4Q33A

Crystal structure of inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from clostridium perfringens complexed with imp and a110
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
357
structure length
344
Chain Sequence
MARILKTAYTFDDVLLVPNKSEVLPNEVSLKTQLTKKIQLNIPLMSASMDTVTESKMAIAMAREGGIGIIHKNMTIEDQAREVDRVKRSGGLLCGASIGVTNDMMERVDAVVKAKVDVIVLDTAHGHSKGVIEGVKRIKAKYPELQVIAGNIATPEAVRDLAEAGADCVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQLTAVMDCAEEGKKLGIPVIADGGLKYSGDIVKALAAGACAAMMGSIFAGCEEAPGAIEIYQGRSYKVYRGMGSLGAMAKFVPEGVEGRIAYKGHLADTIYQLIGGIKSGMGYLGAPTLENLYENANFVVQTSAGFRESHPHDINITKEAPNYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
publication title Crystal Structure of Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase from Clostridium perfringens Complexed with IMP and A110
rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 102
structure length 344
sequence length 357
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4q33A00
1IIHA 3WJZA 3EX4A 3W1QA 2YW4A 1KTNA 1FUYA 4MKNA 4XUGA 4XBSA 3HGJA 3QM3A 1VGAA 3TA6A 3GR7A 4UFLA 4IJBA 2QCCA 3ABRA 2I14A 3C0JA 3KVLA 3NL6A 3OA3A 4ZQNA 3TV8A 1Q45A 4KKXA 2E09A 3ABOA 1FBAA 4MLRA 1AL7A 3P74A 3E02A 1QOQA 4GUHA 3AO0A 4NZFA 1MO0A 3UXAA 3EX3A 3HB9A 4JTJA 3S6DA 3OBKA 2F84A 2E77A 5IBXC 3CEUA 3TW7A 4I9AA 4PTNA 1VCFA 2PC4A 4ZL1A 2ZZ6A 4LV9A 3W7HA 1TPDA 3GDTA 5D32A 3ZWTA 2B7PA 3OHIA 3L0GA 1BTMA 3MP3A 2QJGA 1TIMA 3IRDA 1XFBA 2CLKA 1VHNA 2JKEA 4FNPA 3SJ3A 3GDMA 3QF0A 1FQ0A 4K36A 4K8EA 4RR4A 5U4NA 4PH6A 5K2ZA 1N55A 4O8RA 1VCGA 1OF8A 3IIZA 5FI8A 3L68A 3LHTA 5T26A 1JQVA 3QPZA 1OX6A 3N14A 3W7GA 3PSVA 2P10A 1MEHA 3PC0A 2QJIA 1FWWA 3RLVA 2YDAA 5F1UA 2H3DA 2FB2A 2YFOA 3FIGA 3UZ5A 4C1LA 1JUBA 1TJPA 1B4EA 3LHYA 3T4CA 1H7NA 2Q3RA 1GZGA 4FXSA 1JUKA 3G8EA 3FYOA 2P0OA 3M44A 3M7WA 1JRCA 4E2BA 3UWUA 2XN1A 2Y70A 2A21A 3E49A 3CPRA 4UMAA 1H61A 1R46A 3GDRA 1M6JA 4GFSA 5AYZA 4PL2A 4UTTC 4IX0A 4LOCA 1TPWA 1SW0A 2ZQ0A 1XDMA 3TNOA 3G1DA 2Z0IA 1Z48A 3MI2A 4DBEA 5EYWA 3MBDA 4DEFA 3W70A 2GQ9A 2C18A 3O6DA 3OG3A 4E0CA 1S5TA 2GVGA 1FX6A 4ZQRA 4JDBA 