4Q22A

Crystal structure of chitinase d from serratia proteamaculans in complex with n-acetyl glucosamine at 1.93 angstrom resolution
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
398
structure length
397
Chain Sequence
AHAASYLSVGYFNGGGDVTAGPGGDINKLDVTQITHLNYSFGLIYNDEKQETNPALKDPSRLHQIYLSPKVADLQLLPVLRKQNPELKVLLSVGGWGARGFSGAAATAESRAVFIRSVQQVIKQYHLDGIDLDWEYPVNGAWGLVESQPADRANFTLLLAELHKALDKGKLLTIAVGANVKSPQEWVDVKGIAPYLDYINLMTYDMAYGTQYFNSNLYDSKQWPTVAAADRYSANFVVDNYLAAGLKPAQLNLGIGFYGRVPKRATEPGIDWDKADAAKNPVTQPYFTARETAVFKAMGLDLTKDSYFKYNDIVSKLLNDPQRRFTAHWDSDAQVPYLTMKSAEGKPLFAISYENPRSVALKADYIKSKGLGGAMFWEYGADDNNRLAHQLAESLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Glycoside hydrolase family 18
publication title Crystal structure of Chitinase D from Serratia proteamaculans in complex with N-acetyl glucosamine at 1.93 Angstrom resolution
rcsb
source organism Serratia proteamaculans
total genus 128
structure length 397
sequence length 398
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4q22A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4q22A01
4GO8A 2OYMA 4W5UA 4Z2GA 3N17A 4AZ5A 3E1F1 3WQ8A 1C7TA 2ZXDA 2VTFA 5KEZA 1UQZA 4ZFMA 1UWRA 4S3KA 3AXIA 4W88A 2XYLA 4ZE4A 4TTUA 3AMLA 3WF1A 4TTGA 3W26A 1ODZA 3II1A 4QLKA 1RH9A 1E0XA 1VJZA 1GJWA 1BFNA 5M03A 4H8VA 4F79A 1E6SM 1ZB5A 3DHUA 1KB3A 3PBGA 5AYIA 2TAAA 3WNMA 4AW7A 1E3ZA 2ZUNA 1E5NA 5FIPA 1CEOA 4WSJA 4XB3A 4YN5A 1G9HA 2F8QA 3AYSA 2JIWA 3OZPA 4HMCA 1M7XA 1Y7VA 2VRJA 1LG1A 3W28A 3ARYA 4CN6A 3UCQA 3T0BA 2WNWA 1GOQA 6CGTA 1QI4A 3AMCA 4P7RA 3WNOA 5JBFA 1XSIA 1E56A 4BQ5A 3VD5A 1UR1A 4B9ZA 3L4VA 5I5RA 4CCCA 1Q6DA 5I78A 1WE5A 2XVKA 1MW1A 2BY3A 2J4GA 1NWTA 5ABEA 2A3EA 4L4OA 2BV9A 2J8FA 2D23A 2FGZA 5CPSA 2D3NA 1JNEA 1BYAA 1WDSA 4LX4A 5A6BA 2UY2A 4HMDA 1ZJAA 1ZU8A 3U57A 1VEOA 3OGSA 5A6BD 1UR4A 2XFYA 3KL5A 1FOBA 2GJXB 4NRSA 5C71A 5A8NA 5LA2A 1JF6A 2BNJA 1GQKA 3N9KA 1FFQA 3PTKA 3MMUA 4GPNA 5JH8A 1GNXA 2E9BA 1JGIA 4AY1A 3POHA 4OKDA 2J25A 