4PX1A

Crystal structure of maleylacetoacetate isomerase from methylobacteriu extorquens am1 with bound malonate (target efi-507068)
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
SMVKMYGNWRSAAAFRVRIALNLKGIAYEEVFLDLDAGDQHKPDFLAINPQGAVPALFDGDGPPLTQSLAILDYLEETRTGVPLLPEEPRARARARSLAQVVACDTHPLYVPRVRTFLMENYGLPRERMLEFLRNAFITGLKTLETRLSNEAGTGRFCQGDAVSHADLCLISLWVGTGIFGIDTAAYPTVKRISEEVLALDAVARAHPLRQPGAPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Maleylacetoacetate isomerase (Glutathione S-transferase)
publication title Crystal structure of glutathione s-transferase zeta from methylobacterium extorquens (TARGET EFI-507068)
rcsb
source organism Methylobacterium extorquens
total genus 75
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4px1A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4px1A01
3TJFA 3LYKA 1SENA 3H1NA 1XFLA 3F63A 3MSZA 2QSIA 2AUVA 3HKRA 2MBSA 4TR1B 1Y6EA 4KUNA 3QOUA 3BBYA 3G9BA 3FW2A 2TIRA 1M2DA 1XOBA 2GQLA 2B3SA 3F4SA 2WDUA 4O5RA 3U6VA 2XHFA 5JWRB 2JSYA 1OVNA 3VI7A 3FHKA 4LL1B 1VF3A 3IBHA 3UOMA 4EUYA 3C73A 3VWWA 3DIEA 3HCZA 2G2QA 4P3YB 2R3XA 4CHSA 1OC3A 2LSTA 3R3EA 4D73A 3MDKA 2FLSA 3WGEA 4JRRA 1OYJA 2AJQB 2ES7A 1TK8B 2LQQA 1VF1A 3CSIA 3H8QA 2V32A 3LFLA 1AC1A 4MZCA 3TKSE 3A5WA 4NWYA 3VFIA 4L8EA 4QQ7A 4PURA 3ZIVA 1AAZA 5C00A 3IDVA 5IMZA 1ZYEA 4PGTA 2XBIA 1GSDA 2DMMA 1R26A 2PGTA 18GSA 1T4YA 5ENUA 1THXA 3WT2A 1T00A 3GL5A 1PL2A 4HQSA 3KTBA 4IP1A 1ERWA 1TI1A 2I4AA 1SK2A 4IVFA 4HOJA 1JHBA 1ON4A 5KN1A 3PPUA 3ZL5A 2RM5A 3UBKA 1URMA 5LD0A 3ZREA 5J41A 1SU9A 2H8LA 1SKSB 4I6XA 1AQVA 4HJ2A 2H66A 3A2VA 4HU7A 3LG6A 1YEPA 5COHA 1THOA 2IMKA 3DXBA 4GF0A 3C7MA 3EURA 4CW9A 2PUKC 1TK0B 2RLIA 4L5LA 1PD21 2N5FA 