2GQ8A 3YPIA 2V8ZA 4BI6A 3LHZA 3P8JA 3WK2A 4LC6A 3MJYA 6ALDA 2WNQA 2YYTA 3RK8A 2ZA2A 2FPTA 3HO8A 5D2TA 1R47A 1S5VA 4UCGA 4CNNA 4HHPA 3W7RA 3EEGA 3QC3A 4Z1BA 4JTEA 3WJYA 4IPIA 3SY5A 2Y7DA 4EIVA 4ZZ9A 4UTUA 1MZHA 1KBIA 1O4UA 3LCWA 4HSOA 1W5QA 3NPWA 5HQEA 4I7UA 3W7NA 2X1TA 3B8DA 2WOQA 2JBMA 4HNTA 1D3GA 1XBZA 5LGZA 4RJEA 3SECA 1UUMA 2NUYA 3NO5A 1ZHAA 1BEUA 4ZVJA 1JUEA 2ZZ3A 4M6PA 1M7OA 4GUGA 2NX1A 1YADA 3C4UA 2DJXA 4QJ1A 5AN7A 2V2DA 1W5MA 1VYPX 3VNDA 2HMCA 5KMYA 4MY8A 3LI1A 5I3HA 1FDZA 4JIPA 1FDJA 3OIXA 1T0OA 1WX0A 3KHJA 4R33A 1HG3A 2ZRYA 3UWYA 1KM2A 4UNLA 2Q3OA 3QJAA 3PY2A 2W79A 3EWXA 4A29A 1ME7A 1I2PA 1TPVA 4XKYB 2RDWA 2ZTJA 4GUFA 4Q32A 4EOUA 2ZRWA 4CQ8A 4YCOA 2WNZA 5HNRA 3M9YA 5SWUA 1OABA 4LV4A 1FWTA 3NG3A 3U6WA 3GIYA 1OX4B 1LCOA 4AVFA 1ZENA 1ME9A 2B0MA 4K39A 1W5NA 4UMBA 4A2SA 1LOSA 4JTFA 3W7DA 4QISA 1O5XA 5BNKA 4JIQA 4NX0A 4UTKA 1WYIA 4O1BA 1AG1O 1EUAA 1W56A 1VQTA 1NEYA 1H7PA 4BI7A 3PUEA 3LHUA 1B3OA 3EKZA 5K9CA 3QMRA 1IXPA 2YZRA 2QDHA 1DOSA 1XBYA 1WA3A 3HF3A 2V82A 1H7OA 3KVJA 1SO6A 4QITA 3WFAA 2BX7A 4Y96A 3UNDA 1OFPA 4ORIA 4IQLA 4UFIA 3PVFA 3LRMA 1CX9A 2VEKA 2TMDA 3G3MA 3UQNA 5J5DA 4JX6A 2GPTA 2C6QA 1IXOA 4A2RA 2ABAA 1I2NA 1F74A 4QQ3A 2AAMA 4Q33A 3W7IA 3NQAA 1TJRA 3BW4A 2Y85A 3E0IA 4JDYA 5EL1A 3TMQA 4CNPA 4ADSA 2OJPA 2JKPA 4NJGA 4L4MA 3LV5A 2EAWA 3BLFA 3NQEA 1G7VA 1JCXA 4N6FA 3W72A 1YLVA 1JR1A 4UTWC 2C16A 4YWIA 3TX9A 2TYSA 2E6YA 5FF3A 3I7SA 1Q6QA 3HG4A 4K7YA 5F1VA 4XQ6A 1YTKA 3IGSA 1KFKA 3W1XA 3NR0A 3TJXA 2NZLA 4MIMA 3TJLA 3LV6A 2J88A 4GUIA 2ZTKA 2VELA 4UFKA 3UWWA 3C2VA 1THFD 3HG2A 2E6AA 1RD5A 3TSBA 3LCFA 3IIOA 3LDVA 3TU9A 2Y7FA 1GTHA 2VFHA 3FFSA 4WY0A 3LRKA 2Q8ZA 1V7YA 3IEBA 4IGHA 4JEQA 3SW6A 5KINA 5DXYA 1NVMA 2X30A 2YYUA 2CWNA 2DZPA 3NQFA 3E12A 1G6CA 2A6NA 2G95A 2Y7EA 3F1QA 1WDWA 3VI2A 1UASA 4AH7A 1F05A 3PB0A 1LROA 2E5BA 1QPNA 2KZHA 1KTCA 1C9DA 4CQ9A 3L65A 5DCBA 1EIXA 3TQVA 4HNUA 1OFAA 3LX9A 3I6RA 2OT1A 1KTBA 3DKJA 2CLOA 1G4EA 3C6CA 3W7QA 5HUOA 3NXFA 1LOQA 2V2HA 1YPIA 3W1AA 1OFBA 2C3ZA 1QDSA 3IV3A 2AQWA 3ANYA 5TIMA 2DZSA 3SZ8A 1KA9F 4JTUA 3WK0A 1LYXA 5CPMA 3W1TA 4HKPA 3LTYA 