4IM4A 4W8AA 4S3JA 4UFHA 3SUVA 2XJ7A 4WK9A 1V6VA 3WNKA 5HBFA 2VQUA 3AIQA 5D9MA 1HVXA 1BGGA 1GQLA 2VO5A 1KWGA 2GVYA 4N42A 4AXNA 3B9EA 4HU0A 2WYSA 2ZX9A 3ZT6A 3VD7A 5HDRA 3VIFA 4BA0A 1HJUA 1KXQA 1PEZA 2UWFA 3QR3A 4KRUA 3ZO9A 1DEDA 2J74A 3SUSA 3SCQA 3NSXA 4NZCA 2CCRA 3SEPA 3T09A 2VC9A 4UQBA 3UR7A 3WDIA 2IUZA 3DYPA 4HOXA 4R27A 1LL6A 3WSUA 1BAGA 1KXHA 1MWOA 1ISZA 1UD5A 2YL5A 2ZX7A 3VGBA 4MB1A 1EQCA 3N11A 4GZJA 4W84A 4H2CA 1LL7A 1J9YA 2E40A 4RE4A 3K46A 2VCCA 4RE3A 3CUGA 1CXIA 5ABFA 1OCQA 3GDBA 1EDQA 5HNNA 5FD0A 1OGSA 2HISA 4OZOA 1XH2A 4JCMA 1QI5A 4U3CA 4XUYA 4AIOA 3OIHA 2X8RA 4CD4A 2VX5A 3AIUA 3TA9A 3WDQA 3RPMA 3MUZ1 1XYZA 2WCAA 2VURA 1KFWA 4UFMA 5I6SA 2YL9A 5BCAA 2DH2A 1E40A 5BXSA 3GXFA 2JF7A 4DM1A 3MV01 2EBNA 3U5UA 2O9RA 3VMPA 5FL0A 1JZ4A 1Z32X 2YBUA 4D6HA 1H41A 4ATWA 4JL2A 3AISA 1LQ0A 1QNRA 1A3HA 3GZAA 2ZXBA 4P7QA 2J75A 1QVBA 1H11A 1Q6GA 2C7FA 1UD2A 3F5KA 1R7OA 4E8DA 1TZ7A 1BF2A 1GJUA 5CG0A 4D72A 3OA5A 3WEMA 4D6EA 3M7SA 3BCFA 4W87A 2RGLA 3AICA 2PWDA 1CLVA 2EPLX 3KE0A 5A2CA 4QFUA 4LQ1A 3SCNA 1BPLB 1E72M 2WPGA 3M46A 4HU8A 2WSKA 1MW3A 3AFBA 1ZBKA 2WHMA 4CCEA 3QHOA 2J7FA 3O6AA 3HU7A 2CESA 2EXOA 2CERA 1EIBA 1WDPA 1W3LA 2PC8A 5A8OA 1PX3A 2VZVA 3B9AA 4Z2KA 3L2LA 3OLIA 3VGFA 4U33A 3TTYA 1E6QM 1TUXA 2Y2WA 5AY7A 2VX7A 3W37A 3BAJA 1JYWA 1J0YA 1UQYA 1E70M 1OINA 1H3GA 4UQAA 1JI1A 1J18A 1JAKA 2DT0A 4GQQA 3WF2A 2W91A 2DSWA 2PWEA 2WZEA 1XD0A 3D5HA 3WH9A 1QHOA 3SCRA 1WZKA 2VI0A 1OWQA 4GINA 2HVMA 3EMZA 4UFKA 3WBAA 2WCSA 4AYSA 1MXDA 1KQYA 1N82A 2Z1KA 2C8NA 4MPKA 2YLAA 1JDAA 4J7RA 3W6LA 1GQIA 4M80A 4HA1A 4MADA 3NYDA 2G3IA 3WUEA 4QAWA 5EMYA 2BY0A 1V02A 2E0PA 5IFPA 3LPPA 1EH9A 2YLLA 4MB3A 3GM8A 3WD4A 1J0IA 3BXWA 4W8BA 5ABFB 1ZBVA 1HL8A 4PMOA 4W86A 1JD9A 4PMNA 4DM2A 1SFSA 2VX6A 1V3HA 1HKKA 3TOPA 4AWEA 3WBEA 2J47A 1NP0A 1V3JA 2CITA 3VOCA 1E73M 5CSUA 3N15A 2V3DA 3VD4A 1SYTA 1WP6A 4HP5A 1E71M 2D3LA 3CZJA 5I77A 3BAKA 3PZIA 3OGRA 5DEZA 3ZSTA 4B3KA 2WANA 1QNPA 1ODUA 4J3TA 3DHPA 1UR8A 1A47A 1VAHA 1XSKA 1LWJA 2Y24A 