4Q7NA

Crystal structure of the complex of buffalo signalling protein spb-40 with 4-n-trimethylaminobutyraldehyde at 1.79 angstrom resolution
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNYGSQRFSKIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLWPGWRDKRHLTTLVKEMKAEFVREAQAGTEQLLLSAAVTAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFRGNEDASSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSYTLASSKTDVGAPISGPGIPGRFTKWKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAIKDVLARV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Chitinase-3-like protein 1
publication title Crystal structure of the complex of Buffalo Signalling protein SPB-40 with 4-N-trimethylaminobutyraldehyde at 1.79 Angstrom Resolution
rcsb
total genus 129
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4q7nA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4q7nA01
5DEZA 4B9YA 3CZKA 3ZSTA 3NCOA 2O9RA 3OIHA 4QLJA 1E0XA 5LA1A 3EYPA 5I5RA 1GJUA 3PTKA 1QW8A 5A2BA 1BQCA 3W25A 1W9UA 1U33A 1H1NA 4B9ZA 1E4NA 1C8YA 4W5UA 2CESA 3BSGA 4D6GA 3K8LA 4M1RA 1UR8A 4PMYA 1HX0A 1TVNA 1JAEA 2PF0A 1P6WA 2PBGA 4AD4A 3KL3A 1CGYA 1IT0A 5I23A 1U30A 2CBIA 1OGGA 1RD6A 1VFFA 2AAAA 3WDIA 2YJQA 4YHEA 5A1AA 1GHRA 4LQ1A 1JDAA 1NP0A 1VRXA 2EPNA 2XHYA 4GPNA 1GQIA 3N11A 1JDDA 2ZX7A 1UD3A 5BXPA 2BY1A 2GDVA 3OGSA 4QCFA 1FHLA 3K8MA 3DC0A 3W29A 4EK7A 2J7BA 3NSMA 2ZWZA 1CXLA 1WNOA 1C8QA 2UY5A 2W4XA 3VMOA 1Q6DA 2BVTA 2VX5A 2WHLA 4TTUA 3I3BA 2BV9A 2D0HA 1D2KA 1VFUA 4CD7A 1JZ6A 1QVBA 1C91A 3W38A 1JG9A 4MB3A 1Y7VA 1UWIA 4BQ3A 1MW3A 3WDQA 1JI2A 3HMCA 3MV01 3LPFA 4U5IA 2VUYA 2EPOA 2Z1KA 1TZ7A 3WQ5A 1QHOA 1UR0A 2WZHA 3VD7A 3PBGA 1OM0A 1EH9A 3PN8A 1ESWA 2DIJA 2G4FA 2GK1B 1W3JA 1M01A 4XZWA 4TXEA 1E5NA 3MSGA 4UQDA 4BQ5A 3AMCA 1EO5A 3M07A 4AC1X 1UWRA 3GXMA 3WMSA 3IJ9A 5BRPA 4D71A 3POHA 4KH2A 1B90A 5CQ1A 1MVYA 5C70A 1E15A 2XG9A 2RGLA 3VIKA 3VGEA 2XVNA 2BY3A 3VX1A 1E5JA 4JKLA 3W37A 1VBUA 2OWCA 5CLTA 4NI3A 2W91A 1BYBA 1UOKA 3EDFA 3ZJ6A 1JZ2A 3RPMA 2OSXA 2OLHA 5EB8A 3O2LA 1H5VA 4AD5A 1E40A 4BF7A 4QLLA 1JZ5A 