5FF0A 1EB3A 4RK8A 4XTIA 1ZFJA 1GPWA 1SZNA 2C14A 4DXVA 2BTMA 3LTSA 5DCDA 3N3MA 5D03A 3PUDA 3PM6A 5BMXA 3NL2A 5D04C 1H60A 3OVPA 1KLYA 2E5DA 3PS7A 3QW3A 3O06A 2PURA 3TROA 1WXJA 1DJNA 4FO4A 2Y61A 2H6RA 1TV8A 3L67A 4RZ6A 4NQ1A 2P1FA 4O1CA 3CC1A 4O13A 2JK2A 3CEPA 1F6PA 4N9DA 1EWEA 3K30A 1LZOA 1P5BA 3FEMA 2XFWA 4GJ1A 3UY7A 2CZEA 3TE9A 5EKYA 4DBDA 1OHLA 1R2SA 1PHWA 4AHPA 3DH7A 3EX1A 5KZDA 4A21A 3I65A 1M5WA 4AB4A 4FNQA 4X22A 2R8WA 4CLMA 3DFSA 4FIRA 3M16A 3DI1A 3IGXA 2A7PA 3WK3A 3GZ3A 3FOKA 3TC6A 2V2CA 1H7WA 3W3OA 3W1RA 1WBJA 4FXRA 3CM4A 5IBXA 3LBCA 1PV8A 5F4WA 2EHHA 5HUPA 1I4NA 4LS1A 1SZEA 3HPSA 3UY8A 1K3UA 2A0NA 5AOUA 5U7SA 1VC4A 1DVJA 4RX0A 3RNDA 3G1AA 4MJMA 3ZWSA 3A23A 5AB3A 3A5VA 5MHBA 1YDVA 3M41A 4YCPA 1HUVA 5KZEA 1ALDA 4NJHA 1AW2A 5AHNA 2QCNA 2ZZ1A 1ZCOA 4MY9A 5F4SA 1OX5A 1PCKA 5C5YA 1SQ7A 4WXZA 3G1HA 3GK0A 1H5YA 1U83A 1VHCA 4DF2A 1LDCA 4NJIA 1FWNA 1EUNA 1SW7A 2EKCA 3W75A 4FB7A 4UTIA 3G1SA 1SFJA 5KITA 2ISWA 3KVKA 2QKFA 3G1VA 3Q37A 1KM5A 3W7KA 3WK1A 5ABTA 2FFCA 4PCFA 1OFEA 2WV8A 3S1VA 4DO5A 4FIQA 3I7RA 3S1WA 3FKRA 3O6YX 1DHPA 3DKLA 5D02A 5HWMA 4J9JA 1QCWA 1C29A 4FX7A 4UNKA 1DKWA 4LVDA 4RV8A 4AWSA 1D3HA 1W3IA 2ATSA 1SO3A 1WV2A 2YX0A 4WQ6A 1QO5A 3L5MA 3FA5A 1ME8A 3MMTA 5I3FA 1KM1A 5J5RA 5AHIA 3LCGA 4UTTA 4JTTA 4UXDA 4JNMA 3Q58A 2TPSA 1YTDA 1CW2A 2V0TA 5HJLA 2EGZA 2NXHA 2A1YA 1FCQA 2VEMA 1I45A 3PUOA 5CGQA 1QAPA 1LBFA 3HJZA 1XM3A 4TX9A 4OV9A 4P2VA 3MHGA 5D2WA 3DZ1A 3TFXA 3W85A 4JY8A 1D9EA 3C2RA 3PF3A 3ZS4A 3CTLA 4LVGA 2RH9A 5G2WA 3WJWA 3NDOA 2NX3A 3BK0A 4IMEA 3GXPA 3W23A 2CLLA 3GNDA 5BMWA 1JCMP 3F4NA 3NPUA 2VFIA 3IVUA 2ZZ7A 3G18A 3EXTA 5F2LA 3QSTA 3ABQA 4W9TA 3P8IA 3R12A 4UFMA 1KM0A 2E68A 3GYEA 5BW6A 1A5AA 4O4WA 4TU1A 3B0UX 3VCRA 3C52A 4JX4A 1I2QA 2BWGA 3P61A 4Y8FA 3W6YA 5G4EA 1HTIA 4O14A 1J5TA 3L0KA 3T7VA 3V75A 1H7RA 3P84A 1LLZA 3QEZA 2DJLA 4DO6A 4D2JA 3MI3A 1GWJA 1KM4A 1NFBA 4FNSA 4JX5A 3STCA 3AJXA 3LCHA 3L21A 3R5EA 1GOXA 5C54A 1R2RA 1QR7A 5DN1A 1GQNA 4G1KA 1IIGA 2GVJA 2NLIA 1SSGA 3P7YA 5EY5A 2ATMA 1P0NA 3H54A 3W7JA 3W1UA 1PE1A 4HNVA 3HG3A 1SPQA 2FB3A 2GOUA 2A7NA 3ATYA 3GAKA 1JCJA 3S8HA 