4PUE | Genus

Total Genus 148

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	148
sequence length	371
structure length	371
Chain Sequence	KPHISALNAPQLDQRYKNEFTIGAAVEPYQLQNEKDVQMLKRHFNSIVAENVMKPISIQPEEGKFNFEQADRIVKFAKANGMDIRFHTLVWHSQVPQWFFLDKEGKPMVNETDPVKREQNKQLLLKRLETHIKTIVERYKDDIKYWDVVNQVVGDDGKLRNSPWYQIAGIDYIKVAFQAARKYGGDNIKLYMNDYNTEVEPKRTALYNLVKQLKEEGVPIDGIGHQSHIQIGWPSEAEIEKTINMFAALGLDNQITELDVSMYGWPPRAYPTYDAIPKQKFLDQAARYDRLFKLYEKLSDKISNVTFWGIADNHTWLDSRADVYYDANGNVVVDPNAPYAKVEKGKGKDAPFVFGPDYKVKPAYWAIIDHK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Endo-1,4-beta-xylanase
publication title	Extracellulr Xylanase from Geobacillus stearothermophilus: E159Q mutant, with xylotetraose in active site. rcsb
source organism	Geobacillus stearothermophilus
total genus	148
structure length	371
sequence length	371
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2014-03-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4pueA00

1VJZA 1WDSA 2J25A 1FOBA 1CXIA 2W92A 3J7HA 3PZOA 1XV8A 4KRTA 3NSNA 2OYKA 1CBGA 1JF6A 3OLEA 4FLSA 2DSVA 4HOXA 1GW1A 4YHGA 1UQYA 3WH7A 3VUPA 1DWIM 2FHBA 2QPUA 4P7NA 3CUFA 4GO8A 1E9LA 1ITXA 2EBNA 2F2HA 3PZGA 1WDQA 3A3HA 3TP4A 1W1PA 1OD0A 2WMIB 1JD7A 3UR7A 4AD4A 2CESA 1JXJA 3VNYA 4Z2JA 4AISA 5FCZA 2F8QA 3GH5A 4W87A 1LWJA 1QBBA 3DHPA 1H2JA 3AMCA 3L4UA 3HN3A 4OOUA 1E5JA 4HA1A 1HJSA 5IHSA 3CHFA 3D5HA 3DC0A 1EOMA 1L0PA 1V0NA 4UQCA 5IFTA 1ISVA 3WDRA 1JNEA 1CYGA 4MAZA 1M03A 1R85A 4PRWA 5BXTA 3BAKA 1XYFA 1PBGA 3WSUA 3GM8A 3VM5A 1OM0A 4N0RA 1JIBA 2FH8A 4E8CA 5JIPA 1DWJM 1MVYA 3BCDA 4P8WA 2PI6A 5GNXA 4PYSA 3SUSA 3SUVA 1E3XA 3EBVA 3GXDA 2VQUA 1UKPA 1WZLA 2J62A 3PHAA 1MXDA 3EMCA 4CU6A 3MUAA 3AMLA 3WL0A 3N18A 3NYDA 4KGLA 4M80A 1BYCA 1D3CA 1H3GA 5D9NA 1J11A 1GOKA 1A47A 3UERA 2DDXA 1SMAA 4D1JA 3MUIA 2GK1B 4UQEA 3PZIA 