3FW6A 5F7UA 1KGXA 3GBEA 3A4XA 3L4ZA 5LYRA 4CU6A 3CMGA 5A6LA 2Y8KA 3IANA 3T2QA 2PWHA 2ZXBA 1XSJA 4V28A 3UESA 1J10A 1UWUA 4M82A 1PPIA 2J62A 4CVWA 4OUEA 2NW0A 1MQQA 2WC4A 3J7HA 1BGGA 2D20A 1Z32X 3AHZA 2EBNA 3QR3A 3VIFA 1CPUA 2ZWYA 1B3VA 3DYMA 4M29A 5BCAA 1GZJA 3PZOA 1EGZA 3MSDA 1GCYA 4EE9A 2WMIA 4L4OA 1G0CA 1DEDA 1V6UA 4H2CA 1BGAA 2DSKA 4FLSA 3WQ8A 4CN4A 5I78A 2WK2A 2CHNA 3RDKA 1CGWA 4EANA 1UWTA 4IM4A 3L4TA 3AYSA 3HN3A 1BFNA 2O92A 1C93A 3WEOA 1CECA 3OLDA 1HIZA 3VNYA 2VL4A 1HJWA 4UQCA 4GZJA 2XTKA 1BYAA 1EHAA 1KGWA 2FHBA 4PTXA 1R87A 2BXYA 2XFRA 1QNOA 2IXVA 3U7BA 3QHMA 4PMRA 1MW2A 4XB3A 3T09A 5I0DA 4Z2GA 1J01A 2BS9A 5D9OA 3WQ6A 2CBVA 2VZOA 3L4XA 2XGBA 3VM7A 3AI0A 4TX8A 2OYMA 4B3KA 3WF0A 4M56A 1JF5A 1CEOA 1UZ1A 1XH1A 2JIEA 1N82A 3W82A 5D9MA 1HJQA 3RJYA 3VIGA 2J79A 1K9DA 1R85A 1BG4A 4MPKA 3VKKA 2A3HA 1QNRA 3WDJA 2OSYA 2YA0A 2PC8A 4QDMA 3WD0A 3WNMA 2BFGA 3WNNA 2WYSA 2VQTA 2E8YA 4LYPA 3KL0A 4TUFA 1B3ZA 3SUWA 3AXXA 4S3JA 3W81A 2VT0A 4MNLA 3VOCA 1JIBA 2YIHA 3VIJA 7CGTA 2VURA 5TD4A 2PWGA 3EDKA 4PTVA 3RCNA 4W85A 4PEEA 5I3DA 1NWSA 3SCOA 4JHZA 1V6WA 2VCBA 1ISXA 1GJWA 3ZO9A 1ZBKA 3ALFA 4JFWA 4B15A 1EHNA 2E8ZA 4Q22A 2VCAA 5CPTA 1GVIA 3WENA 2ZUMA 5EFFA 3UR8A 5A8OA 3WDHA 2WCGA 4X0NA 1HKMA 4U2YA 3RILA 3VMNA 5ABFB 4J3WA 1H09A 3VGHA 3AZRA 2XGIA 4DM2A 4LX4A 3SEPA 3ARTA 5AYIA 3IAQA 1G94A 4BQ4A 1KGUA 4NZCA 4CD8A 5A94A 1G01A 4GI9A 1L0PA 2WBKA 3MKKA 1WCGA 4AZBA 4M8UA 1UWQA 3NDZA 2CPUA 4ACZA 1JD9A 2XSAA 3VDAA 4UZUA 4KRTA 4HMDA 3VGGA 4CD6A 3SUVA 5HPCA 4UQEA 4M81A 1QHZA 3ECQA 4J7RA 3TONA 1WZLA 1XSKA 3MUZ1 2VR4A 3WQVA 1UD5A 1GORA 1QHPA 1I75A 4Z2JA 3S6TA 5JBDA 3W27A 3L4YA 3EMCA 1V3HA 4NRRA 3ZJ8A 3O6AA 1V0LA 5JUVA 4D6JA 2D0GA 4LPCA 4DWSB 3O9NA 1E6PA 1MQPA 3PZVA 4WSJA 3VO0A 4LYRA 2X1IA 2CERA 3WD2A 5DFAA 3VILA 4H8HA 5JBEA 3SCNA 2D23A 3OZOA 2XFFA 2A3BA 3WEZA 4AZCA 3GNPA 5IFTA 5CSYA 4AZ6A 1FP9A 1EDGA 5D9NA 4V27A 4W8BA 2FH6A 1KWGA 4W89A 2YDSA 2X2YA 3QOKA 2X09A 4YPJA 1D7FA 4CU8A 3A6OA 2EPMX 5D9PA 1V3KA 3AICA 3PZUA 3GXIA 3AMGA 1Q4NX 1B1YA 3GH7A 2EEXA 1TG7A 5HXMA 1H0GA 2Q8XA 2CKRA 1JAKA 2J4GA 8CGTA 