3N12A 3NJ3A 2GJPA 3RILA 3CZGA 2WAGA 1H49A 1DWFM 4CUCA 5GQBA 1M01A 2YIHA 2OWCA 3ZJ6A 3OLGA 4JKKA 2D20A 2G3NA 3WUFA 1C8YA 3BH4A 2ZUMA 5E0FA 2WMKA 3FNDA 3AS0A 1PZ3A 4EE9A 1SMAA 3VU2A 4ATDA 4XZBA 1V08A 3NCOA 3ARZA 5M5DA 1QNSA 2VT0A 3WFZA 3WELA 1J11A 4J3VA 1UKSA 2WC4A 1BYCA 3PHAA 2ZUUA 4IUGA 1B30A 2CBVA 3AMDA 5A6KA 1H2JA 3HMCA 3VIKA 2G4FA 4CGTA 4V27A 1CXEA 3WQ6A 5AC5A 2WMGA 2Z1SA 1IZKA 1OM0A 2XVGA 4AC1X 8CGTA 2F61A 3VNZA 1NOFA 1QBAA 4JFWA 1UD6A 3PN8A 3L4UA 4PYSA 1YHTA 2YJQA 4H8UA 4TVCA 2QPUA 5HPCA 3WNLA 3VVGA 3PZQA 3MU7A 3T2QA 3WY1A 4UOZA 3VMNA 2VRQA 1E9LA 5AYBA 3N13A 3PZNA 3AZSA 5E70A 5CSYA 1CGUA 4WLCA 1UZ4A 3CUIA 3VIGA 5IHRA 1V02E 1C91A 1MYRA 2OWXA 4D6CA 4U2YA 3THDA 2YDSA 1DWAM 1JXJA 5A6AA 5GPRA 1JNDA 3PTQA 4V28A 3WFLA 1GZJA 1PX4A 2WVUA 2D2OA 1K9TA 3CZKA 3M07A 5D4YA 2Q8XA 4PMZA 3FHQA 2X09A 3ZOAA 1Q6EA 2QV4A 3GBDA 1UA7A 2VR5A 3IAQA 3EDEA 5A6MA 1CYGA 1TG7A 4ZXOA 4HMEA 4P7LA 4BS0A 1UR0A 1WPCA 1KGUA 1I1XA 4PRWA 4DUWA 3ARPA 4PSPA 3GBEA 2VRKA 1V6XA 1AQMA 4U5IA 2CIPA 3VGHA 1VF8A 1LJYA 2J7GA 1WO2A 2G8ZA 1QHPA 4TUFA 3BSGA 4B9YA 5HPOA 4W8LA 4QLJA 4UFIA 5M17A 1QHZA 1R85A 1GVYA 3BCDA 4CD8A 4A4AA 5EB8A 5A2BA 1C93A 3WDHA 1E6PA 3LMYA 1OGGA 3W27A 1W3JA 1WDQA 5JUVA 1W2PA 1C90A 1B31A 1IV8A 2PI6A 2XIBA 5GNZA 3F5JA 5A6SA 2XWEA 2O9OA 2FGLA 1E4IA 1CGTA 3WDJA 4JFVA 1LG2A 3UG5A 2XVPA 1B3VA 1WZLA 1XD1A 5E09A 1NOWA 2DQXA 3L4TA 2ZUVA 3SCVA 4Q22A 4FMVA 3QOMA 3WD1A 1VFFA 4PTXA 4WSKA 1JFHA 2QMKA 1EOMA 1M04A 1W91A 3JUGA 4UR9A 4Y7EA 2YA1A 2D22A 1H5VA 1XH0A 3AQUA 3GXIA 1MQQA 2ZXAA 3WENA 1QOXA 5FOOA 1V0LA 2PF0A 2OWWA 3FHAA 2XGIA 4ML4A 4GZIA 2WWDA 3MUAA 1HN1A 5CZKA 3AIRA 3ZJ8A 1DWHM 4MNMA 2OYKA 3VILA 4MAVA 3MMWA 2WC7A 4TX6A 2QHAA 2CHNA 1HIZA 2UY3A 2WMHA 1PPIA 4PEEA 2VCAA 3MSDA 2EPKX 3GTNA 1W32A 4OOUA 2WLYA 1FP9A 2JIEA 1PJ9A 3WQ4A 3L4YA 3W24A 1GHSA 4PSRA 3EDDA 2JE8A 1QPKA 3RM9A 3PZTA 3BGAA 1C8QA 1JYXA 4P8VA 1HL9A 2XFFA 3B9DA 4NRRA 3QHMA 1PX8A 1MW0A 3DC0A 3UG4A 5I23A 4QLLA 2XWDA 2PBOA 4URIA 1OT2A 4J3XA 1JD7A 2EEXA 1K9FA 