4Q8ZA

Crystal structure of 1-hydroxy-4-methylpyridin-2(1h)-one bound to human carbonic anhydrase ii
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Exploring the influence of the protein environment on metal-binding pharmacophores.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4q8zA00
3TVNX 1XEGA 5EKMA 2FNKA 2CBBA 1IF5A 3FE4A 3V3JA 5FNJA 2HL4A 5L3OA 2EU2A 4PQ7A 1CNBA 4G7AA 4KNNA 2FNMA 2HD6A 4HT2A 1CAHA 1H9QA 3F4XA 3KWAA 4YWPA 3RYYA 4Q7WA 1FSNA 1HVAA 3HKTA 1OKMA 1CRMA 5DSNA 1HCBA 2NNOA 3MNAA 4BCWA 3Q31A 2WD2A 3T82A 4CACA 1TTMA 4YYTA 3RYXB 5A6HA 3F7UA 3LXEA 5SZ2A 3RG3A 1CAIA 5BRVA 1TEUX 4FVNA 2FOSA 5DOHA 1KEQA 1UGGA 5CACA 4CNXA 2CBAA 3IBNA 1I91A 3JXHC 5EKJA 3S9TA 3CYUA 3PJJA 2NNVA 3MMFA 1BNWA 1G0EA 1AVNA 1G45A 3CZVA 3IBIA 4C3TA 3M67A 4QY3A 3M1WA 3U3AX 2POWA 5SZ7A 5J8ZA 1BNMA 3U7CA 4Q8YA 3CAJA 4CA2A 2GD8A 1ZSCA 3IBUA 3FFPX 3DCSA 1CAYA 5FNGA 1KWRA 4Q7SA 5E2NA 1FQNA 1JCZA 2CABA 3KNEA 3HKQA 4KAPA 3RJ7A 4Q08A 5JQ0A 1T9NA 4QK2A 4TWMA 5BYIA 5E28A 1LG5A 1BN1A 4PXXA 4M2VA 4QK1A 4QIZA 2NWZA 4CNVA 4HU1A 4K0SA 3MDZA 1YO2A 2NN1A 3JXGA 1UGDA 3JXFA 5JG5B 2POVA 3N3JA 4HEWA 4Q8ZA 2HFWA 3DC9A 1YO0A 1ZSAA 3VBDA 4Q07A 4JSWA 1BNNA 4ITPA 3R17B 1KWQA 3KIGA 5SZ5A 1TG3A 1HCAA 3CA2A 1LG6A 4FIKA 9CA2A 2NXRA 4FVOA 1Z9YA 4Z1JA 1CZMA 2QP6A 2WEHA 3HFPA 3SBIA 3PO6A 3D8WA 1G0FA 3W6HA 2ZNCA 3HLJA 3BL0A 3M2NA 3ML2A 5E2MA 1BN3A 4IWZA 4E49A 3DVBA 1CA3A 5FNKA 1BNUA 1HECA 4PYXA 2H15A 3FW3A 4Q6EA 5BRWA 4K13A 4MTYA 4TWLA 3OKVA 5EHVA 1CNYA 3OIKA 3P5AA 4BF1A 5G01A 4HT0A 1RZCA 3M5SA 5JESB 4Q9YA 3KKXA 4YXIA 1CILA 5DSLA 3NJ9A 3N4BA 5FNIA 1FLJA 4CNWA 3M96A 4WUQA 4KNJA 5JDVB 3S76A 4XE1A 1CNHA 4KP8A 3NI5A 3F8EA 1XPZA 2WEOA 4LU3A 4YGKA 3V5GA 3IBLA 1LUGA 2NNGA 4Z1NA 4Q6DA 5FNHA 2NXTA 3D9ZA 4MDLA 1KOQA 1JD0A 2ILIA 3MHOA 4XFWA 1CNJA 1RZEA 4R59A 4DZ7A 3V3FA 1UGCA 5DRSA 5FDIA 2NMXA 5JGSB 1CNGA 1CVCA 4ZWIA 3DCCA 4JSAA 1Y7WA 4E3FA 1LGDA 3QYKA 2FNNA 4FU5A 4WUPA 4QSAA 3P3JA 3DVDA 4G0CA 4QK3A 1IF9A 2HOCA 3HKNA 2F14A 1CNWA 2WD3A 4LHIA 1FR7A 2CBCA 3T83A 1CCTA 2FOQA 5AMGA 