3HYPA 4NHWA 1M2BA 4ECCA 5FT3A 5CRHA 2ZNMA 2EIQA 3NIVA 4ZBDA 1TOFA 4XS4B 3CYNA 22GSA 4ML1A 6GSWA 2KP1A 1UA5A 3HJOA 2FY6A 3ZZXA 2DJ0A 1H75A 3I9V2 4PNGA 2KLXA 3VK9A 5B6NA 3L9UA 2P5QA 2DJ3A 3U5RE 3HJMA 1EOHA 4O7HA 1AW9A 4FH8A 3BCIA 4PUAA 5H5SA 5IQYA 6GSXA 1XWCA 1K3LA 1O73A 1CQGA 5LCZA 2HRKA 4DSRA 4GSNA 5IOXA 4ACSA 4LMVA 2IMIA 4MP4A 3LSZA 4POLA 2GZPA 3DEXA 1S3DA 2OJLA 2IWTA 1X9WB 4HJMA 1K0BA 2C0EA 4ZL8A 4I8BA 3C8EA 1O85A 1G0TA 2ALBA 5AIXA 4N30A 6GSUA 4TOPA 2LNSA 4HEA2 1TKDB 2GTUA 4WF4A 3QAVA 1XW5A 1SJZA 3S9FA 2OACA 4NMUA 1MDJA 2HSYA 4EE0A 1W89A 1KBNA 3RHCA 1IYHA 3GKXA 4AJ7A 3BOAA 2MMOA 4O92A 1TP9A 1AQWA 1ZOFA 1SL2B 2H1AA 2DLXA 3QMXA 2CZ2A 2H6YA 2N5AA 4DSSA 1T3BA 2I9HA 4JBBA 3WGDA 2QGVA 1EV9A 1Z3EA 5INYA 5IMAA 3KMNA 5B8AA 2DJ1A 1OAZA 1ZMAA 1PX6A 4KA0A 4TKYA 1ZCPA 1T1VA 12GSA 4OCEA 5GSSA 4IS0A 1OE7A 2LTKA 1N2AA 5EL8A 2GZYA 2VLTA 1ST9A 2VD1A 3Q6OA 3IK7A 2E7PA 1GTIA 2LRNA 2HXKA 5D73A 1A23A 1KNGA 1M99A 3FZ9A 2YCDA 3LWAA 4QL9A 5C04A 4TN8A 2C0FA 1PA3A 3GURA 3F3QA 16GSA 2O8VB 2IPAA 5IPGA 3GSSA 4IP6A 5FWGA 1K0AA 3W8JA 1FW1A 1G6YA 2B5XA 2MMZA 2IIYA 2HE3A 2LRCA 4YQUA 3TB2A 3O3TA 3Q18A 4XIHA 2HRFA 3UVTA 4ULXA 2H6XA 4H86A 4PTSA 1UVZA 4MF5A 1N8JA 1G6WA 4KGIA 1XBSA 3ZITA 4BWSA 1EWXA 3KGKA 3ZLPA 5KEJA 5CRGA 5HFKA 3P90A 3W8SA 5J9CA 4IJ3A 2PN8A 2CAQA 2QC7A 3DRNA 5HR2A 2RUEA 1QK8A 3APSA 4XCSA 1FG4A 1TRSA 3FRCA 2G0FA 4OO5A 4NPBA 3TKPA 1R7HA 4WXTA 1FB6A 1BJXA 2FA4A 1PN9A 3UMAA 2WJUA 4ILFA 1BX9A 2AV4A 3ED3A 1MEKA 1NM3A 1T8EB 3P7XA 5DALB 5F0GA 5FHIA 4ZXGA 5DJLA 5KN3A 5IO0A 2HZEA 5A5KA 2VUPA 1QMVA 5ECSA 4OWYA 5D9VA 2KHPA 4NAXA 4IHUA 4DSQA 1WWJA 4MH2A 4G2EA 1F37A 3ERWA 3DVXA 1XWAA 3DMLA 5CP1A 3TRQA 5IMVA 3KJYA 2DIYA 3KP8A 1S3CA 3ZRDA 3HHVA 4ZBAA 4GSTA 