2PB1A 1JYNA 1GHRA 1UKOA 3WD4A 2W61A 2G3NA 1UQZA 1O7AA 3LPPA 1P6WA 4LYRA 4PUEA 1HT6A 4NZCA 5GPRA 2OSWA 4D6DA 3W28A 1WPCA 4V27A 1M53A 4P8XA 1QOXA 3CH9A 2VRQA 4H04A 4AZ7A 4X9YA 3AQUA 4FK9A 1UD4A 1R7AA 4J3SA 4D72A 4OBRA 1U30A 5EB8A 1ODZA 3MANA 5BXRA 3WD3A 3QHNA 5IFPA 5IXEA 3PTQA 2WHMA 2VNCA 4PMRA 2XWDA 1UUQA 5FL1A 1Q6GA 4HMEA 2JF6A 1H1NA 3L4XA 2ZUMA 4GQRA 1UOKA 2BY1A 1M04A 2J4GA 1V3KA 1B9ZA 1OGBA 1X1NA 2DPEA 4F9JA 2YLAA 3AHVA 4K68A 1V02A 5BXSA 4RE4A 1AQHA 2XJ7A 3EDJA 4KMQA 1W3LA 2ZIDA 1E55A 3SUUA 1IT0A 3II1A 3CMJA 1UWSA 3VD9A 1ZJBA 2J7CA 3GYCA 1KCLA 2XVPA 4NSBA 1CGVA 3VINA 4JFUA 1X6NA 1E6RA 3UG4A 3VGDA 3W81A 4MB3A 5I77A 1MW0A 3MMUA 4A3YA 2ZXBA 1MFVA 5TD4A 3ZR6A 1XD0A 3BMVA 4J7RA 3VTRA 3WEMA 3N9KA 3ARXA 4H7VA 3WQ6A 4W86A 4W7WA 1VFMA 4QCEA 3W26A 2E8YA 3CGTA 3K46A 2HVMA 1E5NA 4H41A 8A3HA 3WQVA 3OZPA 2YL5A 2UY3A 1WO2A 1JNDA 2PWFA 1J0JA 1KXQA 1ZL1A 1MXGA 2E8ZA 3CPUA 1WZMA 2BS9A 2Y4SA 5AYBA 1E40A 1TUXA 4MPKA 5IDIA 3ZR5A 1ZU8A 3CUHA 3VO0A 1XSJA 1VFFA 2W5FA 1J01A 1JZ4A 5F7UA 1ECEA 3GXIA 5M3WA 4HP5A 2GJXB 4CD4A 3LPOA 2XGIA 3OG2A 4MTVA 2X8RA 4GPNA 3WL1A 4X0NA 3WQ4A 3L2LA 5A6LA 2XIBA 4UR9A 3W53A 2W4XA 3RJXA 2ZUWA 3WFZA 3AS3A 2YL8A 2O9PA 3WF2A 3A6OA 3AZSA 3VIPA 5BYWA 1HN1A 3RIKA 3WDQA 5JBDA 2PF0A 1JZ3A 3HU7A 1BAGA 4Z2HA 1H0IA 2ZX6A 3QHMA 3M46A 2ZXQA 4GI6A 4CN4A 1MW1A 2WYSA 2RGMA 4AZIA 1OBAA 2J7BA 2DGAA 2JIEA 5ABFA 1V03A 3QGVA 1UWUA 1UR0A 4ZXOA 4D6EA 2WANA 3RPMA 3BXWA 1H4PA 4LQ1A 4PMNA 1UWIA 3AIVA 4V28A 4M29A 2VCAA 1EOKA 4XZBA 1UZ1A 3BAJA 1KXVA 3G6LA 2ZX7A 5AC5A 4IPNB 1MW2A 2VZVA 2PC8A 2GVYA 1ZS2A 4U33A 2WMKA 1H41A 1JZ8A 1CDGA 7TAAA 4P7OA 1GQIA 1VRXA 2X0HA 4DWSB 3VDCA 2IXVA 3SEPA 2XFRA 3CO4A 1XRVA 2PWHA 3IJ8A 1E6QM 1HXJA 1TMQA 3ARQA 3QOMA 4HU8A 1ZBVA 1OGSA 3PBGA 3T0BA 4D6HA 2QHAA 4ZENA 1UZ4A 2VX7A 4MNKA 2FGZA 5BWFA 2BVYA 3W25A 5ABGA 4GQQA 3I3EA 