5FEXA 2PCQA 4ADTA 3PB2A 3PSWA 4NZJA 3W1NA 3M1ZA 5G5IA 4K8HA 1EP2A 2OCZA 2WSQA 3S42A 1TREA 1VR6A 3PBYA 2JKAA 4TMBA 4AHOA 4BR1A 3ABSA 1EP3A 2WQPA 3TFCA 3R8RA 1NAL1 1TPFA 1LM1A 2WSYA 1W0MA 1B9BA 3A24A 1P1XA 1TPB1 5FEZA 1HO4A 5BOOA 3EKLA 1K7EA 2VKZG 5AC8A 3F03K 3S0CA 4P61A 1X1ZA 4LC8A 4LT9A 3MBFA 1TRDA 2RDTA 2QDGA 3MHUA 1G4PA 4ML9A 3RFAA 3INPA 1VYRA 3V1PA 3NQGA 4KFPA 1F73A 4DF1A 2CZ5A 4LU0A 3N73A 4O28A 4ZQMA 5G2IA 1K8ZA 4HNNA 4GBUA 4M7SA 5E0KA 1PIIA 4FHAA 2Z6IA 2XN2A 1SZGA 5EPDA 4MY1A 3HIJA 1KLZA 2ZFAA 2V9DA 2E6FA 3QQ0A 3LM7A 4Y90A 3W83A 3HGRA 3LCLA 3ZR4A 3OEXA 2WSRA 5K4ZA 2NUXA 2BXVA 1TTIA 1JULA 3IIPA 1WQ5A 3NM3A 3RF9A 4UTWA 2VXNA 1I2RA 3BG9A 1SO5A 2QCFA 3B06A 4OHQA 3SI9A 3G1FA 5C6MA 2GJLA 5AYYA 4YLWA 3CIXA 3DGRA 5HR7A 3OVQA 1FCVA 3KRSA 1XDLA 2G96A 1L6SA 4O12A 5KTLA 4WZHA 3HGOA 1G7UA 4JXCA 3EWYA 3C3NA 2DZUA 1SFLA 2ZA3A 1QFEA 2J9ZA 3P62A 1TPUA 4O1DA 3QMSA 4IX2A 3I7QA 3S9YA 1DJQA 1PVNA 2WKJA 3TMLA 2RDUA 3TR2A 1PL9A 4O53A 1L9WA 4WY0B 4M7TA 1E51A 3O15A 3JR2A 1OF6A 1JRBA 3G0SA 3LRLA 1GVFA 3DHFA 1H50A 4NT0A 4N9CA 3PG9A 2VFFA 1J2WA 3M5VA 4GNJA 2ISVA 4FNUA 4B5NA 3FKKA 5CZTA 1FDYA 3C2OA 4DF0A 2ZZ4A 2WJZA 3EXRA 2OX1A 5F2MA 1EP1A 4GRSA 3CWNA 3CLMA 1FWRA 4NU7A 5D37A 2NUWA 4CCCA 3DI0A 3FS2A 2R14A 4LRTA 3S5OA 1P4CA 1RQBA 3DXIA 3SR7A 1HO1A 3LTPA 4AF0B 2ZYFA 3GKAA 4MOZA 3DFTA 3NVTA 4H4IA 3IVSA 5D09A 2VC6A 3W7EA 8TIMA 1YXDA 1PHQA 1LRQA 4LW7A 4O50A 4NNAA 1VLWA 4NNBA 3W71A 4AWUA 1VZWA 1RV8A 3KAOA 5I3GA 3W7MA 4RZ5A 1L6WA 2EPHA 2QCHA 1JQXA 2ZDRA 3GAYA 3MYPA 1UB3A 2NXIA 2FPYA 3PWAA 4N2YA 3IIVA 1IF2A 3W07A 5I3IA 4DQWA 4M19A 4Z1CA 1RZMA 1GVSA 1G67A 4RKAA 3KOFA 1RQHA 3MWAA 1ICQA 4BWLC 4O57A 1AW1A 3GKFA 2V5BA 4NUWA 2EF9A 5CSSA 4ZMGA 2AGKA 2YFNA 4N9BA 2A2IA 3DU0A 4EF9A 3B0PA 4TO8A 1TTPA 1WAUA 3GXTA 2ZBTA 3TSMA 3TW6A 2CLFA 1K03A 1WOBA 1QOPA 4NXKA 3UWQA 1XUZA 1Q6RA 2NV1A 3BPWA 3R13A 1OFOA 3SSJA 1TCDA 1WBHA 1JCYA 1LORA 1AW5A 4X9SA 2G97A 2PRLA 1OX4A 5EA9A 2OZ0A 3TK7A 1JJKA 1SO4A 3QW4B 4RCXA 4PODA 2VFEA 4XWUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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