3CUFA 3W4RA 4UQAA 5D8WA 2PI6A 2ZX8A 2WW5A 1GOIA 1OCQA 2WWCA 3SCVA 3WH6A 3TOPA 2WVSA 2B31A 2QF8A 4AZ5A 4AZCB 1ECEA 3CLWA 1C90A 3WH5A 3AS3A 3NJ3A 3AYRA 1CLXA 1E6ZA 4JKMA 1PBGA 3RMEA 1VIWA 5I6SA 1UR1A 3EMZA 1DP0A 4WLCA 3W0KA 3SCUA 1F4AA 1VBRA 4MAZA 1M53A 1H3GA 4AXNA 1JNDA 3CZGA 4M24A 1J0HA 1KR1A 3PZMA 4AIOA 2WLYA 4Q7NA 1CZ1A 5E6ZA 1LL7A 1V6YA 5FOOA 1E55A 1MQRA 1UH3A 2DSUA 4CKQA 2MANA 1EA9C 2XUCA 4AIUA 1SYTA 3PHAA 3CTTA 2XWDA 3VM5A 3WKZA 2QLYA 4CCEA 3AJ7A 4B16A 3VTRA 4HMEA 3FHAA 3AIWA 1C7TA 1TA3B 2PBOA 2G3MA 3CZ8A 4J28A 2WM0A 1V02A 2V38A 1Q6EA 2E9MA 2VRJA 2WC3A 1WDRA 1XYZA 1ODUA 2ZX6A 1QBBA 3GBDA 3G6MA 2D0FA 4P8UA 4MNMA 3AZTA 3VX0A 4CCCA 3JUGA 4JCLA 1EIBA 1LLOA 4MADA 2CIPA 3U5YA 1R8LA 1VEOA 1US2A 2WC7A 3VU2A 1X6LA 4CVUA 4D72A 2DH3A 2D22A 4FF5A 3D3AA 4D6DA 3HJEA 1LG1A 3EMQA 3A47A 2ZUTA 1PX3A 3WF1A 3WF3A 2WHKA 5CSUA 3ZMRA 2HISA 5D8ZA 5I24A 1SR0A 3ZOAA 3RJXA 4CCDA 3VGFA 1DHKA 2QMKA 1MW1A 5IDIA 3VIHA 1MW0A 1U2YA 3LMYA 2DIEA 4MB4A 4S3KA 4AIEA 3GZAA 4E2OA 3BLKA 1IZKA 3GNRA 2VZSA 2ZOXA 3GM8A 1TCMA 3AXHA 1CTNA 1HNYA 1OD0A 1ISVA 1PEZA 2YLAA 2CBUA 1GQJA 2DQXA 5CGTA 3OLEA 3K4DA 1XH2A 2A3CA 2BHZA 5FKYA 4DUVA 2G8ZA 1RH9A 4D1IA 2DT2A 1WDQA 4D6IA 4UOQA 4U3CA 3M6DA 2EQDA 4UNIA 4W93A 4D6FA 1CLVA 4Z2HA 2D2OA 1KBKA 3D5HA 1NOUA 1NOFA 3WMCA 5E0CA 1JL8A 1B3YA 2W92A 2F8QA 2W61A 2DEPA 3AIBA 1D3CA 1C8XA 4BA0A 3S2CA 1M03A 4IISA 4KRUA 1XH0A 2WCAA 2J7EA 2VX6A 1E43A 2BHYA 2GK1A 4JCMA 4OIFA 1TE1A 4P7QA 2J25A 2WKGA 1JNEA 2WBGA 3I3EA 1OIFA 5A95A 4DWSD 3ZT5A 2YOCA 4D6HA 5I77A 4JZ5A 1W32A 1QNSA 3VDHA 1CGTA 2G3JA 1UD4A 4P7RA 1B0IA 1ODZA 1EDTA 4UQBA 2ZUUA 1V0MA 1ISWA 4D6CA 1V08A 5M5DA 2JIWA 3FAWA 5GNXA 3U7VA 2W63A 6CGTA 3AQUA 2BVYA 1W9PA 3QHOA 4BCEA 2VZVA 2XVPA 2VRKA 3CMJA 2E9BA 2BY2A 5ABHA 3AHXA 4P8WA 4WK9A 1QPKA 5BXRA 2F61A 3QHNA 1E0VA 1FH7A 4YN5A 3T2PA 1E72M 3F5KA 3EDJA 4P8XA 3OG2A 5GQBA 1JI1A 4MB5A 4J3XA 4PMNA 4F66A 2W66A 2PWEA 1MFUA 1IZJA 1KBBA 2WNWA 1HXJA 3BH4A 4CD5A 4W87A 3ZJKA 1RP9A 2GJXB 1KR0A 4KGLA 1TFVA 1PIFA 1UR2A 1HT6A 2ZUNA 3N9KA 1UKPA 1EQPA 5HPOA 2YL9A 1HJSA 1CGXA 4EAMA 3SUUA 