1RD6A 3GNPA 3UEQA 1J0IA 1UR4A 1PAMA 1TA3A 2YOCA 3ARUA 1E0XA 2WZIA 2Y5EA 2DIJA 2VZOA 3IANA 2XM1A 1DWGM 2WPGA 4EAMA 2EPMX 3VILA 4IUGA 1W1VA 2QMKA 3MKKA 4PCTA 3SCUA 3BGAA 1QNOA 2D2OA 2ZUVA 2VZUA 3WF0A 2FGLA 1I1XA 2VRKA 4Z2LA 2CXGA 1E4MM 1X6LA 1UHVA 5CPTA 3HJEA 4UTFA 1W2VA 2YA1A 1FHLA 4NRSA 3GH4A 1V08A 4MB1A 5A8MA 7A3HA 4UFHA 1VAHA 3K4AA 4KRUA 1C3FA 2O9TA 1BSIA 1E0VA 4B16A 1WB0A 1JI1A 2XWEA 4CCDA 1E6XM 1U2YA 1K9TA 2AOSA 4U5KA 4PMXA 3ZSSA 2G4FA 5D8WA 1J0KA 1VJSA 4MJ4A 5FD0A 3UETA 3WDHA 1VFUA 1QNRA 3TOPA 3EMQA 3QHOA 5I78A 5A8OA 2O92A 3WNOA 4MDPA 1EGZA 3W0KA 2CPUA 4Z2KA 1XCWA 4Q7NA 1WP6A 2ESCA 4AZ5A 5CGMA 5EMYA 5I79A 2MANA 4OIFA 3WKZA 4BZYA 2GSJA 2WWCA 1UD6A 3RMEA 1Q6EA 1R8LA 4B15A 5JBEA 3WQWA 3K4DA 1TVNA 1OIMA 1W9PA 3IJ7A 4FF5A 3TTQA 3AIRA 3MV01 3DYMA 4EE9A 3AMDA 2PWDA 1JFHA 4HPHA 3CUGA 4CU8A 2J74A 5CSYA 1NOFA 1LL6A 1QW9A 2WMGA 3W4RA 2YA2A 5A94A 5LA0A 4HMCA 4QLJA 3CTTA 2WVTA 1BYDA 5D4YA 2XHYA 2Y24A 1ESWA 1V02E 3N04A 1PX8A 4LYPA 5HDRA 2BVTA 4UNIA 1HJQA 2BHUA 4CVWA 1C8QA 1EHAA 2J7FA 4DUVA 5BRPA 3WELA 3FW6A 1DWHM 1M01A 5DFAA 4ZFMA 1PIFA 1JAKA 1W9BM 3WF1A 1H11A 1UH3A 1NARA 3IK2A 5I6SA 2XFYA 3WUGA 2PWEA 3WUBA 4AXNA 3F5JA 3KEHA 1JZ5A 2JIWA 1EO5A 9CGTA 1CENA 3N11A 2A3AA 3ZT6A 4MNMA 2QPSA 3WNLA 2BHZA 4HPGA 5DO8A 2ZX8A 1TZ7A 1W1YA 1BG9A 1UG6A 3N1AA 3VGGA 2WZEA 1PIGA 1FP8A 3A47A 2VTFA 1VBRA 1UWRA 3CZKA 3TONA 1JZ7A 2AMGA 1B3VA 1VEPA 4J3WA 1N82A 2ZUNA 3PTKA 4AW7A 1OWQA 3EMZA 3WNKA 5JUVA 3SCTA 3NJ3A 4PMUA 4MJ2A 5D9MA 1NH6A 2QMJA 3GH7A 4URIA 1W1TA 2J79A 2ZXDA 3OGSA 3CZEA 4UQAA 3NCOA 1QHPA 5A2BA 5A69A 2A3BA 3GTNA 2CERA 3O9NA 4AIEA 2BY3A 3AHXA 2WB5A 3ARVA 3KZSA 3MUY1 5CXPA 1JYVA 3NIYA 2WHLA 5I2UA 2F61A 1UA7A 4J3TA 3QR3A 4W7VA 1LG2A 4PMDA 3WUEA 4WIWA 1CPUA 1KQYA 2Y2WA 2CETA 4JFTA 5A6BD 1PJ9A 4JFWA 1EXPA 1E6ZA 2EXOA 2OWXA 4ATLA 1CZ1A 3EDEA 3IJ9A 4N42A 5CZKA 2A3EA 3M6DA 1OD8A 4HOZA 1C92A 4PMQA 1GOIA 1RPKA 1FH7A 2D1ZA 1IZJA 1MFUA 5CPSA 6A3HA 2XTKA 1QHOA 4AD0A 2J47A 4QCFA 4M81A 3ARRA 1HVQA 1WZAA 2WVVA 1C7TA 3GXMA 1HKIA 4YPJA 3BAIA 1JDDA 1FHDA 2XG9A 2PBGA 1DP0A 4UQBA 1VBUA 4JL2A 1NOUA 1A3HA 4PTMA 5C71A 1QI5A 2XVKA 5E0CA 3F4VA 5DT7A 1HKKA 4JHOA 3WDIA 4F66A 1NWTA 1UR9A 3WENA 1GCYA 5AC4A 2CCRA 3AZTA 4OZOA 3BCFA 3BSGA 5HNNA 1XGZA 2ZX5A 5D8ZA 1ZB5A 4FLQA 1EO7A 1FH8A 1M7XA 1UD5A 4OBSA 3VOCA 3WN6A 3T0DA 4AC1X 4EK7A 2BHYA 1HL9A 2IXUA 5E09A 1Z32X 2DT0A 4CKQA 2VT0A 3WUFA 4XZWA 1VF8A 1F4AA 1ISZA 2EQDA 2UY4A 4HA4A 1GUVA 2ZUSA 2AAAA 4UFIA 2DSWA 2YA0A 1SYTA 5E9AA 4J3UA 2WBKA 1E1EA 2YDSA 4V2XA 3WEZA 4AIOA 2FH6A 1QNPA 4RL3A 5CJ5A 4W5ZA 5LA2A 4CD6A 3B9EA 4M8UA 1MQPA 1R87A 2E40A 4D6IA 3CZLA 3VVGA 1E56A 1CECA 3L4VA 2CBUA 1JAEA 1UWTA 1C93A 3AIUA 2YDRA 2V5CA 3MUZ1 4H8HA 1B0IA 1GJWA 2D23A 1AMYA 3I3BA 4M56A 2WVSA 2YBTA 4XB3A 3WNMA 3WEOA 1JZ6A 5DT5A 1GORA 3GBDA 2JEQA 3PN8A 4GZIA 3MMWA 3CBWA 1VEMA 3NUKA 1XH0A 3HMCA 1KGXA 3SIMA 4HTYA 4PTXA 1CXHA 3L4YA 4D6CA 4HZ8A 3SCVA 1JYXA 1B31A 3GZAA 2DT2A 2OSXA 4MAVA 1Q6CA 3ECQA 2FHCA 4WK9A 4TVUA 1XC6A 1NQ6A 1XHGA 3TTSA 3VIJA 3BLKA 3POCA 2CEQA 4UQ9A 2WMJA 3POHA 2CKRA 3A4WA 4U2YA 1E6SM 4AWEA 3S2CA 4BQ3A 1KQZA 1NOWA 4M1RA 1CGYA 5HPOA 5A2CA 1CGWA 2DQXA 1DEDA 2UY2A 1CGTA 3WFLA 3ZM8A 3APGA 4WKHA 3CZJA 3OGVA 4FMVA 3PZ9A 1E72M 2CHNA 4KWUA 1GJUA 5LA1A 4W5UA 1V3IA 4OJYA 4TX6A 3U57A 3OGRA 1GVYA 1HL8A 3ZJ8A 3SCOA 4UOQA 2VUYA 4BQ2A 5A6JA 3O6AA 2BY2A 4PTVA 5M03A 4WJXA 1VIWA 1GQKA 2IUZA 4ATWA 1J0YA 2D22A 4S3KA 3VPLA 3ZO9A 1BVZA 3THCA 1NWUA 1WNOA 2X1IA 1GONA 2C8NA 2CNCA 1EHNA 1W2PA 3VIFA 5ABFB 4PEEA 3VU2A 5FIPA 3VNZA 3VX1A 1QBAA 1HJXA 5JIWA 4H8UA 1K6AA 3WBAA 1C91A 5ABHA 1VENA 4AEEA 2VQTA 1BGAA 4HA3A 4OUEA 1WDRA 3T2OA 2QV4A 4UOJA 1XYZA 4W8AA 4AZ6A 3VIMA 1E4IA 4TTGA 2J78A 5HPCA 4EANA 4TVCA 