3UG3A 4JCLA 5IFTA 3AHTA 1US2A 3IJ7A 1RPKA 3DYOA 3AZRA 2X0YA 3MSGA 4W7VA 1C8XA 1H09A 1B3ZA 1JZ7A 2W4XA 4WKAA 4A3YA 3OG2A 1MQPA 1UUQA 3MMDA 3W6MA 4AIEA 1C3FA 2PWHA 3SUWA 6A3HA 3G6LA 2FH6A 3WKZA 4AISA 2OSXA 3EDKA 5A69A 3SCWA 2WM0A 3TTQA 3AZTA 4F9JA 3CPUA 4B3LA 1TVNA 1FH9A 3GH7A 1OD8A 3ALFA 2AMGA 5CLWA 2WMIA 1CNVA 3LPFA 3ZJ7A 1TMQA 3PTMA 1EXPA 2A3HA 2WW5A 3CO4A 2YDRA 3WNNA 1WDRA 3SCUA 1G0CA 3K8MA 5EFDA 5EBAA 1BQCA 4NF7A 4QCEA 2AAAA 1FA2A 1OB0A 1W9UA 5M3WA 2FH8A 3A4AA 4X0VA 3EBVA 1ZBCA 3SCSA 2WZHA 4LYRA 5BROA 1E1FA 2ZOXA 3AYRA 2VUYA 1R87A 4CD5A 3T0DA 1X6NA 3CMJA 2E8YA 2W61A 2VZTA 1JZ3A 4R5EA 3PZ9A 1EHNA 1V3IA 3ZJKA 1FHDA 4AZIA 1V6WA 4BQ4A 4UZSA 2WVVA 3TTOA 3AROA 5CLTA 3VIHA 2ZICA 4H41A 4AZBA 2Y8KA 1KCKA 4KWUA 5CGTA 2XSBA 1GUVA 4M1RA 1R7AA 5FCZA 4HA4A 5BWFA 4XZWA 5LA1A 3VD3A 5BXTA 3N18A 1ITXA 1NWSA 1KR0A 1HKMA 2CPUA 1BVZA 3W25A 1UWSA 4BCEA 1UKQA 2J78A 5A8QA 5I3DA 1KGWA 1E6ZA 5AC4A 3W29A 1LL4A 1UH4A 5FL1A 1B1YA 3PZVA 1NWRA 2WMFA 4U31A 1OSEA 4ZXLA 1PIGA 1R86A 3VIJA 1EOKA 1C7SA 4GIAA 5E6YA 5A2AA 1US3A 4OBRA 1VB9A 4FK9A 4A3HA 1TFVA 2Y8VA 3VDCA 1E55A 1QI3A 4AZ6A 4M24A 1WZMA 2JFEX 3ZIZA 4QP0A 2XTKA 2BXZA 2WVTA 4UOQA 1W1YA 1CIUA 2GUYA 3AHYA 4J3WA 5E0CA 3AS1A 4HA3A 2AOSA 2A3AA 1JG9A 4C7FA 2VZSA 2V3EA 2XHYA 1LLOA 1CLXA 1EHAA 2D0HA 4U5KA 2VR4A 1CXHA 4GI9A 3BSHA 4F9DA 1CDGA 2PWGA 5JBDA 1J12A 2DIJA 1QBBA 4DWSC 4HOZA 4K68A 5A94A 1GORA 4W93A 2WMIB 1V0MA 3OB8A 3OLEA 4EANA 1CXKA 2GJRA 1HX0A 2XVLA 3ZT7A 4UNIA 3GXMA 3T0AA 2GFTA 1O6IA 1PIFA 2UY4A 4AZHA 2WHJA 4JFTA 4EKJA 3WD3A 1U30A 4AEEA 2V38A 4JKMA 1QI2A 4W89A 1KXTA 2CBUA 2DT3A 2WLZA 1J10A 1J0HA 4PMRA 3OGVA 2GSJA 1SMDA 4MTVA 4HZ7A 1XHGA 2E4TA 2VX4A 3ARUA 2OSYA 3LPOA 2DH3A 1G01A 2OSWA 3UETA 5ECUA 1CGYA 3KL0A 1HJXA 2VL4A 4KH2A 3W0KA 3WF0A 3VKKA 1KWKA 4PCSA 2BS9A 1E6XM 2CETA 2VJXA 2WVVB 1JAEA 4DUVA 2BY1A 5E6ZA 1B0IA 1X1NA 1H1NA 3MS8A 3K1DA 1E6NA 4E8CA 2ZX8A 4NI3A 4TVDA 3WEOA 3EYPA 3UR8A 2FHBA 3WQWA 1H4PA 4TXEA 4CU8A 1E0VA 3WF3A 4MB5A 1KR1A 5CJ5A 1K9EA 4M56A 