3K8NA 4ZILA 2HLSA 4V2MA 4HQZA 4WBJA 2B7KA 2H75A 2K6VA 1U3AA 4HUAA 4MH3A 1XW9A 3IXRA 2OA7A 3FYGA 1XIYA 2H01A 1BYEA 2YZHA 4BPYA 4EF0A 1KTEA 3F4RA 3HVSA 1PX7A 1MD4A 3HXSA 1VF2A 4E8EA 4IQAA 2MYGA 3FY7A 3C1RA 2AYTA 4F03A 3GMFA 4LMWA 2KUCA 1EEJA 2XPEA 3LYPA 3EINA 8GSSA 1B9XC 2JZRA 1NHYA 2OE3A 1EGOA 5HR1A 2GSSA 1ERVA 3D4TA 1MD3A 4N10A 5JCGA 3LQ7A 1PGTA 1JFUA 4LL4B 1RW1A 2HNLA 3WGXA 1M9BA 1FVJA 2HFDA 3UJ1A 2JL4A 3EMXA 1XCCA 3DD3A 5D9TA 3LORA 4F9ZA 2H73A 4BA7A 1Z7RA 1Y25A 1XPVA 4J57E 3ERGA 3APOA 2HSNB 2PVQA 4IBPA 1JZOA 4RQXA 4XHMA 1OE8A 3M0FA 3ZFBA 1DUGA 4N0ZA 1WE0A 5DCHA 3NZNA 1F3AA 2EIRA 2LV3A 2PVOC 1B48A 2X8GA 4ECJA 1HNBA 5GAPD 5D96A 3GV1A 1QGVA 4HZ4A 5G2ZA 2I1UA 3TKRA 2VCZA 3TRPA 1LBKA 2IN3A 17GSA 1AXDA 4V2LA 1C72A 1JZWA 3BCKA 3FK8A 3GUSA 1Z7PA 1ACVA 2YWMA 4Q5RA 5DJMA 2WCIA 4ZL9A 4JEDA 2UZ8A 4NXIA 4WETA 5ECPB 5GAND 2E0QA 2X99A 4KDXA 5IMFA 2C3TA 3DVWA 3GKKA 5CRWA 5ECMB 2H1BA 3GL3A 3ME7A 2HT9A 4XS6A 2ZUPA 2DJ2A 1TJDA 3HDCA 3ZVJD 5J5NA 2L59A 2ON5A 3ZVJA 3KH7A 3V1WA 5IO2A 4V1Ap 2CVKA 3Q74A 4K7NA 2YWIA 3M1GA 3F4TA 2DJJA 1PQNA 3UEMA 1O81A 3US3A 1K0MA 4POMA 3H93A 4Z7XA 3M8NA 1CQHA 4MDCA 3ZFLA 1R5PA 2CT6A 4AJ6A 4XS4A 3QAGA 1B9YC 1BG5A 4BL7B 1X9MB 3TOUA 1HYUA 2V6OA 1SK1A 1M0UA 2HSMA 1O6JA 1GSQA 2FWFA 4RQRA 3GH9A 2JACA 1K0OA 1UC7A 1B4QA 2F8AA 1NW2A 2H70A 1TU7A 4TW5A 1O8WA 1V58A 2L6CA 2EIOA 3GKMA 1XWGA 4JR6A 3TRXA 5DAKA 3IHQA 4KH7A 1TRWA 2PBJA 2OE0A 1SJ6A 4EDYA 4QL7A 1TK5B 2FGXA 5KN0A 2HSMB 3M3MA 2MBTA 3MAKA 4IN0A 2A4VA 3MNGA 3QFAC 4BVXA 3GX8A 1FO5A 2RM6A 3E0UA 2JZSA 3GKNA 3VPTA 1SYXA 2H76A 3RPPA 4I2TA 6GSVA 3ISOA 5J3RA 5DAKB 5IOWA 4RI6A 4CDOA 4GXZA 2O89A 4POKA 1GTBA 1QFNA 1GSYA 2QKEA 1K0CA 1Z6MA 4BVXB 1F6MC 4ZB9A 3CTGA 3ME8A 3D5JA 4MF6A 