2GDVA 3BC9A 3WQ8A 3VD7A 4GKLA 3VMPA 2WCAA 4QLLA 3W6MA 4CN6A 4JZ5A 1G94A 5BRQA 4CU7A 3GNRA 1EH9A 3AMGA 4W89A 3LMYA 3SUTA 1NP2A 1QI3A 3DYOA 3O2LA 2G3MA 2XPKA 1ZBKA 3AISA 1H49A 6TAAA 5CSUA 5E70A 1L8NA 1KWKA 2ZUTA 3M7SA 3CIVA 1AQ0A 4E2OA 4TOQA 5D9OA 1OSEA 4AMCA 2XVNA 3K8MA 4UZUA 1YQ2A 4EKJA 3AJ7A 4BQ4A 1EDGA 3MV11 7CGTA 1G0CA 2WAGA 4L4PA 1BFNA 1V6YA 2EPNA 4W8LA 1B3WA 4M24A 4DUXA 2DH3A 1HJWA 1QI0A 3VIOA 3ARPA 1BVNP 2G8ZA 3NSMA 5DF0A 1Q6DA 1PEZA 3GXFA 2NSXA 3SCSA 3T2PA 5GNZA 3WH8A 1CIUA 5CG0A 4WKAA 4A3HA 4IM4A 2C7FA 1OCQA 4U3AA 2J8GA 1E4LA 2DIEA 2VL4A 4JFSA 1LF1A 4D71A 3CUIA 1JF5A 1MWOA 1GHSA 3U7BA 3GNOA 4UFJA 3AIBA 2J7HA 4RE2A 2J7DA 4P7RA 4JCMA 2VVNA 3PZVA 1DWFM 3AMKA 4B9YA 5A6BA 2EJ1A 1UR2A 4DWSC 4Y7EA 4BS0A 4B3KA 4ZE5A 1UA3A 3FHAA 1UD3A 2E9BA 1EDTA 4CUCA 1B3YA 2WC3A 3PZUA 1MYRA 3K8KA 4UFMA 4Z2GA 5A8PA 3VX0A 1PZ2A 4AZCA 3CZ8A 1J10A 4HU0A 1C90A 2DT1A 4LYQA 2D20A 2EO7A 4J3XA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2YBU A;  1LJY A;  3VDB A;  3FN9 A;  1HJV A;  1EA9 C;  4GIA A;  2Z1S A;  1SFS A;  3UCQ A;  5E6Y A;  5EBA A;  1GPF A;  1MQR A;  1KGW A;  1E43 A;  2WWD A;  2B31 A;  1UR1 A;  4UZS A;  4W7U A;  4C7D A;  1GQJ A;  2BY0 A;  2GUY A;  2J77 A;  1U33 A;  1FFQ A;  2ZOX A;  2DEP A;  3LPF A;  1CLV A;  2DSZ A;  1US2 A;  3WH5 A;  4S3J A;  1OT1 A;  1WDP A;  4YHE A;  3KWX A;  5A1A A;  2DSU A;  4PTW A;  2Z1K A;  1E4N A;  4P8V A;  3OB8 A;  4AYS A;  1QI4 A;  4Q22 A;  4W84 A;  1B3X A;  1O6I A;  1GOM A;  3AIC A;  3W6L A;  4GIN A;  1D7F A;  4JKL A;  4X0V A;  3AXH A;  4OKD A;  4ACZ B;  3U7V A;  2VX4 A;  2V3F A;  3PZM A;  3VGH A;  3W24 A;  4ACY A;  1JDC A;  1J12 A;  1UYQ A;  4J27 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4PUEA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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