HBS B; 3MJU A; 1YH9 A; 2R1H A; 5CNB A; 3K3U A; 3UHU A; 3FH9 B; 1V75 B; 1JZM A; 2MYB A; 1LFY B; 2YRS B; 3E55 A; 1VXE A; 1X9F D; 3HYU A; 1XZ7 B; 4NK1 A; 1A0U B; 3PT8 B; 1J7S A; 1CH9 A; 2MGD A; 4MQI A; 3S65 A; 3G46 A; 1QI8 A; 5CN8 A; 4ROM A; 3HHB A; 1NS6 B; 2D5X B; 2GNV A; 4IRO A; 3UHB A; 3UHT A; 2HBD B; 1Y0W B; 3UHC A; 5HY8 B; 1OFJ A; 2NRM A; 4KMW A; 1G08 A; 1YDZ A; 5CN7 A; 2M6Z B; 4F6J A; 3D4X A; 2FRK X; 1DLW A; 2HBC B; 1SDK B; 2G0S A; 1IDR A; 1Y85 A; 1Y4P B; 5ILE A; 5KKK A; 1HBA A; 1SI4 A; 1S0H A; 1FDH A; 5CN9 A; 3HXN B; 1THB B; 1A9W A; 1RQ4 B; 3QMA A; 1H97 A; 6HBW A; 2ZSS A; 1BIN A; 5EQM A; 3UHQ A; 4FC3 B; 2GDM A; 3S1J A; 1COH A; 1Y4B B; 102M A; 3IXF A; 2GL3 A; 1RPS B; 1JZL A; 3GLN A; 2W31 A; 1H1X A; 1J41 A; 1YEN A; 3VHB A; 3QM5 A; 1PMB A; 2MGM A; 2AA1 A; 1A6K A; 5CNF A; 2KSC A; 1VXG A; 1DKE A; 3S48 C; 3EDA A; 3SZK A; 1CBL A; 4C0N A; 1Y46 A; 1Y83 B; 5E29 B; 2HZ3 A; 1ABY B; 4M4A A; 1MYH A; 1JY7 B; 1J7Y A; 1Y4Q B; 1YGF A; 3LB2 A; 3PIA B; 1A6G A; 4FH7 A; 3HRW A; 1HGA B; 1XY0 B; 1HBA B; 1MKO A; 1RQA A; 2DN3 B; 1N9X A; 2V1F A; 5CNG A; 3BJ1 B; 3HEO A; 1CBM A; 3ZHW A; 1SHR A; 1N9I A; 1A4F B; 4WCH D; 2DN2 B; 1URV A; 3ARJ A; 1ABW B; 5EYJ A; 2QSS B; 5KER A; 1WLA A; 2HBE A; 1MYT A; 107M A; 3WCT A; 3OO5 B; 2OHA A; 3A5G A; 3WCT C; 3GYS B; 1YCB A; 2LH5 A; 2HBS B; 1V5H A; 4H2L A; 3D7O B; 2DN1 A; 1F5P A; 3AQ7 A; 3UHK A; 2Z8A A; 1MOD A; 2BMM A; 1Y2Z A; 5HLU A; 2HZ1 A; 1CPW A; 3MJP B; 1LH7 A; 3R0G A; 3ODQ B; 2OLP A; 5EUI A; 3OVU C; 1MOC A; 1C7D A; 3LQD B; 5B85 A; 2D6C A; 2W6X A; 2MGA A; 1YEO A; 1R1X A; 3MKB A; 1GDL A; 4DC7 A; 3ED9 A; 4ROL A; 3MOU A; 1BZ1 A; 1MLG A; 4N7O B; 1HLB A; 1EWA A; 1GLI A; 1BIJ A; 3FS4 B; 5EE4 D; 5KDQ B; 1MTK A; 2BKM A; 4F4O B; 4AVD A; 2AUQ A; 4U8U C; 1HBH A; 1GCW A; 1O1L A; 2QU0 A; 3P5Q A; 1Y0T B; 5CNE A; 2EB8 A; 2R4Z A; 4ODC B; 2XKI A; 1NPG A; 1RSE A; 1MTJ A; 1MLO A; 4NXC A; 3ARL A; 2ZLW A; 5F0B A; 3NML A; 2D2M A; 2CMM A; 1JWN A; 4MQG A; 1HCO A; 2QLS A; 1IRD A; 1OR4 A; 2D2M C; 3GQG B; 1YGD A; 1MLM A; 3WFT A; 1XZ2 B; 2RAO A; 4F6G A; 2D2N B; 3UHH A; 1C7D B; 1HGB B; 5B84 A; 3WCW D; 4MPM A; 3EU1 A; 1YEO B; 1HDB A; 3RGK A; 2HBG A; 4HHB A; 2VYW A; 1A3N A; 3G4U A; 4HRT A; 4TYX A; 1LFL B; 1HAB A; 2H8F B; 1FAW B; 1Y7G A; 1QSH A; 4G51 A; 3AQ5 A; 2LH7 A; 1BIJ B; 3E5I A; 3IC0 A; 109M A; 3UHX A; 1NWI A; 2V1K A; 3GKV A; 1UVX A; 2BLI A; 3WCP A; 5JGG A; 1Y5F A; 1MLN A; 2Z6N A; 1S6A A; 1HBH B; 1HV4 A; 3CIU B; 4MBN A; 1J40 A; 2BK9 A; 1Q1F A; 1O1J B; 1CQ2 A; 1YMC A; 1KFR A; 2Z85 A; 4IT8 A; 4MQJ A; 1G9V A; 1J3Y A; 2R4Y A; 1QSI A; 1RQ3 A; 1YIH B; 2IG3 A; 3NMM B; 1Y7C A; 2ZSO A; 3V2V A; 4MQG B; 1HCO B; 1A01 B; 2QLS B; 1Y8I A; 2MYE A; 4YU4 B; 1Y4R A; 1YCA A; 3DHR A; 1G0A A; 1FSX A; 1GBU B; 104M A; 1JF4 A; 4ZVB A; 3WTG B; 1MYM A; 3EOK B; 1OUT B; 1Y5K A; 3LB3 A; 1YZI B; 1Y45 A; 2ZS0 B; 1DWR A; 2R80 A; 1WMU A; 5D1V A; 1FDH G; 1HSY A; 1CLS A; 4MAX A; 2MGL A; 3GKV B; 5JGG B; 1Y5F B; 2ZS1 A; 1L2K A; 1LFQ B; 3AQ8 A; 2W6V A; 3ONZ B; 1QXD B; 1HBR B; 2ZS1 C; 1SDL A; 1XQ5 A; 2W6Y A; 4HRR B; 3OZV A; 3UH7 A; 4KMV A; 4H07 A; 3V2Z A; 2AUR A; 1O1P A; 5C6Y A; 2VLZ A; 1Y0A A; 1K0Y A; 4MQC A; 3OJ1 A; 3ZJH A; 2QFK A; 3AT5 B; 3QJD B; 4MU5 A; 4MQH A; 2ZST A; 1LFT B; 3NFE A; 4PQC A; 1GZX A; 4M4B B; 1Y7Z A; 1NGK A; 1HAC A; 4NK2 A; 3WCT D; 3GDJ A; 4OF9 A; 5AB8 A; 2E2Y A; 1DWS A; 1Y22 A; 1A3O B; 2BLH A; 4L2M A; 6HBI A; 1Y45 B; 1HDA A; 1HBB A; 3ZJJ A; 1JZK A; 1JP9 A; 3OO4 B; 3UHY A; 2QMB A; 1MBD A; 1M9P A; 2ZSQ A; 4O4T A; 1DXC A; 1MYF A; 1JF3 A; 1QXE A; 1K1K B; 2G0R A; 1DXT A; 5M3S A; 2D60 B; 1XZV B; 3SDH A; 1JP6 A; 2HHB A; 1NEJ A; 3PI9 A; 1Y4G B; 3WR1 B; 1SWM A; 1CG5 B; 1S69 A; 2PGH A; 3O89 A; 4N7P B; 1LTW A; 1SDL B; 2QRW A; 2HCO B; 1UMO A; 3FH9 A; 1V75 A; 4U8U D; 