4QJWA 1YDAA 3S97A 1MUAA 1H9NA 4QJ0A 3DA2A 1YDBA 3M5EA 1A42A 2EZ7A 1H4NA 2FOYA 3V3HB 3V7XA 5DSPA 3R16A 3BL1A 4WR7A 2FOVA 4E3DA 2Q1QA 3C7PA 4L5UA 4YVYA 3IAIA 1G48A 1YDCA 3DD0A 4MLXA 1BICA 1CVHA 1UGAA 4QJOA 5JEHB 1XQ0A 4Q09A 3V2MA 3OKUA 4HBAA 1V9EA 2VVAX 3EFIA 3DCWA 1G4OA 4HF3A 4WW6A 4YGFA 1I9MA 1DMYA 5EH7A 1BZMA 2O4ZA 5JEPB 12CAA 4YX4A 4DZ9A 3N2PA 3P55A 1BNQA 1URTA 2FW4A 3S8XA 2FMGA 1CALA 1IF8A 2X7UA 1CAKA 3M98A 1ZH9A 4IDRX 4JSZA 3ZP9A 1TEQX 3GZ0A 5G0BA 3MNKA 1TB0X 1CVEA 1CVBA 5G03A 4ZWZA 4HEYA 1V9IC 4YXOA 1BV3A 1Z97A 3D93A 4UOVA 3B1BA 5FLSA 5EH5A 4QJPA 4COQA 4CNRA 4Q0LA 3T5UA 4Q99A 2AW1A 1AZMA 1CAOA 3IGPA 4RIVA 5E2RA 5FDCA 3HS4A 3MHMA 4N16A 2WEJA 3RGEA 4PYYA 1G46A 2POUA 3P3HA 3M2ZA 4FRCA 2AX2A 4JSSA 2FOUA 3D0NA 1CNCA 1RAZA 5DOGA 4KV0A 5FLPA 4E3GA 5BNLA 4Q90A 1DCBA 4Q06A 2EU3A 4MO8A 3OY0A 1MOOA 3M14A 1I9OA 1I9PA 4M2WA 4M2UA 5JGTB 3MNUA 1J9WA 1UGBA 2Q1BA 3KOKA 4JS6A 3S78B 4RUXA 4Q7PA 1HEDA 4MDMA 4Z1EA 3HKUA 4KUYA 3OIMA 3S72B 4RUYA 1LZVA 1HEAA 1YDDA 5DSMA 3OILA 5DSKA 5DSOA 5BRUA 4Z1KA 1BN4A 3DVCA 5EHWA 4XIXA 5EH8A 4K0ZA 4KP5A 2NN7A 4BF6A 4E4AA 5FLQA 3D92A 5FL6A 1JV0A 3V3IB 5SZ3A 4QJMA 1EOUA 4XZ5A 3SAXA 3RZ5A 3KOIA 1I90A 3DV7A 3TMJA 1CA2A 3ML5A 1ZGFA 5DSRA 5HPJA 3RG4A 4K1QA 5E5UA 4YXUA 3DC3A 5G0CA 5EZTX 3T84A 1RZBA 4KNIA 5IPZA 2OSFA 4QTLA 1ZNCA 5DSJA 3M5TA 3M1QA 1CAMA 3UYNA 3M1KA 4WW8A 3OYQA 4M2RA 5CLUA 5EOIA 4ZX1A 4FPTA 1UGEA 4PZHA 4XIWA 4ZAOA 1AM6A 4HEZA 1G3ZA 2QOAA 4KUWA 3MZCA 1CIMA 1TBTX 5E2SA 1TH9A 1I9NA 4E3HA 3RYVB 1CAJA 3P4VA 3P5LA 4QEFA 3IEOA 5JG3B 4YGNA 3MHLA 4YGJA 5FL5A 2H4NA 3F7BA 3RLDA 5FNMA 2ABEA 1UGFA 3M1JA 1FR4A 4RN4A 1ZFKA 3MWOA 3RZ8A 3M40A 3RZ0B 5E2KA 3TVOX 1DCAA 4Q49A 5JEGB 1CANA 1XEVA 3EFTA 3U47A 1G54A 1RAYA 4ETQC 1YO1A 3DBUA 4ILXA 5L6KA 3P58A 4RIUA 5DVXA 1FSRA 4K0TA 3V3GB 5EIJA 4Q7VA 1IF7A 1CCSA 1FQLA 4ZWXA 4L5VA 4Y0JA 1G53A 5SZ0A 1BCDA 1ZFQA 3SAPA 1ZSBA 3M2XA 4WL4A 3KS3A 2CBEA 4GL1X 4L5WA 3RZ1B 1CVDA 3K7KA 4YHAA 3ZNCA 1OKNA 1HUHA 1CAZA 5LMDA 4QSJA 1DMXA 2CA2A 2NXSA 3MHCA 3DAZA 5A25A 2GEHA 3T5ZA 2NWYA 4N0XB 