2WS2A 5DQYA 4X0XA 2FUG2 2JU5A 1X5DA 3D4MA 4MJBA 5G5EA 1SYRA 5G5FA 2PWJA 2CX4A 1OC8A 3HJPA 5HR0A 3IC4A 5CYYA 2GSTA 3Q19A 3L4NA 3P2AA 4KAEA 1GH2A 3HZ8A 2H0GA 1I5GA 4KX4A 3L9VA 2WZ9A 1MDIA 5ECNB 2X8CA 4ECIA 3D6IA 5JWOB 2YV7A 3GN3A 2H74A 1W4VA 2E2MA 1WP0A 4G0IA 1AUCA 2L4QA 2BJXA 2OKAA 2H72A 1R5AA 2NVLA 3VPQA 4ZB8A 2YJ7A 4Q5FA 2H19A 3MWHA 2DSAA 4MA9A 2CQ9A 2M72A 1NSWA 4Q5NA 2C8UA 3ZTLA 4JU5A 1F2EA 3LGCA 3HA9A 2BTOT 3UIWA 1X9SB 4GSSA 3UVHA 2GSQA 4N0VA 2E2GA 3KXOA 3TGZA 4WKWA 4HDEA 1XVQA 1ZYQB 4USSA 1SD9A 5G31A 1J9BA 5CREA 4V2NA 4K6XA 2LUSA 4HU9A 1GTUA 2NPBA 5ECIB 2GT5A 3JCML 4JR4A 1FVKA 1A2LA 2O87A 3VLNA 2B7JA 3GYKA 4EXJA 2JSZA 4MJCA 2CAIA 4TR0A 2L5OA 4KB3A 4MJAA 4XS1A 5CRDA 14GSA 1WIKA 2C3QA 2YNXA 1TI3A 4XTSA 1GUMA 4PQIA 1JLVA 3GH6A 2HSHA 7GSSA 3N9JA 3UARA 3CRTA 3E3EA 1YF1A 1GUKA 2GLRA 4KSMA 3OR5A 5E4WA 4KCAA 4K7OA 3QDNA 2V41A 1H4OA 2B5YA 4MCUA 4ZIJA 3IK9A 2C0DA 2O85A 3KEBA 3RHBA 5DALA 1TDIA 2OBKA 4KNDA 4MJEA 1XVWA 2O7KA 2PPTA 4G10A 3GIXA 1PRXA 3CMIA 2YPMA 1GLQA 4F2IA 5AIVA 4EDZA 2YJHA 2LRTA 2M80A 3ZIJA 3O6TA 1FB0A 4K7IA 1YJ6A 4FO5A 3W6GA 4G19A 2IL3A 1QQ2A 1RK4A 4FIWA 3CSJA 1YEXA 3F9UA 3FZ5A 2OE1A 2YWOA 5ID2B 1XW6A 3EYTA 4L5OA 1WMJA 3EVIA 2L6DA 2MMNA 3D0ZA 2VM1A 1IYIA 3CRUA 4I97A 2C80A 1SK0A 3CTFA 3L9SA 1ZGNA 3LJRA 1GP1A 2Z9SA 3KCMA 2GQKA 5D9XA 1BQ7A 4PNFA 1OC9A 2VCTA 1WRYA 1PKWA 1V57A 1A0FA 4Q5QA 1SD8A 5JWQB 1HNCA 5ECKB 2XPDA 4IJIA 2B5EA 5L71A 4GWRA 5BMUA 2B1KA 5EVOA 4PQHA 3VWXA 10GSA 4L0WA 1DE2A 2YOIA 4IGJA 5DVBA 2XC2A 2N5BA 3TKSA 1K0DA 1U6TA 2REMA 4DEJA 1Z9HA 1OC9B 3VWUA 20GSA 1ILOA 4PXOA 3KZQA 3F3RA 5ECHB 3UL3A 5AGYA 4KDYA 1EV4A 3HVXA 1GSSA 5D8IA 1YY7A 1Q4JA 4WR4A 3IE3A 3QR6A 4KW6A 1A8YA 1OKDA 2VL9A 2VCQA 1QXHA 4KF9A 