3GQP B; 3ZJI A; 3UHD A; 1LFY A; 2YRS A; 1KD2 B; 1FHJ B; 1XZ7 A; 5CMV A; 3ZJN A; 3PT8 A; 3AG0 A; 3WFU A; 5CHQ A; 2G14 A; 3GDJ B; 2O5L X; 3UHS A; 4X0L B; 2BWH A; 1YHU B; 1NS6 A; 3UI0 A; 1V4W B; 2D5X A; 2ZSX A; 1YEV B; 1F63 A; 1Y8H B; 3HC9 A; 3WCV B; 2D2M D; 2HBD A; 1Y0W A; 3G52 A; 5HY8 A; 2M6Z A; 2HBC A; 1SDK A; 1IBE B; 5JOM A; 4O35 A; 2ZSN A; 1YMA A; 1JDO A; 3MBA A; 4NI1 B; 5F2A A; 3HXN A; 1THB A; 1Y09 B; 2AV0 A; 4SDH A; 1EMY A; 1DXU B; 3OK5 A; 1J52 A; 1RQ4 A; 1SPG B; 1BZR A; 4FC3 A; 1IT2 A; 1MWC A; 1Y4B A; 1RPS A; 4VHB A; 1MBN A; 1JW8 A; 3UHE A; 2FAL A; 4MBA A; 1Y8W B; 1ECD A; 4HBI A; 2ZT3 A; 1Y83 A; 1VHB A; 5E29 A; 1MZ0 A; 1ABY A; 1ABS A; 1VXF A; 1JY7 A; 1Y4Q A; 3PIA A; 1R1Y A; 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2D2N C; 4NS2 A; 1DO7 A; 1YVT B; 2RI4 B; 1LFL A; 2G3H A; 3VRF B; 2H8F A; 3E5O A; 1FAW A; 5MBA A; 2AV3 A; 1MNO A; 2MB5 A; 3LB1 A; 2EB9 A; 1NWN A; 3KUN A; 1DUO A; 3ECX A; 3D1A A; 5E6E B; 1C7C B; 3OZU A; 1A6N A; 1BZ6 A; 1CH7 A; 1J3Z B; 5HU6 B; 2NSR A; 1NAZ A; 2ZSR A; 3CIU A; 1FSL A; 1O1J A; 2FRJ X; 1AJG A; 3VRE B; 2O5S X; 1YIH A; 1W92 A; 3NMM A; 1DLY A; 1ECO A; 1IT3 A; 112M A; 3UH3 A; 1IWH B; 1LHS A; 1A01 A; 2ZSZ A; 3OGB A; 2Z6T A; 1Y31 B; 1I3D A; 4YU4 A; 4KJT A; 1S5X B; 1U7S A; 3BOM B; 1GBU A; 3ORD A; 3R5I B; 1BVD A; 3WTG A; 1VXB A; 3UH5 A; 3EOK A; 3QM7 A; 1OUT A; 3ECZ A; 1ASH A; 2LH1 A; 1MLR A; 1XYE B; 1YZI A; 2ZS0 A; 1MWD A; 1XXT B; 2ZS0 C; 5IKS A; 1BVC A; 2ZT4 A; 5E83 B; 1GDJ A; 3D1A B; 1YHE B; 3A0G A; 4ZVA A; 3AT6 B; 2W72 B; 1B0B A; 1BZZ B; 2EVK A; 1LFQ A; 5EOH A; 1JL6 A; 1YOG A; 3ONZ A; 3QJE B; 1QXD A; 1HBR A; 4G1B A; 4HRR A; 3HEN A; 3GQR A; 2VYY A; 2ZT1 A; 1DO3 A; 1V07 A; 1CH4 A; 1A9W E; 1BBB B; 1GCV B; 1BUW B; 2NX0 A; 1BAB B; 1YIE A; 5CN5 A; 3AT5 A; 3QJD A; 3DR9 A; 2DXM B; 2OH8 A; 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