3MNIA 4R5AA 5SZ6A 3N0NA 4RFDA 5FNLA 3MHIA 3S71B 4FL7A 3SBHA 5DSQA 1RJ6A 3NB5A 4ZX0A 1BNTA 3U45X 1KOPA 1RZAA 5E5RA 1BNVA 4YGLA 1G1DA 3V2JA 1ZGEA 6CA2A 1FQRA 1CINA 5SZ4A 1CNKA 3L14A 1HUGA 3P44A 1I9LA 2VVBX 2X7SA 4LP6A 5JQTA 1Z93A 1FQMA 1THKA 3K2FA 2X7TA 3M04A 3S75B 5FLRA 1CNIA 8CA2A 3RZ7A 5FLOA 2W2JA 4Q83A 5CA2A 2NWOA 5C8IA 2HKKA 1ZE8A 3MNJA 3B4FA 3DD8A 3S73B 4E9OX 4KUVA 3S74B 4Q81A 4Q87A 4CQ0A 4QJXA 5CJFA 2WEGA 2NWPA 4QSIA 3W6IA 2NNSA 4E5QA 3OYSA 4X5SA 1G6VA 4Q8XA 1CCUA 4Q78A 2HNCA 1I8ZA 5FLTA 1I9QA 7CA2A 4ITOA 3PYKA 3UYQA 1G52A 2Q38A 3M2YA 4MDGA 4KNMA 1RZDA 1IF6A 5EKHA 1HEBA 4RUZA 1CVAA 1IF4A 4MLTA 1RJ5A 1TE3X 3K34A 4R5BA 5EHEA 3MNHA 1F2WA 2OSMA 4RFCA 3T85A 4QIYA 1CRAA 2IT4A 1FSQA 3RYZA 5FL4A 1OKLA 1OQ5A 1CNXA 1TG9A 5AMLA 5SZ1A 3M3XA 3S77B 4Z0QA 3BETA 4QSBA 2CBDA 3KONA 4ZWYA 2FMZA 3RYJB 1G4JA 3KLDB 4RH2A 5DSIA 5AMDA 3MYQA 2QO8A 1CVFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TVN X;  1XEG A;  5EKM A;  2FNK A;  2CBB A;  1IF5 A;  3FE4 A;  3V3J A;  5FNJ A;  2HL4 A;  5L3O A;  2EU2 A;  4PQ7 A;  1CNB A;  4G7A A;  4KNN A;  2FNM A;  2HD6 A;  4HT2 A;  1CAH A;  1H9Q A;  3F4X A;  3KWA A;  4YWP A;  3RYY A;  4Q7W A;  1FSN A;  1HVA A;  3HKT A;  1OKM A;  1CRM A;  5DSN A;  1HCB A;  2NNO A;  3MNA A;  4BCW A;  3Q31 A;  2WD2 A;  3T82 A;  4CAC A;  1TTM A;  4YYT A;  3RYX B;  5A6H A;  3F7U A;  3LXE A;  5SZ2 A;  3RG3 A;  1CAI A;  5BRV A;  1TEU X;  4FVN A;  2FOS A;  5DOH A;  1KEQ A;  1UGG A;  5CAC A;  4CNX A;  2CBA A;  3IBN A;  1I91 A;  3JXH C;  5EKJ A;  3S9T A;  3CYU A;  3PJJ A;  2NNV A;  3MMF A;  1BNW A;  1G0E A;  1AVN A;  1G45 A;  3CZV A;  3IBI A;  4C3T A;  3M67 A;  4QY3 A;  3M1W A;  3U3A X;  2POW A;  5SZ7 A;  5J8Z A;  1BNM A;  3U7C A;  4Q8Y A;  3CAJ A;  4CA2 A;  2GD8 A;  1ZSC A;  3IBU A;  3FFP X;  3DCS A;  1CAY A;  5FNG A;  1KWR A;  4Q7S A;  5E2N A;  1FQN A;  1JCZ A;  2CAB A;  3KNE A;  3HKQ A;  4KAP A;  3RJ7 A;  4Q08 A;  5JQ0 A;  1T9N A;  4QK2 A;  4TWM A;  5BYI A;  5E28 A;  1LG5 A; 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