3F6FA 2WRTA 4WEYA 2AHEA 1M2AA 4AF2A 5D9WA 4K2DA 4PQ1A 1XXUA 3C1SA 3QPMA 3QAWA 4F0BA 2GGTA 4GTUA 3TDGA 3R2QA 4TXOB 4BVYB 1ABAA 1EGRA 1YKAA 2I3YA 3EWLA 2VIMA 4J56E 3N5OA 1K3OA 1QUWA 3I69A 3IAS2 5B8BA 3IR4A 4BWQA 3AY8A 3IV4A 2B6MA 2A2SA 1DSBA 2C0GA 1TXXA 2CZ3A 2ZCTA 1TTZA 5IMDA 4V1Ag 2NDOA 5ABRA 5HFGA 1YZXA 4MZBA 2H6ZA 4WR5A 2FD3A 2AB6A 4F82A 1GSEA 1M7TA 4FYUA 4ZBBA 4GCIA 2V6KA 3KM6A 1USBA 3D21A 4F0CA 3G7JA 1GSUA 1GLPA 3BJ5A 3IC8A 2VO4A 1G7EA 3RAZA 4NV2A 3FR9A 2NTOA 2VL3A 3C71A 2PU9C 1DBYA 2VCWA 5ECRB 3KH9A 1GNEA 1S3AA 1FAAA 6GSYA 1GNWA 4JZQA 4PX1A 2A2RA 1F9MA 5H5RA 2KOKA 1Q98A 3GNJA 2GT6A 4EKZA 3TJJA 5JCWA 5H5QA 2J23A 2NBSA 4J2FA 1U3IA 1PMTA 5F06A 4YAVA 5B7CA 5CO3A 3ZYWA 1SKWB 6GSTA 1ERUA 1E6BA 4TRXA 3LXTA 1K0NA 4YH2A 3TCOA 2DJKA 1EOGA 2H1DA 2JZTA 1I9DA 2K8SA 4FQUA 3EE2A 2GSRA 4ML6A 2I81A 1PSQA 4DVCA 2V1MA 4I2UA 3WD6A 1YF0A 4BL7A 3KIJA 4K0GA 4EVMA 4TR4A 2VD0A 1XZOA 2VCVA 4MMMA 1DE1A 3CXGA 5GSTA 1VF4A 1MDKA 2C3NA 3F8UA 4D73B 1SL0B 3QFBC 3RPNA 4MPGA 3QD9A 2VAFA 3KTLA 2C4JA 4RUVA 1WPIA 1V98A 1JZDA 3GRXA 2IFQA 2HZFA 4IQ1A 1GWCA 4IKHA 3ERFA 2LQOA 1TRUA 1JZRA 5IM9A 2VLUA 3O76A 5G30A 3HZ4A 1GTAA 1EP7A 5IPHA 1FHEA 3KMOA 19GSA 2B1LA 1EEMA 2C1YA 4TVEA 1E2YA 2GDRA 2HRNA 1RQMA 2DBCA 3GSTA 6GSSA 3L0HA 1SKRB 2F9SA 2IFQB 2FWHA 4TXVA 5IIZA 1LU4A 1K3YA 1U88A 3APQA 5EPFA 2P0GA 4WBRD 2WGRA 2WB9A 2VM2A 2LKUA 1WOUA 2GVPA 1T7PB 1ML6A 5AN1A 4TR3A 4MABA 1ZL9A 4HI7A 2FWEA 2YANA 3H79A 4ZL7A 3RBTA 3LXZA 1V40A 5ELAA 2XBQA 5D93A 3PINA 2AAWA 2CV4A 2EC4A 1PL1A 5A4WA 3FR3A 4ID0A 4AGSA 3H4KA 1MTCA 4OO4A 2DC5A 2DIZA 3RDWA 1GL8A 5DQSA 4K8MA 3J7Yk 2MZCA 5LNKe 4HZ2A 1O7UA 2LS5A 1AIUA 1SJIA 4NHZA 1NHOA 2F8FA 3M9KA 2IJYA 4LA1A 3EMPA 2CA8A 1XOAA 3BD2A 3HD5A 1O8XA 