3W38A 5DT7A 1UKOA 3AIBA 4F66A 4MDOA 3NDZA 3ARTA 2E3ZA 1XCWA 2J7EA 2ZIDA 1QNQA 1VBRA 5D9NA 3AXHA 5C70A 1L8NA 2WKLA 3RM8A 1JI2A 5CGMA 1OD0A 3CGTA 3GXDA 3PZOA 3PZGA 4OBSA 4U3AA 3WH7A 2W5FA 3AI0A 1VEPA 1Q6CA 5CXPA 4KRTA 4H8HA 1HP4A 2WHKA 4CCDA 1JZ8A 3HJEA 4JIEA 4PMYA 3SIMA 3AXXA 3NIYA 3CUJA 1GW1A 4CD7A 4GQRA 5C8BB 1I75A 3ZR5A 4YPJA 4PMUA 1OGBA 3M6DA 3ARXA 1GOOA 2EPOA 2GK1A 4MNJA 1UHVA 1VENA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1IYX A;  1CWY A;  1LWH A;  3MCO A;  4E2D A;  3PY2 A;  2DZX A;  3LBO A;  1Q4N X;  1W5P A;  3PSV A;  1NWU A;  3L23 A;  1KBB A;  2V3G A;  4D6I A;  1K7X A;  3IEB A;  2A6N A;  3WQC A;  2HS6 A;  1LWI A;  1WBJ A;  3DKL A;  3LRM A;  3PG9 A;  6TIM A;  4AH7 A;  4AYG A;  3HF3 A;  3AAL A;  4CNN A;  4S3F A;  1VR6 A;  2JEP A;  1JCY A;  4DJD A;  3DC8 A;  3QGK C;  1UP2 A;  1RPX A;  1QAS A;  1CGW A;  1W3T A;  2QKF A;  3CK5 A;  2GPT A;  2DW6 A;  2YDQ A;  3OZY A;  3DHD A;  3OJG A;  4G7F A;  1ECE A;  1AJ0 A;  4RNH A;  1N8F A;  4A29 A;  1FHL A;  3FFS A;  4K8G A;  1Q7M A;  2G3J A;  5H2Z A;  2XP5 A;  3W7D A;  2YGY A;  3K8K A;  1CZ1 A;  4GVG A;  2DUZ A;  3IV3 A;  1UB3 A;  4C6N A;  4GME A;  3B9N A;  4B5U A;  5KTL A;  4YVP A;  2C0H A;  3VXG A;  4HTB A;  4FP1 A;  2OX1 A;  3BAI A;  5EFF A;  1A5A A;  3MBD A;  2IW0 A;  3M44 A;  3ARW A;  1SR0 A;  3IAP A;  1S2W A;  1HF6 A;  3N04 A;  4XKM A;  4WCJ A;  3B8V A;  2NQ9 A;  2OZ3 A;  2ZC1 A;  3HMJ G;  3D3A A;  3GHU A;  4FO4 A;  1JCL A;  4QSF A;  1AZ1 A;  1PTG A;  1FWC C;  2E68 A;  4IGH A;  1SZF A;  2FZD A;  1W1Z A;  2B81 A;  3MMT A;  2O9P A;  1EBG A;  3SFW A;  4POD A;  4G6C A;  4N0R A;  5TNV A;  2EKG A;  1YEY A;  1BSL A;  1H7N A;  5MKG B;  2BGS A;  4JXC A;  3I3D A;  1GKQ A;  4D2J A;  4F2B A;  3UES A;  2DP3 A;  3CHF A;  1UZH A;  1ZP3 A;  4YHE A;  3R79 A;  5LIK X;  1OC7 A;  2JK2 A;  4FIQ A;  3D6N A;  5LIY X;  1BXB A;  3W6Y A;  4Z42 C; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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