4HU0A 1LG2A 3A4WA 4MNKA 3VUPA 2JALA 4U2ZA 3IAPA 4BS0A 4X9YA 4ATDA 4FLQA 2XSBA 2ESCA 3THDA 5EMYA 4AEFA 5CJ5A 3DECA 4PSPA 4HA4A 1PX4A 1EDQA 1PZ2A 2VTFA 1V02E 3KE0A 4UFJA 4IUGA 5A2CA 4QCEA 4NF7A 4AZ7A 2G41A 3CZJA 3WF4A 4HMCA 3B9AA 2WMGA 1Q6CA 4K68A 3WUBA 5E6YA 3RM9A 1UD8A 5FCZA 4TVCA 4F79A 3KWXA 2J7CA 3FN9A 1WP6A 1BYCA 2WMHA 2ZXAA 4W88A 2G3NA 2VVNA 4ZENA 4GI8A 4HZ6A 4WJXA 3W6MA 3WNLA 1QI4A 3UETA 1EO7A 4EKJA 4XV0A 3WEMA 4JKKA 1GOMA 2QPUA 3FY1A 2VR5A 4AMCA 2V3FA 3KZSA 4Z2KA 2CBJA 3CUIA 1GHSA 3W24A 1UKSA 3WY1A 1B3WA 1A47A 2EJ1A 1AVAA 3E1F1 3ARWA 2Y2WA 3F5LA 3IJ7A 4U3AA 1UQZA 2NT1A 1S46A 4WF7A 4OBRA 2JFEX 3ZR5A 4ZEPA 4N0RA 1ZBCA 5IXEA 3ARYA 5BRQA 4AWEA 3L4VA 1TR1A 1QNPA 1E4MM 3OBAA 1HKKA 1B3XA 2NT0A 3QOMA 5BYWA 4F9DA 5A6KA 1K9FA 1LL4A 5ABEA 5A8PA 4MTVA 1AMYA 3CHEA 3WL0A 1NOWA 4HPGA 4PN2A 4OZOA 3CHDA 2QV4A 2V5DA 1SFSA 4W7VA 2Y4SA 3VGBA 3AS1A 2DH2A 1HJUA 1DWGM 4E8DA 1QNQA 1DWAM 3WD4A 1FH8A 4RE3A 4GXPA 1DWHM 1E6SM 2J74A 2VQUA 1EOMA 4XZBA 8A3HA 1VAHA 4N42A 5ABFA 4AYSA 4IPLA 2CEQA 2ZUVA 3TP4A 3DHPA 1XV8A 2BNJA 3BSHA 1JZ8A 1HL9A 1CENA 1FA2A 2JF7A 3ZT6A 1ISZA 1W2PA 2XVLA 4AD3A 1GOQA 2E40A 5JIWA 4C7DA 1J0YA 1GUVA 4CGTA 2GJRA 1UR4A 3ARSA 1UUQA 1OT2A 3WQ4A 2A3EA 1CNVA 3AOFA 5DT5A 3VD9A 3OGRA 4U31A 2YL6A 4JAWA 1WO2A 3AHTA 4HA1A 2X05A 5A6MA 5CG0A 4UZSA 1W1TA 4HA3A 3W6LA 3ZR6A 3WBAA 2JEPA 3OZPA 2WSKA 4W7UA 2EXOA 2UY3A 4HZ8A 2O9TA 1NWUA 4HOZA 2YA2A 1LWHA 3PTMA 4DWSA 5JH8A 4TTGA 1E56A 1B31A 1GNXA 5A2AA 4JFSA 2WKLA 2BHUA 1ZJBA 3BAYA 3VIOA 3L2LA 3GYCA 1FH9A 2FDMA 6TAAA 2DPEA 1XSIA 4UFLA 3CZLA 1BG9A 3RIKA 1PIGA 1ZJAA 1Q6GA 2E3ZA 1GPFA 3AROA 4KGJA 1OBAA 3L2MA 4GO9A 3WN6A 1O7AA 4UFKA 4AZGA 4JIEA 1BPLB 4RE4A 1TVPA 5A8NA 1NQ6A 2OWWA 1JF6A 1HJXA 2JF6A 4YHGA 2OSWA 2ZXDA 2NSXA 1JZ3A 2WVTA 2J8GA 4R5EA 1NARA 1W2VA 4PRWA 3BAIA 3CO4A 2WVVB 3GTNA 3GH4A 1BVNP 3PZ9A 4D1JA 1OIMA 1W9VA 1CDGA 1UQYA 3UG3A 4CN1A 2YDQA 4TVUA 4PCSA 1E6NA 1K9EA 4U5KA 4DUWA 2WPGA 4F9JA 4AISA 1JZ4A 1UWSA 3AIQA 4MNJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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