2PMTA 1YDKA 1YQ1A 1AQXA 2GS3A 2M46A 4I5QA 3VWVA 1V2AA 1JLWA 5J9BA 2L4CA 4HS1A 1T4ZA 3KP9A 4AJ8A 1YKCA 2HRKB 3CSHA 3A2XA 5F05A 4POBA 4YAPA 5B6MA 5DDLA 2FNOA 3SWLA 3EU4A 5GZZB 4FYBA 5HR3A 2CVDA 2LJAA 3CBUA 1F3BA 1HQOA 4KE3A 4EL1A 5F07A 3TKQA 4OCFA 3HVVA 4OFMA 3TOTA 9GSSA 2H30A 2OBIA 1A8LA 1EZKA 3UBLA 4G9HA 3GTUA 2HYXA 4ZB6A 1GRXA 2VLVA 1G7OA 3A3TA 3PGTA 2L5LA 4MK3A 4NV5A 4N11A 1ZZYA 2P31A 1Z6NA 4MLYA 3IOSA 1X5CA 4E8HA 5EY6A 1GULA 4RI7A 4ISDA 5G1LA 3GA4A 2WULA 4IW9A 4DSSB 3DGQA 5A4VA 5CNWA 4EO3A 2IMDA 1LJRA 3GTUB 2LJKA 1KEBA 1HD2A 1J0FA 2HQTA 5J4UA 11GSA 1A2JA 3HY2A 2MMAA 2TRCP 1VRSD 2FWGA 4OD7A 2D2ZA 4MPFA 3NOFA 1OKTA 2K18A 4JE1A 5CAXA 1R4WA 4ECBA 3FR6A 4WF5A 2LNTA 4IELA 3G7YA 2VL2C 3LEFA 2OADA 2R37A 5ELGA 2RUFA 2R5GA 4YQVA 1FOVA 1V9WA 2IMEA 4XRDA 4XRAA 1M9AA 1GUHA 2KP2A 2WFCA 5ID2A 4K0NA 5A4UA 3TKSC 3DWVA 3L78A 4OFNA 1B4PA 2GQMA 2X8HA 3WYWA 2RIIA 2H1GA 1UN2A 5E59A 3IRAA 2V2GA 1PKZA 2JADA 1BAYA 3KD0A 4L0UA 4G0LA 2CX3A 4OFTA 5F8BA 3EU3A 3TJBA 1B8XA 2PERA 1BEDA 3UAPA 3F6DA 3G7IA 5DBQA 3D22A 1VGLA 3ZMLA 4OMVA 3EC3A 4KCEA 3IPZA 2IMFA 4KSOA 4O32A 4X43A 3TUEA 4PUFC 3I43A 3FEUA 2TRXA 5ECOB 1HNAA 2YWNA 3ZMKA 4YQMA 3PH9A 3TJKA 2VCXA 2CVBA 2VL2A 3FZ4A 1X5EA 3I6AA 4K9ZA 2ON7A 1XWKA 4EC0A 1SL1B 1TW9A 5G1KA 3IA1A 4FYCA 4GQFA 2HRAA 2FA8A 2F51A 3P8WA 5AISA 3QCPA 1WJKA 3J7Yb 1J08A 4GRFA 1A0RP 2LJRA 1EP8A 3F0IA 3SBCA 5KN2A 4TXOA 4BVYA 3IAM2 2H0IA 3PR8A 2J9HA 4X1UA 2HZEB 2GZZA 4K1FA 5HFIA 1A24A 3GX0A 1A2MA 3WT1A 4MF7A 1TRVA 4MZWA 3GHAA 2F3MA 1ERTA 1Z5YE 3VI5A 1XWBA 3GFKA 3FZAA 2YZUA 2VOCA 2H71A 2H0HA 5DCGA 2R2JA 3TJGA 4GQCA 2R4VA 3VURA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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